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Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
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Only 100 of 255 total aligned reads displayed.
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tGGGGTAAAATCAATGGAT‑GAATTTGTGACGTTGTTCATGTTTATGCCAAAGTC‑TGATTCGTTA‑CACAGCACCGATTCCATGCAATTATTCGTGCCTTGTTCCAG‑AATCCGCACTTTAATATTGGGATACAGCTCATTAAATTTACCGATTGCCAGCGGTAAAAAATAAAATACTGCGGTCGGAATACACGCTAACGTCACCATACCACGATGATAAGCATTCATATCACGAATATTAAAAAGCGTTTCATCGAATTTCTTTATTAATTCCCGCGCCTCCGGGAGCaa > 1:583304/1‑288 (MQ=255) tCAATGGAT‑GAATTTGTGACGTTGTTCATGTTTATGCCAAAGTC‑TGATTCGTTA‑CACAGCACCGATTCCATGCAATTATTCGTGCCTTGTTCCAG‑CATCCGCACTTTAATATTGGGATACAGCTCATTAAATTTACCGATTGCCAGCGGTAAAAAATAAAATACTGCGGTCGGAATACACGCTAACGTCACCATACCACGATGATAAGCATTCATATCACGCATATTAAAAAGCGTTTCATCGAATTTCTTTATTAATTCCCGCCCCTCCGTAATCAACCTTTTTCCt > 1:1539652/1‑288 (MQ=255) tCAATGGAT‑GAATTTGTGACGTTGTTCATGTTTATGCCAAAGTC‑TGATTCGTTA‑CACAGCACCGATTCCATGCAATTATTCGTGCCTTGTTCCAG‑AATCCGCACTTTAATATTGGGATACAGCTCATTAAATTTACCGATTGCCAGCGGTAAAAAATAAAATACTGCGGTCGGAATACACGCTaa < 2:611113/185‑1 (MQ=255) tCAATGGAT‑GAATTTGTGACGTTGTTCATGTTTATGCCAAAGTC‑TGATTCGTTA‑CACAGCACCGATTCCATGCAATTATTCGTGCCTTGTTCCAG‑AATCCGCACTTTAATATTGGGATACAGCTCATTAAATTTACCGATTGCCAGCGGTAAAAAATAAAATACTGCGGTCGGAATACACGCTAACGTCACCATACCACgatgat < 1:1670071/205‑1 (MQ=255) tCAATGGAT‑GAATTTGTGACGTTGTTCATGTTTATGCCAAAGTC‑TGATTCGTTA‑CACAGCACCGATTCCATGCAATTATTCGTGCCTTGTTCCAG‑AATCAGCACTTTAATATTGGGATACAGCTCATTAAATTTACCGATTGCCAGCGGTAAAAAATAAAATACTGCGGTCGGAATACACGCTAACGTCACCATACCACGATGATAAGCATTCATATCACGAATATTAAAAAGCGTTTCATCGAATTTCTTTATTAATTCCCGCCCCTCCGGGAGCAACCTTTTTCCt > 1:875875/1‑288 (MQ=255) |||| GAGGCATTGCCAGGCCAGGAAGCGCGCTAATCCCCAGTCCCGCCTCCACCAGTCCTAAACTCGTGCTAAGATGACGCACTTCGTAAAACCAGTCCAGCTTCCAGGGCTTGTCGGCCAGCTGTTGTTCTATCAACAGTCGGTTGCCGCTGGAGGAGCGTACGCCAATCATTTTGTAACCCACTAACTCCTGCCATTCTACAAGCTGCTTTTTGGCCAATGGATGGTCACGCCGACAGGCCAGCACGAACGGCTCGTTGACCAGTGGGGTAAAATCAATGGAA‑CTATTTGTGACGTTGTTCATGTTTATGCCAAAGTC‑ACTTTCGTTA‑CACAGCACGCTTTCCATGCAATTATTCGTGCCTTGTTCCAG‑AATCCGCACTTTAATATTGGGATACAGCTCATTAAATTTACCGATTGCCAGCGGTAAAAAATAAAATACTGCGGTCGGAATACACGCTAACGTCACCATACCACGATGATAAGCATTCATATCACGAATATTAAAAAGCGTTTCATCGAATTTCTTTATTAATTCCCGCGCCTCCGGGAGCAACCTTTTTCCTGC > CP042583/662665‑663226 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |