Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 550,565 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 550,565 | 0 | A | T | 100.0% | 584.4 / NA | 244 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base T (149/95); total (149/95) | |||||||||||
* | CP042583 | 550,566 | 0 | G | C | 98.4% | 562.7 / NA | 244 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (2/2); new base C (147/93); total (149/95) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.44e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 550,567 | 0 | C | G | 99.2% | 576.6 / NA | 244 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base G (147/94); minor base T (1/1); total (149/95) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 244 total aligned reads displayed.
GCTAATATTCATTTAATGAATATTTAAGGATAAATTATATGGACATGGAGAGCCAAAAAATATTGTTTGCACTTTCCACTCCGATGGAAATACGCAATGAATGCTGTTTACCTAGCCATAGTAGTCCCAAAATGTATTTAGGTACATGCTTTTTTGACCTTTCTTCCAGTTGGGGAATTGATGACCGTGATGACCTGCTGCGCACAATTCACCGAATGATCGATAACGGTCATGCCGCTCGGTTGGCAGGGTTTTATCACCGCTGGTTTCGTTATAGCCCATGTGAATGGCGTGACTATCTTGCTGAACTAAATGAGCAAGGTCAGGCTTATGCGCAATTTGTCGCCAGCACCGCCGAATGCTGTGGCGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTCCGGATGGGTTTTTTAAGCCGAATGGGCGTACTTAATAACTGGTTGAGCGAAGAAGAAAGTCTATGGATCCAGAGCCGCATTCATCTACGGGCTCTACGTTATTATAGTAACTGGCGGCAATACTTTGCCGGTTATACCTTTGGTCGGCAATATTGGCAGT > CP042583/550290‑550847 ||| atatTCATTTAATGAATATTTAAGGATAAATTATATGGACATGGAGTCGCAAAAAATATTGTTTGCACTTTCCACTCCGATGGAAATACGCAATGAATGCTGTTTACCTTCGCATTCATCACCCAAAATGTATTTAGGTACATGCTTTTTTGACCTTTCTTCCTCATGGGGAATTGATGACCGTGATGACCTGCTGCGCACAATTCACCGAATGATCGATAACGGTCATGCCGCTCGGTTGGCAGGGTTTTATCACCGCTGGTTTCGTTATTCGCCATGTGAATGGCGt > 1:364542/1‑289 (MQ=255) tttAATGAATATTTAAGGATAAATTATATGGACATGGAGTCGCAAAAAATATTGTTTGCACTTTCCACTCCGATGGAAATACGCAATGAATGCTGTTTACCTTCGCATTCATCACCCAAAATGTATTTAGGTACATGCTTTTTTGACCTTTCTTCCTCATGGGGAATTGATGACCGTGATGACCTGCTGCGCACAATTCACCGAATGATCGATAACGGTCATGCCGCTCGGTTGGCAGGGTTTTATCACCGCTGGTTTCGTTATTCGCCATGTGAATGGCGTGACTa > 1:102792/1‑287 (MQ=255) aTGAATATTTAAGGATAAATTATATGGACATGGAGTCGCAAAAAATATTGTTTGCACTTTCCACTCCGATGGAAATACGCAATGAATGCTGTTTACCTTCGCATTCATCACCCAAAATGTATTTAGGTACATGCTTTTTTGACCTTTCTTCCTCATGGGGAATTGATGACCGTGATGACCTGCTTCGCACAATTCACCGAAGGATCGATAACGGTCATGCCGCTCGGTTGGCAGGGTTTTATCACCGCAGGTTTCGTTATTGGCCATGTGAATGCCGGGTCTATCtt > 2:870216/1‑287 (MQ=255) tatTTAAGGATAAATTATATGGACATGGAGTCGCAAAAAATATTGTTTGCACTTTCCACTCCGATGGAAATACGCAATGAATGCTGTTTACCTTCGCATTCATCACCCAAAATGTATTTAGGTACATGCTTTTTTGACCTTTCTTCCTCATGGGGAATTGATGACCGTGATGACCTGCTGCGCACAATTCACCGAATGATCGATAACGGTCATGCCGCTCGGTTGGCAGGGTTTTATCACCGCTGGTTTCGGTATTCGCCATGTGAATGGCGTGACTATCTTGCTGa > 2:1091540/1‑287 (MQ=255) aaGGATAAATTATATGGACATGGAGTCGCAAAAAATATTGTTTGCACTTTCCACTCCGATGGAAATACGCAATGAATGCTGTTTACCTTCGCATTCATCACCCAAAATGTATTTAGGTACATGCTTTTTTGACCTTTCTTCCTCATGGGGAATTGATGACCGTGATGACCTGCTGCGCACAATTCACCGAATGATCGATAACGGTCATGCCGCTCGGTTGGCAGGGTTTTATCACCGCTGGTTTCGTTATTCGCCATGTGAATGGCGTGACTATCTTGCTGAACTAAAt > 2:1722209/1‑289 (MQ=255) aTAAATTATATGGACATGGAGTCGCAAAAAATATTGTTTGCACTTTCCACTCCGATGGAAATACGCAATGAATGCTGTTTACCTTCGCATTCATCACCCAAAATGTATTTAGGTACATGCTTTTTTGACCTTTCTTCCTCATGGGGAATTGATGACCGTGATGACCTGCTGCGCACAATTCACCGAATGATCGATAACGGTCATGCCGCTCGGTTGGCAGGGTTTTATCACCGCTGGTTTCGTTATTCGCCATGTGAATGGCGTGACTATCTTGCTGAACTAAATGAg < 1:10013/288‑1 (MQ=255) tAAATTATATGGACATGGAGTCGCAAAAAATATTGTTTGCACTTTCCACTCCGATGGAAATACGCAATGAATGCTGTTTACCTTCGCATTCATCACCCAAAATGTATTTAGGTACATGCTTTTTTGACCTTTCTTCCTCATGGGGAATTGATGACCGTGATGACCTGCTGCGCACAATTCACCGAATGATCGATAACGGTCATGCCGCTCGGTTGGCAGGGTTTTATCACCGCTGGTTTCGTTATTCGCCATGTGAATGGCGTGACTATCTTTCTGAACTAAATGacaa > 2:743632/1‑286 (MQ=255) tAAATTATATGGACATGGAGTCGCAAAAAATATTGTTTGCACTTTCCACTCCGATGGAAATACGCAATGAATGCTGTTTACCTTCGCATTCATCACCCAAAATGTATTTAGGTACATGCTTTTTTGACCTTTCTTCCTCATGGGGAATTGATGACCGTGATGACCTGCTGCGCACAATTCACCGAATGATCGATAACGGTCATGCCGCTCGGTTGGCAGGGTTTTATCACCGCTGGTTTCGTTATTCGCCATGTGAATGGCGTGACTATCTTGCTGAACTAAATGAGCa > 1:1546616/1‑289 (MQ=255) atGGACATGGAGTCGCAAAAAATATTGTTTGCACTTTCCACTCCGATGGAAATACGCAATGAATGCTGTTTACCTTCGCATTCATCACCCAAAATGTATTTAGGTACATGCTTTTTTGACCTTTCTTCCTCATGGGGAATTGATGACCGTGATGACCTGCTGCGCACAATTCACCGAATGATCGATAACGGTCATGCCGCTCGGTTGGCAGGGTTTTATCACCGCTGGTTTCGTTATTCGCCATGTGAATGGCGTGACTATCTTGCTGAACTAAATGAGCAAGGTCAgg > 2:416364/1‑289 (MQ=255) tGGACATGGAGTCGCAAAAAATATTGTTTGCACTTTCCACTCCGATGGAAATACGCAATGAATGCTGTTTACCTTCGCATTCATCACCCAAAATGTATTTAGGTACATGCTTTTTTGACCTTTCTTCCTCATGGGGAATTGATGACCGTGATGACCTGCTGCGCACAATTCACCGAATGATCGATAACGGTCATGCCGCTCGGTTGGCAGGGTTTTATCACCGCTGGTTTCGTTATTCGCCATGTGAATGGCGTGACTATCTTGCTGAACTAAATGAGCAAGGTCAg > 1:449144/1‑287 (MQ=255) aCATGGAGTCGCAAAAAATATTGTTTGCACTTTCCACTCCGATGGAAATACGCAATGAATGCTGTTTACCTTCGCATTCATCACCCAAAATGTATTTAGGTACATGCTTTTTTGACCTTTCTTCCTCATGGGGAATTGATGACCGTGATGACCTGCTGCGCACAATTCACCGAATGATCGATAACGGTCATGCCGCTCGGTTGGCAGGGTTTTATCACCGCTGGTTTCGTTATTCGCCATGTGAATGGCGTGACTATCTTGTTGAACTAAATGAGCAAGGTCAGGCTTa > 1:1316090/1‑289 (MQ=255) atggagtcgcAAAAAATATTGTTTGCACTTTCCACTCCGATGGAAATACGCAATGAATGCTGTTTACCTTCGCATTCATCACCCAAAATGTATTTAGGTACATGCTTTTTTGACCTTTCTTCCTCATGGGGAATTGATGACCGTGATGACCTGCTGCGCACAATTCACCGAATGATCGATAACGGTCATGCCGCTCGGTTGGCAGGGTTTTATCACCGCTGGTTTCGTTATTCGCCATGTGAATGGCGTGACTATCTTGCTGAACTAAATGAGCAAGGTCAGGCTTATg > 2:173763/10‑289 (MQ=255) tggagtcgcAAAAAATATTGTTTGCACTTTCCACTCCGATGGAAATACGCAATGAATGCTGTTTACCTTCGCATTCATCACCCAAAATGTATTTAGGTACATGCTTTTTTGACCTTTCTTCCTCATGGGGAATTGATGACCGTGATGACCTGCTGCGCACAATTCACCGAATGATCGATAACGGTCATGCCGCTCGGTTGGCAGGGTTTTATCACCGCTGGTTTCGTTATTCGCCATGTGAATGGCGTGACTATCTTGCTGAACTAAATGAGCAAGGTCAGGCTTATgc > 2:1425883/9‑289 (MQ=255) gcAAAAAATATTGTTTGCACTTTCCACTCCGATGGAAATACGCAATGAATGCTGTTTACCTTCGCATTCATCACCCAAAATGTATTTAGGTACATGCTTTTTTGACCTTTCTTCCTCATGGGGAATTGATGACCGTGATGACCTGCTGCGCACAATTCACCGAATGATCGATAACGGTCATGCCGCTCGGTTGGCAGGGTTTTATCACCGCTGGTTTCGTTATTCGCCATGTGAATGGCGTGACTATCTTGCTGAACTAAATGAGCAAGGTCAGGCTTATGCGCAAttt > 2:569387/2‑289 (MQ=255) gcAAAAAATATTGTTTGCACTTTCCACTCCGATGGAAATACGCAATGAATGCTGTTTACCTTCGCATTCATCACCCAAAATGTATTTAGGTACATGCTTTTTTGACCTTTCTTCCTCATGGGGAATTGATGACCGTGATGACCTGCTGCGCACAATTCACCGAATGATCGATAACGGTCATGCCGCTCGGTTGGCAGGGTTTTATCACCGCTGGTTTCGTTATTCGCCATGTGAATGGCGTGACTATCTTGCTGAACTAAATGAGCAAGGTCAGGCTTATGCGCAAttt > 2:1589270/2‑289 (MQ=255) gcAAAAAATATTGTTTGCACTTTCCACTCCGATGGAAATACGCAATGAATGCTGTTTACCTTCGCATTCATCACCCAAAATGTATTTAGGTACATGCTTTTTTGACCTTTCTTCCTCATGGGGAATTGATGACCGTGATGACCTGCTGCGCACAATTCACCGAATGATCGATAACGGTCATGCCGCTCGGTTGGCAGGGTTTTATCACCGCTGGTTTCGTTATTCGCCATGTGAATGGCGTGACTATCTTGCTGAACTAAATGAGCAAGGTCAGGCTTATGCGCAAttt < 1:995328/288‑1 (MQ=255) gcAAAAAATATTGTTTGCACTTTCCACTCCGATGGAAATACGCAATGAATGCTGTTTACCTTCGCATTCATCACCCAAAATGTATTTAGGTACATGCTTTTTTGACCTTTCTTCCTCATGGGGAATTGATGACCGTGATGACCTGCTGCGCACAATTCACCGAATGATCGATAACGGTCATGCCGCTCGGTTGGCAGGGTTTTATCACCGCTGGTTTCGTTATTCGCCATGTGAATGGCGTGACTATCTTGCTGAACTAAATGAGCAAGGGCAGGCTTATGCGCAAttt > 2:967233/2‑289 (MQ=255) cAAAAAATATTGTTTGCACTTTCCACTCCGATGGAAATACGCAATGAATGCTGTTTACCTTCGCATTCATCACCCAAAATGTATTTAGGTACATGCTTTTTTGACCTTTCTTCCTCATGGGGAATTGATGACCGTGATGACCTGCTGCGCACAATTCACCGAATGATCGATAACGGTCATGCCGCTCGGTTGGCAGGGTTTTATCACCGCTGGTTTCGTTATTCGCCATGTGAATGGCGTGACTATCTTGCTGAACTAAATGAGCAAGGTCAGGCTTATGCGCAATTTg > 1:464810/1‑289 (MQ=255) ttGCACTTTCCACTCCGATGGAAATACGCAATGAATGCTGTTTACCTTCGCATTCATCACCCAAAATGTATTTAGGTACATGCTTTTTTGACCTTTCTTCCTCATGGGGAATTGATGACCGTGATGACCTGCTGCGCACAATTCACCGAATGATCGATAACGGTCATGCCGCTCGGTTGGCAGGGTTTTATCACCGCTGGTTTCGTTATTCGCCATGTGAATGGCGTTACTATCTTGCTGAACTAAATGAGCAAGGTCAGGCTTATGCGCAATTTGTCGCCAGCAccg > 1:190839/1‑288 (MQ=255) tGCACTTTCCACTCCGATGGAAATACGCAATGAATGCTGTTTACCTTCGCATTCATCACCCAAAATGTATTTAGGTACATGCTTTTTTGACCTTTCTTCCTCATGGGGAATTGATGACCGTGATGACCTGCTGCGCACAATTCACCGAATGATCGATAACGGTCATGCCGCTCGGTTGGCAGGGTTTTATCACCGCTGGTTTCGTTATTCGCCATGTGAATGGCGTGACTATCTTGCTGAACTAAATGAGCAAGGTCAGGCTTATGCGCAATTTGTCGCCAGCAccgcc < 1:1384213/289‑1 (MQ=255) tCCACTCCGATGGAAATACGCAATGAATGCTGTTTACCTTCGCATTCATCACCCAAAATGTATTTAGGTACATGCTTTTTTGACCTTTCTTCCTCATGGGGAATTGATGACCGTGATGACCTGCTGCGCACAATTCACCGAATGATCGATAACGGTCATGCCGCTCGGTTGGCAGGGTTTTATCACCGCTGGTTTCGTTATTCGCCATGTGAATGGCGTGACTATCTTGCTGAACTAAATGAGCAAGGTCAGGCTTATGCGCAATTTGTCGCCAGCACCTCCGGAtctt > 2:503189/1‑286 (MQ=255) tCCACTCCGATGGAAATACGCAATGAATGCTGTTTACCTTCGCATTCATCACCCAAAATGTATTTAGGTACATGCTTTTTTGACCTTTCTTCCTCATGGGGAATTGATGACCGTGATGACCTGCTGCGCACAATTCACCGAATGATCGATAACGGTCATGCCGCTCGGTTGGCAGGGTTTTATCACCGCTGGTTTCGTTATTCGCCATGTGAATGGCGTGACTATCTTGCTGAACTAAATGAGCAAGGTCAGGCTTATGCGCAATTTGTCGCCAGCACCGCCGAAt > 2:1380414/1‑286 (MQ=255) ccGATGGAAATACGCAATGAATGCTGTTTACCTTCGCATTCATCACCCAAAATGTATTTAGGTACATGCTTTTTTGACCTTTCTTCCTCATGGGGAATTGATGACCGTGATGACCTGCTGCGCACAATTCACCGAATGATCGATAACGGTCATGCCGCTCGGTTGGCAGGGTTTTATCACCGCTGGTTTCGTTATTCGCCATGTGAATGGCGTGACTATCTTGCTGAACTAAATGAGCAAGGTCAGGCTTATGCGCAATTTGTCGCCAGCACCGCCGAATGCTGTGGCg < 1:745118/289‑1 (MQ=255) tGGAAATACGCAATGAATGCTGTTTACCTTCGCATTCATCACCCAAAATGTATTTAGGTACATGCTTTTTTGACCTTTCTTCCTCATGGGGAATTGATGACCGTGATGACCTGCTGCGCACAATTCACCGAATGATCGATAACGGTCATGCCGCTCGGTTGGCAGGGTTTTATCACCGCTGGTTTCGTTATTCGCCATGTGAATGGCGTGACTATCTTGCTGAACTAAATGAGCAAGGTCAGGCTTATGCGCAATTTGTCGCCAGCACCGCCGAATGCtggtgccgagg > 2:368228/1‑280 (MQ=255) tGGAAATACGCAATGAATGCTGTTTACCTTCGCATTCATCACCCAAAATGTATTTAGGTACATGCTTTTTTGACCTTTCTTCCTCATGGGGAATTGATGACCGTGATGACCTGCTGCGCACAATTCACCGAATGATCGATAACGGTCATGCCGCTCGGTTGGCAGGGTTTTATCACCGCTGGTTTCGTTATTCGCCATGTGAATGGCGTGACTATCTTGCTGAACTAAATGAGCAAGGTCAGGCTTATGCGCAATTTGTCGCCAGCACCGCCGAATGCTGTGGCGAAgg > 2:1766803/1‑289 (MQ=255) tGGAAATACGCAATGAATGCTGTTTACCTTCGCATTCATCACCCAAAATGTATTTAGGTACATGCTTTTTTGACCTTTCTTCCTCATGGGGAATTGATGACCGTGATGACCTGCTGCGCACAATTCACCGAATGATCGATAACGGTCATGCCGCTCGGTTGGCAGGGTTTTATCACCGCTGGTTTCGTTATTCGCCATGTGAATGGCGTGACTATCTTGCTGAACTAAATGAGCAAGGTCAGGCTTATGCGCAATTTGTCGCCAGCACCGCCGAATGCTGTGGCGAAgg > 2:891101/1‑289 (MQ=255) tGGAAATACGCAATGAATGCTGTTTACCTTCGCATTCATCACCCAAAATGTATTTAGGTACATGCTTTTTTGACCTTTCTTCCTCATGGGGAATTGATGACCGTGATGACCTGCTGCGCACAATTCACCGAATGATCGATAACGGTCATGC‑‑CTCGGTTGGCAGGGTTTTATCACCGCTGGTTTCGTTATTCGCCATGTGAATGGCGTGACTATCTTGCTGAACTAAATGAGCAAGGTCAGGCTTATGCGCAATTTGTCGCCAGCACCGCCGAATGCTGTGGCGAAgggg > 1:14499/1‑289 (MQ=255) aCGCAATGAATGCTGTTTACCTTCGCATTCATCACCCAAAATGTATTTAGGTACATGCTTTTTTGACCTTTCTTCCTCATGGGGAATTGATGACCGTGATGACCTGCTGCGCACAATTCACCGAATGATCGATAAAGGTCCTGCCGCTCGGTTGGCAGGGTTTTATCACCGCTGGTTTCGTTATTCGCCATGTGCATGGCGTGCGTAGCTTGCTGAACTAAATTAGCAAGGTAAGGCTTATCGGCAATGTGTCGCCAGACACGCCGAAGGATGTGGCGCAGGGGGTATc > 2:1693447/1‑289 (MQ=255) cGCAATGAATGCTGTTTACCTTCGCATTCATCACCCAAAATGTATTTAGGTACATGCTTTTTTGACCTTTCTTCCTCATGGGGAATTGATGACCGTAATGACCTGCTGCGCACAATTCACCGAATGATCGATAACGGTCATGCCGCTCGGTTGGCAGGGTTTTATCACCGCTGGTTTCGTTATTCGCCATGTGAATGGCGTGACTATCTTGCTGAACTAAATGAGCAAGGTCAGGCTTATGCGCAATTTGTCGCCAGCACCGCCGAATGCTGTGGCGAAGGGGGAATCa < 1:959068/289‑1 (MQ=255) cAATGAATGCTGTTTACCTTCGCATTCATCACCCAAAATGTATTTAGGTACATGCTTTTTTGACCTTTCTTCCTCATGGGGAATTGATGACCGTGATGACCTGCTGCGCACAATTCACCGAATGATCGATAACGGTCATGCCGCTCGGTTGGCAGGGTTTTATCACCGCTGGTTTCGTTATTCGCCATGTGAATGGCGTGACTATCTTGCTGAACTAAATGAGCAAGGTCAGGCTTATGCGCAATTTGTCGCCAGCa > 1:104127/1‑257 (MQ=255) cAATGAATGCTGTTTACCTTCGCATTCATCACCCAAAATGTATTTAGGTACATGCTTTTTTGACCTTTCTTCCTCATGGGGAATTGATGACCGTGATGACCTGCTGCGCACAATTCACCGAATGATCGATAACGGTCATGCCGCTCGGTTGGCAGGGTTTTATCACCGCTGGTTTCGTTATTCGCCATGTGAATGGCGTGACTATCTTGCTGAACTAAATGAGCAAGGTCAGGCTTATGCGCAATTTGTCGCCAGCa < 2:104127/257‑1 (MQ=255) atgaatgCTGTTTACCTTCGCATTCATCACCCAAAATGTATTTAGGTACATGCTTTTTTGACCTTTCTTCCTCATGGGGAATTGATGACCGTGATGACCTGCTGCGCACAATTCACCGAATGATCGATAACGGTCATGCCGCTCGGTTGGCAGGGTTTTATCACCGCTGGTTTCGTTATTCGCCATGTGAATGGCGTGACTATCTTGCTGAACTAAATGAGCAAGGTCAGGCTTATGCGCAATTTGTCGCCAGCACCGCCGAATGCTGTGGCGAAGGGGGAATCAAAGc < 1:204799/289‑1 (MQ=255) cttcgcattcatcacccAAAATGTATTTAGGTACATGCTTTTTTGACCTTTCTTCCTCATGGGGAATTGATGACCGTGATGACCTGCTGCGCACAATTCACCGAATGATCGATAACGGTCATGCCGCTCGGTTGGCAGGGTTTTATCACCGCTGGTTTCGTTATTCGCCATGTGAATGGCGTGACTATCTTGCTGAACTAAATGAGCAAGGTCAGGCTTATGCGCAATTTGTCGCCAGCACCGCCGAATGCTGTGGCGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTCCg > 1:325091/15‑289 (MQ=255) cgcattcatcacccAAAATGTATTTAGGTACATGCTTTTTTGACCTTTCTTCCTCATGGGGAATTCATGACCGTGATGACCTGCTGCGCACAATTCACCGAATGATCGATAACGGTCATACCGCTCGGTTGGCAGGGTTTTATCACCGCTGGTTTCGTTATTCTCCATGTGAATGGCGTGACTATCTTGCTGAACTAAATGAGCAAGGTCAGGCTTATGCGCAATTTGTCGCCAGCACCGCCGAATGCTGTGGCGCAGGGGGCATCAAAGCCTGGGATTACGTCCGGAt > 2:776716/12‑289 (MQ=255) atcacccAAAATGTATTTAGGTACATGCTTTTTTGACCTTTCTTCCTCATGGGGAATTGATGACCGTGATGACCTGCTGCGCACAATTCACCGAATGATCGATAACGGTCATGCCGCTCGGTTGGCAGGGTTTTATCACCGCTGGTTTCGTTATTCGCCATGTGAATGGCGTGACTATCTTGCTGAACTAAATGAGCAAGGTCAGGCTTATGCGCAATTTGTCGCCAGCACCGCCGAATGCTGTGGCGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTCCGGATGGGtttt > 1:1661293/5‑289 (MQ=255) aaggTATTGAGGTATATGCTTTTTTGACCTTTCTTCCTCATGGGGAATTGATGACCGTGATGACCTGCTGCGCACAATTCACCGAATGATCGATAACGGTCATGCCGCTCGGTTGGCAGGGTTTTATCACCGCTGGTTTCGTTATTCGCCATGTGAATGGCGGGACTATCTTGCTGAACTAAATGAGCAAGGTCAGGCTTATGCGCAATTTGTCGCCAGCACCGCCGAATGCTGTGGCGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTCCGGATGGGTTTTTTAAGCCGa < 2:1857420/286‑1 (MQ=255) ttAGGTACATGCTTTTTTGACCTTTCTTCCTCATGGGGAATTGATGACCGTGATGACCTGCTGCGCACAATTCACCGAATGATCGATAACGGTCATGCCGCTCGGTTGGCAGGGTTTTATCACCGCTGGTTTCGTTATTCGCCATGTGAATGGCGTGACTATCTTGCTGAACTAAATGAGCAAGGTCAGGCTTATGCGCAATTTGTCGCCAGCACCGCCGAATGCTGTGGCGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTCCGGATGGGTTTTTTAAGCCGAATGGGCg < 1:173763/289‑1 (MQ=255) ttAGGTACATGCTTTTTTGACCTTTCTTCCTCATGGGGAATTGATGACCGTGATGACCTGCTGCGCACAATTCACCGAATGATCGATAACGGTCATGCCGCTCGGTTGGCAGGGTTTTATCACCGCTGGTTTCGTTATTCGCCATGTGAATGGCGTGACTATCTTGCTGAACTAAATGAGCAAGGTCAGGCTTATGCGCAATTTGTCGCCAGCACCGCCGAATGCTGTGGCGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTCCGGATGGGTTTTTTAAGCCGAATGGGCg < 1:416364/289‑1 (MQ=255) ttAGGTACATGCTTTTTTGACCTTTCTTCCTCATGGGGAATTGATGACCGTGATGACCTGCTGCGCACAATTCACCGAATGATCGATAACGGTCATGCCGCTCGGTTGGCAGGGTTTTATCACCGCTGGTTTCGTTATTCGCCATGTGAATGGCGTGACTATCTTGCTGAACTAAATGAGCAAGGTCAGGCTTATGCGCAATTTGTCGCCAGCACCGCCGAATGCTGTGGCGAAGAGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTCCGGATGGGTTTTTTAAGCCGAATGGGCg < 1:1693447/289‑1 (MQ=255) ggTACATGCTTTTTTGACCTTTCTTCCTCATGGGGAATTGATGACCGTGATGACCTGCTGCGCACAATTCACCGAATGATCGATAACGGTCATGCCGCTCGGTTGGCAGGGTTTTATCACCGCTGGTTTCGTTATTCGCCATGTGAATGGCGTGACTATCTTGCTGAACTAAATGAGCAAGGTCAGGCTTATGCGCAATTTGTCGCCAGCACCGCCGAATGCTGTGGCGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTCCGGATGGGTTTTTTAAGCCGAATGGGCGt > 1:1569412/1‑287 (MQ=255) cATGCTTTTTTGACCTTTCTTCCTCATGGGGAATTGATGACCGTGATGACCTGCTGCGCACAATTCACCGAATGATCGATAACGGTCATGCCGCTCGGTTGGCAGGGTTTTATCACCGCTGGTTTCGTTATTCGCCATGTGAATGGCGTGACTATCTTGCTGAACTAAATGAGCAAGGTCAGGCTTATGCGCAATTTGTCGCCAGCACCGCCGAATGCTGTGGCGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTCCGGATGGGTTTTTTAAGCCGAATGGGCGTACTtaa > 1:399417/1‑289 (MQ=255) cATGCTTTTTTGACCTTTCTTCCTCATGGGGAATTGATGACCGTGATGACCTGCTGCGCACAATTCACCGAATGATCGATAACGGTCATGCCGCTCGGTTGGCAGGGTTTTATCACCGCTGGTTTCGTTATTCGCCATGTGAATGGCGTGACTATCTTGCTGAACTAAATGAGCAAGGTCAGGCTTATGCGCAATTTGTCGCCAGCACCGCCGAATGCTGTGGCGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTCCGGATGGGTTTTTTAAGCCGAATGGGCGTACTtaa > 2:116507/1‑289 (MQ=255) tttttGACCTTTCTTCCTCATGGGGAATTGATGACCGTGATGACCTGCTGCGCACAATTCACCGAATGATCGATAACGGTCATGCCGCTCGGTTGGCAGGGTTTTATCACCGCTGGTTTCGTTATTCGCCATGTGAATGGCGTGACTATCTTGCTGAACTAAATGAGCAAGGTCAGGCTTATGCGCAATTTGTCGCCAGCACCGCCGAATGCTGTGGCGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTCCGGATGGGTTTTTTAAGCCGAATGGGCGTACTTAATAACTg > 1:1720984/1‑289 (MQ=255) tttCTTCCTCATGGGGAATTGATGACCGTGATGACCTGCTGCGCACAATTCACCGAATGATCGATAACGGTCATGCCGCTCGGTTGGCAGGGTTTTATCACCGCTGGTTTCGTTATTCGCCATGTGAATGGCGTGACTATCTTGCTGAACTAAATGAGCAAGGTCAGGCTTATGCGCAATTTGTCGCCAGCACCGCCGAATGCTGTGGCGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTCCGGATGGGTTTTTTAAGCCGAATGGGCGTACTTAATAACTGGTTGAGCga > 2:268596/1‑289 (MQ=255) tcttcctcatGGGGAATTGATGACCGTGATGACCTGCTGCGCACAATTCACCGAATGATCGATAACGGTCATGCCGCTCGGTTGGCAGGGTTTTATCACCGCTGGTTTCGTTATTCGCCATGTGAATGGCGTGACTATCTTGCTGAACTAAATGAGCAAGGTCAGGCTTATGCGCAATTTGTCGCCAGCACCGCCGAATGCTGTGGCGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTCCGGATGGGTTTTTTAAGCCGAATGGGCGTACTTAATAACTGGTTGAGctgag > 2:1779227/10‑285 (MQ=255) tcttcctcatGGGGAATTGATGACCGTGATGACCTGCTGCGCACAATTCACCGAATGATCGATAACGGTCATGCCGCTCGGTTGGCAGGGTTTTATCACCGCTGGTTTCGTTATTCGCCATGTGAATGGCGTGACTATCTTGCTGAACTAAATGAGCAAGGTCAGGCTTATGCGCAATTTGTCGCCAGCACCGCCGAATGCTGTGGCGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTCCGGATGGGTGTTTTAAGCCGAATGGGCGTACTTAATAACTGGTTGAGCgaag > 1:1710316/10‑289 (MQ=255) ttcctcatGGGGAATTGATGACCGTGATGTCCTGCTGCGCACAATTCACCGAATGATCGATAACGGTCATGCCGCTCGGTTGGCAGGGTTTTATCACCGCTGGTTTCGTTATTCGCCATGTGAATGGCGTGACTATCTTGCTGAACTAAATGAGCAAGGTCAGGCTTATGCGCAATTTGTCGCCAGCACCGCCGAATGCTGTGGCGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTCCGGATGGGTTTTTTAAGCCGAATGGGCGTACTTAATAACTGGTTGAGCgaagaa < 1:279320/282‑1 (MQ=255) ctcatGGGGAATTGATGACCGTGATGACCTGCTGCGCACAATTCACCGAATGATCGATAACGGTCATGCCGCTCGGTTGGCAGGGTTTTATCACCGCTGGTTTCGTTATTCGCCATGTGAATGGCGTGACTATCTTGCTGAACTAAATGAGCAAGGTCAGGCTTATGCGCAATTTGTCGCCAGCACCGCCGAATGCTGTGGCGAAGGGGAAATCAAAGCCTGGGATTATGTCCGGATGGGTTTTTTAAGCCGAATGGGCGTACTTAATAACTGGTTGAGCgaagaagaa < 1:569387/285‑1 (MQ=255) ggggAATTGATGACCGTGATGACCTGCTGCGCACAATTCACCGAATGATCGATAACGGTCATGCCGCTCGGTTGGCAGGGTTTTATCACCGCTGGTTTCGTTATTCGCCATGTGAATGGCGTGACTATCTTGCTGAACTAAATGAGCAAGGTCAGGCTTATGCGCAATTTGTCGCCAGCACCGCCGAATGCTGTGGCGAAGGGGGAATCAACGCCTGGGATTATGTCCGGATGGGTTTTTTAAGCCGAATGGGCGTACTTAATAACTGGTTGAGCGAAGAAGAAAGTCt > 1:1074320/1‑289 (MQ=255) ggggAATTGATGACCGTGATGACCTGCTGCGCACAATTCACCGAATGATCGATAACGGTCATGCCGCTCGGTTGGCAGGGTTTTATCACCGCTGGTTTCGTTATTCGCCATGTGAATGGCGTGACTATCTTGCTGAACTAAATGAGCAAGGTCAGGCTTATGCGCAATTTGTCGCCAGCACCGCCGAATGCTGTGGCGAAGGGGGAATCAAAGCCt < 1:1298197/216‑1 (MQ=255) ggggAATTGATGACCGTGATGACCTGCTGCGCACAATTCACCGAATGATCGATAACGGTCATGCCGCTCGGTTGGCAGGGTTTTATCACCGCTGGTTTCGTTATTCGCCATGTGAATGGCGTGACTATCTTGCTGAACTAAATGAGCAAGGTCAGGCTTATGCGCAATTTGTCGCCAGCACCGCCGAATGCTGTGGCGAAGGGGGAATCAAAGCCt > 2:1298197/1‑216 (MQ=255) tgatgaCCGTGATGACCTGCTGCGCACCATTCACCGAATGATCGATAACGGTCATGCCGCTCGGTTGGCAGGGTTTTATCACCGCTGGTTTCGTTATTCGCCATGTGAATGGCGTGACTATCTTGCTGAACTAAATGAGCAAGGTCAGGCTTATGCGCAATTTGTCGCCAGCACCGCCGAATGCTGTGGCGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTCCGGATGGGTTTTTTAAGCCGAATGGGCGTACTTAATAACTGGTTGAGCGAAGAAGAAAGTCTATGGATc < 2:1674056/289‑1 (MQ=255) tgaCCTGCTGCGCACAATTCACCGAATGATCGATAACGGTCATGCCGCTCGGTTGGCAGGGTTTTATCACCGCTGGTTTCGTTATTCGCCATGTGAATGGCGTGACTATCTTGCTGAACTAAATGAGCAAGGTCAGGCTTATGCGCAATTTGTCGCCAGCACCGCCGAATGCTGTGGCGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTCCGGATGGGTTTTTTAAGCCGAATGGGCGTACTTAATAACTGGTTGAGCGAAGAAGAAAGTCTATGGATCCagtcgcgcat < 1:761900/288‑9 (MQ=255) tgaCCTGCTGCGCACAATTCACCGAATGATCGATAACGGTCATGCCGCTCGGTTGGCAGGGTTTTATCACCGCTGGTTTCGTTATTCGCCATGTGAATGGCGTGACTATCTTGCTGAACTAAATGAGCAAGGTCAGGCTTATGCGCAATTTGTCGCCAGCACCGCCGAATGCTGTGGCGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTCCGGATGGGTTTTTTAAGCCGAATGGGCGTACTTAATAACTGGTTGAGCGAAGAAGAAAGTCTATGGATCCAGTCGCGCAtt < 2:258885/289‑1 (MQ=255) ctgctgCGCACAATTCACCGAATGATCGATAACGGTCATGC‑‑CTCGGTTGGAAGGGTTTTATCACCGCTGGTTTCGTTATTCGCCATGTGAATGGCGTGACTATCTTGCTGAACTAAATGAGCAAGGTCAGGCTTATGCGCAATTTGTCGCCAGCACCGCCGAATGCTGTGGCGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTCC‑GATGGGTTTTTTAAGCCGAATGGGCGTACTTAATAACTGGTTGAGCGAAGAAGAAAGTCTATGGATCCAGTCGCGCATTCATCTAc < 2:14499/289‑1 (MQ=255) tgctgcGCACAATTCACCGAATGATCGATAACGGTCATGCCGCTCGGTTGGCAGGGTTTTATCACCGCTGGTTTCGTTATTCGCCATGTGAATGGCGTGACTATCTTGCTGAACTAAATGAGCAAGGTCAGGCTTATGCGCAATTTGTCGCCAGCACCGCCGAATGCTGTGGCGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTCCGGATGGGTTTTTTAAGCCGAATGGGCGTACTTAATAACTGGTTGAGCGAAGAAGAAAGTCTATGGATCCAGTCGCGCATTCATc > 2:41917/1‑288 (MQ=255) tgctgcGCACAATTCACCGAATGATCGATAACGGTCATGCCGCTCGGTTGGCAGGGTTTTATCACCGCTGGTTTCGTTATTCGCCATGTGAATGGCGTGACTATCTTGCTGAACTAAATGAGCAAGGTCAGGCTTATGCGCAATTTGTCGCCAGCACCGCCGAATGCTGTGGCGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTCCGGATGGGTTTTTTAAGCCGAATGGGCGTACTTAATAACTGGTTGAGCGAAGAAGAAAGTCTATGGATCCAGTCGCGCATTCATCt > 2:665367/1‑289 (MQ=255) tgctgcGCACAATTCACCGAATGATCGATAACGGTCATGCCGCTCGGTTGGCAGGGTTTTATCACCGCTGGTTTCGTTATTCGCCATGTGAATGGCGTGACTATCTTGCTGAACTAAATGAGCAAGGTCAGGCTTATGCGCAATTTGTCGCCAGCACCGCCGAATGCTGTGGCGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTCCGGATGGGTTTTTTAAGCCGAATGGGCGTACTTAATAACTGGTTGAGCGAAGAAGAAAGTCTATGGATCCAGTCGCGCATTCATCt < 1:503189/289‑1 (MQ=255) tgctgcGCACAATTCACCGAATGATCGATAACGGTCATGCCGCTCGGTTGGCAGGGTTTTATCACCGCTGGTTTCGTTATTCGCCATGTGAATGGCGTGACTATCTTGCTGAACTAAATGAGCAAGGTCAGGCTTATGCGCAATTTGTCGCCAGCACCGCCGAATGCTGTGGCGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTCCGGATGGGTTTTTTAAGCCGAATGGGCGTACTTAATAAATGGTTGAGGGAAGAATAAAGGCTATGGTTCCAGTCGCGCATCCAtat > 2:1246598/1‑287 (MQ=255) gctgcGCACAATTCACCGAATGATCGATAACGGTCATGCCGCTCGGTTGGCAGGGTTTTATCACCGCTGGTTTCGTTATTCGCCATGTGAATGGCGTGACTATCTTGCTGAACTAAATGAGCAAGGTCAGGCTTATGCGCAATTTGTCGCCAGCACCGCCGAATGCTGTGGCGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTCCGGATGGGTTTTTTAAGCCGAATGGGCGTACTTAATAACTGGTTGAGCGAAGAAGAAAGTCTATGGATCCAGTCGCGCATTCATCTa < 1:1048863/289‑1 (MQ=255) gctgcGCACAATTCACCGAATGATCGATAACGGTCATGCCGCTCGGTTGGCAGGGTTTTATCACCGCTGGTTTCGTTATTCGCCATGTGAATGGCGTGACTATCTTGCTGAACTAAATGAGCAAGGTCAGGCTTATGCGCAATTTGTCGCCAGCACCGCCGAATGCTGTGGCGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTCCGGATGGGTTTTTTAAGCCGAATGGGCGTACTTAATAACTGGTTGAGCGAAGAAGAAAGTCTATGGATCCAGTCGCGCATTCATCTa < 1:1600961/289‑1 (MQ=255) ttcgcACAATTCACCGAATGATCGATAACGGTCATGCCGCTCGGTTGGCAGGGTTTTATCACCGCTGGTTTCGTTATTCGCCATGTGAATGGCGTGACTATCTTGCTGAACTAAATGAGCAAGGTCAGGCTTATGCGCAATTTGTCGCCAGCACCGCCGAATGCTGTGGCGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTCCGGATGGGTTTTTTAAGCCGAATGGGCGTACTTAATAACTGGTTGAGCGAAGAAGAAAGTCTATGGATCCAGTCGCGCATTCATCTACg < 1:870216/287‑1 (MQ=255) tgcGCACAATTCACCGAATGATCGATAACGGTCATGCCGCTCGGTTGGCAGGGTTTTATCACCGCTGGTTTCGTTATTCGCCATGTGAATGGCGTGACTATCTTGCTGAACTAAATGAGCAAGGTCAGGCTTATGCGCAATTTGTCGCCAGCACCGCCGAATGCTGTGGCGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTCCGGATGGGTTTTTTAAGCCGAATGGGCGTACTTAATAACTGGTTGAGCGAAGAAGAAAGTCTATGGATCCAGTCGCGCATTCATCTAc < 2:399417/288‑1 (MQ=255) tgcGCACAATTCACCGAATGATCGATAACGGTCATGCCGCTCGGTTGGCAGGGTTTTATCACCGCTGGTTTCGTTATTCGCCATGTGAATGGCGTGACTATCTTGCTGAACTAAATGAGCAAGGTCAGGCTTATGCGCAATTTGTCGCCAGCACCGCCGAATGCTGTGGCGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTCCGGATGGGTTTTTTAAGCCGAATGGGCGTACTTAATAACTGGTTGAGCGAAGAAGAAAGTCTATGGATCCAGTCGCGCATTCATCTACg < 1:891101/289‑1 (MQ=255) gaccaATTCCCCGAATGATGGATAACGGTCATGCCGCTCGGTTGGCAGGGTTTTATCACCGCTGGTTTCGTTATTCGCCATGTGAATGGCGTGACTATCTTGCTGAACTAAATGAGCAAGGTCAGGCTTATGCGCAATTTGTCGCCAGCACCGCCGAATGCTGTGGCGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTCCGGATGGGTTTTTTAAGCCGAATGGGCGTACTTAATAACTGGTTGAGCGAAGAAGAAAGTCTATGGATCCAGTCGCGCATTCATCTACggg < 2:1546616/285‑1 (MQ=255) acaATTCACCGAATGATCGATAACGGTCATGCCGCTCGGTTGGCAGGGTTTTATCACCGCTGGTTTCGTTATTCGCCATGTGAATGGCGTGACTATCTTGCTGAACTAAATGAGCAAGGTCAGGCTTATGCGCAATTTGTCGCCAGCACCGCCGAATGCTGTGGCGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTCCGGATGGGTTTTTTAAGCCGAATGGGCGTACTTAATAACTGGTTGAGCGAAGAAGAAAGTCTATGGATCCAGTCGCGCATTCATCTACGGGctc < 1:1184476/289‑1 (MQ=255) acaATTCACCGAATGATCGATAACGGTCATGCCGCTCGGTTGGCAGGGTTTTATCACCGCTGGTTTCGTTATTCGCCATGTGAATGGCGTGACTATCTTGCTGAACTAAATGAGCAAGGTCAGGCTTATGCGCAATTTGTCGCCAGCACCGCCGAATGCTGTGGCGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTCCGGATGGGTTTTTTAAGCCGAATGGGCGTACTTAATAACTGGTTGAGCGAAGAAGAAAGTCTATGGATCCAGTCGCGCATTCATCTACGGGct < 2:959478/288‑1 (MQ=255) aaTTCACCGAATGATCGATAACGGTCATGCCGCTCGGTTGGCAGGGTTTTATCACCGCTGGTTTCGTTATTCGCCATGTGAATGGCGTGACTATCTTGCTGAACTAAATGAGCAAGGTCAGGCTTATGCGCAATTTGTCGCCAGCACCGCCGAATGCTGTGGCGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTCCGGATGGGTTTTTTAAGCCGAATGGGCGTACTTAATAACTGGTTGAGCGAAGAAGAAAGTCTATGGATCCAGTCGCGCATTCATCTACGGGCTCTa < 1:1009179/289‑1 (MQ=255) ttCACCGAATGATCGATAACGGTCATGCCGCTCGGTTGGCAGGGTTTTATCACCGCTGGTTTCGTTATTCGCCATGTGAATGGCGTGACTATCTTGCTGCACTAAATGAGCAAGGTCAGGCTTATGCGCAATTTGTCGCCAGCACCGCCGAATGCTGTGGCGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTCCGGATGGGTTTTTTAAGCCGAATGGGCGTACTTAATAACTGGTTGAGCGAAGAAGAAAGTCTATGGAACAAGTAGCGCATTCATCTACGGGCTCTACg > 2:184434/1‑289 (MQ=255) ttCACCGAATGATCGATAACGGTCATGCCGCTCGGTTGGCAGGGTTTTATCACCGCTGGTTTCGTTATTCGCCATGTGAATGGCGTGACTATCTTGCTGAACTAAATGAGCAAGGTCAGGCTTATGCGCAATTTGTCGCCAGCACCGCCGAATGCTGTGGCGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTCCGGATGGGTTTTTTAAGCCGAATGGGCGTACTta < 1:1574319/225‑1 (MQ=255) ttCACCGAATGATCGATAACGGTCATGCCGCTCGGTTGGCAGGGTTTTATCACCGCTGGTTTCGTTATTCGCCATGTGAATGGCGTGACTATCTTGCTGAACTAAATGAGCAAGGTCAGGCTTATGCGCAATTTGTCGCCAGCACCGCCGAATGCTGTGGCGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTCCGGATGGGTTTTTTAAGCCGAATGGGCGTACTTAATAACTGGTTGAGCGAAGAAGAAAGTCTATGGATCCAGTCGCGCATTCATCTACGGGCTCTACg < 2:325091/289‑1 (MQ=255) ttCACCGAATGATCGATAACGGTCATGCCGCTCGGTTGGCAGGGTTTTATCACCGCTGGTTTCGTTATTCGCCATGTGAATGGCGTGACTATCTTGCTGAACTAAATGAGCAAGGTCAGGCTTATGCGCAATTTGTCGCCAGCACCGCCGAATGCTGTGGCGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTCCGGATGGGTTTTTTAAGCCGAATGGGCGTACTTAATAACTGGTTGAGCGAAGAAGAAAGTCTATGGATCCAGTCGCGCATTCATCTACGGGCTCTACg > 1:1525897/1‑289 (MQ=255) aCCGAATGATCGATAACGGTCATGCCGCTCGGTTGGCAGGGTTTTATCACCGCTGGTTTCGTTATTCGCCATGTGAATGGCGTGACTATCTTGCTGAACTAAATGAGCAAGGTCAGGCTTATGCGCAATTTGTCGCCAGCACCGCCGAATGCTGTGGCGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTCCGGATGGGTTTTTTAAGCCGAATGGGCGTACTTAATAACTGGTTGAGCGAAGAAGAAAGTCTATGGATCCAGTCGCGCATTCATCTACGGGCTCTACGtta > 1:1224337/1‑289 (MQ=255) cGAATGATCGATAACGGTCATGCCGCTCGGTTGGCAGGGTTTTATCACCGCTGGTTTCGTTATTCGCCATGTGAATGGCGAGACTATCTTGCTGAACTAAATGAGCAAGGTCAGGCTTATGCGCAATTTGTCGCCAGCACCGCCGAATGCTGTGGCGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTCCGGATGGGTTTTTTAAGCCGAATGGGCGTACTTAATAACTGGTTGAGCGAAGAAGAAAGTCTATGGATCCAGTCGCGCATTCATCTACGGGCTCTACGttatt > 1:247566/1‑289 (MQ=255) aTGATCGATAACGGTCATGCCGCTCGGTTGGCAGGGTTTTATCACCGCTGGTTTCGTTATTCGCCATGTGAATGGCGTGACTATCTTGCTGAACTAAATGAGCAAGGTCAGGCTTATGCGCAATTTGTCGCCAGCACCGCCGAATGCTGTGGCGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTCCGGATGGGTTTTTTAAGCCGAATGGGCGTACTTAATAACTGGTTGAGCGAAGAAGAAAGTCTATGGATCCAGTCGCGCATTCATCTACGGGCTCTACGTTATtata > 1:1875777/1‑289 (MQ=255) aTGATCGATAACGGTCATGCCGCTCGGTTGGCAGGGTTTTATCACCGCTGGTTTCGTTATTCGCCATGTGAATGGCGTGACTATCTTGCTGAACTAAATGAGCAAGGTCAGGCTTATGCGCAATTTGTCGCCAGCACCGCCGAATGCTGTGGCGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTCCGGATGGGTTTTTTAAGCCGAATGGGCGTACTTAATAACTGGTTGAGCGAAGAAGAAAGTCTATGGATCCAGTCGCGCATTCATCTACGGCCTCTACGTTATtata > 2:1612497/1‑289 (MQ=255) gATCGATAACGGTCATGCCGCTCGGTTGGCAGGGTTTTATCACCGCTGGTTTCGTTATTCGCCATGTGAATGGCGTGACTATCTTGCTGAACTAAATGAGCAAGGTCAGGCTTATGCGCAATTTGTCGCCAGCACCGCCGAATGCTGTGGCGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTCCGGATGGGTTTTTTAAGCCGAATGGGCGTACTTAATAACTGGTTGAGCGTAGAAGAAAGTCTATGGATCCAGTCTAGCATTCATCTACGGGCTCTACCTTATtatatt > 2:692149/1‑287 (MQ=255) gATAACGGTCATGCCGCTCGGTTGGCAGGGTTTTATCACCGCTGGTTTCGTTATTCGCCATGTGAATGGCGTGACTATCTTGCTGAACTAAATGAGCAAGGTCAGGCTTATGCGCAATTTGTCGCCAGCACCGCCGAATGCTGTGGCGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTCCGGATGGGTTTTTTAAGCCGAATGGGCGTACTTAATAACTGGTTGAGCGAAGAAGAAAGTCTATGGATCCAGTCGCGCATTCATCTACGGGCTCTACGTTATTATAGTAACt < 1:1328967/289‑1 (MQ=255) gTCATGCCGCTCGGTTGGCAGGGTTTTATCACCGCTGGTTTCGTTATTCGCCATGTGAATGGCGTGACTATCTTGCTGAACTAAATGAGCAAGGTCAGGCTTATGCGCAATTTGTCGCCAGCACCGCCGAATGCTGTGGCGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTCCGGATGGGTTTTTTAAGCCGAATGGGCGTACTTAATAACTGGTTGAGCGAAGAAGAAAGTCTATGGATCCAGTCGCGCATTCATCTACGGGCTCTACGTTATTATAGTAACTGGCGGCa > 2:1789031/1‑289 (MQ=255) tCATGCCGCTCGGTTGGCAGGGTTTTATCACCGCTGGTTTCGTTATTCGCCATGTGAATGGCGTGACTATCTTGCTGAACTAAATGAGTAAGGTCAGGCTTATGCGCAATTTGTCGCCAGCACCGCCGAATGCTGTGGCGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTCCGGATGGGTTTTTTAAGCCGAATGGGCGTACTTAATAACTGGTTGAGCGAAGAAGAAAGTCTATGGATCCAGTCGCGCATTCATCTACggg > 1:1786028/1‑260 (MQ=255) aTGCCGCTCGGTTGGCAGGGTTTTATCACCGCTGGTTTCGTTATTCGCCATGTGAATGGCGTGACTATCTTGCTGAACTAAATGAGCAAGGTCAGGCTTATGCGCAATTTGTCGCCAGCACCGCCGAATGCTGTGGCGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTCCGGATGGGTTTTTTAAGCCGAATGGGCGTACTTAATAACTGGTTGAGCGAAGAAGAAAGTCTATGGATCCAGTCGCGCATTCATCTACGGGctc < 2:1911249/261‑1 (MQ=255) aTGCCGCTCGGTTGGCAGGGTTTTATCACCGCTGGTTTCGTTATTCGCCATGTGAATGGCGTGACTATCTTGCTGAACTAAATGAGCAAGGTCAGGCTTATGCGCAATTTGTCGCCAGCACCGCCGAATGCTGTGGCGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTCCGGATGGGTTTTTTAAGCCGAATGGGCGTACTTAATAACTGGTTGAGCGAAGAAGAAAGTCTATGGATCCAGTCGCGCATTCATCTACGGGCTCTACGTTATTATAGTAACTGGCGGCAAt > 2:1317853/1‑288 (MQ=255) gCCGCTCGGTTGGCAGGGTTTTATCACCGCTGGTTTCGTTATTCGCCATGTGAATGGCGTGACTATCTTGCTGAACTAAATGAGCAAGGTCAGGCTTATGCGCAATTTGTCGCCAGCACCGCCGAATGCTGTGGCGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTCCGGATGGGTTTTTTAAGCCGAATGGGCGTACTTAATAACTGGTTGAGCGAAGAAGAAAGTCTATGGATCCAGTCGCGCATTCATCTACGGGCTCTACGTTATTATAGTAACTGGCGGCAATACt > 1:807310/1‑289 (MQ=255) ggtCGGGTGGCAGGGTTTTATCACCGGTGGTTTCGGTATTCTCCATGTGAATGGCGTGACTATCTTGCTGAACTAAATGAGCAAGGTCAGGCTTATGCGCAATTTGTCGCCAGCACCGCCGAATGCTGTGGCGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTCCGGATGGGTTTTTTAAGCCGAATGGGCGTACTTAATAACTGGTTGAGCGAAGAAGAAAGTCTATGGATCCAGTCGCGCATTCATCTACGGGCTCTACGTTATTATAGTAACTGGCGGCAATACTTTg < 2:1710316/287‑1 (MQ=255) gCTCGGTTGGCAGGGTTTTATCACCGCTGGTTTCGTTATTCGCCATGTGAATGGCGTGACTATCTTGCTGAACTAAATGAGCAAGGTCAGGCTTATGCGCAATTTGTCGCCAGCACCGCCGAATGCTGTGGCGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTCCGGATGGGTTTTTTAAGCCGAATGGGCGTACTTAATAACTGGTTGAGCGAAGAAGAAAGTCTATGGATCCAGTCGCGCATTCATCTACGGGCTCTACGTTATTATAGTAACTGGCGGCAATACTTTg < 2:102792/289‑1 (MQ=255) cGGTTGGCAGGGTTTTATCACCGCTGGTTTCGTTATTCGCCATGTGAATGGCGTGACTATCTTGCTGAACTAAATGAGCAAGGTCAGGCTTATGCGCAATTTGTCGCTAGCACCGCCGAATGCTGTGGCGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGGTTCTGTCCGGATGGGTTTTTTAAGCCGAATGGGCGTCTTTAATAACTGGTTGAGCGAAGAAGAAAGTCTATGGATCCAGTCGTGCATTTCTCTACGGGCTCTACGATATTATAGTAACATTCGGCAATACttttgcg > 2:1210162/1‑285 (MQ=255) cGGTTGGCAGGGTTTTATCACCGCTGGTTTCGTTATTCGCCATGTGAATGGCGTGACTATCTTGCTGAACTAAATGAGCAAGGTCAGGCTTATGCGCAATTTGTCGCCAGCACCGCCGAATGCTGTGGCGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTCCGGATGGGTTTTTTAAGCCGAATGGGCGTACTTAATAACTGGTTGAGCGAAGAAGAAAGTCTATGGATCCAGTCGCGCATTCATCTACGGGCTCTACGTTATTATAGTAACTGGCGGCAATACTTTGCCg > 1:1726840/1‑289 (MQ=255) cGGTTGGCAGGGTTTTATCACCGCTGGTTTCGTTATTCGCCATGTGAATGGCGTGACTATCTTGCTGAACTAAATGAGCAAGGTCAGGCTTATGCGCAATTTGTCGCCAGCACCGCCGAATGCTGTGGCGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTCCGGATGGGTTTTTTAAGCCGAATGGGCGTACTTAATAACTGGTTGAGCGAAGAAGAAAGTCTATGGATCCAGTCGCGCATTCATCTACGGGCTCTACGGTATTATAGTAACTGGCGGCAATACTTTTCCg > 2:1346421/1‑289 (MQ=255) aGGGTTTTATCACCGCTGGTTTCGTTATTCGCCATGTGAATGGCGTGACTATCTTGCTGAACTAAATGAGCAAGGTCAGGCTTATGCGCAATTTGTCGCCAGCACCGCCGAATGCTGTGGCGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTCCGGATGGGTTTTTTAAGCCGAATGGGCGTACTTAATAACTGGTTGAGCGAAGAAGAAAGTCTATGGATCCAGTCGCGCATTCATCTACGGGCTCTACGGTATTATAGTAAATGGCGGAAATACTTTGCCGGttcaac > 2:1003169/1‑284 (MQ=255) ggTTTTATCACCGCTGGTTTCGTTATTCGCCCTGTGAATGGCGTGACTATCTTGCTGAACTAAATGAGCAAGGTCAGGCTTATGCGCAATTTGTCGCCAGCACCGCCGAATGCTGTGGCGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTCCGGATGGGTTTTTTAAGCCGAATGGGCGTACTTAATAACTGGTTGAGCGAAGAAGAAAGTCTATGGATCCAGTCGCGCATTCATCTACGGGCTCTACGTTATTATAGTAACTGGCGGCAATACTTTGCCGGTTATACCt < 2:462594/288‑1 (MQ=255) cACCGCTGGTTTCGTTATTCGCCATGTGAATGGCGTGACTATCTTGCTGAACTAAATGAGCAAGGTCAGGCTTATGCGCAATTTGTCGCCAGCACCGCCGAATGCTGTGGCGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTCCGGATGGGTTTTTTAAGCCGAATGGGCGTACTTAATAACTGGTTGAGCGAAGAAGAAAGTCTATGGATCCAGTCGCGCATTCATCTACGGGCTCTACGTTATTATAGTAACTGGCGGCAATACTTTGCCGGTTATACCTTTGGTCGGc < 2:807310/289‑1 (MQ=255) ccGCTGGTTTCGTTATTCGCCATGTGAATGGCGTGACTATCTTGCTGAACTAAATGAGc < 1:1244948/59‑1 (MQ=255) ccGCTGGTTTCGTTATTCGCCATGTGAATGGCGTGACTATCTTGCTGAACTAAATGAGAAAGGTCAGGCTTATGCGCAATTTGTCGCCAGCACCGCCGAATGCTGTGGCGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTCCGGATGGGTTTTTTAAGCCGAATGGGCGTACTTAATAACTGGTTGAGCGAAGAAGAAAGTCTATGGATCCAGTCGCGCATTCATCTACGGGCTCTACGTTATTATAGTAACTGGCGGCAATACTTTGCCGGTTATACCTTTGGTCGGCaa > 2:477395/1‑289 (MQ=255) cGCTGGTTTCGTTATTCGCCATGTGAATGGCGTGACTATCTTGCTGAACTAAATGAGCAAGGTCAGGCTTATGCGCAATTTGTCGCCAGCACCGCCGAATGCTGTGGCGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTCCGGATGGGTTTTTTAAGCCGAATGGGCGTACTTAATAACTGGTTGAGCGAAGAAGAAAGTCTATGGATCCAGTCGCGCATTCATCTACGGGCTCTACGTTATTATAGTAACTGGCGGCaa > 1:544073/1‑258 (MQ=255) cGCTGGTTTCGTTATTCGCCATGTGAATGGCGTGACTATCTTGCTGAACTAAATGAGCAAGGTCAGGCTTATGCGCAATTTGTCGCCAGCACCGCCGAATGCTGTGGCGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTCCGGATGGGTTTTTTAAGCCGAATGGGCGTACTTAATAACTGGTTGAGCGAAGAAGAAAGTCTATGGATCCAGTCGCGCATTCATCTACGGGCTCTACGTTATTATAGTAACTGGCGGCAATACTTTGCCGGTTATACCTTTGGTCGGCAat > 2:531619/1‑289 (MQ=255) gCTGGTTTCGTTATTCGCCATGTGAATGGCGTGACTATCTTGCTGAACTAAATGAGCAAGGTCAGGCTTATGCGCAATTTGTCGCCAGCACCGCCGAATGCTGTGGCGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTCCGGATGGGTTTTTTAAGCCGAATGGGCGTACTTAATAACTGGTTGAGCGAAGAAGAAAGTCTATGGATCCAGTCGCGCATTCATCTACGGGCTCTACGTTATTATAGTAACTGGCGGCAATACTTTGCCGGTTATACCTTTGGTCGGTAata > 2:603770/1‑289 (MQ=255) gCTGGTTTCGTTATTCGCCATGTGAATGGCGTGACTATCTTGCTGAACTAAATGAGCAAGGTCAGGCTTATGCGCAATTTGTCGCCAGCACCGCCGAATGCTGTGGCGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTCCGGATGGGTTTTTTAAGCCGAATGGGCGTACTTAATAACTGGTTGAGCGAAGAAGAAAGTCTATGGATCCAGTCGCGCATTCATCTACGGGCTCTACGTTATTATAGTAACTGGCGGCAATACTTTGCCGGTTATACCGTTGGTCGGCAata > 1:1814465/1‑289 (MQ=255) gCTGGTTTCGTTATTCGCCATGTGAATGGCGTGACTATCTTGCTGAACTAAATGAGCAAGGTCAGGCTTATGCGCAATTTGTCGCCAGCACCGCCGAATGCTGTGGCGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTCCGGATGGGTTTTTTAAGCCGAATGGGCGTACTTAATAACTGGTTGAGCGAAGAAGAAAGTCTATGGATCCAGTCGCGCATTCATCTACGGGCTCTACGTTATTATAGTAACTGGCGGCAATACTTTGCCGGGTATACCTTTGGTCGGCAata > 1:628775/1‑289 (MQ=255) tttCGTTATTCGCCATGTGAATGGCGTGACTATCTTGCTGAACTAAATGAGCAAGGTCAGGCTTATGCGCAATTTGTCGCCAGCACCGCCGAATGCTGTGGCGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTCCGGATGGGTTTTTTAAGCCGAATGGGCGTACTTAATAACTGGTTGAGCGAAGAAGAAAGTCTATGGATCCAGTCGCGCATTCATCTACGGGCTCTACGTTATTATAGTAACTGGCGGCAATACTTTGCCGGTTATACCTTTGGTCGGCAATATTgg < 1:68049/288‑1 (MQ=255) tCGTTATTCGCCATGTGAATGGCGTGACTATCTTGCTGAACTAAATGAGCAAGGTCAGGCTTATGCGCAATTTGTCGCCAGCACCGCCGAATGCTGTGGCGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTCCGGATGGGTTTTTTAAGCCGAATGGGCGTACTTAATAACTGGTTGAGCGAAGAAGAAAGTCTATGGATCCAGTCGCGCATTCATCTACGGGCTCTACGTTATTATAGTAACTGGCGGCAATACTTTGCCGGTTATACCTTTGGTCGGCAATATTGGCAg < 1:1091540/289‑1 (MQ=255) ||| GCTAATATTCATTTAATGAATATTTAAGGATAAATTATATGGACATGGAGAGCCAAAAAATATTGTTTGCACTTTCCACTCCGATGGAAATACGCAATGAATGCTGTTTACCTAGCCATAGTAGTCCCAAAATGTATTTAGGTACATGCTTTTTTGACCTTTCTTCCAGTTGGGGAATTGATGACCGTGATGACCTGCTGCGCACAATTCACCGAATGATCGATAACGGTCATGCCGCTCGGTTGGCAGGGTTTTATCACCGCTGGTTTCGTTATAGCCCATGTGAATGGCGTGACTATCTTGCTGAACTAAATGAGCAAGGTCAGGCTTATGCGCAATTTGTCGCCAGCACCGCCGAATGCTGTGGCGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTCCGGATGGGTTTTTTAAGCCGAATGGGCGTACTTAATAACTGGTTGAGCGAAGAAGAAAGTCTATGGATCCAGAGCCGCATTCATCTACGGGCTCTACGTTATTATAGTAACTGGCGGCAATACTTTGCCGGTTATACCTTTGGTCGGCAATATTGGCAGT > CP042583/550290‑550847 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |