Predicted mutation | ||||||
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RA | CP042583 | 712,980 | 3 bp→TGA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP042583 | 712,980 | 0 | A | T | 99.5% | 467.5 / NA | 196 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
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Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 712,981 | 0 | C | G | 100.0% | 465.4 / NA | 196 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (82/114); total (82/114) | |||||||||||
* | CP042583 | 712,982 | 0 | T | A | 100.0% | 468.5 / NA | 196 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base A (82/114); total (82/114) |
Only 100 of 196 total aligned reads displayed.
CCAGCGGTACTGTCTGAATAGAAAGATAAAAAAGATAATTCATCCCACCCAGGCTAACGCCGTAAAACAACAGCGGTAACCGTTGCTCTTTGGCAAAGCGCAGTCGCCATGGCTTAAAGAACGCGATGAGGATCAGCGTTCCTAATGCCAGACGCAGCGCAGTGACACCCGGTGCGCCCACCAGAGGAAAAAGACTCTTAGCTAAGCTGGCTCCACCCTGAATAGACGCCATGGCAACGAGCAATATGACTATTGGTAACCAGACCGGCATTTTACGTAAACTACCAGGCATCCTTTCTCCCACAAATATCTAGACTTAAGTAAAGCGTGGAGTGTACTGGATATACCCAATGCTGGTTGAGCATTTGTTGAAAAAATTTTCCCCCGTTTTGACTAAAATGCGCCAGGATTGATGGAATCATTAGTCTGGTGATTAGGAATAATCTGGATGAATGACAGGGAAAACATGCGTAATACTTACGCAGTTCTCTGAAAAAGTGATTTAAATTTAGATGGATAGCGGTGTATGGAAACGTTCTGTTACATGAAATG > CP042583/712700‑713251 ||| ccAGCGGTACGGTCTGAATAGAAAGATAAAAAAGAGACTTCAGCCCGCCCAGCGAAAACCCGTAAAACAACAGCGGTAACCGTTGCACTTTGGCAAGGCGCAGTCGCCATGGCTTAAAGGACGCGATGAGGATCAGCGTTCCTAATGCCAGACGCAGCGCAGTGACACCCGGTGCGCCCACCAGAGGAAAAAGTGACTTAGCTAACGAGGCTCCACCCTGAATAGACGCCATGGCAACGAGCAATATGACTATTGGTAACCAGACCGGCATTTTACGTAATGAACCAgg < 2:1053418/289‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |