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Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
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gTTTATGCCAAAGTCTGATTCGTTA‑CACAGCACCGATTCCATGCAATTATTCGTGCCTTGTTCCAG‑AATCCGCACTTTAATATTGGGATACAGCTCATTAAATTTACCGATTGCCAGCGGTAAAAAATAAAATACTGCGGTCGGAATACACGCTAACGTCACCATACCACGATGATAAGCATTCATATCACGAATATTAAAAAGCGTTTCATCGAATTTCTTTATTAATTCCCGCGCCTC‑CGGGAGCAACCTTTTTCCTGCTTTTGTTAACGTAACCTTGCGAGTTGTa < 2:1582925/289‑1 (MQ=255) tctGCCAAAGTCTGATTCGTTA‑CACAGCACCGATTCCATGCAATTATTCGTGCCTTGTTCCAG‑AATCCGCACTTTAATATTGGGATACAGCTCATTAAATTTACCGATTGCCAGCGGTAAAAAATAAAATACTGCGGTCGGAATACACGCTAACGTCACCATACCACGATGATAAGCATTCATATCACGAATATTAAAAAGCGTTTCATCGAATTTCTTTATTAATTCCCGCGCCTC‑CGGGAGCAACCTTTTTCCTGCTTTTGTTAACGTAACCTTGCGAGTTGTACg > 1:1309017/3‑288 (MQ=255) tGCCAAAGTCTGATTCGTTA‑CACAGCACCGATTCCATGCAATTATTCGTGCCTTGTTCCAG‑AATCCGCACTTTAATATTGGGATACAGCTCATTAAATTTACCGATTGCCAGCGGTAAAAAATAAAATACTGCGGTCGGAATACACGCt < 1:834296/149‑1 (MQ=255) tGCCAAAGTCTGATTCGTTA‑CACAGCACCGATTCCATGCAATTATTCGTGCCTTGTTCCAG‑AATCCGCACTTTAATATTGGGATACAGCTCATTAAATTTACCGATTGCCAGCGGTAAAAAATAAAATACTGCGGTCGGAATACACGCt > 2:834296/1‑149 (MQ=255) gCCAAAGTCTGATTCGTTA‑CACAGCACCGATTCCATGCAATTATTCGTGCCTTGTTCCAG‑AATCCGCACTTTAATATTGGGATACAGCTCATTAAATTTACCGATTGCCAGCGGTAAAAAATAAAATACTGCGGTCGGAATACACGCTAACGTCACCATACCACGATGATAAGCATTCATATCACGAATATTAAAAAGCGTTTCATCGAATTTCTTTATTAATTCCCGCGCCTC‑CGGGAGCAACCTTTTTCCTGCTTTTGTTAACGTAACCTTGCGAGTTGTACGCTCa < 2:1562312/289‑1 (MQ=255) ||| CCGCCTCCACCAGTCCTAAACTCGTGCTAAGATGACGCACTTCGTAAAACCAGTCCAGCTTCCAGGGCTTGTCGGCCAGCTGTTGTTCTATCAACAGTCGGTTGCCGCTGGAGGAGCGTACGCCAATCATTTTGTAACCCACTAACTCCTGCCATTCTACAAGCTGCTTTTTGGCCAATGGATGGTCACGCCGACAGGCCAGCACGAACGGCTCGTTGACCAGTGGGGTAAAATCAATGGAA‑CTATTTGT‑GACGTTGTTCATGTTTATGCCAAAGTCACTTTCGTTA‑CACAGCACGCTTTCCATGCAATTATTCGTGCCTTGTTCCAG‑AATCCGCACTTTAATATTGGGATACAGCTCATTAAATTTACCGATTGCCAGCGGTAAAAAATAAAATACTGCGGTCGGAATACACGCTAACGTCACCATACCACGATGATAAGCATTCATATCACGAATATTAAAAAGCGTTTCATCGAATTTCTTTATTAATTCCCGCGCCTC‑CGGGAGCAACCTTTTTCCTGCTTTTGTTAACGTAACCTTGCGAGTTGTACGCTCAA > CP042583/662704‑663261 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |