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Only 100 of 176 total aligned reads displayed.
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aaCTTATTCCTCGCAGTAGTGATATTTCACCTGGCATTGATGGAATTTGCCCGGGGCC‑TTTTCCTCCGAACGGATTTACCGTACTTACAGATGCAGCATATGGTAACGGAGACTGTTTCGGTTTGTACTGGCCTATTGGTCAGGAGCATAAACTACCTATAGTGTGCGAAACGTACCATGACGAATGGCGAATCGTACCTGCCTTTTCCAGCATTAAGAAGTTCGAAGAATGGCTGGAAGTGAATGATGATGATCCCCATGAAAATGGCATCAGCATCGAAGATCAAg > 1:1833305/1‑288 (MQ=255) cGCAGTAGTGATATTTCACCTGGCATTGATGGAATTTGCCCGGGGCC‑TTTTCCTCCGAACGGATTTACCGTACTTACAGATGCAGCATATGGTAACGGAGACTGTTTCGGTTTGTACTGGCCTATTGGTCAGGAGCATAAACTACCTATAGTGTGCGAAACGTACCATGACGAATGGCGAATCGTACCTGCCTTTTCCAGCATTAAGAAGTTCGAAGAATGGCTGGAAGTGAATGATGATGATCCCCATGAAAATGGCATCAGCATCGAAGATCAAGACTTTGCAGCaa > 1:574936/1‑289 (MQ=255) ||| TTCGATGACCCAGACTGGCCCTTTAGTGAAAGTATTTTAGTTATCACCACTGCTAGTCCAGAAGAAGTTCAGAGCTGGTTTGTAGAAGAAATTGCCCCTGATGAGTGCTGGGAAGGATGGAGTGAAGATACGGAGCATGGATGGGTTGAAGTCCCTGTGGGTATGCATCCGGTTACTTGTTGGTGGGATTAAAACATTTATATAAACAGATAAGCGGATGTTTACATAAATTTTTATGTGAAGGAACATGATGAAACTTATTCCTCGCAGTAGTGATATTAGTCCTGGCATTGATGGAATTTGCCCGGGGCC‑TTTTCCTCCGAACGGATTTACCGTACTTACAGATGCAGCATATGGTAACGGAGACTGTTTCGGTTTGTACTGGCCTATTGGTCAGGAGCATAAACTACCTATAGTGTGCGAAACGTACCATGACGAATGGCGAATCGTACCTGCCTTTTCCAGCATTAAGAAGTTCGAAGAATGGCTGGAAGTGAATGATGATGATCCCCATGAAAATGGCATCAGCATCGAAGATCAAGACTTTGCAGCAAA > CP042583/1960154‑1960708 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |