| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP042583 | 1,959,875 | 3 bp→TCA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP042583 | 1,959,875 | 0 | A | T | 99.1% | 270.0 / NA | 114 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (67/46); minor base C (1/0); total (68/46) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| * | CP042583 | 1,959,876 | 0 | G | C | 100.0% | 267.4 / NA | 114 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base C (68/46); total (68/46) | |||||||||||
| * | CP042583 | 1,959,877 | 0 | T | A | 99.1% | 270.6 / NA | 114 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base A (67/46); minor base C (1/0); total (68/46) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 114 total aligned reads displayed.
CTTGATGGCTTCATCAACATCACCGCCAGTCCTCTCTAACAAACGTCTGGCAACCTGGATACCGACAGGTACGTTCTTCCGAAGTTTACGAATTTCACTTAACCATTCCATGTCAAACCCCTTTAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATAGTAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATAATTATGACACCTTTAGAACGCATTACCCAACTTGTTAATATCAATGGTGATGTTAATAATCCTGATACTCCTCGTCCATTGTTATCTCTTGAGGATTTTTTTATTGACAATAATATCCATGGTAGTATATGTTGCAATGTGATTCCAGAACAATCTCCGCAAGCTATCTATCACCATTTTCTGAAAATACGTGAGCGTAACAATGTTAGTGATGTTTTGGTAGAAATTACGATGTTC > CP042583/1959604‑1960156 ||| cTTGATGGCTTCATCAACATCACCGCCAGTCCTCTCTAACAAACGTCTGGCAACCTGGATACCGACAGGTACGTTCTTCCGAAGTTTACGAATTTCACTTAACCATTCCATGTCAAACCCCTTTAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTTACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGt > 2:1015143/1‑289 (MQ=255) ttGATGGCTTCATCAACATCACCGCCAGTCCTCTCTAACAAACGTCTGGCAACCTGGATACCGACAGGTACGTTCTTCCGAAGTTTACGAATTTCACTTAACCATTCCATGTCAAACCCCTTTACATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGtt > 1:903815/1‑289 (MQ=255) gATGGCTTCATCAACATCACCGCCAGTCCTCTCTAACAAACGTCTGGCAACCTGGATACCGACAGGTACGTTCTTCCGAAGTTTACGAATTTCACTTAACCATTCCATGTCAAACCCCTTTAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTTACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTtg < 1:1015143/289‑1 (MQ=255) aTGGCTTCATCAACATCACCGCCAATCCTCTCTAACAAACGTCTGGCAACCTGTATACCGACAGGTACGTTCTTTCGAAGTTTACGAATTTCACTTAACCATGCCATGTCAAACCCCTTTAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTTACTTAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTTAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAACGTCATTCGTTtga < 1:688775/289‑1 (MQ=255) tcatcaACATCACCGCCAGTCCTCTCTAACAAACGTCTGGCAACCTGGATACCGACAGGTACGTTCTTCCGAAGTTTACGAATTTCACTTAACCATTCCATGTCAAACCCCTTTAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAata > 2:577536/1‑289 (MQ=255) cGCCAGTCCTCTCTAACAAACGTCTGGCAACCTGGATACCGACAGGTACGTTCTTCCGAAGTTTACGAATTTCACTTAACCATTCCATGTCAAACCCCTTTAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAggg > 1:890417/1‑289 (MQ=255) cAGTCCTCTCTAACAAACGTCTGGCAACCTGGATACCGACAGGTACGTTCTTCCGAAGTTTACGAATTTCACTTAACCATTCCATGTCAAACCCCTTTAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGaat < 2:890417/289‑1 (MQ=255) gTCCTCTCTAACAAACGTCTGGCAACCTGGATACCGACAGGTACGTTCTTCCGAAGTTTACGAATTTCACTTAACCATTCCATGTCAAACCCCTTTAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGaataa > 1:328050/1‑289 (MQ=255) tCCTCTCTAACAAACGTCTGGCAACCTGGATACCGACAGGTACGTTCTTCCGAAGTTTACGAATTTCACTTAACCATTCCATGTCAAACCCCTTTAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGaataat > 2:1414416/1‑289 (MQ=255) ctctAACAAACGTCTGGCAACCTGGATACCGACAGGTACGTTCTTCCGAAGTTTACGAATTTCACTTAACCATTCCATGTCAAACCCCTTTAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATAATTATg > 2:1344157/1‑289 (MQ=255) ctctAACAAACGTCTGGCAACCTGGATACCGACAGGTACGTTCTTCCGAAGTTTACGAATTTCACTTAACCATTCCATGTCAAACCCCTTTAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATAATTATg > 2:1328157/1‑289 (MQ=255) ctctAACAAACGTCTGGCAACCTGGATACCGACAGGTACGTTCTTCCGAAGTTTACGAATTTCACTTAACCATTCCATGTCAAACCCCTTTAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATAATTATg > 1:862195/1‑289 (MQ=255) tctAACAAACGTCTGGCAACCTTGATACCGAAAGGTACGTTCTTCCGAAGTTTACGAATTTCACTTAACCATTCCATGTCAAACCCCTTTAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACACGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCGTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATAATTATGa < 2:999175/289‑1 (MQ=255) tctAACAAACGTCTGGCAACCTGGATACCGACAGGTACGTTCTTCCGAAGTTTACGAATTTCACTTAACCATTCCATGTCAAACCCCTTTAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATAATTATGa < 2:569477/289‑1 (MQ=255) ctAACAAACGTCTGGCAACCTGGATACCGACAGGTACGTTCTTCCGAAGTTTACGAATTTCACTTAACCATTCCATGTCAAACCCCTTTAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATAATTATGac < 2:640085/289‑1 (MQ=255) ctAACAAACGTCTGGCAACCTGGATACCGACAGGTACGTTCTTCCGAAGTTTACGAATTTCACTTAACCATTCCATGTCAAACCCCTTTAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATAATTATGac < 1:1391118/289‑1 (MQ=255) cAAACGTCTGGCAACCTGGATACCGACAGGTACGTTCTTCCGAAGTTTACGAATTTCACTTAACCATTCCATGTCAAACCCCTTTAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATAATTATGACACCt > 1:266691/1‑289 (MQ=255) cGTCTGGCAACCTGGATACCGACAGGTACGTTCTTCCGAAGTTTACGAATTTCACTTAACCATTCCATGTCAAACCCCTTTAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATAATTATGACACCTTTAg > 1:390611/1‑289 (MQ=255) gTCTGGCAACCTGGATACCGACAGGTACGTTCTTCCGAAGTTTACGAATTTCACTTAACCATTCCATGTCAAACCCCTTTAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATAATTATGACACCTTTAGa < 1:214023/289‑1 (MQ=255) gTCTGGCAACCTGGATACCGACAGGTACGTTCTTCCGAAGTTTACGAATTTCACTTAACCATTCCATGTCAAACCCCTTTAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATAATTATGACACCTTTAGa < 1:388831/289‑1 (MQ=255) tGGCAACCTGGATACCGACAGGTACGTTCTTCCGAAGTTTACGAATTTCACTTAACCATTCCATGTCAAACCCCTTTAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATAATTATGACACCTTTAGAACg < 1:1328157/289‑1 (MQ=255) ccTGGATACCGACAGGTACGTTCTTCCGAAGTTTACGAATTTCACTTAACCATTCCATGTCAAACACCTTTAAATCTTTATGATCTTACATATCACAACGTCTGTATAACGACCCGGCATGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATTATGCTCTTGAAACTAATAATACGGATGCAATTGTCACTATTTCTTCGCTAATGACTCCCAACAATGTCATTCGTTTGACGAATATATTATTTCACGGTATAATTATGACACCTTTAGAACGCATTa > 2:1127084/1‑288 (MQ=255) gACAGGTACGTTCTTCCGAAGTTTACGAATTTCACTTAACCATTCCATGTCAAACCCCTTTAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATAATTATGACACCTTTAGAACGCATTACCCAACTTGtt < 2:1439550/289‑1 (MQ=255) gACAGGTACGTTCTTCCGAAGTTTACGAATTTCACTTAACCATTCCATGTCAAACCCCTTTAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATAATTATGACACCTTTAGAACGCATTACCCAACTTGtt > 1:488663/1‑289 (MQ=255) aCAGGTACGTTCTTCCGAAGTTTACGAATTTCACTTAACCATTCCATGTCAAACCCCTTTAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATAATTATGACACCTTTAGAACGCATTACCCAACTTGTTa > 1:510936/1‑289 (MQ=255) cttcCGAAGTTTACGAATTTCACTTAACCATTCCATGTCAAACCCCTTTAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATAATTATGACACCTTTAGAACGCATTACCCAACTTGTTAATATCAATGGt < 2:1892605/289‑1 (MQ=255) ttAACCATTCCATGTCAAACCACTTTAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATAATTATGACACCTTTAGAACGCATTACCCAACTTGTTAATATCAATGGTGATGTTAATAATCCTGATActcc < 2:615718/289‑1 (MQ=255) tAACCATTCCATGTCAAACCCCTTTAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATAATTATGACACCTTTAGAACGCATTACCCAACTTGTTAATATCAATGGTGATGTTAATAATCCTGATActcct < 1:1344157/289‑1 (MQ=255) cATTCCATGTCAAACCCCTTTAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATAATTATGACACCTTTAGAACGCATTACCCAACTTGTTAATATCAATGGTGATGTTAATAATCCTGATACTCCTCGTc < 1:1414416/289‑1 (MQ=255) aTTCCATGTCAAACCCCTTTAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATAATTATGACACCTTTAGAGCGCATTACCCAACTTGTTAATATCAATGGTGATGTTAATAATCCTGATACTCCTCGTcc < 2:903815/289‑1 (MQ=255) cAAACCCCTTTAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATAATTATGACACCTTTAGAACGCATTACCCAACTTGTTAATATCAATGGTGATGTTAATAATCCTGATACTCCTCGTCCATTGTTAt < 2:862195/288‑1 (MQ=255) ttAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATAATTATGACACCTTTAGAACGCATTACCCAACTTGTTAatat > 2:641579/1‑235 (MQ=255) ttAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATAATTATGACACCTTTAGAACGCATTACCCAACTTGTTAatat < 1:641579/235‑1 (MQ=255) aTGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATAATTATGACACCTTTAGAACGCATTACCCAACTTGTTAATATCAATGGTGATGTTAATAATCCTGATACTCCTCGTCCATTGTTATCTCTTGAGGATTTTTTTAtt < 2:266691/289‑1 (MQ=255) gATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATAATTATGACACCTTTAGAACGCATTACCCAACTTGTTAATATCAATGGTGATGTTAATAATCCTGATACTCCTCGTCCATTGTTATCTCTTGAGGATTTTTTTATTGa < 1:1136811/289‑1 (MQ=255) atTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATAATTATGACACCTTTAGAACGCATTACCCAACTTGTTAATATCAATGGTGATGTTAATAATCCTGATACTCCTCGTCCATTGTTATCTCTTGAGGATTTTTTTATTGACaa > 1:1233280/1‑289 (MQ=255) tAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATAATTATGACACCTTTAGAACGCATTACCCAACTTGTTAATATCAATGGTGATGTTAATAATCCTGATACTCCTCGTCCATTGTTATCTCTTGAGGATTTTTTTATTGACaata > 2:1591956/1‑289 (MQ=255) aacaacGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTtgatga < 1:8519/150‑1 (MQ=255) cGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATAATTATGACACCTTTAGAACGCATTACCCAACTTGTTAATATCAATGGTGATGTTAATAATCCTGATACTCCTCGTCCATTGTTATCTCTTGAGGATTTTTTTAtt < 2:1094972/270‑1 (MQ=255) cGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATAATTATGACACCTTTAGAACGCATTACCCAACTTGTTAATATCAATGGTGATGTTAATAATCCTGATACTCCTCGTCCATTGTTATCTCTTGAGGATTTTTTTAtt > 1:1094972/1‑270 (MQ=255) cGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATAATTATGACACCTTTAGAACGCATTACCCAACTTGTTAATATCAATGGTGATGTTAATAATCCTGATACTCCTCGTCCATTGTTATCTCTTGAGGATTTTTTTATTGACAATAATATCCATGgt > 1:517344/1‑288 (MQ=255) cGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATAATTATGACACCTTTAGAACGCATTACCCAACTTGTTAATATCAATGGTGATGTTAATAATCCTGATACTCCTCGTCCATTGTTATCTCTTGAGGATTTTTTTATTGACAATAATATCCATGgt > 1:1801497/1‑288 (MQ=255) tCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATAATTATGACACCTTTAGAACGCATTACCCAACTTGTTAATATCAATGGTGATGTTAATAATCCTGATACTCCTCGTCCATTGTTATCTCTTGAGGATTTTTTTATTGACAATAATATCCATGgttca > 2:589507/1‑286 (MQ=255) tCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATAATTATGACACCTTTAGAACGCATTACCCAACTTGTTAATATCAATGGTGATGTTAATAATCCTGATACTCCTCGTCCATTGTTATCTCTTGAGGATTTTTTTATTGACAATAATATCCATGgttca > 2:184549/1‑286 (MQ=255) tGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATAATTATGACACCTTTAGAACGCATTACCCAACTTGTTAATATCAATGGTGATGTTAATAATCCTGATACTCCTCGTCCATTGTTATCTCTTGAGGATTTTTTTATTGACAATAATATCCATGgttcaat < 2:390611/289‑6 (MQ=255) tGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATAATTATGACACCTTTAGAACGCATTACCCAACTTGTTAATATCAATGGTGATGTTAATAATCCTGATACTCCTCGTCCATTGTTATCTCTTGAGGATTTTTTTATTGACAATAATATCCATGgttcaat > 2:788832/1‑284 (MQ=255) tAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATAATTATGACACCTTTAGAACGCATTACCCAACTTGTTAATATCAATGGTGATGTTAATAATCCTGATACTCCTCGTCCATTGTTATCTCTTGAGGATTTTTTTATTGACAATAATATCCATGGTTCAATATGt > 1:1125922/1‑289 (MQ=255) cGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATAATTATGACACCTTTAGAACGCATTACCCAACTTGTTAATATCAATGGTGATGTTAATAATCCTGATACTCCTCGTCCATTGTTATCTCTTGAGGATTTTTTTATTGACAATAATATCCATTGTTCAATATGTTGc > 2:315602/1‑289 (MQ=255) cGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATAATTATGACACCTTTAGAACGCATTACCCAACTTGTTAATATCAATGGTGATGTTAATAATCCTGATACTCCTCGTCCATTGTTATCTCTTGAGGATTTTTTTATTGACAATAATATCCATGGTTCAATATGTTGc > 2:1394581/1‑289 (MQ=255) cGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATAATTATGACACCTTTAGAACGCATTACCCAACTTGTTAATATCAATGGTGATGTTAATAATCCTGATACTCCTCGTCCATTGTTATCTCTTGAGGATTTTTTTATTGACAATAATATCCATGGTTCAATATGTTGc > 2:972620/1‑289 (MQ=255) cGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATAATTATGACACCTTTAGAACGCATTACCCAACTTGTTAATATCAATGGTGATGTTAATAATCCTGATACTCCTCGTCCATTGTTATCTCTTGAGGATTTTTTTATTGACAATAATATCCATGGTTCAATATGTTGCAAtgt > 2:760228/1‑289 (MQ=255) cGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATAATTATGACACCTTTAGAACGCATTACCCAACTTGTTAATATCAATGGTGATGTTAATAATCCTGATACTCCTCGTCCATTGTTATCTCTTGAGGATTTTTTTATTGACAATAATATCCATGGTTCAATATGTTGCAAtgt > 1:948494/1‑289 (MQ=255) ggCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATAATTATGACACCTTTAGAACGCATTACCCAACTTGTTAATATCAATGGTGATGTTAATAATCCTGATACTCCTCGTCCATTGTTATCTCTTGAGGATTTTTTTATTGACAATAATATCCATGGTTCAATATGTTGCAAtgtg > 2:248276/1‑289 (MQ=255) actgaATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATAATTATGACACCTTTAGAACGCATTACCCAACTTGTTAATATCAATGGTGATGTTAATAATCCTGATACTCCTCGTCCATTGTTATCTCTTGAGGATTTTTTTATTGACAATAATATCCATGGTTCAATATGTTGCAATGTGATTCCa > 2:591547/1‑289 (MQ=255) atatCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATAATTATGa > 1:434807/1‑144 (MQ=255) atatCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATAATTATGa < 2:434807/144‑1 (MQ=255) tatCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATAATTATGACACCTTTAGAACGCATTACCCAACTTGTTAATATCAATGGTGATGTTAATAATCCTGATACTCCTCGTCCATTGTTATCTCTTGAGGATTTTTTTATTGACAATAATATCCATGGTTCAATATGTTGCAATGTGATTCCAGAACaa > 1:444131/1‑289 (MQ=255) tatCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATAATTATGACACCTTTAGAACGCATTACCCAACTTGTTAATATCAATGGTGATGTTAATAATCCTGATACTCCTCGTCCATTGTTATCTCTTGAGGATTTTTTTATTGACAATAATATCCATGGTTCAATATGTTGCAATGTGATTCCAGAACaa < 1:248276/289‑1 (MQ=255) atCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATAATTATGACACCTTTAGAACGCATTACCCAACTTGTTAATATCAATGGTGATGTTAATAATCCTGATACTCCTCGTCCATTGTTATCTCTTGAGGATTTTTTTATTGACAATAATATCCATGGTTCAATATGTTGCAATGTGATTCCAGAACAAt < 2:1125922/289‑1 (MQ=255) tcACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATAATTATGACACCTTTAGAACGCATTACCCAACTTGTTAATATCAATGGTGATGTTAATAATCCTGATACTCCTCGTCCATTGTTATCTCTTGAGGATTTTTTTATTGACAATAATATCCATGGTTCAATATGTTGCAATGTGATTCCAGAACAAtct > 2:771989/1‑288 (MQ=255) tcACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATAATTATGACACCTTTAGAACGCATTACCCAACTTGTTAATATCAATGGTGATGTTAATAATCCTGATACTCCTCGTCCATTGTTATCTCTTGAGGATTTTTTTATTGACAATAATATCCATGGTTCAATATGTTGCAATGTGATTCCAGAACAAtct > 1:1616163/1‑288 (MQ=255) cACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATAATTATGACACCTTTAGAACGCATTACCCAACTTGTTAATATCAATGGTGATGTTAATAATCCTGATACTCCTCGTCCATTGTTATCTCTTGAGGATTTTTTTATTGACAATAATATCCATGGTTCAATATGTTGCAATGTGATTCCAGAACAATCTcc > 1:1371715/1‑289 (MQ=255) gTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATAATTATGACACCTTTAGAACGCATTACCCAACTTGTTAATATCAATGGTGATGTTAATAATCCTGATACTCCTCGTCCATTGTTATCTCTTGAGGATTTTTTTATTGACAATAATATCCATTGTTCAATATGTTGCAATGTGATTCCAGAACAATCTCCGCa < 1:315602/289‑1 (MQ=255) gTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATAATTATGACACCTTTAGAACGCATTACCCAACTTGTTAATATCAATGGTGATGTTAATAATCCTGATACTCCTCGTCCATTGTTATCTCTTGAGGATTTTTTTATTGACAATAATATCCATGGTTCAATATGTTGCAATGTGATTCCAGAACAATCTCCGCa > 2:103300/1‑289 (MQ=255) tttCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATAATTATGACACCTTTAGAACGCATTACCCAACTTGTTAATATCAATGGTGATGTTAATAATCCTGATACTCCTCGTCCATTGTTATCTCTTGAGGATTTTTTTATTGACAATAATATCCATGGTTCAATATGTTGCAATGTGATTCCAGAACAATCTCCGCAAg < 1:760228/289‑1 (MQ=255) ccTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATAATTATGACACCTTTAGAACGCATTACCCAACTTGTAAATATCAATGGTGATGTTAATAATCCTGATACTCCTCGTCCATTGTTATCTCTTGAGGATTTTTTTATTGACAATAATATCCATGGTTCAATATGTTGCAATGTGATTCCAGAACAATCTCCGCAAGcta > 2:1434414/1‑289 (MQ=255) aTGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATAATTATGACACCTTTAGAACGCATTACCCAACTTGTTAATATCAATGGTGATGTTAATAATCCTGATACTCCTCGTCCATTGTTATCTCTTGAGGATTTTTTTATTGACAATAATATCCATGGTTCAATATGTTGCAAtgt > 2:1440108/1‑249 (MQ=255) tgatgCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATAATTATGACACCTTTAGAACGCATTACCCAACTTGTTAATATCAATGGTGATGTTAATAATCCTGATACTCCTCGTCCATTGTTATCTCTTGAGGATTTTTTTATTGACAATAATATCCa < 1:1670342/222‑1 (MQ=255) tgatgCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAAGGAATAATTATGACACCTTTAGAACGCATTACCCAACTTGTTAATATCAATGGTGATGTTAATAATCCTGATACTCCTCGTCCATTGTTATCTCTTGAGGATTTTTTTATTGACAATAATATCCa > 2:1670342/1‑222 (MQ=255) atgCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATAATTATGACACCTTTAGAACGCATTACCCAACTTGTTAATATCAATGGTGATGTTAATAATCCTGATACTCCTCGTCCATTGTTATCTCTTGAGGATTTTTTTATTGACAATAATATCCa < 2:925257/220‑1 (MQ=255) atgCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATAATTATGACACCTTTAGAACGCATTACCCAACTTGTTAATATCAATGGTGATGTTAATAATCCTGATACTCCTCGTCCATTGTTATCTCTTGAGGATTTTTTTATTGACAATAATATCCa > 1:925257/1‑220 (MQ=255) ctctTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATAATTATGACACCTTTAGAACGCATTACCCAACTTGTTAATATCAATGGTGATGTTAATAATCCTGATACTCCTCGTCCATTGTTATCTCTTGAGGATTTTTTTATTGACAATAATATCCATGGTTCAATATGTTGCAATGTGATTCCAGAACAATCTCCg < 1:1087504/257‑1 (MQ=255) ctctTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATAATTATGACACCTTTAGAACGCATTACCCAACTTGTTAATATCAATGGTGATGTTAATAATCCTGATACTCCTCGTCCATTGTTATCTCTTGAGGATTTTTTTATTGACAATAATATCCATGGTTCAATATGTTGCAATGTGATTCCAGAACAATCTCCg > 2:1087504/1‑257 (MQ=255) tctTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATAATTATGACACCTTTAGAACGCATTACCCAACTTGTTAATATCAATGGTGATGTTAATAATCCTGATACTCCTCGTCCATTGTTATCTCTTGAGGATTTTTTTATTGACAATAATATCCATGGTTCAATATGTTGCAATGTGATTCCAGAACAATCTCCGCAAGCTATCTATCACCATTTTCTGAAAATACGt < 1:438125/289‑1 (MQ=255) ctTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATAATTATGACACCTTTAGAACGCATTACCCAACTTGTTAATATCAATGGTGATGTTAATAATCCTGATACTCCTCGTCCATTGTTATCTCTTGAGGATTTTTTTATTGACAATAATATCCATGGTTCAATATGTTGCAATGTGATTCCAGAACAATCTCCGCAAGCTATCTATCACCATTTTCTGAAAATACGTg > 2:18772/1‑289 (MQ=255) tGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATAATTATGACACCTTTAGAACGCATTACCCAACTTGTTAATATCAATGGTGATGTTAATAATCCTGATACTCCTCGTCCATTGTTATCTCTTGAGGATTTTTTTATTGACAATAATATCCATGGTTCAATATGTTGCAATGTGATTCCAGAACAATCTCCGCAAGCTATCTATCACCATTTTCTGAAAATACGTGAg < 2:510936/289‑1 (MQ=255) gAAACTAATAATACGTATGGAATTGTAACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATAATTATGACACCTTTAGAACGCATTACCCAACTTGTTAATATCAATGGTGATGTTAATAATCCTGATACTCCTCGTCCATTGTTATCTCTTGAGGATTTTTTTATTGACAATAATATCCATGGTTCAATATGTTGCAATGTGATTCCAGAACAATCTCCGCAAGCTATCTATCACCATTTTCTGAAAATACGTGAGc > 2:922174/1‑289 (MQ=255) taataaTACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATAATTATGACACCTTTAGAACGCATTACCCAACTTGTTAATATCAATGGTGATGTTAATAATCCTGATACTCCTCGTCCATTGTTATCTCTTGAGGATTTTTTTATTGACAATAATATCCATGGTTCAATATGTTGCAATGTGATTCCAGAACAATCTCCGCAAGCTATCTATCACCATTTTCTGAAAATACGTGAGCGTAAc < 1:1513273/289‑1 (MQ=255) taataaTACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATAATTATGACACCTTTAGAACGCATTACCCAACTTGTTAATATCAATGGTGATGTTAATAATCCTGATACTCCTCGTCCATTGTTATCTCTTGAGGATTTTTTTATTGACAATAATATCCATGGTTCAATATGTTGCAATGTGATTCCAGAACAATCTCCGCAAGCTATCTATCACCATTTTCTGAAAATACGTGAGCGTAAc > 2:1513273/1‑289 (MQ=255) ataataCGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATAATTATGACACCTTTAGAACGCATTACCCAACTTGTTAATATCAATGGTGATGTTAATAATCCTGATACTCCTCGTCCATTGTTATCTCTTGAGGATTTTTTTATTGACAATAATATCCATGGTTCAATATGTTGCAATGTGATTCCAGAACAATCTCCGCAAGCTATCTATCACCATTTTCTGAAAATACGTGAGCGTAACaa > 1:1419543/1‑289 (MQ=255) taataCGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATAATTATGACACCTTTAGAACGCATTACCCAACTTGTTAATATCAATGGTGATGTTAATAATCCTGATACTCCTCGTCCATTGTTATCTCTTGAGGATTTTTTTATTGACAATAATATCCATGGTTCAATATGTTGCAATGTGATTCCAGAACAATCTCCGCAAGCTATCTATCACCATTTTCTGAAAATACGTGAGCGTAACAAt > 1:1057952/1‑289 (MQ=255) tATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATAATTATGa > 2:609998/1‑85 (MQ=255) tATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATAATTATGa < 1:609998/85‑1 (MQ=255) tATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATAATTATGACACCTTTAGAACGCATTACCCAACTTGTTAATATCAATGGTGATGTTAATAATCCTGATACTCCTCGTCCATTGTTATCTCTTGAGGATTTTTTTATTGACAATAATATCCATGGTTCAATATGTTGCAATGTGATTCCAGAACAATCTCCGCAAGCTATCTATCACCATTTTCTGAAAATACGTGAGCGTAACAATGTTAGTg > 1:1639116/1‑289 (MQ=255) aTGGAATTGTCACTCTTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATAATTATGACACCTTTAGAACGCATTACCAAACTTGTTAATATCAATGGTGATGTTAATAATCCTGATACTCCTCGTCCATTGTTATATCTTGATGATTTTTTTATTGACAATAATATCCATGGTTCAATATGTTGCAATGTGATTCCAGACCAATCTCCGCAAGCTTTCTATCACAATTTTCTGAAACTACGTATGCGTAACAATGTTAGttt > 2:1234771/1‑287 (MQ=255) aTGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATAATTATGACACCTTTAGAACGCATTACCCAACTTGTTAATATCAATGGTGATGTTAATAATCCTGATACTCCTCGTCCATTGTTATCTCTTGAGGATTTTTTTATTGACAATAATATCCATGGTTCAATATGTTGCAATGTGATTCCAGAACAATCTCCGCAAGCTATCTATCACCATTTTCTGAAAATACGTGAGCGTAACAATGTTAGTGa > 1:60734/1‑289 (MQ=255) tGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATAATTATGACACCTTTAGAACGCATTACCCAACTTGTTAATATCAATGGTGATGTTAATAATCCTGATACTCCTCGTCCATTGTTATCTCTTGAGGATTTTTTTATTGACAATAATATCCATGGTTCAATATGTTGCAATGTGATTCCAGAACAATCTCCGCAAGCTATCTATCACCATTTTCTGAAAATACGTGAGCGTAACAATGTTAGTGAt > 1:1817879/1‑289 (MQ=255) tGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATAATTATGACACCTTTAGAACGCATTACCCAACTTGTTAATATCAATGGTGATGTTAATAATCCTGATACTCCTCGTCCATTGTTATCTCTTGAGGATTTTTTTATTGACAATAATATCCATGGTTCAATATGTTGCAATGTGATTCCAGAACAATCTCCGCAAGCTATCTATCACCATTTTCTGAAAATACGTGAGCGTAACAATGTTAGTGAt > 1:452164/1‑289 (MQ=255) tGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATAATTATGACACCTTTAGAACGCATTACCCAACTTGTTAATATCAATGGTGATGTTAATAATCCTGATACTCCTCGTCCATTGTTATCTCTTGAGGATTTTTTTATTGACAATAATATCCATGGTTCAATATGTTGCAATGTGATTCCAGAACAATCTCCGCAAGCTATCTATCACCATTTTCTGAAAATACGTGAGCGTAACAATGTTAGTGAt > 1:79782/1‑289 (MQ=255) tCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATAATTATGACACCTTTAGAACGCATTACCCAACTTGTTAATATCAATGGTGATGTTAATAATCCTGATACTCCTCGTCCATTGTTATCTCTTGAGGATTTTTTTATTGACAATAATATcc < 2:699669/186‑1 (MQ=255) tCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATAATTATGACACCTTTAGAACGCATTACCCAACTTGTTAATATCAATGGTGATGTTAATAATCCTGATACTCCTCGTCCATTGTTATCTCTTGAGGATTTTTTTATTGACAATAATATcc > 1:699669/1‑186 (MQ=255) tCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATAATTATGACACCTTTAGAACGCATTACCCAACTTGTTAATATCAATGGTGATGTTAATAATCCTGATACTCCTCGTCCATTGTTATCTCTTGAGGATTTTTTTATTGACAATAATATCCATGGTTCAATATGTTGCAATGTGATTCCAGACAAATCTCCGCAAGCTATCTATCACCATTTTCTGAAAATACGTAAGCGTAACAATGTTGGTGATGTTTTGGt > 1:1026153/1‑289 (MQ=255) tCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATAATTATGACACCTTTAGAACGCATTACCCAACTTGTTAATATCAATGGTGATGTTAATAATCCTGATACTCCTCGTCCATTGTTATCTCTTGAGGATTTTTTTATTGACAATAATATCCATGGTTCAATATGTTGCAATGTGATTCCAGAACAATCTCCGCAAGCTATCTATCACCATTTTCTGAAAATACGTGAGCGTAACAATGTTAGTGATGTTTTGGt > 1:619484/1‑289 (MQ=255) tCACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATAATTATGACACCTTTAGAACGCATTACCCAACTTGTTAATATCAATGGTGATGTTAATAATCCTGATACTCCTCGTCCATTGTTATCTCTTGAGGATTTTTTTATTGACAATAATATCCATGGTTCAATATGTTGCAATGTGATTCCAGAACAATCTCCGCAAGCTATCTATCACCATTTTCTGAAAATACGTGAGCGTAACAATGTTAGTGATGTTTTGGt > 1:1084052/1‑289 (MQ=255) cACTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATAATTATGACACCTTTAGAACGCATTACCCAACTTGTTAATATCAATGGTGATGTTAATAATCCTGATACTCCTCGTCCATTGTTATCTCTTGAGGATTTTTTTATTGACAATAATATCCATGGTTCAATATGTTGCAATGTGATTCCAGAACAATCTCCGCAAGCTATCTATCACCATTTTCTGAAAATACGTGAGCGTAACAATGTTAGTGATGTTTTGGt < 1:184549/288‑1 (MQ=255) aCTATTTATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATAATTATGACACCTTTAGAACGCATTACCCAACTTGTTAATATCAATGGTGATGTTAATAATCCTGATACTCCTCGTCCATTGTTATCTCTTGAGGATTTTTTTATTGACAATAATATCCATGGTTCAATATGTTGCAATGTGATTCCAGAACAATCTCCGCAAGCTATCTATCACCATTTTCTGAAAATACGTGAGCGTAACAATGTTAGTGATGTTTTGGTAg > 2:832783/1‑289 (MQ=255) tATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATAATTATGACACCTTTAGAACGCATTACCCAACTTGTTAATATCAATGGTGATGTTAATAATCCTGATACTCCTCGTCCATTGTTATCTCTTGAGGATTTTTTTATTGACAATAATATCCATGGTTCAATATGTTGCAATGTGATTCCAGAACAATCTCCGCAAGCTATCTATCACCATTTTCTGAAAATACGTGAGCGTAACAATGTTAGTGATGTTTTGGTAGAAATTa < 2:1639116/289‑1 (MQ=255) tATCTGCTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATAATTATGACACCTTTAGAACGCATTACCCAACTTGTTAATATCAATGGTGATGTTAATAATCCTGATACTCCTCGTCCATTGTTATCTCTTGAGGATTTTTTTATTGACAATAATATCCATGGTTCAATATGTTGCAATGTGATTCCAGAACAATCTCCGCAAGCTATCTATCACCATTTTCTGAAAATACGTGAGCGTAACAATGTTAGTGATGTTTTGGTAGAAATTa < 2:1801497/289‑1 (MQ=255) cTAATGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATAATTATGACACCTTTAGAACGCATTACCCAACTTGTTAATATCAATGGTGATGTTAATAATCCTGATACTCCTCGTCCATTGTTATCTCTTGAGGATTTTTTTATTGACAATAATATCCATGGTTCAATATGTTGCAATGTGATTCCAGAACAATCTCCGCAAGCTATCTATCACCATTTTCTGAAAATACGTGAGCGTAACAATGTTAGTGATGTTTTGGTAGAAATTACGATGt > 2:1022712/1‑289 (MQ=255) aaTGAATTCAAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATAATTATGACACCTTTAGAACGCATTACCCAACTTGTTAATATCAATGGTGATGTTAATAATCCTGATACTCCTCGTCCATTGTTATCTCTTGAGGATTTTTTTATTGACAATAATATCCATGGTTCAATATGTTGCAATGTGATTCCAGAACAATCTCCGCAAGCTATCTATCACCATTTTCTGAAAATACGTGAGCGTAACAATGTTAGTGATGTTTTGGTAGAAATTACGATGTTc > 2:318751/1‑289 (MQ=255) ||| CTTGATGGCTTCATCAACATCACCGCCAGTCCTCTCTAACAAACGTCTGGCAACCTGGATACCGACAGGTACGTTCTTCCGAAGTTTACGAATTTCACTTAACCATTCCATGTCAAACCCCTTTAAATATTTATGATATTAAATATAACAACGTCTGGATAACGACCCGGCCTGACTGAATATCTCACGTTTTCCTGCTTAACATTCATGTTATGATGCTCTTGAAACTAATAATACGTATGGAATTGTCACTATTTATCTGCTAATGAATAGTAACAATGTCATTCGTTTGATGAATATATTATTTCAGGGAATAATTATGACACCTTTAGAACGCATTACCCAACTTGTTAATATCAATGGTGATGTTAATAATCCTGATACTCCTCGTCCATTGTTATCTCTTGAGGATTTTTTTATTGACAATAATATCCATGGTAGTATATGTTGCAATGTGATTCCAGAACAATCTCCGCAAGCTATCTATCACCATTTTCTGAAAATACGTGAGCGTAACAATGTTAGTGATGTTTTGGTAGAAATTACGATGTTC > CP042583/1959604‑1960156 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |