Predicted mutation | ||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP042583 | 654,625 | 0 | T | A | 98.7% | 728.9 / NA | 317 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/0); major base A (137/174); minor base C (2/2); total (140/177) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 317 total aligned reads displayed.
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atatTCCAGCGGTTTTTGTACCGATTCGCCCACGGCTTTCAGCCCGGCGAAGTGGATCACGGTGTCGATAGCGTGATCGTGCAGGATCTCGGTCATCAACGCTTCGTTACGAATATCGCCTTCAACAAACGTTGGATGTTTGCCGCCTAAACGCTCGATAACAGGCAGTACGCTGCGCTTACTGTTACAGAGGTTATCAAGAATGATGACATCATGACCGTTTTGCAGTAATTGCACACAGGTATGACTTCCAATGTAACCGCTACCACCGGTACCACGAACTACCATa > 2:1607066/1‑289 (MQ=255) ccAGCGGTTTTTGTACCGATTCGCCCCCGGCTTTCAGCCCGGCGAAGTGGATCACGGTGTCGATAGCGTGATCGTGCAGGATCTCGGTCATCAACGCTTCGTTACGAATATCGCCTTCAACAAACGTTGGATGTTTGCCGCCTAAACGCTCGATAACAGGCAGTACGCTGCGCTTACTGTTACAGAGGTTATCAAGAATGATGACATCATGACCGTTTTGCAGTAATTGCACACAGGTATGACTTCCAATGTAACCGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCg < 2:127553/289‑1 (MQ=255) tttttGTACCGATTCGCCCACGGCTTTCAGCCCGGCGAAGTGGATCACGGTGTCGATAGCGTTATCGTGCAGGATCTCGGTCATCAACGCTTCGTTACGAATATCGCCTTCAACAAACGTTGGATGTTTGCCGCCTAAACGCTCGATAACAGGCAGTACGCTGCGCTTACTGTTACAGAGGTTATCAAGAATGATGACATCATGACCGTTTTGCAGTAATTGCACACAGGTATGACTTCCAATGTAACCGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCAt < 1:926989/288‑1 (MQ=255) ||| CCAACCGGGTTGAAGTAGCGCAGCAGGGCAATGCTCCAGTCCGGCTGGGCTTTTTGCAGATCGGTGAGGATCTGTTCCACCATCAGCTTGCTTTTGCCGTAAGGGCTTTGCGGTGTGCCGGTCGGGAAGCTTTCAACGTATGGAATTTTGGGCTGATCGCCATAAACGGTGGCGGAGGAGCTAAAAATAAAGTTTTTGACGTTAGCGGCGCGCATGGCGCTAATCAGGCGCAGAGTGCCGTTGACATTGTTGTCGTAATATTCCAGCGGTTTTTGTACGCTTTCGCCCACGGCTTTCAGCCCGGCGAAGTGGATCACGGTGTCGATAGCGTGATCGTGCAGGATCTCGGTCATCAACGCTTCGTTACGAATATCGCCTTCAACAAACGTTGGATGTTTGCCGCCTAAACGCTCGATAACAGGCAGTACGCTGCGCTTACTGTTACAGAGGTTATCAAGAATGATGACATCATGACCGTTTTGCAGTAATTGCACACAGGTATGACTTCCAATGTAACCGCTACCACCGGTAACCAGAACTCTCATAATTCGCTCCATTA > CP042583/654345‑654903 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |