| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP042583 | 911,127 | 3 bp→TCA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP042583 | 911,127 | 0 | A | T | 99.2% | 595.0 / NA | 254 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (117/133); minor base C (2/0); total (120/134) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.22e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
| * | CP042583 | 911,128 | 0 | G | C | 100.0% | 602.9 / NA | 254 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base C (120/134); total (120/134) | |||||||||||
| * | CP042583 | 911,129 | 0 | T | A | 99.6% | 600.2 / NA | 254 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base A (120/133); minor base C (0/1); total (120/134) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 254 total aligned reads displayed.
GCTGGCATGATGCGCAGCATTTCACGGTGCAAGCCTCTACGCCGCTTAAAGCCAAACGCGCATGGAAACTGTGCGCGCTTTATCCCAGCCTGAAAGATAGTTATTGGTTAAGCTTGAACTATGGTATGCAGGAGGCTGCTCGCCGCTACGGTGTGGATTTAAAAGTGCTGGAGGCAGGCGGCTACAGCCAGTTGGCTACCCAGCAAGCACAAATCGACCAGTGTAAACAGTGGGGCGCAGAGGCCATTTTGCTCGGTAGTAGCACGACCAGTTTTCCCGACCTGCAAAAGCAGGTAGCAAGTCTGCCGGTGATCGAACTGGTAAATGCTATTGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGTTTCAGATGGGCTATCAACCGGGGCGATATCTGGTGCAATGGGCGCACGGTAAACCACTGAATGTGCTGTTGATGCCCGGACCCGATAACGCCGGGGGCAGTAAGGAGATGGTCGAGGGTTTTCGCGCAGCCATTGCCGGAAGCCCGGTGCGTATTGTTGATATTGCGCTTGGTGATAA > CP042583/910858‑911407 ||| gCATGATGCGCAGCATTTCACGGTGCAAGCCTCTACGCCGCTTAAAGCCAAACGCGCATGGAAACTGTGCGCGCTTTATCCCAGCCTGAAAGATTCATATTGGTTATCGTTGAACTATGGTATGCAGGAGGCTGCTCGCCGCTACGGTGTGGATTTAAAAGTGCTGGAGGCAGGCGGCTACAGCCAGTTGGCTACCCAGCAAGCACAAATCGACCAGTGTAAACAGTGGGGCGCAGAGGCCATTTTGCTCGGTAGTAGCACGACCTCATTTCCCGACCTGCAAAAGCAg > 1:63454/1‑289 (MQ=255) atgatgCGCAGCATTTCACGGTGCAAGCCTCTACGCCGCTTAAAGCCAAACGCGCATGGAAACTGTGCGCGCTTTATCCCAGCCTGAAAGATTCATATTGGTTATCGTTGAACTATGGTATGCAGGAGGCTGCTCGCCGCTACGGTGTGGATTTAAAAGTGCTGGAGGCAGGCGGCTACAGCCAGTTGGCTACCCAGCAAGCACAAATCGACCAGTGTAAACAGTGGGGCGCAGAGGCCATTTTGCTCGGTAGTAGCACGACCCCATTTCCCGACCTGCAAAAGCAGGt > 2:121009/1‑289 (MQ=255) cagcaTTTCACGGTGCAAGCCTCTACGCCGCTTAAAGCCAAACGCGCATGGAAACTGTGCGCGCTTTATCCCAGCCTGAAAGATTCATATTGGTTATCGTTGAACTATGGTATGCAGGAGGCTGCTCGCCGCTACGGTGTGGATTTAAAAGTGCTGGAGGCAGGCGGCTACAGCCAGTTGGCTACCCAGCAAGCACAAATCGACCAGTGTAAACAGTGGGGCGCAGAGGCCATTTTGCTCGGTAGTAGCACGACCTCATTTCCCGACCTGCAAAAGCAGGTAGCAAg > 1:1750756/1‑287 (MQ=255) aCGGTGCAAGCCTCTACGCCGCTTAAAGCCAAACGCGCATGGAAACTGTGCGCGCTTTATCCCAGCCTGAAAGATTCATATTGGTTATCGTTGAACTATGGTATGCAGGAGGCTGCTCGCCGCTACGGTGTGGATTGAAAAGTGCTGGAGGCAGGCGGCTACAGCCAGTTGGCTACCAAGCAAGCACAAATCGACCAGTGTAAACAGTGGGGCGCAGAGGCCATTTTGCTCGGTAGTAGCACGACCTCATTTCCCGACCTGCAAAAGCAGGTAGCAAGTCTGCCGGTGa < 1:1220959/289‑1 (MQ=255) gCAAGCCTCTACGCCGCTTAAAGCCAAACGCGCATGGAAACTGTGCGCGCTTTATCCCAGCCTGAAAGATTCATATTGGTTATCGTTGAACTATGGTATGCAGGAGGCTGCTCGCCGCTACGGTGTGGATTTAAAAGTGCTGGAGGCAGGCGGCTACAGCCAGTTGGCTACCCAGCAAGCACAAATCGACCAGTGTAAACAGTGGGGCGCAGAGGCCATTTTGCTCGGTAGTAGCACGACCTCATTTCCCGACCTGCAAAAGCAGGTAGCAAGTCTGCCGGTGATCGa < 1:1479474/288‑1 (MQ=255) ccTCTACGCCGCTTAAAGCCAAACGCGCATGGAAACTGTGCGCGCTTTATCCCAGCCTGAAAGATTCATATTGGTTATCGTTGAACTATGGTATGCAGGAGGCTGCTCGCCGCTACGGTGTGGATTTAAAAGTGCTGGAGGCAGGCGGCTACAGCCAGTTGGCTACCCAGCAAGCACAAATCGACCAGTGTAAACAGTGGGGCGCAGAGGCCATTTTGCTCGGTAGTAGCACGACCTCATTTCCCGACCTGCAAAAGCAGGTAGCAAGTCTGCCGGTGATCGAACTGGt < 2:63454/289‑1 (MQ=255) tACGCCGCTTAAAGCCAAACGCGCATGGAAACTGTGCGCGCTTTATCCCAGCCTGAAAGATTCATATTGGTTATCGTTGAACTATGGTATGCAGGAGGCTGCTCGCCGCTACGGTGTGGATTTAAAAGTGCTGGAGGCAGGCGGCTACAGCCAGTTGGCTACCCAGCAAGCACAAATCGACCAGTGTAAACAGTGGGGCGCAGAGGCCATTTTGCTCGGTAGTAGCACGACCTCATTTCCCGACCTGCAAAAGCAGGTAGCAAGTATGCCGGTGATCGAACTGGTAAAt > 1:1352000/1‑289 (MQ=255) cTTAAAGCCAAACGCGCATGGAAACTGTGCGCGCTTTATCCCAGCCTGAAAGATTCATATTGGTTATCGTTGAACTATGGTATGCAGGAGGCTGCTCGCCGCTACGGTGTGGATTTAAAAGTGCTGGAGGCAGGCGGCTACAGCCAGTTGGCTACCCAGCAAGCACAAATCGACCAGTGTAAACAGTGGGGCGCAGAGGCCATTTTGCTCGGTAGTAGCACGACCTCATTTCCCGACCTGCAAAAGCAGGTAGCAAGTCTGCCGGTGATCGAACTGGTAAATGCTATTg > 2:236089/1‑289 (MQ=255) aaaGCCAAACGCGCATGGAAACTGTGCGCGCTTTATCCCAGCCTGAAAGATTCATATTGGTTATCGTTGAACTATGGTATGCAGGAGGCTGCTCGCCGCTACGGTGTGGATTTAAAAGTGCTGGAGGCAGGCGGCTACAGCCAGTTGGCTACCCAGCAAGCACAAATCGACCAGTGTAAACAGTGGGGCGCAGAGGCCATTTTGCTCGGTAGTAGCACGACCTCATTTCCCGACCTGCAAAAGCAGGTAGCAAGTCTGCCGGTGATCGAACTGGTAAATGCTATTGATg < 1:290041/289‑1 (MQ=255) aCGCGCATGGAAACTGTGCGCGCTTTATCCCAGCCTGAAAGATTCATATTGGTTATCGTTGAACTATGGTATGCAGGAGGCTGCTCGCCGCTACGGTGTGGATTTAAAAGTGCTGGAGGCAGGCGGCTACAGCCAGTTGGCTACCCAGCAAGCACAAATCGACCAGTGTAAACAGTGGGGCGCAGAGGCCATTTTGCTCGGTAGTAGCACGACCTCATTTCCCGACCTGCAACAGCAGGTAGCAAGTCTGCCGGTGATCGAACTGGTAAATGCTATTGATGCTCCCCAg > 1:824312/1‑289 (MQ=255) cATGGAAACTGTGCGCGCTTTATCCCAGCCTGAAAGATTCATATTGGTTATCGTTGAACTATGGTATGCAGGAGGCTGCTCGCCGCTACGGTGTGGATTTAAAAGTGCTGGAGGCAGGCGGCTACAGCCAGTTGGCTACCCAGCAAGCACAAATCGACCAGTGTAAACAGTGGGGCGCAGAGGCCATTTTGCTCGGTAGTAGCACGACCTCATTTCCCGACCTGCAAAAGCAGGTAGCAAGTCTGCCGGTGATCGAACTGGTAAATGCTATTGATGCTCCCCAGGTGaa > 1:1093526/1‑289 (MQ=255) cTGTGCGCGCTTTATCCCAGCCTGAAAGATTCATATTGGTTATCGTTGAACTATGGTATGCAGGAGGCTGCTCGCCGCTACGGTGTGGATTTAAAAGTGCTGGAGGCAGGCGGCTACAGCCAGTTGGCTACCCAGCAAGCACAAATCGACCAGTGTAAACAGTGGGGCGCAGAGGCCATTTTGCTCGGTAGTAGCACGACCTCATTTCCCGACCTGCAAAAGCAGGTAGCAAGTCTGCCGGTGATCGAACTGGTAAATGCTATTGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCcgcg < 1:863466/289‑1 (MQ=255) cTGTGCGCGCTTTATCCCAGCCTGAAAGATTCATATTGGTTATCGTGGAACTATGGTATGCAGGAGGCTGCTCGCCGCTACGGTGTGGATTTAAAAGTGCTGGAGGCAGGCGGCTACAGCCAGTTGGCTACCCAGCAAGCACAAATCGACCAGTGTAAACAGTGGGGCGCAGAGGCCATTTTGCTCGGTAGTAGCACGACCTCATTTCCCGACCTGCAAAAGCAGGTAGCAAGTCTGCCGGTGATCGAACTGGTAAATGCTATTGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCcgcg < 1:1738163/289‑1 (MQ=255) tgtgCGCGCTTTATCCCAGCCTGAAAGATTCATATTGGTTATCGTTGAACTATGGTATGCAGGAGGCTGCTCGCCGCTACGGTGTGGATTTAAAAGTGCTGGAGGCAGGCGGCTACAGCCAGTTGGCTACCCAGCAAGCACAAATCGACCAGTGTAAACAGTGGGGCGCAGAGGCCATTTTGCTCGGTAGTAGCACGACCTCATTTCCCGACCTGCAAAAGCAGGTAGCAAGTCTGCCGGTGATCGAACTGGTAAATGCTATTGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCCGCGt < 1:469232/289‑1 (MQ=255) tgCGCGCTTTATCCCAGCCTGAAAGATTCATATTGGTTATCGTTGAACTATGGTATGCAGGAGGCTGCTCGCCGCTACGGTGTGGATTTAAAAGTGCTGGAGGCAGGCGGCTACCGCCAGTTGGCTACCCAGCAAGCACAAATCCACCAGTGTAAACAGTGGGGCGCAGACGCCATCTTGCTCGGTAGTAGCACGACCTCATTTCCCGACCTGCAAAAGCAGGTAGCAAGTCTGCCGGTGATCGCACTGGTAAATGCTATTGATGTCCCCCAGGTTAAAAGCCGAGTTg > 2:1506037/1‑289 (MQ=255) tgCGCGCTTTATCCCAGCCTGAAAGATTCATATTGGTTATCGTTGAACTATGGTATGCAGGAGGCTGCTCGCCGCTACGGTGTGGATTTAAAAGTGCTGGAGGCAGGCGGCTACAGCCAGTTGGCTACCCAGCAAGCACAAATCGACCAGTGTAAACAGTGGGGCGCAGAGGCCATTTTGCTCGGTAGTAGCACGACCTCATTTCCCGCCCTGCAAAAGCAGGTAGCAAGTCTGCCGGTGATCGAACTGGTAAATGCCATTGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCAGCGTTg > 2:1400459/1‑289 (MQ=255) tgCGCGCTTTATCCCAGCCTGAAAGATTCATATTGGTTATCGTTGAACTATGGTATGCAGGAGGCTGCTCGCCGCTACGGTGTGGATTTAAAAGTGCTGGAGGCAGGCGGCTACAGCCAGTTGGCTACCCAGCAAGCACAAATCGACCAGTGTAAACAGTGGGGCGCAGAGGCCATTTTGCTCGGTAGTAGCACGACCTCATTTCCCGACCTGCAAAAGCAGGTAGCAAGTCTGCCGGTGATCGAACTGGTAAATGCTATTGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCCGCGTTg > 1:915738/1‑289 (MQ=255) gcgcTTTATCCCAGCCTGAAAGATTCATATTGGTTATCGTTGAACTATGGTATGCAGGAGGCTGCTCGCCGCTACGGTGTGGATTTAAAAGTGCTGGAGGCAGGCGGCTACAGCCAGTTGGCTACCCAGCAAGCACAAATCGACCAGTGTAAACAGTGGGGCGCAGAGGCCATTTTGCTCGGTAGTAGCACGACCTCATTTCCCGACCTGCAAAAGCAGGTAGCAAGTCTGCCGGTGATCGAACTGGTAAATGCTATTGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCCGCGTTGgt < 1:1484490/288‑1 (MQ=255) ttATCCCAGCCTGAAAGATTCATATTGGTTATCGTTGAACTATGGTATGCAGGAGGCTGCTCGCCGCTACGGTGTGGATTTAAAAGTGCTGGAGGCAGGCGGCTACAGCCAGTTGGCTACCCAGCAAGCACAAATCGACCAGTGTAAACAGTGGGGCGCAGAGGCCATTTTGCTCGGTAGTAGCACGACCTCATTTCCCGACCTGCAAAAGCAGGTAGCAAGTCTGCCGGTGATCGAACTGGTAAATGCTATTGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGccc < 1:812381/289‑1 (MQ=255) gCCTGAAAGATTCATATTGGTTATCGTTGAACTATGGTATGCAGGAGGCTGCTCGCCGCTACGGTGTGGATTTAAAAGTGCTGGAGGCAGGCGGCTACAGCCAGTTGGCTACCCAGCAAGCACAAATCGACCAGTGTAAACAGTGGGGCGCAGAGGCCATTTTGCTCGGTAGTAGCACGACCTCATTTCCCGACCTGCAAAAGCAGGTAGCAAGTCTGCCGGTGATCGAACTGGTAAATGCTATTGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGTTTCa > 1:982518/1‑289 (MQ=255) ccTGAAAGATTCATATTGGTTATCGTTGAACTATGGTATGCAGGAGGCTGCTCGCCGCTACGGTGTGGATTTAAAAGTGCTGGAGGCAGGCGGCTACAGCCAGTTGGCTACCCAGCAAGCACAAATCGACCAGTGTAAACAGTGGGGCGCAGAGGCCATTTTGCTCGGTAGTAGCACGACCTCATTTCCCGACCTGCAAAAGCAGGTAGCAAGTCTGCCGGTGATCGaa < 1:1378853/229‑1 (MQ=255) ccTGAAAGATTCATATTGGTTATCGTTGAACTATGGTATGCAGGAGGCTGCTCGCCGCTACGGTGTGGATTTAAAAGTGCTGGAGGCAGGCGGCTACAGCCAGTTGGCTACCCAGCAAGCACAAATCGACCAGTGTAAACAGTGGGGCGCAGAGGCCATTTTGCTCGGTAGTAGCACGACCTCATTTCCCGACCTGCAAAAGCAGGTAGCAAGTCTGCCGGTGATCGAACTGGTAAATGCTATTGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGTTTCAg > 2:1833073/1‑289 (MQ=255) ccTGAAAGATTCATATTGGTTATCGTTGAACTATGGTATGCAGGAGGCTGCTCGCCGCTACGGTGTGGATTTAAAAGTGCTGGAGGCAGGCGGCTACAGCCAGTTGGCTACCCAGCAAGCACAAATCGACCAGTGTAAACAGTGGGGCGCAGAGGCCATTTTGCTCGGTAGTAGCACGACCTCATTTCCCGACCTGCAAAAGCAGGTAGCAAGTCTGCCGGTGATCGAACTGGTAAATGCTATTGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGTTTCAg > 2:874227/1‑289 (MQ=255) tGAAAGATTCATATTGGTTATCGTTGGAAGATGGTAGGCCGGAGGCTGCTCGCCGCGACGGTGTGGATGTAAAAGTGCTGGAGGCAGGCGGCTACAGCCAGTTGGCTACCCAGCAAGCACAAATCGACCAGTGTAAACAGTGGGGCGCAGAGGCCATTTTGCTCGGTAGTAGCACGACCTCATTTCCCGACCTGCAAAAGCAGGTAGCAAGTCTGCCGGTGATCGAACTGGTAAATGCTATTGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGTTTCAGAt < 2:1750756/289‑1 (MQ=255) tGAAAGATTCATATTGGTTATCGTTGAACTATGGTATGCAGGAGGCTGCTCGCCGCTACGGTGTGGATTTAAAAGTGCTGGAGGCAGGCGGCTACAGCCAGTTGGCTACCCAGCAAGCACAAATCGACCAGTGTAAACAGTGGGGCGCAGAGGCCATTTTGCTCGGTAGTAGCACGACCTCATTTCCCGACCTGCAAAAGCAGGTAGCAAGTCTGCCGGTGATCGAACTGGTAAATGCTATTGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGTTTCAGAt < 2:801247/289‑1 (MQ=255) aaagattcatATTGGTTATCGTTGAACTATGGTATGCAGGAGGCTGCTCGCCGCTACGGTGTGGATTTAAAAGTGCTGGAGGCAGGCGGCTACAGCCAGTTGGCTACCCAGCAAGCACAAATCGACCAGTGTAAACAGTGGGGCGCAGAGGCCATTTTGCTCGGTAGTAGCACGACCTCATTTCCCGACCTGCAAAAGCAGGTAGCAAGTCTGCCGGTGATCGAACTGGTAAATGCTATTGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGTTTCAGATgg > 1:1025790/10‑289 (MQ=255) ttcctATTGGTTATCGTTGAACTTGTGTATGCAGGGGGCTGCACGCCGCTACGGTGTGGAATTAAAAGTGCTGGAGGCAGGCGGCTACAGCCAGTTGGCTACCCAGCAAGCACAAATCGACCAGTGTAAACAGTGGGGCGCAGAGGCCATTTTGCTCGGTAGTAGCACGACCTCATTTCCCGACCTGCAAAAGCAGGTAGCAAGTCTGCCGGTGATCGAACTGGTAAATGCTATTGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGTTTCAGATGGGCTa < 2:1665307/284‑1 (MQ=255) tcatATTGGTTATCGTTGAACTATGGTATGCAGGAGGCTGCTCGCCGCTACGGTGTGGATTTAAAAGTGCTGGAGGCAGGCGGCTACAGCCAGTTGGCTACCCAGCAAGCACAAATCGACCAGTGTAAACAGTGGGGCGCAGAGGCCATTTTGCTCGGTGGTAGCACGACCTCATTTCCCGACCTGCACAAGCAGGTAGCAAGTCTGCCGGTGAACGAACTGGTAAATGCTATTGATTCTCCCCAGGTGAAAAGCCGCAATGGTGTTCCCTGGTGTCCGAGTGGCTAta > 2:1534259/4‑288 (MQ=255) tcatATTGGTTATCGTTGAACTATGGTATGCAGGAGGCTGCTCGCCGCTACGGTGTGGATTTAAAAGTGCTGGAGGCAGGCGGCTACAGCCAGTTGGCTACCCAGCAAGCACAAATCGACCAGTGTAAACAGTGGGGCGCAGAGGCCATTTTGCTCGGTAGTAGCACGACCTCATTTCCCGACCTGCAAAAGCAGGTAGCAAGTCTGCCGGTGATCGAACTGGTAAATGCTATTGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGTTTCAGATGGGCTAt > 2:1171882/4‑288 (MQ=255) catATTGGTTATCGTTGAACTATGGTATGCAGGAGGCTGCTCGCCGCTACGGTGTGGATTTAAAAGTGCTGGAGGCAGGCGGCTACAGCCAGTTGGCTACCCAGCAAGCACAAATCGACCAGTGTAAACAGTGGGGCGCAGAGGCCATTTTGCTCGGTAGTAGCACGACCTCATTTCCCGACCTGCAAAAGCAGGTAGCAAGTCTGCCGGTGATCGAACTGGTAAATGCTATTGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGTTTCAGATGGGCTATCa > 1:654962/3‑289 (MQ=255) atATTGGTTATCGTTGAACTATGGTATGCAGGAGGCTGCTCGCCGCTACGGTGTGGATTTAAAAGTGCTGGAGGCAGGCGGCTACAGCCAGTTGGCTACCCAGCAAGCACAAATCGACCAGTGTAAACAGTGGGGCGCAGAGGCCATTTTGCTCGGTAGTAGCACGACCTCATTTCCCGACCTGCAAAAGCAGGTAGCAAGTCTGCCGGTGATCGAACTGGTAAATGCTATTGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGTTTCAGATGGGCTATCaa < 1:236089/288‑1 (MQ=255) tATTGGTTATCGTTGAACTATGGTATGCAGGAGGCTGCTCGCCGCTACGGTGTGGATTTAAAAGTGCTGGAGGCAGGCGGCTACAGCCAGTTGGCTACCCAGCAAGCACAAATCGACCAGTGTAAACAGTGGGGCGCAGAGGCCATTTTGCTCGGTAGTAGCACGACCTCATTTCCCGACTTGCAAAAGCAGGTAGCAAGTCTGCCGGTGATCGAACTGGTAAATGCTATTGATGCTCCCCAGGTGAGAAGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGTTTCAGATGGGCTATCAAc < 1:1180692/289‑1 (MQ=255) ggttatcgttGAACTATGGTATGCAGGAGGCTGCTCGCCGCTACGGTGTGGATTTAAAAGTGCTGGAGGCAGGCGGCTACAGCCAGTTGGCTACCCAGCAAGCACAAATCGACCAGTGTAAACAGTGGGGCGCAGAGGCCATTTTGCTCGGTAGTAGCACGACCTCATTTCCCGACCTGCAAAAGCAGGTAGCAAGTCTGCCGGTGATCGAACTGGTAAATGCTATTGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGTTTCAGATGGGCTATCAACCggg < 1:416350/281‑1 (MQ=255) cgttGAACTATGGTATGCAGGAGGCTGCTCGCCGCTACGGTGTGGATTTAAAAGTGCTGGAGGCAGGCGGCTACAGCCAGTTGGCTACCCAGCAAGCACAAATCGACCAGTGTAAACAGTGGGGCGCAGAGGCCATTTTGCTCGGTAGTAGCACGACCTCATTTCCCGACCTGCAAAAGCAGGTAGCAAGTCTGCCGGTGATCGAACTGGTAAATGCTATTGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGtt > 1:1211949/3‑262 (MQ=255) cgttGAACTATGGTATGCAGGAGGCTGCTCGCCGCTACGGTGTGGATTTAAAAGTGCTGCAGGCAGGCGGCTACAGCCAGTTGGCTACCCAGCAAGCACAAATCGACCAGTGTAAACAGTGGGGCGCAGAGGCCATTTTGCTCGGTAGTAGCACGACCTCATTTCCCGACCTGCAAAAGCAGGTGGCAAGTCTGCCGGTGATCGCACTGGTAAATGCTATTGATGCACCCCAGCAGAAAAGCCGCTTGGGTGTTGCCTGGTTTCAGAGGGGCCAGGAACCGTGGcacca > 2:348971/3‑285 (MQ=255) gttGAACTATGGTATGCAGGAGGCTGCTCGCCGCTACGGTGTGGATTTAAAAGTGCTGGAGGCAGGCGGCTACAGCCAGTTGGCTACCCAGCAAGCACAAATCGACCAGTGTAAACAGTGGGGCGCAGAGGCCATTTTGCTCGGTAGTAGCACGACCTCATTTCCCGACCTGCAAAAGCAGGTAGCAAGTCTGCCGGTGATCGAACTGGTAAATGCTATTGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGTTTCAGATGTGCTATCAACCGGGGCGata > 1:13062/2‑288 (MQ=255) gttGAACTATGGTATGCAGGAGGCTGCTCGCCGCTACGGTGTGGATTTAAAAGTGCTGGAGGCAGGCGGCTACAGCCAGTTGGCTACCCAGCAAGCACAAATCGACCAGTGTAAACAGTGGGGCGCAGAGGCCATTTTGCTCGGTAGTAGCACGACCTCATTTCCCGACCTGCAAAAGCAGGTAGCAAGTCTGCCGGTGATCGAACTGGTAAATGCTATTGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGTTTCAGATGGGCTATCAACCGGGGCGatat < 1:1642062/288‑1 (MQ=255) aaCTATGGTATGCAGGAGGCTGCTCGCCGCTACGGTGTGGATTTAAAAGTGCTGGAGGCAGGCGGCTACAGCCAGTTGGCTACCCAGCAAGCACAAATCGACCAGTGTAAACAGTGGGGCGCAGAGGCCATTTTGCTCGGTAGTAGCACGACCTCATTTCCCGACCTGCAAAAGCAGGTAGCAAGTCTGCCGGTGATCGAACTGGTAAATGCTATTGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGTTTCAGATGGGCTATCAACCGGGGCGATGACTgg > 2:612493/1‑289 (MQ=255) aCTATGGTATGCAGGAGGCTGCTCGCCGCTACGGTGTGGATTTAAAAGTGCTGGAGGCAGGCGGCTACAGCCAGTTGGCTACCCAGCAAGCACAAATCGACCAGTGTAAACAGTGGGGCGCAGAGGCCATTTTGCTCGGTAGTAGCACGACCTCATTTCCCGACCTGCAAAAGCAGGTAGCAAGTCTGCCGGTGATCGAACTGGTAAATGCTATTGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGTTTCAGATGGGCTATCAACCGGGGCGATATCTgg < 1:932209/288‑1 (MQ=255) aCTATGGTATGCAGGAGGCTGCTCGCCGCTACGGTGTGGATTTAAAAGTGCTGGAGGCAGGCGGCTACAGCCAGTTGGCTACCCAGCAAGCACAAATCGACCAGTGTAAACAGTGGGGCGCAGAGGCCATTTTGCTCGGTAGTAGCACGACCTCATTTCCCGACCTGCAAAAGCAGGTAGCAAGTCTGCCGGTGATCGAACTGGTAAATGCTATTGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGTTTCAGATGGGCTATCAACCGGGGCGATATCTGGt < 1:60626/289‑1 (MQ=255) tGCAGGAGGCTGCTCGCCGCTACGGTGTGGATTTAAAAGTGCTGGAGGCAGGCGGCTACAGCCAGTTGGCTACCCAGCAAGCACAAATCGACCAGTGTAAACAGTGGGGCGCAGAGGCCATTTTGCTCGGTAGTAGCACGACCTCATTTCCCGACCTGCAAAAGCAGGTAGCAAGTCTGCCGGTGATCGAACTGGTAAATGCTATTGATGCTCCCCAGGTGAGAAGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGTTTCAGATGGGCTATCAACCGGGGCGATATCTGGTGCAATGGgc > 1:1897770/1‑289 (MQ=255) tGCAGGAGGCTGCTCGCCGCTACGGTGTGGATTTAAAAGTGCTGGAGGCAGGCGGCTACAGCCAGTTGGCTACCCAGCAAGCACAAATCGACCAGTGTAAACAGTGGGGCGCAGAGGCCATTTTGCTCGGTAGTAGCACGACCTCATTTCCCGACCTGCAAAAGCAGGTAGCAAGTCTGCCGGTGATCGAACTGGTAAATGCTATTGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGcc > 2:89259/1‑241 (MQ=255) tGCAGGAGGCTGCTCGCCGCTACGGTGTGGATTTAAAAGTGCTGGAGGCAGGCGGCTACAGCCAGTTGGCTACCCAGCAAGCACAAATCGACCAGTGTAAACAGTGGGGCGCAGAGGCCATTTTGCTCGGTAGTAGCACGACCTCATTTCCCGACCTGCAAAAGCAGGTAGCAAGTCTGCCGGTGATCGAACTGGTAAATGCTATTGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGcc < 1:89259/241‑1 (MQ=255) gCAGGAGGCTGCTCGCCGCTACGGTGTGGATTTAAAAGTGCTGGAGGCAGGCGGCTACAGCCAGTTGGCTACCCAGCAAGCACAAATCGACCAGTGTAAACAGTGGGGCGCAGAGGCCATTTTGCTCGGTAGTAGCACGACCTCATTTCCCGACCTGCAAAAGCAGGTAGCAAGTCTGCCGGTGATCGAACTGGTAAATGCTATTGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGTTTCAGATGGGCTATCAACCGGGGCGATATCTGGTGCAATGGgcg < 1:1430829/289‑1 (MQ=255) gCAGGAGGCTGCTCGCCGCTACGGTGTGGATTTAAAAGTGCTGGAGGCAGGCGGCTACAGCCAGTTGGCTACCCAGCAAGCACAAATCGACCAGTGTAAACAGTGGGGCGCAGAGGCCATTTTGCTCGGTAGTAGCACGACCTCATTTCCCGACCTGCAAAAGCAGGTAGCAAGTCTGCCGGTGATCGAACTGGTAAATGCTATTGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGTTTCAGATGGGCTATCAACCGGGGCGATATCTGGTGCAATGGgcg < 1:1695773/289‑1 (MQ=255) ggaggCGGGTGGCCGCTACGGGGGGGATTTAAAAGTGCTGGGGGCAGACGGCTACAGCCAGTTGGCTACCCAGCAAGCACAAATCGACCAGTGTAAACAGTGGGGCGCAGAGGCCATTTTGCTCGGTAGTAGCACGACCTCATTTCCCGACCTGCAAAAGCAGGTAGCAAGTCTGCCGGTGATCGAACTGGTAAATGCTATTGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGTTTCAGATGGGCTATCAACCGGGGCGATATCTGGTGCAATGGGCGCa < 2:1743634/288‑1 (MQ=255) gaggCTGCTCGCCGCTACGGTGTGGATTTAAAAGTGCTGGAGGCAGGCGGCTACAGCCAGTTGGCTACCCAGCAAGCACAAATCGACCAGTGTAAACAGTGGGGCGCAGAGGCCATTTTGCTCGGTAGTAGCACGACCTCATTTCCCGACCTGCAAAAGCAGGTAGCAAGTCTGCCGGTGATCGAACTGGTAAATGCTATTGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGTTTCAGATGGGCTATCAACCGGGGCGATATCTGGTGCAATGGGCGCACg > 2:1673330/1‑289 (MQ=255) ggCTGCTCGCCGCTACGGTGTGGATTTAAAAGTGCTGGAGGCAGGCGGCTACAGCCAGTTGGCTACCCAGCAAGCACAAATCGACCAGTGTAAACAGTGGGGCGCAGAGGCCATTTTGCTCGGTAGTAGCACGACCTCATTTCCCGACCTGCAAAAGCAGGTAGCAAGTCTGCCGGTGATCGAACTGGTAAATGCTATTGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGTTTCAGATGGGCTATCAACCGGGGCGATATCTGGTGCAATGGGCGCACGGt > 1:723179/1‑289 (MQ=255) gtgctCGCCGCTACGGGGTGGATTTAATAGTGCTGGAGGCAGGCGGCTACAGCCAGTTGGCTACCCAGCAAGCACAAATCGACCAGTGTAAACAGTGGGGCGCAGAGGCCATTTTGCTCGGTAGTAGCACGACCTCATTTCCCGACCTGCAAAAGCAGGTAGCAAGTCTGCCGGTGATCGAACTGTTAAATGCTATTGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCCGCGTTGGTTTGCCCTGGTTTCAGATGGGCTATCACCCGGGGCTATATCTGGTGCAATGGGCGCACGGTa < 1:1926402/287‑1 (MQ=255) ctgctCGCCGCTACGGTGTTGATTTAAAAGTGCTGGAGGCAGGCGGCTACAGCCAGTTGGCTACCCAACAAGGACAAATCGACCAGTGTAAACAGTGGGGCGCAGAGGCCATTTTGCTCGGTAGTAGCACGACCTCATTTCCCGACCTGCAAAAGCAGGTAGCAAGTCTGCCGGTGATCGAACTGGTAAATGCTATTGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGTTTCAGATGGGCTATCAACCGGGGCGATATCTGGTGCAATGGGCGCACGGTa < 2:298308/288‑1 (MQ=255) ctgctCGCCGCTACGGTGTGGATTTAAAAGTGCTGGAGGCAGGCGGCTACAGCCAGTTGGCTACCCAGCAAGCACAAATCGACCAGTGTAAACAGTGGGGCGCAGAGGCCATTTTGCTCGGTAGTAGCACGACCTCATTTCCCGACCTGCAAAAGCAGGTAGCAAGTCTGCCGGTGATCGAACTGGTAAATGCTATTGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGTTTCAGATGGGCTATCAACCGGGGCGATATCTGGTGCAATGGGCGCACGGTa < 2:663379/288‑1 (MQ=255) tgctCGCCGCTACGGTGTGGATTTAAAAGTGCTGGAGGCAGGCGGCTACAGCCAGTTGGCTACCCAGCAAGCACAAATCGACCAGTGTAAACAGTGGGGCGCAGAGGCCATTTTGCTCGGTAGTAGCACGACCTCATTTCCCGACCTGCAAAAGCAGGTAGCAAGTCTGCCGGTGATCGAACTGGTAAATGCTATTGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGTTTCAGATGGGCTATCAACCGGGGCGATATCTGGTGCAATGGGCGCa < 1:684675/282‑1 (MQ=255) tgctCGCCGCTACGGTGTGGATTTAAAAGTGCTGGAGGCAGGCGGCTACAGCCAGTTGGCTACCCAGCAAGCACAAATCGACCAGTGTAAACAGTGGGGCGCAGAGGCCATTTTGCTCGGTAGTAGCACGACCTCATTTCCCGACCTGCAAAAGCAGGTAGCAAGTCTGCCGGTGATCGAACTGGTAAATGCTATTGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGTTTCAGATGGGCTATCAACCGGGGCGATATCTGGTGCAATGGGCGCa > 2:97026/1‑282 (MQ=255) ctCGCCGCTACGGTGTGGATTTAAAAGTGCTGGAGGCAGGCGGCTACAGCCAGTTGGCTACCCAGCAAGCACAAATCGACCAGTGTAAACAGTGGGGCGCAGAGGCCATTTTGCTCGGTAGTAGCACGACCTCATTTCCCGACCTGCAAAAGCAGGTAGCAAGTCTGCCGGTGATCGAACTGGTAAATGCTATTGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGTTTCAGATGGGCTATCAACCGGGGCGATATCTGGTGCAATGGGCGCACGGTAAAcc > 1:1518260/1‑289 (MQ=255) gcTACGGGGGGGATTTAAAAGTGCTGGGGGCAGGCGGCTACAGCCAGTTGGCTACCCAGCAAGCACAAATCGACCAGTGTAAACAGTGGGGCGCAGAGGCCATTTTGCTCGGTAGTAGCACGACCTCATTTCCCGACCTGCAAAAGCAGGTAGCAAGTCTGCCGGTGATCGAACTGGTAAATGCTATTGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGTTTCAGATGGGCTATCAACCGGGGCGATATCTGGTGCAATGGGCGCACGGTAAACCACTGaa < 2:1058966/289‑1 (MQ=255) tACGGTGTGGATTTAAAAGTGCTGGAGGCAGGCGGCTACAGCCAGTTGGCTACCCAGCAAGCACAAATCGACCAGTGTAAACAGTGGGGCGCAGAGGCCATTTTGCTCGGTAGTAGCACGACCTCATTTCCCGACCTGCAAAAGCAGGTAGCAAGTCTGCCGGTGATCGAACTGGTAAATGCTATTGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGTTTCAGATGGGCTATCAACCGGGGCGATATCTGGTGCAATGGGCGCACGGTAAACCACTGAAt < 1:1840966/288‑1 (MQ=255) gATTGAAGAGGGGTGGAGACAGGGGGCTACAGCCAGTTGGCTACCCAGCTAGGCCGAATGGAGAGGTGTAAACAGTGGGGGGCAGGGGCCATATTGCGCGGTAGTAGCACGACCTCATTTACCGACCTGCAAAAGCAGGTAGCAAGGCTGCCGGTGAGCGAACTGGTAGATGCTATTGGTGCTCCCCGGGTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGTTTCAGATGGGCTATCAACCGGGGCGATATCTGGTGCAATGGGCGCACGGTAAACCACTGAATGTGCTGTTg < 2:1338134/288‑1 (MQ=255) aTTTAAAAGTGCTGGAGGCAGGCGGCTACAGCCAGTTGGCTACCCAGCAAGCACAAATCGACCAGTGTAAACAGTGGGGCGCAGAGGCCATTTTGCTCGGTAGTAGCACGACCTCATTTCCCGACCTGCAAAAGCAGGTAGCAAGTCTGCCGGTGATCGAACTGGTAAATGCTATTGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGTTTCAGATGGGCTATCAACCGGGGCGATATCTGGTGCAATGGGCGCACGGTAAACCACTGAATGTGCTGTTGAt > 1:1873124/1‑289 (MQ=255) aTTTAAAAGTGCTGGAGGCAGGCGGCTACAGCCAGTTGGCTACCCAGCAAGCACAAATCGACCAGTGTAAACAGTGGGGCGCAGAGGCCATTTTGCTCGGTAGTAGCACGACCTCATTTCCCGACCTGCAAAAGCAGGTAGCAAGTCTGCCGGTGATCGAACTGGTAAATGCTATTGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGTTTCAGATGGGCTATCAACCGGGGCGATATCTGGTGCAATGGGCGCACGGTAAACCACTGAATGTGCTGTTGAt > 2:741500/1‑289 (MQ=255) aaaGTGCTGGAGGCAGGCGGCTACAGCCAGTTGGCTACCCAGCAAGCACAAATCGACCAGTGTAAACAGTGGGGCGCAGAGGCCATTTTGCTCGGTAGTAGCACGACCTCATTTCCCGACCTGCAAAAGCAGGTAGCAAGTCTGCCGGTGATCGAACTGGTAAATGCTATTGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGTTTCAGATGGGCTATCAACCGGGGCGATATCTGGTGCAATGGGCGCACGGTAAACCACTGAATGTGCTGTTGATGCCCg < 1:731697/289‑1 (MQ=255) aaaGTGCTGGAGGCAGGCGGCTACAGCCAGTTGGCTACCCAGCAAGCACAAATCGACCAGTGTAAACAGTGGGGCGCAGAGGCCATTTTGCTCGGTAGTAGCACGACCTCATTTCCCGACCTGCAAAAGCAGGTAGCAAGTCTGCCGGTGATCGAACTGGTAAATGCTATTGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGTTTCAGATGGGCTATCAACCGGGGCGATATCTGGTGCAATGGGCGCACGGTAAACCACTGAATGTGCTGTTGATGCCCg > 2:1147282/1‑289 (MQ=255) cTGGAGGCAGGCGGCTACAGCCAGTTGGCTACCCAGCAAGCACAAATCGACCAGTGTAAACAGTGGGGCGCAGAGGCCATTTTGCTCGGTAGTAGCACGACCTCATTTCCCGACCTGCAAAAGCAGGTAGCAAGTCTGCCGGTGATCGAACTGGTAAATGCTATTGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGTTTCAGATGGGCTATCAACCGGGGCGATATCTGGTGCAATGGGCGCACGGTAAAc < 2:1869367/259‑1 (MQ=255) tGGAGGCAGGCGGCTACAGCCAGTTGGCTACCCAGCAAGCACAAATCGACCAGTGTAAACAGTGGGGCGCAGAGGCCATTTTGCTCGGTAGTAGCACGACCTCATTTCCCGACCTGCAAAAGCAGGTAGCAAGTCTGCCGGTGATCGAACTGGTAAATGCTATTGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGTTTCAGATGGGCTATCAACCGGGGCGATATCTGGTGCAATGGGCGCACGGTAAACCACTGAATGTGCTGTTGATGCCCGGACCCGa > 1:1649452/1‑289 (MQ=255) acgaaggcGGCTCGCGCCAGTTTGCTAGCCAGGAAGCACAAATCGGACAGTGGAAACCGGGGGGCGCAGGGGCCAGGTTGCTAGGTAGTAGCACGACCTCATTTCCCGACCTGAAAAAGCAGGTAGCAAGGCTGCCGGTGATCGAACTGGTAAATGCTATTGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGTTTCAGATGGGCTATCAACCGGGGCGATATCTGGTGCAATGGGCGCACGGTAAACCACTGAATGTGCTGTTGATGCCCGGACCCGATa < 2:163141/284‑1 (MQ=255) aggcGGCTACAGCCAGTTGGCTACCCAGCAAGCACAAATCGACCAGTGTAAACAGTGGGGCGCAGAGGCCATTTTGCTCGGTAGTAGCACGACCTCATTTCCCGACCTGCAAAAGCAGGTAGCAAGTCTGCCGGTGATCGAACTGGTAAATGCTATTGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGTTTCAGATGGGCTATCAACCGGGGCGATATCTGGTGCAATGGGCGCACGGTAAACCACTGAATGTGCTGTTGATGCCCGGACCCGATAACGcc > 2:567010/1‑289 (MQ=255) cTACAGCCAGTTGGCTACCCAGCAAGCACAAATCGACCAGTGTAAACAGTGGGGCGCAGAGGCCATTTTGCTCGGTAGTAGCACGACCTCATTTCCCGACCTGCAAAAGCAGGTAGCAAGTCTGCCGGTGATCGAGCTGGTAAATGCTATTGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGTTTCAGATGGGCTATCAACCGGGGCGATATCTGGTGCAATGGGCGCACGGTAAACCACTGAATGTGCTGTTGATGCCCGGACCCGATAACGCCggggg < 1:1571732/288‑1 (MQ=255) cTACAGCCAGTTGGCTACCCAGCAAGCACAAATCGACCAGTGTAAACAGTGGGGCGCAGAGGCCATTTTGCTCGGTAGTAGCACGACCTCATTTCCCGACCTGCAAAAGCAGGTAGCAAGTCTGCCGGTGATCGAACTGGTAAATGCTATTGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGTTTCAGATGGGCTATCAACCGGGGCGATATCTGGTGCAATGGGCGCACGGTAAACCACTGAATGTGCTGTTGATGCCCGGACCCGATAACGCCggggg < 1:567010/288‑1 (MQ=255) cTACAGCCAGTTGGCTACCCAGCAAGCACAAATCGACCAGTGTAAACAGTGGGGCGCAGAGGCCATTTTGCTCGGTAGTAGCACGACCTCATTTCCCGACCTGCAAAAGCAGGTAGCAAGTCTGCCGGTGATCGAACTGGTAAATGCTATTGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGTTTCAGATGGGCTATCAACCGGGGCGATATCTGGTGCAATGGGCGCACGGTAAACCACTGAATGTGCTGTTGATGCCCGGACCCGATAACGCCggggg < 2:686184/288‑1 (MQ=255) cTACAGCCAGTTGGCGACCCGACAAGCGCAAATCGACCCGTGTAAACAGTGGGGCGCAGAGGCCATTTTGCTCGGTAGTAGCACGACCTCATTTCCCGACCTGCAAAAGCAGGTAGCAAGTCTGCCGGTGATCGAACTGGTAAATGCTATTGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGTTTCAGATGGGCTATCAACCGGGGCGATATCTGGTGCAATGGGCGCACGGTAAACCACTGAATGTGCTGTTGATGCCCGGACCCGATAACGCCggggg < 2:1598386/288‑1 (MQ=255) cTACCCAGCAAGCACAAATCGACCAGTGTAAACAGTGGGGCGCAGAGGCCATTTTGCTCGGTAGTAGCACGACCTCATTTCCCGACCTGCAAAAGCAGGTAGCAAGTCTGCCGGTGATCGAACTGGTAAATGCTATTGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGTTTCAGATGGGCTATCAACCGGGGCGATATCTGGTGCAATGGGCGCACGGTAAACCACTGAATGTGCTGTTGATGCCCGGACCCGATAACGCCGGGGGCAGTAAGGAGATGGt > 2:1472838/1‑289 (MQ=255) aCCCAGCAAGCACAAATCGACCAGTGTAAACAGTGGGGCGCAGAGGCCATTTTGCTCGGTAGTAGCACGACCTCATTTCCCGACCTGCAAAAGCAGGTAGCAAGTCTGCCGGTGATCGAACTGGTAAATGCTATTGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGccc > 1:328194/1‑171 (MQ=255) aCCCAGCAAGCACAAATCGACCAGTGTAAACAGTGGGGCGCAGAGGCCATTTTGCTCGGTAGTAGCACGACCTCATTTCCCGACCTGCAAAAGCAGGTAGCAAGTCTGCCGGTGATCGAACTGGTAAATGCTATTGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGccc < 2:328194/171‑1 (MQ=255) acaAATCGACCAGAGTAAACAGTGGGGCGCAGAGGCCATTTTGCTCGGTAGTAGCACGACCTCATTTCCCGACCTGCAAAAGCAGGTAGCAAGTCTGCCGGTGATCGAACTGGTAAATGCTATTGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGTTTCAGATGGGCTATCAACCGGGGCGATATCTGGTGCAATGGGCGCACGGTAAACCACTGAATGTGCTGTTGATGCCCGGACCCGATAACGCCGGGGGCAGTAAGGAGATGGTCGAGGGTTTTcgc > 1:366487/1‑289 (MQ=255) caAATCGACCAGTGTAAACAGTGGGGCGCAGAGGCCATTTTGCTCGGTAGTAGCACGACCTCATTTCCCGACCTGCAAAAGCAGGTAGCAAGTCTGCCGGTGATCGAACTGGTAAATGCTATTGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGTTTCAGATGGGCTATCAACCGGGGCGATATCTGGTGCAATGGGCGCACGGTAAACCACTGAATGTGCTGTTGATGCCCGGACCCGATAACGCCGGGGGCAGTAAGGAGATGGTCGAGGGTTTTcgcg < 1:1439256/289‑1 (MQ=255) caAATCGACCAGTGTAAACAGTGGGGCGCAGAGGCCATTTTGCTCGGTAGTAGCACGACCTCATTTCCCGACCTGCAAAAGCAGGTAGCAAGTCTGCCGGTGATCGAACTGGTAAATGCTATTGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGTTTCAGATGGGCTATCAACCGGGGCGATATCTGGTGCAATGGGCGCACGGTAAACCACTGAATGTGCTGTTGATGCCCGGACCCGATAACGCCGGGGGCAGTAAGGAGATGGTCGAGGGTTTTcgcg < 2:962158/289‑1 (MQ=255) gtAAACAGTGGGGCGCAGAGGCCATTTTGCTCGGTAGTAGCACGACCTCATTTCCCGACCTGCAAAAGCAGGTAGCAAGTCTGCCGGTGATCGAACTGGTAAATGCTATTGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGTTTCAGATGGGCTATCAACCGGGGCGATATCTGGTGCAATGGGCGCACGGTAAACCACTGAATGTGCTGTTGATGCCCGGACCCGATAACGCCGGGGGCAGTAAGGAGATGGTCGAGGGTTTTCGCGCAGCCATTGCCg < 1:1147282/288‑1 (MQ=255) tGGGTCGCGCAGGCCATTTTGCGCGGAATGAGCACGCCCTCATTTCCCGACCTGGAAAAGCAGGTAGCAAGTCGGCCGGTGATCGAACTGGTAAATGCTATTGATGCTCCCAAGGTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGTTTCAGATGGGCTATCAACCGGGGCGATATCTGGTGCAATGGGCGCACGGTAAACCACTGAATGTGCTGTTGATGCCCGGACCCGATAACGCCGGGGGCAGTAAGGAGATGGTCGAGGGTTTTCGCGCAGCCATTGCCGGAAGCCCg < 2:70964/288‑1 (MQ=255) tGGGGCGCAGAGGCCATTTTGCTCGGTAGTAGCACGACCTCATTTCCCGACCTGCAAAAGCAGGTAGCAAGTCTGCCGGTGATCGAACTGGTAAATGCTATTGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGTTTCAGATGGGCTATCAACCGGGGCGATATCTGGTGCAATGGGCGCACGGTAAACCACTGAATGTGCTGTTGATGCCCGGACCCGATAACGCCGGGGGCAGTAAGGAGATGGTCGAGGGTTTTcgcg < 2:1916362/268‑1 (MQ=255) tGGGGCGCACAGGCCGTTTTGGTTGGTAGTGGCACGACCTCATTTCCCGACCGGCAAAAGCAGGTAGCAAGTCTGCCGGTGATCGAACTGGTAAATGCTATTGATGATCCCCAGGTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGTTTCAGATGGGCTATCAACCGGGGCGATATCTGGTGCAATGGGCGCACGGTAAACCACTGAATGTGCTGTTGATGCCCGGACCCGATAACGCCGGGGGCAGTAAGGAGATGGTCGAGGGTTTTCGCGCAGCCATTGCCGGAAGCCCg < 2:989106/288‑1 (MQ=255) ggggCGCAGAGGCCATTTTGCTCGGTAGTAGCACGACCTCATTTCCCGACCTGCAAAAGCAGGTAGCAAGTCTGCCGGTGATCGAACTGGTAAATGCTATTGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGTTTCCGATGGGCTATCAACCGGGGCGATATCTGGTGCAATGGGCGCACGGTAAACCACTGAATGTGCTGTTGATGCCCGGACCCGATAACGCCGGGGGCAGTAAGGAGATGGTCGAGGGTTTTCGCGCAGCCATTGCCGGAAGCCCGGt > 2:499368/1‑289 (MQ=255) ggggCGCAGAGGCCATTTTGCTCGGTAGTAGCACGACCTCATTTCCCGACCTGCAAAAGCAGGTAGCAAGTCTGCCGGTGATCGAACTGGTAAATGCTATTGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGTTTCAGATGGGCTATCAACCGGGGCGATATCTGGTGCAATGGGCGCACGGTAAACCACTGAATGTGCTGTTGATGCCCGGACCCGATAACGCCGGGGGCCGTAAGGAGATGGTCGAGGGTTTTCGCGCAGCCATTGCCGGAAGCCCGGt > 1:1417132/1‑289 (MQ=255) ggggCGCAGAGGCCATTTTGCTCGGTAGTAGCACGACCTCATTTCCCGACCTGCAAAAGCAGGTAGCAAGTCTGCCGGTGATCGAACTGGTAAATGCTATTGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGTTTCAGATGGGCTATCAACCGGGGCGATATCTGGTGCAATGGGCGCACGGTAAACCACTGAATGTGCTGTTGATGCCCGGACCCGATAACGCCGGGGGCAGTAAGGAGATGGTCGAGGGTTTTCGCGCAGCCCGTGCCGGAAGCCGGGt > 2:1035553/1‑289 (MQ=255) ggggCGCAGAGGCCATTTTGCTCGGTAGTAGCACGACCTCATTTCCCGACCTGCAAAAGCAGGTAGCAAGTCTGCCGGTGATCGAACTGGTAAATGCTATTGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGTTTCAGATGGGCTATCAACCGGGGCGATATCTGGTGCAATGGGCGCACGGTAAACCACTGAATGTGCTGTTGATGCCCGGACCCGATAACGCCGGGGGCAGTAAGGAGATGGTCGAGGGTTTTCGCGCAGCCATTGCCGGAAGCCCg < 1:1035553/287‑1 (MQ=255) ggggCGCAGAGGCCATTTTGCTCGGTAGTAGCACGACCTCATTTCCCGACCTGCAAAAGCAGGTAGCAAGTCTGCCGGTGATCGAACTGGTAAATGCTATTGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGTTTCAGATGGGCTATCAACCGGGGCGATATCTGGTGCAATGGGCGCACGGTAAACCACTGAATGTGCTGTTGATGCCCGGACCCGATAACGCCGGGGGCAGTAAGGAGATGGTCGAGGGTTTTCGCGCAGCCATTGCCGGAAGCCCGGt < 1:1252581/289‑1 (MQ=255) ggggCGCAGAGGCCATTTTGCTCGGTAGTAGCACGACCTCATTTCCCGACCTGCAAAAGCAGGTAGCAAGTCTGCCGGTGATCGAACTGGTAAATGCTATTGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGTTTCAGATGGGCTATCAACCGGGGCGATATCTGGTGCAATGGGCGCACGGTAAACCACTGAATGTGCTGTTGATGCCCGGACCCGATAACGCCGGGGGCAGTAAGGAGATGGTCGAGGGTTTTCGCGCAGCCATTGCCGGAAGCCCGGt < 1:1833073/289‑1 (MQ=255) ggggCGCAGAGGCCATTTTGCTCGGTAGTAGCACGACCTCATTTCCCGACCTGCAAAAGCAGGTAGCAAGTCTGCCGGTGATCGAACTGGTAAATGCTATTGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGTTTCAGATGGGCTATCAACCGGGGCGATATCTGGTGCAATGGGCGCACGGTAAACCACTGAATGTGCTGTTGATGCCCGGACCCGATAACGCCGGGGGCAGTAAGGAGATGGTCGAGGGTTTTCGCGCAGCAATTGCCGGAAGCCCGGt > 2:270100/1‑289 (MQ=255) ggggCGCAGAGGCCATTTTGCTCGGTAGTAGCACGACCCCATTTACCGAACTGCAAAAGCAGGTAGCAAGTCTGCCGGTGAACGAACTGGTAAATGTTATTGAATCTCCCCAGGTGAAAAGCCGCCTTGGTGTGCCCTGGCTTCAGATGGGCTATCAACCGGGGCGCTATCTGATGCAATGGGCGCTCGGTAAACCACTGAATGTGCCGTTGATGCCCGGTCCCGATAACGCTGGGGGCTGTGAGGATATGGTCGCGGGTGTTCGCGCAGCCATCGCGGGAGTCCCggg > 2:814102/1‑288 (MQ=255) gcgcAGAGGCCATTTTGCTCGGTAGTAGCACGACCTCATTTCCCGACCTGCAAAAGCAGGTAGCAAGTCTGCCGGTGATCGAACTGGTAAATGCTATTGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGTTTCAGATGGGCTATCAACCGGGGCGATATCTGGTGCAATGGGCGCACGGTAAACCACTGAATGTGCTGTTGATGCCCGGACCCGATAACGCCGGGGGCAGTAAGGAGATGGTCGAGGGTTTTCGCGCAGCCATTGCCGGAAGCCCGGTGc < 2:439455/288‑1 (MQ=255) cgcAGAGGCCATTTTGCTCGGTAGTAGCACGACCTCATTTCCCGACCTGCAAAAGCAGGTAGCAAGTCTGCCGGTGATCGAACTGGTAAATGCTATTGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGTTTCAGATGGGCTATCAACCGGGGCGATATCTGGTGCAATGGGCGCACGGTAAACCACTGAATGTGCTGTTGATGCCCGGACCCGATAACGCCggg > 2:1235412/1‑232 (MQ=255) cgcAGAGGCCATTTTGCTCGGTAGTAGCACGACCTCATTTCCCGACCTGCAAAAGCAGGTAGCAAGTCTGCCGGTGATCGAACTGGTAAATGCTATTGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGTTTCAGATGGGCTATCAACCGGGGCGATATCTGGTGCAATGGGCGCACGGTAAACCACTGAATGTGCTGTTGATGCCCGGACCCGATAACGCCGGGGGCAGTAAGGAGATGGTCGAGGGTTTTCGCGCAGCCATTGCCGGAAGCCCGGTGCGt > 1:697678/1‑289 (MQ=255) cgcAGAGGCCATTTTGCTCGGTAGTAGCACGACCTCATTTCCCGACCTGCAAAAGCAGGTAGAAAGTCTGCCGGTGATCGAACTGGTAAATGCTATTGATGCTCCCCAGGTGAACAGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGCTTCAGCTGGGCTATCAACCGGGGCGATATCTGGTGCAATGGGCGCACGGTAAACCACTGAATGTGCTGTTGATGCCCGGACCCGATAACGCCGGGGGCAGTCAGGCGATGGTGGAGCGGTTTCGCGCATCCATCGCCGGAAGCCCGGTGCGt > 2:1312272/1‑289 (MQ=255) ccggagGCCATTTTGCTAGGTAGTAGCACGACCTCATTTCCCGACCTGCAAAAGCAGGTAGCAAGTCTGCCGGTGATCGAACTGGTAAATGCTATTGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGTTTCAGATGGGCTATCAACCGGGGCGATATCTGGTGCAATGGGCGCACGGTAAACCACTGAATGTGCTGTTGATGCCCGGACCCGATAACGCCGGGGGCAGTAAGGAGATGGTCGAGGGTTTTCGCGCAGCCATTGCCGGAAGCCCGGTGCGt < 2:202911/285‑1 (MQ=255) tgagGCCATTTTGGTCGGTAATAGCACGCACTCACTTCCCGGCCTGGCAAAGGAGGTAGATGGTCTGCCTGTGATCGAACTGGTAGATGCTATTGCGGCTCCCCCGGTGGAAAGCGGCGTTGGTGTGCCCTGGTTTCAGATGGGCTATCAACCGGGGCGATATCTGGTGGAATGGGCGCACGGTAAACCACTGAATGTGCTGTTGATGCCCGGACCCGATAACGCCGGGGGCAGTAAGGAGATGGTCGAGGGTTTTCGCGCAGCCATTGCCGGAAGCCCGGTGCGTAt < 2:366487/287‑1 (MQ=255) agGCCATTTTGCTCGGTAGTAGCACGACCTCATTTCCCGACCTGCAAAAGCAGGTAGCAAGTCTGCCGGTGATCGAACTGGTAAATGCTATTGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGTGTCAGATGGGCTATCAACCGGGGCGATATCTGGTGCAATGGGCGCACGGTAAACCACTGAATGTGCTGTTGATGCCCGGACCCGATAACGCCGGGGGCAGTAAGGAGATGGTCGAGGGTTTTCGCGCAGCCATTGCCGGAAGCCCGGTGGGGAttgt > 1:519207/1‑289 (MQ=255) gCTCGGTAGTAGCACGACCTCATTTCCCGACCTGCAAAAGCAGGTAGCAAGTCTGCCGGTGATCGAACTGGTAAATGCTATTGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGTTTCAGATGGGCTATCAACCGGGGCGATATCTGGTGCAATGGGCGCACGGTAAACCACTGAATGTGCTGTTGATGCCCGGACCCGATAACGCCGGGGGCAGTAAGGAGATGGTCGAGGGTTTTCGCGCAGCCATTGCCGGAAGCCCGGTGCGTATTGTTGATATTgc > 1:781550/1‑288 (MQ=255) tCGGTGGTCGCACGACCTCATTTCCCGGCCTGCAAAAGCAGGTAGCAAGTCTGCGGGTGATCGAACTGGTAAATGCTATTGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGTTTCAGATGGGCTATCAACCGGGGCGATATCTGGTGCAATGGGCGCACGGTAAACCACTGAATGTGCTGTTGATGCCCGGACCCGATAACGCCGGGGGCAGTAAGGAGATGGTCGAGGGTTTTCGCGCAGCCATTGCCGGAAGCCCGGTGCGTATTGTTGATATTGCGCt < 2:1839693/289‑1 (MQ=255) tCGGTAGTAGCACGACCTCATTTCCCGACCTGCAAAAGCAGGTAGCAAGTCTGCCGGTGATCGAACTGGTAAATGCTATTGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGTTTCAGATGGGCTATCAACCGGGGCGATATCTGGTGCAATGGGCGCACGGTAAACCACTGAATGTGCTGTTGATGCCCGGACCCGATAACGCCGGGGGCAGTAAGGAGATGGTCGAGGGTTTTCGCGCAGCCGTTGCCGGAAGCCCGGTGCGCATTGTTGAGATTgc > 2:1571248/1‑286 (MQ=255) tCGGTAGTAGCACGACCTCATTTCCCGACCTGCAAAAGCAGGTAGCAAGTCTGCCGGTGATCGAACTGGTAAATGCTATTGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGTTTCAGATGGGCTATCAACCGGGGCGATATCTGGTGCAATGGGCGCACGGTAAACCACTGAATGTGCTGTTGATGCCCGGACCCGATAACGCCGGGGGCAGTAAGGAGATGGTCGAGGGTTTTCGCGCAGCCATTGCCGGAAGCCCGGTGCGTATTGTTGATATTGCGCt < 1:553052/289‑1 (MQ=255) tCGGTAGTAGCACGACCTCATTTCCCGACCTGCAAAAGCAGGTAGCAAGTCTGCCGGTGATCGAACTGGTAAATGCTATTGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGTTTCAGATGGGCTATCAACCGGGGCGATATCTGGTGCAATGGGCGCACGGTAAACCACTGAATGTGCTGTTGATGCCCGGACCCGATAACGCCGGGGGCAGTAAGGAGATGGTCGAGGGTTTTCGCGCAGCCATTGCCGGAAGCCCGGTGCGTATTGTTGATATTGCGCt < 1:1114823/289‑1 (MQ=255) agCACGACCTCATTTCCCGACCTGCAAAAGCAGGTAGCAAGTCTGCCGGTGATCGAACTGGTAAATGCTATTGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGTTTCAGATGGGCTATCAACCGGGGCGATATCTGGTGCAATGGGCGCACGGTAAACCACTGAATGTGCTGTTGATGCCCGGACCCGATAACGCCGGGGGCAGTAAGGAGATGGTCGAGGGTTTTCGCGCAGCCATTGCCGGAAGCCCGGTGCGTATTGTTGATATTGCGCTTGGTGAt < 1:964529/288‑1 (MQ=255) ||| GCTGGCATGATGCGCAGCATTTCACGGTGCAAGCCTCTACGCCGCTTAAAGCCAAACGCGCATGGAAACTGTGCGCGCTTTATCCCAGCCTGAAAGATAGTTATTGGTTAAGCTTGAACTATGGTATGCAGGAGGCTGCTCGCCGCTACGGTGTGGATTTAAAAGTGCTGGAGGCAGGCGGCTACAGCCAGTTGGCTACCCAGCAAGCACAAATCGACCAGTGTAAACAGTGGGGCGCAGAGGCCATTTTGCTCGGTAGTAGCACGACCAGTTTTCCCGACCTGCAAAAGCAGGTAGCAAGTCTGCCGGTGATCGAACTGGTAAATGCTATTGATGCTCCCCAGGTGAAAAGCCGCGTTGGTGTGCCCTGGTTTCAGATGGGCTATCAACCGGGGCGATATCTGGTGCAATGGGCGCACGGTAAACCACTGAATGTGCTGTTGATGCCCGGACCCGATAACGCCGGGGGCAGTAAGGAGATGGTCGAGGGTTTTCGCGCAGCCATTGCCGGAAGCCCGGTGCGTATTGTTGATATTGCGCTTGGTGATAA > CP042583/910858‑911407 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |