Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 450,799 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 450,799 | 0 | A | T | 98.7% | 553.8 / NA | 238 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (94/139); minor base C (2/1); total (96/142) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.68e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 450,800 | 0 | G | C | 99.2% | 547.7 / NA | 238 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/1); new base C (95/138); total (96/142) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 450,801 | 0 | C | G | 98.7% | 548.2 / NA | 238 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/2); new base G (95/140); total (96/142) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 |
Only 100 of 239 total aligned reads displayed.
GGCGGCAAGCGATCCGCTGCCTGCTGAGTTACGCCAGTTTCGTCACTGTTTTCAGGCCGCGCTCAATGGCGTTAAGACCGACTGGCGGCACTGGCTGGGTAAAGGCCCCGGATTAACGCCGAGTCATGATGACACGCTGAGCGGAATGCTGCTGGCGGCCTGGTATTATGGCGCTTTAGATGCGCGCTCCGGTCGTCCGTTTTTTGCCTGTTCCGACAATCTGCAACTCGTTACCACAGCGGTGAGCGTCAGTTATTTACGTTATGCCGCGCAAGGATATTTCGC‑CAGC‑CCACTCCTGCACTTTGTTCATGCTCTGAGTTGCCCGAAACGTACCGCTGTTGCGATTGATAGCCTGCTGGCGCTGGGGCATACGAGTGGGGCAGATACGCTGCTGGGGTTCTGGCTTGGCCAACAATTATTACAAGGAAAACCATGAAAACACTGGTTGTGGCTCTTGGGGGCAACGCCTTACTCCAGCGCGGTGAGGCGCTGACGGCAGAAAATCAATATCGCAATATCGCCAGTGCTGTACCCGCGCTGGCACGCCTGGCCCGTTCTTATCGGTTGG > CP042583/450513‑451080 ||| aTCCGCTGCCTGCTGAGTTACGCCAGTTTCGTCACTGTTTTCAGGCCGCGCTCAATGGCGTTAAGACCGACTGGCGGCACTGGCTGGGTAAAGGCCCCGGATTAACGCCGAGTCATGATGACACGCTGAGCGGAATGCTGCTGGCGGCCTGGTATTATGGCGCTTTAGATGCGCGCTCCGGTCGTCCGTTTTTTGCCTGTTCCGACAATCTGCAACTCGTTACCACAGCGGTGAGCGTCAGTTATTTACGTTATGCCGCGCAAGGATATTTCGC‑CTCG‑CCACTCCTGc > 1:1168468/1‑288 (MQ=255) tCCGCTGCCTGCTTAGTTACGCAGGGTTCGTCGGTGATTAGGGGCCGCGCTCGATGGCGTTAAGACCGACTGGCGGCACGGGGTGGGTACAGGCCCCGGATTAACGCGGGGTCATGATGACACGCTGGGGGGAATGCTGCGGGCGGGCTGGTAGTATGGCGATTTAGAGGCGCGCTCCGGTCGTCCGTTTTTTGCCGGTTCCGACAATCTGCAACTCGTTAGCACGGCGGTGAGCGTCAGTTATTTACGTTATGCCGCGCAAGGATATTTCGC‑CTCG‑CCACTCCTGCAc < 2:256924/289‑1 (MQ=255) cGCTGCCTGCTGAGTTACGCCAGTTTCGTCACTGTTTTCAGGCCGCGCTCAATGGCGTTAAGACCGACTGGCGGCACTGGCTGGGTAAAGGCCCCGGATTAACGCCGAGTCATGATGACACGCTGAGCGGAATGCTGCTGGCGGCCTGGTATTATGGCGCTTTAGATGCGCGCTCCGGTCGTCCGTTTTTTGCCTGTTCCGACAATCTGCAACTCGTTACCACAGCGGTGAGCGTCAGTTATTTACGTTATGCCGCGCAAGGATATTTCGC‑CTCG‑CCACTCCTGCACtt < 1:844107/289‑1 (MQ=255) ccggtcgAGTTACGCCGGTTGTGTCACGGTTGTCGGGCCGCGCTCAAGGGCGGTAAGGCCGACGGGCGGCCCTGGCTGGGTAAAGGGCCCGGATTAACGCCGAGTCAGGATGACACGCTGAGCGGAATGCTGCTGGCGGCCTGGTATTATGGCGCTTTAGATGCCCGCTCCGGTCGTCCGTTTTTTGCCTGTTCCGACAATCTGCAACTCGTTACCACAGCGGTGAGCGTCAGTTATTTACGTTATGCCGCGCAAGGATATTTCGC‑CTCG‑CCACTCCTGCACTTTGTTc < 2:1402169/283‑1 (MQ=255) ctgctgAGTTACGCCAGTTTCGTCACTGTTTTCAGGCCGCGCTCAATGGCGTTAAGACCGACTGGCGGCACTGGCTGGGTAAAGGCCCCGGATTAACGCCGAGTCATGATGACACGCTGAGCGGAATGCTGCTGGCGGCCTGGTATTATGGCGCTTTAGATGCGCGCTCCGGTCGTCCGTTTTTTGCCTGTTCCGACAATCTGCAACTCGTTACCACAGCGGTGAGCGTCAGTTATTTACGTTATGCCGCGCAAGGATATTTCGC‑CTCG‑CCACTCCTGCACTTTGTTc < 2:1241637/288‑1 (MQ=255) ccgctgagcatcGCCAGTGTCGTCCCTGTTTTCAGGCCGAGCTCAATGGCGTTAAGACCGACTGGCGGCAATGGCGGGGTAAAGGCCCCGGATTAACGCCGAGTCATGACGACACGCTGAGCGGAATGCTGCTGGCGGCCTGGTATTATGGCGCTTTAGATGCGCGCGCCGGTCGTCCGTTTTTTGCCTGTTCCGACAATCTGCAACTCGTTAACACAGCGGTGAGCGTCAGTTATTTACGTTATGCCGCGCAAGGATATTTCGC‑CTCG‑CCACTCCTGCACTTTGTTc < 2:635159/277‑1 (MQ=255) tACGCCAGTTTCGTCACTGTTTTCAGGCCGCGCTCAATGGCGTTAAGACCGACTGGCGGCACTGGCTGGGTAAAGGCCCCGGATTAACGCCGAGTCATGATGACACGCTGAGCGGAATGCTGCTGGCGGCCTGGTATTATGGCGCTTTAGATGCGCGCTCCGGTCGTCCGTTTTTTGCCTGTTCCGACAATCTGCAACTCGTTACCACAGCGGTGAGCGTCAGTTATTTACGTTATGCCGCGCAAGGATATTTCGC‑CTCG‑CCACTCCTGCACTTTGTTCATGCTCTGAg > 1:1869255/1‑289 (MQ=255) tACGCCAGTTTCGTCACTGTTTTCAGGCCGCGCTCAATGGCGTTAAGACCGACTGGCGGCACTGGCTGGGTAAAGGCCCCGGATTAACGCCGAGTCATGATGACACGCTGAGCGGAATGCTGCTGGCGGCCTGGTATTATGGCGCTTTAGATGCGCGCTCCGGTCGTCCGTTTTTTGCCTGTTCCGACAATCTGCAACTCGTTACCACAGCGGTGAGCGTCAGTTATTTACGTTATGCCGCGCAAGGATATTTCGC‑CTCG‑CCACTCCTGCACTTTGTTCATGCTCTGAg < 1:911059/289‑1 (MQ=255) tACGCCAGTTTCGTCACGGGTTTCAGGGCGCGGTAAATGGCGTTAAGACCGACGGGCGGCACTGGCTGGCTAAAGGCCCCGGATTAACGCCGAGTCATGATGACACGCTGAGCGGAATGCTGCTGGCGGCCTGGTATTATGGCGCTTTAGATGCGCGCTCCGGTCGTCCGTTTTTTGCCTGTTCCGACAATCTGCAACTCGTTACCACAGCGGTGAGCGTCAGTTATTTACGTTATGCCGCGCAAGGATATTTCGC‑CTCG‑CCACTCCTGCACTTTGTTCATGCTCTGAg < 2:421635/289‑1 (MQ=255) cGCCAGTTTCGTCACTGTTTTCAGGCCGCGCTCAATGGCGTTAAGACCGACTGGCGGCACTGGCTGGGTAAAGGCCCCGGATTAACGCCGAGTCATGATGACACGCTGAGCGGAATGCTGCTGGCGGCCTGGTATTATGGCGCTTTAGATGCGCGCTCCGGTCGTCCGTTTTTTGCCTGTTCCGACAATCTGCAACTCGTTACCACAGCGGTGAGCGTCAGTTATTTACGTTATGCCGCGCAAGGATATTTCGC‑CTCG‑CCACTCCTGCACTTTGTTCATGCTCTGAGtt > 1:229557/1‑289 (MQ=255) cAGTTTCGTCACTGTTTTCAGGCCGCGCTCAATGGCGTTAAGACCGACTGGCGGCACTGGCTGGGTAAAGGCCCCGGATTAACGCCGAGTCATGATGACACGCTGAGCGGAATGCTGCTGGCGGCCTGGTATTATGGCGCTTTAGATGCGCGCTCCGGTCGTCCGTTTTTTGCCTGTTCCGACAATCTGCAACTCGTTACCACAGCGGTGAGCGTCAGTTATTTACGTTATGCCGCGCAAGGATATTTCGC‑CTCG‑CCACTCCTGCACTTTGTTCATGCTCTGAGTTGc < 1:599726/288‑1 (MQ=255) gTTTCGTCACTGTTTTCAGGCCGCGCTCAATGGCGTTAAGACCGACTGGCGGCACTGGCTGGGTAAAGGCCCCGGATTAACGCCGAGTCATGATGACACGCTGAGCGGAATGCTGCTGGCGGCCTGGTATTATGGCGCTTTAGATGCGCGCTCCGGTCGTCCGTTTTTTGCCTGTTCCGACAATCTGCAACTCGTTACCACAGCGGTGAGCGTCAGTTATTTACGTTATGCCGCGCAAGGATATTTCGC‑CTCG‑CCACTCCTGCACTTTGTTCATGCTCTGAGTTGCCCg > 1:1800024/1‑289 (MQ=255) ttCGTCACTGTTTTCAGGCCGCGCTCAATGGCGTTAAGACCGACTGGCGGCACTGGCTGGGTAAAGGCCCCGGATTAACGCCGAGTCATGATGACACGCTGAGCGGAATGCTGCTGGCGGCCTGGTATTATGGCGCTTTAGATGCGCGCTCCGGTCGTCCGTTTTTTGCCTGTTCCGACAATCTGCAACTCGTTACCACAGCGGTGAGCGTCAGTTATTTACGTTATGCCGCGCAAGGATATTTCGC‑CTCG‑CCACTCCTGCACTTTGTTCATGCTCTGAGTTGCCCg < 1:29236/287‑1 (MQ=255) ttCGTCACTGTTTTCAGGCCGCGCTCAATGGCGTTAAGACCGACTGGCGGCACTGGCTGGGTAAAGGCCCCGGATTAACGCCGAGTCATGATGACACGCTGAGCGGAATGCTGCTGGCGGCCTGGTATTATGGCGCTTTAGATGCGCGCTCCGGTCGTCCGTTTTTTGCCTGTTCCGACAATCTGCAACTCGTTACCACAGCGGTGAGCGTCAGTTATTTACGTTATGCCGCGCAAGGATATTTCGC‑CTCG‑CCACTCCTGCACTTTGTTCATGCTCTGAGTTGCCCg < 1:1676332/287‑1 (MQ=255) gTCACTGTTTTCAGGCCGCGCTCAATGGCGTTAAGACCGACTGGCGGCACTGGCTGGGTAAAGGCCCCGGATTAACGCCGAGTCATGATGACACGCTGAGCGGAATGCTGCTGGCGGCCTGGTATTATGGCGCTTTAGATGCGCGCTCCGGTCGTCCGTTTTTTGCCTGTTCCGACAATCTGCAACTCGTTACCACAGCGGTGAGCGTCAGTTATTTACGTTATGCCGCGCAAGGATATTTCGC‑CTCG‑CCACTCCTGCACTTTGTTCATGCTCTGAGTTGCCCGAAACg < 1:1101365/289‑1 (MQ=255) gTCACTGGTTTCAGGCCGCGCTAAATGGCGTTAAGACCGACTGGCGGCACTGGCTGGGTAAAGGCCCCGGATTAACGCCGAGTCATGATGACACGCTGAGCGGAATGCTGCTGGCGGCCTGGTATTATGGCGCTTTAGATGCGCGCTCCGGTCGTCCGTTTTTTGCCTGTTCCGACAATCTGCAACTCGTTACCACAGCGGTGAGCGTCAGTTATTTACGTTATGCCGCGCAAGGATATTTCGC‑CTCG‑CCACTCCTGCACTTTGTTCATGCTCTGAGTTGCCCGAAACg < 1:620262/289‑1 (MQ=255) gTCAATGTTTTCAGGCCGCGCTAAATGGCGTTAAGACCGACGGACGGCACTGGCTGGGGAGAGGCCCCGGATTAACGCCGAGTGATGATGACACGCTGCGCGGAATGCTGCTGGCGGCTTGGTATTATGGCGCGTTAGATGCGCGCTCCGGTCGTGCGTGTTTTGCCTGTTCCGACAATCTGCAACTCGTTACCACAGCGGTGAGCGTCAGTTATTTACGTTATGCCGCGCAAGGATATTTCGC‑CTCG‑CCACTCCTGCACTTTGTTCATGCTCTGAGTTGCCCGAAACg < 2:882915/289‑1 (MQ=255) tGTTTTCAGGCCGCGCTCAATGGCGTTAAGACCGACTGGCGGCACTGGCTGGGTAAAGGCCCCGGATTAACGCCGAGTCATGATGACACGCTGAGCGGAATGCTGCTGGCGGCCTGGTATTATGGCGCTTTAGATGCGCGCTCCGGTCGTCCGTTTTTTGCCTGTTCCGACAATCTGCAACTCGTTACCACAGCGGTGAGCGTCAGTTATTTACGTTATGCCGCGCAAGGATATTTCGC‑CTCG‑CCACTCCTGCACTTTGTTCATGCTCTGAGTTGCCCGAAACGTAcc > 1:1256759/1‑288 (MQ=255) tGTTTTCAGGCCGCGCTCAATGGCGTTAAGACCGACTGGCGGCACTGGCTGGGTAAAGGCCCCGGATTAACGCCGAGTCATGATGACACGCTGAGCGGAATGCTGCTGGCGGCCTGGTATTATGGCGCTTTAGATGCGCGCTCCGGTCGTCCGTTTTTTGCCTGTTCCGACAATCTGCAACTCGTTACCACAGCGGTGAGCGTCAGTTATTTACGTTATGCCGCGCAAGGATATTTCGC‑CTCG‑CCACTCCTGCACTTTGTTCATGCTCTGAGTTGCCCGAAACGTAcc > 1:977450/1‑288 (MQ=255) ttttCAGGCCGCGCTCAATGGCGTTAAGACCGACTGGCGGCACTGGCTGGGTAAAGGCCCCGGATTAACGCCGAGACATGCTGACACGCTGAGCGGAATGCTGCTGGCGGGCTGGGCTTATGGGGCGTTTGATGCGCGCTCCGGTCCTCCGTTTTTTGTCTGTTCCGACAGTCTGCAACTCGTTACCCCAGCGGTCAGCGTCAGTTTTTTACTTTATGCCGCGCTAGGAGATCTCGCTCCGC‑CCGCT‑CTGTTCTCTGCTCATGCGCTGCGATTCCCGAATCGtgaccc > 2:1582328/1‑283 (MQ=255) gcgcTCAATGGCGTTAAGACCGACTGGCGGCACTGGCTGGGTAAAGGCCCCGGATTAACGCCGAGTCATGATGACACGCTGAGCGGAATGCTGCTGGCGGCCTGGTATTATGGCGCTTTAGATGCGCGCTCCGGTCGTCCGTTTTTTGCCTGTTCCGACAATCTGCAACTCGTTACCACAGCGGTGAGCGTCCGTTATTTACGTTATGCCGCGCCAGGATATTTAGC‑CTCG‑CCACTCCTGCCCTTTGTTCCTGCCCCGAGTTGCCCGACACGTCACGCGGTTGCGCTTg > 2:1807618/1‑289 (MQ=255) gcgcTCAATGGCGTTAAGACCGACTGGCGGCACTGGCTGGGTAAAGGCCCCGGATTAACGCCGAGTCATGATGACACGCTGAGCGGAATGCTGCTGGCGGCCTGGTATTATGGCGCTTTAGATGCGCGCTCCGGTCGTCCGTTTTTTGCCTGTTCCGACAATCTGCAACTCGTTACCACAGCGGTGAGCGTCAGTTATTTACGTTATGCCGCGCAAGGATATTTCGC‑CTCG‑CCACTCCTGCACTTTGTTCATGCTCTGAGTTGCCCGAAACGTACCTCCTTTGCGCTTg > 2:954979/1‑289 (MQ=255) ggCGTTAAGACCGACTGGCGGCACTGGCTGGGTAAAGGCCCCGGATTAACGCCGAGTCATGATGACACGCTGAGCGGAATGCTGCTGGCGGCCTGGTATTATGGCGCTTTAGATGCGCGCTCCGGTCGTCCGTTTTTTGCCTGTTCCGACAATCTGCAACTCGTTACCACAGCGGTGAGCGTCAGTTATTTACGTTATGCCGCGCAAGGATATTTCGC‑CTCG‑CCACTCCTGCACTTTGTTCATGCTCTGAGTTGCCCGAAACGTACCGCTGTTGCGATTGAttcgctgc < 1:437098/289‑8 (MQ=255) cGTTAAGACCGACTGGCGGCACTGGCTGGGTAAAGGCCCCGGATTAACGCCGAGTCATGATGACACGCTGAGCGGAATGCTGCTGGCGGCCTGGTATTATGGCGCTTTAGATGCGCGCTCCGGTCGTCCGTTTTTTGCCTGTTCCGACAATCTGCAACTCGTTACCACAGCGGTGAGCGTCAGTTATTTACGTTATGCCGCGCAAGGATATTTCGC‑CTCG‑CCACTCCTGCACTTTGTTCATGCTCTGAGTTGCCCGAAACGTACCGCTGTTGCGATTGATTCGctgctg > 1:1279476/1‑289 (MQ=255) aaGACCGACTGGCGGCACTGGCTGGGTAAAGGCCCCGGATTAACGCCGAGTCATGATGACACGCTGAGCGGAATGCTGCTGGCGGCCTGGTATTATGGCGCTTTAGATGCGCGCTCCGGTCGTCCGTTTTTTGCCTGTTCCGACAATCTGCAACTCGTTACCACAGCGGTGAGCGTCAGTTATTTACGTTATGCCGCGCAAGGATATTTCGC‑CTCG‑CCACTCCTGCACTTTGTTCATGCTCTGAGTTGCCCGAAACGTACCGCTGTTGCGATTGATTCGCTGCTGgcgc < 2:736695/289‑1 (MQ=255) aGACCGACTGGCGGCCCTGGCTGGGTAAAGGCCCCGGATTAACGCCGAGTCATGATGACACGCTGAGCGGAATGCTGCTGGCGGCCTGGTATTATGGCGCTTTAGATGCGCGCTCCGGTCGTCCGTTTTTTGCCTGTTCCGACAATCTGCAACTCGTTACCACAGCGGTGAGCGTCAGTTATTTACGTTATGCCGCGCAAGGATATTTCGC‑CTCG‑CCACTCCTGCACTTTGTTCATGCTCTGAGTTGCCCGAAACGTACCGCTGTTGCGATTGATTCGCTGCTGGCGCt < 1:245552/289‑1 (MQ=255) ccGACGGGCGGGACTGGCTGGGTAACGGCCCCGGATTAACGCCGAGTCATGATGACACGCTGAGCGGAATGCTGCTGGCGGCCTGGTATTATGGCGCTTTAGATGCGAGCTCCGGTCGTCCGTTTTTTGCCTGTTCCGACAATCTGCAACTCGTTACCACAGCGGTGAGCGTCAGTTATTTACGTTATGCCGCGCAAGGATATTTCGC‑CTCG‑CCACTCCTGCACTTTGTTCATGCTCTGAGTTGCCCGAAACGTACCGCTGTTGCGATTGATTCGCTGCTGGCGCTg < 2:217623/287‑1 (MQ=255) cGACTGGCGGCACTGGCTGGGTAAAGGCCCCGGATTAACGCCGAGTCATGATGACACGCTGAGCGGAATGCTGCTGGCGGCCTGGTATTATGGCGCTTTAGATGCGCGCTCCGGTCGTCCGTTTTTTGCCTGTTCCGACAATCTGCAACTCGTTACCACAGCGGTGAGCGTCAGTTATTTACGTTATGCCGCGCAAGGATATTTCGC‑CTCG‑CCACTCCTGCACTTTGTTCATGCTCTGAGTTGCCCGAAACGTACCGCTGTTGCGATTGATTCGCTGCTGGCGCTggg > 1:3470/1‑288 (MQ=255) cTGGCGGCACTGGCTGGGTAAAGGCCCCGGATTAACGCCGAGTCATGATGACACGCTGAGCGGAATGCTGCTGGCGGCCTGGTATTATGGCGCTTTAGATGCGCGCTCCGGTCGTCCGTTTTTTGCCTGTTCCGACAATCTGCAACTCGTTACCACAGCGGTGAGCGTCAGTTATTTACGTTATGCCGCGCAAGGATATTTCGC‑CTCG‑CCACTCCTGCACTTTGTTCATGCTCTGAGTTGCCCGAAACGTACCGCTGTTGCGATTGATTCGCTGCTGGCGCTGGGGCa < 1:1336309/288‑1 (MQ=255) gcACTGGCTGGGTAAGGGCCCCGGATTAACGCCGAGTCATGATGACACGCTGGGCGGAATGCTGCTGGCGGCCTGGTATTATGGCGCTTTAGATGCGCGCTCCGGTCGTCCGTTTTTTGCCTGTTCCGACAATCTGCAACTCGTTACCACAGCGGTGAGCGTCAGTTATTTACGTTATGCTGCGCAAGGATATTTCGC‑CTCG‑CCACTCCTGCACTTTGTTCATGCTCTGAGTTGCCCGAAACGTACCGCTGTTGCGATTGATTCGCTGCTGGCGCTGGGGCATACgtc < 2:1748079/288‑3 (MQ=255) gcACTGGCTGGGTAAAGGCCCCGGATTAACGCCGAGTCATGATGACACGCTGAGCGGAATGCTGCTGGCGGCCTGGTATTATGGCGCTTTAGATGCGCGCTCCGGTCGTCCGTTTTTTGCCTGTTCCGACAATCTGCAACTCGTTACCACAGCGGTGAGCGTCAGTTATTTACGTTATGCCGCGCAAGGATATTTCGC‑CTCG‑CCACTCCTGCACTTTGTTCATGCTCTGAGTTGCCCGAAACGTACCGCTGTTGCGATTGATTCGCTGCTGGCGCTGGGGCATACgtc < 1:872092/288‑3 (MQ=255) gaacgggctggGTAAAGGCCCCGGATTAACGCCGAGTCAGGATGACACGCTGAGCGGAATGCTGCTGGCGGCCTGGTATTATGGCGCTTTAGATGCGCGCTCCGGTCGTCCGTTTTTTGCCTGTTCCGACAATCTGCAACTCGTTACCACAGCGGTGAGCGTCAGTTATTTACGTTATGCCGCGCAAGGATATTTCGC‑CTCG‑CCACTCCTGCACTTTGTTCATGCTCTGAGTTGCCCGAAACGTACCGCTGTTGCGATTGATTCGCTGCTGGCGCTGGGGCATACgtc < 2:1661764/283‑3 (MQ=255) cagtggctgcGTAACGGCAGCGGATTAGCGCCGAGTCGTGATGGCAGTCTGAGCAGAATGCGGCTGGCGGCCTGGTATTATGGCGCTTTAGGTGCGCGCGCCGATCGTCCGTTTTTGGCCTGTTCCGACAATCTGCAACTCGTTACGACAGCGGTGAGCGTCAGTTATTTACGTTATGCCGCGCAAGGATATTTCGC‑CTCG‑CCACTCCTGCACTTTGTTCATGCTCTGAGTTGCCCGAAACGTACCGCTGTTGCGATTGATTCGCTGCTGGCGCTGGGGCATACgtca < 2:529462/285‑4 (MQ=255) gcttggGTAACGGCCCGGGTTTACCGCCGGTTCGTGATGCCACGCGGGGCGGAATGCTGCTGGCGGCCTGGTATTATGGCGCTTTAGATGCGCGCTCCGGTCTTCCGTTTTTTGCCTGTTCCGACAATCTGCAACTCGTTACCACAGCGGTGAGCGTCAGTTATTTACGTTATGCCGCGCAAGGATATTTCGC‑CTCG‑CCACTCCTGCACTTTGTTCATGCTCTGAGTTGCCCGAAACGTACCGCTGTTGCGATTGATTCGCTGCTGGCGCTGGGGCATACgtcaggggc < 2:448987/286‑9 (MQ=255) 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ccGGATTAACGCCGAGTCATGATGACACGCTGAGCGGAATGCTGCTGGCGGCCTGGTATTATGGCGCTTTAGATGCGCGCTCCGGTCGTCCGTTTTTTGCCTGTTCCGACAATCTGCAACTCGTTACCACAGCGGTGAGCGTCAGTTATTTACGTTATGCCGCGCAAGGATATTTCGC‑CTCG‑CCACTCCTGCACTTTGTTCATGCTCTGAGTTGCCCGAAACGTACCGCTGTTGCGATTGATTCGCTGCTGGCGCTGGGGCATACGTCAGGGGCAGATACGCTGCTggg > 1:375399/1‑289 (MQ=255) cGGATTAACGCCGAGTCATGATGACACGCTGAGCGGAATGCTGCTGGCGGCCTGGTATTATGGCGCTTTAGATGCGCGCTCCGGTCGTCCGTTTTTTGCCTGTTCCGACAATCTGCAACTCGTTACCACAGCGGTGAGCGTCAGTTATTTACGTTATGCCGCGCAAGGATATTTCGC‑CTCG‑CCACTCCTGCACTTTGTTCATGCTCTGAGTTGCCCGAAACGTACCGCTGTTGCGATTGATTCGCTGCTGGCGCTGGGGCATACGTCAGGGGCAGATACGCTGCTgggg > 1:74814/1‑289 (MQ=255) cGGATTAACGCCGAGTCATGATGACACGCTGAGCGGAATGCTGCTGGCGGCCTGGTATTATGGCGCTTTAGATGCGCGCTCCGGTCGTCCGTTTTTTGCCTGTTCCGACAATCTGCAACTCGTTACCACAGCGGTGAGCGTCAGTTATTTACGTTATGCCGCGCAAGGATATTTCGC‑CTCG‑CCACTCCTGCACTTTGTTCATGCTCTGAGTTGCCCGAAACGTACCGCTGTTGCGATTGATTCGCTGCTGGCCCTGGGGCATACGTCAGGGGCAGATACGCTGCTgggg > 2:928907/1‑289 (MQ=255) 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GGCGGCAAGCGATCCGCTGCCTGCTGAGTTACGCCAGTTTCGTCACTGTTTTCAGGCCGCGCTCAATGGCGTTAAGACCGACTGGCGGCACTGGCTGGGTAAAGGCCCCGGATTAACGCCGAGTCATGATGACACGCTGAGCGGAATGCTGCTGGCGGCCTGGTATTATGGCGCTTTAGATGCGCGCTCCGGTCGTCCGTTTTTTGCCTGTTCCGACAATCTGCAACTCGTTACCACAGCGGTGAGCGTCAGTTATTTACGTTATGCCGCGCAAGGATATTTCGC‑CAGC‑CCACTCCTGCACTTTGTTCATGCTCTGAGTTGCCCGAAACGTACCGCTGTTGCGATTGATAGCCTGCTGGCGCTGGGGCATACGAGTGGGGCAGATACGCTGCTGGGGTTCTGGCTTGGCCAACAATTATTACAAGGAAAACCATGAAAACACTGGTTGTGGCTCTTGGGGGCAACGCCTTACTCCAGCGCGGTGAGGCGCTGACGGCAGAAAATCAATATCGCAATATCGCCAGTGCTGTACCCGCGCTGGCACGCCTGGCCCGTTCTTATCGGTTGG > CP042583/450513‑451080 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |