| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP042583 | 759,415 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP042583 | 759,415 | 0 | A | T | 98.4% | 578.3 / ‑0.5 | 251 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (108/137); minor base G (3/1); total (113/138) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.27e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
| * | CP042583 | 759,416 | 0 | G | C | 100.0% | 589.5 / NA | 251 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base C (113/138); total (113/138) | |||||||||||
| * | CP042583 | 759,417 | 0 | C | G | 100.0% | 598.0 / NA | 251 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (113/138); total (113/138) | |||||||||||
Only 100 of 251 total aligned reads displayed.
TATATCTGGTTGATCTTGCTGTTTCTGCTGCCATTTCTGATTGTCTTTAAAATAAGCCTGGCGGAGATGGCGCGCGCTATTCCACCTTATACCGAACTGATGGAGTGGGCTGACGGGCAACTGTCCATCACTCTTAATCTCGGTAATTTTCTGCAACTGACCGACGATCCGCTCTATTTCGATGCTTATCTCCAGAGCCTACAGGTGGCTGCGATTAGCACATTTTGCTGTTTACTGATCGGCTATCCGCTGGCGTGGGCGGTGGCGCACAGTAAGCCTAGCACCCGTAATATTTTATTACTACTGGTGATCCTGCCGAGCTGGACCAGCTTTCTGATCCGCGTTTATGCCTGGATGGGAATATTAAAAAACAACGGTGTGCTGAATAATTTTCTGCTGTGGCTGGGGGTTATCGATCAACCGCTGACCATTCTGCATACCAATCTGGCCGTTTATATCGGCATTGTTTACGCTTACGTGCCGTTTATGGTACTGCCGATTTATACCGCGTTGATTCGTATTGATTATAGCCTGGTGGAAGCAGCGCTGGATCTCGGTGC > CP042583/759136‑759695 ||| tCTGGTTGATCTTGCTGTTTCTGCTGCCATTTCTGATTGTCTTTAAAATAAGCCTGGCGGAGATGGCGCGCGCTATTCCACCTTATACCGAACTGATGGAGTGGGCTGACGGGCAACTGTCCATCACTCTTAATCTCGGTAATTTTCTGCAACTGACCGACGATCCGCTCTATTTCGATGCTTATCTCCAGTCGCTACAGGTGGCTGCGATTTCGACATTTTGCTGTTTACTGATCGGCTATCCGCTGGCGTGGGCGGTGGCGCACAGTAAGCCTTCGACCCGTAatat < 2:654549/289‑1 (MQ=255) ggtttgtCTTGCTGTTTCTGCTGCCATTTCTGGTGTTCGTTAAAAGAAGCCTGGGGGAGATGGCGCGCGCTCTTCCACCTTATACCGAGCTGATGGGGTGGGCTGACGGGCAACTGTCCATCACTCTTAATCTCGGTAATTTTCTGCAACTGACCGACGATCCGCTCTATTTCGATGCTTATCTCCAGTCGCTACAGGTGGCTGCGATTTCGACATTTTGCTGTTTACTGATCGGATATCCGCTGGCGTGGGCGGTGGCGCACAGTAAGCCTTCGACCCGTAATAtttt < 2:1879504/283‑1 (MQ=255) ggTTGATCTTGCTGTTTCTGCTGCCATTTCTGATTGTCTTTAAAATAAGCCTGGCGGAGATGGCGCGCGCTATTCCACCTTATACCGAACTGATGGAGTGGGCTGACGGGCAACTGTCCATCACTCTTAATCTCGGTAATTTTCTGCAACTGACCGACGATCCGCTCTATTTCGATGCTTATCTCCAGTCGCTACAGGTGGCTGCGCTTTCGACATTTTGCTGTTTACTGATCGGCTATCCGCATGCGTTGGCGGTGGCGGCTAGTGAGCCTGCGACCCGTAAtttttt > 2:1242978/1‑289 (MQ=255) ggTTGATCTTGCTGTTTCTGCTGCCATTTCTGATTGTCTTTAAAATAAGCCTGGCGGAGATGGCGCGCGCTATTCCACCTTATACCGAACTGATGGAGTGGGCTGACGGGCAACTGTCCATCACTCTTAATCTCGGTAATTTTCTGCAACTGACCGACGATCCGCTCTATTTCGATGCTTATCTCCAGTCGCTACAGGTGGCTGCGATTTCGACATTTTGCTGTTTACTGATCGGCTATCCGCTGGCGTGGGCGGTGGCGCACAGTAAGCCTTCGACCCGTAATAtttt < 2:819367/289‑1 (MQ=255) ggTTGATCTTGCTGTTTCTGCTGCCATTTCTGATTGTCTTTAAAATAAGCCTGGCGGAGATGGCGCGCGCTATTCCACCTTATACCGAACTGATGGAGTGGGCTGACGGGCAACTGTCCATCACTCTTAATCTCGGTAATTTTCTGCAACTGACCGACGATCCGCTCTATTTCGATGCTTATCTCCAGTCGCTACAGGTGGCTGCGATTTCGACATTTTGCTGTTTACTGATCGGCTATCCGCTGGCGTGGGCGGTGGCGCACAGTAAGCCTTCGACCCGTAATAtttt > 2:1734554/1‑289 (MQ=255) ggTTGATCTTGCTGTTTCTGCTGCCATTTCTGATTGTCTTTAAAATAAGCCTGGCGGAGATGGCGCGCGCTATTCCACCTTATACCGAACTGATGGAGTGGGCTGACGGGCAACTGTCCATCACTCTTAATCTCGGTAATTTTCTGCAACTGACCGACGATCCGCTCTATTTCGATGCTTATCTCCAGTCGCTACAGGTGGCTGCGATTTCGACATTTTGCTGTTTACTGATCGGCTATCCGCTGGCGTGGGCGGTGGCGCACAGTAAGCCTTCGACCCGTAATAtttt > 1:1401688/1‑289 (MQ=255) tGATCTTGCTGTTTCTGCTGCCATTTCTGATTGTCTTTAAAATAAGCCTGGCGGAGATGGCGCGCGCTATTCCACCTTATACCGAACTGATGGAGTGGGCTGACGGGCAACTGTCCATCACTCTTAATCTCGGTAATTTTCTGCAACTGACCGACGATCCGCTCTATTTCGATGCTTATCTCCAGTCGCTACAGGTGGCTGCGATTTCGACATTTTGCTGTTTACTGATCGGCTATCCGCTGGCGTGGGCGGTGGCGCACAGTAAGCCTTCGACCCGTAATATTttat < 1:570552/288‑1 (MQ=255) tGATCTTGCTGTTTCTGCTGCCATTTCTGATTGTCTTTAAAATAAGCCTGGCGGAGATGGCGCGCGCTATTCCACCTTATACCGAACTGATGGAGTGGGCTGACGGGCAACTGTCCATCACTCTTAATCTCGGTAATTCTCTGCAACTGACCGACGATCCGCTCTATTTCGATGCTTATCTCCAGTCGCTACAGGTGGCTGCGATTTCGACATTTTGCTGTTTACTGATCGGCTATCCGCTGGCGTGGGCGGTGGCGCACAGTAAGCCTTCGACCCGTAATATTttat < 1:307632/288‑1 (MQ=255) gATCTTGCTGTTTCTGCTGCCATTTCTGATTGTGTTTAAAATAAGCCTGGCGGAGATGGCGCGCGCTATTCCACCTTATACCGAACTGATGGAGTGGGCTGACGGGCAACTGTCCATCACTCTTAATCTCGGTAATTTTCTGCAACTGACCGACGATCCGCTCTATTTCGATGCTTATCTCCAGTCGCTACAGGTGGCTGCGATTTCGACATTTTGCTGTTTACTGATCGGCTATCCGCTGGCGTGGGCGGTGGCGCACAGTAAGCCTTCGACCCGTAATATTttatta < 2:1027861/289‑1 (MQ=255) aTCTTGCTGTTTCTGCTGCCATTTCTGATTGTCTTTAAAATAAGCCTGGCGGAGATGGCGCGCGCTATTCCACCTTATACCGAACTGATGGAGTGGGCTGACGGGCAACTGTCCATCACTCTTAATCTCGGTAATTTTCTGCAACTGACCGACGATCCGCTCTATTTCGATGCTTATCTCCAGTCGCTACAGGTGGCTGCGATTTCGACATTTTGCTGTTTACTGATCGGCTATCCGCTGGCGTGGGCGGTGGCGCACAGTAAGCCTTCGACCCGTAATAtttt > 2:1727402/1‑284 (MQ=255) tCTTGCTGTTTCTGCTGCCATTTCTGATTGTCTTTAAAATAAGCCTGGCGGAGATGGCGCGCGCTATTCCACCTTATACCGAACTGATGGAGTGGGCTGACGGGCAACTGTCCATCACTCTTAATCTCGGTAATTTTCTGCAACTGACCGACGATCCGCTCTATTTCGATGCTTATCTCCAGTCGCTACAGGTGGCTGCGATTTCGACATTTTGCTGTTTACTGATCGGCTATCCGCTGGCGTGGGCGGTGGCGCACAGTAAGCCTTCGACCCGTAGTATTTTATtac < 1:1878463/288‑1 (MQ=255) cTGTTTCTGCTGCCATTTCTGATTGTCTTTAAAATAAGCCTGGCGGAGATGGCGCGCGCTATTCCACCTTATACCGAACTGATGGAGTGGGCTGACGGGCAACTGTCCATCACTCTTAATCTCGGTAATTTTCTGCAACTGACCGACGATCCGCTCTATTTCGATGCTTATCTCCAGTCGCTACAGGTGGCTGCGATTTCGACATTTTGCTGTTTACTGATCGGCTATCCGCTGGCGTGGGCGGTGGCGCACAGTAAGCCTTCGACCCGTAATATTTTATTACTACTgg > 1:730071/1‑289 (MQ=255) cTGTTTCTGCTGCCATTTCTGATTGTCTTTAAAATAAGCCTGGCGGAGATGGCGCGCGCTATTCCACCTTATACCGAACTGATGGAGTGGGCTGACGGGCAACTGTCCATCACTCTTAATCTCGGTAATTTTCTGCAACTGACCGACGATCCGCTCTATTTCGATGCTTATCTCCAGTCGCTACAGGTGGCTGCGATTTCGACATTTTGCTGTTTACTGATCGGCTATCCGCTGGCGTGGGCGGTGGCGCACAGGAAGCCTTCGACCCGTAATATTTTATTACTACTgg < 2:1209962/289‑1 (MQ=255) tGTTTCTGCTGCCATTTCTGATTGTCTTTAAAATAAGCCTGGCGGAGATGGCGCGCGCTATTCCACCTTATACCGAACTGATGGAGTGGGCTGACGGGCAACTGTCCATCACTCTTAATCTCGGTAATTTTCTGCAACTGACCGACGATCCGCTCTATTTCGATGCTTATCTCCAGTCGCTACAGGTGGCTGCGATTTCGACATTTTGCTGTTTACTGATCGGCTATCCGCTGGCGTGGGCGGTGGCGCACAGTAAGCCTTCGACCCGTAATATTTTATTACTACTgg < 2:341814/288‑1 (MQ=255) gctgcCATTTCTGATTGTCTTTAAAATAAGCCTGGCGGAGATGGCGCGCGCTATTCCACCTTATACCGTACTGATGGAGTGGGCTGACGGGCAACTGTCCATCACTCTTAATCTCGGTAATTTTCTGCAACTGACCGACGATCCGCTCTATTTCGATGCTTATCTCCAGTCGCTACAGGTGGCTGCGATTTCGACATTTTGCTGTTTACTGATCGGCTATCCGCTGGCGTGGGCGGTGGCGCACAGTAAGCCTTCGACCCGTAATATTTTATTACTACTGGTGATCCTg < 1:847165/289‑1 (MQ=255) gctgcCATTTCTGATTGTCTTTAAAATAAGCCTGGCGGAGATGGCGCGCGCTATTCCACCTTATACCGAACTGATGGAGTGGGCTGACGGGCAACTGTCCATCACTCTTAATCTCGGTAATTTTCTGCAACTGACCGACGATCCGCTCTATTTCGATGCTTATCTCCAGTCGCTACAGGTGGCTGCGATTTCGACATTTTGCTGTTTACTGATCGGCTATCCGCTGGCGTGGGCGGTGGCGCACAGTAAGCCTTCGACCCGTAATATTTTATTACTACTGGTGATCCTg < 2:1650510/289‑1 (MQ=255) aTTTCTGATTGTCTTTAAAATAAGCCTGGCGGAGATGGCGCGCGCTATTCCACCTTATACCGAACTGATGGAGTGGGCTGACGGGCAACTGTCCATCACTCTTAATCTCGGTAATTTTCTGCAACTGACCGACGATCCGCTCTATTTCGATGCTTATCTCCAGTCGCTACAGGTGGCTGCGATTTCGACATTTTGCTGTTTACTGATCGGCTATCCGCTGGCGTGGGCGGTGGCGCACAGTAAGCCTTCGACCCGTAATATTTTATTACTACTGGTGATCCTGCCgtcg < 1:396803/289‑4 (MQ=255) aTTTCTGATTGTCTTTAAAATAAGCCTGGCGGAGATGGCGCGCGCTATTCCACCTTATACCGAACTGATGGAGTGGGCTGACGGGCAACTGTCCATCACTCTTAATCTCGGTAATTTTCTGCAACTGACCGACGATCCGCTCTATTTCGATGCTTATCTCCAGTCGCTACAGGTGGCTGCGATTTCGACATTTTGCTGTTTACTGATCGGCTATCCGCTGGCGTGGGCGGTGGCGCACAGTAAGCCTTCGACCCGTAATATTTTATTACTACTGGTGATCCTGCCgtcg > 1:1481916/1‑286 (MQ=255) tGATTGTCTTTAAAATAAGCCTGGCGGAGATGGCGCGCGCTATTCCACCTTATACCGAACTGATGGAGTGGGCTGACGGGCAACTGTCCATCACTCTTAATCTCGGTAATTTTCTGCAACTGACCGACGATCCGCTCTATTTCGATGCTTATCTCCAGTCGCTACAGGTGGCTGCGATTTCGACATTTTGCTGTTTACTGATCGGCTATCCGCTGGCGTGGGCGGTGGCGCACAGTAAGCCTTCGACCCGTAATATTTTATTACTACTGGTGATCCTGCCgtcgtggac < 2:329070/289‑9 (MQ=255) ttGTCTTTAAAATAAGCCTGGCGGAGATGGCGCGCGCTATTCCACCTTATACCGAACTGATGGAGTGGGCTGACGGGCAACTGTCCATCACTCTTAATCTCGGTAATTTTCTGCAACTGACCGACGATCCGCTCTATTTCGATGCTTATCTCCAGTCGCTACAGGTGGCTGCGATTTCGACATTTTGCTGTTTACTGATCGGCTATCCGCTGGCGTGGGCGGTGGCGCACAGTAAGCCTTCGACCCGTAATATTTTATTACTACTGGTGATCCTGCCGTCGTGGAcctc > 1:941786/1‑287 (MQ=255) ttGTCTTTAAAATAAGCCTGGCGGAGATGGCGCGCGCTATTCCACCTTATACCGAACTGATGGAGTGGGCTGACGGGCAACTGTCCATCACTCTTAATCTCGGTAATTTTCTGCAACTGACCGACGATCCGCTCTATTTCGATGCTTATCTCCAGTCGCTACAGGTGGCTGCGATTTCGACATTTTGCTGTTTACTGATCGGCTATCCGCTGGCGTGGGCGGTGGCGCACAGTAAGCCTTCGACCCGTAATATTTTATTACTACTGGTGATCCTGCCGTCGTGGAcct < 1:766555/288‑2 (MQ=255) ttGTCTTTAAAATAAGCCTGGCGGAGATGGCGCGCGCTATTCCACCTTATACCGAACTGATGGAGTGGGCTGACGGGCAACTGTCCATCACTCTTAATCTCGGTAATTTTCTGCAACTGACCGACGATCCGCTCTATTTCGATGCTTATCTCCAGTCGCTACAGGTGGCTGCGATTTCGACATTTTGCTGTTTACTGATCGGCTATCCGCTGGCGTGGGCGGTGGCGCACAGTAAGCCTTCGACCCGTAATATTTTATTACTACTGGTGATCCTGCCGTCGTGGAcct < 1:812633/288‑2 (MQ=255) aTACGCCTGGCGGGGATTGAGCGGGCTATTCCACATTATACCGATCTAGTGGAGTGGGATGACGGGCAACTGTCCATCTCTCTTGATCTCGGTAATTTTCTGCAACTGCCCGACGATCCGCTCTATTTCGATGCTTATCTCCAGTCGCTACAGGTGGCTGCGATTTCGACATTTTGCTGTTTACTGATCGGCTATCCGCTGGCGTGGGCGGTGGCGCACAGTAAGCCTTCGACCCGTAATATTTTATTACTACTGGTGATCCTGCCGTCGTGGACCTCGTTTCTGAt < 2:216776/287‑1 (MQ=255) aTGGCGCGCGCTATTCCACCTTATACCGAACTGATGGAGTGGGCTGACGGGCAACTGTCCATCACTCTTAATCTCGGTAATTTTCTGCAACTGACCGACGATCCGCTCTATATCGATGCTTATCTCCAGTCGCTACAGGTGGCTGCGATTTCGACATTTTTCTGTTTACTGATCGGCTATCCGCTGGCGTGGGCGGTGGCGCACAGTAAGCCTTCGACCCTTAATATTTTATTACTACTTGGGATCCTGCCGTCGGGGACCGCGTTTCTGATCCGCCTTTCTGcgttgt > 2:199717/1‑284 (MQ=255) cgcgcgcTATTCCACCTTATACCGAACTGATGGAGTGGGCTGACGGGCAACTGTCCATCACTCTTAATCTCGGTAATTTTCTGCAACTGACCGACGATCCGCTCTATTTCGATGCTTATCTCCAGTCGCTACAGGTGGCTGCGATTTCGACATTTTGCTGTTTACTGATCGGCTATCCGCTGGCGTGGGCGGTGGCGCACAGTAAGCCTTCGACCCGTAATATTTTATTACTACTGGTGATCCTGCCGTCGTGGACCTCGTTTCTGATCCGCGTTTATGCCTGGATggg > 2:1335690/1‑289 (MQ=255) gcgcTATTCCCCCTTATCCCGAACTTATGGAGTGGGCTGACGGGCAACTGTCCATCACTCTTAATCTCGGTAATTTTCTGCAACTGACCGACGATCCGCTCTATTTCGATGCTTATCTCCAGTCGCTACAGGTGGCTGCGATTTCGACATTTTGCTGTTTACTGATCGGCTATCCGCTGGCGTGGGCGGTGGCGCACAGTAAGCCTTCGACCCGTAATATTTTATTACTACTGGTGATCCTGCCGTCGTGGACCTCGTTTCTGATCCGCGTTTATGCCTGGATGGGaa < 2:730071/288‑1 (MQ=255) gcgcTATTCCACCTTATACCGAACTGATGGAGTGGGCTGACGGGCAACTGTCCATCACTCTTAATCTCGGTAATTTTCTGCAACTGACCGACGATCCGCTCTATTTCGATGCTTATCTCCAGTCGCTACAGGTGGCTGCGATTTCGACATTTTGCTGTTTACTGATCGGCTATCCGCTGGCGTGGGCGGTGGCGCACAGTAAGCCTTCGACCCGTAATATTTTATTACTACTGGTGATCCTGCCGTCGTGGACCTCGTTTCTGATCCGCGTTTATGCCTGGATGGGaa < 2:508891/288‑1 (MQ=255) tCCACCTTATACCGAACTGATGGAGTGGGCTGACGGGCAACTGTCCATCACTCTTAATCTCGGTAATTTTCTGCAACTGACCGACGTTCCGCTCTATTTCGATGCTTATCTCCAGTCACTACAGGTGGCTGCGATTTCGACATTTTGCTGTTTACTGATCGGCTATCCGCTGGCGTGGGCGGTGGCGCACAGTAAGCCTTCGACCCGTAATATTTTATTACTACTGGTGATCCTGCCGTCGTGGACCTCGTTTCTGATCCGCGTTTATGCCTGGATGGGAATATTaaaa < 2:240950/289‑1 (MQ=255) tataCCGAACTGATGGAGTGGGCTTGCGGGCAACTGTCCATCACTCTTAGTCTCGGTAAGTTTGTGCAACTGAACGACGATCCGCTCTATTTCGATGCTTATCTCCAGTCGCTACAGGTGGCTGCGATTTCGACATTTTGCTGTTTACTGATCGGCTATCCGCTGGCGTGGGCGGTGGCGCACAGTAAGCCTTCGACCCGTAATATTTTATTACTACTGGTGATCCTGCCGTCGTGGACCTCGTTTCTGATCCGCGTTTATGCCTGGATGGGAATATTAAAAAACAACg < 2:1193033/289‑1 (MQ=255) tataCCGAACTGATGGAGTGGGCTGACGGGCAACTGTCCATCACTCTTAATCTCGGTAATTTTCTGCAACTGACCGACGATCCGCTCTATTTCGATGCTTATCTCCAGTCGCTACAGGTGGCTGCGATTTCGACATTTTGCTGTTTACTGATCGGCTATCCGCTGGCGTGGGCGGTGGCGCACAGTAAGCCTTCGACCCGTAATATTTTATTACTACTGGTGATCCTGCCGTCGTGGACCTCGTTTCTGATCCGCGTTTATGCCTGGATGGGAATATTAAAAAACAACg > 1:457417/1‑289 (MQ=255) aaCTGATGGAGTGGGCTGACGGGCAACTGTCCATCACTCTTAATCTCGGTAATTTTCTGCAACTGACCGACGATCCGCTCTATTTCGATGCTTATCTCCAGTCGCTACAGGTGGCTGCGATTTCGACATTTTGCTGTTTACTGATCGGCTATCCGCTGGCGTGGGCGGTGGCGCACAGTAAGCCTTCGACCCGTAATATTTTATTACTACTGGTGATCCTGCCGTCGTGGACCTCGTTTCTGATCCGCGTTTATGCCTGGATGGGAATATTAAAAAACAACGgtgt > 1:1628601/1‑286 (MQ=255) aCTGATGGAGTGGGCTGACGGGCAACTGTCCATCACTCTTAATCTCGGTAATTTTCTGCAACTGACCGACGATCCGCTCTATTTCGATGCTTATCTCCAGTCGCTACAGGTGGCTGCGATTTCGACATTTTGCTGTTTACTGATCGGCTATCCGCTGGCGTGGGCGGTGGCGCACAGTAAGCCTTCGACCCGTAATATTTTATTACTACTGGTGATCCTGCCGTCGTGGACCTCGTTTCTGATCCGCGTTTATGCCTGGATGGGAATATTAAAAAACAACGGTGTGCTg > 2:592576/1‑289 (MQ=255) aTGGAGTGGGCTGACGGGCAACTGTCCATCACTCTTAATCTCGGTAATTTTCTGCAACTGACCGACGATCCGCTCTATTTCGATGCTTATCTCCAGTCGCTACAGGTGGCTGCGATTTCGACATTTTGCTGTTTACTGATCGGCTATCCGCTGGCGTGGGCGGTGGCGCACAGTAAGCCTTCGACCCGTAATATTTTATTACTACTGGTGATCCTGCCGTCGTGGACCTCGTTTCTGATCCGCGTTTATGCCTGGATGGGAATATTAAAAAACAACGGTGTGCTGaata > 2:78635/1‑289 (MQ=255) tGGGCTGACGGGCAACTGTCCATCACTCTTAATCTCGGTAATTTTCTGCAACTGACCGACGATCCGCTCTATTTCGATGCTTATCTCCAGTCGCTACAGGTGGCTGCGATTTCGACATTTTGCTGTTTACTGATCGGCTATCCGCTGGCGTGGGCGGTGGCGCACAGTAAGCCTTCGACCCGTAATATTTTATTACTACTGGTGATCCTGCCGTCGTGGACCTCGTTTCTGATCCGCGTTTATGCCTGGATGGGAATATTAAAAAACAACGGTGTGCTGAATAAttt > 1:1019503/1‑287 (MQ=255) ttataagaagCAGCTGTCCATCACTCTTAATCACGGTAATTTTCTGCAACTTACCGACACTCCGCTCTATTTCGATGCTTATCTCCCGTCGCTACAGGTGGCTGCGATTTCGACATTTTGCTGTTTACTGATCGGCTATCCGCTGGCGTGGGCGGTGGCGCACAGTAAGCCTTCGACCCGTAATATTTTATTACTACTGGTGATCCTGCCGTCGTGGACCTCGTTTCTGATCCGCGTTTATGCCTGGATGGGAATATTAAAAAACAACGGTGTGCTGAATAATTTTctg < 2:1045805/280‑1 (MQ=255) ggCTGACGGGCAACTGTCCATCACTCTTAATCTCGGTAATTTTCTGCAACTGACCGACGATCCGCTCTATTTCGATGCTTATCTCCAGTCGCTACAGGTGGCTGCGATTTCGACATTTTGCTGTTTACTGATCGGCTATCCGCTGGCGTGGGCGGTGGCGCACAGTAAGCCTTCGACCCGTAATATTTTATTACTACTGGTGATCCTGCCGTCGTGGACCTCGTTTCTGATCCGCGTTTATGCCTGGATGGGAATATTAAAAAACAACGGTGTGCTGAATAAtt < 1:1125267/284‑1 (MQ=255) ggCTGACGGGCAACTGTCCATCACTCTTAATCTCGGTAATTTTCTGCAACTGACCGACGATCCGCTCTATTTCGATGCTTATCTCCAGTCGCTACAGGTGGCTGCGATTTCGACATTTTGCTGTTTACTGATCGGCTATCCGCTGGCGTGGGCGGTGGCGCACAGTAAGCCTTCGACCCGTAATATTTTATTACTACTGGTGATCCTGCCGTCGTGGACCTCGTTTCTGATCCGCGTTTATGCCTGGATGGGAATATTAAAAAACAACGGTGTGCTGAATAATTTTct > 2:1286522/1‑288 (MQ=255) tgccGGGCAACTGGCCATTACTGTTAATCTGGGTAATTTTCTGCAACTGCACGACGAGCCGCTCTTTTTAGATGCTTTTCTCCAGTCGCTACCGGTGGCTGCGATTTCGACATTTTGCTGTTTACTGATCGGCTATCCGCTGGCGTGGGCGGTGGCGCACAGTAAGTCTTCGACCCGTAATAATTGATTACTACTGGTGATCCTGCCGTCGTGGACCTCGTTTCTGATCCGCGTTTATGCCTGGATGGGAATATTAAAAAACAACGGTGTGCTGAATAATTTTctgct < 2:1105665/285‑1 (MQ=255) tGACGGGCAACTGTCCATCACTCTTAATCTCGGTAATTTTCTGCAACTGACCGACGATCCGCTCTATTTCGATGCTTATCTCCAGTCGCTACAGGTGGCTGCGATTTCGACATTTTGCTGTTTACTGATCGGCTATCCGCTGGCGTGGGCGGTGGCGCACAGTAAGCCTTCGACCCGTAATATTTTATTACTACTGGTGATCCTGCCGTCGTGGACCTCGTTTCTGATCCGCGTTTATGCCTGGATGGGAATATTAAAAAACAACGGTGTGCTGAATAATTTTctgct < 2:1472515/288‑1 (MQ=255) tGACGGGCAACTGTCCATCACTCTTAATCTCGGTAATTTTCTGCAACTGACCGACGATCCGCTCTATTTCGATGCTTATCTCCAGTCGCTACAGGTGGCTGCGATTTCGACATTTTGCTGTTTACTGATCGGCTATCCGCTGGCGTGGGCGGTGGCGCACAGTAAGCCTTCGACCCGTAATATTTTATTACTACTGGTGATCCTGCCGTCGTGGACCTCGTTTCTGATCCGCGTTTATGCCTGGATGGGAATATTAAAAAACAACGGTGTGCTGAATAATTTTctgct < 2:983406/288‑1 (MQ=255) tGACGGGCAACTGTCCATCACTCTTAATCTCGGTAATTTTCTGCAACTGACCGACGATCCGCTCTATTTCGATGCTTATCTCCAGTCGCTACAGGTGGCTGCGATTTCGACATTTTGCTGTTTACTGATCGGCTATCCGCTGGCGTGGGCGGTGGCGCACAGTAAGCCTTCGACCCGTAATATTTTATTACTACTGGTGATCCTGCCGTCGTGGACCTCGTTTCTGATCCGCGTTTATGCCTGGATGGGAATATTAAAAAACAACGGTGTGCTGAATAATTTTctgct < 1:1242978/288‑1 (MQ=255) cGGGCAACTGTCCATCACTCTTAATCTCGGTAATTTTCTGCAACTGACCGACGATCCGCTCTATTTCGATGCTTATCTCCAGTCGCTACAGGTGGCTGCGATTTCGACATTTTGCTGTTTACTGATCGGCTATCCGCTGGCGTGGGCGGTGGCGCACAGTAAGCCTTCGACCCGTAATATTTTATTACTACTGGTGATCCTGCCGGCGTGGACCTCGTTTCTGATCCGCGTTTATGCCTGGATTGGAATTGTAAAAAAAAACGGTTTGCTGAATAATTTTctgcttggg > 2:1562259/1‑285 (MQ=255) gCAACTTTCCATCACTCTTAATCTCGGTAATTTTCTGCAACTGACCGACGATCCGCTCTATTTCGATGCTTATCTCCAGTCGCTACAGGTGGCTGCGATTTCGACATTTTGCTGTTTACTGATCGGCTATCCGCTGGCGTGGGCGGTGGCGCACAGTAAGCCTTCGACCCGTAATATTTTATTACTACTGGTGATCCTGCCGTCGTGGACCTCGTTTCTGATCCGCGTTTATGCCTGGATGGGAATATTAAAAAACAACGGTGTGCTGAATAATTTTCTGCTGTGGCt < 1:136540/288‑1 (MQ=255) aaCTGTCCATCACTCTTAATCTCGGTAATTTTCTGCAACTGACCGACGATCCGCTCTATTTCGATGCTTATCTCCAGTCGCTACAGGTGGCTGCGATTTCGACATTTTGCTGTTTACTGATCGGCTATCCGCTGGCGTGGGCGGTGGCGCACAGTAAGCCTTCGACCCGTAATATTTTATTACTACTGGTGATCCTGCCGTCGTGGACCTCGTTTCTGATCCGCGTTTATGCCTGGATGGGAATATTAAAAAACAACGGTGTGCTGAATAATTTTCTGCTGTGGCTggg > 1:491155/1‑289 (MQ=255) aaCTGTCCATCACTCTTAATCTCGGTAATTTTCTGCAACTGACCGACGATCCGCTCTATTTCGATGCTTATCTCCAGTCGCTACAGGTGGCTGCGATTTCGACATTTTGCTGTTTACTGATCGGCTATCCGCTGGCGTGGGCGGTGGCGCACAGTAAGCCTTCGACCCGTAATATTTTATTACTACTGGTGATCCTGCCGTCGTGGACCTCGTTTCTGATCCGCGTTTATGCCTGGATGGGAATATTAAAAAACAACGGTGTGCTGAATAATTTTCTGCTGTGGCTgg < 1:1288671/288‑1 (MQ=255) tGTCCATCCCTCTTTAACTCGGTCATTTTCTGCAACTGACCGCCGATCCGCTCTATTTCGATGCTTATCTCCAGTCGCTACAGGTGGCTGCGATTTCGACATTTTGCTGTTTACTGATCGGCTGTCCGCTGGCGTGAGCGGTGGCGCACAGTAAGCCTTCGACCCGTAATATTTTATTACTACTGGTGATCCTGCCGTCGTGGACCTCGTTTCTGATCCGCGTTTATGCCTGGATGGGAATATTAAAAAACAACGGTGTGCTGAATAATTTTCTGCTGTGGCTGGGGGt < 2:1144723/289‑1 (MQ=255) tctTAATCTCGGTAATTTTCTGCAACTGACCGACGATCCGCTCTATTTCGATGCTTATCTCCAGTCGCTACAGGTGGCTGCGATTTCGACATTTTGCTGTTTACTGATCGGCTATCCGCTGGCGTGGGCGGTGGCGCACAGTAAGCCTTCGACCCGTAATATTTTATTACTACTGGTGATCCTGCCGTCGTGGACCTCGTTTCTGATCCGCGTTTATGCCTGGATGGGAATATTAAAAAACAACGGTGTGCTGAATAATTTTCTGCTGTGGCTgg > 1:1045805/1‑275 (MQ=255) ttAATCTCGGTAATTTTCTGCAACTGACCGACGATCCGCTCTATTTCGATGCTTATCTCCAGTCGCTACAGGTGGCTGCGATTTCGACATTTTGCTGTTTACTGATCGGCTATCCGCTGGCGTGGGCGGTGGCGCACAGTAAGCCTTCGACCCGTAatat < 1:118884/160‑1 (MQ=255) aTCTCGTTAATTTGCTGCAACTGACCGACGATCCGCTCTATTTCGATGCTTATCTCCAGTCGCTACCGGTGGCTGCGATTTCGACATTTTGCTGTTTACTGATCGGCTATCCGCTGGCGTGGGCGGTGGCGCACAGTAAGCCTTCGACCCGTAATATTTTATTACTACTGGTGATCCTGCCGTCGTGGACCTCGTTTCTGATCCGCGTTTATGCCTGGATGGGAATATTAAAAAACAACGGTGTGCTGAATAATTTTCTGCTGTGGCTGGGGGTTATCGATCAACCGCt < 2:1169128/289‑1 (MQ=255) ggTAATTTTCTGCAACTGCCCGACGATCCGCTCTATTTCGATGCTTATCTCCAGTCGCTACAGGTGGCTGCGATTTCGACATTTTGCTGTTTACTGATCGGCTATCCGCTGGCGTGGGCGGTGGCGCACAGTAAGCCTTCGACCCGTAATATTTTATTACTACTGGTGATCCTGCCGTCGTGGACCTCGTTTCTGATCCGCGTTTATGCCTGGATGGGAATATTAAAAAACAACGGTGTGCTGAATAATTTTCTGCTGTGGCTGGGGGTTATCGATCAACCGCTGACCa < 2:463080/289‑1 (MQ=255) ggTAATTTTCTGCAACTGACCGACGATCCGCTCTATTTCGATGCTTATCTCCAGTCGCTACAGGTGGCTGCGATTTCGACATTTTGCTGTTTACTGATCGGCTATCCGCTGGCGTGGGCGGTGGCGCACAGTAAGCCTTCGACCCGTAATATTTTATTACTACTGGTGATCCTGCCGTCGTGGACCTCGTTTCTGATCCGCGTTTATGCCTGGATGGGAATATTaaaaaa < 2:1271520/230‑1 (MQ=255) ggTAATTTTCTGCAACTGACCGACGATCCGCTCTATTTCGATGCTTATCTCCAGTCGCTACAGGTGGCTGCGATTTCGACATTTTGCTGTTTACTGATCGGCTATCCGCTGGCGTGGGCGGTGGCGCACAGTAAGCCTTCGACCCGTAATATTTTATTACTACTGGTGATCCTGCCGTCGTGGACCTCGTTTCTGATCCGCGTTTATGCCTGGATGGGAATATTAAAAAACAACGGTGTGCTGAATAATTTTCTGCTGTGGCTgg < 2:1507631/265‑1 (MQ=255) ggTAATTTTCTGCAACTGACCGACGATCCGCTCTATTTCGATGCTTATCTCCAGTCGCTACAGGTGGCTGCGATTTCGACATTTTGCTGTTTACTGATCGGCTATCCGCTGGCGTGGGCGGTGGCGCACAGTAAGCCTTCGACCCGTAATATTTTATTACTACTGGTGATCCTGCCGTCGTGGACCTCGTTTCTGATCCGCGTTTATGCCTGGATGGGAATATTAAAAAACAACGGTGTGCTGAATAATTTTCTGCTGTGGCTGGGGGTTATCGATCAACCGCTGACCa > 1:1822661/1‑289 (MQ=255) ggTAATTTTCTGCAACTGACCGACGATCCGCTCTATTTCGATGCTTATCTCCAGTCGCTACAGGTGGCTGCGATTTCGACATTTTGCTGTTTACTGATCGGCTATCCGCTGGCGTGGGCGGTGGCGCACAGTAAGCCTTCGACCCGTAATATTTTATTACTACTGGTGATCCTGCCGTCGTGGACCTCGTTTCTGATCCGCGTTTATGCCTGGATGGGAATATTAAAAAACAACGGTGTGCTGAATAATTTTCTGCTGTGGCTGGGGGTTATCGATCAACCGCTGACCa > 2:177343/1‑289 (MQ=255) ggTAATTTTCTGCAACTGACCGACGATCCGCTCTATTTCGATGCTTATCTCCAGTCGCTACAGGTGGCTGCGATTTCGACATTTTGCTGTTTACTGATCGGCTATCCGCTGGCGTGGGCGGTGGCGCACAGTAAGCCTTCGACCCGTAATATTTTATTACTACTGGTGATCCTGCCGTCGTGGACCTCGTTTCTGATCCGCGTTTATGCCTGGATGGGAATATTAAAAAACAACGGTGTGCTGAATAATTTTCTGCTGTGGCTGGGGGTTATCGATCAACCGCTGACCa < 1:544080/289‑1 (MQ=255) aaTTTTCTGCAACTGACCGACGATCCGCTCTATTTCGATGCTTATCTCCAGTCGCTACAGGTGGCTGCGATTTCGACATTTTGCTGTTTACTGATCGGCTATCCGCTGGCGTGGGCGGTGGCGCACAGTAAGCCTTCGACCCGTAATATTTTATTACTACTGGTGATCCTGCCGTCGTGGACCTCGTTTCTGATCCGCGTTTATGCCTGGATGGGAATATTAAAAAACAACGGTGTGCTGAATAATTTTCTGCTGTGGCTGGGGGTTATCGATCAACCGCTGACCAtt < 1:592576/288‑1 (MQ=255) aaTTTTCTGCAACTGACCGACGATCCGCTCTATTTCGATGCTTATCTCCAGTCGCTACAGGTGGCTGCGATTTCGACATTTTGCTGTTTACTGATCGGCTATCCGCTGGCGTGGGCGGTGGCGCACAGTAAGCCTTCGACCCGTAATATTTTATTACTACTGGTGATCCTGCCGTCGTGGACCTCGTTTCTGATCCGCGTTTATGCCTGGATGGGAATATTAAAAAACAACGGTGTGCTGAATAATTTTCTGCTGTGGCTGGGGGTTATCGATCAACCGCTGACCAtt < 1:248252/288‑1 (MQ=255) tGCAACTGACCGACGATCCGCTCTATTTCGATGCTTATCTCCAGTCGCTACAGGTGGCTGCGATTTCGACATTTTGCTGTTTACTGATCGGCTATCCGCTGGCGTGGGCGGTGGCGCACAGTAAGCCTTCGACCCGTAATATTTTATTACTACTGGTGATCCTGCCGTCGTGGACCTCGTTTCTGATCCGCGTTTATGCCTGGATGGGAATATTAAAAAACAACGGTGTGCTGAATAATTTTCTGCTGTGGCTGGGGGTTATCGATCAACCGCTGACCATTCTGCATa > 2:909201/1‑288 (MQ=255) cgaTCCGCTCTATTTCGATGCTTATCTCCAGTCGCTACAGGTGGCTGCGATTTCGACATTTTGCTGTTTACTGATCGGCTATCCGCTGGCGTGGGCGGTGGCGCACAGTAAGCCTTCGACCCGTAATATTTTATTACTACTGGTGATCCTGCCGTCGTGGACCTCGTTTCTGATCCGCGTTTATGCCTGGATGGGAATATTAAAAAACAACGGTGTGCTGAATAATTTTCTGCTGTGGCTGGGGGTTATCGATCAACCGCTGACCATTCTGCATACCAATCTGGCCGtt > 1:1285949/1‑289 (MQ=255) aTCCGCTCTATTTCGATGCTTATCTCCAGTCGCTACAGGTGGCTGCGATTTCGACATTTTGCTGTTTACTGATCGGCTATCCGCTGGCGTGGGCGGTGGCGCACAGTAAGCCTTCGACCCGTAATATTTTATTACTACTGGTGATCCTGCCGTCGTGGACCTCGTTTCTGATCCGCGTTTATGCCTGGATGGGAATATTAAAAAACAACGGTGTGCTGAATAATTTTctgct > 2:1081797/1‑232 (MQ=255) aTCCGCTCTATTTCGATGCTTATCTCCAGTCGCTACAGGTGGCTGCGATTTCGACATTTTGCTGTTTACTGATCGGCTATCCGCTGGCGTGGGCGGTGGCGCACAGTAAGCCTTCGACCCGTAATATTTTATTACTACTGGTGATCCTGCCGTCGTGGACCTCGTTTCTGATCCGCGTTTATGCCTGGATGGGAATATTAAAAAACAACGGTGTGCTGAATAATTTTctgct < 1:1081797/232‑1 (MQ=255) cGCTCTATTTCGATGCTTATCTCCAGTCGCTACAGGTGGCTGCGATTTCGACATTTTGCTGTTTACTGATCGGCTATCCGCTGGCGTGGGCGGTGGCGCACAGTAAGCCTTCGACCCGTAATATTTTATTACTACTGGTGATCCTGCCGTCGTGGACCTCGTTTCTGATCCGCGTTTATGCCTGGATGGGAATATTAAAAAACAACGGTGTGCTGAATAATTTTCTGCTGTGGCTGGGGGTTAt < 2:1831983/244‑1 (MQ=255) tATTTGGATGCTTATCTCCAGTCGCGACAGGTGGCTGCGATTTCGACATTTTGCTGTTTACTGATCGGCTATCCGCTGGCGTGGGCGGTGGCGCACAGTAAGCCTTCGACCCGTAATATTTTATTACTACTGGTGATCCTGCCGTCGTGGACCTCGTTTCTGATCCGCGTTTATGCCTGGATGGGAATATTAAAAAACAACGGTGTGCTGAATAATTTTCTGCTGTGGCTGGGGGTTATCGATCAACCGCTGACCATTCTGCATACCAATCTGGCCGTTTATATCGGCa < 1:1673911/289‑1 (MQ=255) tATTTCGATGCTTATCTCCAGTCGCTACAGGTGGCTGCGATTTCGACATTTTGCTGTTTACTGATCGGCTATCCGCTGGCGTGGGCGGTGGCGCACAGTAAGCCTTCGACCCGTAATATTTTATTACTACTGGTGATCCTGCCGTCGTGGACCTCGTTTCTGATCCGCGTTTATGCCTGGATGGGAATATTAAAAAACAACGGTGTGCTGAATAATTTTCTGCTGTGGCTGGGGGTTATCGATCAACCGCTGACCATTCTGCATACCAATCTGGCCGTTTATATCGGCa < 2:1039861/289‑1 (MQ=255) tATTTCGATGCTTATCTCCAGTCGCTACAGGTGGCTGCGATTTCGACATTTTGCTGTTTACTGATCGGCTATCCGCTGGCGTGGGCGGTGGCGCACAGTAAGCCTTCGACCCGTAATATTTTATTACTACTGGTGATCCTGCCGTCGTGGACCTCGTTTCTGATCCGCGTTTATGCCTGGATGGGAATATTAAAAAACAACGGTGTGCTGAATAATTTTCTGCTGTGGCTGGGGGTTATCGATCAACCGCTGACCATTCTGCATACCAATCTGGCCGTTTATATCGGCa < 2:1628601/289‑1 (MQ=255) tttCGATGCTTATCTCCAGTCGCTACAGGTGGCTGCGATTTCGACATTTTGCTGTTTACTGATCGGCTATCCGCTGGCGTGGGCGGTGGCGCACAGTAAGCCTTCGACCCGTAATATTTTATTACTACTGGTGATCCTGCCGTCGTGGACCTCGTTTCTGATCCGCGTTTATGCCTGGATGGGAATATTAAAAAACAACGGTGTGCTGAATAATTTTCTGCTGTGGCTGGGGGTTATCGATCAACCGCTGACCATTCTGCATACCAATATGGCCGTTTATATCGGCAtt > 1:950478/1‑289 (MQ=255) aTGCTTATCTCCAGTCGCTACAGGTGGCTGCGATTTCGACATTTTGCTGTTTACTGATCGGCTATCCGCTGGCGTGGGCGGTGGCGCACAGTAAGCCTTCGACCCGTAATATTTTATTACTACTGGTGATCCTGCCGTCGTGGACCTCGTTTCTGATCCGCGTTTATGCCTGGATGGGAATATTAAAAAACAACGGTGTGCTGAATAATTTTCTGCTGTGGCTGGGGGTTATCGATCAACCGCTGACCATTCTGCATACCAATCTGGCCGTTTATATCGGCATTGttt > 1:1003871/1‑288 (MQ=255) aTGCTTATCTCCAGTCGCTACAGGTGGCTGCGATTTCGACATTTTGCTGTTTACTGATCGGCTATCCGCTGGCGTGGGCGGTGGCGCACAGTAAGCCTTCGACCCGTAATATTTTATTACTACTGGTGATCCTGCCGTCGTGGACCTCGTTTCTGATCCGCGTTTATGCCTGGATGGGAATATTAAAAAACAACGGTGTGCTGAATAATTTTCTGCTGTGGCTGGGGGTTATCGATCAACCGCTGACCATTCTGCATACCAATCTGGCCGTTTATATCGGCATTGttt > 1:903288/1‑288 (MQ=255) aTGCTTATCTCCAGTCGCTACAGGTGGCTGCGATTTCGACATTTTGCTGTTTACTGATCGGCTATCCGCTGGCGTGGGCGGTGGCGCACAGTAAGCCTTCGACCCGTAATATTTTATTACTACTGGTGATCCTGCCGTCGTGGACCTCGTTTCTGATCCGCGTTTATGCCTGGATGGGAATATTAAAAAACAACGGTGTGCTGAATAATTTTCTGCTGTGGCTGGGGGTTATCGATCAACCGCTGACCATTCTGCATACCAATCTGGCCGTTTATATCGGCATTGttt > 1:329816/1‑288 (MQ=255) tGCTTATCTCCAGTCGCTACAGGTGGCTGCGATTTCGACATTTTGCTGTTTACTGATCGGCTATCCGCTGGCGTGGGCGGTGGCGCACAGTAAGCCTTCGACCCGTAATATTTTATTACTACTGGTGATCCTGCCGTCGTGGACCTCGTTTCTGATCCGCGTTTATGCCTGGATGGGAATATTAAAAAACAACGGTGTGCTGAATAATTTTCTGCTGTGGCTGGGGGTTATCGATCAACCGCTGACCATTCTGCATACCAATCTGGCCGTTTATATCGGCATTGTTTAc > 2:140521/1‑289 (MQ=255) tATCTCCAGTCGCTACAGGTGGCTGCGATTTCGACATTTTGCTGTTTACTGATCGGCTATCCGCTGGCGTGGGCGGTGGCGCACAGTAAGCCTTCGACCCGTAATATTTTATTACTACTGGTGATCCTGCCGTCGTGGACCTCGTTTCTGATCCGCGTTTATGCCTGGATGGGAATATTAAAAAACAACGGTGTGCTGAATAATTTTCTGCTGTGGCTGGGGGTTATCGATCAACCGCTGACCATTCTGCATACCAATCTGGCCGTTTATATCGGCATTGTTTa > 1:1168030/1‑284 (MQ=255) tATCTCCAGTCGCTACAGGTGGCTGCGATTTCGACATTTTGCTGTTTACTGATCGGCTATCCGCTGGCGTGGGCGGTGGCGCACAGTAAGCCTTCGACCCGTAATATTTTATTACTACTGGTGATCCTGCCGTCGTGGACCTCGTTTCTGATCCGCGTTTATGCCTGGATGGGAATATTAAAAAACAACGGTGTGCTGAATAATTTTCTGCTGTGGCTGGGGGTTATCGATCAACCGCTGACCATTCTGCATACCAATCTGGCCGTTTATATCGGCATTGTTTACGCtt > 1:290273/1‑289 (MQ=255) ccagtcgcTACAGGTGGCTGCGATTTCGACATTTTGCTTTTTACTGATCGGCTATCCGCTGGCGTGGGCGGTGGCGCACAGTAAGCCTTCGACCCGTAATATTTTATTACTACTGGTGATCCTGCCGTCGTGGACCTCGTTTCTGATCCGCGTTTATGCCTGGATGGGAATATTAAAAAACAACGGTGTGCTGAATAATTTTCTGCTGTGGCTGGGGGTTATCGATCAACCGCTGACCATTCTGCATACCAATCTGGCCGTTTATATCGGCATTGTTTACGCTTACGTg < 1:1343399/282‑1 (MQ=255) ccagtcgcTACAGGTGGCTGCGATTTCGACATTTTGCTGTTTACTGATCGGCTATCCGCTGGCGTGGGCGGTGGCGCACAGTAAGCCTTCGACCCGTAATATTTTATTACTACTGGTGATCCTGCCGTCGTGGACCTCGTTTCTGATCCGCGTTTATGCCTGGATGGGAATATTAAAAAACAACGGTGTGCTGAATAATTTTCTGCTGTGGCTGGGGGTTATCGATCAACCGCTGACCATTCTGCATACCAATCTGGCCGTTTATATCGGCATTGTTTACGCTTACGTg < 1:641617/282‑1 (MQ=255) ccagtcgcTACAGGTGGCTGCGATTTCGACATTTTGCTGTTTACTGATCGGCTATCCGCTGGCGTGGGCGGTGGCGCACAGTAAGCCTTCGACCCGTAATATTTTATTACTACTGGTGATCCTGCCGTCGTGGACCTCGTTTCTGATCCGCGTTTATGCCTGGATGGGAATATTAAAAAACAACGGTGTGCTGAATAATTTTCTGCTGTGGCTGGGGGTTATCGATCAACCGCTGACCATTCTGCATACCAATCTGGCCGTTTATATCGGCATTGTTTACGCTTACGTg < 1:674871/282‑1 (MQ=255) ccagtcgcTACAGGTGGCTGCGATTTCGACATTTTGCTGTTTACTGATCGGCTATCCGCTGGCGTGGGCGGTGGCGCACAGTAAGCCTTCGACCCGTAATATTTTATTACTACTGGTGATCCTGCCGTCGTGGACCTCGTTTCTGATCCGCGTTTATGCCTGGATGGGAATATTAAAAAACAACGGTGTGCTGAATAATTTTCTGCTGTGGCTGGGGGTTATCGATCAACCGCTGACCATTCTGCATACCAATCTGGCCGTTTATATCGGCATTGTTTACGCTTACGTg < 1:1644928/282‑1 (MQ=255) gtcgcTACAGGTGGCTGCGATTTCGACATTTTGCTGTTTACTGATCGGCTATCCGCTGGCGTGGGCGGTGGCGCACAGTAAGCCTTCGACCCGTAATATTTTATTACTACTGGTGATCCTGCCGTCGTGGACCTCGTTTCTGATCCGCGTTTATGCCTGGATGGGAATATTAAAAAACAACGGTGTGCTGAATAATTTTCTGCTGTGGCTGGGGGTTATCGATCAACCGCTGACCATTCTGCATACCAATCTGGCCGTTTATATCGGCATTGTTTACGCTTACGTGCCg > 1:98586/5‑289 (MQ=255) cgcTACAGGGGGCTGCGATTGCGACATTTTGCTGTTTGCTGATCGGCTATCCGCTGGCGTGGGCGGTGGCGAACAGTAAGCCTTCGACCCGTAATATTTTATTACTACTGGTGATCCTGCCGTCGTGGACCTCGTTTCTGATCCGCGTTTATGCCTGGATGGGAATATTAAAAAACAACGGTGTGCTGAATAATTTTCTGCTGTGGCTGGGGGTTATCGATCAACCGCTGACCATTCTGCATACCAATCTGGCCGTTTATATCGGCATTGTTTACGCTTACGTGcc < 2:440610/284‑1 (MQ=255) aCAGGTGGCTGCGATTTCGACATTTTGCTGTTTACTGATCGGCTATCCGCTGGCGTGGGCGGTGGCGCACAGTAAGCCTTCGACCCGTAATATTTTATTACTACTGGTGATCCTGCCGTCGTGGACCTCGTTTCTGATCCGCGTTTATGCCTGGATGGGAATATTaaaaaa > 2:1836216/1‑171 (MQ=255) aCAGGTGGCTGCGATTTCGACATTTTGCTGTTTACTGATCGGCTATCCGCTGGCGTGGGCGGTGGCGCACAGTAAGCCTTCGACCCGTAATATTTTATTACTACTGGTGATCCTGCCGTCGTGGACCTCGTTTCTGATCCGCGTTTATGCCTGGATGGGAATATTaaaaaa < 1:1836216/171‑1 (MQ=255) ggctgggttttcgccaTTTTGTTGTTTACTGTACGGCTATCCGCTGGCGTGGGCGGTGGCGCACAGTAAGCCTTCGACCCGTACTATTTTATTACTACTGGTGATCCTGCCGTCGTGGACCTCGTTTCTGATCCGCGTTTATGCCTGGATGGGAATATTAAAAAACAACGGTGTGCTGAATAATTTTCTGCTGTGGCTGGGGGTTATCGATCAACCGCTGACCATTCTGCATACCAATCTGGCCGTTTATATCGGCATTGTTTACGCTTACGTGCCGTTTATGGTACTg < 2:74402/275‑1 (MQ=255) gctgctatttcgacaTTTTGCTGTTTACTGATCGGCTATCCGCTGGCGTGGGCGGTGGCGCACAGTAAGCCTTCGACCCGTAATATTTTATTACTACTGGTGATCCTGCCGTCGTGGACCTCGTTTCTGATCCGCGTTTATGCCTGGATGGGAATATTAAAAAACAACGGTGTGCTGAATAATTTTCTGCTGTGGCTGGGGGTTATCGATCAACCGCTGACCATTCTGCATACCAATCTGGCCGTTTATATCGGCATTGTTTACGCTTACGTGCCGTTTATGGTACTg < 1:703950/276‑1 (MQ=255) gCTGCGATTTCGACATTTTGCTGTTTACTGATCGGCTATCCGCTGGCGTGGGCGGTGGCGCACAGTAAGCCTTCGACCCGTAATATTTTATTACTACTGGTGATCCTGCCGTCGTGGACCTCGTTTCTGATCCGCGTTTATGCCTGGATGGG‑ATATTAAAAAACAACGGTGTGCTGAATAATTTTCTGCTGTGGCTGGGGGTTATCGATCAACCGCTGACCATTCTGCATACCAATCTGGCCGTTTATATCGGCATTGTTTACGCTTACGTGCCGTTTATGGTACTg < 2:320792/287‑1 (MQ=255) gCTGCGATTTCGACATTTTGCTGTTTACTGATCGGCTATCCGCTGGCGTGGGCGGTGGCGCACAGTAAGCCTTCGACCCGTAATATTTTATTACTACTGGTGATCCTGCCGTCGTGGACCTCGTTTCTGATCCGCGTTTATGCCTGGATGGG‑ATATTAAAAAACAACGGTGTGCTGAATAATTTTCTGCTGTGGCTGGGGGTTATCGATCAACCGCTGACCATTCTGCATACCAATCTGGCCGTTTATATCGGCATTGTTTACGCTTACGTGCCGTTTATGGTACTg > 1:320792/1‑287 (MQ=255) cTGCGATTTCGACATTTTGCTGTTTACTGATCGGCTATCCGCTGGCGTGGGCGGTGGCGCACAGTAAGCCTTCGACCCGTAATATTTTATTACTACTGGTGATCCTGCCGTCGTGGACCTCGTTTCTGATCCGCGTTTATGCCTGGATGGGAATATTAAAACACAACGGTGTGCTGAATAATTTTCTGCTGTGGCTGGGGGTTATGGATCAACCGCTGACTATTCCTCATACAAATCGGGCCCTTTATATCGGCCTTGTTTACGCTTCCGTGCCGgtttgtgtccttg > 2:1023142/1‑278 (MQ=255) cTGCGATTTCGACATTTTGCTGTTTACTGATCGGCTATCCGCTGACGTGGGCGGTGGCGCACAGTAAGCCTTCGACCCGTAATATTTTATTACTACTGGTGATCCTGCCGTCGTGGACCTCGTTTCTGATCCGCGTTTATGCCTGGATGGGATTATTAAAAAACAACGGTGTGCTGAATAATTTTCTGCTGTGGCTGGGGGTTATCGATCAACCGCTGACCATTCTGCATACCAATCTGGCCGTTTATATCGGCATTGTCTACGCTTACGTGCCGTTTATGGTACTGcc > 1:1906402/1‑289 (MQ=255) gacaTTTTGCTGTTTACTGATCGGCTATCCGCTGGCGTGGGCGGTGGCGCACAGTAAGCCTTCGACCCGTAATATTTTATTACTACTGGTGATCCTGCCGTCGTGGACCTCGTTTCTGATCCGCGTTTATGCCTGGATGGGAATATTAAAAAACAACGGTGTGCTGAATAATTTTCTGCTGTGGCTGGGGGTTATCGATCAACCGCTGACCATTCTGCATACCAATCTGGCCGTTTATATCGGc > 2:529228/2‑244 (MQ=255) gCTGTTTACTGTTCGGCTATCTGCTGGCGTGGGCGGTGGCGCACGGTAAGCCGTCGACCCGTAATATTTTATTACTACTGGGGTTCCTGCCGTCGTGGACCTCGTATCTGATCCGCGTTTATGCCTGGATGGGAATATTAAAGAGCAACGGTGTGCTGAATAATTTTCTGCTGTGGCTGGGGGTTATCGATCAACCGCTGACCATTCTGCATACCAATCTGGCCGTTTATATCGGCATTGTTTACGCTTACGTGCCGTTTATGGTACTGCCGATTTATACCGCGTTGAt < 2:941786/289‑1 (MQ=255) tACTGATCGGCTATCCGCTGGCGTGGGCGGTGGCGCACAGTAAGCCTTCGACCCGTAATATTTTATTACTACTGGTGATCCTGCCGTCGTGGACCTCGTTTCTGATCCGCGTTTATGCCTGGATGGGAATATTAAAAAACAACGGTGTGCTGAATAATTTTCTGCTGTGGCTGGGGGTTATCGATCAACCGCTGACCATTCTGCATACCAATCTGGCCGTTTATATCGGCATTGTTTACGCTTACGTGCCGTTTATGGTACTGCCGATTTATACCGCGTTGATTCGTAt < 1:1731159/289‑1 (MQ=255) aTCGGCTATCCGCTGGCGTGGGCGGTGGCGCACAGTAAGCCTTCGACCCGTAATATTTTATTACTACTGGTGATCCTGCCGTCGTGGACCTCGTTTCTGATCCGCGTTTATGCCTGGATGGGAATATTAAAAAACAACGGTGTGCTGAATAATTTTCTGCTTTGGCTGGGGTTTATCGATCAACCGCTGACCATTCTGCATACCAATCTGGCCGGTTATATCGGCATTGTTTACGCTTACGTGCCGTTTATGGTTCTGCCGCTTTATCACGCGTTGTTTCGTATTGAtt > 2:315135/1‑289 (MQ=255) aTCGGCTATCCGCTGGCGTGGGCGGTGGCGCACAGTAAGCCTTCGACCCGTAATATTTTATTACTACTGGTGATCCTGCCGTCGTGGACCTCGTTTCTGATCCGCGTTTATGCCTGGATGGGAATATTAAAAAACAACGGTGTGCTGAATAATTTTCTGCTGTGGCTGGGGGTTATCGATCAACCGCTGACCATTCTGCATACCAATCTGGCCGTTTATATCGGc < 1:519907/225‑1 (MQ=255) ggCTATCCGCTGGCGTGGGCGGTGGCGCACAGTAAGCCTTCGACCCGTAATATTTTATTACTACTGGTGATCCTGCCGTCGTGGACCTCGTTTCTGATCCGCGTTTATGCCTGGATGGGAATATTAAAAAACAACGGTGTGCTGAATAATTTTCTGCTGTGGCTGGGGGTTATCGATCAACCGCTGACCATTCTGCATACCAATCTGGCCGTTTATATCGGc < 1:1715581/222‑1 (MQ=255) ggCTATCCGCTGGCGTGGGCGGTGGCGCACAGTAAGCCTTCGACCCGTAATATTTTATTACTACTGGTGATCCTGCCGTCGTGGACCTCGTTTCTGATCCGCGTTTATGCCTGGATGGGAATATTAAAAAACAACGGTGTGCTGAATAATTTTCTGCTGTGGCTGGGGGTTATCGATCAACCGCTGACCATTCTGCATACCAATCTGGCCGTTTATATCGGCATTGTTTACGCTTACGTGCCGTTTATGGTACTGCCTATTTATACCTCTTTGATTCGTATTGATtat > 2:1660805/1‑288 (MQ=255) tCCGCTGGCGTGGGCGGTGGCGCACAGTAAGCCTTCGACCCGTAATATTTTATTACTACTGGTGATCCTGCCGTCGTGGACCTCGTTTCTGATCCGCGTTTATGCCTGGATGGGAATATTAAAAAACAACGGTGTGCTGAATAATTTTCTGCTGTGGCTGGGGGTTATCGATCAACGGCTGACCATTCTGCATACCAATCTGTCCGTTTATAGCGGCATTGTTTACGCTTACGTGCCTTTTATGTTTCTTCCGATTTATCCTGCGTTGATTCggtgttattatgc > 2:1395028/1‑273 (MQ=255) cGTGGGCGGTGGCGCACAGTAAGCCTTCGACCCGTAATATTTTATTACTACTGGTGATCCTGCCGTCGTGGACCTCGTTTCTGATCCGCGTTTATGCCTGGATGGGAATATTAAAAAACAACGGTGTGCTGAATAATTTTCTGCTGTGGCTGGGGGTTATCGATCAACCGCTGACCATTCTGCATACCAATCTGGCCGTTTATATCGGCATTGTTTACGCTTACGTGCCGTTTATGGTACTGCCGATTTATACCGCGTTGATTCGTATTGATTATTCGCTGGTGGAag < 2:290273/288‑1 (MQ=255) cGTGGGCGGTGGCGCACAGTAAGCCTTCGACCCGTAATATTTTATTACTACTGGTGATCCTGCCGTCGTGGACCTCGTTTCTGATCCGCGTTTATGCCTGGATGGGAATATTAAAAAACAACGGTGTGCTGAATAATTTTCTGCTGTGGCTGGGGGTTATCGATCAACCGCTGACCATTCTGCATACCAATCTGGCCGTTTATATCGGCATTGTTTACGCTTACGTGCCGTTTATGGTACTGCCGATTTATACCGCGTTGATTCGTATTGATTATTCGCTGGTGGAag < 1:198256/288‑1 (MQ=255) tGGGCGGTGGCGCACAGTAAGCCTTCGACCCGTAATATTTTATTACTACTGGTGATCCTGCCGTCGTGGACCTCGTTTCTGATCCGCGTTTATGCCTGGATGGGAATATTAAAAAACAACGGTGTGCTGAATAATTTTCTGCTGTGGCTGGGGGTTATCGATCAACCGCTGACCATTCTGCATACCAATCTGGCCGTTTATATCGGCATTGTTTACGCTTACGTGCCGTTTATGGTACTGCCGATTTATACCGCGTTGATTCGTATTGATTATTCGCTGGTGGAagca > 1:1600835/1‑288 (MQ=255) ggCGGTGGCGCACAGTAAGCCTTCGACCCGTAATATTTTATTACTACTGGTGATCCTGCCGTCGTGGACCTCGTTTCTGATCCGCGTTTATGCCTGGATGGGAATATTAAAAAACAACGGTGTGCTGAATAATTTTCTGCTGTGGCTGGGGGTTATCGATCAAcc > 1:1361986/1‑165 (MQ=255) tAAGCCTTCGACCCGTAATATTTTATTACTACTGGTGATCCTGCCGTCGTGGACCTCGTTTCTGATCCGCGTTTATGCCTGGATGGGAATATTAAAAAACAACGGTGTGCTGAATAATTTTCTGCTGTGGCTGGGGGTTATCGATCAACCGCTGACCATTCTGCATACCAATCTg > 1:1763649/1‑175 (MQ=255) tAAGCCTTCGACCCGTAATATTTTATTACTACTGGTGATCCTGCCGTCGTGGACCTCGTTTCTGATCCGCGTTTATGCCTGGATGGGAATATTAAAAAACAACGGTGTGCTGAATAATTTTCTGCTGTGGCTGGGGGTTATCGATCAACCGCTGACCATTCTGCATACCAATCTGGCCGTTTATATCGGCATTGTTTACGCTTACGTGCCGTTTATGGTACTGCCGATTTATACCGCGTTGATTCGTATTGATTATTCGCTGGTGGAAGCAGCGCTGGATCTCGGTGc > 1:1309282/1‑288 (MQ=255) ||| TATATCTGGTTGATCTTGCTGTTTCTGCTGCCATTTCTGATTGTCTTTAAAATAAGCCTGGCGGAGATGGCGCGCGCTATTCCACCTTATACCGAACTGATGGAGTGGGCTGACGGGCAACTGTCCATCACTCTTAATCTCGGTAATTTTCTGCAACTGACCGACGATCCGCTCTATTTCGATGCTTATCTCCAGAGCCTACAGGTGGCTGCGATTAGCACATTTTGCTGTTTACTGATCGGCTATCCGCTGGCGTGGGCGGTGGCGCACAGTAAGCCTAGCACCCGTAATATTTTATTACTACTGGTGATCCTGCCGAGCTGGACCAGCTTTCTGATCCGCGTTTATGCCTGGATGGGAATATTAAAAAACAACGGTGTGCTGAATAATTTTCTGCTGTGGCTGGGGGTTATCGATCAACCGCTGACCATTCTGCATACCAATCTGGCCGTTTATATCGGCATTGTTTACGCTTACGTGCCGTTTATGGTACTGCCGATTTATACCGCGTTGATTCGTATTGATTATAGCCTGGTGGAAGCAGCGCTGGATCTCGGTGC > CP042583/759136‑759695 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |