Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 587,040 | 3 bp→TCA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 587,040 | 0 | A | T | 99.4% | 754.0 / ‑5.7 | 317 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (185/130); minor base C (2/0); total (187/130) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.15e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
* | CP042583 | 587,041 | 0 | G | C | 99.7% | 746.4 / NA | 317 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base C (186/129); total (187/130) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.11e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 587,042 | 0 | T | A | 98.7% | 738.2 / NA | 317 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (4/0); new base A (182/130); total (187/130) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.46e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 |
Only 100 of 317 total aligned reads displayed.
TAACGATCAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTGATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATAAGTTCGATCTGGCGTTTGCTAACGACCCGGATTATGACCGTCACGGTATCGTCACTCCGGCAGGTTTGATG‑AATCCGAACCACTACCTGGCGGTGGCAATCAATTACCTGTTCCAGCATCGTCCGCAGTGGGGCAAAGATGTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTAGTTCTGCGATGATCGACCGTGTGGTCAACGACTTGGGCCGTAAACTGGTAGAAGTCCCGGTAGGTTTCAAATGGTTTGTCGATGGTCTGTTCGACGGCAGCTTCGGCTTTGGCGGCGAAGAGAGTGCAGGGGCTTCCTTCCTGCGTTTCGACGGCACGCCGTGGTCCACCGACAAAGACGGCATCATCATGTGTCTGCTGGCGGCGGAAATCACCGCTGTCACCGGTAAGAACCCGCAGGAACACTACAACGAACTGGCAAAACGCTTTGGTGCGCCG > CP042583/586763‑587318 ||| acgttaggtgcGATAAACCCTCCCACTTTATGCAGCTAGATAAAGAGGGCGCGATCCGTATGGATTGCTCATCCGGGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATAAGTTCGATCTGGCGTTTGCTAACGACCCGGATTATGACCGTCACGGTATCGTCACTCCGGCAGGTTTGATG‑AATCCGAACCACTACCTGGCGGTGGCAATCAATTACCTGTTCCAGCATCGTCCGCAGTGGGGCAAAGATGTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTTCATCTGCgatgat < 2:1310865/279‑1 (MQ=255) tCAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTGATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATAAGTTCGATCTGGCGTTTGCTAACGACCCGGATTATGACCGTCACGGTATCGTCACTCCGGCAGGTTTGATG‑AATCCGAACCACTACCTGGCGGTGGCAATCAATTACCTGTTCCAGCATCGTCCGCAGTGGGGCAAAGATGTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTTCATCTGCGATGATCGa > 1:727765/1‑288 (MQ=255) tCAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTGATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATAAGTTCGATCTGGCGTTTGCTAACGACCCGGATTATGACCGTCACGGTATCGTCACTCCGGCAGGTTTGATG‑AATCCGAACCACTACCTGGCGGTGGCAATCAATTACCTGTTCCAGCATCGTCCGCAGTGGGGCAAAGATGTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTTCATCTGCGATGATCGa > 1:388809/1‑288 (MQ=255) ggTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTGATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATAAGTTCGATCTGGCGTTTGCTAACGACCCGGATTATGACCGTCACGGTATCGTCACTCCGGCAGGTTTGATG‑AATCCGAACCACTACCTGGCGGTGGCAATCAATTACCTGTTCCAGCATCGTCCGCAGTGGGGCAAAGATGTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTTCATCTGCGATGATCGACCgt > 2:1902532/1‑289 (MQ=255) gTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTGATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATAAGTTCGATCTGGCGTTTGCTAACGACCCGGATTATGACCGTCACGGTATCGTCACTCCGGCAGGTTTGATG‑AATCCGAACCACTACCTGGCGGTGGCAATCAATTACCTGTTCCAGCATCGTCCGCAGTGGGGCAAAGATGTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTTCATCTGCGATGATCGACCgtg > 1:1006265/1‑289 (MQ=255) tcaacaaaaCCTCCCGCTTTATGACCCTTGATAAGGAGGGGGCGATCCGTAGGGCATGCTCCTCCGAGGGTGGGATGGCGGGCCTGCTGGCACGGCGTGATAAGTTCGATCTGGCGTTTGCTAACGACCCGGATTATGACCGTCACGGTATCGTCACTCCGGCAGGTTTGATG‑AATCCGAACCACTACCTGGCGGTGGCAATCAATTACCTGTTCCAGCATCGTCCGCAGTGGGGCAAAGATGTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTTCATCTGCGATGATCGACCgtg < 2:1876803/282‑1 (MQ=255) tCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTGATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATAAGTTCGATCTGGCGTTTGCTAACGACCCGGATTATGACCGTCACGGTATCGTCACTCCGGCAGGTTTGATG‑AATCCGAACCACTACCTGGCGGTGGCAATCAATTACCTGTTCCAGCATCGTCCGCAGTGGGGCAAAGATGTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTTCATCTGCGATGATCGACCgtg < 2:1110800/288‑1 (MQ=255) aTCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTGATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATAAGTTCGATCTGGCGTTTGCTAACGACCCGGATTATGACCGTCACGGTATCGTCACTCCGGCAGGTTTGATG‑AATCCGAACCACTACCTGGCGGTGGCAATCAATTACCTGTTCCAGCATCGTCCGCAGTGGGGCAAAGATGTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTTCATCTGCGATGATCGACCGTGTgg > 1:1144514/1‑288 (MQ=255) cAACCCTTCCGCTTTATGCCCCTTGATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGGGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATAAGTTCGATCTGGCGTTTGCTAACGACCCGGATTATGACCGTCACGGTATCGTCACTCCGGCAGGTTTGATG‑AATCCGAACCACTACCTGGCGGTGGCAATCAATTACCTGTTCCAGCATCGTCCGCAGTGGGGCAAAGATGTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTTCATCTGCGATGATCGACCGTGTGGTCa < 1:195028/289‑1 (MQ=255) tCCGTTTTATGAACCTTGGTAAGGGCGGCGCGATCCGTATGGCCTGCTCCTCCGGGTTGGGGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATAAGTTCGATCTGGCGTTTGCTAACGACCCGGATTATGACCGTCACGGTATCGTCACTCCGGCAGGTTTGATG‑AATCCGAACCACTACCTGGCGGTGGCAATCAATTACCTGTTCCAGCATCGTCCGCAGTGGGGCAAAGATGTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTTCATCTGCGATGATCGACCGTGTGGTCAACGACtt < 2:1836707/289‑1 (MQ=255) cGCTTTATGCACCTTGATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATAAGTTCGATCTGGCGTTTGCTAACGACCCGGATTATGACCGTCACGGTATCGTCACTCCGGCAGGTTTGATG‑AATCCGAACCACTACCTGGCGGTGGCAATCAATTACCTGTTCCAGCATCGTCCGCAGTGGGGCAAAGATGTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTTCATCTGCGATGATCGACCGTGTGGTCAACGACTTgg > 1:146366/1‑289 (MQ=255) cGCTTTATGCACCTTGATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATAAGTTCGATCTGGCGTTTGCTAACGACCCGGATTATGACCGTCACGGTATCGTCACTCCGGCAGGTTTGATG‑AATCCGAACCACTACCTGGCGGTGGCAATCAATTACCTGTTCCAGCATCGTCCGCAGTGGGGCAAAGATGTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTTCATCTGCGATGATCGACCGTGTGGTCAACGACTTgg > 1:824259/1‑289 (MQ=255) gCTTTATGCACCGTGATAAAGCCGTCGCGACCCGTATGGCCTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATAAGTTCGATCTGGCGTTTGCTAACGACCCGGATTATGACCGTCACGGTATCGTCACTCCGGCAGGTTTGATG‑AATCCGAACCACTACCTGGCGGTGGCAATCAATTACCTGTTCCAGCATCGTCCGCAGTGGGGCAAAGATGTTGCCGTCGGTAAAACGCTTGTTTCATCTGCGATGATCGACCGTGTGGTCAACGACTTggg < 2:125077/289‑1 (MQ=255) ttATGCACCTTGATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATAAGTTCGATCTGGCGTTTGCTAACGACCCGGATTATGACCGTCACGGTATCGTCACTCCGGCAGGTTTGATG‑AATCCGAACCACTACCTGGCGGTGGCAATCAATTACCTGTTCCAGCATCGTCCGCAGTGGGGCAAAGATGTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTTCATCTGCGATGATCGACCGTGTGGTCAACGACTTGGGCCg > 1:284374/1‑289 (MQ=255) ttATGCACCTTGATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCCCCTCCGTGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATAAGTTCGATCTGGCGTTTGCTAACGACCCGGATTATGACCGTCACGGTATCGTCACTCCGGCAGGTTTGATG‑AATCCGAACCACTACCTGGCGGTGGCAATCAATTACCTGTTCCAGCATCGTCCGCAGTGGGGCAAAGATGTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTTCATCTGCGATGATCGACCGTGTGGTCAACGACTTGGGCCg < 1:532880/289‑1 (MQ=255) aTGCACCTTGATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATAAGTTCGATCTGGCGTTTGCTAACGACCCGGATTATGACCGTCACGGTATCGTCACTCCGGCAGGTTTGATG‑AATCCGAACCACTACCTGGCGGTGGCAATCAATTACCTGTTCCAGCATCGTCCGCAGTGGGGCAAAGATGTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTTCATCTGCGATGATCGACCGTGTGGTCAACGACTTGGGCCGTa > 2:1383089/1‑289 (MQ=255) aTGCACCTTGATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATAAGTTCGATCTGGCGTTTGCTAACGACCCGGATTATGACCGTCACGGTATCGTCACTCCGGCAGGTTTGATG‑AATCCGAACCACTACCTGGCGGTGGCAATCAATTACCTGTTCCAGCATCGTCCGCAGTGGGGCAAAGATGTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTTCATCTGCGATGATCGACCGTGTGGTCAACGACTTGGGCCGTa > 2:1349811/1‑289 (MQ=255) cTTGATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATAAGTTCGATCTGGCGTTTGCTAACGACCCGGATTATGACCGTCACGGTATCGTCACTGCGGCAGGTTTGATG‑AATCCGAACCACTACCTGGCGGTGGCAATCAATTACCTGTTCCAGCATCGTCCGCAGTGGGGCCAAGATGTTGCCGTCGGTAAAATGCTGGTTTCATCTTCGATGATCGACCGTGTGGTTAAACACTTGGGCCCTATACtcg > 2:116374/1‑287 (MQ=255) aCGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATAAGTTCGATCTGGCGTTTGCTAACGACCCGGATTATGACCGTCACGGTATCGTCACTCCGGCAGGTTTGATG‑AATCCGAACCACTACCTGGCGGTGGCAATCAATTACCTGTTCCAGCATCGTCCGCAGTGGGGCAAAGATGTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTTCATCTGCGATGATCGACCGTGTGGTCAACGACTTGGGCCGTAAACTGGTAGAAGTccc > 1:1261218/1‑289 (MQ=255) aCGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATAAGTTCGATCTGGCGTTTGCTAACGACCCGGATTATGACCGTCACGGTATCGTCACTCCGGCAGGTTTGATG‑AATCCGAACCACTACCTGGCGGTGGCAATCAATTACCTGTTCCAGCATCGTCCGCAGTGGGGCAAAGATGTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTTCATCTGCGATGATCGACCGTGTGGTCAACGACTTGGGCCGTAAACTGGTAGAAGTccc > 1:1727733/1‑289 (MQ=255) cgcgATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATAAGTTCGATCTGGCGTTTGCTAACGACCCGGATTATGACCGTCACGGTATCGTCACTCCGGCCGGTTTGATG‑AATCCGAACCACTACCTGGCGGTGGCAATCAATTACCTGTTCCAGCATCGTCCGCAGTGGGGCAAAGGTGTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTTCTTCCTCCGTTATCGACGCTGTGGTCAACGACTTGGGCCGTAAACGTGTTAAAGTCCCGGtc > 2:145702/1‑288 (MQ=255) cgcgATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATAAGTTCGATCTGGCGTTTGCTAACGACCCGGATTATGACCGTCACGGTATCGTCACTCCGGCAGGTTTGATG‑AATCCGAACCACTACCTGGCGGTGGCAATCAATTACCTGTTCCAGCATCGTCCGCAGTGGGGCAAAGATGTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTTCATCTGCGATGATCGACCGTGTGGTCAACGACTTGGGCCGTAAACTGGTAGGAGTCCCGGTa > 1:659766/1‑289 (MQ=255) aTGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATAAGTTCGATCTGGCGTTTGCTAACGACCCGGATTATGACCGTCACGGTATCGTCACTCCGGCAGGTTTGATG‑AATCCGAACCACTACCTGGCGGTGGCAATCAATTACCTGTTCCAGCATCGTCCGCAGTGGGGCAAAGATGTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTTCATCTGCGATGATCGACCGTGTGGTCAACGACTTGGGCCGTAAACTGGTAGAAGTCCCGGTAGGTTTCaaa < 1:1523268/288‑1 (MQ=255) cTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATAAGTTCGATCTGGCGTTTGCTAACGACCCGGATTATGACCGTCACGGTATCGTCACTCCGGCAGGTTTGATG‑AATCCGAACCACTACCTGGCGGTGGCAATCAATTACCTGTTCCAGCATCGTCCGCAGTGGGGCAAAGATGTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTTCATCTGCGATGATCGACCGTGTGGTCAACGACTTGGGCCGTAAACTGGTAGAAGTCCCGGTAGGTTTCAAATGGtt < 2:420817/288‑1 (MQ=255) gCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATAAGTTCGATCTGGCGTTTGCTAACGACCCGGATTATGACCGTCACGGTATCGTCACTCCGGCAGGTTTGATG‑AATCCGAACCACTACCTGGCGGTGGCAATCAATTACCTGTTCCAGCATCGTCCGCAGTGGGGCAAAGATGTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTTCATCTGCGATGATCGACCGTGTGGTCAACGACtt < 1:457250/244‑1 (MQ=255) gCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATAAGTTCGATCTGGCGTTTGCTAACGACCCGGATTATGACCGTCACGGTATCGTCACTCCGGCAGGTTTGATG‑AATCCGAACCACTACCTGGCGGTGGCAATCAATTACCTGTTCCAGCATCGTCCGCAGTGGGGCAAAGATGTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTTCATCTGCGATGATCGACCGTGTGGTCAACGACtt > 2:457250/1‑244 (MQ=255) gCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATAAGTTCGATCTGGCGTTTGCTAACGACCCGGATTATGACCGTCACGGTATCGTCACTCCGGCAGGTTTGATG‑AATCCGAACCACTACCTGGCGGTGGCAATCAATTACCTGTTCCAGCATCGTCCGCAGTGGGGCAAAGATGTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTTCATCTGCGATGATCGACCGTGTGGTCAACGACTTGGGCCGTAAACTGGTAGAAGTCCCGGTAGGTTTCAAATGGt > 1:1621274/1‑285 (MQ=255) gCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATAAGTTCGATCTGGCGTTTGCTAACGACCCGGATTATGACCGTCACGGTATCGTCACTCCGGCAGGTTTGATG‑AATCCGAACCACTACCTGGCGGTGGCAATCAATTACCTGTTCCAGCATCGTCCGCAGTGGGGCAAAGATGTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTTCATCTGCGATGATCGACCGTGTGGTCAACGACTTGGGCCGTAAACTGGTAGAAGTCCCGGTAGGTTTCAAATGGTTTg > 1:377350/1‑288 (MQ=255) ctcctcCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATAAGTTCGATCTGGCGTTTGCTAACGACCCGGATTATGACCGTCACGGTATCGTCACTCCGGCAGGTTTGATGAAATCCGAACCACTACCTGGCGGTGGCAATCAATTACCTGTTCCAGCATCGTCCGCCGTTGGGCAAAGATGTTGCCGGCGGTAAAACGCTGGTTTCATCTGCGATGATCGACCGTGTGGTCCACGACTCGGGCCGTAAACTGGTAGAAGTCCCGGTAGGTTTCAACTGGTTTGt > 2:23039/1‑289 (MQ=255) ctcctcCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATAAGTTCGATCTGGCGTTTGCTAACGACCCGGATTATGACCGTCACGGTATCGTCACTCCGGCAGGTTTGATG‑AATCCGAACCACTACCTGGCGGTGGCAATCAATTACCTGTTCCAGCATCGTCCGCAGTGGGGCAAAGATGTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTTCATCTGCGATGATCGACCGTGTGGTCAACGACTTGGGCCGTaaa > 2:329407/1‑253 (MQ=255) ctcctcCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATAAGTTCGATCTGGCGTTTGCTAACGACCCGGATTATGACCGTCACGGTATCGTCACTCCGGCAGGTTTGATG‑AATCCGAACCACTACCTGGCGGTGGCAATCAATTACCTGTTCCAGCATCGTCCGCAGTGGGGCAAAGATGTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTTCATCTGCGATGATCGACCGTGTGGTCAACGACTTGGGCCGTAAACTGGTAGAAGTCCCGGTAGGTTTCAAATGGtt > 2:769463/1‑285 (MQ=255) ctcctcCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATAAGTTCGATCTGGCGTTTGCTAACGACCCGGATTATGACCGTCACGGTATCGTCACTCCGGCAGGTTTGATG‑AATCCGAACCACTACCTGGCGGTGGCAATCAATTACCTGTTCCAGCATCGTCCGCAGTGGGGCAAAGATGTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTTCATCTGCGATGATCGACCGTGTGGTCAACGACTTGGGCCGTAAACTGGTAGAAGTCCCGGTAGGTTTCAAATGGTTTGTc > 2:1637277/1‑289 (MQ=255) ctcctcCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATAAGTTCGATCTGGCGTTTGCTAACGACCCGGATTATGACCGTCACGGTATCGTCACTCCGGCAGGTTTGATG‑AATCCGAACCACTACCTGGCGGTGGCAATCAATTACCTGTTCCAGCATCGTCCGCAGTGGGGCAAAGATGTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTTCATCTGCGATGATCGACCGTGTGGTCAACGACTTGGGCCGTAAACTGGTAGAAGTCCCGGTAGGTTTCAAATGGTTTGTc > 1:1058807/1‑289 (MQ=255) ctcctcCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATAAGTTCGATCTGGCGTTTGCTAACGACCCGGATTATGACCGTCACGGTATCGTCACTCCGGCAGGTTTGATG‑AATCCGAACCACTACCTGGCGGTGGCAATCAATTACCTGTTCCAGCATCGTCCGCAGTGGGGCAAAGATGTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTTCATCTGCGATGATCGACCGTGTGGTCAACGACTTGGGCCGTAAACTGGTAGAAGTCCCGGTAGGTTGCAAATGGttttca > 2:560416/1‑286 (MQ=255) tcctccGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATAAGTTCGATCTGGCGTTTGCTAACGACCCGGATTATGACCGTCACGGTATCGTCACTCCGGCAGGTTTGATG‑AATCCGAACCACTACCTGGCGGTGGCAATCAATTACCTGTTCCAGCATCGTCCGCAGTGGGGCAAAGATGTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTTCATCTGCGATGATCGACCGTGTGGTCAACGACtt > 2:1035642/1‑242 (MQ=255) tcctccGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATAAGTTCGATCTGGCGTTTGCTAACGACCCGGATTATGACCGTCACGGTATCGTCACTCCGGCAGGTTTGATG‑AATCCGAACCACTACCTGGCGGTGGCAATCAATTACCTGTTCCAGCATCGTCCGCAGTGGGGCAAAGATGTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTTCATCTGCGATGATCGACCGTGTGGTCAACGACTTGGGCCGTAAACTGGTAGAAGTCCCGGTAGGTTTCAAATGGTTTGTCg > 1:1315110/1‑289 (MQ=255) cgggtgtGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATAAGTTCGATCTGGCGTTTGCTAACGACCCGGATTATGACCGTCACGGTATCGTCACTCCGGCAGGTTTGATG‑AATCCGAACCACTACCTGGCGGTGGCAATCAATTACCTGTTCCAGCATCGTCCGCAGTGGGGCAAAGATGTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTTCATCTGCGATGATCGACCGTGTGGTCAACGACTTGGGCCGTAAACTGGTAGAAGTCCCGGTAGGTTTCAAATGGTTTGTCGATGGt < 1:1857952/286‑1 (MQ=255) tgCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATAAGTTCGATCTGGCGTTTGCTAACGACCCGGATTATGACCGTCACGGTATCGTCACTCCGGCAGGTTTGATG‑AATCCGAACCACTACCTGGCGGTGGCAATCAATTACCTGTTCCAGCATCGTCCGCAGTGGGGCAAAGATGTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTTCATCTGCGATGATCGACCGTGTGGTCAACGACTTGGGCCGTAAACTGGTAGAAGTCCCGGTAGGTTTCAAATGGTTTGTCGATg < 2:677766/281‑1 (MQ=255) tgCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATAAGTTCGATCTGGCGTTTGCTAACGACCCGGATTATGACCGTCACGGTATCGTCACTCCGGCAGGTTTGATG‑AATCCGAACCACTACCTGGCGGTGGCAATCAATTACCTGTTCCAGCATCGTCCGCAGTGGGGCAAAGATGTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTTCATCTGCGATGATCGACCGTGTGGTCAACGACTTGGGCCGTAAACTGGTAGAAGTCCCGGTAGGTTTCAAATGGTTTGTCGATGGTCTGTTc > 1:516412/1‑289 (MQ=255) ggCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATAAGTTCGATCTGGCGTTTGCTAACGACCCGGATTATGACCGTCACGGTATCGTCACTCCGGCAGGTTTGATG‑AATCCGAACCACTACCTGGCGGTGGCAATCAATTACCTGTTCCAGCATCGTCCGCAGTGGGGCAAAGATGTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTTCATCTGCGATGATCGACCGTGTGGTCAACGACTTGGGCCGTAAACTGGTAGAAGTCCCGGTAGGTTTCAAATGGTTTGTCGATGGTCTGTTCGACGGc > 1:589/1‑289 (MQ=255) cGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATAAGTTCGATCTGGCGTTTGCTAACGACCCGGATTATGACCGTCACGGTATCGTCACTCCGGCAGGTTTGATG‑AATCCGAACCACTACCTGGCGGTGGCAATCAATTCCCTGTTCCAGCATCGTCCGCAGTGTGGCAAAGATGTTGCAGTCGGTAAAACGCTGGTTTCATCTGCGATGATCGACCGTGTGGTCAACGACTTGGGCCGTCAACTGTGACAAGTCCCGGTAGGCTTCACATGGTTTGTCGATGGTCTGTTCGACGGccg > 2:287432/1‑287 (MQ=255) tgGCACTGCGTGATAAGTTCGATCTGGCGTTTGCTAACGACCCGGATTATGACCGTCACGGTATCGCCACTCCGGCAGGTTTGATG‑AATCCGAACCACTACCTGGCGGTGGCAATCAATTACCTGTTCCAGCATCGTCCGCAGTGGGGCAAAGATGTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTTCATCTGCGATGATCGACCGTGTGGTCAACGACTTGGGCCGTAAACTGGTAGAAGTCCCGGTAGGTTTCAAATGGTTTGGCGGTGGTCCGTTCGAAGGCAGCCTCGGCtt > 2:481304/1‑289 (MQ=255) aCTGCGTGATAAGTTCGATCTGGCGTTTGCTAACGACCCGGATTATGACCGTCACGGTATCGTCACTCCGGCAGGTTTGATG‑AATCCGAACCACTACCTGGCGGTGGCAATCAATTACCTGTTCCAGCATCGTCCGCAGTGGGGCAAAGATGTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTTCATCTGCGATGATCGACCGTGTGGTCAACGACTTGGGCCGTAAACTGGTAGAAGTCCCGGTAGGTTTCAAATGGTTTGTCGATGGTCTGTTCGACGGCAGCTTCGGCTTTggc > 1:1456917/1‑289 (MQ=255) cGTGATAAGTTCGATCTGGCGTTTGCTAACGACCCGGATTATGACCGTCACGGTATCGTCACTCCGGCAGGTTTGATG‑AATCCGAACCACTACCTGGCGGTGGCAATCAATTACCTGTTCCAGCATCGTCCGCAGTGGGGCAAAGATGTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTTCATCTGCGATGATCGACCGTGTGGTCAACGACTTGGGCCGTAAACTGGTAGAAGTCCCGGTAGGTTTCAAATGGTTTGTCGATGGTCTGTTCGACGGCAGCTTCGGCTTTGggggcg > 1:781821/1‑289 (MQ=255) cGTGATAAGTTCGATCTGGCGTTTGCTAACGACCCGGATTATGACCGTCACGGTATCGTCACTCCGGCAGGTTTGATG‑AATCCGAACCACTACCTGGCGGTGGCAATCAATTACCTGTTCCAGCATCGTCCGCAGTGGGGCAAAGATGTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTTCATCTGCGATGATCGACCGTGTGGTCAACGACTTGGGCCGTAAACTGGTAGAAGTCCCGGTAGGTTTCAAATGGTTTGTCGATGGTCTGTTCGACGGCAGCTTCGGCTTTGgcggcg > 1:628585/1‑289 (MQ=255) cGTGATAAGTTCGATCTGGCGTTTGCTAACGACCCGGATTATGACCGTCACGGTATCGTCACTCCGGCAGGTTTGATG‑AATCCGAACCACTACCTGGCGGTGGCAATCAATTACCTGTTCCAGCATCGTCCGCAGTGGGGCAAAGATGTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTTCATCTGCGATGATCGACCGTGTGGTCAACGACTTGGGCCGTAAACTGGTAGAAGTCCCGGTAGGTTTCAAATGGTTTGTCGAGGGTCTTTTCGGCGGCAGCTTCGGCTTTGgcggcg > 2:1647811/1‑289 (MQ=255) cGTGATAAGTTCGATCTGGCGTTTGCTAACGACCCGGATTATGACCGTCACGGTATCGTCACTCCGGCAGGTTTGATG‑AATCCGAACCACTACCTGGCGGTGGCAATCAATTACCTGTTCCAGCATCGTCCGCAGTGGGGCAAAGATGTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTTCATCTGCGATGATCGACCGTGTGGTCAACGACTTGGGCCGTAAACTGGTAGAAGTCCCGGTAGGTTTCAAATGGTTTGGCGGTGGTCTGTTCGACGGCCGCTTCGGCCTTggcggcc > 2:815347/1‑288 (MQ=255) cGTGATAAGTTCGATCTGGCGTTTGCTAACGACCCGGATTATGACCGTCACGGTATCGTCACTCCGGCAGGTTTGATG‑AATCCGAACCACTACCTGGCGGTGGCAATCAATTACCTGTTCCAGCATCGTCCGCAGTGGGGCAAAGATGTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTTCATCTGCGATGAACGACCGGGTGGTCAACGACTTGGGCCGTAAACTGGTAGAAGTCCCGGTAGGTTTCAAATGGTTAGTGGCTGGTATGTTTGCAGGCAGCTTTGCCTTTGgcggcg > 2:1503215/1‑289 (MQ=255) gTGATAAGTTCGATCTGGCGTTTGCTAACGACCCGGATTATGACCGTCACGGTATCGTCACTCCGGCAGGTTTGATG‑AATCCGAACCACTACCTGGCGGTGGCAATCAATTACCTGTTCCAGCATCGTCCGCAGTGGGGCAAAGATGTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTTCATCTGCGATGATCGACCGTGTGGTCAACGAc > 1:1779598/1‑203 (MQ=255) gTGATAAGTTCGATCTGGCGTTTGCTAACGACCCGGATTATGACCGTCACGGTATCGTCACTCCGGCAGGTTTGATG‑AATCCGAACCACTACCTGGCGGTGGCAATCAATTACCTGTTCCAGCATCGTCCGCAGTGGGGCAAAGATGTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTTCATCTGCGATGATCGACCGTGTGGTCAACGACTTGGGCCGTAAACTGGTAGAAGTCCCGGTAGGTTTCAAATGGTTTGTCGATGGTCTGTTCGACGGCAGCTTCGGCTTTGGCGGCGa > 1:1039229/1‑289 (MQ=255) gTGATAAGTTCGATCTGGCGTTTGCTAACGACCCGGATTATGACCGTCACGGTATCGTCACTCCGGCAGGTTTGATG‑AATCCGAACCACTACCTGGCGGTGGCAATCAATTACCTGTTCCAGCATCGTCCGCAGTGGGGCAAAGATGTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTTCATCTGCGATGATCGACCGTGTGGTCAACGACTTGGGCCGTAAACTGGTAGAAGTCCCGGTAGGTTTCAAATGGTTTGTCGATGGTCTGTTCGACGGCAGCTTCGGCTTTGGCGGCGa > 1:1484587/1‑289 (MQ=255) gTGATAAGTTCGATCTGGCGTTTGCTAACGACCCGGATTATGACCGTCACGGTATCGTCACTCCGGCAGGTTTGATG‑AATCCGAACCACTACCTGGCGGTGGCAATCAATTACCTGTTCCAGCATCGTCCGCAGTGGGGCAAAGATGTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTTCATCTGCGATGATCGACCGTGTGGTCAACGACCTGGGCCGTAAACTGGTCGAAGTCCCGGTAGGTTTAAAATGGGTTGTCGATGGTCTGTGCGACGGAAGTTGCGGCTTTgggcgtga > 2:649688/1‑283 (MQ=255) tAAGTTCGATCTGGCGTTTGCTAACGACCCGGATTATGACCGTCACGGTATCGTCACTCCGGCAGGTTTGATG‑AATCCGAACCACTACCTGGCGGTGGCAATCAATTACCTGTTCCAGCATCGTCCGCAGTGGGGCAAAGATGTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTTCATCTGCGATGATCGACCGTGTGGTCAACGACTTGGGCCGTAAACTGGTAGAAGTCCCGGTAGGTTTCAAATGGTTTGTCGATGGTCTGTTCGACGGCAGCTTCGGCTTTGGCGGCGAagag < 2:494663/289‑1 (MQ=255) tCGATCTGGCGTTTGCTAACGACCCGGATTATGACCGTCACGGTATCGTCACTCCGGCAGGTTTGATG‑AATCCGAACCACTACCTGGCGGTGGCAATCAATTACCTGTTCCAGCATCGTCCGCAGTGGGGCAAAGATGTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTTCATCTGCGATGATCGACCGTGTGGTCAACGACTTGGGCCGTAAACTGGTAGAAGTCCCGGTAGGTTTCAAATGGTTTGTCGATGGTCTGTTCGACGGCAGCTTCGGCTTTGGCGGCGGAGAGAGTg > 2:1095440/1‑288 (MQ=255) cGATCTGGCGTTTGCTAACGACCCGGATTATGACCGTCACGGTATCGTCACTCCGGCAGGTTTGATG‑AATCCGAACCACTACCTGGCGGTGGCAATCAATTACCTGTTCCAGCATCGTCCGCAGTGGGGCAAAGATGTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTTCATCTGCGATGATCGACCGTGTGGTCAACGACTTGGGCCGTAAACTGGTAGAAGTCCCGGTAGGTTTCAAATGGTTTGTCGATGGTCTGTTCGACGGCAGCTTCGGCTTTGGCGGCGAAGAGAGTGCa < 1:422352/289‑1 (MQ=255) gATCTGGCGTTTGCTAACGACCCGGATTATGACCGTCACGGTATCGTCACTCCGGCAGGTTTGATG‑AATCCGAACCACTACCTGGCGGTGGCAATCAATTACCTGTTCCAGCATCGTCCGCAGTGGGGCAAAGATGTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTTCATCTGCGATGATCGACCGTGTGGTCAACGACTTGGGCCGTAAACTGGTAGAAGTCCCGGTAGGTTTCAAATGGTTTGTCGATGGTCTGTTCGACGGCAGCTTCGGCTTTGGCGGCGAAGAGAGTGCAg > 1:598103/1‑289 (MQ=255) tCTGGCGTTTGCTAACGACCCGGATTATGACCGTCACGGTATCGTCACTCCGGCAGGTTTGATG‑AATCCGAACCACTACCTGGCGGTGGCAATCAATTACCTGTTCCAGCATCGTCCGCAGTGGGGCAAAGATGTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTTCATCTGCGATGATCGACCGTGTGGTCAACGACTTGGGCCGTAAACTGGTAGAAGTCCCGGTAGGTTTCAAATGGTTTGTCGATGGTCTGTTCGACGGCAGCTTCGGCTTTGGCGGCGAAGAGAGTGCAgg < 2:1727733/288‑1 (MQ=255) gCGTTTCCGAGCGCCCCGGATCATGACCGTGACGGTATCGTGAGTCCGGCGGGTTTGATG‑GATCGGAACCACGACCGGGCGGTGGCAATCCATTACCGGTTCCAGCATCGTCCGCAGTGGGGCATAGATGTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTTCATCTGCGATGTTCGACCGTGTGGTCAACGACTTGGGCCGTAAACTGGTAGAAGTCCCGGTAGGTTTCAAATGGTTTGTCGATGGTCTGTTCGACGGCAGCTTCGGCTTTGGCGGCGAAGAGAGTGCAGGGGct < 2:936338/288‑1 (MQ=255) gCTAACGACCCGGATTATGACCGTCACGGTATCGTCACTCCGGCAGGTTTGATG‑AATCCGAACCACTACCTGGCGGTGGCAATCAATTACCTGTTCCAGCATCGTCCGCAGTGGGGCAAAGATGTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTTCATCTGCGATGATCGACCGTGTGGTCAACGACTTGGGCCGTAAACTGGTAGAAGTCCCGGTAGGTTTCAAATGGTTTGTCGATGGTCTGTTCGACGGCAGCTTCGGCTTTGGCGGCGAAGAGAGTGCAGGGGCttccttcc < 2:1315110/289‑1 (MQ=255) cGACCCGGATTATGACCGTCACGGTATCGTCACTCCGGCAGGTTTGATG‑AATCCGAACCACTACCTGGCGGTGGCAATCAATTACCTGTTCCAGCATCGTCCGCAGTGGGGCAAAGATGTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTTCATCTGCGATGATCGACCGTGTGGTCAACGACTTGGGCCGTAAACTGGTAGAAGTCCCGGTAGGTTTCAAATGGTTTGTCGATGGTTTGTTCGACGGCAGCTTCGGCTTTGGCGGCGACGAGAGTGCAGGGGCTTACTTCCTTCGt > 1:1404692/1‑289 (MQ=255) cGACCCGGATTATGACCGTCACGGTATCGTCACTCCGGCAGGTTTGATG‑AATCCGAACCACTACCTGGCGGTGGCAATCAATTACCTGTTCCAGCATCGTCCGCAGTGGGGCAAAGATGTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTTCATCTGCGATGATCGACCGTGTGGTCAACGACTTGGGCCGTAAACTGGTAGAAGTCCCGGTAGGTTTCAAATGGTTTGTCGATGGTCTGTTCGACGGCAGCTTCGGCTTTGGCGGCGAAGAGAGTGCAGGGGCTTCCTTCCTGCGt < 1:1647811/289‑1 (MQ=255) ttATGCCCGTCACGGTATCGTCACTCCGGCAGGTTTGATG‑AATCCGAACCACTACCTGGCGGTGGCAATCAATTACCTGTTCCAGCATCGTCCGCAGTGGGGCAAAGATGTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTTCATCTGCGATGATCGACCGTGTGGTCAACGACTTGGGCCGTAAACTGGTAGAAGTCCCGGTAGGTTTCAAATGGTTTGTCGATGGTCTGTTCGACGGCAGCTTCGGCTTTGGCGGCGAAGAGAGTGCAGGGGCTTCCTTCCTGCGTTTCGACGGc < 2:388809/289‑1 (MQ=255) ttAGGACCGTCACGGTATCGTCACTCCGGAAGGTTTGATG‑AATCCGAACCACTACCTGGCGGTGGCAATCAATTACCTGTTCCAGCATCGTCCGCAGTGGGGCAAAGATGTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTTCATCTGCGATGATCGACCGTGTGGTCAACGACTTGGGCCGTAAACTGGTAGAAGTCCCGGTAGGTTTCAAATGGTTTGTCGATGGTCTGTTCGACGGCAGCTTCGGCTTTGGCGGCGAAGAGAGTGCAGGGGCTTCCTTCCTGCGTTTCGACgg < 1:1543211/288‑1 (MQ=255) tATGACCGTCACGGTATCGTCACTCCGGCAGGTTTGATG‑AATCCGAACCACTACCTGGCGGTGGCAATCAATTACCTGTTCCAGCATCGTCCGCAGTGGGGCAAAGATGTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTTCATCTGCGATGATCGACCGTGTGGTCAACGACTTGGGCCGTAAACTGGTAGAAGTCCCGGTAGGTTTCAAATGGTTTGTCGATGGTCTGTTCGACGGCAGCTTCGGCTTTGGCGGCGAAGAGAGTGCAGGGGCTTCCTTCCTGCGTTTCGACGGCa < 2:598320/289‑1 (MQ=255) aaTGCCCGTCCCGGTCTCGCCCCTCCGGCGGATTTGATG‑AATCCGAACCACGACCTGGCGGTGGCAATCCATTACCTGTTCCAGCATCGTCCGCAGTGGGGCAAAGATGTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTTCATCTGCGATGATCGACCGTGTGGTCAACGACTTGGGCCGTAAACTGGTAGAAGTCCCGGTAGGTTTCAAATGGTTTGTCGATGGTCTGTTCGACGGCAGCTTCGGCTTTGGCGGCGAAGAGAGTGCAGGGGCTTCCTTCCTGCGTTTCGACGGCa < 2:146366/288‑1 (MQ=255) ccGTCACGGTATCGTCACTCGGGCAGGTTTGATG‑ACTCCGCACCACTACCTGGCGGTGGCAATCCATTACCTGTTCCAGCATCGTCCGCAGTGGGGCAAAGATGTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTTCATCTGCGATGATCGACCGTGTGGTCAACGACTTGGGCCGTAAACTGGTAGAAGTCCCGGTAGGTTTCAAATGGTTTGTCGATGGTCTGTTCGACGGCAGCTTCGGCTTTGGCGGCGAAGAGAGTGCAGGGGCTTCCTTCCTGCGTTTCGACGGCACGCCg < 2:1191004/289‑1 (MQ=255) tCACGGTATCGTCACTCCGGCAGGTTTGATG‑AATCCGAACCACTACCTGGCGGTGGCAATCAATTACCTGTTCCAGCATCGTCCGCAGTTGGGCAAAGATGTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTTCATCTGCGATGATCGACCGTGTGGTCAACGACTTGGGCCGTAAACTGGTAGAAGTCCCGGTAGGTTTCAAATGGTTTGTCGATGGTCTGTTCGACGGCAGCTTCGGCTTTGGCGGCGAAGAGAGTGCCGGGGCTTCCTTCCTGCGTTTCGACGGCACGCCGTgg > 2:1565767/1‑289 (MQ=255) tCACGGTATCGTCACTCCGGCAGGTTTGATG‑AATCCGAACCACTACCTGGCGGTGGCAATCAATTACCTGTTCCAGCATCGTCCGCAGTGGGGCAAAGATGTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTTCATCTGCGATGATCGACCGTGTGGTCAACGACTTGGGCCGTAAACTGGTAGAAGTCCCGGTAGGTTTCaaa < 2:1889336/196‑1 (MQ=255) tCACGGTATCGTCACTCCGGCAGGTTTGATG‑AATCCGAACCACTACCTGGCGGTGGCAATCAATTACCTGTTCCAGCATCGTCCGCAGTGGGGCAAAGATGTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTTCATCTGCGATGATCGACCGTGTGGTCAACGACTTGGGCCGTAAACTGGTAGAAGTCCCGGTAGGTTTCAAATGGTTTGTCGATGGTCTGTTCGACGGCAGCTTCGGCTTTGGCGGCGAAGAGAGTGCa < 1:1876890/253‑1 (MQ=255) tCACGGTATCGTCACTCCGGCAGGTTTGATG‑AATCCGAACCACTACCTGGCGGTGGCAATCAATTACCTGTTCCAGCATCGTCCGCAGTGGGGCAAAGATGTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTTCATCTGCGATGATCGACCGTGTGGTCAACGACTTGGGCCGTAAACTGGTAGAAGTCCCGGTAGGTTTCAAATGGTTTGTCGATGGTCTGTTCGACGGCAGCTTCGGCTTTGGCGGCGAAGAGAGTGCAGGGGCTTCCTTCCTGCGTTTCGACGGCACGCCGTgg > 2:891682/1‑289 (MQ=255) tCACGGTATCGTCACTCCGGCAGGTTTGATG‑AATCCGAACCACTACCTGGAGGTGGCAATCAATTACCTGTTCCAGCATCGTCCGCAGTGGGGCAAAGATGTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTTCATCTGCGATGATCGACCGTGTGGTTAACGACTTGGGCCGTAAACTGGTACAAGTCCCGGTCGGTTTCAAATGGTTTGTCGATGGTCTGTTCGACGGCAGCTTCGACTTTGGCGGCGAAGAGAGTGCAGGGGCTTCCTTCCTGCGGTTGGaggcgcagccgggg > 2:1699802/1‑276 (MQ=255) cGGTATCGTCACTCCGGCAGGTTTGATG‑AATCCGAACCACTACCTGGCGGTGGCAATCAATTACCTGTTCCAGCATCGTCCGCAGTGGGGCAAAGATGTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTTCATCTGCGATGATCGACCGTGTGGTCAACGACTTGGGCCGTAAACTGGTAGAAGTCCCGGTAGGTTTCAAATGGTTTGTCGATGGTCTGTTCGACGGCAGCTTCGGCTTTGGCGGCGAAGAGAGTGCAGGGGCTTCCTTCCTGCGTTTCGACGGCCCGCCGTGGTc > 1:1280324/1‑288 (MQ=255) tCCGGCAGGTTTGATG‑AATCCGAACCACTACCTGGCGGTGGCAATCAATTACCTGTTCCAGCATCGTCCGCAGTGGGGCAAAGATGTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTTCATCTGCGATGATCGACCGTGTGGTCAACGACTTGGGCCGTAAACTGGTAGAAGTCCCGGTAGGTTTCAAATGGTTTGTCGATGGTCTGTTCGACGGCAGCTTCGGCTTTGGCGGCGAAGAGAGTGCAGGGGCTTCCTTCCTGCGTTTCGACGGCACGCCGTGGTCCACCGACAAAGAc > 1:1800250/1‑289 (MQ=255) ccGGCAGGTTTGATG‑AATCCGAACCACTACCTGGCGGTGGCAATCAATTACCTGTTCCAGCATCGTCCGCAGTGGGGCAAAGATGTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTTCATCTGCGATGATCGACCGTGTGGTCAACGACTTGGGCCGTAAACTGGTAGAAGTCCCGGTAGGTTTCAAATGGTTTGTCGATGGTCTGTTCGACGGCAGCTTCGGCTTTGGCGGCGAAGAGAGTGCAGGGGCTTCCTTCCTGCGTTTCGACGGCACGCCGTGGTCCACCGACAAAGACg < 1:1349811/289‑1 (MQ=255) aGGTTTGATG‑AATCCGAACCACTACCTGGCGGTGGCAATCAATTACCTGTTCCAGCATCGTCCGCAGTGGGGCAAAGATGTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTTCATCTGCGATGATCGACCGTGTGGTCAACGACTTGGGCCGTAAACTGGTAGAAGTCCCGGTAGGTTTCAAATGGTTTGTCGATGGTCTGTTCGACGGCAGCTTCGGCTTTGGCGGCGAAGAGAGTGCAGGGGCTTCCTTCCTGCGTTTCGACGGCACGCCGTGGTCCACCGACAAAGACGGcat < 1:686985/288‑1 (MQ=255) tCCGAACCACTACCTGGCGGTGGCAATCAATTACCTGTTCCAGCATCGTCCGCAGTGGGGCAAAGATGTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTTCATCTGCGATGATCGACCGTGTGGTCAACGACTTGGGCCGTAAACTGGTAGAAGTCCCGGTAGGTTTCAAATGGTTTGTCGATGGTCTGTTCGACGGCAGCTTCGGCTTTGGCGGCGAAGAGAGTGCAGGGGCTTCCTTCCTGCGGTTCGGCGGCACGCCGTGGCCCACCGACAAAGACGGCCTCATCAGTTGTct > 2:707741/1‑288 (MQ=255) tCCGAACCACTACCTGGCGGTGGCAATCAATTACCTGTTCCAGCATCGTCCGCAGGGGGGCAAAGATGTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTTCATCTGCGATGATCGACCGTGTGGTCAACGACTTGGGCCGTAAACTGGTAGAAGTCCCGGTAGGTTTCAAATGGTTTGTCGATGGTCTGTTCGACGGCAGCTCCGGCTTTGGCGCCGAAGAGAGTGCAGGGGCTTCCTTCCTGCGTTTCGACGGCCCGCCCTGGGCAACCGACCATGCCTGcatccttctttttctc > 2:1768936/1‑277 (MQ=255) ccACTACCTGGCGGTGGCAATCAATTACCTGTTCCAGCATCGTCCGCAGTGGGGCAAAGATGTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTTCATCTGCGATGATCGACCGTGTGGTCAACGACTTGGGCCGTAAACTGGTAGAAGTCCCGGTAGGTTTCAAATGGTTTGTCGATGGTCTGTTCGACGGCAGCTTCGGCTTTGGCGGCGAAGAGAGTGCAGGGGCTTCCTTCCTGCGTTTCGACGGCACGCCGTGGTCCACCGACAAAGACGGCATCATCATGTGTCTGCTggcg < 2:628585/289‑1 (MQ=255) tACCTGGCGGTGGCAATCAATTACCTGTTCCAGCATCGTCCGCAGTGGGGCAAAGATGTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTTCATCTGCGATGATCGACCGTGTGGTCAACGACTTGGGCCGTAAACTGGTAGAAGTCCCGGTAGGTTTCAAATGGTTTGTCGATGGTCTGTTCGACGGCAGCTTCGGCTTTGGCGGCGAAGAGAGTGCAGGGGCTTCCTTCCTGCGTTTCGACGGCACGCCGTGGTCCACCGACAAAGACGGCATCATCATGTGTCTGCTGGcggcgg > 1:927982/1‑289 (MQ=255) gTGGCAATCAATTACCTGTTCCAGCATCGTCCGCAGTGGGGCAAAGATGTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTTCATCTGCGATGATCGACCGTGTGGTCAACGACTTGGGCCGTAAACTGGTAGAAGTCCCGGTAGGTTTCAAATGGTTTGTCGATGGTCTGTTCGACGGCAGCTTCGGCTTTGGCGGCGAAGAGAGTGCAGGGGCTTCCTTCCTGCGTTTCGACGGCACGCCGTGGTCCACCGACAAAGACGGCATCATCATGTGTCTGCTGGCGGCGGAAATCAcc > 1:230852/1‑288 (MQ=255) tGGCAATCAATTACCTGTTCCAGCATCGTCCGCAGTGGGGCAAAGATGTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTTCATCTGCGATGATCGACCGTGTGGTCAACGACTTGGGCCGTAAACTGGTAGAAGTCCCGGTAGGTTTCAAATGGTTTGTCGATGGTCTGTTCGACGGCAGCTTCGGCTTTGGCGGCGAAGAGAGTGCAGGGGCTTCCTTCCTGCGTTTCGACGGCACGCCGTGGTCCACCGACAAAGACGCCATCATCATGTGTCTGCTGGCGGCGGAAATCACCg > 2:204977/1‑288 (MQ=255) aCCTGTTCCAGCATCGTCCGCAGTGGGGCAAAGATGTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTTCATCTGCGATGATCGACCGTGTGGTCAACGACTTGGGCCGTAAACTGGTAGAAGTCCCGGTAGGTTTCAAATGGTTTGTCGATGGTCTGTTCGACGGCAGCTTCGGCTTTGGCGGCGAAGAGAGTGCAGGGGCTTCCTTCCTGCGTTTCGACGGCACGCCGTGGTCCACCGACAAAGACGGCATCATCATGTGTCTGCTGGCGGCGGAAATCACCGCTGTCACCGGTaa > 1:752726/1‑289 (MQ=255) gTTCCAGCATCGTCCGAGGTGGGGAAAAGATGTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTTCATCTGCGATGATCGACCGTGTGGTCAACGACTTGGGCCGTAAACTGGTAGAAGTCCCGGTAGGTTTCAAATGGTTTGTCGATGGTCTGTTCGACGGCAGCTTCGGCTTTGGCGGCGAAGAGAGTGCAGGGGCTTCCTTCCTGCGTTTCGACGGCACGCCGTGGTCCACCGACAAAGACGGCATCATCATGTGTCTGCTGGCGGCGGAAATCACCGCTGTCACCGGTAAGaa < 2:255549/288‑1 (MQ=255) tCCAGCATCGTCCGCAGTGGGGCAAAGATGTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTTCATCTGCGATGATCGACCGTGTGGCCAACGACTTGGGCCGTAAACTGGTAGAAGTCCCGGTAGGTTTCAAATGGTTTGTCGATGGTCTGTTCGACGGCAGCTTCGGCTTTGGCGGCGAAGAGAGTGCAGGGGCTTCCTTCCTGCGTTTCGACGGCACGCCGTGGTCCACCGACAAAGACGGCATCATCATGTGTCTGCTGGCGGCGGAAATCACCGCTGTCACCGGTAAGAAccc > 2:943111/1‑289 (MQ=255) tCCAGCATCGTCCGCAGTGGGCCAAAGATGTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTTCATCTGCGATGATCGACCGTGTGGTCAACGACTTGGGCCGTAAACTGGTAGAAGTCCCGGTAGGTTTCAAATGGTTTGTCGATGGTCTGTTCGACGGCAGCTTCGGCTTTGGCGGCGAAGAGAGTGCAGGGGCTTCCTTCCTGCGTTTCGACGGCACGCCGTGGTCCACCGACAAAGACGGCATCATCATGTGTCTGCTGGCGGCGGAAATCACCGCTGTCACCGGTAAGAAcc < 1:1437360/288‑1 (MQ=255) cgggttCGTCCGAAGTGGGGTAATGTGGTTGACGGCGGTAAGTCGAGGGTTTGATCTTCGATGGTCGTCCGTGTGGTCAACGAATTGGGCCGTAAACTGGTAGAAGTCCTTGTAGGGTTCAAATGGTTTGTCGATGGTCTGTTCGACGGCTGCTTCGGCTTTTGCGGCGAAGAGAGTGCAGGGGTTTCCTTCCTGCGTTTCGACGGCACGCCGTGGTCCACCGACAAAGACGGCATCATCATGTGTCTGCTGGCGGCGGAAATCACCGCTGTCACCGGTAAGAACCCGc < 2:1006265/284‑1 (MQ=255) cAGGATCGTCCGCAGTGGGGCAAAGATGTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTTCATCTGCGATGATCGACCGTGTGGTCAACGACTTGGGCCGTAAACTGGTAGAAGTCCCGGTAGGTTTCAAATGGTTTGTCGATGGTCTGTTCGACGGCAGCTTCGGCTTTGGCGGCGAAGAGAGTGCAGGGGCTTCCTTCCTGCGTTTCGACGGCACGCCGTGGTCCACCGACAAAGACGGCATCATCATGTGTCTGCTGGCGGCGGAAATCACCGCTGTCACCGGTAAGAACCCGc < 1:1902044/289‑1 (MQ=255) cAGCATCGTCCGCAGTGGGGCAAAGATGTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTTCATCTGCGATGATCGACCTTGTGGTCAACGACTTGGGCCGTAAACTGGTAGAAGTCCCGGTAGGTTTCAAATGGTTTGTCGATGGTCTGTTCGACGGCAGCTTCGGCTTTGGCGGCGAAGAGAGTGCAGGGGCTTCCTTCCTGCGTTTCGACGGCACGCCGTGGTCCACCGACAAAGACGGCATCATCATGTGTCTGCTGGCGGCGGAAATCACCGCTGTCACCGGTAAGAACCCGc < 1:1067019/289‑1 (MQ=255) cATCGTCCGCAGTGGGGCAAAGATGTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTTCATCTGCGATGATCGACCGTGTGGTCAACGACTTGGGCCGTAAACTGGTAGAAGTCCCGGTAGGTTTCAAATGGTTTGTCGATGGTCTGTTCGACGGCAGCTTCGGCGTCGGCGGCGAAGAGAGTGCAGTGGCTTCCTTCCTGCGTTTCGACGGAACGCCGTGGTCCACCGACAAAGACGGCATCATCCTGTGTCTGCTGGCGACGGACATCACCGATGTGCCCGGTCAGAACCCGAAg > 2:1582446/1‑288 (MQ=255) gTCCGCAGTGGGGCAAAGATGTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTTCATCTGCGATGATCGACCGTGTGGTCAACGACTTGGGCCGTAAACTGGTAGAAGTCCCGGTAGGTTTCAAATGGTTTGTCGATGGTCTGTTCGACGGCAGCTTCGGCTTTGGCGGCGAAGAGAGTGCAGGGGCTTCCTTCCTGCGTTTCGACGGCACGCCGTGGTCCACCGACAAAGACGGCATCATCATGTGTCTGCTGGCGGCGGAAATCACCGCTGTCACCGGTAAGAACCCGCAGGAac > 1:343260/1‑288 (MQ=255) gTCCGCAGTGGGGCAAAGATGTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTTCATCTGCGATGATCGACCGTGTGGTCAACGACTTGGGCCGTAAACTGGTAGAAGTCCCGGTAGGTTTCAAATGGTTTGTCGATGGTCTGTTCGACGGCAGCTTCGGCTTTGGCGGCGAAGAGAGTGCAGGGGCTTCCTTCCTGCGTTTCGACGGCACGCCGTGGTCCACCGACAAAGACGGCATCATCATGTGTCTGCTGGCGGCGGAAATACCCGCTGTCCCCGGGCAGAACCCCAAGGAac > 2:1264687/1‑288 (MQ=255) tCCGCAGTGGGGCAAAGATGTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTTCATCTGCGATGATCGACCGTGTGGTCAACGACTTGGGCCGTAAACTGGTAGAAGTCCCGGTAGGTTTCAAATGGTTTGTCGATGGTCTGTTCGACGGCAGCTTCGGCTTTGGCGGCGAAGAGAGTGCAGGGGCTTCCTTCCTGCGTTTCGACGGCACGCCGTGGTCCACCGACAAAGa < 1:1629383/222‑1 (MQ=255) tCCGCAGTGGGGCAAAGATGTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTTCATCTGCGATGATCGACCGTGTGGTCAACGACTTGGGCCGTAAACTGGTAGAAGTCCCGGTAGGTTTCAAATGGTTTGTCGATGGTCTGTTCGACGGCAGCTTCGGCTTTGGCGGCGAAGAGAGTGCAGGGGCTTCCTTCCTGCGTTTCGACGGCACGCCGTGGTCCACCGACAAAGa > 2:1629383/1‑222 (MQ=255) tCCGCAGTGGGGCAAAGATGTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTTCATCTGCGATGATCGACCGTGTGGTCAACGACTTGGGCCGTAAACTGGTAGAAGTCCCGGTAGGTTTCAAATGGTTTGTCGATGGTCTGTTCGACGGCAGCTTCGGCTTTGGCGGCGAAGAGAGTGCAGGGGCTTCCTTCCTGCGTTTCGACGGCACGCCGTGGTCCACCGACAAAGACGGCATCATCATGTGTCTGCTGGCGGCGGAAATCACCGCTGTCACCGGTAAGAACCCGCAGGAaca > 2:384746/1‑288 (MQ=255) tCCGCAGTGGGGCAAAGATGTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTTCATCTGCGATGATCGACCGTGTGGTCAACGACTTGGGCCGTAAACTGGTAGAAGTCCCGGTAGGTTTCAAATGGTTTGTCGATGGTCTGTTCGACGGCAGCTTCGGCTTTGGCGGCGAAGAGAGTGCAGGGGCTTCCTTCCTGCGTTTCGACGGCACGCCGTGGTCCACCGACAAAGACGGCATCATCATGTGTCTGCTGGCGGCGGAAATCACCGCTGTCACCGGTAAGAACCCGCAGGAac > 1:1574924/1‑287 (MQ=255) tCCGCAGTGGGGCAAAGATGTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTTCATCTGCGATGATCGACCGTGTGGTCAACGACTTGGGCCGTAAACTGGTAGAAGTCCCGGTAGGTTTCAAATGGTTTGTCGATGGTCTGTTCGACGGCAGCTTCGGCTTTGGCGGCGAAGAGAGTGCAGGGGCTTCCTTCCTGCGTTTCGACGGCACGCCGTGGTCCACCGACAAAGACGGCATCATCATGTGTCTGCTGGCGGCGGAAATCACCGCTGTCACCGGTAAGAACCCGCAGGAac > 1:1223382/1‑287 (MQ=255) gCAAAGATGTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTTCATCTGCGATGATCGACCGTGTGGTCAACGACTTGGGCCGTAAACTGGTAGAAGTCCCGGTAGGTTTCAAATGGTTTGTCGATGGTCTGTTCGACGGCAGCTTCGGCTTTGGCGGCGAAGAGAGTGCAGGGGCTTCCTTCCTGCGTTTCGACGGCACGCCGTGGTCCACCGACAAAGACGGCATCATCATGTGTCTGCTGGCGGCGGAAATCACCGCTGTCACCGGTAAGAACCCGCAGGAACACTACAACGAAc < 1:31736/288‑1 (MQ=255) aGATGTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTTCATCTGCGATGATCGACCGTGTGGTCAACGACTTGGGCCGTAAACTGGTAGAAGTCCCGGTAGGTTTCAAATGGTTTGTCGATGGTCTGTTCGACGGCAGCTTCGGCTTTGGCGGCGAAGAGAGTGCAGGGGCTTCCTTCCTGCGTTTCGACGGCACGCCGTGGTCCACCGACAAAGACGGCATCATCATGTGTCTGCTGGCGGCGGAAATCACCGCTGTCACCGGTAAGAACCCGCAGGAACACTACAACGAACTGGCa > 1:369831/1‑289 (MQ=255) gTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTTCATCTGCGATGATCGACCGTGTGGTCAACGACTTGGGCCGTAAACTGGTAGAAGTCCCGGTAGGTTTCAAATGGTTTGTCGATGGTCTGTTCGACGGCAGCTTCGGCTTTGGCGGCGAAGAGAGTGCAGGGGCTTCCTTCCTGCGTTTCGACGGCACGCCGTGGTCCACCGACAAAGACGGCATCATCATGTGTCTGCTGGCGGCGGAAATCACCGCTGGCACCGGTAAGAACCCGCAGGAACACTCAAACGAACTGGCaaaa > 2:343447/1‑288 (MQ=255) aaaaCGCTGGTGTCAGCTGGGATGATCTACCGTGTGGTCAACGACTTGGGCCGTAAACTGGTAGAAGTCCCGGTAGGTTTCAAATGGTTTGTCGATGGTCTGTTCGACGGCAGCTTCGGCTTTGGCGGCGAAGAGAGTGCAGGGGCTTCCTTCCTGCGTTTCGACGGCACGCCGTGGTCCACCGACAAAGACGGCATCATCATGTGTCTGCTGGCGGCGGAAATCACCGCTGTCACCGGTAAGAACCCGCAGGAACACTACAACGAACTGGCAAAACGCTTTGGTgcgc < 2:154658/289‑1 (MQ=255) ||| TAACGATCAGGTCGATCAAACCTTCCGCTTTATGCACCTTGATAAAGACGGCGCGATCCGTATGGACTGCTCCTCCGAGTGTGCGATGGCGGGCCTGCTGGCACTGCGTGATAAGTTCGATCTGGCGTTTGCTAACGACCCGGATTATGACCGTCACGGTATCGTCACTCCGGCAGGTTTGATG‑AATCCGAACCACTACCTGGCGGTGGCAATCAATTACCTGTTCCAGCATCGTCCGCAGTGGGGCAAAGATGTTGCCGTCGGTAAAACGCTGGTTAGTTCTGCGATGATCGACCGTGTGGTCAACGACTTGGGCCGTAAACTGGTAGAAGTCCCGGTAGGTTTCAAATGGTTTGTCGATGGTCTGTTCGACGGCAGCTTCGGCTTTGGCGGCGAAGAGAGTGCAGGGGCTTCCTTCCTGCGTTTCGACGGCACGCCGTGGTCCACCGACAAAGACGGCATCATCATGTGTCTGCTGGCGGCGGAAATCACCGCTGTCACCGGTAAGAACCCGCAGGAACACTACAACGAACTGGCAAAACGCTTTGGTGCGCCG > CP042583/586763‑587318 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |