| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP042583 | 630,630 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP042583 | 630,630 | 0 | A | T | 98.7% | 528.2 / NA | 230 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (112/113); minor base C (2/1); total (114/116) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| * | CP042583 | 630,631 | 0 | G | C | 99.6% | 532.5 / NA | 230 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base C (112/115); total (114/116) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.88e-01 | |||||||||||
| * | CP042583 | 630,632 | 0 | C | G | 100.0% | 536.7 / NA | 230 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (114/116); total (114/116) | |||||||||||
Only 100 of 230 total aligned reads displayed.
GGCCCGTATGCCATTTTCGCCTCCGTCAAAATGGTTAGCGCATTTACCGTAACCGCTTCCACGATGCTCGCACCGCGCCTGTTTAAAGAGTTTGAAATTGAGACCGGGAAATCCACCTGGCTGTTAGGGCTGGCAGGTATTACCGAAGGGGCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTAGCTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTAGCACACCCGGTGCCGGCATTTTCAGCCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATCAGCACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATGGCAACTATCTGACTGATGGCGTAATGCCATAAACAAAAAGGAAACGACGATGAAAGCAGTATCTCGCGTTCACATCACCCCGCATATGCACTGGGATCGAGAGTGGTATTTCACCACCGAAGAGAGTCGTATTCTGCTGGTCAA > CP042583/630354‑630906 ||| ggCCCGTATGCCATTTTCGCCTCCGTCAAAATGGTTTCGGCATTTACCGTAACCGCTTCCACGATGCTCGCACCGCGCCTGTTTAAAGAGTTTGAAATTGAGACCGGGAAATCCACCTGGCTGTTAGGGCTGGCAGGTATTACCGAAGGGGCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTAc < 1:1467660/289‑1 (MQ=255) ccGTATGCCATTTTCGCCTCCGTCAAAATGGTTTCGGCATTTACCGTAACCGCTTCCACGATGCTCGCACCGCGCCTGTTTAAAGAGTTTGAAATTGAGACCGGGAAATCCACCTGGCTGTTAGGGCTGGCAGGTATTACCGAAGGGGCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACt > 1:547744/1‑287 (MQ=255) ttCGCCTCCGTCAAAATGGTTTCGGCATTTACCGTAACCGCTTCCACGATGCTCGCACCGCGCCTGTTTAAAGAGTTTGAAATTGAGACCGGGAAATCCACCTGGCTGTTAGGGCTGGCAGGTATTACCGAAGGGGCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGgcg > 1:1472644/1‑289 (MQ=255) ttCGCCTCCGTCAAAATGGTTTCGGCATTTACCGTAACCGCTTCCACGATGCTCGCACCGCGCCTGTTTAAAGAGTTTGAAATTGAGACCGGGAAATCCACCTGGCTGTTAGGGCTGGCAGGTATTACCGAAGGGGCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGgcg < 1:260375/289‑1 (MQ=255) tCGCCTCCGTCAAAATGGTTTCGGCATTTACCGTAACCGCTTCCACGATGCTCGCACCGCGCCTGTTTAAAGAGTTTGAAATTGAGACCGGGAAATCCACCTGGCTGTTAGGGCTGGCAGGTATTACCGAAGGGGCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGCCTCCCGGTGCCGGCATTTTCCTGCTCTTTTTTCTTCATGATAATGgcgc > 2:1679644/1‑289 (MQ=255) cccacGTCAAAATGGTTTCGGAATTTACCGTAACCGGTTCCACGGTGCTTGGACCGGGGCTGGTTAAAGAGTTTGGAATTGAGACCGGGAAATCCCCCTGGCTGTTAGGGCTGGCAGATATTACCGAAGGGGCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCgcggg < 2:215419/285‑1 (MQ=255) ccTCCGTCAAAATGGTTTCGGCATTTACCGTAGCCGCTTCCACGATGCTCGCACCGCGCCTGTTTAAAGAGTTTGAAATTGAGACCGGGAAATCCACCTGGCTGTTAGGGCTGGCAGGTATTACCGAAGGGGCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTGTTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCgcggg < 1:853356/289‑1 (MQ=255) cTCCGTCAAAATGGTTTCGGCATTTACCGTAACCGCTTCCACGATGCTCGCACCGCGCCTGTTTAAAGAGTTTGAAATTGAGACCGGGAAATCCACCTGGCTGTTAGGGCTGGCAGGTATTACCGAAGGGGCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCgcgggc < 1:1611512/289‑1 (MQ=255) cTCCGTCAAAATGGTTTCGGCATTTACCGTAACCGCTTCCACGATGCTCGCACCGCGCCTGTTTAAAGAGTTTGAAATTGAGACCGGGAAATCCACCTGGCTGTTAGGGCTGGCAGGTATTACCGAAGGGGCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCgcggg < 1:1592655/288‑1 (MQ=255) aaaatggtgtcggcATTTACCGTAACCGCTTCCACGATGCTCGCACCGCGCCTGTTTAAAGAGTTTGAAATTGAGACCGGGAAATCCACCTGGCTGTTAGGGCTGGCAGGTATTACCGAAGGGGCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTa < 1:1558604/277‑1 (MQ=255) tACCGTAACCGCTTCCACGATGCTCGCACCGCGCCTGTTTAAAGAGTTTGAAATTGAGACCGGGAAATCCACCTGGCTGTTAGGGCTGGCAGGTATTACCGAAGGGGCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTgg > 1:1671954/1‑289 (MQ=255) tAACCGCTTCCACGATGCTCGCACCGCGCCTGTTTAAAGAGTTTGAAATTGAGACCGGGAAATCCACCTGGCTGTTAGGGCTGGCAGGTATTACCGAAGGGGCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTg > 1:569536/1‑288 (MQ=255) aCCGCTTCCACGATGCTCGCACCGCGCCTGTTTAAAGAGTTTGAAATTGAGACCGGGAAATCCACCTGGCTGTTAGGGCTGGCAGGTATTACCGAAGGGGCGATCCCGATGGCGATTGAAGTGCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGgcg < 2:1720470/289‑1 (MQ=255) cTTCCACGATGCTCGCACCGCGCCTGTTTAAAGAGTTTGAAATTGAGACCGGGAAATCCACCTGGCTGTTAGGGCTGGCAGGTATTACCGAAGGGGCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCCTGATAATGGCGCGTGCGGTGTTATGGCGGCAATTGTCTGGTTGGGCGCGGc > 2:366323/1‑289 (MQ=255) cTTCCACGATGCTCGCACCGCGCCTGTTTAAAGAGTTTGAAATTGAGACCGGGAAATCCACCTGGCTGTTAGGGCTGGCAGGTATTACCGAAGGGGCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGc > 1:2351/1‑289 (MQ=255) tCCACGATGCTCGCACCGCGCCTGTTTAAAGAGTTTGAAATTGAGACCGGGAAATCCACCTGGCTGTTAGGGCTGGCAGGTATTACCGAAGGGGCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCAt > 1:324311/1‑289 (MQ=255) tCGCACCGCGCCTGTTTAAAGAGTTTGAAATTGAGACCGGGAAATCCACCTGGCTGTTAGGGCTGGCAGGTATTACCGAAGGGGCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTggggg < 1:950643/288‑1 (MQ=255) cGCACCGCGCCTGTTTAAAGAGTTTGAAATTGAGACCGGGAAATCCACCTGGCTGTTAGGGCTGGCAGGTATTACCGAAGGGGCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGgggggg > 1:1272078/1‑286 (MQ=255) cGCACCGCGCCTGTTTAAAGAGTTTGAAATTGAGACCGGGAAATCCACCTGGCTGTTAGGGCTGGCAGGTATTACCGAAGGGGCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCt < 1:840481/289‑1 (MQ=255) gcgcCTGTTTAAAGAGTTTGAAATTGAGACCGGGAAATCCACCTGGCTGTTAGGGCTGGCAGGTATTACCGAAGGGGCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCaa > 1:436331/1‑287 (MQ=255) cgcCTGTTTAAAGAGTTTGAAATTGAGACCGGGAAATCCACCTGGCTGTTAGGGCTGGCAGGTATTACCGAAGGGGCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATc > 1:632762/1‑288 (MQ=255) cgcCTGTTTAAAGAGTTTGAAATTGAGACCGGGAAATCCACCTGGCTGTTAGGGCTGGCAGGTATTACCGAAGGGGCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGGTATGGCGTCAATTGGCTGGCTTGGCGCGGGATGGGTGGGGGCGGCAGTc > 2:397186/1‑288 (MQ=255) tttAAAGAGTTTGAAATTGAGACCGGGAAATCCACCTGGCTGTTAGGGCTGGCAGGTATTACCGAAGGGGCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATctcgact > 1:164057/1‑282 (MQ=255) tAAAGAGTTTGAAATTGGGACCGGGAAATCCACCTGGCTGTTAGGGCTGGCAGGTATTACCGAAGGGGCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGT‑GGGGCTGCAATCTCGACTGCaa < 1:162927/289‑1 (MQ=255) aaaGAGTTTGAAATTGAGACCGGGAAATCCACCTGGCTGTTAGGGCTGGCAGGTATTACCGAAGGGGCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATCTCGACTGCaa < 2:1740185/289‑1 (MQ=255) tttGAAATTGAGACCGGGAAATCCACCTGGCTGTTAGGGCTGGCAGGTATTACCGAAGGGGCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGgcg > 1:982235/1‑250 (MQ=255) tttGAAATTGAGACCGGGAAATCCACCTGGCTGTTAGGGCTGGCAGGTATTACCGAAGGGGCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATCTCGACTGCAATtct > 1:173126/1‑287 (MQ=255) tttGAAATTGAGACCGGGAAATCCACCTGGCTGTTAGGGCTGGCAGGTATTACCGAAGGGGCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGGTATGGCGGCAAGTGGCTGGTTTGGCTCGGCCTTGGTGGGGGGGGGAATCCCGACTGCAAtttc > 2:852112/1‑285 (MQ=255) gAAATCCACCTGGCTGTTAGGGCTGGCAGGTATTACCGAAGGGGCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATCTCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCa < 1:1365382/288‑1 (MQ=255) aaTCCACCTGGCTGTTGGGGCTGGCAGGTATTACCGAAGGGGCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATCTCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCAcg < 2:178078/288‑1 (MQ=255) aaTCCACCTGGCTGTTAGGGCTGGCAGGTATTACCGAAGGGGCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATCTCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCAcg < 1:1225548/288‑1 (MQ=255) cTGGCTGTTAGGGCTGGCAGGTATTACCGAAGGGGCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCAGTGGGGGTGGCTGCAATCTCGGCTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTaa > 1:705359/1‑288 (MQ=255) tGGCTGTTAGGGCTGGCAGGTATTACCGAAGGGGCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGGGGGGGCTGCAATCTCGGCTGCAATTCTCCTGATGTGTCGGCGTTAGCCGGTTAAg > 2:1365382/1‑288 (MQ=255) ggCTGTTAGGGCTGGCAGGTATTACCGAAGGGGCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATCTCTACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGGCACGCGGTTAAGcc > 2:1584742/1‑288 (MQ=255) gCTGTTAGGGCTGGCAGGTATTACCGAAGGGGCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTggg > 2:1855769/1‑234 (MQ=255) gCTGTTAGGGCTGGCAGGTATTACCGAAGGGGCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTggg < 1:1855769/234‑1 (MQ=255) gCTGTTAGGGCTGGCAGGTATTACCGAAGGGGCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATCTCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCAt > 1:1151672/1‑289 (MQ=255) cTGTTAGGGCTGGCAGGTATTACCGAAGGGGCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTGTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATTATAATGGCGCGGGCCGGGTGCTGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGTGCGGCATCGGCGGGGGCTGCAATCTCGACTGCAATTGCCCTGGTGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATg > 2:1184549/1‑289 (MQ=255) gTTAGTGGTGGCAGGTATTACCGGAGGGGCGAGCCCGATGGCGATTGAGGATCCGCTGTGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATCTCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATGGc < 2:1281761/289‑1 (MQ=255) tAGGGCTGGCAGGTATTACCGAAGGGGCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATCTCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATGGCa > 1:1541428/1‑288 (MQ=255) ggCAGGTATTACCGAAGGGGCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATCTCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATGGCAACTATctg > 1:1202813/1‑289 (MQ=255) ggCAGGTATTACCGAAGGGGCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATCTCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATGGCAACTATct < 2:32887/288‑1 (MQ=255) cAGGTATTACCGAAGGGGCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCGGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCGGCAATCTCGACTGCAATTCTCCCGATGTGGCGGCGTCACGCGGTCACGCATGGCAACTATccg > 2:1844407/1‑285 (MQ=255) tATTACCGAAGGGGCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTATGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATCTCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCAGGGCAACTATCTGACGGAt > 1:1162816/1‑289 (MQ=255) aGGGGCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCaa < 2:449811/179‑1 (MQ=255) aGGGGCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCaa > 1:449811/1‑179 (MQ=255) ggggCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCaa < 2:1434779/178‑1 (MQ=255) ggggCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCaa > 1:1434779/1‑178 (MQ=255) ggggCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATCTCGACTGCAATTCTCCTGATGTTGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATGGCAACTATCTGACTGATGGCGTAATg > 1:1601965/1‑288 (MQ=255) ggggCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCCGGTTTGGCCCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATCTCGACTGCACGTCTCCTGATGTGGCGGGGTCACGCGGTTAACCATGCCAACTATGTGCCTGAttggcttatgc > 2:262979/1‑279 (MQ=255) ggCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATCTCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATGGCAACTATCTGACTGATGGCGTAATGCCa > 1:489204/1‑289 (MQ=255) aTCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATCTCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATGGCAACTATCTGACTGATGGCGTAATGCCATaa > 1:29843/1‑288 (MQ=255) aTCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATCTCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATGGCAACTATCTGACTGATGGCGTAATGCCATaa > 1:1427170/1‑288 (MQ=255) gATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATCTCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATGGCAACTATct < 2:1879785/261‑1 (MQ=255) cGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATCTCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATGGCAACTATCTGACTGATGGCGTAATGCCATAAACAAAAAGGaa > 1:1131147/1‑289 (MQ=255) ttGAAGATCCGCTGCGGGGTTTTGGTTCGTTTTGGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATCTCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATGGCAACTATCTGACTGATGGCGTAATGCCATAAACAAAAAGGAAacg < 2:1671954/289‑1 (MQ=255) tCCGCTGCTGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATCTCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATGGCAACTATCTGACTGATGGCGTAATGCCATAAACAAAAAGGAAACGACGAt < 1:1184549/287‑1 (MQ=255) ccggggCGTGTTATTGGTTTGTTTGTGATGGTGTCTATGGTAACGGGGGTTATTGTGGGTGAGATGAATATCGGCCTTTCGTCAGCCGGTGCCGGCATTTTTCCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATCTCGACTGGAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATGGCAACTATCTGACTGATGGCGTAATGCCATAAACAAAAAGGAAACGACGATGa < 2:903700/283‑1 (MQ=255) cTGCGGGTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATCTCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATGGCAACTATCTGACTGATGGCGTAATGCCATAAACAAAAAGGAAACGACGATGAAAGc > 1:1037660/1‑289 (MQ=255) ggTTATTGGTTCGTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATCTCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATGGCAACTATCTGACTGATTGCGTAATGCCATAAACAAAAAGGAAAAGAACAAGAAAACAggca > 2:1563868/1‑286 (MQ=255) ggttcgtttGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATCTCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATGGCAACTATCTGACTGATGGCGTAATGCCATAAACAAAAAGGAAACGACGATGAAAGCAGTATCTCGCGt < 2:1131147/283‑1 (MQ=255) ttcgtttGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATCTCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATGGCAACTATCTGACTGATGGCGTAATGCCATAAACAAAAAGGAAACGACGATGAAAGCAGTATCTCGCGtt < 2:436331/284‑1 (MQ=255) tcgtttGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCGATCTCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCTCGCGGTTAAGCATGGCAACTATCTGACTGATGGCGTAATGCCATAAACAAAAAGGAAACGACCAAGCAATCACGATCTCGCGCTc > 2:1640689/4‑288 (MQ=255) cgtttGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATCTCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTa > 1:1815248/3‑210 (MQ=255) cgtttGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATCTCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATGGCAACTATCTGACTGATGGCGTAATGCCATAAACAAAAAGGAAACGACGATTAAAGc > 2:1028293/3‑273 (MQ=255) cgtttGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATCTCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATGGCAACTATCTGACTGATGGCGTAATGCCATAAACAAAAAGGAAACGACGATGAAAGc < 1:1028293/271‑1 (MQ=255) gtttGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATCTCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATGGCAACTATCTGACTGATGGCGTAATGCCATAAACAAAAAGGAAACGACGATGAAAGCAGTATCTCGCGTTcaca < 1:1692694/288‑1 (MQ=255) gtttGTGCGGGGCTCTATGGTGACGGGGGCTATTGTCGGTGCGAGGAATATCGGCCTTTCCACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGGTTTGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATCTCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATGGCAACTATCTGACTGATGGCGTAATGCCATAAACAAAAAGGAAACGACGATGAAAGCAGTATCTCGCGTTcaca < 2:683171/288‑1 (MQ=255) gCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATCTCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATGGCAACTATCTGACTGATGGCGTAATGCCATAAACAAAAAGGAAACGACGATGAAAGCAGTATCTCGCGTTCACATCAccc < 1:1392901/289‑1 (MQ=255) cTGTGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGGTCGATGAATAGCGGCCTGTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATCTCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATGGCAACTATCTGACTGATGGCGTAATGCCATAAACAAAAAGGAAACGACGATGAAAGCAGTATCTCGCGTTCACATCAccc < 2:1162816/288‑1 (MQ=255) gCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATCTCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATGGCAACTATctgactga < 2:1243211/220‑1 (MQ=255) gCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATCTCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATGGCAACTATCTGACTGATGGCGTAATGCCATAAACAAAAAGGAAACGACGATGAAAGCAGTATCTCGCGTTCACATCACCCCGCat > 1:1147978/1‑289 (MQ=255) tctctgggaagcggCGCTTTTGTCGGTTGTAGTAATTTCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATCTCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATGGCAACTATCTGACTGATGGCGTAATGCCATAAACAAAAAGGAAACGACGATGAAAGCAGTATCTCGCGTTCACATCACCCCGCata < 2:1601965/276‑1 (MQ=255) aggggaccGGGGGCTATGTTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGAAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATCTCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATGGCAACTATCTGACTGATGGCGTAATGCCATAAACAAAAAGGAAACGACGATGAAAGCAGTATCTCGCGTTCACATCACCCCGCATATGCa < 2:1886773/282‑1 (MQ=255) aTGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATCTCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATGGCAACTATCTGACTGATGGCGTAATGCCATAAACAAAAAGGAAACGACGATGAAAGCAGTATCTCGCGTTCACATCACCCCGCATATGCa < 1:1750976/289‑1 (MQ=255) ggTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATCTCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATGGCAACTATCTGACTGATGGCGTAATGCCATAAACAAAAAGGAAACGACGATGAAAGCAGTATCTCGCGTTCACATCACCCCGCATATGCACt < 1:1897784/289‑1 (MQ=255) gTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGAGGAATATCGGCCTGTCGACGCCCGTTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGGGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATCTCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATGGCAACTATCTGACTGATGGCGTAATGCCATAAACAAAAAGGAAACGACGATGAAAGCAGTATCTCGCGTTCACATCACCCCGCATATGCACt < 1:280822/288‑1 (MQ=255) tAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATCTCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCgg < 1:1674704/186‑1 (MQ=255) tAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATCTCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATGGCAACTATCTGACTGATGGCGTAATGCCATAAACAAAAAGGAAACGACGATGAAAGCAGTAtct < 1:25764/259‑1 (MQ=255) tAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATCTCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATGGCAACTATCTGACTGATGGCGGAATGCCATAAACAAAAAGGAAACGACGATGAAAGCAGTATCTCGCGTCTACATCACCCCGCataatgcctgg > 2:609989/1‑281 (MQ=255) ggCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATCTCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATGGCAACTATCTGACTGATGGCGTAATGCCATAAACAAAAAGGAAacg > 2:1348819/1‑236 (MQ=255) ggCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATCTCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATGGCAACTATCTGACTGATGGCGTAATGCCATAAACAAAAAGGAAacg < 1:1348819/236‑1 (MQ=255) ggCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATCTCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATGGCAACTATCTGACTGATGGCGTAATGCCATAAACAAAAAGGAAACGACGATGAAAGCAGTATCTCGCGTTCACATCACCCCGCATATGCACTGGGATCg > 1:1911405/1‑289 (MQ=255) tgcTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGGCGGCATGTTATCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATCTCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATGGCAACTATCTGACTGATGGCGTAATGCCATAAACAAAAAGGAAACGACGATGAAAGCAGTATCTCGCGTTCACATCACCCCGCATATGCACTGGGATCga < 1:904327/287‑1 (MQ=255) tATTGTCGGTGCGATGAATAGCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAGTGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATCTCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATGGCAACTATCTGACTGATGGCGTAATGCCATAAACAAAAAGGAAACGACGATGAAAGCAGTATCTCGCGTTCACATCACCCCGCATATGCACTGGGATCGAGAGt < 1:764811/289‑1 (MQ=255) ttGTCGGTGGCGTGAGTATCGGCCTTTCGGAACCCGGTGCCTGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAAGGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATCTCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATGGCAACTATCTGACTGATGGCGTAATGCCATAAACAAAAAGGAAACGACGATGAAAGCAGTATCTCGCGTTCACATCACCCCGCATATGCACTGGGATCGAGAGTgg < 2:1202813/289‑1 (MQ=255) tCGGTGCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATCTCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATGGCAACTATCTGACTGATGGCGTAATGCCATAAACAAAAAGGAAACGACGATGAAAGCa < 2:474411/238‑1 (MQ=255) gCGATGAATATCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATCTCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATGGCAACTATCTGACTGATGGCGTAATGCCATAAACAAAAAGGAAACGACGATGAAAGCAGTATCTCGCGTTCACATCACCCCGCATATGCACTGGGCTCGAGAGTGGTATTTca > 1:1000882/1‑288 (MQ=255) atCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCTGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATCTCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATGGCAACTATCTGACTGATGGCGTAATGCCATAAACAAAAAGGAAACGACGATGAAAGCAGTATCTCGCGTTCACATCACCCCGCTTATGCACTGGGATCGAGAGTGGTATTTCACCACCGAaga < 2:584990/289‑1 (MQ=255) atCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATCTCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATGGCAACTATCTGACTGATGGCGTAATGCCATAAACAAAAAGGAAACGACGAt < 2:1412308/217‑1 (MQ=255) atCGGCCTTTCGACACCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATCTCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATGGCAACTATCTGACTGATGGCGTAATGCCATAAACAAAAAGGAAACGACGATGAAAGCAGTATCTCGCGTTCACATCACCCCGCATATTCACTGGGAACGAGAGTGGTATTTCAACACCCaaaa > 2:1489242/1‑287 (MQ=255) ggcctttcgacacCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATCTCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATGGCAACTATCTGACTGATGGCGTAATGCCATAAACAAAAAGGAAACGACGATGAAAGCAGTATCTCGCGTTCACATCACCCCGCATATGCACTGGGATCGAGAGTGGTATTTCACCACCGAagagtc < 1:1744660/280‑3 (MQ=255) tcgacacCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGATGCAATCTCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATGGCAACTATCTGACTGATGGCGTAATGCCATAAACAAAAAGGAAACGACGATGAAAGCAGTATCTCGCGTTCACATCAACCCGCATATGCACTGGGATCGAGAGTGGTATTTCACCAACGAacaggccagtaa > 2:276086/4‑281 (MQ=255) cgacacCCGGTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATCTCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATGGCAACTATCTGACTGATGGCGTAATGCCATAAACAAAAAGGAAACGACGATGAAAGCAGTATCTCGCGTTCACATCACCCCGCATATGCACTGGGATCGAGAGTAGTATTTCACCACCGAAGAGTCACGTAtt < 1:15768/287‑1 (MQ=255) cacCCGGGGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATCTCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATGGCAACTATCTGACTGATGGCGTAATGCCATAAACAAAAAGGAAACGACGATGAAAGCAGTATCTCGCGTTCACATCACCCCGCATATGCACTGGGATCGAGAGTGGTATTTCACCACCGAAGAGTCACGTATTctg < 2:530129/289‑1 (MQ=255) ccGGTGCGGGCGTGTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTAGGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATCTCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATGGCAACTATCTGACTGATGGCGTAATGCCATAAACAAAAAGGAAACGACGATGAAAGCAGTATCTCGCGTTCACATCACCCCGCATATGCACTGGGATCGAGAGTGGTATTTCACCACCGAAGAGTCACGTATTctgctg < 2:1044573/289‑1 (MQ=255) ggTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATCTCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATGGCAACTATCTGACTGATGGCGTAATGCCATAAACAAAAAGGAAACGACGATGAAAGCAGTATCTCGCGTTCACATCACCCCGCATATGCACTGGGATCGAGAGTGGTATTTCACCACCGAAGAGTCACGTATTCTGCTgg > 1:406294/1‑288 (MQ=255) gTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATCTCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATGGCAACTATCTGACTGATGGCGTAATGCCATAAACAAAAAGGAAACGACGATGAAAGCAGTATCTCGCGTTCACATCACCCCGCATATGCACTGGGATCGAGAGTGGTATTTCACCACCGAAGAGTCACGTATTCTGCTGGTc > 1:1324071/1‑289 (MQ=255) gTGCCGGCATTTTCTCGCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATCTCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATGGCAACTATCTGACTGATGGCGTAATGCCATAAACAAAAAGGAAACGACGATGAAAGCAGTATCTCGCGTTCACATCACCCCGCATATGCACTGGGATCGAGAGTGGTATTTCACCACCGAAGAGTCACGTATTCTGCTGGTc > 1:337409/1‑289 (MQ=255) ccGGCATTTTTTCGCTCTTTTTACTTAAGGATAATGGGGCGGGGGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATCTCGACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATGGCAACTATCTGACTGATGGCGTAATGCCATAAACAAAAAGGAAACGACGATGAAAGCAGTATCTCGCGTTCACATCACCCCGCATATGCACTGGGATCGAGAGTGGTATTTCACCACCGAAGAGTCACGTATTCTGCTGGTCaa < 2:756227/288‑1 (MQ=255) ||| GGCCCGTATGCCATTTTCGCCTCCGTCAAAATGGTTAGCGCATTTACCGTAACCGCTTCCACGATGCTCGCACCGCGCCTGTTTAAAGAGTTTGAAATTGAGACCGGGAAATCCACCTGGCTGTTAGGGCTGGCAGGTATTACCGAAGGGGCGATCCCGATGGCGATTGAAGATCCGCTGCGGGTTATTGGTAGCTTTGTGCTGGGCTCTATGGTAACGGGCGCTATTGTCGGTGCGATGAATATCGGCCTTAGCACACCCGGTGCCGGCATTTTCAGCCTCTTTTTACTTCATGATAATGGCGCGGGCGGTGTTATGGCGGCAATTGGCTGGTTTGGCGCGGCATTGGTGGGGGCTGCAATCAGCACTGCAATTCTCCTGATGTGGCGGCGTCACGCGGTTAAGCATGGCAACTATCTGACTGATGGCGTAATGCCATAAACAAAAAGGAAACGACGATGAAAGCAGTATCTCGCGTTCACATCACCCCGCATATGCACTGGGATCGAGAGTGGTATTTCACCACCGAAGAGAGTCGTATTCTGCTGGTCAA > CP042583/630354‑630906 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |