Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 699,923 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 699,923 | 0 | A | T | 99.1% | 495.3 / NA | 212 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); major base T (99/110); minor base G (1/1); total (101/111) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 699,924 | 0 | G | C | 98.6% | 480.1 / NA | 212 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (3/0); new base C (98/110); total (101/111) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.08e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 699,925 | 0 | C | G | 99.5% | 489.1 / NA | 212 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base G (100/111); total (101/111) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.76e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 212 total aligned reads displayed.
GCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGCGTGGTCGGTATTCCAATGGTCGCGCCGTTCCACGGTCGCGACAGCCGCTTTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGAGCCCGTTGGGTAGCCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGAAATTCTTGGCGGGGCGCTTTCCGGCGGTAAAACGACGCATCAGGAAACGTTACAAACCAGTCCCGATGCCATTCTTAACTGCATGACCACTATCATCATCAACCCGGAACTCTTCGGCGCGCCGGATTGTAACGCGCAGACCGAAGCCTTTGCCGAGTGGGTGAAAGCCAGCCCGCATGATGATGATAAGCCGATTTTGCTACCGGGCGAGTGGGAAGTGAACACGCG > CP042583/699644‑700203 ||| cggGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGCGTGGTCGGTATTCCAATGGTCGCGCCGTTCCACGGTCGCGACAGCCGCTTTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGa > 1:1659859/1‑288 (MQ=255) cggGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGCGTGGTCGGTATTCCAATGGTCGCGCCGTTCCACGGTCGCGACAGCCGCTTTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCGACGACCAATCCGGCGGGAATGCCGGCGTCGCCGTTGGGTTGGCTGTTGa > 2:1306429/1‑288 (MQ=255) ggggTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGCGTGGTCGGTATTCCAATGGTCGCGCCGTTCCACGGTCGCGACAGCCGCTTTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGAc < 1:1591358/288‑1 (MQ=255) gggTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGCGTGGTCGGTATTCCAATGGTCGCGCCGTTCCACGGTCGCGACAGCCGCTTTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCCGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCCGGAGTCCCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCt > 1:1584758/1‑289 (MQ=255) gggTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGCGTGGTCGGTATTCCAATGGTCGCGCCGTTCCACGGTCGCGACAGCCGCTTTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCt > 1:1705616/1‑289 (MQ=255) gggTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGCGTGGTCGGTATTCCAATGGTCGCGCCGTTCCACGGTCGCGACAGCCGCTTTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCt > 1:1650880/1‑289 (MQ=255) ggTTTGCCTCTATCCCTTTTGTTGGCGTGGTCGGTATTCCAAGGGTCGGGCCGTTCCACGGTCGCGACAGCCGCTTTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATGATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCt < 2:227583/288‑1 (MQ=255) tGTTTCTTTCCACTTTGTTGGCGTGGTCGGTATTCCAATGGTCGCGCCGTTCCACGGTCGCGACAGCCGCTTTTGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGcc < 2:969945/289‑1 (MQ=255) gTCTCTGTCCACTTTGTTAGCGTGGTCGGTATTCCATTGGTCGCGCCGTTCCACGGTCGCGACAGCCGCTTTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCg < 1:1905191/289‑1 (MQ=255) gTCTCTATCCACTTTGTTAGCGTGGTCGGTATTCCAATGGTCGCGCCGTTCCACGGTCGCGACAGCCGCTTTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCg < 1:549194/289‑1 (MQ=255) tATCCACTTTGTTAGCGTGGTCGGTATTCCAATGGTCGCGCCGTTCCACGGTCGCGACAGCCGCTTTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACAt > 2:456364/1‑289 (MQ=255) tATCCACTTTGTTAGCGTGGTCGGTATTCCAATGGTCGCGCCGTTCCACGGTCGCGACAGCCGCTTTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGGCGCCGTTTGGTTGGCTTTTGTCCTTTGCCGAACAt > 2:846443/1‑289 (MQ=255) ttCCACTTTTTTAGCGTGGTCGGTATTCCAATGGTCGCGCCGTTCCACGGTCGCGACAGCCGCTTTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATa < 1:97149/288‑1 (MQ=255) aTCCTCTTTTTTCGCGTGGTCGGTACTCCTATGGTCGCGCCGTTCCACTGTCGCGACAGCCTCTTTGGCACCAATCCTTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTTTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATa < 1:895008/289‑1 (MQ=255) aTCCACTTTGTTCGCGTGATCGGTCTTCCAATGGTCGCGCCGTTCCACGGTCGCGACAGCCGCTTTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATa < 2:1705616/289‑1 (MQ=255) tCCACTTTGTTAGCGTGGTCGGTATTCCAATGGTCGCGCCGTTCCACGGTCGCGACAGCCGCTTTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATaa > 1:1198042/1‑289 (MQ=255) aCTTTGTTAGCGTGGTCGGTATTCCAATGGTCGCGCCGTTCCACGGTCGCGACAGCCGCTTTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAg > 2:812560/1‑288 (MQ=255) tttGTTAGCGTGGTCGGTATTCCAATGGTCGCGCCGTTCCACGGTCGCGACAGCCGCTTTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGAc < 2:668109/269‑1 (MQ=255) tttGTTAGCGTGGTCGGTATTCCAATGGTCGCGCCGTTCCACGGTCGCGACAGCCGCTTTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCt > 1:1257380/1‑289 (MQ=255) ttGTTAGCGTGGTCGGTATTCCAATGGTCGCGCCGTTCCACGGTCGCGACAGCCGCTTTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTa < 1:728834/289‑1 (MQ=255) tgttttacGTGGTGTGTAGTCCAATGTTCGCTCCTGTCCACGGTCGAGACAGCCGATTTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTACCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTa < 2:1187081/282‑1 (MQ=255) ttAGCGTGGTCGGTATTCCAATGGTCGCGCCGTTCCACGGTCGCGACAGCCGCTTTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGc < 2:1257380/289‑1 (MQ=255) ttAGCGTGGTCGGTATGCCAATGGTCGAGCCGTTCCACTGTCGCGACAGCCGCTTTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGc < 2:283337/289‑1 (MQ=255) tAGCGTGGTCGTGATGCCAATGGTGCCGCCGGTCCACGGTCGGGACAGCCGCTTTGGCACCAATCCGTTCGTGGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGGTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATGGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGc < 2:944957/288‑1 (MQ=255) tAGCGTGGTCGGTATTCCAATGGTCGCGCCGTTCCACGGTCGCGACAGCCGCTTTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGc > 1:1671554/1‑288 (MQ=255) gTCGGTATTCCAATGGTCGCGCCGTTCCACGGTCGCGACAGCCGCTTTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCa > 1:668842/1‑288 (MQ=255) gTCGGTATTCCAATGGTCGCGCCGTTCCACGGTCGCGACAGCCGCTTTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCCCCGTTGGGTACGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCCCCGCCCTTTCa > 2:1925371/1‑288 (MQ=255) cGGTATTCCAATGGTCGCGCCGTTCCACGGTCGCGACAGCCGCTTTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCg < 1:701300/289‑1 (MQ=255) cGGTATTCCAATGGGCGCGCCGTTCCACGGGCGCTACAGCCGC‑TTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTACCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCg < 1:1063413/288‑1 (MQ=255) aaTGGTCGCGCCGTTCCACGGTCGCGACAGCCGCTTTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCg > 1:14185/1‑254 (MQ=255) aaTGGTCGCGCCGTTCCACGGTCGCGACAGCCGCTTTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTTTGaa > 1:1847188/1‑289 (MQ=255) cgcgCCGTTCCACGGTCGCGACAGCCGCTTTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGAAATTCtt > 1:806668/1‑289 (MQ=255) gcgcCGTTCCACGGTCGCGACAGCCGCTTTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTTGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGAAATTCTTg > 1:1763387/1‑289 (MQ=255) ttCCACGGTCGCGACAGCCGCTTTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCg > 2:552627/1‑241 (MQ=255) tCCACGGTCGCGACAGCCGCTTTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGAAATTCTTGGCgggg < 1:651085/288‑1 (MQ=255) tCCACGGTCGCGACAGCCGCTTTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGAAATTCTTGGCgggg < 1:1489966/288‑1 (MQ=255) tCCACGGTCGCCACAGCCGCTTTGGCTCCAATCCGTGCTGTGTGGATTTCCCTCGTCAAGATACTTTCCCGCTGTTGCCTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCTTCTCCTGGCATAAAGGCCTCTCCGTGCCGCCCGGTTGCCTGTCAGACTCTCACGGCGTCTCGACAACCAATGCCCCGGTCATTCAGGAACCCCCGTTCGGCTCGTTGCCGACCTTTGCCGTAATTTACGGCGACTCCCCTGCGTCGCTGTGTGaactcgcttgcggcgc > 2:1707399/1‑275 (MQ=255) ggTCGCGACAGCCGCTTTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCg < 1:1322988/235‑1 (MQ=255) ggTCGCGACAGCCGCTTTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCg > 2:1322988/1‑235 (MQ=255) cgcgACAGCCGCTTTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGAAATTCTTGGCGGGGCGCTTTcc < 1:943494/288‑1 (MQ=255) gcgACAGCCGCTTTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGAAATTCTTGGCGGGGCGCTTTCcgg < 1:1925371/289‑1 (MQ=255) cgACAGCCGCTTTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGACCATAAAGGCTACGCCCTTGCCGCGAAGTGTGAAATTCTTGGCTGGGCGCTTTCcggc > 2:1635029/1‑289 (MQ=255) cagcagCTTGGGCCCCAGTCTGTTCTGTGGGGTTGCCCCGCGTAGAGATAATGTCCGCCTGTGGCTTGATTACGCCGACGGGGCCAGTGCATTTGGCAAAACCGGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGGTGCCTGATTGACGTTAACGGCGGGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGGGTCGCCGTTGGGTTCGCGGTGGACCTTTGCCGAACATACAGGATACGCCCTTGCAGCGAGGTGTGAAATTCTTGGCGGGGCGCTTTCCGGCGGt < 2:1693322/289‑1 (MQ=255) ccGCTTTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGAACTTCTTGGCGGGGCGCTTTCCGGCGGTaaa > 1:511187/1‑289 (MQ=255) ttGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGGTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACCCCCTTGCAGGGATGGTGGCAATTCCTGGCCGGGCGCTTTCCCGCGGtgacatgga > 2:1853152/1‑281 (MQ=255) cACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGAAATTCTTGGCGGGGCGCTTTCCGGCGGTAAAACGACGCa > 1:1832657/1‑288 (MQ=255) aTCCGTTCTGGGTGGTTTTCCCTCGTAAGGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAACCCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGAAATTCTTGGCGGGGCGCTTTCCGGCGGTAAAACGACGCATCAGGa < 2:781269/289‑1 (MQ=255) tCCGTTCTGTTGTGTTTTCCCTCGTAACGATTATTTCCCGCTATTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGAAATTCTTGGCGGGGCGCTTTCCGGCGGTAAAACGACGCATCAGGaa < 2:1832657/289‑1 (MQ=255) ccGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGAAATTCTTGGCGGGGCGCTTTCCGGCGGTAAAACGACGCATCAGGaaa < 1:884816/289‑1 (MQ=255) ccGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGAAATTCTTGGCGGGGCGCTTTCCGGCGGTAAAACGACGCATCAGGaaa < 1:1865553/289‑1 (MQ=255) ccGTTCTGGGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCGGTTGCTTGATTACGCCACCAGAGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGAAATTCTTGGCGGGGCGCTTTCCGGCGGTAAAACGACGCATCAGGaaa < 1:261933/289‑1 (MQ=255) cTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGAAATTCTTGGCGGGGCGCTTTCCGGCGGTAAAACGACGCATCAGGAAACGTTa < 1:703108/289‑1 (MQ=255) tgtgGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCTCTGCAGCCATGTCGTAAATTCTTGGCGGGCAGCTTTCCGCGGTTAAAACGACGCCTCAGTAAACGTTACaa > 2:1367361/1‑289 (MQ=255) tgtgGTGTTCCCTCGTAAAGATAATTACCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTCATTGACGTTTACGGCGTGCCGACGACCAATCCGGCGGGAATGCAGGAGTCGCCGGTGGGTTCGCTGGTGACTTTTGCCGAACATACGGGCTACGCCTTTGCAGCGATGGGTGAATTTCTTGACGGGGCGTTTTCCGGCGTTCACACGACGGCGCAGTAACCGTTACaa > 2:1414836/1‑289 (MQ=255) ggTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGAAATTCTTGGCGGGGCGCTTTCCGGCGGTAAAACGACGCATCAGGAAACGTTACAAAcc < 1:872348/289‑1 (MQ=255) ccTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGAAATTCTTGGCGGGGCGCTTTCCGGCGGTAAAACGACGCATCAGGAAACGTTACAAACCAGTCCCg > 1:242581/1‑289 (MQ=255) ccTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGAAATTCTTGGCGGGGCGCTTTCCGGCGGTAAAACGACGCATCAGGAAACGTTACAAACCAGTCCCg > 1:608689/1‑289 (MQ=255) cggaaaGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGGTTACGCCCCCAGCGGCATTGCAGTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGGCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGAAATTCTTGGCGGGGCGCTTTCCGGCGGTAAAACGACGCATCAGGAAACGTTACAAACCAGTCCCGATg < 1:916740/286‑1 (MQ=255) cGTAAGGATGATTTCCCGGTGGTGCTTTAGTACGCCAGCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAGCCCGCGTCGCGTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGAAATTCTTGGCGGGGCGCTTTCCGGCGGTAAAACGACGCATCAGGAAACGTTACAAACCAGTCCCGATg < 2:1099668/289‑1 (MQ=255) cGTAACGATAATTTCCCGCGTTTGCTTGATTACGCACCCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGAAATTCTTGGCGGGGCGCTTTCCGGCGGTAAAACGACGCATCAGGAAACGTTACAAACCAGTCCCGATg < 2:1508367/289‑1 (MQ=255) cGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGAAATTCTTGGCGGGGCGCTTTCCGGCGGTAAAACGACGCATCAGGAAACGTTACAAACCAGTCCCGATg < 1:3344/289‑1 (MQ=255) cGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTGGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGAAATTCTTGGCGGGGCGCTTTCCGGCGGTAAAACGACGCATCAGGAAACGTTACAAACCAGTCCCGATg < 2:625000/289‑1 (MQ=255) tAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCATCGATGTGTGAAATTCTTGGCGGGGCGCTTTCCGGCGGTAAACCGACGCATTAGGAAACGTTCCAAACCAGTCTCGATGc > 2:1589824/1‑288 (MQ=255) tAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGAAATTCTTGGCGGGGCGCTTTCCGGCGGTAAAACGACGCATCAGGAAACGTTACAAACCAGTCCCGATGcc > 1:115960/1‑289 (MQ=255) aTAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGAAATTCTTGGCGGGGCGCTTTCCGGCGGTAAAACGACGCATCAGGAAACGTTACAAACCAGTCCCGATg > 1:757414/1‑282 (MQ=255) aTAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGAAATTCTTGGCGGGGCGCTTTCCGGCGGTAAAACGACGCATCAGGAAACGTTACAAACCAGTCCCGATg < 2:757414/282‑1 (MQ=255) ccGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGCCGTTAACGGCGTGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGAAATTCTTGGCGGGGCGCTTTCCGGCGGTAAAACGACGCATCAGGAAACGTTACAAACCAGTCCCGATGCCATTCTTAACTGCa < 1:451010/289‑1 (MQ=255) tGTTGCTTGATTCCGCGACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGAAATTCTTGGCGGGGCGCTTTCCGGCGGTAAAACGACGCATCAGGAAACGTTACAAACCAGTCCCGATGCCATTCTTAACTGCATGAc < 1:1263711/289‑1 (MQ=255) aCGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGAAATTCTTGGCGGGGCCCTTTCCGGCGGTAAAACGACGCCTCAGGAAACGTTACAAACCCGTCCCGATGCCATTCTTAACCGCATCACCACTatccaca > 2:1017283/1‑284 (MQ=255) ccaccaGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGAAATTCTTGGCGGGGCGCTTTCCGGCGGTAAAACGACGCATCAGGAAACGTTACAAACCAGTCCCGATGCCATTCTTAACTGCATGa > 1:1946165/1‑273 (MQ=255) tGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGAAATTCTTGGCGGGGCGCTTTCCGGCGGTAAAACGACGCATCAGGAAACGTTACAAACCAGTCCCGATGCCATTCTTAACTGCATGACCACTATCATCATCAACCCGGAACTCTTCGgcgcg < 1:412774/289‑1 (MQ=255) tGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGAAATTCTTGGCGGGGCGCTTTCCGGCGGTAAAACGACGCATCAGGAAACGTTACAAACCAGTCCCGATGCCATTCTTAACTGCATGACCACTATCATCATCAACCCGGAACTCTTCGgcgcg < 1:770398/289‑1 (MQ=255) tGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGAAATTCTTGGCGGGGCGCTTTCCGGCGGTAAAACGACGCATCAGGAAACGTTACAAACCAGTCCCGATGCCATTCTTAACTGCATGACCACTATCATCATCAACCCGGAACTCTTCGgcgcg < 2:690916/289‑1 (MQ=255) tGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGAAATTCTTGGCGGGGCGCTTTCCGGCGGTAAAACGACGCATCAGGAAACGTTACAAACCAGTCCCGATGCCATTCTTAACTGCATGACCACTATCATCATCAACCCGGAACTCTTCGgcgcg < 1:181216/289‑1 (MQ=255) aaaCCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGAAATTCTTGGCGGGGCGCTTTCCGGCGGTAAAACGACGCATCAGGAAACGTTACAAACCAGTCCCGATGCCATTCTTAACTGCATGACCACTATCATCATCAACCCGGAACTCTTCGGCGCGCCGGa < 1:812560/289‑1 (MQ=255) aaCCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGAAATTCTTGGCGGGGCGCTTTCCGGCGGTAAAACGACGCATCAGGAAACGTTACAAACCAGTCCCGATGCCATTCTTAACTGCATGACCACTATCATCATCAACCCGGAACTCTTCGGCGCGCCGGAt > 1:272975/1‑289 (MQ=255) gTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGAAATTCTTGGCGGGGCGCTTTCCGGCGGTAAAACGACGCATCAGGAAACGTTACAAACCAGTCCCGATGCCATTCTTAACTGCATGACCACTAGCATCATCAACCCGGAACTCTTCGGCGCGCCGGATTGTACCCCCCCGACCCAAACCttt > 2:1563449/1‑288 (MQ=255) tCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCCACGCCCTTGCAGCGATGTGTGAAATTCTTGGCGGGGCGCTTTCCGGCGGTAAAACGACGCATCAGGCAACGTTACAAACCAGTCCCGATGCCATTCTTAACTGCATGACCCCCATCATCCTCCACCCGGAACTCTTCTGCCCGCCGGATTTGAACGCGCCGCCCGAAGccctat > 2:1659394/1‑284 (MQ=255) gTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGAAATTCTTGGCGGGGCGCTTTCCGGCGGTAAAACGACGCATCAGGAAACGTTACAAACCAGTCCCGATGCCATTCTTAACTGCATGACCACTATCATCATCAACCCGGAACTCTTCGGCGCGCCGGATTGTAACGCGCAGACCGAAGCCTTTGCCGAGt < 1:832039/289‑1 (MQ=255) ccAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGAAATTCTTGGCGGGGCGCTTTCCGGCGGTAAAACGACGCCACAGGAAACGTTACAAACCAGTCCCAATGCCATTCTTAACTGCATGACCACTACCATCCTCAACCCGGAACTCTTCTGCGCGCCGGACTGGAACGCGCAGACCGACGCCTTTGCCTAGTgtggta > 2:1389729/1‑284 (MQ=255) tggcTGATTGACGTTAACGGCGTGCCGAAGACCAATCCGGCGGTAATGGAGGAGTCGGCGTTGGGTGCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGAAATTCTTGGCGGGGCGCTTTCCGGCGGTAAAACGACGCATCAGGAAACGTTACAAACCAGTCCCGATGCCATTCTTAACTGCATGACCACTATCATCATCAACCCGGAACTCTTCGGCGCGCCGGATTGTAACGCGCAGACCGAAGCCTTTGCCGAGTGGGTGAAagcct < 2:1488014/286‑2 (MQ=255) cTGGTTGACGTTAACGGCGTGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGAAATTCTTGGCGGGGCGCTTTCCGGCGGTAAAACGACGCATCAGGAAACGTTACAAACCAGTCCCGATGCCATTCTTAACTGCATGACCACTATCATCATCAACCCGGAACTCTTCGGCGCGCCGGATTGTAACGCGCAGACCGAAGCCTTTGCCGAGTGGGTGAAagcctcg < 2:1671554/288‑4 (MQ=255) gATTGACGTTAACGGCGTGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGAGGTGTGAAATTCTTGGCGGGGCGCTTTCCGGCGGTAAAACGACGCCTCAGGAAACGTTACAAACCAGTCCCGATTCCATTCTTAACTCCATGACCACTATCACCATCAACCCGGAACTCTTCGGCGCGCCGGGTTGTAACGCGCAAACCGAAGCCTTTGCCGACGGGGGGAGagcctctcc > 2:1500729/1‑283 (MQ=255) tgtgcGTTAACGGCGTGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGAAATTCTTGGCGGGGCGCTTTCCGGCGGTAAAACGACGCATCAGGAAACGTTACAAACCAGTCCCGATGCCATTCTTAACTGCATGACCACTATCATCATCAACCCGGAACTCTTCGGCGCGCCGGATTGTAACGCGCAGACCGAAGCCTTTGCCGAGTGGGTGAAagcctcgccgca < 2:272975/285‑9 (MQ=255) gTGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGAAATTCTTGGCGGGGCGCTTTCCGGCGGTAAAACGACGCATCAGGAAACGTTACAAACCAGTCCCGATGCCATTCTTAACTGCATGACCACTATCATCATCACCCCGGAACTCTTCGGCGCGCCGGATTGTAACGCTCAGACCGAAGCCTTTTCCGCGTGGGGGAAAACCTCGCCGCCTGACGATGACAAg > 2:1949100/1‑288 (MQ=255) gTGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGAAATTCTTGGCGGGGCGCTTTCCGGCGGTAAAACGACGCATCAGGAAACGTTACAAACCAGTCCCGATGCCATTCTTAACTGCATGACCACTATCATCATCAACCCGGAACTCTTCGGCGCGCCGGATTGTAACGCGCAGACCGAAGCCTTTGCCGAGTGGGTGAAAGCCTCGCCGCATGATGATGATAAg < 2:801138/288‑1 (MQ=255) tGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGAAATTCTTGGCGGGGCGCTTTCCGGCGGTAAAACGACGCATCAGGAAACGTTACAAACCAGTCCCGATGCCATTCTTAACTGCATGACCACTATCATCATCAACCCGGAACTCTTCGGCGCGCCGGATTGTAACGCGCAGACCGAAg < 1:1557367/243‑1 (MQ=255) tGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGAAATTCTTGGCGGGGCGCTTTCCGGCGGTAAAACGACGCATCAGGAAACGTTACAAACCAGTCCCGATGCCATTCTTAACTGCATGACCACTATCATCATCAACCCGGAACTCTTCGGCGCGCCGGATTGTAACGCGCAGACCGAAGCCTTTGCCGAGGGGGTGAAAGCCCCGCCGCATGATGATGATAAGcc > 2:261130/1‑289 (MQ=255) ggcggccAATGCGGCGGTAATGCAGGAGTGGCCGTTTGGTTTGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGGTGTGTGAAATTCTTGGCGGGGCGCTTTCCGGCGGTAAAACGGCGCATCAGGAAACGTTACAAACCAGTCCCGATGCCATTCTTAACTGCATGACCACTATCATCATCAACCCGGAACTCTTCGGCGCGCCGGATTGTAACGCGCAGACCGAAGCCTTTGCCGAGTGGGTGAAAGCCTCGCCGCATGATGATGATAAGCCGAtt < 2:1105243/284‑1 (MQ=255) acCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGAAATTCTTGGCGGGGCGCTTTCCGGCGGTAAAACGACGCATCAGGAAACGTTACAAACCAGTCCCGATGCCATTCTTAACTGCATGACCACTATCATCATCAACCCGGAACTCTTCGGCCCGCCGGATTTTAACGCGCAGAACGAACCCTTTGCCGAGTGGGTGAAAGCCTCGCCCCATGATGAATGTAACGCGAtttt > 2:885451/1‑287 (MQ=255) aaTCCGGCGGTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGAAATTCTTGGCGGGGCGCTTTCCGGCGGTAAAACGACGCATCAGGAAACGTTACAAACCAGTCCCGATGCCATTCTTAACTGCATGACCACTATCATCATCAACCCGGAACTCTTCGGCGCGCCGGATTGTAACGCGCAGACCGAAGCCTTTGCCGAGTGGGTGAAAGCCTCGCCGCATGATGATGATAAGCCGATTTTGCTAc < 1:974761/289‑1 (MQ=255) gcggTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGAAATTCTTGGCGGGGCGCTTTCCGGCGGTAAAACGACGCATCAGGAAACGTTACAAACCAGTCCCGATGCCATTCTTAACTGCATGACCACTATCATCATCAACCCGGAACTCTTCGGCGCGCCGGATTGTAACGCGCAGACCGAAGCCTTTGCCGAGt < 1:1538621/238‑1 (MQ=255) gcggTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGAAATTCTTGGCGGGGCGCTTTCCGGCGGTAAAACGACGCATCAGGAAACGTTACAAACCAGTCCCGATGCCATTCTTAACTGCATGACCACTATCATCATCAACCCGGAACTCTTCGGCGCGCCGGATTGTAACGCGCAGACCGAAGCCTTTGCCGAGt > 2:1538621/1‑238 (MQ=255) cggTAATGCAGGAGTCGCCGTTGGGTTCGCTGTTGAACTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGAAATTCTTGGCGGGGCGCTTTCCGGCGGTAAAACGACGCATCAGGAAGCGTTACAAACCAGTCCCGATGCCATTCTTAACTGCATGACCACTATCATCATCAACCCGGAACTCTTCGGCGCGCCGGATTGTAACGCGCAGACCGAAGCCTTTGCCGAGTGGGTGAAAGCCTCGCCGCATGATGATGATAAGCCGATTTTGCTACCGGGCg < 2:385235/288‑1 (MQ=255) ggagtcgccGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGAAATTCTTGGCGGGGCGCTTTCCGGCGGTAAAACGACGCATCAGGAAACGTTACAAACCAGTCCCGATGCCATTCTTAACTGCATGACCACTATCATCATCAACCCGGAACTCTTCGGCGCGCCGGATTGTAACGCGCAGACCGAAGCCTTTGCCGAGGGGGTGAAAGCCTCGCCGCATGAGGATGATAAGCCGATTTTGCTACCGGGCGAGTGGGAAGTg > 2:495324/8‑289 (MQ=255) gtcgccGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGAAATTCTTGGCGGGGCGCTTTCCGGCGGTAAAACGACGCATCAGGAAACGTTACAAACCAGTCCCGATGCCATTCTTAACTGCATGACCACTATCATCATCAACCCGGAACTCTTCGGCGCGCCGGATTGTAACGCGCAGACCGAAGCCTTTGCCGAGTGGGTGAAAGCCTCGCCGCATGATGATGATAAGCCGATTTTGc < 2:730872/262‑1 (MQ=255) gtcgccGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGAAATTCTTGGCGGGGCGCTTTCCGGCGGTAAAACGACGCATCAGGAAACGTTACAAACCAGTCCCGATGCCATTCTTAACTGCATGACCACTATCATCATCAACCCGGAACTCTTCGGCGCGCCGGATTGTAACGCGCAGACCGAAGCCTTTGCCGAGTGGGTGAAAGCCTCGCCGCATGATGATGATAAGCCGATTTTGCTACCGGGCGATGGGGAAGTGAac > 1:1123207/5‑289 (MQ=255) gccGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGAAATTCTTGGCGGGGCGCTTTCCGGCGGTAAAACGACGCATCAGGAAACGTTACAAACCAGTCCCGATGCCATTCTTAACTGCAt < 2:511992/146‑1 (MQ=255) gccGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGAAATTCTTGGCGGGGCGCTTTCCGGCGGTAAAACGACGCATCAGGAAACGTTACAAACCAGTCCCGATGCCATTCTTAACTGCATGACCACTATCATCATCAACCCGGAACTCTTCGGCGCGCCGGATTGTAACGCGCAGACCGAAGCCTTTGCCGAGTGGGTGAAAGCCTCGCCGCATGATGATGATAAGCCGATTTTGCTACCGGGCGAGTGGGAAGTGAacac > 1:39614/2‑288 (MQ=255) gccGTTGGGTTCGCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGAAATTCTTGGCGGGGCGCTTTCCGGCGGTAAAACGACGCATCAGGAAACGTTACAAACCAGTCCCGATGCCATTCTTAACTGCATGACCACTATCATCATCAACCCGGAACTCTTCGGCGCGCCGGATTGTAACGCGCAGACCGAAGCCTTTGCCGAGTGGGTGAAAGCCTCGCCGCAGGATGATGATAAGCCGATTTTGCTACCGGGGGAGTGGGAAGTTGacac > 2:177896/2‑288 (MQ=255) ||| GCGGGGTTTGTCTCTATCCACTTTGTTAGCGTGGTCGGTATTCCAATGGTCGCGCCGTTCCACGGTCGCGACAGCCGCTTTGGCACCAATCCGTTCTGTGTGGTTTTCCCTCGTAAAGATAATTTCCCGCTGTTGCTTGATTACGCCACCAGCGCCATTGCATTTGGCAAAACCCGCGTCGCCTGGCATAAAGGCGTCCCCGTGCCGCCAGGTTGCCTGATTGACGTTAACGGCGTGCCGACGACCAATCCGGCGGTAATGCAGGAGAGCCCGTTGGGTAGCCTGTTGACCTTTGCCGAACATAAAGGCTACGCCCTTGCAGCGATGTGTGAAATTCTTGGCGGGGCGCTTTCCGGCGGTAAAACGACGCATCAGGAAACGTTACAAACCAGTCCCGATGCCATTCTTAACTGCATGACCACTATCATCATCAACCCGGAACTCTTCGGCGCGCCGGATTGTAACGCGCAGACCGAAGCCTTTGCCGAGTGGGTGAAAGCCAGCCCGCATGATGATGATAAGCCGATTTTGCTACCGGGCGAGTGGGAAGTGAACACGCG > CP042583/699644‑700203 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |