Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 920,460 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 920,460 | 0 | A | T | 99.7% | 700.9 / NA | 297 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/1); new base T (156/140); total (156/141) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.75e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 920,461 | 0 | G | C | 99.7% | 691.0 / NA | 297 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base C (155/140); total (156/141) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.76e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.95e-01 | |||||||||||
* | CP042583 | 920,462 | 0 | C | G | 99.7% | 704.1 / NA | 297 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); new base G (156/140); total (156/141) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.75e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.76e-01 |
Only 100 of 297 total aligned reads displayed.
ATCGCCGCAGCTGTGGCAGGGATAGTTTTACTCGCTAGTAACGCTCAGGCACAAACCGTACCGGAAGGCTATCAGCTACAGCAAGTGCTCATGATGAGCCGCCATAACTTACGTGCGCCGCTGGCGAACAATGGCAGTGTGCTGGAGCAGAGCACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAAAGCGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCGGGGTGTGATATTCCTGTGCATCACCAGGAAAAAATGGGCACTATGGACCCAACCTTTAACCCGGTGATCACCGATGATTCCGCCGCATTCAGTGAACAGGCGGTGGCGGCAATGGAGAAAGAGCTCAGCAAACTCCAGCTTACC‑GACAGCTACCAGCTACTGGAAAAAATCGTTAACTATAAA > CP042583/920184‑920741 ||| aacgcctcAGCAGGGGAAGGGAGAGTTTTACTCGCTTCAAACGCTCGGGCAAAAACCGGACCGGAAGGCTATCAGCTACAACAAGTGCGCATGATGGGCCGCCATAACTTACGGGCGCCGCTGGCGAACAATGGCAGTGTGCTGGAGCAGTCGACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGcc < 2:1220467/287‑1 (MQ=255) aTCGCCGCAGCTGTGGCAGGGATAGTTTTACTCGCTTCAAACGCTCAGGCACAAACCGTACCGGAAGGCTATCAGCTACAGCAAGTGCTCATGATGAGCCGCCATAACTTACGTGCGCCGCTGGCGAACAATGGCAGTGTGCTGGAGCAGTCGACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGGGTATATGGGCCATTACACGCGCGAATGGCCGGCAGAGCAGGGGAGGGTGAAATCGGGGGAATGc > 2:505390/1‑288 (MQ=255) cgccgcAGCTGTGGCAGGGATAGTTTTACTCGCTTCAAACGCTCAGGCACAAACCGTACCGGAACGCTATCAGCTACAGCAAGTGCTCATGATGAGCCGCCATAACTTACGTGCGCCGCTGGCGAACAATGGCAGTGTGCTGAAGCAGTCGACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGACCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCccg < 1:970199/289‑1 (MQ=255) cccggcAGCTGTGGCAGGGATGGTTTTACTCGCTTCAAACGCCCAGGCACAAACCGTACCGGAAGGCTATCAGCTACAGCAAGTGCTCATGATGAGCCGCCATAACTTACGTGCGCCGCTGGCGAACAATGGCAGTGTGCTGGAGCAGTCGACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCccg < 2:317185/285‑1 (MQ=255) gccgcAGCTGTGGCAGGGATAGTTTTACTCGCTTAAAACGATCAGGCACAAACCGTACCGGAAGGCTATCAGCTACAGCAAGTGCTCATGATGAGCCGCCATAACTTACGTGCGCCGCTGGCGAACAATGGCAGTGTGCTGGAGCAGTCGACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCccg < 2:1458994/288‑1 (MQ=255) cgcAGCTGTGGCAGGGATAGTTTTACTCGCTTCAAACGCTCAGGCACAAACCGTACCGGAAGGCTATCAGCTACAGCAAGTGCTCATGATGAGCCGCCATAACTTACGTGCGCCGCTGGCGAACAATGGCAGTGTGCTGGAGCAGTCGACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGGAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCccgccg < 1:484672/289‑1 (MQ=255) aGCTGTGGCAGGGATAGTTTTACTCGCTTCAAACGCTCAGGCACAAACCGTACCGGAAGGCTATCAGCTACAGCAAGTGCTCATGATGAGCCGCCATAACTTACGTGCGCCGCTGGCGAACAATGGCAGTGTGCTGGAGCAGTCGACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCccgccgccg < 2:1478752/289‑1 (MQ=255) gtgGCAGGGATAGTTTTACTCGCTTCAAACGCTCAGGCACAAACCGTACCGGAAGGCTATCAGCTACAGCAAGTGCTCATGATGAGCCGCCATAACTTACGTGCGCCGCTGGCGAACAATGGCAGTGTGCTGGAGCAGTCGACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTaca < 1:775745/289‑1 (MQ=255) gtgGCAGGGATAGTTTTACTCGCTTCAAACGCTCAGGCACAAACCGTACCGGAAGGCTATCAGCTACAGCAAGTGCTCATGATGAGCCGCCATAACTTACGTGCGCCGCTGGCGAACAATGGCAGTGTGCTGGAGCAGTCGACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTaca < 1:1167705/289‑1 (MQ=255) tgGCAGGGATAGTTTAACTCCCTTCAAACGCTCAGTCACAAACCGTACCGGAAGGCTACCAGGTACAGCAAGTGCTCATGATGAGCCGCCATAACTTACGTGCGCCGCTGGCGAACAATGGCAGTGTGCTGGAGCAGTCGACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTaca < 2:183825/288‑1 (MQ=255) aGTTTTACTCGCTTCAAACGCTCAGGCACAAACCGTACCGGAAGGCTATCAGCTACAGCAAGTGCTCATGATGAGCCGCCATAACTTACGTGCGCCGCTGGCGAACAATGGCAGTGTGCTGGAGCAGTCGACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTtatgcc < 1:1005331/289‑1 (MQ=255) aGTTTTACTCGCTTCAAACGCTCAGGCACAAACCGTACCGGAAGGCTATCAGCTACAGCAAGTGCTCATGATGAGCCGCCATAACTTACGTGCGCCGCTGGCGAACAATGGCAGTGTGCTGGAGCAGTCGACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTtatgcc < 1:155968/289‑1 (MQ=255) ctcgcttcaaaCGCTCAGGCACAAACCGTACCGGAAGGCTATCAGCTACAGCAAGTGCTCATGATGAGCCGCCATAACTTACGTGCGCCGCTGGCGAACAATGGCAGTGTGCTGGAGCAGTCGACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGTAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCa > 1:695348/10‑289 (MQ=255) ctcgcttcaaaCGCTCAGGCACAAACCGTACCGGAAGGCTATCAGCTACAGCAAGTGCTCATGATGAGCCGCCATAACTTACGTGCGCCGCTGGCGAACAATGGCAGTGTGCTGGAGCAGTCGACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCa > 1:1451761/10‑289 (MQ=255) ctcgcttcaaaCGCTCAGGCACAAACCGTACCGGAAGGCTATCAGCTACAGCAAGTGCTCATGATGAGCCGCCATAACTTACGTGCGCCGCTGGCGAACAATGGCAGTGGGCAGGAGCAGTCGACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGGGAAGATGGGCCATTACAAGCGTGAAGGGACGTCAGCGCCGGGGACGGTGAAGTCGGGGGAATGGTCGGTGTCGTACAACGTTTATGCCTATTCCa > 2:896993/10‑289 (MQ=255) ttcaaaCGCTCAGGCACAAACCGTACCGGAAGGCTATCAGCTACAGCAAGTGCTCATGATGAGCCGCCATAACTTACGTGCGCCGCTGGCGAACAATGGCAGTGTGCTGGAGCAGTCGACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAg > 1:1221368/5‑288 (MQ=255) ttcaaaCGCTCAGACGCAAACCGGACCGGAAGGCTATCAGCTACAGCAAAGGCTCATGATGGGCCGCCATAGCTTACGGGCGCCGCTGGCGAACAATGGCAGTGTGCTGGAGCAGTCGACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGt < 2:1753857/285‑1 (MQ=255) aCGCGCAGGCACAAAAGGTAGCGGAAGGCTATCAGATACAGCAAGTGCTCATGATGCGAGGTGATCAGTTCCGTGCGCAGCGGGCGAACAATGGCAGTGTGCTGGAGCAGTCGACGCCGAATAAATGTCCAGACTGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACAACCAAAGGTGGCGTGCTCGAGGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGGGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCa < 2:745920/289‑1 (MQ=255) cTCAGGCACAAACCGTACCGGAAGGCTATCAGCTACAGCAAGTGCTCATGATGAGCCGCCATAACTTACGTGCGCCGCTGGCGAACAATGGCAGTGTGCTGGAGCAGTCGACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGt > 1:1835934/1‑281 (MQ=255) aaCCGTACCGGAAGGCTATCAGCTACAGCAAGTGCTCATGATGAGCCGCCATAACTTACGTGCGCCGCTGGCGGACAATGGCAGTGTGCTGGAGCAGTCGACGCCGAATAAATGGCCAGAGTGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCccg < 1:1806671/238‑1 (MQ=255) tACCGGAAGGCTATCAGCTACAGCAAGTGCTCATGATGAGCCGCCATAACTTACGTGCGCCGCTGGCGAACAATGGCAGTGTGCTGGAGCAGTCGACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGc > 1:1646754/1‑289 (MQ=255) aCCGGAATGCTGTCAGCTAGTGCAAGAGTTCCAGGTGAGCCGCCATAACTTACGGGCGCCGCTGGCGAACAGTGGCAGTGTGCTGGAGCAGTCGACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTTAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGGAACGTTGCGACCGca < 2:952494/289‑1 (MQ=255) aCCGGAAGGCTATCAGCTACAGCAAGTGCTCATGATGAGCCGCCATAACTTACGTGCGCCGCTGGCGAACAATGGCAGTGTGCTGGAGCAGTCGACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGca < 1:433712/289‑1 (MQ=255) ggaaggagttCAGCTGAAGCAAGTGATCATGATGAGCCGCCATAACTTACGTGCGCCGCGGGCGAACAATGGCAGTGTGCTGGAGAAGTCGACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAg < 2:1002533/280‑1 (MQ=255) ggAAGGCTATCAGCTACAGCAAGTGCTCATGATGAGCCGCCATAACTTACGTGCGCCGCTGGCGAACAATGGCAGTGTGCTGGAGCAGTCGACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGcaccg > 1:558941/1‑287 (MQ=255) ggAAGGCTATCAGCTACAGCAAGTGCTCATGATGAGCCGCCATAACTTACGTGCGCCGCTGGCGAACAATGGCAGTGTGCTGGAGCAGTCGACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAg < 1:505390/289‑1 (MQ=255) ggAAGGCTATCAGCTACAGCAAGTGCTCATGATGAGCCGCCATAACTTACGTGCGCCGCTGGCGAACAATGGCAGTGTGCTGGAGCAGTCGACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAg < 1:387329/289‑1 (MQ=255) ggAAGGCTATCAGCTACAGCAAGTGCTCATGATGAGCCGCCATAACTTACGTGCGCCGCTGGCGAACAATGGCAGTGTGCTGGAGCAGTCGACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAg < 1:1491963/289‑1 (MQ=255) aGCAAGTGCTCATGATGAGCCGCCATAACTTACGTGCGCCGCTGGCGAACAATGGCAGTGTGCTGGAGCAGTCGACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGgcgc > 1:259437/1‑289 (MQ=255) gggtccgggggaGCGGCCATAAGTTACGTGGGCCGCTGGCGAGCAATGGACGTGTGCGGGGGCAGTCGACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCGCCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTcc < 2:1451761/278‑1 (MQ=255) gCTCATGATGAGCCGCCATAACTTACGTGCGCCGCTGGCGAACAATGGCAGTGTGCTGGAGCAGTCGACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGca > 2:459756/1‑262 (MQ=255) gCTCATGATGAGCCGCCATAACTTACGTGCGCCGCTGGCGAACAATGGCAGTGTGCTGGAGCAGTCGACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTcc < 1:1884230/287‑1 (MQ=255) tCATGATGGGCCGCATCAGCTGACTGGCGCAGCTGGCGAACAATGGCAGGGTGCTGGAGCAGTCGAAGCCGAATAAAGGTCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCCACTCACCACCAAAGGTGGGGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATTCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCa < 2:1028440/241‑1 (MQ=255) tCATGATGAGCCGCCATAACTTACGTGCGCCGCTGGCGAACAATGGCAGTGTGCTGGAGCAGTCGACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCggg < 1:376886/289‑1 (MQ=255) gaGCCGCCATAACTTACGTGCGCCGCTGGCGAACAATGGCAGTGTGCTGGAGCAGTCGACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCGGGGTGTGat > 2:20147/1‑289 (MQ=255) gccgccATAACTTACGTGCGCCGCTGGCGAACAATGGCAGTGTGCTGGAGCAGTCGACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCGGGGTGTGata < 1:1628067/288‑1 (MQ=255) ccgccATAACTTACGTGCGCCGCTGGCGAACAATGGCAGTGTGCTGGAGCAGTCGACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAg > 1:743622/1‑253 (MQ=255) ccgccATAACTTACGTGCGCCGCTGGCGAACAATGGCAGTGTGCTGGAGCAGTCGACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCCGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCGGGGTGTGatat > 2:378424/1‑288 (MQ=255) ccgccATAACTTACGTGCGACGCTGGCGAACAATGGCAGTGTGCTGGAGCAGTCGACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCACGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAAAGTACCGtt > 1:1028440/1‑241 (MQ=255) tACGTGCGCCGCTGGCGAACAATGGCAGTGTGCTGGAGCAGTCGACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCGGGGTGTGATATTCCTGTGCATCa < 1:451857/289‑1 (MQ=255) cGTGCGCCGCTGGCGAACAATGGCAGTGTGCTGGAGCAGTCGACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTtatgcc > 2:484333/1‑201 (MQ=255) cGTGCGCCGCTGGCGAACAATGGCAGTGTGCTGGAGCAGTCGACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCGGGGTGTGATATTCCTGTGCATCAc > 2:758988/1‑288 (MQ=255) tGGCGAACAATGGCAGTGTGCTGGAGCAGTCGACGCCGCATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGCAGCGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGGCCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCGGGGTGGTGTAATCCTGCTCACCACCCGGAAAAAAt > 2:8792/1‑289 (MQ=255) gAACAATGGCAGTGTGCTGGAGCAGTCGACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCGGGGTGTGATATTCCTGTGCATCACCAGGAAAAAATggg < 1:1517425/288‑1 (MQ=255) tgtgCTGGAGCAGTCGACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCCCATTCCCGGGGGTTGATATTCCTGTGCATCACCAGGAAAACATGGGCAATATGGCCCCa > 2:441228/1‑289 (MQ=255) ggtgATGGAGCAGGCGCCGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGGAGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCGGGGTGTGATATTCCTGTGCATCACCAGGAAAAAATGGGCACTATGGAccc < 2:1624601/287‑1 (MQ=255) gtcgaCGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACGGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCGGGGTGTGATATTCCTGTGCATCACCAGGAAAAAATggg > 2:837338/5‑264 (MQ=255) gtcgaCGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGca < 2:1772321/195‑1 (MQ=255) gtcgaCGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGca > 1:1772321/5‑199 (MQ=255) gtcgaCGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCGGGGTGTGATATTCCTGTGCATCACCAGGAAAAAATggg < 2:1920348/260‑1 (MQ=255) gtcgaCGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCGGGGTGTGATATTCCTGTGCATCACCAGGAAAAAATGGGCACTATGGACCCAACCTTTAACCCg > 1:618064/5‑289 (MQ=255) gtcgaCGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCGGGGTGTGATATTCCTGTGCATCACCAGGAAAAAATGGGCACTATGGACCCAACCTTTAACCCg > 2:983282/5‑289 (MQ=255) gtcgaCGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGAGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCCTTATTACCGGCTCATTCCCGGGGTGTGAGATTCCTTTGCATCTCCAGGAAAAAATGTGCACTATGGCCCCAATCttttaacat > 2:1392419/5‑283 (MQ=255) gtcgaCGCCGAATAAATGGACAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACGGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCGGGGTGTGATATTCCTGTGCATCACCAGGAAAAAATggg < 1:837338/260‑1 (MQ=255) cgaCGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCGGGGTGTGATATTCCTGTGCATCACCAGGAAAAAATGGGCACTATGGACCCAACCTTTAACCCGGt < 1:20147/287‑1 (MQ=255) cGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCGGGGTGTGATATTCCTGTGCATCACCAGGAAAAAATggg < 1:1281067/259‑1 (MQ=255) cGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCGGGGTGTGATATTCCTGTGCATCACCAGGAAAAAATggg > 2:1281067/1‑259 (MQ=255) cGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCGGGGTGTGATATTCCTGTGCATCACCAGGAAAAAATGGGCACTATGGACCCAACCTTTAACCCGGTGa > 1:1053523/1‑288 (MQ=255) aTAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCGGGGTGTGATATTCCTGTGCATCACCAGGCAAAAATGGGTACTATGGACCCAACCTTTAACCCGGTGAGCACCgg > 2:927056/1‑288 (MQ=255) aTAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGACCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCGGGGTGTGATATTCCTGTGCATCACCAGGAAAAAATGGGCACTCTGGAGCCAACCTTTAACCCGGTAAtacacga > 2:1322187/1‑283 (MQ=255) tGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCGGGGTGTGATATTCCTGTGCATCACCAGGAAAAAATGGGCACTATGGACCCAACCTTTAACCCGGTGATCACCGATGAtt < 2:586400/289‑1 (MQ=255) ggCCGGCATGGGAGTGCCCCGGTGGGCAACTCACCGACAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCGGGGTGTGATATTCCTGTGCATCACCAGGAAAAAATGGGCACTATGGACCCAACCTTTAACCCGGTGATCACCGATGAtt < 2:1646754/288‑1 (MQ=255) cAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCGGGGTGTGATATTCCTGTGCATCACCAGGAAAAAATGGGCACTATGGACCCAACCTTTAACCCGGTGATCACCGATGATTccgc < 1:758988/289‑1 (MQ=255) aTGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTAACCACAAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCGGGGTGTGATATTCCTGTGCATCACCAGGAAAAAATGGGCACTATGGACCCAACCTTTAACCCGGTGATCACCGATGATTCcgccgc < 1:8792/288‑1 (MQ=255) gggACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAATGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCGGGGTGTGATATTCCTGTGCATCACCAGGAAAAAATGGGCACTATGGACCCAACCTTTAACCCGGTGATCACCGATGATTCCGCCGCAtt < 1:1392419/289‑1 (MQ=255) gACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCGGGGTGTGATATTCCTGTGCATCACCAGGAAAAAATGGGCACTATGGACCCAACCTTTAACCCg > 1:1537749/1‑261 (MQ=255) gACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCGGGGTGTGATATTCCTGTGCATCACCAGGAAAAAATGGGCACTATGGACCCAACCTTTAACCCg < 2:1537749/261‑1 (MQ=255) ccccGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCGGGGTGTGATATTCCTGTGCATCACCAGGAAAAAATGGGCACTATGGACCCAACCTTTAACCCGGTGATCACCGATGAtt < 1:812965/272‑1 (MQ=255) ccccGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCGGGGTGTGATATTCCTGTGCATCACCAGGAAAAAATGGGCACTATGGACCCAACCTTTAACCCGGTGATCACCGATGATTCCGCCGCATTCAGTGaa > 2:1680221/1‑289 (MQ=255) gTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCGGGGTGTGATATTCCTGTGCATCACCAGGAAAAAATGGGCACTATGGACCCAACCTTTAACCCGGTGATCACCGATGATTCCGCCGCAtt < 2:806643/277‑1 (MQ=255) gCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCGGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCGGGGTGTGATATTCCTGTGCATCACCAGGAAAAAATGGGCACTATGGACCCAACCTTTAACCCGGTGATCACCGATGATTCCGCCGCATTCAGTGAACAGGCGGt < 2:737691/288‑1 (MQ=255) gCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCGGGGTGTGATATTCCTGTGCATCACCAGGAAAAAATGGGCACTATGGACCCAACCTTTAACCCGGTGATCACCGATGATTCCGCCGCATTCAGTGAACAGGCGGt < 1:1945730/288‑1 (MQ=255) cAACTCCCCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCTCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACCGTTCTTTATTACCCGCGCATTCCCGGGTTGTGATATTCCTGTGCATCACCAGGAACAAGTGGGCACTATGGACCCCACCTTTAATCCGGTGATCACCGATGATCACTCCGCCTTCAgccgaccggtgtgg > 2:418848/1‑275 (MQ=255) cAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCGGGGTGTGATATTCCTGTGCATCACCAGGAAAAAAGGGGCACTAGGGACCCAACCTTTAACCCGGTGATTACGCATGATTCCGGCGCATGCATTGAACAGGCgggg > 2:351575/1‑286 (MQ=255) tCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCGGGGTGTGATATTCCTGTGCATCACCAGGAAAAAATGGGCACTATGGACCCAACCTTTAACCCGGTGATCACCGATGATTCCGCCGCATTCAGTGAACAGGCGGTggcggc < 2:1197466/289‑1 (MQ=255) cGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCGGGGTGTGATATTCCTGTGCATCACCAGGAAAAAATGGGCACTATGGACCCAACCTTTAACCCGGTGATCACCGATGATTCCGCCGCATTCAGTGAACAGGCGGTGGCGGCAATGGAGAAAGAGCTc > 1:1037940/1‑289 (MQ=255) gCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCGGGGTGTGATATTCCTGTGCATCACCAGGAAAAAATGGGCACTATGGACCCAACCTTTAACCCGGTGATCACCGATGATTCCGCCGCATTCAGTGAACAGGCGGTGGCGGCAATGGAGAAAGAGCTCAGc < 1:1322187/289‑1 (MQ=255) cTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCGGGGTGTGATATTCCTGTGCATCACCAGGAAAAAATGGGCACTATGGACCCAACCTTTAACCCGGTGATCACCGATGATTCCGCCGCATTCAGTGAACAGGCGGTGGCGGCAATGGAGAAAGAGCTCAGCa > 1:325365/1‑289 (MQ=255) atatGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCGGGGTGTGATATTCCTGTGCATCACCAGGAAAAAATGGGCACTATGGACCCAACCTTTAACCCGGTGATCACCGATGATTCCGCCGCATTCAGTGAACAGGCGGTGGCGGCAATGGAGAAAGAGCTCAGCAAACTCCAGCt > 1:461762/1‑289 (MQ=255) tatGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCGGGGTGTGATATTCCTGTGCATCACCAGGAAAAAATGGGCACTATGGACCCAACCTTTAACCCGGTGATCACCGATGATTCCGCCGCATTCAGTGAACAGGCGGTGGCGGCAATGGAGAAAGAGCTCAGCAAACTCCAGCtt > 1:146291/1‑289 (MQ=255) ggCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCGGGGTGTGATATTCCTGTGCATCACCAGGAAAAAATGGGCACTATGGACCCAACCTTTAACCCGGTGATCACCGATGATTCCGCCGCATTCAGTGAACAGGCGGTGGCGGCAATGGAGAAAGAGCTCAGCAAACTCCAGCTTACC‑g > 1:678171/1‑289 (MQ=255) ccATTGCATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCACTCCCGGGGTGTGATATTCCTGTGCATCACCAGGAAAAAATGGGCACTATGGACCCAACCTTTAACCCGGTGATCACCGATGATTCCGCCGCATTCAGTGAACAGGCGGTGGCGGCAATGGAGAAAGAGCTCAGCAAACTCCAGCTTACC‑GAc > 1:988471/1‑289 (MQ=255) ccATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCGGGGTGTGATATTCCTGTGCATCACCAGGATAAAATGGGCACTATGGACCCAACCTTTAACCCGGTGATCACCAATGATTCCGCCGCATTCAGTGAACAGGCGGTGGCGGCAAGGGAAAAAGAGCTCAGCAAACCCCAACTTACC‑GAc > 2:230268/1‑289 (MQ=255) ccATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCGGGGTGTGATATTCCTGTGCATCACCAGGAAAAAATGGGCACTATGGACCCAACCttt > 2:18935/1‑199 (MQ=255) ccATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCGGGGTGTGATATTCCTGTGCATCACCAGGAAAAAATGGGCACTATGGACCCAACCTTTAACCCGGTGATCACCGATGATTCCGCCGCATTCAGTGAACAGGCGGTGGCGGCAATGGAGAAAGAGCTCAGCAAACTCCAGCTTACC‑GAc > 1:1682066/1‑289 (MQ=255) aTTACATGCGTGAATGGCTGGGAGAGCAGTGGAGGGGGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCGGGGTGTGATATTCCTGTGCATCACCAGGAAAAAATGGGCACTATGGACCCAACCTTTAACCCGGTGATCACCGATGATTCCGCCGCATTCAGTGAACAGGCGGTGGCGGCAATGGAGAAAGAGCTCAGCAAACTCCAGCTTACC‑GAcag < 2:618064/289‑1 (MQ=255) aTTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCGGGGTGTGATATTCCTGTGCATCACCAGGAAAAAATGGGCACTATGGACCCAACCTTTAACCCGGTGATCACCGATGATTCCGCCGCATTCAGTGAACAGGCGGTGGCGGCACTGGAGAGAGAACTCAGCAAACTCAACCTTACC‑caca > 2:494513/1‑288 (MQ=255) gCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCGGGGTGTGATATTCCTGTGCATCACCAGGAAAAAATGGGCACTATGGACCCAACCTTTAACCCGGTGATCACCGATGATTCCGCCGCATTCAGTGAACAGGCGGTGGCGGCAATGGAGAAAGAGCTCAGCAAACTCCAGCTTACC‑GAcagctacca > 2:1079423/1‑288 (MQ=255) gAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCGGGGTGTGATATTCCTGTGCATCACCAGGAAAAAATGGGCACTATGGACCCAACCTTTAACCCGGTGATCACCGATGATTCCGCCGCATTCAGTGAACAGGCGGTGGCGGCAATGGAGAAAGAGCTCAGCAAACTCCAGCTTACC‑GAcagctaccagcta < 1:925152/288‑1 (MQ=255) aaTGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCGGGGTGTGATATTCCTGTGCATCACCAGGAAAAAATGGGCACTATGGACCCAACCTTTAACCCGGTGATCACCGATGATTCCGCCGCATTCAGTGAACAGGCGGTGGCGGCCATGGAGAAAGAGCTCAGCCAACTCCAGCTTACC‑GACAGCTACCAGCTCCt > 1:1189396/1‑289 (MQ=255) ctggcAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCGGGGTGTGATATTCCTGTGCATCACCAGGAAAAAATGGGCACTATGGACCCAACCTTTAACCCGGTGATCACCGATGATTccgcc > 2:639001/1‑207 (MQ=255) cAGAGCAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCGGGGTGTGATATTCCTGTGCATCACCAGGAAAAAATGGGCACTATGGACCCAACCTTTAACCCGGTGATCACCGATGATTCCGCCGCATTCAGTGAACAGGCGGTGGCGGCAATGGAGAAAGAGCTCAGCAAACTCCAGCTTACC‑GACAGCTACCAGCTACTGGaaaaaa > 1:135513/1‑288 (MQ=255) cAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTg > 2:1817384/1‑66 (MQ=255) cAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCTACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCGGGGTGTGATATTCCTGTGCATCACCAGGAAAAAATGGGCACTATGGACCCAACCTTTAACCCGGTGATCACCGCTGATTCCGCCGCATTCAGTGAACAGGCGGTGGCGGCAATGGAGAAAGAGCTCAGCAAACTCCAGCTTACC‑GACAGCTACCAGCTACTGGAAAAAATCGtt < 1:1143834/288‑1 (MQ=255) cAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCGGGGTGTGATATTCCTGTGCATCACCAGGAAAAAATGGGCACTATGGACCCAACCTTTAACCCGGTGATCACCGATGATTCCGCCGCATTCAGTGAACAGGCGGTGGCGGCAATGGAGAAAGAGCTCAGCAAACTCCAGCTTACC‑GACAGCTACCAGCTACTGGAAAAAATCGtt < 1:44249/288‑1 (MQ=255) cAGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCGGGGTGTGATATTCCTGTGCATCACCAGGAAAAAATGGGCACTATGGACCCAACCTTTAACCCGGTGATCACCGATGATTCCGCCGCATTCAGTGAACAGGCGGTGGCGGCAATGGAGAAAGAGCTCAGCAAACTCCAGCTTACC‑GACAGCTACCAGCTACTGGAAAAAATCGTTa > 2:1319505/1‑289 (MQ=255) aGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCGGGGTGTGATATTCCTGTGCATCACCAGGAAAAAATGGGCACTATGGACCCAACCTTTAACCCGGTGATCACCGATGATTCCGCCGCATTCAGTGAACAGGCGGTGGCGGCAATGGAGAAAGAGCTCAGCAAACTCCAGCTTACC‑GACAGCTACCAGCTACTGGAAAAAATCGtt < 1:1079423/287‑1 (MQ=255) aGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCGGGGTGTGATATTCCTGTGCATCACCAGGAAAAAATGGGCACTATGGACCCAACCTTTAACCCGGTGATCACCGATGATTCCGCCGCATTCAGTGAACAGGCGGTGGCGGCAATGGAGAAAGAGCTCAGCAAACTCCAGCTTACC‑GACAGCTACCAGCTACTGGAAAAAATCGtt < 2:1039188/287‑1 (MQ=255) aGGGGATGGTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCGGGGTGTGATATTCCTGTGCATCACCAGGAAAAAATGGGCACTATGGACCCAACCTTTAACCCGGTGATCACCGATGATTCCGCCGCATTCAGTGAACAGGCGGTGGCGGCAATGGAGAAAGAGCTCAGCAAACTCCAGCTTACC‑GACAGCTACCAGCTACTGGAAAAAATCGTTa < 1:230268/288‑1 (MQ=255) ggTGAAATCGGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCTGCGCATTCCCGGGGTGTGATATTCCTGTGCATCACAAGGAAAAAATGGGCACTAGGGACCCAACCTTTAACCCGGTGATCACCGATGATTCCGCCGCATTCAGTGAACAGGCGGTGGCGGCGATGGAGAATGAGCTCAGCAAACTCCAGCTTCCCAGAC‑GATACTAGCCATTGGAAAAAAACGTTCACTATaaa > 2:1143834/1‑289 (MQ=255) ||| ATCGCCGCAGCTGTGGCAGGGATAGTTTTACTCGCTAGTAACGCTCAGGCACAAACCGTACCGGAAGGCTATCAGCTACAGCAAGTGCTCATGATGAGCCGCCATAACTTACGTGCGCCGCTGGCGAACAATGGCAGTGTGCTGGAGCAGAGCACGCCGAATAAATGGCCAGAATGGGACGTCCCCGGTGGGCAACTCACCACCAAAGGTGGCGTGCTCGAAGTGTATATGGGCCATTACATGCGTGAATGGCTGGCAGAGCAGGGGATGGTGAAAAGCGGGGAATGCCCGCCGCCGTACACCGTTTATGCCTATGCCAATAGTCTGCAACGTACCGTTGCGACCGCACAGTTCTTTATTACCGGCGCATTCCCGGGGTGTGATATTCCTGTGCATCACCAGGAAAAAATGGGCACTATGGACCCAACCTTTAACCCGGTGATCACCGATGATTCCGCCGCATTCAGTGAACAGGCGGTGGCGGCAATGGAGAAAGAGCTCAGCAAACTCCAGCTTACC‑GACAGCTACCAGCTACTGGAAAAAATCGTTAACTATAAA > CP042583/920184‑920741 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |