Predicted mutation | ||||||
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RA | CP042583 | 605,373 | 3 bp→TGA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP042583 | 605,373 | 0 | A | T | 98.4% | 439.4 / NA | 187 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
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* | CP042583 | 605,375 | 0 | T | A | 100.0% | 444.4 / NA | 187 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base A (91/96); total (91/96) |
Only 100 of 187 total aligned reads displayed.
TGGATCTCACTGGCACCCAGCACCACATGACCGATCGCCATCAACAACGCCCCCAGCATCACCGCCATGCGATTGCCGAGAACTTTATCCGCCAAAAAGCCACCGAGGATTGGCGTGACATACACCAGGCTACAGTAGGCGCTAAATAACTCGTAGGCGTGAGTATCGTTGTATTTTAGTTGATTGGTGAGATAGAGAATCAGCAGGGCACGCATGCCGTAAAAGCTAAAATATTCCCAGATTTGCAGCGCAACGACATAGTAAATAGCGCGCGGCTGACTTGCGTGTTTATTCATAATAATTCCACAATTGACGGCAACGTCACGTAATAGTTGCGCGGCGTGCTTGTGTTTCCTTAAAGTTAAAACTTTGATACAGATCTGATTATTTATGCAATATGCTGTCTGATTGCATAAATATACATTAGCTGAAGCGTGATGATATAAACAATTTGCGTCTTTTGGCGTCGGGTTTGTTTCTTAATATGTCAAAAGATTGGCTATCGACGAACTGGCGAGGTAACGCTATGTTAACGGTGTAGCTATCAGAATACGGAAGGC > CP042583/605095‑605654 ||| atCTCACTGGCACCCAGCACCACATGACCGATCGCCATCAACAACGCCCCCAGCATCACCGCCATGCGATTGCCGAGAACTTTATCCGCCAAAAAGCCACCGAGGATTGGCGTGACATACACCAGCGAACAGTAGGCGCTAAATAACTCGTAGGCGTGAGTATCGTTGTATTTTAGTTGATTGGTGAGATAGAGAATCAGCAGGGCACGCATGCCGTAAAAGCTAAAATATTCCCAGATTTGCAGCGCAACGACATAGTAAATAGCGCGCGGCTGTGATGCGTGTTTa < 1:968493/288‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |