Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 794,903 | 3 bp→TGA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 794,903 | 0 | A | T | 99.5% | 485.2 / NA | 207 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (116/89); minor base C (1/0); total (118/89) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 794,904 | 0 | C | G | 98.6% | 481.3 / NA | 207 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base G (116/88); minor base T (2/1); total (118/89) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 794,905 | 0 | T | A | 99.0% | 478.0 / NA | 207 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base A (116/88); minor base C (2/0); total (118/89) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.08e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 207 total aligned reads displayed.
GTCGCAAGTGTATTCGCCGTTATCGCCATTCAGACGGAACGGACGGTTTTGCAGATCCACCTTGTTGATATGATCAAAAATGATCTCAGTTTCAAACTTGGTGGCATGTTCGTGCATGCGCTCCATTAATAACGGACCGGTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCACTACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGCCCATGAGATCCCCATAGTTGTTGGCAGACAATGGGCAGGATTGTAGGGAATTTACAGACGTAAAAAAAGAGTATGACGATTTTGTTAACAATTTGTGCAATCGGCAGCATCGATAAGCAGGTCAAATTCTCCCGTCATTATCACCTCTGCTACTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTT > CP042583/794624‑795183 ||| cGCAAGTGTATTCGCCGTTATCGCCATTCAGACGGAACGGACGGTTTTGCAGATCCACCTTGTTGATATGATCAAAAATGATCTCAGTTTCAAACTTGGTGGCATGTTCGTGCATGCGCTCCATTAATAACGGACCGGTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGAt > 1:638098/1‑289 (MQ=255) cAAGTGTATTCGCCGTTATCGCCATTCAGACGGAACGGACGGTTTTGCAGATCCACCTTGTTGTTATGATCAAAAATGATCTCAGTTTCAAACTTGGTGGCATGTTCGTGCATGCGCTCCATTAATAACGGACCGGTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATaa < 1:789024/289‑1 (MQ=255) agttgtATTCGCCGTTATCGACATTCAGACGGAACGGACGGTTTTGCAGATCCACCTTGTTGATATGATCAAAAATGATCTCAGTTTCAAACTTGGTGGCATGTTCGTGCATGCGCTCCATTAATAACGGACCGGTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATaa < 2:1498380/285‑1 (MQ=255) gtATTCGCCGTTATCGCCATTCAGACGGAACGGACGGTTTTGCAGATCCACCTTGTTGATATGATCAAAAATGATCTCAGTTTCAAACTTGGTGGCATGTTCGTGCATGCGCTCCATTAATAACGGACCGGTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCa < 1:1136190/287‑1 (MQ=255) ttttCGCCTTTTTGGCCATTCAGGCGGACCGGACGGTTTTGCAGATCCACCTTGTTGATATGATCAAAAATGATCTCAGTTTCAAACTGGGTGGCATGTTCGTGCATGCGCTCCATTAATAACGGACCGGTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGtt < 2:1824827/287‑1 (MQ=255) ttCGCCGTTATCGCCATTCAGACGGAACGGACGGTTTTGCAGATCCACCTTGTTGATATGATCAAAAATGATCTCAGTTTCAAACTTGGTGGCATGTTCGTGCATGCGCTCCATTAATAACGGACCGGTCAGATAGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTTGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGTTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCAGGCGGGCCCGAACCCAGGCTAAGCAGTGTa > 1:681836/1‑289 (MQ=255) gcccGTTATCGCCATTCGGACGGAACGGACGTTTTAGCAGATCGACCTTGTTGTTATGATCAAAAATGGTCTCAGTTTCAAACTTGGTGGCATGTTCGTGCATGCGCTCCATTAATAACGGACCGGTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACt < 2:1062694/287‑1 (MQ=255) gCCATTCAGACGGAACGGACGGTTTTGCAGATCCACCTTGTTGATATGATCAAAAATGATCTCAGTTTCAAACTTGGTGGCATGTTCGTGCATGCGCTCCATTAATAACGGACCGGTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTc < 2:1098631/289‑1 (MQ=255) tCAGACGGAACGGACGGTTTTGCAGATCCACCTTGTTGATATGATCAAAAATGATCTCAGTTTCAAACTTGGTGGCATGTTCGTGCATGCGCTCCATTAATAACGGACCGGTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGc > 1:1782121/1‑288 (MQ=255) tCAGACGGAACGGACGGTTTTGCAGATCCACCTTGTTGATATGATCAAAAATGATCTCAGTTTCAAACTTGGTGGCATGTTCGTGCATGCGCTCCATTAATAACGGACCGGTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGCGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGc > 1:1630503/1‑288 (MQ=255) cggaacggaCGGTTTTGCAGATCCACCTTGTTGATATGATCAAAAATGATCTCAGTTTCAAACTTGGTGGCATGTTCGTGCATGCGCTCCATTAATAACGGACCGGTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGCCCATga < 1:1011871/289‑1 (MQ=255) ggaacggaCGGTTTTGCAGATCCTCCTTGTTGATATGATCAAAAATGATCTCAGTTTCAAACTTGGTGGCATGTTCGTGCATGCGCTCCATTAATAACGGACCGGTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGCCCATgag < 1:1716047/289‑1 (MQ=255) gaacggaCGGTTTTGCAGATCCACCTTGTTGATATGATCAAAAATGATCTCAGTTTCAAACTTGGTGGCATGTTCGTGCATGCGCTCCATTAATAACGGACCGGTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGCCCATgag < 2:899471/288‑1 (MQ=255) acggacggTTTTGCAGATCCACCTTGTTGATATGATCAAAAATGATCTCAGTTTCAAACTTGGTGGCATGTTCGTGCATGCGCTCCATTAATAACGGACCGGTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGCCCATgag > 1:352901/1‑286 (MQ=255) cggTTTTGCAGATGCACCTTGTTGATATTGTCAAAAATGATCTCAGTTGCTAACTGGGTGGCAGGTTCGGGCATGCGCTCCATTAATAACGGACCGCTCAGATCGTTTGGATCGCAAGACCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCGGCGGTTTGCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCTCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCGGTTTACTGTGTTTGGTCGTGCTCATGAGATCCCCa < 2:1527530/288‑1 (MQ=255) ttttGCAGATCCACCTTGTTGATATGATCAAAAATGATCTCAGTTTCAAACTTGGTGGCATGTTCGTGCATGCGCTCCATTAATAACGGACCGGTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTGTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACCGCAGGCGTGTATCCCGCCGGGCGTGAACCCGGGCTAAGCCGTTGACTGCGTTTGGTCGTGCCCATGAGCACCCCATAgt > 2:331799/1‑289 (MQ=255) tCCACCTTGTTGATATGATCAAAAATGATCTCAGTTTCAAACTTGGTGGCATGTTCGTGCATGCGCTCCATTAATAACGGACCGGTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGCCCATGAGATCCCCATAGTTGTTGGc < 2:638098/287‑1 (MQ=255) ccACCTTGTTGATATGATCAAAAATGATCTCAGTTTCAAACTTGGTGGCATGTTCGTGCATGCGCTCCATTAATAACGGACCGGTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGCACCCAGGACAAGCAGTTGACGGGGTTTGGTCGTGCCCATGGGATCCCCATAGTTGTTGGccac > 2:231128/1‑286 (MQ=255) aCCTTTGTGATATGATCAAAAATGATCTCAGTTTCAAACTTGGTGGCGTGTTCGTGCATGCGCTCCATTAATAACGGACCGGTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGCCCATGAGATCCCCATAGTTGTTGGCAGACa < 2:1718957/289‑1 (MQ=255) aCCTTGTTGATATGATCAAAAATGATCTCAGTTTCAAACTTGGTGGCATGTTCGTGCATGCGCTCCATTAATACCGGACCGGTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGCCCATGAGATCCCCATAGTTGTTGGCAGACa < 1:1775152/289‑1 (MQ=255) aCCTTGTTGATATGATCAAAAATGATCTCAGTTTCAAACTTGGTGGCATGTTCGTGCATGCGCTCCATTAATAACGGACCGGTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGCCCATGAGATCCCCATAGTTGTTGGCAGACa < 1:420663/289‑1 (MQ=255) ccTTGTTGATATGATCAAAAATGATCTCAGTTTCAAACTTGGTGGCATGTTCGTGCATGCGCTCCATTAATAACGGACCGGTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGCCCATGAGAt > 1:1462644/1‑267 (MQ=255) gttgttATGATCAAAAATGATCTCAGTTTCAAACTTGGTGGCATGTTCGTGCATGCGCTCCATTAATAACGGACCGGTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGCCCATGAGATCCCCATAGTTGTTGGCAGACAATggg < 1:1533990/289‑1 (MQ=255) gttgATATGATCAAAAATGATCTCAGTTTCAAACTTGGTGGCATGTTCGTGCATGGGCTCTATTAATAACGGACCGGTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGCCCATGAGATCCCCATAGTTGTTGGCAGACAATggg < 1:1940271/289‑1 (MQ=255) gtggATATGATCAAAAATGATCTCAGTTTCAAACTTGGTGGCATGTTCGTGCATCCGCTCCATTAATAACGGACCGGTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGCCCATGAGATCCCCATAGTTGTTGGCAGACAATggg < 1:442703/286‑1 (MQ=255) atGATCAAAAATGATCTCAGTTTCAAACTTGGTGGCATGTTCGTGCATGCGCTCCATTAATAACGGACCGGTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGCCCATGAGATCCCCATAGTTGTTGGCAGACAATGGGCAGGAt > 1:611832/1‑289 (MQ=255) aTCAAAAATGATCTCAGTTTCAAACTTGGTGGCATGTTCGTGCATGCGCTCCATTAATAACGGACCGGTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTg > 1:1161215/1‑244 (MQ=255) aTCAAAAATGATCTCAGTTTCAAACTTGGTGGCATGTTCGTGCATGCGCTCCATTAATAACGGACCGGTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCAGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGCCCATGAGATCCCCATAGTTGTTGGCAGACAATGGGCAGGATTGt > 1:1340800/1‑289 (MQ=255) cAAAAATGATCTCAGTTTCAAACTTGGTGGCATGTTCGTGCATGCGCTCCATTAATAACGGACCGGTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGCCCATGAGATCCCCATAgt > 2:594798/1‑261 (MQ=255) aaaaTGATCTCAGTTTCAAACTTGGTGGCATGTTCGTGCATGCGCTCCATTAATAACGGACCGGTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGCCCATGAGATCCCCATAGTTGTTGGCAGACAATGGGCAGGATTGTAggg < 1:842300/289‑1 (MQ=255) aTCTCAGTTTCAAACTTGGTGGCATGTTCGTGCATGCGCTCCATTAATAACGGACCGGTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGCCCATGAGAt > 2:1584468/1‑244 (MQ=255) aTCTCAGTTTCAAACTTGGTGGCATGTTCGTGCATGCGCTCCATTAATAACGGACCGGTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGGTTGGTCGTGCCCATGAGAACCCCATAGTGTTTGGCAGACAATGGGCAGGATGGTAGGGAATTTa > 2:842300/1‑289 (MQ=255) aGTTTCAAACTTGGTGGCATGTTCGTGCATGCGCTCCATTAATAACGGACCGGTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGAt < 1:892312/204‑1 (MQ=255) ttCAAACTTGGTGGCATGTTCGTGCATGCGCTCCATTAATAACGGACCGGTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGCCCATGAGATCCCCATAGTTGTTGGCAGACAATGGGCAGGATTGTAGGGAATTTACAGACg < 1:623893/287‑1 (MQ=255) cATGTTCGTGCATGCGCTCCATTAATAACGGACCGGTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGCCCATGAGATCCCCATAGTTGTTGGCAGACAATGGGCAGGATTGTAGGGAATTTACAGACGTAAAAAAaga > 1:1251484/1‑283 (MQ=255) cgcTCCATTAATAACGGACCGGTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGCCCATGAGATCCCCATAGTTGTTGGCAGACAATGGGCAGGATTGTAGGGAATTTACAGACGTAAAAAAAGAGTATGACGATTTTGTTAACa > 1:1401623/1‑289 (MQ=255) ccATTAATAACGGACCGGTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGCCCATGAGATCCCCATAGTTGTTGGCAGACAATGGGCAGGATTGTAGGGAATTTACAGACGTAAAAAAAGAGTATGACGATTTTGTTAACAAttt > 2:1786566/1‑289 (MQ=255) aataaCGGACCGGTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGCCCATGAGATCCCCATAGTTGTTGGCAGACAATGGGCAGGATTGTAGGGAATTTACAGACGTAAAAAAAGAGTATGACGATTTTGTTAACAATTTGTGCa < 2:925816/289‑1 (MQ=255) ggACCGGTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGCCCATGAGATCCCCATAGTTGTTGGCAGACAATGGGCAGGATTGTAGGGAATTTACAGACGTAAAAAAAGAGTATGACGATTTTGTTAAc < 1:1481914/273‑1 (MQ=255) ggACCGGTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGCCCATGAGATCCCCATAGTTGTTGGCAGACAATGGGCAGGATTGTAGGGAATTTACAGACGTAAAAAAAGAGTATGACGATTTTGTTAACAATTTGTGCAATCGgc > 1:908935/1‑289 (MQ=255) ggACCGGTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGCCCATGAGATCCCCATAGTTGTTGGCAGACAATGGGCAGGATTGTAGGGAATTTACAGACGTAAAAAAAGAGTATGACGATTTTGTTAACAATTTGTGCAATCGgc > 1:602620/1‑289 (MQ=255) ggACCGGTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGCCCATGAGATCCCCATAGTTGTTGGCAGACAATGGGCAGGATTGTAGGGAATTTACAGACGTAAAAAAAGAGTATGACGATTTTGTTAACAATTTGTGCAATCGgc > 1:400953/1‑289 (MQ=255) ggACCGGTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGGGTTTGGTCATGCCCATGAGATCCCCATAGTTGTTGGCAGACAATGGGCAGGATTGTa > 2:1467007/1‑229 (MQ=255) ggACCGGTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGGGGTTGGTCGTTCGCCTGAGATCCCCATAGTTGTTGGCAGACAATGGGCAGGATTGTAGGGAATTTACAGACGTAGAAAAAGAGTATGACGATTTTGTTAACAATTTGTGCAATTggg > 2:1392452/1‑288 (MQ=255) ggACCGGTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGCTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAACCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGCTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGCCCCTGCCATTCCCATGTTTGTTGGCAGACAATGTGGAGGATGTTAGGAAGATTTCCGACTTAAAAAAAGAGGTTGAAGGTTTTGTTTATAAttttttcatatcgc > 2:792092/1‑278 (MQ=255) aCCGGTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGCCCATGAGATCCCCATAGTTGTTGGCAGACAATGGGCAGGATTGTAGGGAATTTACAGACGTCAAAAAAGAGTATGACGATTTTGTTAACAATTTGTGCAATCGgca > 1:733281/1‑288 (MQ=255) aCCGGTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGCCCATGAGATCCCCATAGTTGTTGGCAGACAATGGGCAGGATTGTAGGGAATTTACAGACGTAAAAAAAGAGTATGACGATTTTGTTAACAATTTGTGCAATCGgca > 1:1173621/1‑288 (MQ=255) aCCGGTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGCCCATGAGATCCCCATAGTTGTTGGCAGACAATGGGCAGGATTGTAGGGAATTTACAGACGTAAAAAAAGAGTATGACGAATTTGTTAACAATTTGTGCAATCGgca > 1:1511776/1‑288 (MQ=255) aCCGGTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGCCCATGAGATCCCCATAGTTGTTGGCAGACAATGGGCAGGATTGTAGGGAATTTACAGACGGAAAAAAAGAGTAATACGATTTTGTTAATAATTtggt > 2:481405/1‑277 (MQ=255) ccGGTCAGTTCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGCCCATGAGATCCCCATAGTTGTTGGCAGACAATGGGCAGGATTGTAGGGAATTTACAGACGTAAAAAAAGAGTATGACGATTTTGTTAACAATTTGTGCAATCGgcag < 1:1749438/288‑1 (MQ=255) ccGGTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGCCCATGAGATCCCCATAGTTGTTGGCAGACAATGGGCa > 2:1508077/1‑218 (MQ=255) ccGGTCAGATCGTTTGGAGCGCCAGGCCAGTTTTCCACGTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGCCCATGAGATCCCCATAGTTGTTGGCAGACAATGGGCAGGATTGTAGGGAATTTACAGACGTAAAAAAAGAGTATGACGATTTTGTTAACAATTTGTGCAATCGgcag < 1:1813651/288‑1 (MQ=255) cGGTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGCCCATGAGATCCCCATAGTTGTTGGTAGACAATGGGCAGGATTGTAGGGAATTTACAGACGTAAAAAAAGAGTATGACGATTTTGTTAACAATTTGTGCAATCGgcagca > 1:558562/1‑289 (MQ=255) cGGTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTAAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGCCCATGAGATCCCCATAGTTGTTGGCAGACAATGGGCTGGATTGTAGGGAATTTACAGACGTAAAAAAAGAGTATGACGATTTTGGTAACAATTTGTTCAATCGgaagca > 2:1079346/1‑289 (MQ=255) ggTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGCCCATGAGATCCCCa < 2:610377/193‑1 (MQ=255) gTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGCCCATGAGATCCCCATAGTTGTTGGCAGACAATGGGCAGGATTGTAgg > 2:1158482/1‑225 (MQ=255) gTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGCCCATGAGATCCCCATAGTTGTTGGCAGACAATGGGCAGGATTGTAGGGAATTTACAGACGTAAAAAAAGAGTATGACGATTTTGTTAACAATTTGTGCAATCgg > 1:1663295/1‑282 (MQ=255) tttGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGCCCATGAGATCCCCATAGTTGTTGGCAGACAATGGGCAGGATTGTAGGGAATTTACAGACGTAAAAAAAGAGTATGACGATTTTGTTAACAATTTGTGCAATCGGCAGCATCGATAAGCAg > 2:176602/1‑289 (MQ=255) ttGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGCCCATGAGATCCCCATAGTTGTTGGCAGACAATGGGCAGGATTGTAGGGAATTTACAGACGTAAAAAAAGAGTATGACGATTTTGTTAACAATTTGTGCAATCGGCAGCATCGATAAGCAgg > 2:421754/1‑289 (MQ=255) ccaggccagTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCGGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCTCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACACAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTTCCGATGAGATCCCCATAGTGGTTGGCAGACATTGGGCAGGATTGTAGGTAATTTACTGACGCAATATAATAGTATGATGATTTTTGTACGAATTTGTTCAATAGACAGCCTCGTTACGCAGGTCAAAtca > 2:300956/1‑287 (MQ=255) caggccagTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGCCCATGAGATCCCCATAGTTGTTGGCAGACAATGGGCAGGATTGTAGGGAATTTACAGACGTAAAAAAAGAGTATGACGATTTTGTTAACAATTTGTGCAATCGGCAGCATCGATAAGCAGGTCAAATtc > 2:190484/1‑288 (MQ=255) gccagTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGCCCATGAGATCCCCATAGTTGTTGGCAGACAATGGGCAGGATTGTAGGGAATTTACAGACGTAAAAAAAGAGTATGACGATTTTGTTAACAATTTGTGCAATCGGCAGCATCGATAAGCAGGTCAAATTCTccc > 1:1153131/1‑289 (MQ=255) ccagTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGCCCATGAGATCCCCATAGTTGTTGGCAGACAATGGGCAGGATTGTAGGGAATTTACAGACGTAAAAAAAGAGTATGACGATTTTGTTAACAATTTGTGCAATCGGCAGCATCGATAAGCAGGTCAAATTCTCCCg < 2:397456/289‑1 (MQ=255) cagTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGCCCATGAGATCCCCATAGTTGTTGGCAGACAATGGGCAGGATTGTAGGGAATTTACAGACGTAAAAAAAGAGTATGACGATTTTGTTAACAATTTGTGCAATCGGCAGCATCGATAAGCAGGTCAAATTCTCCCg < 1:1878150/288‑1 (MQ=255) tttCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGCCCATGAGATCCCCATAGTTGTTGGTAGACAATGGGCAGGATTGTAGGGAATTTACAGACGTAAAAAAAGAGTATGACGATTTTGTTAACAATTTGTGCAATCGGCAGCATCGATAAGCAGGTCAAATTCTCCCGTCAtt < 2:558562/289‑1 (MQ=255) gtggtggtgGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGCCCATGAGATCCCCATAGTTGTTGGCAGACAATGGGCAGGATTGTAGGGAATTTACAGACGTAAAAAAAGAGTATGACGATTTTGTTAACAATTTGTGCAATCGGCAGCATCGATAAGCAGGTCAAATTCTCCCGTCATTATCACCTCTGc < 1:1079346/289‑1 (MQ=255) ggtCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGCCCATGAGATCCCCATAGTTGTTGGCAGACAATGGGCAGGATTGTAGGGAATTTACAGACGTAAAAAAAGAGTATGCCGATTTTGTTAACAATTTGTGCAATCGGCAGCATCGATAAGCAGGTCAAATTCTCCCGTCATTATCACCTCTGCCACTTaaa > 1:1904113/1‑289 (MQ=255) gtCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGCTAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGCCCATGAGATCCCCATAGTTGTTGGCAGACAATGGGCAGGATTGTAGGGAATTTACAGACGTAAAAAAAGAGTATGACGATTTTGTTAACACTTTGTGCAATCGGCCGCATCGATAAGCACGTCAAATTCTCCCTTCATTATccccctgcctacgtccat > 2:1847061/1‑275 (MQ=255) gTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGCCCATGAGATCCCCATAGTTGTTGGCAGACAATGGGCAGGATTGTAGGGAATTTACAGACGTAAAAAAAGAATATGACGATTTTGTTAACAATTTGTGCAATCGGCAGCATCGATAAGCAGGTCAAATTCTCCCGTCATTATCACCTCTGCTACTTAAATTTcc < 1:477008/289‑1 (MQ=255) ttGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTTCCCATGAGATCCCCATAGTTGTTGGCAGACAATGGGCAGGATTGTAGGGAATTTACAGACGTAAAAAAAGAGTATGACGATTTTGTTAACAATTTGTTCAAGTGGTAGCATCGATAAGAAGGTCAAATTCTCCCGTCATTATCACCTCTGCTGCTTAAATTTcc > 2:1341177/1‑288 (MQ=255) tGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCGGCCCAGGTGGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGCCCATGAGATCCCCATAGTTGTTGGCAGACAATGGGCAGGATTGTAGGGAATTTACAGACGTAAAAAAAGAGTATGACGATTTTGTTAACAATTTGTGCAATCGGCAGCATCGATAAGCAGGTCAAATTCTCCCGTCATTATCACCTCTGCTACTTAAATTTcc < 2:1173621/287‑1 (MQ=255) ggCCGCCTTTTTCCATGCAGGTAATCATCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGCCCATGATATCCCCATAGTTGTTGGCAGACAATGGGCAGGATTGTAGGGAATTTACAGACGTAAAAAAAGAGTATGACGATTCTGTTAACAATTTGTGCAATCGGCAGCATCGATAAGCAGGTCAAATTTTCCCGTCATTATCACCTCTGCCACTTAAATTTccc > 1:1303332/1‑287 (MQ=255) tttCCATGCCGTTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGCCCATGAGATCCCCATAGTTGTTGGCAGACAATGGGCAGGATTGTAGGGAATTTACAGACGTAAAAAAAGAGTATGACGATTTTGTTAACAATTTGTGCAATCGGCAGCATCGATAAGCAGGTCAAATTCTCCCGTCATTATCACCTCTGCTACTTAAATTTCCCGCTTTATAAGc < 1:727211/289‑1 (MQ=255) aTGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGCCCATGAGATCCCCATAGTTGTTGGCAGACAATGGGCAGGATTGTAGGGAATTTACAGACGTAAAAAAAGAGTATGACGATTTTGTTAACAATTTGTGCAATCGGCAGCATCGATAAGCAGGTCAAATTCTCCCGTCATTATCACCTCTGCTACTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGAtt < 1:1098042/289‑1 (MQ=255) gCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGCCCATGAGATCCCCATAGTTGTTGGCAGACAATGGGCAGGATTGTAGGGAATTTACAGACGTAAAAAAAGAGTATGACGATTTTGTTAACAATTTGTGCAATCGGCAGCATCGATAAGCAGGTCAAATTCTCCCGTCATTATCACCTCTGCTACTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTaa < 1:527239/289‑1 (MQ=255) tAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGCCCATGAGATCCCCATAGTTGTTGGCAGACAATGGGCAGGATTGTAGGGAATTTACAGACGTAAAAAAAGAGTATGACGATTTTGTTAACAATTTGTGCAATCGGCAGCATCGATAAGCAGGTCAAATTCTCCCGTCATTATCACCTCTGCTACTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAatgat > 1:503045/1‑289 (MQ=255) cacaGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGCCCATGAGATCCCCATAGTTGTTGGCAGACa < 2:623430/125‑1 (MQ=255) cacaGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGCCCATGAGATCCCCATAGTTGTTGGCAGACAATGGGCAGGATTGTAGGGAATTTACAGACGTAAAAAAAGAGTATGACGATTTTGTTAACAATTTGTGCAATCGGCAGCATCGATAAGCAGGTCAAATTCTCCCGTCATTATCACCTCTGCTACTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATaa > 2:696989/1‑288 (MQ=255) acaGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGCCCATGAGATCCCCATAGTTGTTGGCAGACAATGGGCAGGATTGTAGGGAATTTACAGACGTAAAAAAAGAGTATGACGATTTTGTTAACAATTTGTGCAATCGGCAGCATCGATAAGCAGGTCAAATTCTCCCGTCATTATCACCTCTGCTACTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATaaa < 1:1577508/288‑1 (MQ=255) tggcaggttgGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGCCCATGAGATCCCCATAGTTGTTGGCAGACAATGGGCAGGATTGTAGGGAATTTACAGACGTAAAAAAAGAGTATGACGATTTTGTTAACAATTTGTGCAATCGGCAGCATCGATAAGCAGGTCAAATTCTCCCGTCATTATCACCTCTGCTACTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGccc < 1:376247/286‑1 (MQ=255) aggttgGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGCCCATGAGATCCCCATAGTTGTTGGCAGACAATGGGCAGGATTGTAGGGAATTTACAGACGTAAAAAAAGAGTATGACGATTTTGTTAACAATTTGTGCAATCGGCAGCATCGATAAGCAGGTCAAATTCTCCCGTCATTATCACCTCTGCTACTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGccc < 1:5722/284‑1 (MQ=255) aggttgGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGCCCATGAGATCCCCATAGTTGTTGGCAGACAATGGGCAGGATTGTAGGGAATTTACAGACGTAAAAAAAGAGTATGACGATTTTGTTAACAATTTGTGCAATCGGCAGCATCGATAAGCAGGTCAAATTCTCCCGTCATTATCACCTCTGCTACTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGccc > 2:5722/1‑284 (MQ=255) aggttgGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGCCCATGAGATCCCCATAGTTGTTGGCAGACAATGGGCAGGATTGTAGGGAATTTACAGACGTAAAAAAAGAGTATGACGATTTTGTTAACAATTTGTGCAATCGGCAGCATCGATAAGCAGGTCAAATTCTCCCGTCATTATCACCTCTGCTACTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATAAATAAACGCCCCTGtt > 2:143661/1‑289 (MQ=255) ttgGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGCCCATGAGATCCCCATAGTTGTTGGCAGACAATGGGCAGGATTGTAGGGAATTTACAGACGTAAAAAAAGAGTATGACGATTTTGTTAACAATTTGTGCAATCGGCAGCATCGATAAGCAGGTCAAATTCTCCCGTCATTATCACCTCTGCTACTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATaagattttcggctc < 1:236428/287‑13 (MQ=255) ggCGCGCGCCGCGTAGCCAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGGGTTTGTCCGTGCCCATGAGATCCCCATAGTGGTTGCCAGACAATGGGCAGGATTGTAGGGAATTTACAGACGTAAAAAAAGAGTATGACGATTTGGTTAACAATTTGTGCAATCGCCAGCATCGAAAAGCAGTTAAATTTCTCCCGTCATTATCCCCTCTCCTACTTAATTTTCCCGCTTTAAAACCCACTTAAATGATGAATAAATGCCCCGTTTATTGa > 2:1371812/1‑289 (MQ=255) ggCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGCCCATGAGATCCCCATAGTTGTTGGCATACAATGGGCAGGATTGTAGGGAATCTACAGACGTAAAAAAAGAGTATGACGATTTAGTTAACAATTTGTGCAATCGGCAGCATCGATAAGCAGGTCAAATTCTCCCGTCATTAACACCTCTGCCACTTAAATTTCCTGCTTTATAATCCGATTAACTGAAGAATAAACGACCCTGTTAATGa > 2:1590969/1‑289 (MQ=255) ggCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGCCCATGAGATCCCCATAGTTGTTGGCAGACAATGGGCAGGATTGTAGGGAATTTACAGACGTAAAAAAAGAGTATGACGATTTTGTTAACAATTTGTGCAATCGGCAGCATCGATAAGCAGGTCAAATTCTCCCGTCATTATCACCTCTGCTACTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGa > 2:350710/1‑289 (MQ=255) cgcgcgcCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGCCCATGAGATCCCCATAGTTGTTGGCAGACAATGGGCAGGATTGTAGGGAATTTACAGACGTAAAAAAAGAGTATGACGATTTTGTTAACAATTTGTGCAATCGGCAGCATCGATAAGCAGGTCAAATTCTCCCGTCATTATCACCTCTGCTACTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAat > 1:1735307/1‑289 (MQ=255) gccgcGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGCCCATGAGATCCCCATAGTTGTTGGCAGACAATGGGCAGGATTGTAGGGAATTTACAGACGTAAAAAAAGAGTATGACGATTTTGTTAACAATTTGTGCAATCGGCAGCATCGATAAGCAGGTCAAATTCTCCCGTCATTATCACCTCTGCTACTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGccc < 2:1092076/272‑1 (MQ=255) gccgcGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGCCCATGAGATCCCCATAGTTGTTGGCAGACAATGGGCAGGATTGTAGGGAATTTACAGACGTAAAAAAAGAGTATGACGATTTTGTTAACAATTTGTGCAATCGGCAGCATCGATAAGCAGGTCAAATTCTCCCGTCATTATCACCTCTGCTACTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTg < 1:936133/289‑1 (MQ=255) gTAGACGGCAGCGGTGTATGCCGCCGGGCCTGGACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGCCCATGAGATCCCCATAGTTGTTGGCAGACAATGGGCAGGATTGTAGGGAATTTACAGACGTAAAAAAAGAGTATGACGATTTTGTTAACAATTTGTGCAATCGGCAGCATCGATAAGCAGGTCAAATTCTCCCGTCATTATCACCTCTGCTACTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCAtg < 2:733281/289‑1 (MQ=255) tAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTAGTGCGCATGAGATCCCCATATTTGTAAGCAGACAATGGGCAGGATTGTAGGGAATTTACAGACGTAAAAAAAGAGTATGACGATTTTGTTAACAATTTGTGCAATCGGCAGCATCGATAAGCAGGTCAAATTCTCCCGTCATTATCACCTCTGCTACTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCAtg < 2:1804446/288‑1 (MQ=255) gcagcGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGCCCATGAGATCCCCATAGTTGTTGGCAGACAATGGGCAGGATTGTAGGGAATTTACAGACGTAAAAAAAGAGTATGACGATTTTGTTAACAATTTGTGCAATCGGCAGCATCGATAAGCAGGTCAAATTCTCCCGTCATTATCACCTCTGCTACTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACt > 1:290797/1‑289 (MQ=255) agcGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGCCCATGAGATCCCCATAGTTGTTGGCAGACAATGGGCAGGATTGTAGGGAATTTACAGACGTAAAAAAAGAGTATGACGATTTTGTTAACAATTTGTGCAATCGGCAGCATCGATAAGCAGGTCAAATTCTCCCGTCATTATCACCTCTGCTACTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAACAAACGCCCCTGTTAATGAATACCTGGCagtttttacaaa > 2:1686930/1‑278 (MQ=255) tATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGCCCATGAGATCCCCATAGTTGTTGGCAGACAATGGGCAGGATTGTAGGGAATTTACAGACGTAAAAAAAGAGTATGACGATTTTGTTAACAATTTGTGCAATCGGCAGCATCGATAAGCAGGTCAAATTCTCCCGTCATTATCACCTCTGCTACTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGcc < 2:409648/250‑1 (MQ=255) tATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGCCCATGAGATCCCCATAGTTGTTGGCAGACAATGGGCAGGATTGTAGGGAATTTACAGACGTAAAAAAAGAGTATGACGATTTTGTTAACAATTTGTGCAATCGGCAGCATCGATAAGCAGGTCAAATTCTCCCGTCATTATCACCTCTGCTACTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGa > 2:1944588/1‑289 (MQ=255) tCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGCCCATGAGATCCCCATAGTTGTTGGCAGACAATGGGCAGGATTGTAGGGAATTTACAGACGTAAAAAAAGAGTATGACGATTTTGTTAACAATTTGTGCAATCGGCAGCATCGATAAGCAGGTCAAATTCTCCCGTCATTATCACCTCTGCTACTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATg > 2:257934/1‑289 (MQ=255) cgccgGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGCCCATGAGATCCCCATAGTTGTTGGCAGACAATGGGCAGGATTGTAGGGAATTTACAGACGTAAAAAAAGAGTATGACGATTTTGTTAACAATTTGTGCAATCGGCAGCATCGATAAGCAGGTCAAATTCTCCCGTCATTATCACCTCTGCTACTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGc > 1:957619/1‑244 (MQ=255) cgccgGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGCCCATGAGATCCCCATAGTTGTTGGCAGACAATGGGCAGGATTGTAGGGAATTTACAGACGTAAAAAAAGAGTATGACGATTTTGTTAACAATTTGTGCAATCGGCAGCATCGATAAGCAGGTCAAATTCTCCCGTCATTATCACCTCTGCTACTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGc < 2:957619/244‑1 (MQ=255) ccgGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGCCCATGAGATCCCCATAGTTGTTGGCAGACAATGGGCAGGATTGTAGGGAATTTACAGACGTAAAAAAAGAGTATGACGATTTTGTTAACAATTTGTGCAATCGGCAGCATCGATAAGCAGGTCAAATTCTCCCGTCATTATCACCTCTGCTACTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGtttt > 2:1411786/1‑288 (MQ=255) ||| GTCGCAAGTGTATTCGCCGTTATCGCCATTCAGACGGAACGGACGGTTTTGCAGATCCACCTTGTTGATATGATCAAAAATGATCTCAGTTTCAAACTTGGTGGCATGTTCGTGCATGCGCTCCATTAATAACGGACCGGTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCACTACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGCCCATGAGATCCCCATAGTTGTTGGCAGACAATGGGCAGGATTGTAGGGAATTTACAGACGTAAAAAAAGAGTATGACGATTTTGTTAACAATTTGTGCAATCGGCAGCATCGATAAGCAGGTCAAATTCTCCCGTCATTATCACCTCTGCTACTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTT > CP042583/794624‑795183 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |