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| * | CP042583 | 918,997 | 0 | T | A | 100.0% | 167.5 / NA | 72 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
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TTTTTGAAAACACACTGGTGTGTTTTATGCGGTTATACAATGAACTCAGACGTAAAGTAAATGAAGAGGATACTCCATGTCTGGAATGTGAAAGTCTAGAAAAAGAATTTGAGGAAATGCAGAATGATAATGATCTAAGTTTATTTATGAGAATATTGCGTACTAATGATACACAAATTTATAGTGGGGTTAGTGGAGGTATTACATATACTATACAATATGTTCGAGATATTGATATTGTTAGAGTGTCCTTGCCGGGCAGAGCTAGTGAGTCTATCACAGATTTTAAAGGTTATTATTGGTATAACTTTATGGAGTATATTGAAAACATTAATGCGTGTGATGATGTTTTTTCTGAGTATTGTTTTGATGATGAAAATATAAGTGTCCAGCCAGAGCGGATAAATACGCCGGGAATATCTGATTTGGATTCTGACATTGATTTGTCTGGTATATCTTTTATTCAGCGTGAAACTAACCAGGCATTAGGATTAAAATATGCTCCTGTAGATGGCGATGGATATTGTCTGTTAAGAGCTATA > CP042583/918729‑919270 ||| tttttGAAAACACACTGGTGTGTTTTATGCGGTTATACAATGAACTCAGACGTAAAGTAAATGAAGAGGATACTCCATGTCTGGAATGTGAATCACTAGAAAAAGAATTTGAGGAAATGCAGAATGATAATGATCTATCATTATTTATGAGAATATTGCGTACTAATGATACACAAATTTATTCAGGGGTTTCAGGAGTTATTACATATACTATACAATATGTTCGAGATATTGATATTGTTAGAGTGTCCTTGCCGGGCAGAGCTTCAGAGTCTATCACAGATTTTa < 1:790384/288‑1 (MQ=255) 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tCCTTGCCGGGCAGAGCTTCAGAGTCTATCACAGATTTTAAAGGTTATTATTGGTATAACTTTATGGAGTATATTGAAAACATTAATGCGTGTGATGATGTTTTTTCTGAGTATTGTTTTGATGATGAAAATATAAGTGTCCAGCCAGAGCGGATAAATACGCCGGGAATATCTGATTTGGATTCTGACATTGATTTGTCTGGTATATCTTTTATTCAGCGTGAAACTAACCAGGCATTAGGATTAAAATATGCTCCTGTAGATGGCGATGGATATTGTCTGTTAagag > 2:948566/1‑289 (MQ=255) tCCTTGCCGGGCAGAGCTTCAGAGTCTATCACAGATTTTAAAGGTTATTATTGGTATAACTTTATGGAGTATATTGAAAACATTAATGCGTGTGATGATGTTTTTTCTGAGTATTGTTTTGATGATGAAAATATAAGTGTCCAGCCAGAGCGGATAAATACGCCGGGAATATCTGATTTGGATTCTGACATTGATTTGTCTGGTATATCTTTTATTCAGCGTGAAACTAACCAGGCATTAGGATTAAAATATGCTCCTGTAGATGGCGATGGATATTGTCTGTTAagag > 2:1840251/1‑289 (MQ=255) tCCTTGCCGGGCAGAGCTTCAGAGTCTATCACAGATTTTAAAGGTTATTATTGGTATAACTTTATGGAGTATATTGAAAACATTAATGCGTGTGATGATGTTTTTTCTGAGTATTGTTTTGATGATGAAAATATAAGTGTCCAGCCAGAGCGGATAAATACGCCGGGAATATCTGATTTGGATTCTGACATTGATTTGTCTGGTATATCTTTTATTCAGCGTGAAACTAACCAGGCATTAGGATTAAAATATGCTCCTGTAGATGGCGATGGATATTGTCTGTTAaga > 2:1181056/1‑288 (MQ=255) 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gCCGGGCAGAGCTTCAGAGTCTATCACAGATTTTAAAGGTTATTATTGGTATAACTTTATGGAGTATATTGAAAACATTAATGCGTGTGATGATGTTTTTTCTGAGTATTGTTTTGATGATGAAAATATAAGTGTCCAGCCAGAGCGGATAAATACGCCGGGAATATCTGATTTGGATTCTGACATTGATTTGTCTGGTATATCTTTTATTCAGCGTGAAACTAACCAGGCATTAGGATTAAAATATGCTCCTGTAGATGGCGATGGATATTGTCTGTTAAGAGCtata < 2:717986/289‑1 (MQ=255) gCCGGGCAGAGCTTCAGAGTCTATCACAGATTTTAAAGGTTATTATTGGTATAACTTTATGGAGTATATTGAAAACATTAATGCGTGTGATGATGTTTTTTCTGAGTATTGTTTTGATGATGAAAATATAAGTGTCCAGCCAGAGCGGATAAATACGCCGGGAATATCTGATTTGGATTCTGACATTGATTTGTCTGGTATATCTTTTATTCAGCGTGAAACTAACCAGGCATTAGGATTAAAATATGCTCCTGTAGATGGCGATGGATATTGTCTGTTAAGAGCtata < 1:736878/289‑1 (MQ=255) cGGGCAGAGCTTCAGAGTCTATCACAGATTTTAAAGGTTATTATTGGTATAACTTTATGGAGTATATTGAAAACATTAATGCGTGTGATGATGTTTTTTCTGAGTATTGTTTTGATGATGAAAATATAAGTGTCCAGCCAGAGCGGATAAATACGCCGGGAATATCTGATTTGGATTCTGACATTGATTTGTCTGGTATATCTTTTATTCAGCGTGAAACTAACCAGGCATTAGGATTAAAATATGCTCCTGTAGATGGCGATGGATATGGTTTGTTAAGAGCtat > 2:751978/1‑286 (MQ=255) 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(MQ=255) ||| TTTTTGAAAACACACTGGTGTGTTTTATGCGGTTATACAATGAACTCAGACGTAAAGTAAATGAAGAGGATACTCCATGTCTGGAATGTGAAAGTCTAGAAAAAGAATTTGAGGAAATGCAGAATGATAATGATCTAAGTTTATTTATGAGAATATTGCGTACTAATGATACACAAATTTATAGTGGGGTTAGTGGAGGTATTACATATACTATACAATATGTTCGAGATATTGATATTGTTAGAGTGTCCTTGCCGGGCAGAGCTAGTGAGTCTATCACAGATTTTAAAGGTTATTATTGGTATAACTTTATGGAGTATATTGAAAACATTAATGCGTGTGATGATGTTTTTTCTGAGTATTGTTTTGATGATGAAAATATAAGTGTCCAGCCAGAGCGGATAAATACGCCGGGAATATCTGATTTGGATTCTGACATTGATTTGTCTGGTATATCTTTTATTCAGCGTGAAACTAACCAGGCATTAGGATTAAAATATGCTCCTGTAGATGGCGATGGATATTGTCTGTTAAGAGCTATA > CP042583/918729‑919270 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |