| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP042583 | 734,281 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP042583 | 734,281 | 0 | A | T | 99.0% | 461.0 / NA | 202 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (105/94); minor base C (1/1); total (107/95) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| * | CP042583 | 734,282 | 0 | G | C | 98.5% | 462.1 / ‑5.4 | 202 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/0); major base C (104/94); minor base T (2/1); total (107/95) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| * | CP042583 | 734,283 | 0 | C | G | 99.5% | 474.3 / NA | 202 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); new base G (107/94); total (107/95) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.70e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 202 total aligned reads displayed.
AACTGGTGCGTCAGCAGCTGGGGTTGGATCAGCCGCTGTATCACCAGTTCTGGCACTATATCAGCAATGCTGTGCAGGGGGATTTTGGCCTGAGCATGGTGAGCCGTCGTCCGGTTGCCGATGAGATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATAACCAGTATGGTCTGGGCGGTTATATTTGGTATGGCGGCGGGAATTATCGCCGCCGTCTGGCGTAACCGTTGGCCGGATCGATTGAGTATGACCATTGCGGTGAGCGGGATCAGCTTTCCGGCATTTGCTCTGGGGATGCTTTTAA‑TTCAGGTATTCTCCGTTGAACTGGGC‑TGGCTGCCTACCGTGGGAGCAGACAGTTGGCAGCACTACATTTTACCC‑TCCCTGACGCTCGGCGCGGCAGTGGCCGCCGTGATGGCGCGCTTTACCCGCGCGAGCTTTGTCGATGTTTTAAGCGAAGATTATATGCGTACCGCGAGGGCGAAAGGGGTGAGCGAAACCTGGGTTGTCCTCAAACACGGGCTACGTAACGCGATGATCCCGGTA > CP042583/734006‑734553 ||| ggTGCGTCAGCAGCTGGGGTTGGATCAGCCGCTGTATCACCAGTTCTGGCACTATATCAGCAATGCTGTGCAGGGGGATTTTGGCCTGTCGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGAGATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATAACCAGTATGGTCTGGGCGGTTATATTTGGTATGGCGGCGGGAATTATCGCCGCCGTCTGGCGTAACCGTTGGCCGGATCGATTGAGTATGACCATTGCGGTGTCGGGGATCTCGTTTCCGGCATTTGct < 1:709386/289‑1 (MQ=255) gTGCGTCAGCAGCTGGGGTTGGATCAGCCGCTGTATCACCAGTTCTGGCACTATATCAGCAATGCTGTGCAGGGGGATTTTGGCCTGTCGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGAGATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATAACCAGTATGGTCTGGGCGGTTATATTTGGTATGGCGGCGGGAATTATCGCCGCCGTCTGGCGTAACCGTTGGCCGGATCGATTGAGTATGACCATTGCGGTGTCGGGGATCTCGTTTCCGGCAt > 2:297782/1‑283 (MQ=255) agcTGGGGTTGGATCAGCCGCTGTATCACCAGTTCTGGCACTATATCAGCAATGCTGTGCAGGGGGATTTTGGCCTGTCGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGAGATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATAACCAGTATGGTCTGGGCGGTTATATTTGGTATGGCGGCGGGAATTATCGCCGCCGTCTGGCGTAACCGTTGGCCGGATCGATTGAGTATGACCATTGCGGTGTCGGGGATCTCGTTTCCGGCATTTGCTCTGGGGAt < 1:1345869/286‑1 (MQ=255) aGCCGCTGTATCACCAGTTCTGGCACTATATCAGCAATGCTGTGCAGGGGGATTTTGGCCTGTCGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGAGATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATAACCAGTATGGTCTGGGCGGTTATCTTTGGTATGGCCGCGTGCATTATCGCCGCCGTCTGGCGTAACCGTTGACCGGATCGCTTGAGGATGTCCCGTGCGGTGGTGGGGACCTCGATTCCGGCCTTTGCCCTGGGGATGCGTTTAC‑TTCATGTAtt > 2:741658/1‑289 (MQ=255) ccGCTGTATCACCAGTTCTGGCACTATATCAGCAATGCTGTGCAGGGGGATTTTGGCCTGTCGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGAGATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATAACCAGTATGGTCTGGGCGGTTATATTTGGTATGGCGGCGGGAATTATCGCCGCCGTCTGGCGTAACCGTTGGCCGGATCGATTGAGTATGACCATTGCGGTGTCGGGGATCTCGTTTCCGGCATTTGCTCTGGGGATGCTTTTAA‑TTCAGGTATtc > 1:1782475/1‑288 (MQ=255) cGCTGTATCACCAGTTCTGGCACTATATCAGCAATGCTGTGCAGGGGGATTTTGGCCTGTCGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGAGATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATAACCAGTATGGTCTGGGCGGTTATATTTGGTATGGCGGCGGGAATTATCGCCGCCGTCTGGCGTAACCGTTGGCCGGATCGATTGAGTATGACCATTGCGGTGTCGGGGATCTCGTTTCCGGCATTTGCTCTGGGGATGCTTTTAA‑TTCAGGTAtt < 1:1009410/286‑1 (MQ=255) gTATCACCAGTTCTGGCACTATATCAGCAATGCTGTGCAGGGGGATTTTGGCCTGTCGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGAGATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATAACCAGTATGGTCTGGGCGGTTATATTTGGTATGGCGGCGGGAATTATCGCCGCCGTCTGGCGTAACCGTTGGCCGGATCGATTGAGTATGACCATTGCGGTGTCGGGGATCTCGTTTCCGGCATTTGCTCTGGGGATGCTTTTAA‑TTCAGGTATTCTCCGtt > 1:766387/1‑289 (MQ=255) gTATCACCAGTTCTGGCACTATATCAGCAATGCTGTGCAGGGGGATTTTGGCCTGTCGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGAGATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATAACCAGTATGGTCTGGGCGGTTATATTTGGTATGGCGGCGGGAATTATCGCCGCCGTCTGGCGTAACCGTTGGCCGGATCGATTGAGTATGACCATTGCGGTGTCGGGGATCTCGTTTCCGGCATTTGCTCTGGGGATGCTTTTAA‑TTCAGGTATTCTCCGtt > 2:669986/1‑289 (MQ=255) gTTCTGGCACTATATCAGCAATGCTGTGCAGGGGGATTTTGGCCTGTCGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGAGATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATAACCAGTATGGTCTGGGCGGTTATATTTGGTATGGCGGCGGGAATTATCGCCGCCGTCTGGCGTAACCGTTGGCCGGATCGATTGAGTATGACCATTGCGGTGTCGGGGATCTCGTTTCCGGCATTTGCTCTGGGGATGCTTTTAA‑TTCAGGTATTCTCCGTTGAACTgg > 1:503379/1‑287 (MQ=255) tCTGGCACTATATCAGCAATGCTGTGCAGGGGGATTTTGGCCTGTGGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGAGATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATAACCAGTATGGTCTGGGCGGTTATATTTGGTATGGCGGCGGGAATTATCGCCGCCGTCTGGCGTAACCGTTGGCCGGATCGATTGAGTATGACCATTGCGGTGTCGGGGATCTCGTTTCCGGCATTTGCTCTGGGGATGCTTTTAA‑TTCAGGTATTCTCCGTTGAACTGggc < 1:1643347/287‑1 (MQ=255) tCTGGCACTATATCAGCAATGCTGTGCAGGGGGATTTTGGCCTGTCGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGAGATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATAACCAGTATGGTCTGGGCGGTTATATTTGGTATGGCGGCGGGAATTATCGCCGCCGTCTGGCGTAACCGTTGGCCGGATCGATTGAGTATGACCCTGGCGGTGTCGGGGATCTCGTTTCCGGCCTTTGCTCTGGGGATGCTTGTAA‑TTCAGGTATTCTCCGTGTCACTGggc‑tt > 2:1786113/1‑288 (MQ=255) gCACTATATCAGCAATGCTGTGCAGGGGGATTTTGGCCTGTCGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGAGATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATAACCAGTATGGTCTGGGCGGTTATATTTGGTATGGCGGCGGGAATTATCGCCGCCGTCTGGCGTAACCGTTGGCCGGATCGATTGAGTATGACCATTGCGGTGTCGGGGATCTCGTTTCCGGCATTTGCTCTgggg < 2:1251213/247‑1 (MQ=255) aaTTCTGTGGAGGGGG‑GTTTGGCCTGTGGATGGGGTCGCGTGGTCCGGTTGCCGATGGGATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATAACCAGTATGGTCTGGGCGGTTATATTTGGTATGGCGGCGGGAATTATCGCCGCCGTCTGGCGTAACCGTTGGCCGGATCGATTGAGTATGACCATTGCGGTGTCGGGGATCTCGTTTCCGGCATTTGCTCTGGGGATGCTTTTAA‑TTCAGGTATTCTCCGTTGAACTGGGC‑TGGCTGCCTACCGTGGGAGc < 2:1033970/289‑1 (MQ=255) aTGCTGTGCAGGGGGATTTTGGCCTGTCGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGAGATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATAACCAGTATGGTCTGGGCGGTTATATTTGGTATGGCGGCGGGAATTATCGCCGCCGTCTGGCGTAACCGTTGGCCGGATCGATTGAGTATGACCATTGCGGTGTCGGGGATCTCGTTTCCGGCATTTGCTCTGGGGATGCTTTTAA‑TTCAGGTATTCTCCGTTGAACTGGGC‑TGGCTGCCTACCGTGGGAGc > 1:1379533/1‑289 (MQ=255) gCTGTGCAGGGGGCTTTTGGCCTGTCGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGAGATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATAACCAGTATGGTCTGGGCGGTTATATTTGGTATGGCGGCGGGAATTATCGCCGCCGTCTGGCGTAACCGTTGGCCGGATCGATTGAGTATGACCATTGCGGTGTCGGGGATCTCGTTTCCGGCATTTGATCTGGGGATGCTTTTAA‑TTCAGGTATTCTCCGTTGAACTGGGC‑TGGCTGCCTACCGTGGGAGCAg > 1:835492/1‑289 (MQ=255) gCTGTGCAGGGGGATTTTGGCCTGTCGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGAGATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATAACCAGTATGGTCTGGGCGGTTATATTTGGTATGGCGGCGGGAATTATCGCCGCCGTCTGGCGTAACCGTTGGCCGGATCGATTGAGTATGACCATTGCGGTGTCGGGGATCTCGTTTCCGGCATTTGCTCTGGGGATGCTTTTAA‑TTCAGGTATTCTCCGTTGAACTGGGC‑TGGCTTCCTa > 1:1340836/1‑277 (MQ=255) tgtgCAGGGGGATTTTGGCCTGTCGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGAGATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATAACCAGTATGGTCTGGGCGGTTATATTTGGTATGGCGGCGGGAATTATCGCCGCCGTCTGGCGTAACCGTTGGCCGGATCGATTGAGTATGACCATTGCGGTGTCGGGGATCTCGTTTCCGGCAt < 2:416612/218‑1 (MQ=255) tgCAGGGGGATTTTGGCCTGTCGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGAGATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATAACCAGTATGGTCTGGGCGGTTATATTTGGTATGGCGGCGGGAATTATCGCCGCCGTCTGGCGTAACCGTTGGCCGGATCGATTGAGTATGACCATTGCGGTGTCGGGGATCTCGTTTCCGGCATTTGCTCTGGGGATGCTTTTAA‑TTCAGGTATTCTCCGTTGAACTGGGC‑TGGCTGCCTACCGTGGGAGCAGACa < 2:1209329/288‑1 (MQ=255) tgCAGGGGGATTTTGGCCTGTCGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGAGATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATAACCAGTATGGTCTGGGCGGTTATATTTGGTATGGCGGCGGGAATTATCGCCGCCGTCTGGCGTAACCGTTGGCCGGATCGATTGAGTATGACCATTGCGGTGTCGGGGATCTCGTTTCCGGCATTTGCTCTGGGGATGCTTTTAA‑TTCAGGTATTCTCCGTTGAACTGGGC‑TGGCTGCCTACCGTGGGAGCAGACAg > 1:667557/1‑289 (MQ=255) aGGGGGATTTTGGCCTGTCGATTGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGAGATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATAACCAGTATGGTCTGGGCGGTTATATTTGGTATGGCGGCGGGAATTATCGCCGCCGTCTGGCGTAACCGTTGGCCGGATCGATTGAGTATGACCATTGCGGTGTCGGGGATCTCGTTTCCGGCATTTGCTCTGGGGATGCTTTTAA‑TTCAGGTATTCTCCGTTGAACTGGGC‑TGGCTGCCTACCGTGGGAGCAGACAGtt < 2:805498/288‑1 (MQ=255) ggggATTTTGGCCTGTCGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGAGATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATAACCAGTATGGTCTGGGCGGTTATATTTGGTATGGCGGCGGGAATTATCGCCGCCGTCTGGCGTAACCGTTGGCCGGATCGATTGAGTATGACCATTGCGGTGTCGGGGATCTCGTTTCCGGCATTTGCTCTGGGGATGCTTTTAA‑TTCAGGTATTCTCCGTTGAACTGGGC‑TGGCTGCCTACCGTGGGAGCAGACAGTTgg < 1:669986/288‑1 (MQ=255) ggATTTTGGCCTGTCGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGAGATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATAACCAGTATGGTCTGGGCGGTTATATTTGGTATGGCGGCGGGAATTATCGCCGCCGTCTGGCGTAACCGTTGGCCGGATCGATTGAGTATGACCATTGCGGTGTCGGGGATCTCGTTTCCGGCCTTTGCTCTGGGGATGCTTTTAA‑TTCAGTTATTCTCCGTTGAACTGGGC‑TGGCTGCCTACCGTGGGAGCAGAcgggtgtag > 2:702058/1‑280 (MQ=255) ttttGGCCTGTCGATGGTGTCGCGTCGTCCGTTTGCCGATGAGATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATAACCAGTATGGTCTGGGCGGTTATATTTGGTATGGCGGCGGGAATTATCGCCGCCGTCTGGCGTAACCGTTGGCCGGATCGATTGAGTATGACCATTGCGGTGTCGGGGATCTCGTTTCCGGCATTTGCTCTGGGGATGCTTTTAA‑TTCAGGTATTCTCCGTTGAACTGGGC‑TGGCTGCCTACCGTGGGAGCAGACAGTTGgcagca < 1:150349/288‑1 (MQ=255) ttttGGCCTGTCGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGAGATTGCCCGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATAACCAGTATGGTCTGGGCGGTTATATTTGGTATGGCGGCGGGAATTATCGCCGCCGTCTGGCGTAACCGTTGGCCGGATCGATTGAGTATGACCATTGCGGTGTCGGGGATCTCGTTTCCGGCATTTGCTCTGGGGATGCTTTTAA‑TTCAGGTATTCTCCGTTGAACTGGGC‑TGGCTGCCTACCGTGGGAGCAGACAGTTGGCAGCAc < 2:1948013/289‑1 (MQ=255) ttttGGCCTGTCGATGGTGTCGCGTCGTCCGGTTGCCGATGAGATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATAACCAGTATGGTCTGGGCGGTTATATTTGGTATGGCGGCGGGAATTATCGCCGCCGTCTGGCGTAACCGTTGGCCGGATCGATTGAGTATGACCATTGCGGTGTCGGGGATCTCGTTTCCGGCATTTGCTCTGGGGATGCTTTTAA‑TTCAGGTATTCTCCGTTGAACTGGGC‑TGGCTGCCTACCGTGGGAGCAGACAGTTGgcagca < 2:1379533/288‑1 (MQ=255) tcgatggtgtcgcgtcgtCCGGTTGCCGATGAGATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATAACCAGTATGGTCTGGGCGGTTATATTTGGTATGGCGGCGGGAATTATCGCCGCCGTCTGGCGTAACCGTTGGCCGGATCGCTTGAGTATGACCATTGCGGTGTCGGGGATCTCGTTTCCGGCATTTGCTCTGGGGATGCTTTTAA‑TTCAGGTATTCTCCGTTTAACTGGGC‑TGGCTGCCTTCCTTTGGAGCCGACAGTTCGCAGCACTACATTTTa > 2:1155620/13‑288 (MQ=255) cgatggtgtcgcgtcgtCCGGTTGCCGATGAGATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATAACCAGTATGGTCTGGGCGGTTATATTTGGTATGGCGGCGGGAATTATCGCCGCCGTCTGGCGTAACCGTTGGCCGGATCGATTGAGTATGACCATTGCGGTGTCGGGGATCTCGTTTCCGGCATTTGCTCTGGGGATGCTTTTAA‑TTCAGGTATTCTCCGTTGAACTGGGC‑TGGCTGCCTACCGTGGGAGCAGACAGTTGGCAGCACTACATTTTAcc < 2:285474/278‑1 (MQ=255) ggtgtcgcgtcgtCCGGTTGCCGATGAGATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATAACCAGTATGGTCTGGGCGGTTATATTTGGTATGGCGGCGGGAATTATCGCCGCCGTCTGGCGTAACCGTTGGCCGGATCGATTGAGTATGACCATTGCGGTGTCGGGGATCTCGTTTCCGGCATTTGCTCTGGGGATGCTTTTAA‑TTCAGGTATTCTCCGTTGAACTGGGC‑TGGCTGCCTACCGTGGGAGCa > 2:609771/8‑259 (MQ=255) ggtgtcgcgtcgtCCGGTTGCCGATGAGATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATAACCAGTATGGTCTGGGCGGTTATATTTGGTATGGCGGCGGGAATTATCGCCGCCGTCTGGCGTAACCGTTGGCCGGATCGATTGAGTATGACCATTGCGGTGTCGGGGATCTCGTTTCCGGCATTTGCTCTGGGGATGCTTTTAA‑TTCAGGTATTCTCCGTTGAACTGGGC‑TGGCTGCCTACCGTGGGAGCa < 1:609771/252‑1 (MQ=255) cgcgtcgtCCGGTTGCCGATGAGATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATAACCAGTATGGTCTGGGCGGTTATATTTGGTATGGCGGCGGGAATTATCGCCGCCGTCTGGCGTAACCGTTGGCCGGATCGATTGAGTATGACCATTGCGGTGTCGGGGATCTCGTTTCCGGCATTTGCTCTGGGGATGCTTTTAA‑TTCAGGTATTCTCCGTTGAA‑TGGGCTTGCCTGCCACCCGGGGGGGCGGAC‑GGTGGCGGCACCCCATTTTTCCCTTCCCTgc > 2:339665/3‑287 (MQ=255) tcCGGTTGCCGATGAGATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATAACCAGTATGGTCTGGGCGGTTATATTTGGTATGGCGGCGGGAATTATCGCCGCCGTCTGGCGTAACCGTTGGCCGGATCGATTGAGTATGACCATTGCGGTGTCGGGGATCTCGTTTCCGGCATTTGCTCTGGGGATGCTTTTAA‑TTCAGGTATTCTCCGTTGAACTGGGC‑TGGCTGCCTACCGTGGGAGCAGACAGTTGGCAGCACTACATTTTACCC‑TCCCTGACGCTCGgc > 1:1115045/1‑289 (MQ=255) gTTGCCGATGGTAGTGCCGGCCGCTTTATGCCAACGCTGGTGCTGACCATAACCAGTATGGTCTGGGCGGTTATATGTGGTATGGCGGCGGGAATTATCGCCGCCGTCTGGCGTAACCGTTGGCCGGATCGATTGAGTATGACCATTGCGGTGTCGGGGATCTCGTTTCCGGCATTTGCTCTGGGGATGCTTTTAA‑TTCAGGTATTCTCCGTTGAACTGGGC‑TGGCTGCCTACCGTGGGAGCAGACAGTTGGCAGCACTACATTTTACCC‑TCCCTGACGCTCGGcgcg < 2:1740887/288‑1 (MQ=255) tGCCGATGAGATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATAACCAGTATGGTCTGGGCGGTTATATTTGGTATGGCGGCGGGAATTATCGCCGCCGTCTGGCGTAACCGTTGGCCGGATCGATTGAGTATGACCATTGCGGTGTCGGGGATCTCGTTTCCGGCATTTGCTCTGGGGATGCTTTTAA‑TTCAGGTATTCTCCGTTGAACTGGGC‑TGGCTGCCTACCGTGGGAGCAGACAGTTGGCAGCACTACATTTTACCC‑TCCCTGACGCTCGGCGCGGCa < 2:346054/289‑1 (MQ=255) cGATGAGATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATAACCAGTATGGTCTGGGCGGTTATATTTGGTATGGCGGCGGGAATTATCGCCGCCGTCTGGCGTAACCGTTGGCCGGATCGATTGAGTATGACCATTGCGGTGTCGGGGATCTCGTTTCCGGCATTTGCTCTGGGGATGCTTTTAA‑TTCAGGTATTCTCCGTTGAACTGGGC‑TGGCTGCCTACCGTGGGAGCAGACAGTTGGCAGCACTACATTTTACCC‑TCCCTGACGCTCGGCGCGGCAGt < 1:855051/288‑1 (MQ=255) gATGAGATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATAACCAGTATGGTCTGGGCGGTTATATTTGGTATGGCGGCGGGAATTATCGCCGCCGTCTGGCGTAACCGTTGGCCGGATCGATTGAGTATGACCATTGCGGTGTCGGGGATCTCGTTTCCGGCATTTGCTCTGGGGATGCTTTTAA‑TTCAGGTATTCTCCGTTGAACTGGGC‑TGGCTGCCTACCGTGGGAGCAGACAGTTGGCAGCACTACATTTTACCC‑TCCCTGACGCTCGGCGCGGCAGTg > 1:1740887/1‑288 (MQ=255) tGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATAACCAGTATGGTCTGGGCGGTTATATTTGGTATGGCGGCGGGAATTATCGCCGCCGTCTGGCGTAACCGTTGGCCGGATCGATTGAGTATGACCATTGCGGTGTCGGGGATCTCGTTTCCGGCATTTGCTCTGGGGATGCTTTTAA‑TTCAGGTATTCTCCGTTGAACTGGGC‑TGGCTGCCTACCGTGGGAGCAGACAGTTGGCAGCACTACATTTTACCC‑TCCCTGACGCCCGGAGCGGCAGTGGccgccggg > 1:1934066/1‑287 (MQ=255) gCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATAACCAGTATGGTCTGGGCGGTTATATTTGGTATGGCGGCGGGAATTATCGCCGCCGTCTGGCGTAACCGTTGGCCGGATCGATTGAGTATGACCATTGCGGTGTCGGGGATCTCGTTTCCGGCATTTGCTCTGGGGATGCTTTTAA‑TTCAGGTATTCTCCGTTGAACTGGGC‑TGGCTGCCTACCGTGGGAGCAGACAGTTGGCAGCACTACATTTTACCC‑TCCCTGACGCTCGGCGCGGCAGTGGCCGCCGTGATGgcgc > 2:540639/1‑288 (MQ=255) cGCTGTGGCTGACCATAACCAGTATGGTCTGGGCGGTTATATTTGGTATGGCGGCGGGAATTATCGCCGCCGTCTGGCGTAACCGTTGGCCGGATCGATTGAGTATGACCATTGCGGTGTCGGGGATCTCGTTTCCGGCATTTGCTCTGGGGATGCTTTTAA‑TTCAGGTATTCTCCGTTGAACTGGGC‑TGGCTGCCTACCGTGGGAGCAGACAGTTGGCAGCACTACATTTTACCC‑TCCCTGACGCTCGGCGCGGCAGTGGCCGCCGTGATGGCGCGCTTTACCcgcgc < 1:694847/289‑1 (MQ=255) aCCATAACCAGTATGGTCTGGGCGGTTATATTTGGTATGGCGGCGGGAATTATCGCCGCCGTCTGGCGTAACCGTTGGCCGGATCGATTGAGTATGACCATTGCGGTGTCGGGGATCTCGTTTCCGGCATTTGCTCTGGGGATGCTTTTAA‑TTCAGGTATTCTCCGTTGAACTGGGC‑TGGCTGCCTACCGTGGGAGCAGACAGTTGGCAGCACTACATTTTACCC‑TCCCTGACGCCCGGCCGGGCAGTGGCCGCCGTGATGGGCCGCTTTACCCGCGCGTCTTTTGTc > 2:120402/1‑288 (MQ=255) tATGGTCTGGGCGGTTATATTTGGTATGGGGGCGGGAATTCTCGCCGCCGTCTGGCGTAACCGTTGGCCGGATCGATTGAGTATGACCATTGCGGTGTCGGGGATCTCGTTTCCGGCATTTGCTCTGGGGATGCTTTTAA‑TTCAGGTATTCTCCGTTGAACTGGGC‑TGGCTGCCTACCGTGGGAGCAGACAGTTGGCAGCACTACATTTTACCC‑TCCCTGACGCTCGGCGCGGCAGTGGCCGCCGTGATGGCGCGCTTTACCCGCGCGTCGTTTGTCGATGTTTTAAg < 1:970310/288‑1 (MQ=255) tATGGTCTGGGCGGTTATATTTGGTATGGCGGCGGGAATTATCGCCGCCGTCTGGCGTAACCGTTGGCCGGATCGATTGAGTATGACCATTGCGGTGTCGGGGATCTCGTTTCCGGCATTTGCTCTGGGGATGCTTTTAA‑TTCAGGTATTCTCCGTTGAACTGGGC‑TGGCTGCCTACCGTGGGAGCAGACAGTTGGCAGCACTACATTTTACCC‑TCCCTGACGCTCGGCGCGGCAGTGGCCGCCGTGATgg < 2:1570169/251‑1 (MQ=255) aTGGTCTGGGCGGTTATATTTGGTATGGCGGCGGGAATTATCGCCGCCGTCTGGCGTAACCGTTGGCCTGATCGATTGAGTATGACCATTGCGGTGTCGGGGATCTCGTTTCCGGCATTTGCTCTGGGGATGCTTTTAA‑TTCAGGTATTCTCCGTTGAACTGGGC‑TGGCTGCCTACCGTGGGAGCAGACAGTTGGCAGCACTACATTTTACCC‑TCCCTGACGCTCGGCGCGGCAGTGGCCGCCGTGATGGCGCGCTTTACCCGCGCGTCGTTTGTCGATGTTTTAAGCg < 1:823890/289‑1 (MQ=255) aTGGTCTGGGCGGTTATATTTGGTATGGCGGCGGGAATTATCGCCGCCGTCTGGCGTAACCGTTGGCCGGATCGATTGAGTATGACCATTGCGGTGTCGGGGATCTCGTTTCCGGCATTTGCTCTGGGGATGCTTTTAA‑TTCAGGTATTCTCCGTTGAACTGGGC‑TGGCTGCCTACCGTGGGAGCAGACAGTTGGCAGCACTACATTTTACCC‑TCCCTGACGCTCGGCGCGGCAGTGGCCGCCGTGATGGCGCGCTTTACCCGCGCGTCGTTTGTCGATGTTTTAAGCg < 1:540639/289‑1 (MQ=255) aTGGTCTGGGCGGTTATATTTGGTATGGCGGCGGGAATTATCGCCGCCGTCTGGCGTAACCGTTGGCCGGATCGATTGAGTATGACCATTGCGGTGTCGGGGATCTCGTTTCCGGCATTTGCTCTGGGGATGCTTTTAA‑TTCAGGTATTCTCCGTTGAACTGGGC‑TGGCTGCCTACCGTGGGAGCAGACAGTTGGCAGCACTACATTTTACCC‑TCCCTGACGCTCGGCGCGGCAGTGGCCGCCGTGATGGCGCGCTTTACCCGCGCGTCGTTTGTCGATGTTTTAAGCg < 1:366326/289‑1 (MQ=255) tCTGGGCGGTTATATTTGGTATGGCGGCGGGAATTATCGCCGCCGTCTGGCGTAACCGTTGTCCGGATCGATTGAGTATGACCATTGCGGTGTCGGGGATCTCGTTTCCGGCATTTGCTCTGGGGATGCTTTTAA‑TTCAGGTATTCTCCGTTGAACTGGGC‑TGGCTGCCTACCGTGGGAGCAGACAGTTGGCAGCACt > 1:1951630/1‑198 (MQ=255) tCTGGGCGGTTATATTTGGTATGGCGGCGGGAATTATCGCCGCCGTCTGGCGTAACCGTTGGCCGGATCGATTGAGTATGACCATTGCGGTGTCGGGGATCTCGTTTCCGGCATTTGCTCTGGGGATGCTTTTAA‑TTCAGGTATTCTCCGTTGAACTGGGC‑TGGCTGCCTACCGTGGGAGCAGACAGTTGGCAGCACTACATTTTACCC‑TCCCTGACGCTCGGCGCGGCAGTGGCCGCCGTGATGGCGCGCTTTACCCGCGCGTCGTTTGTCGATGTTTTAAg < 2:693014/283‑1 (MQ=255) cTGGGCGGTTATATTTGGTAGGGCGGCTGGAATTATCGCCGCCGTCTGGCGTAACCGTTGGCCGGATCGATTGAGTATGACCATTGCGGTGTCGGGGATCTCGTTTCCGGCATTTGCTCTGGGGATGCTTTTAA‑TTCAGGTATTCTCCGTTGAACTGGGC‑TGGCTGCCTACCGTGGGAGCAGACAGTTGGCAGCACTACATTTTACCC‑TCCCTGACGCTCGGCGCGGCAGTGGCCGCCGTGATGGCGCGCTTTACCCGCGCGTCGTTTGTCGATGTTTTAAGCGAAGAt < 1:1901077/289‑1 (MQ=255) gggCGGTTATATTTGGTATGGCGGCGGGAATTATCGCCGCCGTCTGGCGTAACCGTTGGCCGGATCGATTGAGTATGACCATTGCGGTGTCGGGGATCTCGTTTCCGGCATTTGCTCTGGGGATGCTTTTAA‑TTCAGGTATTCTCCGTTGAACTGGGC‑TGGCTGCCTACCGTGGGAGCAGACAGTTGGCAGCACTACATTTTACCC‑TCCCTGACGCTCGGCGCGGCAGTGGCCGCCGTGATGGCGCGCTTTACCCGCGCGTCGTTTGTCGATGTTTTAAGCGAAGATta > 1:330850/1‑289 (MQ=255) gggCGGTTATATTTGGTATGGCGGCGGGAATTATCGCCGCCGTCTGGCGTAACCGTTGGCCGGATCGATTGAGTATGACCATTGCGGTGTCGGGGATCTCGTTTCCGGCATTTGCTCTGGGGATGCTTTTAA‑TTCAGGTATTCTCCGTTGAACTGGGC‑TGGCTGCCTACCGTGGGAGCAGACAGTTGGCAGCACTACATTTTACCC‑TCCCTGACGCTCGGCGCGGCAGTGGCCGCCGTGATGGCGCGCTTTACCCGCGCGTCGTTTGTCGATGTTTTAAGCGAAGATta > 1:1321128/1‑289 (MQ=255) ggCGGTTATATTTGGTATGGCGGCGGGAATTATCGCCGCCGTCTGGCGTAACCGTTGGCCGGATCGATTGAGTATGACCATTGCGGTGTCGGGGATCTCGTTTCCGGCCTTTGCTCTGGGGATGCTTTTAA‑TTCAGGTATGCTCCGTTGAACTGGGC‑TGGCTGCCTACCGTTGGAGCAGAAAGTTGGCAGCAATACATTTTACCC‑TCCCTGACGCGCGGCCCGGCAGTGGCCGCCGGTATCGCGCTCTTTCCCCGCGCGTCGTTTGTCGAAGTTTTAACCGAAGATtat > 2:1952323/1‑289 (MQ=255) ggCGGTTATATTTGGTATGGCGGCGGGAATTATCGCCGCCGTCTGGCGTAACCGTTGGCCGGATCGATTGAGTATGACCATTGCGGTGTCGGGGATCTCGTTTCCGGCATTTGCTCTGGGGATGCTTTTAA‑TTCAGGTATTCTCCGTTGAACTGGGC‑TGGCTGCCTACCGTGGGAGCAGACAGTTTGCAGCACTACATTTTACCC‑TCCCTGACGCTCGGCGCGGCAGTGGCCGCCGTGATGGCGCGCTTTACCCTCGCGTCGTTTGTCGCTGTTTTAAGAGAAGATtat > 2:162573/1‑289 (MQ=255) gCGGTTATATTTGGTATGGCGGCGGGAATTATCGCCGCCGTCTGGCGTAACCGTTGGCCGGATCGATTGAGTATGACCATTGCGGTGTCGGGGATCTCGTTTCCGGCATTTGct > 2:1845/1‑114 (MQ=255) gCGGTTATATTTGGTATGGCGGCGGGAATTATCGCCGCCGTCTGGCGTAACCGTTGGCCGGATCGATTGAGTATGACCATTGCGGTGTCGGGGATCTCGTTTCCGGCATTTGct < 1:1845/114‑1 (MQ=255) gCGGTTATATTTGGTATGGCGGCGGGAATTATCGCCGCCGTCTGGCGTAACCGTTGGCCGGATCGATTGAGTATGACCATTGCGGTGTCGGGGATCTCGTTTCCGGCATTTGCTCTGGGGATGCTTTTAA‑TTCAGGTATTCTCCGTTGAACTGGGC‑TGGCTGCCTACCGTGGGAGCAGACAGTTGgcag < 2:906410/189‑1 (MQ=255) gCGGTTATATTTGGTATGGCGGCGGGAATTATCGCCGCCGTCTGGCGTAACCGTTGGCCGGATCGATTGAGTATGACCATTGCGGTGTCGGGGATCTCGTTTCCGGCATTTGCTCTGGGGATGCTTTTAA‑TTCAGGTATTCTCCGTTGAACTGGGC‑TGGCTGCCTACCGTGGGAGCAGACAGTTGGCAGCACTACATTTTACCC‑TCCCTGACGCTCGGCGCGGCAGTGGCCGCCGTGATGGCGCGCTTTACCCGCGCGTCGTTTGTCGATGTTTTAAGCg < 2:1217448/280‑1 (MQ=255) ttATATTTGGTATGGCGGCGGGAATTATCGCCGCCGTCTGGCGTAACCGTTGGCCGGATCGATTGAGTATGACCATTGCGGTGTCGGGGATCTCGTTTCCGGCATTTGCTCTGGGGAt < 1:1283253/118‑1 (MQ=255) ttATATTTGGTATGGCGGCGGGAATTATCGCCGCCGTCTGGCGTAACCGTTGGCCGGATCGATTGAGTATGACCATTGCGGTGTCGGGGATCTCGTTTCCGGCATTTGCTCTGGGGATGCTTTTAA‑TTCAGGTATTCTCCGTTGAACTGGGC‑TGGCTGCCTACCGTGGGAGCAGACAGTTgg > 2:839825/1‑182 (MQ=255) ttATATTTGGTATGGCGGCGGGAATTATCGCCGCCGTCTGGCGTAACCGTTGGCCGGATCGATTGAGTATGACCATTGCGGTGTCGGGGATCTCGTTTCCGGCATTTGCTCTGGGGATGCTTTTAA‑TTCAGGTATTCTCCGTTGAACTGGGC‑TGGCTGCCTACCGTGGGAGCAGACAGTTGGCAGCACTACATTTTACCC‑TCCCTGACGCTCGGTGCGGCAGTGGCCGCCGTGATGGCGCGCTTTACCCGCGCGTCGTTTGTCGATGTTTTAAGCGAAGATTATATGCg > 1:1045031/1‑289 (MQ=255) ggTATGGCGGCGGGAATTATCGCCGCCGTCTGGCGTAACCGTTGGCCGGATCGATTGAGTATGACCATTGCGGTGTCGGGGATCTCGTTTCCGGCATTTGCTCTGGGGATGCTTTTAA‑TTCAGGTATTCTCCGTTGAACTGGGC‑TGGCTGCCTACCGTGGGAGCAGACAGTTGGCAGCACTACATTTTACCC‑TCCCTGACGCTCGGCGCGGCAGTGGCCGCCGTGATGGCGCGCTTTACCCGCGCGTCGTTTGTCGATGTTTTAAGCGAAGATTATATGCGTACCGCGa > 1:408302/1‑289 (MQ=255) tATGGCGGCGTGAATTATCGCCGCCGTCTGGCGTAACCGTTGGCCGGATCGATTGAGTATGACCATTGCGGTGTCGGGGATCTCGTTTCCGGCATTTGCTCTGGGGATGCTTTTAA‑TTCAGGTATTCTCCGTTGAACTGGGC‑TGGCTGCCTACCGTGGGAGCAGACAGTTGGCAGCACTACATTTTACCC‑TCCCTGACGCTCGGCGCGGCAGTGGCCGCCGTGATGgcgcg < 2:1646444/231‑1 (MQ=255) tATGGCGGCGGGAATTATCGCCGCCGTCTGGCGTAACCGTTGGCCGGATCGATTGAGTATGACCATTGCGGTGTCGGGGATCTCGTTTCCGGCATTTGCTCTGGGGATGCTTTTAA‑TTCAGGTATTCTCCGTTGAACTGGGC‑TGGCTGCCTACCGTGGGAGCAGACAGTTGGCAGCACTACATTTTACCC‑TCCCTGACGCTCGGCGCGGCAGTGGCCGCCGTGATGGCGCGCTTTACCCGCGCGTCGTTTGTCGATGTTTTAAGCGAAGATTATATGCGTACCGCGAgg > 1:906615/1‑289 (MQ=255) tATGGCGGCGGGAATTATCGCCGCCGTCTGGCGTAACCGTTGGCCGGATCGATTGAGTATGACCATTGCGGTGTCGGGGATCTCGTTTCCGGCATTTGCTCTGGGGATGCTTTTAA‑TTCAGGTATTCTCCGTTGAACTGGGC‑TGGCTGCCTACCGTGGGAGCAGACAGTTGGCAGCACTACATTTTACCC‑TCCCTGACGCTCGGCGCGGCAGTGGCCGCCGTGATGGCGCGCTTTACCCGCGCGTCGTTTGTCGATGTTTTAAGCGAAGATTATATGCGTACCGCGAgg > 1:622190/1‑289 (MQ=255) tATGGCGGCGGGAATTATCGCCGCCGTCTGGCGTAACCGTTGGCCGGATCGATTGAGTATGACCATTGCGGTGTCGGGGATCTCGTTTCCGGCATTTGCTCTGGGGATGCTTTTAA‑TTCAGGTATTCTCCGTTGAACTGGGC‑TAGCTGCCTACCGTGGGAGCAGACAGTTGGCAGCACTACATTTTACCC‑TCCCTGACGCTCGGCGCGGCAGTGGCCGCCGTGATGGCGCGCTTTACCCGCGCGTCGTTTGTCGATGTTTTAAGCGAAGATTATATGCGTACCGCGAgg > 1:22514/1‑289 (MQ=255) ggcggcGGGAATTATCGCCGCCGTCTGGCGTAACCGTTGGCCGGATCGATTGAGTATGACCATTGCGGTGTCGGGGATCTCGTTTCCGGCATTTGCTCTGGGGATGCTTTTAA‑TTCAGGTATTCTCCg < 1:1439276/128‑1 (MQ=255) ggcggcGGGAATTATCGCCGCCGTCTGGCGTAACCGTTGGCCGGATCGATTGAGTATGACCATTGCGGTGTCGGGGATCTCGTTTCCGGCATTTGCTCTGGGGATGCTTTTAA‑TTCAGGTATTCTCCg > 2:1439276/1‑128 (MQ=255) ggcggcGGGAATTATCGCCGCCGTCTGGCGTAACCGTTGGCCGGATCGATTGAGTATGACCATTGCGGTGTCGGGGATCTCGTTTCCGGCATTTGCTCTGGGGATGCTTTTAA‑TTCAGGTATTCTCCGTTGAACTGGGC‑TGGCTGCCTACCGTGGGAGCAGACAGTTGGCAGCACTACATTTTACCC‑TCCCTGACGCTCGGCGCGGCAGTGGCCGCCGTGATGGCGCGCTTTACCCGCGCGTCGTTTGTCGATGTTTTAAGCGAAGATTATATGCGTATCGCGAGGGCg > 1:1394805/1‑289 (MQ=255) ggcggcGGGAATTATCGCCGCCGTCTGGCGTAACCGTTGGCCGGATCGATTGAGTATGACCATTGCGGTGTCGGGGATCTCGTTTCCGGCATTTGCTCTGGGGATGCTTTTAA‑TTCAGGTATTCTCCGTTGAACTGGGC‑TGGCTGCCTACCGTGGGAGCAGACAGTTGGCAGCACTACATTTTACCC‑TCCCTGACGCTCGGCGCGGCAGTGGCCGCCGTGATGGCGCGCTTTACCCGCGCGTCGTTTGTCGATGTTTTAAGCGAAGATTATATGCGTACCGCGAGGGCg > 2:57768/1‑289 (MQ=255) cggcggGAATTATCGCCGCCGTCTGGCGTAACCGTTGGCCGGATCGATTGAGTATGACCATTGCGGTGTCGGGGATCTCGTTTCCGGCATTTGCTCTGGGGATGCTTTTAA‑TTCAGGTATTCTCCg < 1:772393/126‑1 (MQ=255) cggcggGAATTATCGCCGCCGTCTGGCGTAACCGTTGGCCGGATCGATTGAGTATGACCATTGCGGTGTCGGGGATCTCGTTTCCGGCATTTGCTCTGGGGATGCTTTTAA‑TTCAGGTATTCTCCg > 2:772393/1‑126 (MQ=255) ggAATTATCGCCGCCGTCTGGCGTAACCGTTGGCCGGATCGATTGAGTATGACCATTGCGGTGTCGGGGATCTCGTTTCCGGCATTTGCTCTGGGGATGCTTTTAA‑TTCAGGTATTCTCCGTTGAACTGGGC‑TGGCTGCCTACCGTGGGAGCAGACAGTTGGCAGCACTACATTTTACCC‑TCCCTGACGCTCGGCGCGGCAGTGGCCGCCGTGATGGCGCGCTTTACCCGCGCGTCGTTTGTCGATGTTTTAAGCGAAGATTATATGCGTACCGCGAGGGCGAAAgggg > 2:1589098/1‑289 (MQ=255) gcaaTTATCGCCGCCGTCTGGCGTAACCGTTGGCCGGATCGATTGAGTATGACCATTGCGGTGTCGGGGATCTCGTTTCCGGCATTTGCTCTGGGGATGCCTTTAA‑TTCAGGTATTCTCCGTTGAACTGTGC‑TGGCTGCCTACCGTGGGCGCAGACAGTTGGCAGCACTACTTTTTACCC‑TCCCTGACGCCCGGCGCGGCCGTCGCCGCCGTCATGCCGCGCTATCCCCCCGCGTCGTTGGTCGTTGTCTTCAGCTAAGCTGCATCGCGTACCGCCGGGGCGCAAgctg > 2:209962/3‑286 (MQ=255) ttATCGGCGCCGTCTGGCGTAACCGTTGGCCGGATCGATTGAGTATGACCATTGCGGTGTCGGGGATCTCGTTTCCGGCATTTGCTCTGGGGATGCTTTTAA‑TTCAGGTATTCTCCGTTGAACTGGGC‑TGGCTGCCTACCGTGGGAGCAGACAGTTGGCAGCACTACATTTTACCC‑TCCCTGACGCTCGGCGCGGCAGTGGCCGCCGTGATGGCGCGCTTTACCCGCGCGTCGTTTGTCGATGTTTTAAGCGAAGATTATATGCGTACCGCGAGGGCGAAAGGGGTGAg < 1:1811813/289‑1 (MQ=255) tCGCCGCCGTCTGGCGTAACCGTTGGCCGGATCGATTGAGTATAACCATTGCGGTGTCGGGGATCTCGTTTCCGGCATTTGCTCTGGGGATGCTTTTAA‑TTCAGGTATTCTCCGTTGAACTGGGC‑TGGCTGCCTACCGTGGGAGCAGACAGTTGGCAGCACTACATTTTACCC‑TCCCTGACGCTCGGCGCGGCAGTGGCCGCCGTGATGGCGCGCTTTACCCGCGCGTCGTTTGTCGATGTTTTAAGCGAAGATTATATGCGTACCGCGAGGGCGAAAGGGGTGAGCGa < 2:484427/289‑1 (MQ=255) ggcTGGCGGAACCGTGGGCCGGAGCGATTGAGTATGACCATTGCGGTGTCGGGGATCTCGTTTCCGGCATTTGCTCGGGGGATGCTTTTAA‑TTCGGGTATTCTCCGTTGAACTGGGC‑TGGCTGCCTACCGTGGGGGCAGACAGTGGGCAGCACTACATTTTACCC‑TCCCGGACGCTCGGCGCGGCAGTGGCCGCCGTGATGGCGCGCTTTACCCGCGCGTCGTTTGTCGATGTTTTAAGCGAAGATTATATGCGTACCGCGAGGGCGAAAGGGGTGAGCGAAACCTggg < 2:1934066/287‑1 (MQ=255) cTGGCGTAACCGTTGGCCGGATCGATTGAGTATGACCATTGCGGTGTCGGGGATCTCGTTTCCGGCATTTGCTCTGGGGATGCTTTTAA‑TTCAGGTATTCTCCGTTGAACTGGGC‑TGGCTGCCTACCGTGGGAGCAGACAGTTGGCAGCACTACATTTTACCC‑TCCCTGACGCTCGGCGCGGCAGTGGCCGCCGTGATGGCGCGCTTTACCCGCGCGTCGTTTGTCGATGTTTTAAGCGAAGATTATATGCGTACCGCGAGGGCGAAAGGGGTGAGCGAAACCTGGGtt < 1:1589098/289‑1 (MQ=255) gTAACCGTTGGCCGGATCGATTGAGTATGACCATTGCGGTGTCGGGGATCTCGTTTCCGGCATTTGCTCTGGGGATGCTTTTAA‑TTCAGGTATTCTCCGTTGAACTGGGC‑TGGCTGCCTACCGTGGGAGCAGACAGTTGGCAGCACTACATTTTACCC‑TCCCTGACGCTCGGCGCGGCAGTGGCCGCCGTGATGGCGCGCTTTACCCGCGCGTCGTTTGTCGATGTTTTAAGCGAAGATTATATGCGTACCGCGAGGGCGAAAGGGGTGAGCGAAACCTGGGTTGTCCt < 1:1535354/289‑1 (MQ=255) aaCCGTTGGCCGGATCGATTGAGTATGACCATTGCGGTGTCGGGGATCTCGTTTCCGGCATTTGCTCTGGGGATGCTTTTAA‑TTCAGGTATTCTCCGTTGAACTGGGC‑TGGCTGCCTACCGTGGGAGCAGACAGTTGGCAGCACTACATTTTACCC‑TCCCTGACGCTCGGCGCGGCAGTGGCCGCCGTGATGGCGCGCTTTACCCGCGCGTCGTTTGCCGATGTTTTAAGCGAAGATTATATGCGTACCGCGAGGGCGAACGGGGTGCGCGAAACCTGGGTTGTCCTCa > 2:461129/1‑289 (MQ=255) cGTTGGCCGGATCGATTGAGTATGACCATTGCGGTGTCGGGGATCTCGTTTCCGGCATTTGCTCTGGGGATGCTTTTAA‑TTCAGGTATTCTCCGTTGAACTGGGC‑TGGCTGCCTACCGTGGGAGCAGACAGTTGGCAGCACTACATTTTACCC‑TCCCTGACGCTCGGCGCGGCAGTGGCCGCCGTGATGGCGCGCTTTACCCGCGCGTCGTTTGTCGATGTTTTAAGCGAAGATTATATGCGTACCGCGAGGGCGAAAGGGGTGAGCGAAACCTGGGTTGTCCTCAAac < 2:1321128/289‑1 (MQ=255) cGTGGGCCGGATCGATTGAGTATGACCATTGCGGTGTCGGGGATCTCGTTTCCGGCATTTGCTCTGGGGATGCTTTTAA‑TTCAGGTAGTCTCCGTTGAACTGGGC‑TGGCTGCCTACCGTGGGAGCAGACAGTTGGCAGCACTACATTTTACCC‑TCCCTGACGCTCGGCGCGGCAGTGGCCGCCGTGATGGCGCGCTTTACCCGCGCGTCGTTTGTCGATGTTTTAAGCGAAGATTATATGCGTACCGCGAGGGCGAAAGGGGTGAGCGAAACCTGGGTTGTCCTCAAac < 1:1600208/289‑1 (MQ=255) tGGCCGGATCGATTGAGTATGACCATTGCGGTGTCGGGGATCTCGTTTCCGGCATTTGCTCTGGGGATGCTTTTAA‑TTCAGGTATTCTCCGTTGAACTGGGC‑TGGCTGCCTACCGTGGGAGCAGACAGTTGGCAGCACTACATTTTACCC‑TCCCTGACGCTCGGCGCGGCAGTGGCCGCCGTGATGGCGCGCTTTACCCGCGCGTCGTTTGTCGATGTTTTAAGCGAAGATTATATGCGTACCGCGAGGGCGAAAGGGGTGAGc > 1:297585/1‑264 (MQ=255) ccGGATCGATTGAGTATGACCATTGCGGTGTCGGGGATCTCGTTTCCGGCATTTGCTCTGGGGATGCTTTTAA‑TTCAGGTATTCTCCGTTGAACTGGGC‑TGGCTGCCTACCGTGGGAGCAGACAGTTGGCAGCACTACATTTTACCC‑TCCCTGACGCTCGGCGCGGCAGTGGCCGCCGTGATGGCGCGCTTTACCCGCGCGTCGTTTGTCGATGTTTTAAGCGAAGATTATATGCGTACCGCGAGGGCGAAAGGGGTGAGCGAAACCTGGGTTGTCCTCAAACACggg < 1:1210225/288‑1 (MQ=255) gATCGATTGAGTATGACCATTGCGGTGTCGGGGATCTCGTTTCCGGCATTTGCTCTGGGGATGCTTTTAA‑TTCAGGTATTCTCCGTTGAACTGGGC‑TGGCTGCCTACCGTGGGAGCAGACAGTTGGCAGCACTACATTTTACCC‑TCCCTGACGCTCGGCGCGGCAGTGGCCGCCGTGATGGCGCGCTTTACCCGCGCGTCGTTTGTCGATGTTTTAAGCGAAGATTATATGCGTACCGCGAGGGCGAAAGGGGTGAGCGAAACCTGGGTTGTCCTCAAACACGGGCTAc > 1:476679/1‑289 (MQ=255) aTCGATTGAGTATGACCATTGCGGTGTCGGGGCTCTCGTTTCCGGCATTTGCTCTGGGGATGCTTTTAA‑TTCAGGTATTCTCCGTTGAACTGGGC‑TGGGTGCCTACCGTGGGAGCAGACAGTTGGCAGCACTACATTTTACCC‑TCCCTGACGCTCGGCGCGGCAGTGGCCGCCGTGATGGCGCGCTTTACCCGCGCGTCGTTTGTCGATGTTTTAAGAGAGGATTTTCTGGGTACCGAGAGGGGCAAAGGGGTGAGGGAAACCTGGGTTGTCCGCaacacagggccacg > 2:674174/1‑277 (MQ=255) aTCGATTGAGTATGACCATTGCGGTGTCGGGGATCTCGTTTCCGGCATTTGCTCTGGGGATGCTTTTAA‑TTCAGGTATTCTCCGTTGAACTGGGC‑TGGCTGCCTACCGTGGGAGCAGACAGTTGGCAGCACTACATTTTACCC‑TCCCTGACGCTCGGCGCGGCAGTGGCCGCCGTGATGGCGCGCTTTACCCGCGCGTCGTTTGTCGATGTTTTAAGCGAAGATTATATGCGTACCGCGAGGGCGAAAGGGGTTAGCGAAACGTGGGTTTTCCTCAAACACGGGCCACg > 2:114535/1‑289 (MQ=255) tCGATTGAGTATGACCATTGCGGTGTCGGGGATCTCGTTTCCGGCATTTGCTCTGGGGATGCTTTTAA‑TTCAGGTATTCTCCGTTGAACTGGGC‑TGGCTGCCTACCGTGGGAGCAGACAGTTGGCAGCACTACATTTTACCC‑TCCCTGACGCTCGGCGCGGCAGTGGCCGCCGTGATGGCGCGCTTTACCCGCGCGTCGTTTGTCGATGTTTTAAGCGAAGATTATATGCGTACCGCGAGGGCGAAAGGGGTGAGCGAAACCTGGGTTGTCCTCAAACACGGGCTACGt < 1:1235836/289‑1 (MQ=255) gATTGAGTATGACCATTGCGGTGTCGGGGATCTCGTTTCCGGCATTTGCTCTGGGGATGCTTTTAA‑TTCAGGTATTCTCCGTTGAACTGGGC‑TGGCTGCCTACCGTGGGAGCAGACAGTTGGCAGCACTACATTTTACCC‑TCCCTGACGCTCGGCGCGGCAGTGGCCGCCGTGATGGCGCGCTTTACCCGCGCGTCGTTTGTCGATGTTTTAAGCGAAGATTATATGCGTACCGCGAGGGCGAAAGGGGTGAGCGAAACCTGGGTTGTCCTCAAACACGGGCTACGTaa < 1:199977/289‑1 (MQ=255) tATGGCCATTTGGGTGTCGGGGATCCCCTTTTCGGGATTTTGTCCGGGGATTGTTTTAATTTCGGGTA‑TCTCCGTTGAACTGGGC‑TGGCTGCCTACCGTGGGAGCAGACAGTTGGCAGCACTACATTTTACCC‑TCCCTGACGCTCGGCGCGGCAGTGGCCGCCGTGATGGCGCGCTTTACCCGCGCGTCGTTTGTCGATGTTTTAAGCGAAGATTATATGCGTACCGCGAGGGCGAAAGGGGTGAGCGAAACCTGGGTTGTCCTCAAACACGGGCTACGTAACGCgat < 1:339665/288‑1 (MQ=255) tATGACCATTGCGGTGTGTGTGATCTTGTTTCCTGCATTTGCTCTGGGGATGCTTTTAA‑TTCAGGTATTGGCCGTTGAACTGGTC‑TGGCTGCCTACCGTGGGAGCAGACAGTTGGCAGCACTACATTTTACCC‑TCCCTGACGCTCGGCGCGGCAGTGGCCTCCGTGATGGCGCGCTTTACCCGCGCGTCGTTTGTCGATGTTTTAAGCGAAGATTATATGCGTACCGCGAGGGCGAAAGGGGTGAGCGAAACCTGGGTTGTCCTCAAACACGGGCTACGTAACGCgat < 2:1286330/288‑1 (MQ=255) tATGACCATTGCGGTGTCGGGGATCTCGTTTCCGGCATTTGCTCTGGGGATGCTTTTAA‑TTCAGGTATTCTCCGTTGAACTGGGC‑TGGCTGCCTACCGTGGGAGCAGACAGTTGGCAGCACTACATTTTACCC‑TCCCTGACGCTCGGCGCGGCAGTGGCCGCCGTGATGGCGCGCTTTACCCGCGCGTCGTTTGTCGATGTTTTAAGCGAAGATTATATGCGTACCGCGAGGGCGAAAGGGGTGAGCGAAACCTGGGtt < 1:684666/259‑1 (MQ=255) tATGACCATTGCGGTGTCGGGGATCTCGTTTCCGGCATTTGCTCTGGGGATGCTTTTAA‑TTCAGGTATTCTCCGTTGAACTGGGC‑TGGCTGCCTACCGTGGGAGCAGACAGTTGGCAGCACTACATTTTACCC‑TCCCTGACGCTCGGCGCGGCAGTGGCCGCCGTGATGGCGCGCTTTACCCGCGCGTCGTTTGTCGATGTTTTAAGCGAAGATTATATGCGTACCGCGAGGGCGAAAGGGGTGAGCGAAACCTGGGTTGTCCTCAAACACGGGCTACGTAACGCgatg > 1:213918/1‑289 (MQ=255) tATGACCATTGCGGTGTCGGGGATCTCGTTTCCGGCATTTGCTCTGGGGATGCTTTTAA‑TTCAGGTATTCTCCGTTGAACTGGGC‑TGGCTGCCTACCGTGGGAGCAGACAGTTGGCAGCACTACATTTTACCC‑TCCCTGACGCTCGGCGCGGCAGTGGCCGCCGTGATGGCGCGCTTTACCCGCGCGTCGTTTGTCGATGTTTTAAGCGAAGATTATATGCGTACCGCGAGGGCGAAAGGGGTGAGCGAAACCTGGGTTGTCCTCAAACACGGGCTACGTAACGCgat < 2:1411281/288‑1 (MQ=255) tATGACCATTGCGGTGTCGGGGATCTCGTTTCCGGCATTTGCTCTGGGGATGCTTTTAA‑TTCAGGTATTCTCCGTTGAACTGGGC‑TGGCTGCCTACCGTGGGAGCAGACAGTTGGCAGCACTACATTTTACCC‑TCCCTGACGCTCGGCGCGGCAGTGGCCGCCGTGATGGCGCGCTTTACCCGCGCGTCGTTTGTCGATGTTTTAAGCGAAGATTATATGCGTACCGCGAGGGCGAAAGGGGTGAGCGAAACCTGGGTTGTCCTCAAACACGGGCTACGTAACGCgat < 1:490835/288‑1 (MQ=255) tATGACCATTGCGGTGTCGGGGATCTCGTTTCCGGCATTTGCTCTGGGGATGCTTTTAA‑TTCAGGTATTCTCCGTTGAACTGGGC‑TGGCTGCCTACCGTGGGAGCAGACAGTTGGCAGCACTACATTTTACCC‑TCCCTGACGCTCGGCGCGGCAGTGGCCGCCGTGATGGCGCGCTTTACCCGCGCGTCGTTTGTCGATGTTTTAAGCGAAGATTATATGCGTACCGCGAGGGCGAAAGGGGTGAGCGAAACCTGGGTTGTCCTCAAACACGGGCTACGTAACGCgat < 1:1155620/288‑1 (MQ=255) aCCATTGCGGTGTCGGGGATCTCGTTTCCGGCATTTGCTCTGGGGATGCTTTTAA‑TTCAGGCATTCTCCGTTGAACTGGGC‑TGGCTGCCTACCGTGGGAGCAGACAGTTGGCAGCCCTACATTTTACCC‑TCCCTGACCCTCGTCGCGGCAGTGGCCGCCCTCATGGCGCGCTTTACCCGCGCGCCGTCTGCCTACGCGTTACGCGGAGATTATATGCGTACCGCGTGGGCGCAAGGGGCGAGCTAAACGTGGGGTGTCCTCATACTACGGCCACGTaaacacgtgatc > 2:1271805/1‑278 (MQ=255) ccATTGCGGTGTCGGGGATCTCGTTTCCGGCATTTGCTCTGGGGATGCTTTTCA‑TTCAGGTATTCTCCGTTGAACTGGGC‑TGGCTGCCTACCGTGGGAGCAGACAGTTGGCAGCACTACATGTTACCC‑TCCCTGACGCTCGGCGCGGCAGTGGCCGCCGTGATGGCGCGCTTTACCCGCGCGTCGTTTGTCGATGTTTTAAGCGAAGATTATATGCGTACCGCGAGGGCGAAAGGGGTGAGCGAAACCTGGGTTGTCCTCAAACACGGGCTACGTAACGCGATGATcc < 2:766387/288‑1 (MQ=255) ccATTGCGGTGTCGGGGATCTCGTTTCCGGCATTTGCTCTGGGGATGCTTTTAA‑TTCAGGTATTCTCCGTTGAACTGGGC‑TGGCTGCCTACCGTGGGAGCAGACAGTTGGCAGCACTACATTTTACCC‑TCCCTGACGCTCGGCGCGGCAGTGGCCGCCGTGATGGCGCGCTTTACCCGCGCGTCGTTTGTCGATGTTTTAAGCGAAGATTATATGCGTACCGCGAGGGCGAAAGGGGTGAGCGAAACCTGGGTTGTCCTCAAACACGGGCTACGTAACGCGATGATccc > 1:1875299/1‑289 (MQ=255) ttGCGGTGTCGGGGATCTCGTTTCCGGCATTTGCTCTGGGGATGCTTTTAA‑TTCAGGTATTCTCCGTTGAACTGGGC‑TGGCTGCCTACCGTGGGAGCAGACAGTTGGCAGCACTACATTTTACCC‑TCCCTGACGCTCGGCGCGGCAGTGGCCGCCGTGATGGCGCGCTTTACCCGCGCGTCGTTTGTCGATGTTTTAAGCg < 2:313961/201‑1 (MQ=255) ttGCGGTGTCGGGGATCTCGTTTCCGGCATTTGCTCTGGGGATGCTTTTAA‑TTCAGGTATTCTCCGTTGAACTGGGC‑TGGCTGCCTACCGTGGGAGCAGACAGTTGGCAGCACTACATTTTACCC‑TCCCTGACGCTCGGCGCGGCAGTGGCCGCCGTGATGGCGCGCTTTACCCGCGCGTCGTTTGTCGATGTTTTAAGCg > 1:313961/1‑201 (MQ=255) tGCGGTGTCGGGGATCTCGTTTCCGGCATTTGCTCTGGGGATGCTTTTAA‑TTCAGGTATGCTCCGTTGAACTGGGC‑TGGCTGCCTACCGTGGGAGCAGACAGTTGGCAGCACTACCTTTTACCC‑TCCCTGACGCTCGGCGCGGCAGTGGCCGCCGTGATGGCGCGCTTTACCCGCGCGTCGTTTGTCGATGTTTTAAGCGAAGATTATATGCGTACCGCGAGGGCGAAAGGGGTGAGCGAAACCTGGGTTGTCCTCAAACACGTGCTACGTAACGCGATGATCCCGGTa < 1:1672898/289‑1 (MQ=255) tGCGGTGTCGGGGATCTCGTTTCCGGCATTTGCGCTGGGGATGCTTTTAA‑TTCAGGTATTCTCCGTTGAACTGGGC‑TGGCTGCCTACCGTGGGAGCAGACAGTTGGCAGCACTACATTTTACCC‑TCCCTGACGCTCGGCGCGGCAGTGGCCGCCGTGATGGCGCGCTTTACCCGCGCGTCGTTTGTCGATGTTTTAAGCGAAGATTATATGCGTACCGCGAGGGCGAAAGGGGTGAGCGAAACCTGGGTTGTCCTCAAACACGGGCTACGTAACGCGATGATCCCGGTa < 1:1309836/289‑1 (MQ=255) ||| AACTGGTGCGTCAGCAGCTGGGGTTGGATCAGCCGCTGTATCACCAGTTCTGGCACTATATCAGCAATGCTGTGCAGGGGGATTTTGGCCTGAGCATGGTGAGCCGTCGTCCGGTTGCCGATGAGATTGCCAGCCGCTTTATGCCAACGCTGTGGCTGACCATAACCAGTATGGTCTGGGCGGTTATATTTGGTATGGCGGCGGGAATTATCGCCGCCGTCTGGCGTAACCGTTGGCCGGATCGATTGAGTATGACCATTGCGGTGAGCGGGATCAGCTTTCCGGCATTTGCTCTGGGGATGCTTTTAA‑TTCAGGTATTCTCCGTTGAACTGGGC‑TGGCTGCCTACCGTGGGAGCAGACAGTTGGCAGCACTACATTTTACCC‑TCCCTGACGCTCGGCGCGGCAGTGGCCGCCGTGATGGCGCGCTTTACCCGCGCGAGCTTTGTCGATGTTTTAAGCGAAGATTATATGCGTACCGCGAGGGCGAAAGGGGTGAGCGAAACCTGGGTTGTCCTCAAACACGGGCTACGTAACGCGATGATCCCGGTA > CP042583/734006‑734553 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |