| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP042583 | 861,151 | 3 bp→TCA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP042583 | 861,151 | 0 | A | T | 100.0% | 390.8 / NA | 165 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base T (70/95); total (70/95) | |||||||||||
| * | CP042583 | 861,152 | 0 | G | C | 99.4% | 388.8 / NA | 165 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base C (69/95); minor base A (1/0); total (70/95) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.24e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| * | CP042583 | 861,153 | 0 | T | A | 100.0% | 392.6 / NA | 165 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base A (70/95); total (70/95) | |||||||||||
Only 100 of 165 total aligned reads displayed.
TGGCTGCTGATGATAATGCTATCACGGATGGCAGTGTAACATTTAATGGTAAAGTTATTGCTCCAGCTTGTACCCTGGTAGCTGCGACGAAAGATTCCGTGGTGACTTTGCCAGATGTTAGTGCCACGAAGTTGCAAACCAATGGTCAGGTTTCTGGCGTGCAAATTGATGTGCCAATTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTGCGGATACTACTCAGATTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCAGTTCTGATGCTGCTACAAACGTGGCCCTGCAAATGTATATGAATGATGGTACAACGGCCATCACGCCAGACACAGAAACCGGGAACATTTTGTTGCAGGATGGAGATCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTAGTGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGA > CP042583/860873‑861426 ||| tGGCTGCTGATGATAATGCTATCACGGATGGCTCAGTAACATTTAATGGTAAAGTTATTGCTCCAGCTTGTACCCTGGTAGCTGCGACGAAAGATTCCGTGGTTACTTTGCCAGATGTTAGTGCCACGAAGTTGCAAACCAATGGTCAGGTTTCTGGCGTGCAAATTGATGTGCCAATTGAATTAACAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTGCGGATACTACTCAGATTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGAtg > 2:1285723/1‑288 (MQ=255)tGGCTGCTGATGATAATGCTATCACGGATGGCTCAGTAACATTTAATGGTAAAGTTATTGCTCCAGCTTGTACCCTGGTAGCTGCGACGAAAGATTCCGTGGTGACTTTGCCAGATGTTAGTGCCACGAAGTTGCAAACCAATGGTCAGGTTTCTGGCGTGCAAATTGATGTGCCAATTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTGCGGATACTACTCAGATTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGAtgc < 1:338004/289‑1 (MQ=255)tGGCTGCTGATGATAATGCTATCACGGATGGCTCAGTAACATTTAATGGTAAAGTTATTGCTCCAGCTTGTACCCTGGTAGCTGCGACGAAAGATTCCGTGGTGACTTTGCCAGATGTTAGTGCCACGAAGTTGCAAACCAATGGTCAGGTTTCTGGCGTGCAAATTGATGTGCCAATTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTGCGGATACTAATCAGATTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGAt > 2:1943129/1‑287 (MQ=255) ggCTGCTGATGATAATGCTATCACGGATGGCTCAGTAACATTTAATGGTAAAGTTATTGCTCCAGCTTGTACCCTGGTAGCTGCGACGAAAGATTCCGTGGTGACTTTGCCAGATGTTAGTGCCACGAAGTTGCAAACCAATGGTCAGGTTTCTGGCGTGCAAATTGATGTGCCAATTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTGCGGATACTACTCAGATTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGAt > 1:373098/1‑286 (MQ=255) gctgATGATAATGCTATCACGGATGGCTCAGTAACATTTAATGGTAAAGTTATTGCTCCAGCTTGTACCCTGGTAGCTGCGACGAAAGATTCCGTGGTGACTTTGCCAGATGTTAGTGCCACGAAGTTGCAAACCAATGGTCAGGTTTCTGGCGTGCAAATTGATGTGCCAATTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTGCGGATACTACTCAGATTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGATgctgct > 1:1076533/1‑288 (MQ=255) aaTGCTATCACGGATGGCTCAGTAACATTTAATGGTGAAGTTATTGCTCCAGCTTGTACCCTGGTAGCTGCGACGAAAGATTCCGTGGTGACTTTGCCAGATGTTAGTGCCACGAAGTTGCAAACCAATGGTCAGGTTTCTGGCGTGCAAATTGATGTGCCAATTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTGCGGATACTACTCAGATTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTGCTACAAACGTgg < 2:1416878/289‑1 (MQ=255) aaTGCTATCACGGATGGCTCAGTAACATTTAATGGTAAAGTTATTGCTCCAGCTTGTACCCTGGTAGCTGCGACGAAAGATTCCGTGGTGACTTTGCCAGATGTTAGTGCCACGAAGTTGCAAACCAATGGTCAGGTTTCTGGCGTGCAAATTGATGTGCCAATTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTGCGGATACTACTCAGATTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTGCTACAAACGTgg < 2:1109501/289‑1 (MQ=255) aaTGCTATCACGGATGGCTCAGTAACATTTAATGGTAAAGTTATTGCTCCAGCTTGTACCCTGGTAGCTGCGACGAAAGATTCCGTGGTGACTTTGCCAGATGTTAGTGCCACGAAGTTGCAAACCAATGGTCAGGTTTCTGGCGTGCAAATTGATGTGCCAATTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTGCGGATACTACTCAGATTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTGCTACAAACGTgg < 2:373098/289‑1 (MQ=255) tATCACGGATGGCTCAGTAACATTTAATGGTAAAGTTATTGCTCCAGCTTGTACCCTGGTAGCTGCGACGAAAGATTCCGTGGTGACTTTGCCAGATGTTAGTGCCACGAAGTTGCAAACCAATGGTCAGGTTTCTGGCGTGCAAATTGATGTGCCAATTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTGCGGAAACTACTCAGATTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGATGCGGACAAAAACCTGGCCCt > 2:812132/1‑288 (MQ=255) aTCACGGATGGCTCAGTAACATTTAATGGTAAAGTTATTGCTCCAGCTTGTACCCTGGTAGCTGCGACGAAAGATTCCGTGGTGACTTTGCCAGATGTTAGTGCCACGAAGTTGCAAACCAATGGTCAGGTTTCTGGCGTGCAAATTGATGTGCCAATTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTGCGGATACTACTCAGATTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTGCTACAAACGTGGCCCTGc < 2:786326/289‑1 (MQ=255) aTCACGGATGGCTCAGTAACATTTAATGGTAAAGTTATTGCTCCAGCTTGTACCCTGGTAGCTGCGACGAAAGATTCCGTGGTGACTTTGCCAGATGTTAGTGCCACGAAGTTGCAAACCAATGGTCAGGTTTCTGGCGTGCAAATTGATGTGCCAATTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTGCGGATACTACTCAGATTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTGCTACAAACGTGGCCCTGc > 2:1939343/1‑289 (MQ=255) cACGGATGGCTCAGTAACATTTAATGGTAAAGTTATTGCTCCAGCTTGTACCCTGGTAGCTGCGACGAAAGATTCCGTGGTGACTTTGCCAGATGTTAGTGCCACGAAGTTGCAAACCAATGGTCAGGTTTCTGGCGTGCAAATTGATGTGCCAATTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTGCGGATACTACTCAGATTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTGCTACAAACGTGGCCCTGCaa < 1:1939343/289‑1 (MQ=255) cACGGATGGCTCAGTAACATTTAATGGTAAAGTTATTGCTCCAGCTTGTACCCTGGTAGCTGCGACGAAAGATTCCGTGGTGACTTTGCCAGATGTTAGTGCCACGAAGTTGCAAACCAATGGTCAGGTTTCTGGCGTGCAAATTGATGTGCCAATTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTGCGGATACTACTCAGATTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTGCTACAAACGTGGCCCTGCaa < 2:1356191/289‑1 (MQ=255) aCGGATGGCTCAGTAACATTTAATGGTAAAGTTATTGCTCCAGCTTGTACCCTGGTAGCTGCGACGAAAGATTCCGTGGTGACTTTGCCAGATGTTAGTGCCACGAAGTTGCAAACCAATGGTCAGGTTTCTGGCGTGCAAATTGATGTGCCAATTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTAACCTTTAATGGCACTGCGGCTACTACTCAGATTACAGCGTTTTCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTTCTACAAACGTGGACCTggcaa > 2:1244179/1‑285 (MQ=255) gatggctcagtAACATTTAATGGTAAAGTTATTGCTCCAGCTTGTACCCTGGTAGCTGCGACGAAAGATTCCGTGGTGACTTTGCCAGATGTTAGTGCCACGAAGTTGCAAACCAATGGTCAGGTTTCTGGCGTGCAAATTGATGTGCCAATTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTGCGGATACTACTCAGATTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTGCTACAAACGTGGCCCTGCAAATGt > 1:1482517/10‑289 (MQ=255) ctcagtAACATTTAATGGTAAAGTTATTGCTCCAGCTTGTACCCTGGTAGCTGCGACGAAAGATTCCGTGGTGACTTTGCCAGATGTTAGTGCCACGAAGTTGCAAACCAATGGTCAGGTTTCTGGCGTGCAAATTGATGTGCCGATTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTGCGGATACTACTCAGATTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTGCTACAAACGTGGCCCTGCAAATGTATatg > 2:486681/5‑289 (MQ=255) ctcagtAACATTTAATGGTAAAGTTATTGCTCCAGCTTGTACCCTGGTAGCTGCGACGAAAGATTCCGTGGTGACTTTGCCAGATGTTAGTGCCACGAAGTTGCAAACCAATGGTCAGGTTTCTGGCGTGCAAATTGATGTGCCAATTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTGCGGATACTACTCAGATTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTGCTACAAACGTGGCCCTGCaa < 2:482868/276‑1 (MQ=255) ctcagtAACATTTAATGGTAAAGTTATTGCTCCAGCTTGTACCCTGGTAGCTGCGACGAAAGATTCCGTGGTGACTTTGCCAGATGTTAGTGCCACGAAGTTGCAAACCAATGGTCAGGTTTCTGGCGTGCAAATTGATGTGCCAATTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTGCGGATACTACTCAGATTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTGCTACAAACGTGGCCCTGCaa > 1:482868/5‑280 (MQ=255) ctcagtAACATTTAATGGTAAAGTTATTGCTCCAGCTTGTACCCTGGTAGCTGCGACGAAAGATTCCGTGGTGACTTTGCCAGATGTTAGTGCCACGAAGTTGCAAACCAATGGTCAGGTTTCTGGCGTGCAAATTGATGTGCCAATTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTGCGGACACTACTCAGATTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGATTCTGCTACAATCGTGGCCCCGCAAATTGATatg > 2:1748484/5‑289 (MQ=255) tcagtAACATTTAATGGTAAAGTTATTGCTCCAGCTTGTACCCTGGTAGCTGCGACGAAAGATTCCGTGGTGACTTTGCCAGATGTTAGTGCCACGAAGTTGCAAACCAATGGTCAGGTTTCTGGCGTGCAAATTGATGTGCCAATTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTGCGGATACTACTCAGATTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTGCTACAAACGTGGCCCTGCAAATGTATatg < 1:581301/285‑1 (MQ=255) cagtAACATTTAATGGTAAAGTTATTGCTCCAGCTTGTACCCTGGTAGCTGCGACGAAAGATTCCGTGGTGACTTTGCCAGATGTTAGTGCCACGAAGTTGCAAACCAATGGTCAGGTTTCTGGCGTGCAAATTGATGTGCCAATTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTGCGGATACTACTCAGATTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTGCTACAAACGTGGCCCTGCAAATGTATatgaa < 1:240158/287‑1 (MQ=255) aaCATTTAATGGTAAAGTTATTGCTCCAGCTTGTACCCTGGTAGCTGCGACGAAAGATTCCGTGGTGACTTTGCCAGATGTTAGTGCCACGAAGTTGCAAACCAATGGTCAGGTTTCTGGCGTGCAAATTGATGTGCCAATTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTGCGGATACTACTCAGATTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTGCTACAAACGTGGCCCTGCAAATGTATatgaatga < 2:1170665/288‑1 (MQ=255) tttAATGGTAAAGTTATTGCTCCAGCTTGTACCCTGGTAGCTGCGACGAAAGATTCCGTGGTGACTTTGCCAGATGTTAGTGCCACGAAGTTGCAAACCAATGGTCAGGTTTCTGGCGTGCAAATTGATGTGCCAATTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTGCGGATACTACTCAGATTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTGCTACGAACGTGGCCCTGc > 1:725230/1‑268 (MQ=255) tttAATGGTAAAGTTATTGCTCCAGCTTGTACCCTGGTAGCTGCGACGAAAGATTCCGTGGTGACTTTGCCAGATGTTAGTGCCACGAAGTTGCAAACCAATGGTCAGGTTTCTGGCGTGCAAATTGATGTGCCAATTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTGCGGATACTACTCAGATTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTGCTACAAACGTGGCCCTGCAAATGTATATGAATGATGGTa > 2:895812/1‑289 (MQ=255) tttAATGGTAAAGTTATTGCTCCAGCTTGTACCCTGGTAGCTGCGACGAAAGATTCCGTGGTGACTTTGCCAGATGTTAGTGCCACGAAGTTGCAAACCAATGGTCAGGTTTCTGGCGTGCAAATTGATGTGCCAATTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTGCGGATACTACTCAGATTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTGCTACAAACGTGGCCCTGCAAATGTAAAGGAAGGATGGTa > 2:988546/1‑289 (MQ=255) tttAATGGTAAAGATATTGCTCCAGCTTGTACCCTGGTAGCTGCGACGAAAGATTCCGTGGTGACTTTGCCAGATGTTAGTGCCACGAAGTTGCAAACCAATGGTCAGGTTTCTGGCGTGCAAATTGATGTGCCAATTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAATGTTCACCTTAATTGGTACTGCGAATACTACTCAGATTACAGCGTTTGCTAACCAGGTCTCATAGGATGCTCCTACAAACGTGGCCCTTCAAATGTATATGAATGATGGTa > 2:475162/1‑289 (MQ=255) aaTGGTAAAGTTATTGCTCCAGCTTGTACCCTGGTAGCTGCGACGAAAGATTCCGTGGTGACTTTGCCAGATGTTAGTGCCACGAAGTTGCAAACCAATGGTCAGGTTTCTGGCGTGCAAATTGATGTGCCAATTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTGCGGATACTACTCAGATTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGAtgc < 1:1488905/245‑1 (MQ=255) aaTGGTAAAGTTATTGCTCCAGCTTGTACCCTGGTAGCTGCGACGAAAGATTCCGTGGTGACTTTGCCAGATGTTAGTGCCACGAAGTTGCAAACCAATGGTCAGGTTTCTGGCGTGCAAATTGATGTGCCAATTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTGCGGATACTACTCAGATTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGAtgc > 2:1488905/1‑245 (MQ=255) aaGTTATTGCTCCAGCTTGTACCCTGGTAGCTGCGACGAAAGATTCCGTGGTGACTTTGCCAGATGTTAGTGCCACGAAGTTGCAAACCAATGGTCAGGTTTCTGGCGTGCAAATTGATGTGCCAATTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTGCGGATACTACTCAGATTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTGCTACAAACGTGGCCCTGCAAATGTATATGAATGATGGTACAACGGCCa > 2:1771002/1‑288 (MQ=255) aTTGCTCCAGCTTGTACCCTGGTAGCTGCGACGAAAGATTCCGTGGTGACTTTGCCAGATGTTAGTGCCACGAAGTTGCAAACCAATGGTCAGGTTTCTGGCGTGCAAATTGATGTGCCAATTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTGCGGATACTACTCAGATTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGAtgc < 1:171939/233‑1 (MQ=255) aTTGCTCCAGCTTGTACCCTGGTAGCTGCGACGAAAGATTCCGTGGTGACTTTGCCAGATGTTAGTGCCACGAAGTTGCAAACCAATGGTCAGGTTTCTGGCGTGCAAATTGATGTGCCAATTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTGCGGATACTACTCAGATTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGAtgc > 2:171939/1‑233 (MQ=255) tGCTCCAGCTTGTACCCTGGTAGCTGCGACGAAAGATTCCGTGGTGACTTTGCCAGATGTTAGTGCCACGAAGTTGCAAACCAATGGTCAGGTTTCTGGCGTGCAAATTGATGTGCCGATTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTGCGGATACTACTCAGATTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTGCTACAAACGTGGCCCTGCAAATGTATATGAATGATGGTACAACGGCCATCACGCCa < 2:216807/289‑1 (MQ=255) cAGCTTGTACCCTGGTAGCTGCGACGAAAGATTCCGTGGTGACTTTGCCAGATGTTAGTGCCACGAAGTTGCAAACCAATGGTCAGGTTTCTGGCGTGCAAATTGATGTGCCAATTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTGCGGATACTACTCAGATTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGAtg > 1:212011/1‑225 (MQ=255) aGCTTGTACCCTGGTAGCTGCGACGAAAGATTCCGTGGTGACTTTGCCAGATGTTAGTGCCACGAAGTTGCAAACCAATGGTCAGGTTTCTGGCGTGCAAATTGATGTGCCAATTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTGCGGATACTACTCAGATTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTGCTACAAACGTGGCCCTGCAAATGTATATGAATGATGGTACAACGGCCATCACGCCAGAcaca > 1:452920/1‑289 (MQ=255) tACCCTGGTAGCTGCGACGAAAGATTCCGTGGTGACTTTGCCAGATGTTAGTGCCACGAAGTTGCAAACCAATGGTCAGGTTTCTGGCGTGCAAATTGATGTGCCAATTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTGCGGATACTACTCAGATTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTGCTACAAACGTGGCCCTGCAAATGTATATGAATGATGGTACAACGGCCATCACGCCAGACACAGAAAcc > 1:390461/1‑289 (MQ=255) tACCCTGGTAGCTGCGACGAAAGATTCCGTGGTGACTTTGCCAGATGTTAGTGCCACGAAGTTGCAAACCAATGGTCAGGTTTCTGGCGTGCAAATTGATGTGCCAATTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTGCGGATACTACTCAGATTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTGCTACAAACGTGGCCCTGCAAATGTATATGAATGATGGTACAACGGCCATCACGCCAGACACAGAAAcc > 2:23765/1‑289 (MQ=255) tACCCTGGTAGCTGCGACGAAAGATTCCGTGGTGACTTTGCCAGATGTTAGTGCCACGAAGTTGCAAACCAATGGTCAGGTTTCTGGCGTGCAAATTGATGTGCCAATTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTGCGGATACTACTCAGATTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTGCTACAAACGTGGCCCTGCAAATGTATATGAATGATGGTACAACGGCCATCACGCCAGACACAGAAAcc > 2:464128/1‑289 (MQ=255) tGGTAGCTGCGACGAAAGATTCCGTGGTGACTTTGCCAGATGTTAGTGCCACGAAGTTGCAAACCAATGGTCAGGTTTCTGGCGTGCAAATTGATGTGCCAATTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTGCGGATACTACTCAGATTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTGCTACAAACGTgg < 2:895081/228‑1 (MQ=255) tGGTAGCTGCGACGAAAGATTCCGTGGTGACTTTGCCAGATGTTAGTGCCACGAAGTTGCAAACCAATGGTCAGGTTTCTGGCGTGCAAATTGATGTGCCAATTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTGCGGATACTACTCAGATTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTGCTACAAACGTgg > 1:895081/1‑228 (MQ=255) tGGTAGCTGCGACGAAAGATTCCGTGGTGACTTTGCCAGATGTTAGTGCCACGAAGTTGCAAACCAATGGTCAGGTTTCTGGCGTGCAAATTGATGTGCCAATTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTGCGGATACTACTCAGATTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTGCTACAAACGTGGCCCTGCAAATGTATATGAATGATGGTACAACGGCCATCACGCCAGACACAGAAACCGGGa > 1:478345/1‑288 (MQ=255) gTAGCTGCGACGAAAGATTCCGTGGTGACTTTGCCAGATGTTAGTGCCACGAAGTTGCAAACCAATGGTCAGGTTTCTGGCGTGCAAATTGATGTGCCAATTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTGCGGATACTACTCAGATTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTGCTACAAACGTGGCCCTGCaa < 1:16077/234‑1 (MQ=255) gTAGCTGCGACGAAAGATTCCGTGGTGACTTTGCCAGATGTTAGTGCCACGAAGTTGCAAACCAATGGTCAGGTTTCTGGCGTGCAAATTGATGTGCCAATTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTGCGGATACTACTCAGATTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTGCTACAAACGTGGCCCTGCaa > 2:16077/1‑234 (MQ=255) gCTGCGACGAAAGATTCCGTGGTGACTTTGCCAGATGTTAGTGCCACGAAGTTGCAAACCAATGGTCAGGTTTCTGGCGTGCAAATTGATGTGCCAATTGAATTAAAAGTTTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTGCGGATACTACTCAGATTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTGCTACAAACGTGGCCCTGCAAATGTATATGAATGATGGTACAACGGCCATCACg > 2:1788/1‑264 (MQ=255) gCTGCGACGAAAGATTCCGTGGTGACTTTGCCAGATGTTAGTGCCACGAAGTTGCAAACCAATGGTCAGGTTTCTGGCGTGCAAATTGATGTGCCAATTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTGCGGATACTACTCAGATTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTGCTACAAACGTGGCCCTGCAAATGTATATGAATGATGGTACAACGGCCATCACg < 1:784460/264‑1 (MQ=255) gCGACGAAAGATTCCGTGGTGACTTTGCCAGATGTTAGTGCCACGAAGTTGCAAACCAATGGTCAGGTTTCTGGCGTGCAAATTGATGTGCCAATTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTGCGGATACTACTCAGATTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTGCTACAAACGTGGCCCTGCAAAt > 1:1855760/1‑230 (MQ=255) gCGACGAAAGATTCCGTGGTGACTTTGCCAGATGTTAGTGCCACGAAGTTGCAAACCAATGGTCAGGTTTCTGGCGTGCAAATTGATGTGCCAATTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTGCGGATACTACTCAGATTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTGCTACAAACGTGGCCCTGCAAATGTATATGAATGATGGTACAACGGCCATCACGCCAGACACAGAAACCGGGAACATTttgt > 2:698005/1‑289 (MQ=255) cgacgaAAGATTCCGTGGTGACTTTGCCAGATGTTAGTGCCACGAAGTTGCAAACCAATGGTCAGGTTTCTGGCGTGCAAATTGATGTGCCAATTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTGCGGATACTACTCAGATTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTGCTACAAACGTGGCCCTGCAAATGTATATGAATGATGGTACAACGGCCATCACGCCAGACACAGAAACCGGGAACATTttgtt > 2:1264438/1‑289 (MQ=255) gacgaAAGATTCCGTGGTGACTTTGCCAGATGTTAGTGCCACGAAGTTGCAAACCAATGGTCAGGTTTCTGGCGTGCAAATTGATGTGCCAATTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTGCGGATACTACTCAGATTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTGCTACAAACGTGGCCCTGCAAATGTATATGAATGATGGTACAACGGCCATCACGCCAGACACAGAAACCGGGAACATTttgttg < 1:1771002/289‑1 (MQ=255) gacgaAAGATTCCGTGGTGACTTTGCCAGATGTTAGTGCCACGAAGTTGCAAACCAATGGTCAGGTTTCTGGCGTGCAAATTGATGTGCCAATTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTGCGGATACTACTCAGATTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTGCTACAAACGTGGCCCTGCAAATGTATATGAATGATGGTACAACGGCCATCACGCCAGACACAGAAACCGGGAACATTttgttg < 1:969511/289‑1 (MQ=255) gacgaAAGATTCCGTGGTGACTTTGCCAGATGTTAGTGCCACGAAGTTGCAAACCAATGGTCAGGTTTCTGGCGTGCAAATTGATGTGCCAATTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTGCGGATACTACTCAGATTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTGCTACAAACGTGGCCCTGCAAATGTATATGAATGATGGTACAACGGCCATCACGCCAGACACAGAAACCGGGAACATTttgttg < 2:567580/289‑1 (MQ=255) cgaAAGATTCCGTGGTGACTTTGCCAGATGTTAGTGCCACGAAGTTGCAAACCAATGGTCAGGTTTCTGGCGTGCAAATTGATGTGCCAATTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTGCGGATACTACTCAGATTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTGCTACAAACGTGGCCCTGCAAATGTATATGAATGATGGTACAACGGCCATCACGCCAGACACAGAAACCGGGAACATTttg > 2:1869902/1‑284 (MQ=255) cgaAAGATTCCGTGGTGACTTTGCCAGATGTTAGTGCCACGAAGTTGCAAACCAATGGTCAGGTTTCTGGCGTGCAAATTGATGTGCCAATTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTGCGGATACTACTCAGATTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTGCTACAAACGTGGCCCTGCAAATGTATATGAATGATGGTACAACGGCCATCACGCCAGACACAGAAACCGGGAACATTttg < 1:1869902/284‑1 (MQ=255) aaGATTCCGTGGTGACTTTGCCAGATGTTAGTGCCACGAAGTTGCAAACCAATGGTCAGGTTTCTGGCGTGCAAATTGATGTGCCAATTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTGCGGATACTACTCAGATTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTGCTACAAACGTGGCCCTGCAAATGTATATGAATGATGGTACAACGGCCATCACGCCAGACACAGAAACCgg > 1:1483040/1‑271 (MQ=255) aaGATTCCGTGGTGACTTTGCCAGATGTTAGTGCCACGAAGTTGCAAACCAATGGTCAGGTTTCTGGCGTGCAAATTGATGTGCCAATTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTGCGGATACTACTCAGATTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTGCTACAAACGTGGCCCTGCAAATGTATATGAATGATGGTACAACGGCCATCACGCCAGACACAGAAACCgg < 2:1483040/271‑1 (MQ=255) ttCCGTGGTGACTTTGCCAGATGTTAGTGCCACGAAGTTGCAAACCAATGGTCAGGTTTCTGGCGTGCAAATTGATGTGCCAATTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTGCGGATACTACTCAGATTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTGCTACAAACGTGGCCCTGCAAATGTATATGAATGATGGTACAACGGCCATCACGCCAGACACAGAAACCGGGAACATTTTGTTGCAGGATg < 2:172135/287‑1 (MQ=255) ttCCGTGGTGACTTTGCCAGATGTTAGTGCCACGAAGTTGCAAACCAATGGTCAGGTTTCTGGCGTGCAAATTGATGTGCCAATTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTGCGGATACTACTCAGATTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTGCTACAAACGTGGCCCTGCAAATGTATATGAATGATGGTACAACGGCCATCACGCCAGACACAGAAACCGGGAACATTTTGTTGCAGGATGga > 1:469392/1‑289 (MQ=255) agtGTTAGCGCCAAGAAGTTGCAATCCAATGGTAAGGTTTCTGGCGTGCAAATTGATTTGCCAATTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACATTCACCTTTAATTGCACTGCGGATACGACTCAGATTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTGCTACAAACGTGGCCCTGCAAATGTATATGAATGATGGTACAACGGCCATCACGCCAGACACAGAAACCGGGAACATTTTGTTGCAGGATGGAGATCAGACGTTGACTTTTa < 2:1520161/287‑1 (MQ=255) tGTTAGTGCCACGAAGTTGCAAACCAATGGTCAGGTTTCTGGCGTGCAAATTGATGTGCCAATTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTGCGGATACTACTCAGATTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTGCTACAAACGTGGCCCTGCAAATGTATATGAATGATGGTACAACGGCCATCACGCCAGACACAGAAACCGGGAACATTTTGTTGCAGGATGGAGATCAGACGTTGACTTTTa < 1:989185/287‑1 (MQ=255) tGTTAGTGCCACGAAGTTGCAAACCAATGGTCAGGTTTCTGGCGTGCAAATTGATGTGCCAATTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTGCGGATACTACTCAGATTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTGCTACAAACGTGGCCCTGCAAATGTATATGAATGATGGTACAACGGCCATCACGCCAGACACAGAAACCGGGAACATTTTGTTGCAGGATGGAGATCAGACGTTGACTTTTa < 1:1513615/287‑1 (MQ=255) gTTAGTGCCACGAAGTTGCAAACCAATGGTCAGGTTTCTGGCGTGCAAATTGATGTGCCAATTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTGCGGATACTACTCAGATTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTGCTACAAACGTGGCCCTGCAAATGTATatgaa > 1:1791940/1‑206 (MQ=255) ttAGTGCCACGAAGTTGCAAACCAATGGTCAGGTTTCTGGCGTGCAAATTGATGTGCCAATTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTGCGGATACTACTCAGATTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTGCTACAAACGTGGCCCTGCAAATGTATATGAATGATGGTACAACGGCCATCACGCCAGACACAGAAACCGGGAACATTTTGTTGCAGGATGGAGATCAGACGTTGACTTTTAAAGt < 2:1076533/289‑1 (MQ=255) gCAAACCAATGGTCAGGTTTCTGGCGTGCAAATTGATGTGCCAATTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTGCGGATACTACTCAGATTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTGCTACAAACGTGGCCCTGCAAATGTATATGAATGATGGTACAACGGCCATCACGCCAGACCCAGAAACCGGGCACATTTTGTTGCAGGATGGAGCTCAGACGTTGACTTTCAAAGTGGATTATATCGCTACg > 2:1664589/1‑289 (MQ=255) cAATGGTCAGGTTTCTGGCGTGCAAATTGATGTGCCAATTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTGCGGATACTACTCAGATTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTGCTACAAACGTGGCCCTGCaa < 2:1893375/172‑1 (MQ=255) cAATGGTCAGGTTTCTGGCGTGCAAATTGATGTGCCAATTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTGCGGATACTACTCAGATTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTGCTACAAACGTGGCCCTGCaa > 1:1893375/1‑172 (MQ=255) aaTGGTCAGGTTTCTGGCGTGCAAATTGATGTGCCAATTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTGCGGATACTACTCAGATTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTGCTACAAACGTGGCCCTGCAAATGTATATGAATGATGGTACAACGGCCATCACGCCAGACACAGAAACCGGGAACATTTTGTTGCAGGATGGAGATCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAg < 1:1641609/289‑1 (MQ=255) aaTGGTCAGGTTTCTGGCGTGCAAATTGATGTGCCAATTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTGCGGATACTACTCAGATTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTGCTACAAACGTGGCCCTGCAAATGTATATGAATGATGGTACAACGGCCATCACGCCAGACACAGAAACCGGGAACATTTTGTTGCAGGATGGAGATCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAg < 1:1398378/289‑1 (MQ=255) aTGGTCAGGTTTCTGGCGTGCAAATTGATGTGCCAATTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTGCGGATACTACTCAGATTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTGCTACAAACGTGGCCCTGCAAATGTATATGAATGATGGTACAACGGCCATCACGCCAGACACAGAAACCGGGAACATTTTGTTGCAGGATGGAGATCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAg < 2:1446637/288‑1 (MQ=255) tcggatgtCTGGCGTGCAAATTGATATGCCAATTGAATTATAACATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAACGGCACTGCGGATACTACTCAGATTACGGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTGCTACAAACGTGGCCCTGCAAATGTATATGAATGATGGTACCACGGCCATCACGCCAGACACAGAAACCGGGAACATTTTGTTGCAGGATGGAGATCAGACGTTGACTTTTAACGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGAc < 2:1848224/281‑1 (MQ=255) tCAGGTTTCTGGCGTGCAAATTGATGTGCCAATTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTGCGGATACTACTCAGATTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTGCTACAAACGTGGCCCTGCAAATGTATATGAATGATGGTACAACGGCCATCACGCCAGACACAGAAACCGGGAACATTTTGTTGCAGGATGGAGATCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGAc < 1:926745/288‑1 (MQ=255) cAGGTTTCTGGCGTGCAAATTGATGTGCCAATTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTGCGGATACTACTCAGATTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTGCTACAAACGTGGCCCTGCAAATGTATATGAATGATGGTACAACGGCCATCACGCCAGACACAGAAACCGGGAACATTTTGTTGCAGGATGGAGATCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACtt < 2:781103/289‑2 (MQ=255) gTTTCTGGCGTGCAAATTGATGTGCCAATTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTGCGGATACTACTCAGATTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTGCTACAAACGTGGCCCTGCAAATGTATATGAATGATGGTACAACGGCCATCACGCCAGACACAGAAACCGGGAACATTTTGTTGCAGGATGGAGATCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACTGGGAAAGCGACttcag > 1:122318/1‑285 (MQ=255) ttCTGGCGTGCAAATTGATGTGCCAATTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTGCGGATACTACTCAGATTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTGCTACAAACGTGGCCCTGCAAATGTATATGAATGATGGTACAACGGCCATCACGCCAGACACAGAAACCGGGAACATTTTGTTGCAGGATGGAGATCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACttcagg < 2:1375937/288‑6 (MQ=255) tGGCGTGCAAATTGATGTGCCAATTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTGCGGATACTACTCAGATTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTGCTACAAACGTGGCCCTGCAAATGTATATGAATGATGGTACAACGGCCATCACGCCAGACACAGAAACCGGGAACATTTTGTTGCAGGATGGAGATCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAAt > 1:1127200/1‑289 (MQ=255) tGGCGTGCAAATTGATGTGCCAATTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTGCGGATACTACTCAGATTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTGCTACAAACGTGGCCCTGCAAATGTATATGAATGATGGTACAACGGCCATCACGCCAGACACAGAAACCGGGAACATTTTGTTGCAGGATGGAGATCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAAt < 2:1482517/289‑1 (MQ=255) cAAATTGATGTGCCAATTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTGCGGATACTACTCAGATTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTGCTACAAACGTGGCCCTGCAAATGTATATGAATGATGGTACAACGGCCATCACTTCAGACACAGAAACCGGGAACATTTTGTTGCAGGATGGAGATCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATg < 2:1035177/289‑1 (MQ=255) ttGATGTGCCAATTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTGCGGATACTACTCAGATTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTGCTACAAACGTGGCCCTGCAAATGTATATGAATGATGGTACAACGGCCATCACGCCAGACACAGAAACCGGGAACATTTTGTTGCAGGATGGAGATCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGt < 1:1737909/289‑1 (MQ=255) ttAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTGCGGATACTACTCAGATTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTGCTACAAACGTGGCCCTGCaa < 1:1027105/129‑1 (MQ=255) tAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTGCGGATACTACTCAGATTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTGCTACAAACGTGGCCCTGCAAATGTATATGAATGATGGTACAACGGCCATCACGCCAGACACAGAAACCGGGAACATTTTGTTGCAGGATGGAGATCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTaa < 1:1002067/289‑1 (MQ=255) tAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTGCGGATACTACTCAGATTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTGCTACAAACGTGGCCCTGCAAATGTATATGAATGATGGTACAACGGCCATCACGCCAGACACAGAAACCGGGAACATTTTGTTGCAGGATGGAGATCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTaa < 2:390461/289‑1 (MQ=255) ttGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTGCGGATACTACTCAGAGTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGAGGCTGCTACAAACGTGGCCCTGCAAATGTATATGAATGATGGTACAACGGCCATCACGCCAGACACAGAAACCGGGAACATTTTGTTGCAGGATGGAGATCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACtattat < 2:717791/289‑1 (MQ=255) tactacCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTGCGGATACTACTCAGATTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTGCTACAAACGTGGCCCTGCAAATGTATATGAATGATGGTACAACGGCCATCACGCCAGACACAGAAACCGGGAACATTTTGTTGCAGGATGGAGATCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAg < 1:1285723/289‑1 (MQ=255) ctacCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTGCGGATACTACTCAGATTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTGCTACAAACGTGGCCCTGCAAATGTATATGAATGATGGTACAACGGCCATCACGCCAGACACAGAAACCGGGAACATTTTGTTGCAGGATGGAGATCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACTGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGaa < 2:122318/289‑1 (MQ=255) ctacCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTGCGGATACTACTCAGATTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTGCTACAAACGTGGCCCTGCAAATGTATATGAATGATGGTACAACGGCCATCACGCCAGACACAGAAACCGGGAACATTTTGTTGCAGGATGGAGATCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGaa < 1:1264438/289‑1 (MQ=255) ccGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTGCGGATACTACTCAGATTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTGCTACAAACGTGGCCCTGCAAATGTATATGAATGATGGTACAACGGCCATCACGCCAGACACAGAAACCGGGAACATTTTGTTGCAGGATGGAGATCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTc > 1:823605/1‑289 (MQ=255) gTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTGCGGATACTACTCAGATTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTGCTACAAACGTGGCCCt > 1:1694000/1‑104 (MQ=255) aCAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTGCGGATACTACTCAGATTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTGCTACAAACGTGGCCCTGCAAATGTATATGAATGATGGTACAACGGCCATCACGCCAGACACAGAAACCGGGAACATTTTGTTGCAGGATGGAGATCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAAt < 1:1582867/237‑1 (MQ=255) aCAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTGCGGATACTACTCAGATTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTGCTACAAACGTGGCCCTGCAAATGTATATGAATGATGGTACAACGGCCATCACGCCAGACACAGAAACCGGGAACATTTTGTTGCAGGATGGAGATCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAAt > 2:1582867/1‑237 (MQ=255) tGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTGCGGATACTACTCAGATTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTGCTACAAACGTGGCCCTGCAAATGTATATGAATGATGGTACAACGGCCATCACGCCAGACACAGAAACCGGGAACATTTTGTTGCAGGATGGAGATCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTtta < 1:1769385/289‑1 (MQ=255) tGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTGCGGATACTACTCAGATTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTGCTACAAACGTGGCCCTGCAAATGTATATGAATGATGGTACAACGGCCATCACGCCAGACACAGAAACCGGGAACATTTTGTTGCAGGATGGAGATCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTtta < 1:23765/289‑1 (MQ=255) ccTTTAATGGCACTGCGGATACTACTCAGATTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTGCTACAAACGTGGCCCTGCAAATGTATATGAATGATGGTACAACGGCCATCACGCCAGACACAGAAACCGGGAACATTTTGTTGCAGGATGGAGATCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTAAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTAc < 2:823605/289‑1 (MQ=255) aaTGGCACTGCGGATACTACTCAGATTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTGCTACAAACGTGGCCCTGCAAATGTATATGAATGATGGTACAACGGCCATCACGCCAGACACAGAAACCGGGAACATTTTGTTGCAGGATGGAGATCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTc < 2:452920/289‑1 (MQ=255) cGGATACTACTCAGATTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTGCTACAAACGTGGCCCTGCAAATGTATATGAATGATGGTACAACGGCCATCACGCCAGACACAGAAACCGGGAACATTTTGTTGCAGGATGGAGATCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAAt < 1:823460/256‑1 (MQ=255) aTTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTGCTACAAACGTGGCCCTGCAAATGTATATGAATGATGGTACAACGGCCATCACGCCAGACACAGAAACCGGGAACATTTTGTTGCAGGATGGAGATCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCat > 2:283344/1‑289 (MQ=255) aGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTGCTACAAACGTGGCCCTGCAAATGTATATGAATGATGGTACAACGGCCATCACGCCAGACACAGAAACCGGGAACATTTTGTTGCAGGATGGAGATCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGaa < 2:1865660/189‑1 (MQ=255) aGCGTTTGCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTGCTACAAACGTGGCCCTGCAAATGTATATGAATGATGGTACAACGGCCATCACGCCAGACACAGAAACCGGGAACATTTTGTTGCAGGATGGAGATCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCatat > 1:14428/1‑210 (MQ=255) ttGCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTGCTACAAACGTGGCCCTGCAAATGTATATGAATGATGGTACAACGGCCATCACGCCAGACACAGAAACCGGGAACATTTTGTTGCAGGATGGAGATCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGaa > 1:1440478/1‑223 (MQ=255) ttGCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTGCTACAAACGTGGCCCTGCAAATGTATATGAATGATGGTACAACGGCCATCACGCCAGACACAGAAACCGGGAACATTTTGTTGCAGGATGGAGATCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGaa < 2:1440478/223‑1 (MQ=255) tGCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTGCTACAAACGTGGCCCTGCAAATGTATATGAATGATGGTACAACGGCCATCACGCCAGACACAGAAACCGGGAACATTTTGTTGCAGGATGGAGATCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTTCAGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAaga < 1:407683/289‑1 (MQ=255) gCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTGCTACAAACGTGGCCCTGCAAATGTATATGAATGATGGTACAACGGCCATCACGCCAGACACAGAAACCGGGAACATTttgttg > 2:3668/1‑108 (MQ=255) gCTAACCAGGCCTCATCTGATGCTGCTACAAACGTGGCCCTGCAAATGTATATGAATGATGGTACAACGGCCATCACGCCAGACACAGAAACCGGGAACATTttgttg < 1:3668/108‑1 (MQ=255) ||| TGGCTGCTGATGATAATGCTATCACGGATGGCAGTGTAACATTTAATGGTAAAGTTATTGCTCCAGCTTGTACCCTGGTAGCTGCGACGAAAGATTCCGTGGTGACTTTGCCAGATGTTAGTGCCACGAAGTTGCAAACCAATGGTCAGGTTTCTGGCGTGCAAATTGATGTGCCAATTGAATTAAAAGATTGTGATACTACCGTAACAAAAAATGCAACGTTCACCTTTAATGGCACTGCGGATACTACTCAGATTACAGCGTTTGCTAACCAGGCCAGTTCTGATGCTGCTACAAACGTGGCCCTGCAAATGTATATGAATGATGGTACAACGGCCATCACGCCAGACACAGAAACCGGGAACATTTTGTTGCAGGATGGAGATCAGACGTTGACTTTTAAAGTTGATTATATCGCTACGGGGAAAGCGACTAGTGGTAATGTGAATGCGGTAACAAATTTCCATATTAACTATTATTAATAGAACTCATTAATTGTTTTATTAATTAGTACCCCTCCAGTGTTCTGGAGGGGATATTCATATTTTTTAAGA > CP042583/860873‑861426 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |