Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 557,955 | 3 bp→TGA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 557,955 | 0 | A | T | 99.2% | 592.8 / NA | 252 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (114/135); minor base G (0/2); total (115/137) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.02e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 557,956 | 0 | C | G | 98.8% | 593.1 / NA | 252 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); major base G (111/137); minor base T (3/0); total (115/137) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 9.23e-02 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 557,957 | 0 | T | A | 98.0% | 582.2 / NA | 252 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); major base A (113/131); minor base G (0/5); total (115/137) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.53e-02 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 253 total aligned reads displayed.
GGTTCCGCACTTTCACGCAGCGTTTTCGCCATCAGCTCTACCGCCGTACAGTTTTGCGGTGCGAATGTCGGTTCCGGTAATGCCGGGCCGTCGAGACCGCTTTCGCCGTGCACATTGTCCGCGATAATCAACTCACGCATTAACGGTTTTACCGCGCCGCCTGCTACCGGAATATCGGTGCGATTAAGCAAGGTCAGCATACGCAGAACATTGCGTAAGGTTTTTTCTGGTGTCTGGTTTCCGGCGGAAGACGTAATTGCTTTGACATCAAGCTCTGGACTGGCGAGGGCGAGAACTATTGCGATAGCGTCGTCATGACCTGGGTCGCAATCTAACAGAATTGGCAGTGCCATTGTTGCTCCTTGTTGTGTGCTTCTTTGCGACAAGGGTAACGCCAGGATGTAACAGATACGAGGGGCGAAACGATAAAGCGTGAGATGGCGCGCAATTGGGTATGCGCGCCAGAGTGATTAATGCAGGATTTTCGCGAGGAAGTC‑TTTTGCGCGGTCGCTTTTCGGATCATCGAAGAAAGCGTCTTTCGGGCTGTCTTCGACAATTTTACC > CP042583/557677‑558239 ||| ggTTCCGCACTTTCACGCAGCGTTTTCGCCATCAGCTCTACCGCCGTACAGTTTTGCGGTGCGAATGTCGGTTCCGGTAATGCCGGGCCGTCGAGACCGCTTTCGCCGTGCACATTGTCCGCGATAATCAACTCACGCATTAACGGTTTTACCGCGCCGCCTGCTACCGGAATATCGGTGCGATTAAGCAAGGTCAGCATACGCAGAACATTGCGTAAGGTTTTTTCTGGTGTCTGGTTTCCGGCGGAAGACGTAATTGCTTTGACATCAAGCTCTGGTGAggcgagg > 1:1418573/1‑288 (MQ=255) ttCCGCACTTTCACGCAGCGTTTTCGCCATCAGCTCTACCGCCGTACAGTTTTGCGGTGCGAATGTCGGTTCCGGTAATGCCGGGCCGTCGAGACCGCTTTCGCCGTGCACATTGTCCGCGATAATCAACTCACGCATTAACGGTTTTACCGCGCCGCCTGCTACCGGAATATCGGTGCGATTAAGCAAGGTCAGCATACGCAGAACATTGCGTAAGGTTTTTTCTGGTGTCTGGTTTCCGGCGGAAGACGTAATTGCTTTGACATCAAGCTCTGGTGAggcgagggcg > 1:1857254/1‑289 (MQ=255) ccGCACTTTCACGCAGCGTTTTCGCCATCAGCTCTACCGCCGTACAGTTTTGCGGTGCGAATGTCGGTTCCGGTAATGCCGGGCCGTCGAGACCGCTTTCGCCGTGCACATTGTCCGCGATAATCAACTCACGCATTAACGGTTTTACCGCGCCGCCTGCTACCGGAATATCGGTGCGATTAAGCAAGGTCAGCCTACGCAGGACATTGCGTAAGGTTTTTTCTGGGGTCTGGTTTCCGGCGAGAGACGTAATTGCTTTGACATCAAGCTCTGGTGAggtgagggggag > 2:1650044/1‑289 (MQ=255) cGCACTTTAACGCAGCGGTTGCGACATAAGCTCTACCGCCGTACAGGTTTGCGGTGCGAATGTCGGTTCCGGTAATGCCGGGCCGTCGAGACCGCTGTCGCCGTGCACATTGTCCGCGATAATCAACTCACGCATTAACGGTTTTACCGCGCCGCCTGCTACCGGAATATCGGTGCGATTAAGCAAGGTCAGCATACGCAGAACATTGCGTAAGGTTTTTTCTGGTGTCTGGTTTCCGGCGGAAGACGTAATTGCTTTGACATCAAGCTCTGGTGAggcgagggcgag < 1:496415/288‑1 (MQ=255) cACTTTCACGCAGCGTTTTCGCCATCAGCTCTACCGCCGTACAGTTTTGCGGTGCGAATGTCGGTTCCGGTAATGCCGGGCCGTCGAGACCGCTTTCGCCGTGCACATTGTCCGCGATAATCAACTCACGCATTAACGGTTTTACCGCGCCGCCTGCTACCGGAATATCGGTGCGATTAAGCAAGGTCAGCATACGCAGAACATTGCGTAAGGTTTTTTCTGGTGTCTGGTTTCCGGCGGAAGACGTAATTGCTTTGACATCAAGCTCTGGTGAGGCGAGGGCgaga > 1:1591288/1‑287 (MQ=255) tCACGCAGCGTTTTCGCCATCAGCTCTACCGCCGTACAGTTTTGCGGTGCGAATGTCGGTTCCGGTAATGCCGGGCCGTCGAGACCGCTTTCGCCGTGCACATTGTCCGCGATAATCAACTCACGCATTAACGGTTTTACCGCGCCGCCTGCTACCGGAATATCGGTGCGATTAAGCAAGGTCAGCATACGCAGAACATTGCGTAAGGTTTTTTCTGGTGTCTGGTTTCCGGCGGAAGACGTAATTGCTTTGACATCAAGCTCTGGTGAGGCGAGGGCGAGAACTAtt > 1:1665463/1‑288 (MQ=255) gTTTTCGCCCTCCGATATACCGCCGTACAGTTTTGCGGTGCGAATGTCGGTTCCGGTAATGCCGGGCCGTCGAGACCGCTTTCGCCGTGCACATTGTCCGCGATAATCAACTCACGCATTAACGGTTTTACCGCGCCGCCTGCTACCGGAATATCGGTGCGATTAAGCAAGGTCAGCATACGCAGAACATTGCGTAAGGTTTTTTCTGGTGTCTGGTTTCCGGCGGAAGACGTAATTGCTTTGACATCAAGCTCTGGTGAGGCGAGGGCGAGAACTATTGCGATAGcg < 2:1568308/288‑1 (MQ=255) ttttCGCCATCAGCTCTACCGCCGTACAGTTTTGCGGTGCGAATGTCGGTTCCGGTAATGCCGGGCCGTCGAGACCGCTTTCGCCGTGCACATTGTCCGCGATAATCAACTCACGCATTAACGGTTTTACCGCGCCGCCTGCTACCGGAATATCGGTGCGATTAAGCAAGGTCAGCATACGCAGAACATTGCGTAAGGTTTTTTCTGGTGTCTGGTTTCCGGCGGAAGACGTAATTGCTTTGACATCAAGCTCTGGTGAGGCGAGGGCGAGAACTATTGCGATAGcgtc > 1:1214729/1‑289 (MQ=255) gTACAGTTTTGCGGTGCGAATGTCGGTTCCGGTAATGCCGGGCCGTCGAGACCGCTTTCGCCGTGCACATTGTCCGCGATAATCAACTCACGCATTAACGGTTTTACCGCGCCGCCTGCTACCGGAATATCGGTGCGATTAAGCAAGGTCAGCATACGCAGAACATTGCGTAAGGTTTTTTCTGGTGTCTGGTTTCCGGCGGAAGACGTAATTGCTTTGACATCAAGCTCTGGTGAGGCGAGGGCGAGAACTATTGCGATAGCGTCGTCATGACCTGGGTCGCAATCTa < 1:631877/289‑1 (MQ=255) gTACAGTTTTGCGGTGCGAATGTCGGTTCCGGTAATGCCGGGCCGTCGAGACCGCTTTCGCCGTGCACATTGTCCGCGATAATCAACTCACGCATTAACGGTTTTACCGCGCCGCCTGCTACCGGAATATCGGTGCGATTAAGCAAGGTCAGCATACGCAGAACATTGCGTAAGGTTTTTTCTGGTGTCTGGTTTCCGGCGGAAGACGTAATTGCTTTGACATCAAGCTCTGGTGAGGCGAGGGCGAGAACTATTGCGATAGCGTCGTCATGACCTGGGTCGCAATCTa > 1:1772483/1‑289 (MQ=255) gTACAGTTTTGCGGTGCGAATGTCGGTTCCGGTAATGCCGGGCCGTCGAGACCGCTTTCGCCGTGCACATTGTCCGCGATAATCAACTCACGCATTAACGGTTTTACCGCGCCGCCTGCTACCGGAATATC‑GTGCGATTAAGCAAGGTCAGCATACGCAGAACATTGCGTAAGGTTTTTTCTGGTGTCTGGTTTCCGGCGGAAGACGTAATTGCTTTGACATCAAGCTCTGGTGAGGCGAGGGCGAGAACTATTGCGATAGCGTCGTCATGACCTGGGTCGCAATCTaa < 2:531569/289‑1 (MQ=255) tACAGTTTTGCGGTGCGAATGTCGCTTCCGGTAATCCCGGGCCGGCGAGACCGCTTTCGCCGTGCACATTGTCCGCGATAATCAACTCACGCATTAACGGTTTTACCGCGCCGCCTGCTACCGGAATATCGGTGCGATTAAGCAAGGTCAGCATACGCAGAACATTGCGTAAGGTTTTTTCTGGTGTCTGGTTTCCGGCGGAAGACGTAATTGCTTTGACATCAAGCTCTGGTGAGGCGAGGGCGAGAACTATTGCGATAGCGTCGTCATGACCTGGGTCGCAATCTaa < 2:1503905/289‑1 (MQ=255) aCAGTTTTGCGGTGCGAATGTCGGTTCCGGTAATGCCGGGCCGTCGAGACCGCTTTCGCCGTGCACATTGTCCGCGATAATCAACTCACGCATTAACGGTTTTACCGCGCCGCCTGCTACCGGAATATCGGTGCGATTAAGCAAGGTCAGCATACGCAGAACATTGCGTAAGGTTTTTTCTGGTGTCTGGTTTCCGGCGGAAGACGTAATTGCTTTGACATCAAGCTCTGGTGAGGCGAGGGCGAGAACTATTGCGATAGCGTCGTCATGACCTGGGTCGCAATCTAAc < 1:834639/289‑1 (MQ=255) ttttGCGGTGCGAATGTCGGTTCCGGTAATGCCGGGCCGTCGAGACCGCTTTCGCCGTGCACATTGTCCGCGATAATCAACTCACGCATTAACGGTTTTACCGCGCCGCCTGCTACCGGAATATCGGTGCGATTAAGCAAGGTCAGCATACGCAGAACATTGCGTAAGGTTTTTTCTGGTGTCTGGTTTCCGGCGGAAGACGTAATTGCTTTGACATCAAGCTCTGGTGAGGCGAGGGCGAGAACTATTGCGATAGCGTCGTCATGACCTGGGTCGCAATCTAACAGaa > 2:940514/1‑289 (MQ=255) tGCGGTGCGAATGTCGGTTCCGGTAATGCCGGGCCGTCGAGACCGCTTTCGCCGTGCACATTGTCCGCGATAATCAACTCACGCATTAACGGTTTTACCGCGCCGCCTGCTACCGGAATATCGGTGCGATTAAGCAAGGTCAGCATACGCAGAACATTGCGTAAGGTTTTTTCTGGTGTCTGGTTTCCGGCGGAAGACGTAATTGCTTTGACATCAAGCTCTGGTGAGGCGAGGGCGAGAACTATTGCGATAGCGTCGTCATGACCTGGGTCGCAATCTAACAGAATTg > 2:428660/1‑289 (MQ=255) gCGGTGCGAATGTCGGTTCCGGTAATGCCGGGCCGTCGAGACCGCTTTCGCCGTGCACATTGTCCGCGATAATCAACTCACGCATTAACGGTTTTACCGCGCCGCCTGCTACCGGAATATCGGTGCGATTAAGCAAGGTCAGCATACGCAGAACATTGCGTAAGGTTTTTTCTGGTGTCTGGTTTCCGGCGGAAGACGTAATTGCTTTGACATCAAGCTCTGGTGAGGCGAGGGCGAGAACTATTGCGATAGCGTCGTCATGACCTGGGTCGCAATCTAACAGAATTgg < 1:337817/289‑1 (MQ=255) cGGTGCGAATGTCGGTTCCGGTAATGCCGGGCCGTCGAGACCGCTTTCGCCGTGCACATTGTCCGCGATAATCAACTCACGCATTAACGGTTTTACCGCGCCGCCTGCTACCGGAATATCGGTGCGATTAAGCAAGGTCAGCATACGCAGAACATTGCGTAAGGTTTTTTCTGGTGTCTGGTTTCCGGCGGAAGACGTAATTGCTTTGACATCAAGCTCTGGTGAGGCGAGGGCGAGAACTATTGCGATAGCGTCGTCATGACCTGGGTCGCAATCTAACAGAATTGGc > 1:1877849/1‑289 (MQ=255) tGCGAATGTCGGTTCCGGTAATGCCGGGCCGTCGAGACCGCTTTCGCCGTGCACATTGTCCGCGATAATCAACTCACGCATTAACGGTTTTACCGCGCCGCCTGCTACCGGAATATCGGTGCGATTAAGCAAGGTCAGCATACGCAGAACATTGCGTAAGGTTTTTTCTGGTGTCTGGTTTCCGGCGGAAGACGTAATTGCTTTGACATCAAGCTCTGGTGAGGCGAGGGCGAGAACTATTGCGATAGCGTCGTCATGACCTGGGTCGCAATCTAACAGAATTGGCAg < 1:447377/288‑1 (MQ=255) cGAATGTCGGTTCCGGTAATGCCGGGCCGTCGAGACCGCTTTCGCCGTGCACATTGTCCGCGATAATCAACTCACGCATTAACGGTTTTACCGCGCCGCCTGCTACCGGAATATCGGTGCGATTAAGCAAGGTCAGCATACGCAGAACATTGCGTAAGGTTTTTTCTGGTGTCTGGTTTCCGGCGGAAGACGTAATTGCTTTGACATCAAGCTCTGGTGAGGCGAGGGCGAGAACTATTGCGATAGCGTCGTCATGACCTGGGTCGCAATCTAACAGAATTGGCAGTg > 2:383004/1‑288 (MQ=255) gAATGTCGGTTCCGGTAATGCCGGGCCGTCGAGACCGCTTTCGCCGTGCACATTGTCCGCGATAATCAACTCACGCATTAACGGTTTTACCGCGCCGCCTGCTACCGGAATATCGGTGCGATTAAGCAAGGTCAGCATACGCAGAACATTGCGTAAGGTTTTTTCTGGTGTCTGGTTTCCGGCGGAAGACGTAATTGCTTTGACATCAAGCTCTGGTGAGGCGAGGGCGAGAACTATTGCGATAGCGTCGTCATGACCTGGGTCGCAATCTAACAGAATTGGCAGTGc < 1:1112997/288‑1 (MQ=255) gAATGTCGGTTCCGGTAATGCCGGGCCGTCGAGACCGCTTTCGCCGTGCACATTGTCCGCGATAATCAACTCACGCATTAACGGTTTTACCGCGCCGCCTGCTACCGGAATATCGGTGCGATTAAGCAAGGTCAGCATACGCAGAACATTGCGTAAGGTTTTTTCTGGTGTCTGGTTTCCGGCGGAAGACGTAATTGCTTTGACATCAAGCTCTGGTGAGGCGAGGGCGAGAACTATTGCGATAGCGTCGTCATGACCTGGGTCGCAATCTAACAGAATTGGCAGTGc < 1:797358/288‑1 (MQ=255) aTGTCGGTTCCGGTAATGCCGGGCCGTCGAGACCGCTTTCGCCGTGCACATTGTCCGCGATAATCAACTCACGCATTAACGGTTTTACCGCGCCGCCTGCTACCGGAATATCGGTGCGATTAAGCAAGGTCAGCATACGCAGAACATTGCGTAAGGTTTTTTCTGGTGTCTGGTTTCCGGCGGAAGACGTAATTGCTTTGACATCAAGCTCTGGTGAGGCGAGGGCGAGAACTATTGCGATAGCGTCGTCATGACCTGGGTCGCAATCTAACAGAATTGGCAGTGCCa < 1:428660/288‑1 (MQ=255) cGGTTCCGGTAATGCCGGGCCGTCGAGACCGCTTTCGCCGTGCACATTGTCCGCGATAATCAACTCACGCATTAACGGTTTTACCGCGCCGCCTGCTACCGGAATATCGGTGCGATTAAGCAAGGTCAGCATACGCAGAACATTGCGTAAGGTTTTTTCTGGTGTCTGGTTTCCGGCGGAAGACGTAATTGCTTTGACATCAAGCTCTGGTGAGGCGAGGGCGAGAACTATTGCGATAGCGTCGTCATGACCTGGGTCGCAATCTAACAGAATTGGCAGTGCCAttgtt < 1:586976/289‑1 (MQ=255) cGGTTCCGGTAATGCCGGGCCGTCGAGACCGCTTTCGCCGTGCACATTGTCCGCGATAATCAACTCACGCATTAACGGTTTTACCGCGCCGCCTGCTACCGGAATATCGGTGCGATTAAGCAAGGTCAGCATACGCAGAACATTGCGTAAGGTTTTTTCTGGTGTCTGGTTTCCGGCGGAAGACGTAATTGCTTTGACATCAAGCTCTGGTGAGGCGAGGGCGAGAACTATTGCGATAGCGTCGTCATGACCTGGGTCGCAATCTAACAGAATTGGCAGTGCCAttgtt < 2:1857254/289‑1 (MQ=255) ggTTCCGGTAATGCCGGGCCGTCGAGACCGCTTTCGCCGTGCACATTGTCCGCGATAATCAACTCACGCATTAACGGTTTTACCGCGCCGCCTGCTACCGGAATATCGGTGCGATTAAGCAAGGTCAGCATACGCAGAACATTGCGTAAGGTTTTTTCTGGTGTCTGGTTTCCGGCGGAAGACGTAATTGCTTTGACATCAAGCTCTGGTGAGGCGAGGGCGAGAACTATTGCGATAGCGTCGTCATGACCGGGGTCGCAATCGACCCGAATTGGCACTGCCAttgttg > 2:119777/1‑289 (MQ=255) taccGGTAATGCCGGCAAGGCGAGACCGCTTGAGCCGTGCACATTGCACGCGATAATCAAATCACGCATTAACGGTGTTACAGCGCCGCCTGCTCACGGAATATCGGTCAGATTAAGCAAGGTAAGCATACGCAGAACATTGAGTAAGGTTTTTTCTGGTGGATGGGGGCCGGCGGAAGAAGTAATGGCTTGGACATCAAGCTCTGGTGAGGCGAGGGCGAGAACTATTGCGATAGCGTCGTCATGAcc < 1:840031/247‑1 (MQ=255) ccGGTAATGCCGGGCCGTCGAGACCGCTTTCGCCGTGCACATTGTCCGCGATAATCAACTCACGCATTAACGGTTTTACCGCGCCGCCTGCTACCGGAATATCGGTGCGATTAAGCAAGGTCAGCATACGCAGAACATTGCGTAAGGTTTTTTCTGGTGTCTGGTTTCCGGCGGAAGACGTAATTGCTTTGACATCAAGCTCTGGTGAGGCGAGGGCGAGAACTATTGCGATAGCGTCGTCATGACCTGGGTCGCAATCTAACAGAATTGGCAGTGCCATTGTTGCt > 1:1448052/1‑287 (MQ=255) cGGTAATGCCGGGCCGTCGAGACCGCTTTCGCCGTGCACATTGTCCGCGATAATCAACTCACGCATTAACGGTTTTACCGCGCCGCCTGCTACCGGAATATCGGTGCGATTAAGCAAGGTCAGCATACGCAGAACATTGCGTAAGGTTTTTTCTGGTGTCTGGTTTCCGGCGGAAGACGTAATTGCTTTGACATCAAGCTCTGGTTAGGCGAGGGCGAGAACTATTGCGATAGCGTCGTCATGACCTGGGTCGCAATCTAACAGAATTGGCAGTGCCATTGTCGCTCCt > 2:1733736/1‑289 (MQ=255) cGGTAATGCCGGGCCGTCGAGACCGCTTTCGCCGTGCACATTGTCCGCGATAATCAACTCACGCATTAACGGTTTTACCGCGCCGCCTGCTACCGGAATATCGGTGCGATTAAGCAAGGTCAGCATACGCAGAACATTGCGTAAGGTTTTTTCTGGTGTCTGGTTTCCGGCGGAAGACGTAATTGCTTTGACATCAAGCTCTGGTGAGGCGAGGGCGAGAACTATTGCGATAGCGTCGTCATGACCTGGGTCGCAATCTAACAGAATTGGCAGTGCCAttgtt > 2:754311/1‑283 (MQ=255) tAATGCCGGGCCGTCGAGACCGCTTTCGCCGTGCACATTGTCCGCGATAATCAACTCACGCATTAACGGTTTTACCGCGCCGCCTGCTACCGGAATATCGGTGCGATTAAGCAAGGTCAGCATACGCAGAACATTGCGTAAGGTTTTTTCTGGTGTCTGGTTTCCGGCGGAAGACGTAATTGCTTTGACATCAAGCTCTGGTGAGGCGAGGGCGAGAACTATTGCGATAGCGTCGTCATGACCTGGGTCGCAATCTAACAGAATTGGCAGTGCCATTGTTGCTCCttg < 1:692180/288‑1 (MQ=255) aaTGCCGGGCCGTCGAGACCGCTTTCGCCGTGCACATTGTCCGCGATAATCAACTCACGCATTAACGGTTTTACCGCGCCGCCTGCTACCGGAATATCGGTGCGATTAAGCAAGGTCAGCATACGCAGAACATTGCGTAAGGTTTTTTCTGGTGTCTGGTTTCCGGCGGAAGACGTAATTGCTTTGACATCAAGCTCTGGTGAGGCGAGGGCGAGAACTATTGCGATAGCGTCGTCATGACCTGGGTCGCAATCTAACAGAATTGGCAGTGCCATTGTTGCTCCttgtt < 1:807871/289‑1 (MQ=255) 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GGTTCCGCACTTTCACGCAGCGTTTTCGCCATCAGCTCTACCGCCGTACAGTTTTGCGGTGCGAATGTCGGTTCCGGTAATGCCGGGCCGTCGAGACCGCTTTCGCCGTGCACATTGTCCGCGATAATCAACTCACGCATTAACGGTTTTACCGCGCCGCCTGCTACCGGAATATCGGTGCGATTAAGCAAGGTCAGCATACGCAGAACATTGCGTAAGGTTTTTTCTGGTGTCTGGTTTCCGGCGGAAGACGTAATTGCTTTGACATCAAGCTCTGGACTGGCGAGGGCGAGAACTATTGCGATAGCGTCGTCATGACCTGGGTCGCAATCTAACAGAATTGGCAGTGCCATTGTTGCTCCTTGTTGTGTGCTTCTTTGCGACAAGGGTAACGCCAGGATGTAACAGATACGAGGGGCGAAACGATAAAGCGTGAGATGGCGCGCAATTGGGTATGCGCGCCAGAGTGATTAATGCAGGATTTTCGCGAGGAAGTC‑TTTTGCGCGGTCGCTTTTCGGATCATCGAAGAAAGCGTCTTTCGGGCTGTCTTCGACAATTTTACC > CP042583/557677‑558239 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |