Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 478,388 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 478,388 | 0 | A | T | 99.5% | 504.8 / NA | 217 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); new base T (96/120); total (97/120) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.47e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
* | CP042583 | 478,389 | 0 | G | C | 99.5% | 502.9 / NA | 217 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/0); new base C (95/120); total (97/120) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.44e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 478,390 | 0 | C | G | 99.1% | 504.1 / NA | 217 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (2/0); new base G (94/120); total (97/120) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.96e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 217 total aligned reads displayed.
CGCACTGGAGCGGATGCGCTCTGAAAGTGCTACCCATGCGCATTGAGGGAATAACCAATGATTGAATGGATTATTCGTCGCAGCGTGGCGAACCGTTTTTTGGTGCTGATGGGCGCGTTGTTTCTGAGCATCTGGGGCACCTGGACCATCATTAATACGCCAGTGGATGCGCTGCCGGATCTCTCCGATGTGCAGGTTATTATTAAAACCAGCTATCCCGGTCAGGCACCACAAATCGTTGAAAATCAGGTGACTTATCCGCTAACCACCACCATGTTGAGCGT‑GCCTGGCGCGAAGACTGTGCGCGGTTTCAGTCAGTTTGGCGACTCTTATGTGTATGTCATTTTCGAAGATGGCACCGATCCGTACTGGGCGCGTAGCCGGGTGCTGGAGTACCTCAACCAGGTACAGGGTAAGCTGCCTGCGGGAGTCAGCGCCGAGCTGGGGCCAGATGCCACGGGTGTTGGCTGGATCTATGAATATGCACTGGTGGATCGCAGCGGTAAGCACGATCTGGCCGATTTACGCAGTTTACAGGACTGGTTTCTCAAATATGAGCTG > CP042583/478109‑478669 ||| cgcACTGGAGCGGATGCGCTCTGAAAGTGCTACCCATGCGCATTGAGGGAATAACCAATGATTGAATGGATTATTCGTCGCTCGGTGGCGAACCGTTTTTTGGTGCTGATGGGCGCGTTGTTTCTGAGCATCTGGGGCACCTGGACCATCATTAATACGCCAGTGGATGCGCTGCCGGATCTCTCCGATGTGCAGGTTATTATTAAAACCAGCTATCCCGGTCAGGCACCACAAATCGTTGAAAATCAGGTGACTTATCCGCTAACCACCACCATGTTGTCGGT‑GCCt < 1:1262479/288‑1 (MQ=255) ggAGCGGATGCGCTCTGAAAGTGCTACCCATGCGCATTGAGGGAATAACCAATGATTGAATGGATTATTCGTCGCTCGGTGGCGAACCGTTTTTTGGTGCTGATGGGCGCGTTGTTTCTGAGCATCTGGGGCACCTGGACCATCATTAATACGCCAGTGGATGCGCTGCCGGATCTCTCCGATGTGCAGGTTATTATTAAAACCAGCTATCCCGGTCAGGCACCACAAATCGTTGAAAATCAGGTGACTTATCCGCTAACCACCACCATGTTGTCGGT‑GCCTGGCGCGa < 2:909544/289‑1 (MQ=255) gATGCGCTCTGAAAGTGCTACCCATGCGCATTGAGGGAATAACCAATGATTGAATGGATTATTCGTCGCTCGGTGGCGAACCGTTTTTTGGTGCTGATGGGCGCGTTGTTTCTGAGCATCTGGGGCACCTGGACCATCATTAATACGCCAGTGGATGCGCTGCCGGATCCCTCCGATGTGCAGGTTATTATTAACACCAGCTATCCCGGTCAGGCACCACAAATCGTTGAAAATCAGGTGACTTATCCGCTAACCAACCCCATGTTGTCGGT‑GCCTGGCGCGaaagctg > 2:388779/1‑284 (MQ=255) gcTCTGAAAGTGCTACCCATGCGCATTGAGGGAATAACCAATGATTGAATGGATTATTCGTCGCTCGGTGGCGAACCGTTTTTTGGTGCTGATGGGCGCGTTGTTTCTGAGCATCTGGGGCACCTGGACCATCATTAATACGCCAGTGGATGCGCTGCCGGATCTCTCCGATGTGCAGGTTATTATTAAAACCAGCTATCCCGGTCAGGCACCACAAATCGTTGAAAATCAGGTGACTTATCCGCTAACCACCACCATGTTGTCGGT‑GCCTGGCGCGAAGACTGTgcg < 2:795004/288‑1 (MQ=255) ctctGAAAGTGCTACCCATGCGCATTGAGGGAATAACCAATGATTGAATGGATTATTCGTCGCTCGGTGGCGAACCGTTTTTTGGTGCTGATGGGCGCGTTGTTTCTGAGCATCTGGGGCACCTGGACCATCATTAATACGCCAGTGGATGCGCTGCCGGATCTCTCCGATGTGCAGGTTATTATTAAAACCAGCTATCCCGGTCAGGCACCACAAATCGTTGAAAATCAGGTGACTTATCCGCTAACCACCACCATGTTGTCGGT‑GCCt < 1:1036625/270‑1 (MQ=255) ctctGAAAGTGCTACCCATGCGCATTGAGGGAATAACCAATGATTGAATGGATTATTCGTCGCTCGGTGGCGAACCGTTTTTTGGTGCTGATGGGCGCGTTGTTTCTGAGCATCTGGGGCACCTGGACCATCATTAATACGCCAGTGGATGCGCTGCCGGATCTCTCCGATGTGCAGGTTATTATTAAAACCAGCTATCCCGGTCAGGCACCACAAATCGTTGAAAATCAGGTGACTTATCCGCTAACCACCACCATGTTGTCGGT‑GCCt > 2:1036625/1‑270 (MQ=255) aaaGTGCTACCCATGCGCATTGAGGGAATAACCAATGATTGAATGGATTATTCGTCGCTCGGTGGCGAACCGTTTTTTGGTGCTGATGGGCGCGTTGTTTCTGAGCATCTGGGGCACCTGGACCATCATTAATACGCCAGTGGATGCGCTGCCGGATCTCTCCGATGTGCAGGTTATTATTAAAACCAGCTATCCCGGTCAGGCACCACAAATCGTTGAAAATCAGGTGACTTATCCGCTAACCACCACCATGTTGTCGGT‑GCCTGGCGCGAAGACTGTGCGCGGtt > 1:1014382/1‑287 (MQ=255) aaGTGCTACCCATGCGCATTGAGGGAATAACCAATGATTGAATGGATTATTCGTCGCTCGGTGGCGACCCGATTTTTCGTACTGATGGGCGCGTTGTTTCTGAGCATCCGGGGCACCTGGACCATCATTACTACGCCAGTGGATGCGCTGCCGGATCCCTCCGATGTGCACGTTATTATTAAAACCAGCTATCCCGGTCACGCACCACAACTCGTCGAAAATCATGCGACTTATCCGCTAACCACCACCATGTT‑ATCGTCGCCTTGCGCCAAGACTGTCCCCGTTTtc > 2:1506026/1‑288 (MQ=255) gCTGCCCTTGCGCTTTGAGGGAATAACCAATGATTGAATGGATTATTCGTCGCTCGGTGGCGATCCGTTTTTTGGTGCTGATGGGCGCGTTGTTTCTGAGCATCTGGGGCACCTGGACCATCATTAATACGCCAGTGGATGCGCTGCCGGATCTCTCCGATGTGCAGGTTATTATTAAAACCAGCTATCCCGGTCAGGCACCACAAATCGTTGAAAATCAGGTGACTTATCCGCTAACCACCACCATGTTGTCGGT‑GCCTGGCGCGAAGACTGTGCGCGGTTtctca < 2:682826/287‑4 (MQ=255) gCTACCCATGCGCATTGAGGGAATAACCAATGATTGAATGGATTATTCGTCGCTCGGTGGCGAACCGTTTTTTGGTGCTGATGGGCGCGTTGTTTCTGAGCATCTGGGGCACCTGGACCATCATTAATACGCCAGTGGATGCGCTGCCGGATCTCTCCGATGTGCAGGTTATTATTAAAACCAGCTATCCCGGTCAGGCACCACAAATCGTTGAAAATCAGGTGACTTATCCGCTAACCACCACCATGTTGTCGGT‑GCCTGGCGCGAAGACTGTGCGCGGTTtctca < 1:1916723/287‑4 (MQ=255) gCTACCCATGCGCATTGAGGGAATAACCAATGATTGAATGGATTATTCGTCGCTCGGTGGCGAACCGTTTTTTGGTGCTGATGGGCGCGTTGTTTCTGAGCATCTGGGGCACCTGGACCATCATTAATACGCCAGTGGATGCGCTGCCGGATCTCTCCGATGTGCAGGTTATTATTAAAACCAGCTATCCCGGTCAGGCACCACAAATCGTTGAAAATCAGGTGACTTATCCGCTAACCACCACCATGTTGTCGGT‑GCCTGGCGCGAAGACTGTGCGCGGTTtctca < 1:1230037/287‑4 (MQ=255) cATGCGCATTGAGGGAATAACCAATGATTGAATGGATTATTCGTCGCTCGGTGGCGAACCGTTTTTTGGTGCTGATGGGCGCGTTGTTTCTGAGCATCTGGGGCACCTGGACCATCATTAATACGCCAGTGGATGCGCTGCCGGATCTCTCCGATGTGCAGGTTATTATTAAAACCAGCTATCCCGGTCAGGCACCACAAATCGTTGAAAATCAGGTGACTTATCCGCTAACCACCACCATGTTGTCGGT‑GCCTGGCGCGAAGACTGTGCGCGGTTTCTCACAGTTTgg < 2:615634/289‑1 (MQ=255) cATGCGCATTGAGGGAATAACCAATGATTGAATGGATTATTCGTCGCTCGGTGGCGAACCGTTTTTTGGTGCTGATGGGCGCGTTGTTTCTGAGCATCTGGGGCACCTGGACCATCATTAATACGCCAGTGGATGCGCTGCCGGATCTCTCCGATGTGCAGGTTATTATTAAAACCAGCTATCCCGGTCAGGCACCACAAATCGTTGAAAATCAGGTGACTTATCCGCTAACCACCACCATGTTGTCGGT‑GCCTGGCGCGAAGACTGTGCGCGGTTTCTCACAGTTTgg < 1:1213612/289‑1 (MQ=255) gcgcATTGAGGGAATAACCAATGATTGAATGGATTATTCGTCGCTCGGTGGCGAACCGTTTTTTGGTGCTGATGGGCGCGTTGTTTCTGAGCATCTGGGGCACCTGGACCATCATTAATACGCCAGTGGATGCGCTGCCGGATCTCTCCGATGTGCAGGTTATTATTAAAACCAGCTATCCCGGTCAGGCACCACAAATCGTTGAAAATCAGGTGACTTATCCGCTAACCACCACCATGTTGTCGGT‑GCCTGGCGCGAAGa > 1:1583170/1‑261 (MQ=255) gcgcATTGAGGGAATAACCAATGATTGAATGGATTATTCGTCGCTCGGTGGCGAACCGTTTTTTGGTGCTGATGGGCGCGTTGTTTCTGAGCATCTGGGGCACCTGGACCATCATTAATACGCCAGTGGATGCGCTGCCGGATCTCTCCGATGTGCAGGTTATTATTAAAACCAGCTATCCCGGTCAGGCACCACAAATCGTTGAAAATCAGGTGACTTATCCGCTAACCACCACCATGTTGTCGGT‑GCCTGGCGCGAAGACTGTGCGCGGTTTCTCACAGTTTGGCg > 1:938080/1‑288 (MQ=255) gcgcATTGAGGGAATAACCAATGATTGAATGGATTATTCGTCGCTCGGTGGCGAACCGTTTTTTGGTGCTGATGGGCGCGTTGTTTCTGAGCATCTGGGGCACCTGGACCATCATTAATACGCCAGTGGATGCGCTGCCGGATCTCTCCGATGTGCAGGTTATTATTAAAACCAGCTATCCCGGTCAGGCACCACAAATCGTTGAAAATCAGGTGACTTATCCGCTAACCACCACCATGTTGTCGGT‑GCCTGGCGCGAAGACTGTGCGCGGTTTCTCACAGTTTGGCGa < 1:1153199/289‑1 (MQ=255) gcgcATTGAGGGAATAACCAATGATTGAATGGATTATTCGTCGCTCGGTGGCGAACCGTTTTTTGGTGCTGATGGGCGCGTTGTTTCTGAGCATCTGGGGCACCTGGACCATCATTAATACGCCAGTGGATGCGCTGCCGGATCTCTCCGATGTGCAGGTTATTATTAAAACCAGCTATCCCGGTCAGGCACCACAAATCGTTGAAAATCAGGTGACTTATCCGCTAACCACCACCATGTTGTCGGT‑GCCTGGCGCGAAGACTGTGCGCGGTTTCTCACAGTTTGGCGa < 1:593925/289‑1 (MQ=255) gcgcATTGAGGGAATAACCAATGATTGAATGGATTATTCGTCGCTCGGTGGCGAACCGTTTATTGGTGCTGATGGGCGCGTTGTTTCTGAGCATCTGGGGCACCTGGACCATCATTAATACGCCAGTGGATGCGCTGCCGGATCTCTCCGATGTGCAGGTTATTATTAAAACCAGCTATCCCGGTCAGGCACCACAAATCGTTGAAAATCAGGTCACTTACTCGCTAACCACCACAATGTTGTCGGT‑GCCTGGCGCGAAGACTGTGCGCGGTTTCTCCCAGTTTggag > 2:1457023/1‑286 (MQ=255) gcgcATTGAGGGAATAACCAATGATTGAAGGGATTATTCGTCGCTCGGTGGCGAACCGTTTTTTGGGGCTGATGGGCGCGTTGTTTCTGAGCATCTGGGGCACCTGGACCATCATTAATACGCCAGTGGATGCGCTGCCGGATCTCTCCGATGTGCAGGTTATTATTAAAACCAGCTATCCCGGTCAGGCACCACAAATCGTTGAAAATCAGGTGACTTATCCGCTAACCACCACCATGTTGTCGGT‑GCCTGGCGCGAAGACTGTGCGCGGTTTCTCACAGTTTGGCGa < 1:570837/289‑1 (MQ=255) cgcATTGAGGGAATAACCAATGATTGAATGGATTATTCGTCGCTCGGTGGCGAACCGTTTTTTGGTGCTGATGGGCGCGTTGTTTCTGAGCATCTGGGGCACCTGGACCATCATTAATACGCCAGTGGATGCGCTGCCGGATCTCTCCGATGTGCAGGTTATTATTAAAACCAGCTATCCCGGTCAGGCACCACAAATCGTTGAAAATCAGGTGACTTATCCGCTAACCACCACCATGTTGTCGGT‑GCCTGGCGCGAAGACTGTGCGCGGTTTCTCACAGTTTGGCGa < 1:1911163/288‑1 (MQ=255) cATTGGGGGAATAACCAATGATTGAATGGATTTTTTGTCGCTCGGTGGCGAACCGTTTTTTGGTGCTGATGGGCGCGTTGTTTCTGAGCATCTGGGGCACCTGGACCATCATTAATACGCCAGTGGATGCGCTGCCGGATCTCTCCGATGTGCAGGTTATTATTAAAACCAGCTATCCCGGTCAGGCACCACAAATCGTTGAAAATCAGGTGACTTATCCGCTAACCACCACCATGTTGTCGGT‑GCCTGGCGCGAAGACTGTGCGCGGTTTCTCACAGTTTGGCGAct < 2:862732/288‑1 (MQ=255) cATTGAGGGAATAACCAATGATTGAATGGATTATTCGTCGCTCGGTGGCGAACCGTTTTTTGGTGCTGATGGGCGCGTTGTTTCTGAGCATCTGGGGCACCTGGACCATCATTAATACGCCAGTGGATGCGCTGCCGGATCTCTCCGATGTGCAGGTTATTATTAAAACCAGCTATCCCGGTCAGGCACCACAAATCGTTGAAAATCAGGTGACTTATCCGCTAACCACCACCATGTTGTCGGT‑GCCTGGCGCGAAGACTGTGCGCGGTTTCTCACAGTTTgg < 2:1623186/283‑1 (MQ=255) ttGAGGGAATAACCAATGATTGAATGGATTATTCGTCGCTCGGTGGCGAACCGTTTTTTGGTGCTGATGGGCGCGTTGTTTCTGAGCATCTGGGGCACCTGGACCATCATTAATACGCCAGTGGATGCGCTGCCGGATCTCTCCGATGTGCAGGTTATTATTAAAACCAGCTATCCCGGTCAGGCACCACAAATCGTTGAAAATCAGGTGACTTATCCGCTAACCACCACCATGTTGTCGGT‑GCCTGGCGCGAAGACTGTGCGCGGTTTCTCACAGTTTGGCGACTCtt > 2:555837/1‑289 (MQ=255) ttGAGGGAATAACCAATGATTGAATGGATTATTCGTCGCTCGGTGGCGAACCGTTTTTTGGTGCTGATGGGCGCGTTGTTTCTGAGCATCTGGGGCACCTGGACCATCATTAATACGCCAGTGGATGCGCTGCCGGATCTCTCCGATGTGCAGGTTATTATTAAAACCAGCTATCCCGGTCAGGCACCACAAATCGTTGAAAATCAGGTGACTTATCCGCTAACCACCACCATGTTGTCGGT‑GCCTGGCGCGAAGACTGTGCGCGGTTTCTCACAGTTTGGCGACTCtt < 1:297527/289‑1 (MQ=255) ttGAGGGAATAACCAATGATTGAATGGATTATTCGTCGCTCGGTGGCGAACCGTTTTTTGGTGCTGATGGGCGCGTTGTTTCTGAGCATCTGGGGCACCTGGACCATCATTAATACGCCAGTGGATGCGCTGCCGGATCCCTCCGATGTGCAGGTTATTATTAAAACCAGCCATCCCGGTCAGGCACCACAAATCGTTGAAAATCAGGTGACTTATCCGCTAACCAACACCATGTTGTCGGT‑GCCTGGCGCGAAGACTGTGACCGGTTTCTCACATTTGGGCGCCTCtt > 2:206444/1‑289 (MQ=255) tgggggAATAACCAATGATTGAATGGATTATTCGTCGCTCGGTGGCGAACCGTTTTTTGGTGCTGATGGGCGCGTTGTTTCTGAGCATCTGGGGCACCTGGACCATCATTAATACGCCAGTGGATGCGCTGCCGGATCTCTCCGATGTGCAGGTTATTATTAAAACCAGCTATCCCGGTCAGGCACCACAAATCGTTGAAAATCAGGTGACTTATCCGCTAACCACCACCATGTTGTCGGT‑GCCTGGCGCGAAGACTGTGCGCGGTTTCTCACAGTTTGGCGACTCTTa < 2:1404558/286‑1 (MQ=255) tGAGGGAATAACCAATGATTGAATGGATTATTCGTCGCTCGGTGGCGAACCGTTTTTTGGTGCTGATGGGCGCGTTGTTTCTGAGCATCTGGGGCACCTGGACCATCATTAATACGCCAGTGGATGCGCTGCCGGATCTCTCCGATGTGCAGGTTATTATTAAAACCAGCTATCCCGGTCAGGCACCACAAATCGTTGAAAATCAGGTGACTTATCCGCTAACCACCACCATGTTGTCGGT‑GCCTGGCGCGAAGACTGTGCGCGGTTTCTCACAGTTTGGCGACTCTTa > 1:1660499/1‑289 (MQ=255) aCCAATGATTGAATGGATTATTCGTCGCTCGGTGGCGAACCGTTTTTTGGTGCTGATGGGCGCGTTGTTTCTGAGCATCTGGGGCACCTGGACCATCATTAATACGCCAGTGGATGCGCTGCCGGATCTCTCCGATGTGCAGGTTATTATTAAAACCAGCTATCCCGGTCAGGCACCACAAATCGTTGAAAATCAGGTGACTTATCCGCTAACCACCACCATGTTGTCGGT‑GCCTGGCGCGAAGACTGTgcg < 1:1401981/252‑1 (MQ=255) 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ttattCGTCGCTCGGTGGCGAACCGTTTTTTGGTGCTGATGGGCGCGTTGTTTCTGAGCATCTGGGGCACCTGGACCATCAATAATACGCCAGTTGATGCGCTGCCGGATCTCTCCGATGTGCAGGTTATTATTAAAACCAGCTATCCCGGTCAGGCACCACAAATCGTTGAAAATCAGGTGACTTATCCGCTAACCACCACCATGTTGTCGGT‑GCCTGGCGCGAAGACTGTGCGCGGTTTCTCACAGTTTGGCGACTCTTATGTGTATGTCATTTTCGAAGATGGCa < 1:366409/288‑1 (MQ=255) gTTTTTTGGTGCTGATGGGCGCGTTGTTTCTGAGCATCTGGGGCACCTGGACCATCATTAATACGCCAGTGGATGCGCTGCCGGATCTCTCCGATGTGCAGGTTATTATTAAAACCAGCTATCCCGGTCAGGCACCACAAATCGTTGAAAATCAGGTGACTTATCCGCTAACCACCACCATGTTGTCGGT‑GCCTGGCGCGAAGACTGTGCGCGGTTTCTCACAGTTTGGCGACTCTTATGTGTATGTCATTTTCGAAGATGGCACCGATCCGTACTGGGCGCGttcgcg < 1:1284620/289‑6 (MQ=255) tttttGGTGCTGATGGGCGCGTTGTTTCTGAGCATCTGGGGCACCTGGACCATCATTAATACGCCGGTGGATGCGCTGCCGGATCTCTCCGATGTGCAGGTTATTATTAAAACCAGCTATCCCGGTCAGGCACCACAAATCGTTGAAAATCAGGTGACTTATCCGCTAACCACCACCATGTTGTCGGT‑GCCTGGCGCGAAGACTGTGCGCGGTTTCTCACAGTTTCGCGACTCTTATGTGTATGTCATTTTCGAAGATGGCACCGATCCGTACTGGGCGCGttcgcggg < 2:535207/289‑8 (MQ=255) 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caccaTGTTGTCGGT‑GCCTGGCGCGAAGACTGTGCGCGGTTTCTCACAGTTTGGCGACTCTTATGTGTATGTCATTTTCGAAGATGGCACCGATCCGTACTGGGCGCGTTCGCGGGTGCTGGAGTACCTCAACCAGGTACAGGGTAAGCTGCCTGCGGGAGTCAGCGCCGAGCTGGGGCCAGATGCCACGGGTGTTGGCTGGATCTATGAATATGCACTGGTGGATCGCAGCGGTAAGCACGATCTGGCCGATTTACGCTCATTACAGGACTGGTTTCTCAAATATGa > 1:795184/1‑288 (MQ=255) caccaTGTTGTCGGT‑GCCTGGCGCGAAGACTGTGCGCGGTTTCTCACAGTTTGGCGACTCTTATGTGTATGTCATTTTCGAAGATGGCACCGATCCGTACTGGGCGCGTTCGCGGGTGCTGGAGTACCTCAACCAGGTACAGGGTAAGCTGCCTGCGGGAGTCAGCGCCGAGCTGGGGCCAGATGCCACGGGTGTTGGCTGGATCTATGAATATGCACTGGTGGATCGCAGCGGTAAGCACGATCTGGCCGATTTACGCTCATTACAGGACTGGTTTCTCAAATATGAg < 1:1936066/289‑1 (MQ=255) caTGTTGTCGGT‑GCCTGGCGCGAACACTGTGCGCGGTTTCTCACAGTTTGGCGACTCTTATGTGTATGTCATCTTCGAAGATGGCACCGATCCGTACTCGGCGCGTTCGCGGGTGCTGGAGTACCTCAACCAGGTACAGGGTACGCTGCCTGCGGGCGTCAGCGCCGAGCTGGGGCCAGTGGCCACGGGTCTTGGCTGGATCGTGGACTACGCACTGGTGGACCGCACCGGCAAGGCCGATCGGGTCCATTTACGCTCATTACAGGACTGGTTTCTCAAatatcacttt > 2:877698/1‑283 (MQ=255) ||| CGCACTGGAGCGGATGCGCTCTGAAAGTGCTACCCATGCGCATTGAGGGAATAACCAATGATTGAATGGATTATTCGTCGCAGCGTGGCGAACCGTTTTTTGGTGCTGATGGGCGCGTTGTTTCTGAGCATCTGGGGCACCTGGACCATCATTAATACGCCAGTGGATGCGCTGCCGGATCTCTCCGATGTGCAGGTTATTATTAAAACCAGCTATCCCGGTCAGGCACCACAAATCGTTGAAAATCAGGTGACTTATCCGCTAACCACCACCATGTTGAGCGT‑GCCTGGCGCGAAGACTGTGCGCGGTTTCAGTCAGTTTGGCGACTCTTATGTGTATGTCATTTTCGAAGATGGCACCGATCCGTACTGGGCGCGTAGCCGGGTGCTGGAGTACCTCAACCAGGTACAGGGTAAGCTGCCTGCGGGAGTCAGCGCCGAGCTGGGGCCAGATGCCACGGGTGTTGGCTGGATCTATGAATATGCACTGGTGGATCGCAGCGGTAAGCACGATCTGGCCGATTTACGCAGTTTACAGGACTGGTTTCTCAAATATGAGCTG > CP042583/478109‑478669 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |