Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 761,216 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 761,216 | 0 | A | T | 100.0% | 661.1 / NA | 280 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base T (140/140); total (140/140) | |||||||||||
* | CP042583 | 761,217 | 0 | G | C | 99.6% | 652.1 / NA | 280 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/0); new base C (139/140); total (140/140) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 761,218 | 0 | C | G | 99.3% | 653.8 / NA | 280 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (2/0); new base G (137/140); total (140/140) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.47e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 280 total aligned reads displayed.
CCTGAATGTGCCTGCGCTGGTGCAGGTGGCGGCGCTCGCCATTATTATGATCCGTGGCCTCGACGTGCTGATGATTTTCAATACGCTGGGCGTGCGCGGTATTGGCGAGTTCATTCATCGCAGCGTACAAACCTGGAGTTTAACGCTGGTCTTTTTAAGCAGTCTGGTGCTGGTTTTCATTGAGATCTGGTGTGCGTTTAGTCTGGTGAAAGGGCGTCGCTGGGCGCGCTGGCTATATCTGCTGACACAAATCACCGCCGCAAGTTACTTGTGGGCGGCTAGCCTGGGGTACGGTTATCCGGAGCTGTTCAGCATTCCCGGTGAAAGTAAACGTGAAATCTTCCATAGCCTGATGCTGCAGAAGCTGCCGGATATGCTCATCCTGATGCTGCTGTTCGTTCCCAGCACCAGTCGGCGGTTCTTCCAGTTGCAATAATGTGTATAATCGTCGCCCCTGATGATGTGAAGGTCAATGTATGCAGTGCGCACTTTACGACGCGGGTCGCTGTCGTTCCTGTCAGTGGATAATGCAGCCGATTCCAGAGCAACTCTCCGCTAAAA > CP042583/760936‑761496 ||| ccTGAATGTGCCTGCGCTGGTGCAGGTGGCGGCGCTCGCCATTATTATGATCCGTGGCCTCGACGTGCTGATGATTTTCAATACGCTGGGCGTGCGCGGTATTGGCGAGTTCATTCATCGCAGCGTACAAACCTGGAGTTTAACGCTGGTCTTTTTAAGCAGTCTGGTGCTGGTTTTCATTGAGATCTGGTGTGCGTTTTCACTGGTGAAAGGGCGTCGCTGGGCGCGCTGGCTATATCTGCTGACACAAATCACCGCCGCAAGTTACTTGTGGGCGGCTTCGCTgggg > 2:113077/1‑289 (MQ=255) ccTGAATGTGCCTGCGCTGGTGCAGGTGGCGGCGCTCGCCATTATTATGATCCGTGGCCTCGACGTGCTGATGATTTTCAATACGCTGGGCGTGCGCGGTATTGGCGAGTTCATTCATCGCAGCGTACAAACCTGGAGTTTAACGCTGGTCTTTTTAAGCAGTCTGGTGCTGGTTTTCATTGAGATCTGGGGTGCGTTTTCACTGGTGAAAGGGCGTCGCTGGGCGCGCTGGCTATATCTGCTGACCCACATCCACGCCGCCAGTTACTTGTGGTCGGCTTCGCTgggg > 2:1949134/1‑289 (MQ=255) aaTGTGCCTGCGCTGGTGCAGGTGGCGGCGCTCGCCATTATTATGATCCGTGGCCTCGACGTGCTGATGATTTTCAATACGCTGGGCGTGCGCGGTATTGGCGAGTTCATTCATCGCAGCGTACAAACCTGGAGTTTAACGCTGGTCTTTTTAAGCAGTCTGGTGCTGGTTTTCATTGAGATCTGGTGTGCGTTTTCACTGGTGAAAGGGCGTCGCTGGGCGCGCTGGCTATATCTGCTGACACAAATCACCGCCGCAAGTTACTTGTGGGCGGCTTCGCTGGGGTACg > 2:968172/1‑289 (MQ=255) aTGTGCCTGCGCTGGTGCAGGTGGCGGCGCTCGCCATTATTATGATCCGTGGCCTCGACGTGCTGATGATTTTCAATACGCTGGGCGTGCGCGGTATTGGCGAGTTCATTCATCGCAGCGTACAAACCTGGAGTTTAACGCTGGTCTTTTTAAGCAGTCTGGTGCTGGTTTTCATTGAGATCTGGTGTGCGTTTTCACTGGTGAAAGGGCGTCGCTGGGCGCGCTGGCTATATCTGCTGACACAAATCACCGCCGCAAGTTACTTGTGGGCGGCTTCGCTGGGGTACgg < 1:170197/289‑1 (MQ=255) aTGTGCCTGCGCTGGTGCAGGTGGCGGCGCTCGCCATTATTATGATCCGTGGCCTCGACGTGCTGATGATTTTCAATACGCTGGGCGTGCGCGGTATTGGCGAGTTCATTCATCGCAGCGTACAAACCTGGAGTTTAACGCTGGTCTTTTTAAGCAGTCTGGTGCTGGTTTTCATTGAGATCTGGTGTGCGTTTTCACTGGTGAAAGGGCGTCGCTGGGCGCGCTGGCTATATCTGCTGACACAAATCACCGCCGCAAGTTACTTGTGGGCGGCTTCGCTGGGGTACgg < 1:652650/289‑1 (MQ=255) tgCCTGCGCTGGTGCAGGTGGCGGCGCTCGCCATTATTATGATCCGTGGCCTCGACGTGCTGATGATTTTCAATACGCTGGGCGTGCGCGGTATTGGCGAGTTCATTCATCGCAGCGTACAAACCTGGAGTTTAACGCTGGTCTTTTTAAGCAGTCTGGTGCTGGTTTTCATTGAGATCTGGTGTGCGTTTTCACTGGTGAAAGGGCGTCGCTGGGCGCGCTGGCTATATCTGCTGACACAAATCACCGCCGCAAGTTACTTGTGGGCGGCTTCGCTGGGGTACgg < 1:489829/286‑1 (MQ=255) cgcTGGTGCAGGTGGCGGCGCTCGCCATTATTATGATCCGTGGCCTCGACGTGCTGATGATTTTCAATACGCTGGGCGTGCGCGGTATTGGCGAGTTCATTCATCGCAGCGTACAAACCTGGAGTTTAACGCTGGTCTTTTTAAGCAGTCTGGTGCTGGTTTTCATTGAGATCTGGTGTGCGTTTTCACTGGTGAAAGGGCGTCGCTGGGCGCGCTGGCTATATCTGCTGACACAAATCACCGCCGCAAGTTACTTGTGGGCGGCTTCGCTGGGGTACgg < 1:793393/280‑1 (MQ=255) cgcTGGTGCAGGTGGCGGCGCTCGCCATTATTATGATCCGTGGCCTCGACGTGCTGATGATTTTCAATACGCTGGGCGTGCGCGGTATTGGCGAGTTCATTCATCGCAGCGTACAAACCTGGAGTTTAACGCTGGTCTTTTTAAGCAGTCTGGTGCTGGTTTTCATTGAGATCTGGTGTGCGTTTTCACTGGTGAAAGGGCGTCGCTGGGCGCGCTGGCTATATCTGCTGACACAAATCACCGCCGCAAGTTACTTGTGGGCGGCTTCGCTGGGGTACGGTTATCCGGa > 1:516189/1‑289 (MQ=255) ggTGCAGGTGGCGGCGCTCGCCATTATTATGATCCGTGGCCTCGACGTGCTGATGATTTTCAATACGCTGGGCGTGCGCGGTATTGGCGAGTTCATTCATCGCAGCGTACAAACCTGGAGTTTAACGCTGGTCTTTTTAAGCAGTCTGGTGCTGGTTTTCATTGAGATCTGGTGTGCGTTTTCACTGGTGAAGGGGCGTCGCTGGGCGCGCTGGCTATATCTGCTGACAAAAATCCCCGCCGCAGGTTACTTGCGGGGGGCCTGCCTGGGGTACGGTTATCCGGac > 2:489829/1‑285 (MQ=255) gTGCAGGTGGCGGCGCTCGCCATTATTATGATCCGTGGCCTCGACGTGCTGATGATTTTCAATACGCTGGGCGTGCGCGGTATTGGCGAGTTCATTCATCGCAGCGTACAAACCTGGAGTTTAACGCTGGTCTTTTTAAGCAGTCTGGTGCTGGTTTTCATTGAGATCTGGTGTGCGTTTTCACTGGTGAAAGGGCGTCGCTGGGCGCGCTGGCTATATCTGCTGACACAAATCACCGCCGCCAGTTACTGGTGGGCGGCTTCGCTGGGGTACGGTTATCGGGAGCTGt > 2:201292/1‑289 (MQ=255) gTGCAGGTGGCGGCGCTCGCCATTATTATGATCCGTGGCCTCGACGTGCTGATGATTTTCAATACGCTGGGCGTGCGCGGTATTGGCGAGTTCATTCATCGCAGCGTACAAACCTGGAGTTTAACGCTGGTCTTTTTAAGCAGTCTGGTGCTGGTTTTCATTGAGATCTGGCGTGCGTTTTCACTGGTGAAAGGGCGTCGCTGGGCGCGCTGGCTATATCTGCTGACACAAATCACCGCCGCAAGTTACTTGTGGGCGGCTTCGCTGGGGTACGGTTATCCGGAGCTGt > 2:244728/1‑289 (MQ=255) ggTGGCGGCGCTCGCCATTATTATGATCCGTGGCCTCGACGTGCTGATGATTTTCAATACGCTGGGCGTGCGCGGTATTGGCGAGTTCATTCATCGCAGCGTACAAACCTGGAGTTTAACGCTGGTCTTTTTAAGCAGTCTGGTGCTGGTTTTCATTGAGATCTGGTGTGCGTTTTCACTGGTGAAATGGCGTCGCTGGGCGCTCTGGCTATATCTGCTGACACAAATCACCGCCGCAAGTGACTTGGTGGCGGCGTCCGTTGGGTACGGTTATGCTGAGCTGtctatc > 2:1645295/1‑284 (MQ=255) cgcTCGCCATTATTATGATCCGTGGCCTCGACGTGCTGATGATTTTCAATACGCTGGGCGTGCGCGGTATTGGCGAGTTAATTCATCGCAGCGTACAAACCTGGAGTTTAACGCTGGTCTTTTTAAGCAGTCTGGTGCTGGTTTTCATTGAGATCTGGTGTGCGTTTTCACTGGTGAAAGGTCGTCGCTGGGCGCGCTGGCTAGATCTGCTTACACAAATCACCGCCGCAATTGACTTGTGGCGGGCCTCTCTGGGGGAGGGGTATGCCGAGCTGTTCAGccatccgcg > 2:896639/1‑281 (MQ=255) gcTCGCCAATATTATGATCCGTGGCCTCGACGTGCTGATGATTTTCAATACGCTGGGCGTGCGCGGTATTGGCGAGTTCATTCATCGCAGCGTACAAACCTGGAGTTTAACGCTGGTCTTTTTAAGCAGTCTGGTGCTGGTTTTCATTGAGATCTGGTGTGCGTTTTCACTGGTGAAAGGGCGTCGCTGGGCGCGCTGGCTATATCTGCTGACACAAATCACCGCCGCAAGTTACTTGTGGGCGGCTTCGCTGGGGTACGGTTATCCGGAGCTGTTCAGCATTCCCGGt < 1:987153/289‑1 (MQ=255) atGATCCGTGGCCTCGACGTGCTGATGATTTTCAATACGCTGGGCGTGCGCGGTATTGGCGAGTTCATTCATCGCAGCGTACAAACCTGGAGTTTAACGCTGGTCTTTTTAAGCAGTCTGGTGCTGGTTTTCATTGAGATCTGGTGTGCGTTTTCACTGGTGAAAGGGCGTCGCTGGGCGCGCTGGCTATATCTGCCGACACAAATCACCGCCGCAAGTTACTTGTGGGCGGCTTCGCTGGGGTACGGTTATCCGGAGCTGTTCAGCATTCCCGGTGAATCAAAACGTg < 1:1312186/289‑1 (MQ=255) aTCCGTGGCCTCGACGTGCTGATGATTTTCAATACGCTGGGCGTGCGCGGTATTGGCGAGTTCATTCATCGCAGCGTACAAACCTGGAGTTTAACGCTGGTCTTTTTAAGCAGTCTGGTGCTGGTTTTCATTGAGATCTGGTGTGCGTTTTCACTGGTGAAAGGGCGTCGCTGGGCGCGCTGGCTATATCTGCTGACACAAATCACCGCCGCAAGTTACTTGTGGGCGGCTTCGCTGGGGTACGGTGATCCGTAGCTGTTCATCATTCCCGGTGaaccaacacttgaaa > 2:323808/1‑276 (MQ=255) aTCCGTGGCCTCGACGTGCTGATGATTTTCAATACGCTGGGCGTGCGCGGTATTGGCGAGTTCATTCATCGCAGCGTACAAACCTGGAGTTTAACGCTGGTCTTTTTAAGCAGTCTGGTGCTGGTTTTCATTGAGATCTGGTGTGCGTTTTCACTGGTGAAAGGGCGTCGCTGGGCGCGCTGGCTATATCTGCTGACACAAATCACCGCCGCAAGTTACTTGTGGGCGGCTTCGCTGGGGTACGGCTATCCGGAGCTGTTCAGCATTCCCGGTGaatcaaacagtgaaa > 2:381608/1‑276 (MQ=255) tCCGTGGCCTCGACGTGCTGATGATTTTCAATACGCTGGGCGTGCGCGGTATTGGCGAGTTCATTCATCGCAGCGTACAAACCTGGAGTTTAACGCTGGTCTTTTTAAGCAGTCTGGTGCTGGTTTTCATTGAGATCTGGTGTGCGTTTTCACTGGTGAAAGGGCGTCGCTGGGCGCGCTGGCTATATCTGCTGACACAAATCACCGCCGCAAGTTACTTGTGGGCGGCTTCGCTGGGGTACGGTTATCCGGAGCTGTTCAGCATTCCCGGTGAATCAAAACGTGAAAt < 1:340475/289‑1 (MQ=255) cGTGGCCTCGACGTGCTGATGATTTTCAATACGCTGGGCGTGCGCGGTATTGGCGAGTTCATTCATCGCAGCGTACAAACCTGGAGTTTAACGCTGGTCTTTTTAAGCAGTCTGGTGCTGGTTTTCATTGAGATCTGGTGTGCGTTTTCACTGGTGAAAGGGCGTCGCTGGGCGCGCTGGCTATATCTGCTGACACAAATCACCGCCGCAAGTTACTTGTGGGCGGCTTCGCTGGGGTACGGTTATCCGGAGCTGTTCAGCATTCCCGGTGAATCAAAACGTGAAATCt > 1:1035164/1‑289 (MQ=255) cGTGGCCTCGACGTGCTGATGATTTTCAATACGCTGGGCGTGCGCGGTATTGGCGAGTTCATTCATCGCAGCGTACAAACCTGGAGTTTAACGCTGGTCTTTTTAAGCAGTCTGGTGCTGGTTTTCATTGAGATCTGGTGTGCGTTTTCACTGGTGAAAGGGCGTCGCTGGGCGCGCTGGCTATATCTGCTGACACAAATCACCGCCGCAAGTTACTTGTGGGCGGCTTCGCTGGGGTACGGTTATCCGGAGCTGTTCAGCATTCCCGGTGAATCAAAACGTGAAATCt > 1:1453321/1‑289 (MQ=255) tGGCCTCGACGTGCTGATGATTTTCAATACGCTGGGCGTGCGCGGTATTGGCGAGTTCATTCATCGCAGCGTACAAACCTGGAGTTTAACGCTGGTCTTTTTAAGCAGTCTGGTGCTGGTTTTCATTGAGATCTGGTGTGCGTTTTCACTGGTGAAAGGGCGTCGCTGGGCGCGCTGGCTATATCTGCTGACACAAATCACCGCCGCAAGTTACTTGTGGGCGGCTTCGCTGGGGTACGGTTATCCGGAGCTGTTCAGCATTCCCGGTGAATCAAAACGTGAAATCtt > 1:1021080/1‑288 (MQ=255) tGGCCTCGACGTGCTGATGATTTTCAATACGCTGGGCGTGCGCGGTATTGGCGAGTTCATTCATCGCAGCGTACAAACCTGGAGGTTAACGCTGGTCTTTTTAAGCAGTCTGGTGCTGGTTTTCATTGAGATCTGGTGTGCGTTTTCACTGGTGAAAGGGCGTCGCTGGGCGCGCTGGCTATATCTGCTGACACAAATCACCGCCGCAAGTTACTTGTGGGCGGCTTCGCTGGGGTACGGTTATCCGGAGCTGTTCAGCATTCCCGGTGAATCAAAACGTGAAATCtt > 1:876935/1‑288 (MQ=255) ccTCGACGTGCTGATGATTTTCAATACGCTGGGCGTGCGCGGTATTGGCGAGTTCATTCATCGCAGCGTACAAACCTGGAGTTTAACGCTGGTCTTTTTAAGCAGTCTGGTGCTGGTTTTCATTGAGATCTGGTGTGCGTTTTCACTGGTGAAAGGGCGTCGCTGGGCGCGCTGGCTATATCTGCTGACACAAATCACCGCCGCAAGTTACTTGTGGGCGGCTTCGCTGGGGTACGGTTATCCGGAGCTGTTCAGCATTCCCGGTGAATCAAAACGTGAAATCTTCCAt > 2:556362/1‑289 (MQ=255) gACGTGCTGATGATTTTCAATACGCTGGGCGTGCGCGGTATTGGCGAGTTCATTCATCGCAGCGTACAAACCTGGAGTTTAACGCTGGTCTTTTTAAGCAGTCTGGTGCTGGTTTTCATTGCGATCTGGTGTGCGTTTTCACTGGTGAAAGGGCGTCGCTGGGCGCGCTGGCTATATCTGCTGACACAAATCACCGCCGCACGTTACTTGTGGGCGGCTTCGCCGGGGTACCGTTTTCCGTAGCTGTTCATCATTCCCGGGGTATCAATACGTGAAATCCTCCAttga > 2:1774627/1‑285 (MQ=255) gACGTGCTGATGATTTTCAATACGCTGGGCGTGCGCGGTATTGGCGAGTTCATTCATCGCAGCGTACAAACCTGGAGTTTAACGCTGGTCTTTTTAAGCAGTCTGGTGCTGGTTTTCATTGAGATCTGGTGTGCGTTTTCACTGGTGAAAGGGCGTCGCTGGGCGCGCTGGCTATATCTGCTGACACAAATCACCGCCGCAAGTTACTTGTGGGCGGCTTCGCTGGGGTACGGTTATCCGGAGCTGTTCAGCATTCCCGGTGAATCAAAACGTGAAATCTTCCATAg > 1:1680132/1‑287 (MQ=255) gACGTGCTGATGATTTTCAATACGCTGGGCGTGCGCGGTATTGGCGAGTTCATTCATCGCAGCGTACAAACCTGGAGTTTAACGCTGGTCTTTTTAAGCAGTCTGGTGCTGGTTTTCATTGAGATCTGGTGTGCGTTTTCACTGGTGAAAGGGCGTCGCTGGGCGCGCTGGCTATATCTGCGGACACAAATCACCGCCGCAAGTTACTTGTGGGCGGCTTCGCTGGGGTACGGTTATCCGGCGCTGTTCCGCATTCCCGGTGTATCCAAACGTGAAATCTTCCagacc > 2:1746839/1‑284 (MQ=255) gTGCTGATGATTTTCAATACGCTGGGCGTGCGCGGTATTGGCGAGTTCATTCATCGCAGCGTACAAACCTGGAGTTTAACGCTGGTCTTTTTAAGCAGTCTGGTGCTGGTTTTCATTGAGATCTGGTGTGCGTTTTCACTGGTGAAAGGGCGTCGCTGGGCGCGCTGGCTATATCTGCTGACACAAATCACCGCCGCAAGTTACTTGTGGGCGGCTTCGCTGGGGTACGGTTATCCGGAGCTGTTCAGCATTCCCGGTGAATCAAAACGTGAAATCTTCCATAGCCTGa < 1:254003/289‑1 (MQ=255) tGCTGATGATTTTCATTACGCGGGGCTGTCGCGGTTTTGGCGTGTTCCTTCATCGCAGCGTACAAACCTGGAGTTTAACGCTGGTCTTTTTAAGCAGTCTGGTGCTGGTTTTCATTGAGATCTGGTGTGCGTTTTCACTGGTGAAAGGGCGTCGCTGGGCGCGCTGGCTATATCTGCTGACACAAATCACCGCCGCAAGTTACTTGTGGGCGGCTTCGCTGGGGTACGGTTATCCGGAGCTGTTCAGCATTCCCGGTGAATCAAAACGTGAAATCTTCCATAGCCTGa < 2:1591497/288‑1 (MQ=255) tCAATACGCTGGGCGTGCGCGGTATTGGCGAGTTCATTCATCGCAGCGTACAAACCTGGAGTTTAACGCTGGTCTTTTTAAGCAGTCTGGTGCTGGTTTTCATTGAGATCTGGTGTGCGTTTTCACTGGTGAAAGGGCGTCGCTGGGCGCGCTGGCTATATCTGCTGACACAAATCACCGCCGCAAGTTACTTGTGGGCGGCTTCGCTGGGGTACGGTTATCCGGAGCTGTTCAGCATTCCCGGTGAATCAAAACGTGAAATCTTCCATAGCCTGATGCTGCAGaa > 1:841098/1‑286 (MQ=255) cGCTGGGCGTGCGCGGTATTGGCGAGTTCATTCATCGCAGCGTACAAACCTGGAGTTTAACGCTGGTCTTTTTAAGCAGTCTGGTGCTGGTTTTCATTGAGATCTGGTGTGCGTTTTCACTGGTGAAAGGGCGTCGCTGGGCGCGCTGGCTATATCTGCTGACACAAATCACCGCCGCAAGTTACTTGTGGGCGGCTTCGCTGGGGTACGGTTATCCGGAGCTGTTCAGCATTCCCGGTGAATCAAAACGTGAAATCTTCCATAGCCTGATGCTGCAGAAGCTGCCGGa < 1:605985/289‑1 (MQ=255) gCTGGGCGTGCGCGGTATTGGCGAGTTCATTCATCGCAGCGTACAAACCTGGAGTTTAACGCTGGTCTTTTTAAGCAGTCTGGTGCTGGTTTTCATTGAGATCTGGTGTGCGTTTTCACTGGTGAAAGGGCGTCGCTGGGCGCGCTGGCTATATCTGCTGACACAAATCACCGCCGCAAGTTACTTGTGGGCGGCTTCGCTGGGGTACGGTTATCCGGAGCTGTTCAGCATTCCCGGTGAATCAAAACGTGAAAt < 2:1907126/255‑1 (MQ=255) 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gTATTGGCGAGTTCATTCATCGCAGCGTACAAACCTGGAGTTTAACGCTGGTCTTTTTAAGCAGTCTGGTGCTGGTTTTCATTGAGATCTGGTGTGCGTTTTCACTGGTGAAAGGGCGTCGCTGGGCGCGCTGGCTATATCTGCTGACACAAATCACCGCCGCAAGTTACTTGTGGGCGGCTTCGCTGGGGTACGGTTATCCGGAGCTGTTCAGCATTCCCGGTGAATCAAAACGTGAAATCTTCCATAGCCTGATGCTGCAGAAGCTGCCGGATATGCTCATCCTGAt > 1:917548/1‑289 (MQ=255) tATTGGCGAGTTCATTCATCGCAGCGTACAAACCTGGAGTTTAACGCTGGTCTTTTTAAGCAGTCTGGTGCTGGTTTTCATTGAGATCTGGTGTGCGTTTTCACTGGTGAAAGGGCGTCGCTGGGCGCGCTGGCTATATCTGCTGACACAAATCACCGCCGCAAGTTACTTGTGGGCGGCTTCGCTGGGGTACGGTTATCCGGAGCTGTTCAGCATTCCCGGTGAATCAAAACGTGAAATCTTCCATAGCCTGATGCTGCAGAAGCTGCCGGATATGCTCATCCTGAtg > 2:1330053/1‑289 (MQ=255) gCGAGTTCATTCATCGCAGCGTACAAACCTGGAGTTTAACGCTGGTCTTTTTAAGCAGTCTGGTGCTGGTTTTCATTGAGATCTGGTGTGCGTTTTCACTGGTGAAAGGGCGTCGCTGGGCGCGCTGGCTATATCTGCTGACACAAATCACCGCCGCAAGTTACTTGTGGGCGGCTTCGCTGGGGTACGGTTATCCGGAGCTGTCCAGCATTCCCGGTGAATCAAAACGTGAAATCTTCCATAGCCTGATGCTGCAGAAg < 1:193826/260‑1 (MQ=255) 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CCTGAATGTGCCTGCGCTGGTGCAGGTGGCGGCGCTCGCCATTATTATGATCCGTGGCCTCGACGTGCTGATGATTTTCAATACGCTGGGCGTGCGCGGTATTGGCGAGTTCATTCATCGCAGCGTACAAACCTGGAGTTTAACGCTGGTCTTTTTAAGCAGTCTGGTGCTGGTTTTCATTGAGATCTGGTGTGCGTTTAGTCTGGTGAAAGGGCGTCGCTGGGCGCGCTGGCTATATCTGCTGACACAAATCACCGCCGCAAGTTACTTGTGGGCGGCTAGCCTGGGGTACGGTTATCCGGAGCTGTTCAGCATTCCCGGTGAAAGTAAACGTGAAATCTTCCATAGCCTGATGCTGCAGAAGCTGCCGGATATGCTCATCCTGATGCTGCTGTTCGTTCCCAGCACCAGTCGGCGGTTCTTCCAGTTGCAATAATGTGTATAATCGTCGCCCCTGATGATGTGAAGGTCAATGTATGCAGTGCGCACTTTACGACGCGGGTCGCTGTCGTTCCTGTCAGTGGATAATGCAGCCGATTCCAGAGCAACTCTCCGCTAAAA > CP042583/760936‑761496 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |