Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
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RA | CP042583 | 791,076 | 3 bp→CGA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP042583 | 791,076 | 0 | G | C | 100.0% | 665.3 / NA | 283 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
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* | CP042583 | 791,077 | 0 | C | G | 99.7% | 660.8 / NA | 283 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base G (153/129); minor base A (1/0); total (154/129) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.97e-01 | |||||||||||
* | CP042583 | 791,078 | 0 | T | A | 99.7% | 673.1 / NA | 283 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base A (153/129); minor base G (1/0); total (154/129) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 283 total aligned reads displayed.
CGCAGCGTGGCGCTAAACAGATGCACTCGCTGAGGAACAACGCTGATGGTCTGTCGTAGAGCCGCTTCATTCAGGCTGGCTATGGGGCTATCGTTAAGCAAAATCTCGCCCTGTTGCGGGTCCCATGCGCGGGTCAGCTGTTGTAACAGTGTACTTTTGCCGCATCCGGTTCGCCCGAGAATCGCTATATGTTCCCCGGCGTTTACCTGAAGAGAAATCCCTTTAAGTGCCTGTTGAGATTGCTCCGGATAAGTGAACTGAACATCCCGTAACGTCAGGCTAACGCGATCGGCAACACGAGTTTGGGTATCAGGAAAGGTGACCTCCGGTTTTTGATCCGTTAAGTCAGAGATACGTACGGCAGAGGCAATGACTTGCCCCAGATGCTGAAATGCACCCGTTACTGGTGCCAGTGCTTCAAACGCGGCTAACGCGCAGAAGACAAACAGGGCAATTAACGCGCCGGGTTGAGCATTGCCGCCAACGCCGCCAGACGCCATCCACAGCATCAGGATCACCGCTAACGCGCCAATGAGCAGCATTATCGCTTGGCTCAAT > CP042583/790798‑791355 ||| cGTGGCGCTAAACAGATGCACTCGCTGAGGAACAACGCTGATGGTCTGTCGTAGAGCCGCTTCATTCAGGCAGGCTATGGGGCTATCGTTAAGCAAAATCTCGCCCTGTTGCGGGTCCCATGCGCGGGTCAGCTGTTGTAACAGTGTTGATTTGCCGCATCCGGTTCGCCCGAGAATCGCTATATGTTCCCCGGCGTTTACCTGAAGAGAAATCCCTTTAAGTGCCTGTTGAGATTGCTCCGGATAAGTGAACTGAACATCCCGTAACGTCAGCGAAACGCGATCGGCa > 1:682331/1‑289 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |