| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP042583 | = 2777593 | 267 (1.030) | 3 (0.010) | 3/526 | 22.3 | 1.00% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| ? | CP042583 | 2777909 = | 337 (1.350) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 271 total aligned reads displayed.
GCCCGAAAGATGAGTGTGAAACCTGCTGCATTAAGTATCCGAACGGGCGCAACGTGCTGTCGCAGGAAAACCAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGCACCACTGCCGTTGACGGCGAACAGCGACTGTAACGGCTACTGGCGGCGGCTGGCAGGACTGGAGCTGCAAGCCTAAGTAAATAGCTCACTTTGTTAACAACTTTAACTACTCTTTAATGCAGTATTAAAGATTAATCGGTAACAAAGTGAGCTGTTATGACTGATAAAACCATTGCGTTTTCGCTACTCGATCTGGCCCCCATTCCCGAAGGTTCTTCAGCGCGAGAAGCATTCTCCCACTCTCTCGATCTCGCCCGTCTGGCTGAAAAGCGCGGCTATCATCGCTACTGGCTGGCAGAACACCACAATATGACTGGCATTGCCAGTGCTGC > CP042583/2777305‑2777877 | aaGATTGGTGGGAAACCTGCTGCATTAAGGATCCGACGGGGGGGAACGTGCTGTCGCAGGAAAACCAACAAGGGTTTGTACTCAATGGCATTCAGGCCATGAGCGGCTACGTTTACGACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGCACCACTGCCGTTGACGGCGAACAGCGACTGTAACGGCTACTGGCGGCGGCTgg < 2:1704817/288‑1 (MQ=255) aGTGTGAAACCTGCTGCATTAAGTATCCGAACGGGCGCAACGTGCTGTCGCAGGAAAACCAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTTGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCTCGACGCCTTCCGCGCTCATGAAAATGGCGCTGCACCACTGCCGTTGACGGTCGACAGCGACTGTAACGGCACCTggcggcggcggtgcggacg > 2:1189969/1‑279 (MQ=255) tgAAACCTGCTGCATTAAGTATCCGAACGGGCGCAACGTGCTGTCGCAGGAAAACCAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACGTGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCCCGATGCTCGACGCCTTCCGCCCTCATGAAAATGGCGCTGCACCACTGCCGTTGCCGGCGAACGGCGACTGTAACGGCTACAGGCGGCGGCTGGCTGGCCTggg > 2:171422/1‑287 (MQ=255) aaaCCTGCTGCATTAAGTATCCGAACGGGCGCAACGTGCTGTCGCAGGAAAACCAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGCACCACTGCCGTTGACGGCGAACAGCGACTGTAACGGCTACTGGCGGCGGCTGGCAGGACTGGa > 2:1062340/1‑286 (MQ=255) aaCCTGCTGCATTAAGTATCCGAACGGGCGCAACGTGCTGTCGCAGGAAAACCAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGCACCACTGCCGTTGACGGCGAACAGCGACTGTAACGGCTACTGGCGGCGGCTGGCAGGACTGGAGCt > 2:439160/1‑288 (MQ=255) aCCTGCTGCATTAAGTATCCGAACGGGCGCAACGTGCTGTCGCAGGAAAACCAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGCACCACTGCCGTTGACGGCGAACAGCGACTGTAACGGCTACTGGCGGCGGCTGGCAGGACTGGAGCTGc < 1:603628/289‑1 (MQ=255) tgctgcATTAAGTATCCGAACGGGCGCAACGTGCTGTCGCAGGAAAACCAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGCACCACTGCCGTTGACGGCGAACAGCGACTGTAACGGCTACTGGCGGCGGCTGGCAGGACTGGAGCTGCAAg < 1:181576/289‑1 (MQ=255) tgctgcATTAAGTATCCGAACGGGCGCAACGTGCTGTCGCAGGAAAACCAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGCACCACTGCCGTTGACGGCGAACAGCGACTGTAACGGCTACTGGCGGCGGCTGGCAGGACTGGAGCTGCAAg < 1:173385/289‑1 (MQ=255) tgccgcATTAAGTATCCGAACGGGCGCACCGTACTGTCGCAGGAAAACCAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGTTACTGACACTTTCGCGATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGCACCACTGCCGTTGACGGCGAACAGCGACTGTAACGGCTACTGGCGGCGGCTGGCAGGACTGGAGCTGCAAg < 1:1802197/289‑1 (MQ=255) gtctgcATTAAGTATCCGAACCGGGGCAACGGGCTGTGGCAGGAAAACCAACAAGTGTTTGTACTAAATGGCAGTCAGACCATGAGCGGGTACGTTTACAACCTCGGTAACGGGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCGGGGTACTGACACTTTCGCGATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGCACCACTGCCGTTGACGGCGAACAGCGACTGTAACGGCTACTGGCGGCGGCTGGCAGGACTGGAGCTGCAAg < 2:1621650/287‑1 (MQ=255) gttgcATTAAGTATCCGAACGGGCGCAACGTGCTGTCGCAGGAAAACCAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGCACCACTGCCGTTGACGGCGAACAGCGACTGTAACGGCTACTGGCGGCGGCTGGCAGGACTGGAGCTGCAAg > 1:259391/3‑288 (MQ=255) gctgcATTAAGTATCCGAACGGGCGCAACGTGCTGTCGCAGGAAAACCAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGCACCACTGCCGTTGACGGCGAACAGCGACTGTAACGGCTACTGGCGGCGGCTGGCAGGACTGGAGCTg < 2:464561/284‑1 (MQ=255) gctgcATTAAGTATCCGAACGGGCGCAACGTGCTGTCGCAGGAAAACCAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGCACCACTGCCGTTGACGGCGAACAGCGACTGTAACGGCTACTGGCGGCGGCTGGCAGGACTGGAGCTGCAAg > 1:1836842/1‑288 (MQ=255) 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ttAAGGATCCGAGCGGGAGCAACGTGCTGTCGCAGGAAAACCAACAGGTGTTTGTACTCAATGGCATTCGGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACGGGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGCACCACTGCCGTTGACGGCGAACAGCGACTGTAACGGCTACTGGCGGCGGCTGGCAGGACTGGAGCTGCAAGCCTAAGt < 2:507482/289‑1 (MQ=255) tATCCGAACGGGCGCAACGTGCTGTCGCAGGAAAACCAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGCACCACTGCCGTTGACGGCGAACAGCGACTGTAACGGCTACTGGCGGCGGCTGGCAGGACTGGGGCTGCAAGCCTAAGTAAATa > 2:589340/1‑289 (MQ=255) ccGAACGGGCGCAACGTGCTGTCGCAGGAAAACCAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGCACCACTGCCGTTGACGTCGAACAGCGACTGTAACGGCTACTGGCGGCGGCTGGCCGGACCGGGGCTGCAAGCCTAAGGAAATAGc > 2:1277052/1‑288 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |