Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 1,042,878 | 3 bp→TGA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 1,042,878 | 0 | A | T | 100.0% | 616.9 / NA | 258 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base T (136/122); total (136/122) | |||||||||||
* | CP042583 | 1,042,879 | 0 | C | G | 100.0% | 608.7 / NA | 258 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (136/122); total (136/122) | |||||||||||
* | CP042583 | 1,042,880 | 0 | T | A | 99.2% | 604.2 / NA | 258 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/0); major base A (134/121); minor base C (1/1); total (136/122) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 |
Only 100 of 258 total aligned reads displayed.
CAATGCTACTGGCGTCGGTCCAGCTACGGAATAAGTAATTGTTTTTGAAGAAAGAGTTATGCCCATAGCAGGCATGAGCCATCACCAGCGCTTGCATGGTAATGGTGTTCTCTTCCATCAGGTAAGCGATACACGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAAACTCCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCACTGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATCCAGCAGGTCGAACGTCCAGTCGGGTCCATCGCTCAAACGTGTGGTGTCCTTATTCATAGAATCGATCGTCGCCATACGCGCACCTCATTGTTGTCGGCGCTCTCTGTGTGGAGCACCTCATTTCAAGCATAGAACACCTGTTAAAAACCGCGTCGCCGGAGAATTTTTTTCTTTGCGATTTCTTATTATCAGAGTGC > CP042583/1042598‑1043158 ||| caatcgaaCTGGCGTCGGTCCAGCTACGGAATAAGTAATTGTTTTTGAAGAAAGAGTTATGCCCATAGCAGGCATGAGCCATCACCAGCGCTTGCATGGTAATGGTGTTCTCTTCCATCAGGTAAGCGATACACGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTAt < 2:929870/282‑1 (MQ=255) atcgaaCTGGCGTCGGTCCAGCTACGGAATAAGTAATTGTTTTTGAAGAAAGAGTTATGCCCATAGCAGGCATGAGCCATCACCAGCGCTTGCATGGTAATGGTGTTCTCTTCCATCAGGTAAGCGATACACGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCa < 2:1763327/284‑1 (MQ=255) ggCGTCGGTCCAGCTACGGAATAAGTAATTGTTTTTGAAGAAAGAGTTATGCCCATAGCAGGCATGAGCCATCACCAGCGCTTGCATGGTAATGGTGTTCTCTTCCATCAGGTAAGCGATACACGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCaa > 1:1190016/1‑287 (MQ=255) cAGCTACGGAATAAGTAATTGTTTTTGAAGAAAGAGTTATGCCCATAGCAGGCATGAGCCATCACCAGCGCTTGCATGGTAATGGTGTTCTCTTCCATCAGGTAAGCGATACACGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGggt < 2:1177743/289‑1 (MQ=255) aTTGTTTTTGAAGAAAGAGTTATGCCCATAGCAGGCATGAGCCATCACCAGCGCTTGCATGGTAATGGTGTTCTCTTCCATCAGGTAAGCGATACACGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTag > 2:833819/1‑289 (MQ=255) tGTTTTTGAAGAAAGAGTTATGCCCATAGCAGGCATGAGCCATCACCAGCGCTTGCATGGTAATGGTGTTCTCTTCCATCAGGTAAGCGATACACGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTagag > 1:11229/1‑289 (MQ=255) tttGAAGAAAGAGTTATGCCCATAGCAGGCATGAGCCATCACCAGCGCTTGCATGGTAATGGTGTTCTCTTCCATCAGGTAAGCGATACACGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGGTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTTCGGGTAGGTATCAAGCCGGTAGAGTTTc > 1:523238/1‑289 (MQ=255) tGAAGAAAGAGTTATGCCCATAGCAGGCATGAGCCATCACCAGCGCTTGCATGGTAATGGTGTTCTCTTCCATCAGGTAAGCGATACACGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCg > 2:881379/1‑288 (MQ=255) aaaaggTTATGACACTAGCCGGCATGGGCACTCGCCATGGCTTGCATTGTAATGTTGTTCTCTACCATCAGGTAAGCGATACACCGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCAcc < 2:1800936/283‑1 (MQ=255) aagaGTTATGCCCATAGCAGGCATGAGCCATCACCAGCGCTTGCATGGTAATGGTGTTCTCTTCCATCAGGTAAGCGATACACGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCAcc < 1:300774/287‑1 (MQ=255) aagaGTTATGCCCATAGCAGGCATGAGCCATCACCAGCGCTTGCATGGTAATGGTGTTCTCTTCCATCAGGTAAGCGATACACGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCAcc < 1:1271346/287‑1 (MQ=255) aagaGTTATGCCAATAGCAGGCATGAGCCATCACCAGCGCTTGCATGGTAATGGTGTTCTCTTCCATCAGGTAAGCGATACACGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCAcc < 1:1902218/287‑1 (MQ=255) cccATAGCAGGCATGAGCCATCACCAGCGCTTGCATGGTAATGGTGTTCTCTTCCATCAGGTAAGCGATACACGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTAtct < 1:1548633/287‑1 (MQ=255) cATAGCAGGCATGAGCCATCACCAGCGCTTGCATGGTAATGGTGTTCTCTTCCATCAGGTAAGCGATACACGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGc < 1:1240540/289‑1 (MQ=255) tAGCAGGCATGAGCCATCACCAGCGCTTGCATGGTAATGGTGTTCTCTTCCATCAGGTAAGCGATACACGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCa < 1:604848/289‑1 (MQ=255) tAGCAGGCATGAGCCATCACCAGCGCTTGCATGGTAATGGTGTTCTCTTCCATCAGGTAAGCGATACACGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCa < 2:1232541/289‑1 (MQ=255) tAGCAGGCATGAGCCATCACCAGCGCTTGCATGGTAATGGTGTTCTCTTCCATCAGGTAAGCGATACACGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCa > 1:1001078/1‑289 (MQ=255) gCATGAGCCATCACCAGCGCTTGCATGGTAATGGTGTTCTCTTCCATCAGGTAAGCGATACGCGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTACAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCTCCACCCGGTCTATCTTTTCCAGATaa > 2:1286373/1‑288 (MQ=255) cATGAGCCATCACCAGCGCTTGCATGGTAATGGTGTTCTCTTCCATCAGGTAAGCGATACACGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAAc > 1:98703/1‑289 (MQ=255) aGCCATCACCAGCGCTTGCATGGTAATGGTGTTCTCTTCCATCAGGTAAGCGATACACGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTAt > 2:509271/1‑213 (MQ=255) aGCCATCACCAGCGCTTGCATGGTAATGGTGTTCTCTTCCATCAGGTAAGCGATACACGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCCCTGCAAGATAAACATca > 2:201220/1‑288 (MQ=255) tCACCAGCGCTTGCATGGTAATGGTGTTCTCTTCCATCAGGTAAGCGATACACGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATCcagcag > 1:1324828/1‑289 (MQ=255) gcgcTTGCATGGTAATGGTGTTCTCTTCCATCAGGTAAGCGATACACGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATCCAGCAGGTCGa > 1:67867/1‑288 (MQ=255) cgcTTGCATGGTAATGGTGTTCTCTTCCATCAGGTAAGCGATACACGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATCCAGCAGGTCGAAc > 1:1789032/1‑289 (MQ=255) gcTTGCATGGTAATGGTGTTCTATTCCATCAGGTAAGCGATACACGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATATGCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGCGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATCCAGCAGGTCGa < 1:768559/286‑1 (MQ=255) aTGGTGTTCTCTTCCATCAGGTAAGCGATACACGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATCCAGCAGGTCGAACGTCCAGTCGGGt > 1:1737255/1‑288 (MQ=255) gtgtTCTCTTCCATCAGGTAAGCGATACACGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTAtct < 2:280583/244‑1 (MQ=255) ttCTCTTCCATCAGGTAAGCGATACACGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATCCAGCAGGTCGAACGTCCAGTCGGGTCCATCg > 1:1083929/1‑288 (MQ=255) ctctTCCATCAGGTAAGCGATACACGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATCCAGCAGGTCGAACGTCCAGTCGGGTCCATCGCTc > 1:1375454/1‑289 (MQ=255) ctctTCCATCAGGTAAGCGATACACGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATCCAGCAGGTCGAACGTCCAGTCGGGTCCATCGCTc > 1:816199/1‑289 (MQ=255) ctctTCCATCAGGTAAGCGATACACGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGAAAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATACATCAACGGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTACCCAGACGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCGATCTCTGCCAGATAAACATCCAGCAGGTCGAACGACCAGTCGGGTCCATcctcc > 2:1039429/1‑285 (MQ=255) tCCATCAGGTAAGCGATACACGGGTTAGAGTTAATGACGATTCCATAGGCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATCCAGCAGGTCGAACGTCCAGTCGGGTCCATCGCTCAAAc < 1:177492/289‑1 (MQ=255) cAGGTAAGCGATACACGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATCCAGCAGGTCGAACGTCCAGTCGGGTCCATCGCTCAAACGtgtg < 1:918840/289‑1 (MQ=255) cAGGTAAGCGATACACGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATCCAGCAGGTCGAACGTCCAGTCGGGTCCATCGCTCAAACGtgtg < 1:1039429/289‑1 (MQ=255) cAGGTAAGCGATACACGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATCCAGCAGGTCGAACGTCCAGTCGGGTCCATCGCTCAAACGtgtg < 1:355507/289‑1 (MQ=255) tAAGCGTTACACGGGTTAGAGTTAAGGCCGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATCCAGCAGGTCGAACGTCCAGTCGGGTCCATCGCTCAAACGTgtggtg < 2:1460267/288‑1 (MQ=255) tAAGCGATACACGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATCCAGCAGGTCGAACGTCCAGTCGGGTCCATCGCTCAAACGTgtgg < 1:881379/286‑1 (MQ=255) gaaGGGATACACGGGTTAGGGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATCCAGCAGGTCGAACGTCCAGTCGGGTCCATCGCTCAAACGTgtggtg < 2:1381874/287‑1 (MQ=255) gCGATACACGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATCCAGCAGGTCGAACGTCCAGTCGGGTCCATCGCTCAAACGTGTGGTGTCCt > 1:272991/1‑289 (MQ=255) gCGATACACGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATCCAGCAGGTCGAACGTCCAGTCGGGTCCATCGCTCAAACGTGTGGTGTCCt > 1:999928/1‑289 (MQ=255) gATACACGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATCCAGCAGGTCGAACGTCCAGTCGGGTCCATCGCTCAAACGTGTGGTGTCCtt < 1:833819/288‑1 (MQ=255) gATACACGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATCCAGCAGGTCGAACGTCCAGTCGGGTCCATCGCTCAAACGTGTGGTGTCCtt < 2:982127/288‑1 (MQ=255) gATACACGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATCCAGCAGGTCGAACGTCCAGTCGGGTCCATCGCTCAAACGTGTGGTGTCCtt < 1:507055/288‑1 (MQ=255) taaccGGGTTAGTGTTAATGACGATTTCATGGGCCAATCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATCCAGCAGGTCGAACGTCCAGTCGGGTCCATCGCTCAAACGTGTGGTGTCCTTAt < 2:417432/284‑1 (MQ=255) cacGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATCCAGCAGGTCGAACGTCCAGTCGGGTCCATCGCTCAAACGTGTGGTGTCCTTATTCa > 1:166985/1‑289 (MQ=255) cacGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATCCAGCAGGTCGAACGTCCAGTCGGGTCCATCGCTCAAACGTGTGGTGTCCTTATTCa > 1:211965/1‑289 (MQ=255) cacGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATCCAGCAGGGCGAACGTCCAGCGGTGGCCACGGCTCCAACGTGTGTTGCGCTTATTCa > 2:308880/1‑289 (MQ=255) gTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCTTTAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCGGCCAGATAAACATCCAGCAGGTCGAACGTCCAGTCGGGTCCATCGCTCAAACGTGTGGTGTCCTTATTCa < 1:140287/284‑1 (MQ=255) ttAGAGTTCATGACGATTTCATGGGCCAGTCCTTTCTCCCCGTGCTTATACCGCCGTTCAGTCTCGATACACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATCCAGCAGGTCGAACGTCCAGTCGGGTCCATCGCTCAAACGTGTGGTGTCCTTATTCATAGaa < 2:1594204/288‑1 (MQ=255) agTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATCCAGCAGGTCGAACGTCCAGTCGGCTCCATCGCCCAAACGTGTGGTGGCCTTATTCATAGAatcga > 2:345788/1‑288 (MQ=255) ttAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGAGAAACGTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATCCAGCAGGTCGAACGTCCAGTCGGGTCCATCGCTCAAACGTGTGGTGTCCTTATTCATAGAatcgatcg < 1:410319/289‑1 (MQ=255) aTGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCCGGAGTAGGCATACATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATCCAGCAGGTCGAACGTCCAGTCGGGTCCATCGCTCAAACGAGTGGGGTCCTTATTCTTCGAatggaa > 2:140287/1‑283 (MQ=255) gATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATCCAGCAGGTCGAACGTCCAGTCGGGTCCATCGCTCAAACGTGTGGTGTCCTTATTCATAGAATCGATCGTCGCCAt > 1:480073/1‑288 (MQ=255) gATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATCCAGCAGGTCGAACGTCCAGTCGGGTCCATCGCTAAAACGTGTGGTGTCCTTATTCATAGAATCGAtcgtaccact > 2:1702370/1‑282 (MQ=255) aTTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATCCAGCAGGTCGAACGTCCAGTCGGGTCCATCGCTCAAACGTGTGGTGTCCTTATTCATAGAATCGATCGTCGCCATAc > 2:1358233/1‑289 (MQ=255) tCATAGGCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATCCAGCAGGTCGAACGTCCAGTCGGGTCCATCGCTCAAACGTGTGGTGTCCTTATTCATAGAATCGATCGTCGCCATAcgcg < 1:345788/289‑1 (MQ=255) cAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCTACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATCCAGCAGGTCGAACGTCCAGTCGGGTCCATCGCTCAAACGTGTGGTGTCCTTATTCATAGAATCGATCGTCGCCATACGCGCACCTCAt > 2:231068/1‑289 (MQ=255) aGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATCCAGCAGGTCGAACGTCCAGTCGGGTCCATCGCTCAAACGTGTGGTGTCCTTATTCATAGAATCGATCGTCGCCATACGCGCACCTCAtt > 1:1434529/1‑289 (MQ=255) tCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATCCAGCAGGTCGAACGTCCAGTCGGGTCCATCGCTCAAACGTGTGGTGTCCTTATTCATAGAATCGATCGTCGCCATACGCGCACCTCAttgt > 1:1249441/1‑289 (MQ=255) tCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATCCAGCAGGTCGAACGTCCAGTCGGGTCCATCGCTCAAACCGGTGGCGTCCTTATTCATAGAATCGATCGTCGCCATAGCGGCCCCTCAtttt > 2:1821892/1‑287 (MQ=255) gCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTCCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTAAATCTGGTGCGGGTAGGTATCTAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATCCAGCAGGTCGAACGTCCAGTCGGGTCCATCGCTCAAACGTGTGGTTGCCTTATTCATAGAATCGATCGTCGCCATACGCGCACCTCATGTTTGTCg > 1:1792227/1‑289 (MQ=255) aCCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATCCAGCAGGTCGAACGTCCAGTCGGGTCCATCGCTCAAACGTGTGGTGTCCTTATTCATAGAATCGATCGTCGCCATACGCGCACCTCATTGTTGTCGgc > 1:1522772/1‑287 (MQ=255) ccGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATCCAGCAGGTCGAACGTCCAGTCGGGTCCATCGCTCAAACGTGTGGTGTCCtt > 1:1470102/1‑239 (MQ=255) ccGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATCCAGCAGGTCGAACGTCCAGTCGGGTCCATCGCTCAAACGTGTGGTGTCCTTATTCATAGAATCGATCGTCGCCATACGCGCACCTCATTGTTGTCGgcgc < 2:781858/288‑1 (MQ=255) ccGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATCCAGCAGGTCGAACGTCCAGTCGGGTCCATCGCTCAAACGTGTGGTGTCCTTATTCATAGAATCGATCGGCGCCATACGCGCACCTCATTTGTTTCGgcgc > 2:1067286/1‑288 (MQ=255) gTGCTTATACCGCCGTTCAGTTTCGATAACCTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATCCAGCAGGTCGAACGTCCAGTCGGGTCCATCGCTCAAACGTGTGGTGTCCTTATTCATAGAATCGATCGTCGCCATACGCGCACCTCATTGTTGTCGGCGctct < 2:1563609/289‑1 (MQ=255) gTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTACCTCTGCCAGATAAACATCCAGCAGGTCGAAAGTCCAGTCGGGTCCATCGCTCAAACGTGTGGTGTCCTTCTTCATAGAATCGAGCGTCGCCCTACGCGCACCTCATTTTTGGCGGCGctc > 2:1554588/1‑288 (MQ=255) cTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCCCTGCAAGATAAACATCCAGCAGGTCGAACGTCCAGTCGGGTCCATAGCCCAAACGTGTGGTGTCCTTATTCATAGAATCGATCGTCGCCATATGCGCACCTCATTGTTGTCGTCGctctccg > 2:667031/1‑287 (MQ=255) cTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCGGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCACTCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATCCAGCAGGTCGAACGTCCAGTCGGGTCCCTCGCGCAAACGGTTGGTGTCCTTATTCATAGAATCGATCGTCCCCATACGTGCAACCCCttgtttgtcgctcccgtgt > 2:263650/1‑275 (MQ=255) gCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATCCAGCAGGTCGAACGTCCAGTCGGGTCCATCGCTCAAACGTGTGGTGTCCTTATTCATAGAATCGATCGTCGCCATACGCGCACCTCATTGATGTCGGCGCTCTCTGTGTgggg > 1:192077/1‑286 (MQ=255) ccGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATCCAGCAGGTCGAACGTCCAGTCGGGTCCATCGCTCAAACGTGTGGTGTCCTTATTCATAGAATCGATCGTCGcc > 2:613533/1‑247 (MQ=255) ccGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATCCAGCAGGTCGAACGTCCAGTCGGGTCCATCGCTCAAACGTGTGGTGTCCTTATTCATAGAATCGATCGTCGCCATAcgcg < 1:1456099/254‑1 (MQ=255) ccGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATCCAGCAGGTCGAACGTCCAGTCGGGTCCATCGCTCAAACGTGTGGTGTCCTTATTCATAGAATCGATCGTCGCCATACGCGCACCTCATTGTTGTCGGCGCTCTCTGTGTGGAGc > 1:1022386/1‑288 (MQ=255) ccGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATCCAGCAGGTCGAACGTCCAGTCGGGTCCATCGCTCAAACGTGTGGTGTCCTTATTCATAGAATCGATCGTCGCCATACGCGCACCTCATTGTTGTCGGCGCTCTCTGTGTGGAGc > 2:1118430/1‑288 (MQ=255) ccGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATCCAGCAGGTCGAACGTCCAGTCGGGTCCATCGCTCAAACGTGTGGTGTCCTTATTCATAGAATCGATCGTCGCCATACGCGCACCTCATCGTTGTCGGCGCTCTCTGTGTGGAGc > 1:1270497/1‑288 (MQ=255) gTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATCCAGCAGGTCGAACGTCCAGTCGGGTCCATCGCTCAAACGTGTGGTGTCCTTATTCATAGAATCGATCGTCGCCATACGCGCACCTCATTGTTGTCGGCGCTCTCTGTGTGGAGCAc > 2:1268453/1‑288 (MQ=255) ttCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATCCAGCAGGTCGAACGTCCAGTCGGGTCCATCGCTCAAACGTGTGGTGTCCTTATTCATAGAATCGATCGTCGCCATACGCGCACCTCATTGTTGTCGGCGCTCTCTGTGTGGAGCAcc > 2:148852/1‑288 (MQ=255) tCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATCCAGCAGGTCGAACGTCCAGTCGGGTCCATCGCTCAAACGTGTGGTGTCCTTATTCATAGAATCGATCGTCGCCAt > 2:1587997/1‑245 (MQ=255) tAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATCCAGCAGGTCGAACGTCCAGTCGGGTCCATCGCTCAAACGTGTGGTGTCCTTATTCATAGAATCGATCGTCGCCATACGCGCACCTCATTGTTGTCGGCGCTCTCTGTGTGGAGCACCTCATTTCAAGCa < 1:624173/289‑1 (MQ=255) tAAACTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATCCAGCAGGTCGAACGTCCAGTCGGGTCCATCGCTCAAACGTGTGGTGTCCTTATTCATAGAATCGATCGTCGCCATACGCGCACCTCATTGTTGTCGGCGCTCTCTGTGTGGAGCACCTCATTTCAAGCa < 1:38336/289‑1 (MQ=255) cTTTTTACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATCCAGCAGGTCGAACGTCCAGTCGGGTCCATCGCTCAAACGTGTGGTGTCCTTATTCATAGAatcga < 2:822665/221‑1 (MQ=255) ttACCGAATGACCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATCCAGCAGGTCGAACGTCCAGTCGGGTCCATCGCTCAAACGTGTGGTGTCCTTATTCATAGAATCGATCGTCGCCATACGCGCACCTCATTGTTGTCGGCGCTCTCTGTGTGGAGCACCTCATTTCAAGCATAGAaca > 1:670942/1‑288 (MQ=255) gCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATc < 1:1593627/136‑1 (MQ=255) gATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATCCAGCAGGTCGAACGTCCAGTCGGGTCCATCGCTCAAACGTGTGGTGTCCTTATTCATAGAATCGATCGTCGCCATACGCGCACCTCATTGTTGTCGGCGCTCTCTGTGTGGAGCACCTCATTTCAAGCATAGAACACCTGTTAAAAACCGCGTCg < 1:1704362/288‑1 (MQ=255) tAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATCCAGCAGGTCGAACGTCCAGTCGGGTCCATCGCTCAAACGTGTGGTGTCCTTATTCATAGAATCGATCGTCGCCATACGCGCACCTCATTGTTGTCGGCGCTCTCTGTGTGGAGCACCTCATTTCAAGCATAGAACACCTGTTAAAAACCGCGTCGCCGgaga > 2:1330806/1‑289 (MQ=255) tGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATCCAGCAGGTCGAACGTCCAGTCGGGTCCATCGCTCAAACGTGTGGTGTCCTTATTCATAGAATCGATCGTCGCCATACGCGCACCTCATTGTTGTCGGCGCTCTCTGTGTGGAGCACCTCATTTCAAGCATAGAACACCTGTTAAAAACCGCGTCGCCGGAGAAttt > 2:1204768/1‑289 (MQ=255) tGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATCCAGCAGGTCGAACGTCCAGTCGGGTCCATCGCTCAAACGTGTGGTGTCCTTATTCATAGAATCGATCGTCGCCATAcgcg < 1:1634208/198‑1 (MQ=255) tGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATCCAGCAGGTCGAACGTCCAGTCGGGTCCATCGCTCAAACGTGTGGTGTCCTTATTCATAGAATCGATCGTCGCCATACGCGCACCTCATTGTTGTCGgc > 2:1790250/1‑216 (MQ=255) tGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATCCAGCAGGTCGAACGTCCAGTCGGGTCCATCGCTCAAACGTGTGGTGTCCTTATTCATAGAATCGATCGTCGCCATACGCGCACCTCATTGTTGTCGGCGCTCTCTGTGTGGAGCACCTCATTTCAAGCATAGAACACCTGTTAAAAACCGCGTCGCCGGAGAAtttttt > 2:1905243/1‑287 (MQ=255) tGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATCCAGCAGGTCGAACGTCCAGTCGGGTCCATCGCTCAAACGTGTGGTGTCCTTATTCATAGAATCGATCGTCGCCATACGCGCACCTCATTGTTGTCGGCGCTCTCTGTGTGGAGCACCTCATTTCAAGCATAGAACACCTGTTAAAAACCGCGTCGCCGGAGAAtttttt > 1:791177/1‑287 (MQ=255) tGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATCCAGCAGGTCGAACGTCCAGTCGGGTCCATCGCTCAAACGTGTGGTGTCCTTATTCATAGAATCGATCGTCGCCATACGCGCACCTCATTGTTGTCGGCGCTCTCTGTGTGGAGCACCTCATTTCAAGCATAGAACACCTGTTAAAAACCGCGTCGCCGGAGAATTTTTTTCTTTGCGAt < 1:1565046/288‑1 (MQ=255) tGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATCCAGCAGGTCGAACGTCCAGTCGGGTCCATCGCTCAAACGTGTGGTGTCCTTATTCATAGAATCGATCGTCGCCATACGCGCACCTCATTGTTGTCGGCGCTCTCTGTGTGGAGCACCTCATTTCAAGCATAGAACACCTGTTAAAAACCGCGTCGCCGGAGAATTTTTTTCTTTGCGAt < 1:1204768/288‑1 (MQ=255) tGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATCCAGCAGGTCGAACGTCCAGTCGGGTCCATCGCTCAAACGTGTGGTGTCCTTATTCATAGAATCGATCGTCGCCATACGCGCACCTCATTGTTGTCGGCGCTCTCTGTGTGGAGCACCTCATTTCAAGCATAGAACACCTGTTAAAAACCGCGTCGCCGGAGAATTTTTTTCTTTGCGAt < 2:67867/288‑1 (MQ=255) tGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGGTGGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATCCAGCAGGTCGAACGTCCAGTCGGGTCCATCGCTCAAACGTGTGGTGTCCTTATTCATAGAATCGATCGTCGCCATACGCGCACCTCATTGTTGTCGGCGCTCTCTGTGTGGAGCACCTCATTTCAAGCATAGAACACCTGTTAAAAACCGCGTCGCCGGAGAATTTTTTTCTTTGCGAt < 2:1434529/288‑1 (MQ=255) aGTAGGCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATCCAGCAGGTCGAACGTCCAGTCGGGTCCATCGCTCAAACGTGTGGTGTCCTTATTCATAGAATCGATCGTCGCCATACGCGCACCTCATTGTTGTCGGCGCTCTCTGTGTGGAGCACCTCATTTCAAGCATAGAACACCTGTTAAAAACCGCGTCGCCGGAGAATTTTTTTCTTTGCGATTTCt > 2:1149285/1‑289 (MQ=255) gCATCCATCATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATCCAGCAGGTCGAACGTCCAGTCGGGTCCATCGCTCAAACGTGTGGTGTCCTTATTCATAGAATCGATCGTCGCCATACGCGCACCTCATTGTTGTCGGCGCTCTCTGTGTGGAGCACCTCATTTCAAGCATAGAACACCTGTTAAAAACCGCGTCGCCGGAGAATTTTTTTCTTTGCGATTTCttatta > 2:585416/1‑289 (MQ=255) atccatcATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATCCAGCAGGTCGAACGTCCAGTCGGGTCCATCGCTCAAACGTGTGGTGTCCTTATTCATAGAATCGATCGTCGCCATACGCGCACCTCATTGTTGTCGGCGCTCTCTGTGTGGAGCACCTCATTTCAAGCATAGAACACCTGTTAAAAACCGCGTCGCCGGAGAATTTTTTTCTTTGCGATTTCTtattat < 1:1149285/288‑1 (MQ=255) tccatcATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATCCAGCAGGTCGAACGTCCAGTCGGGTCCATCGCTCAAACGTGTGGTGTCCTTATTCATAGAATCGATCGTCGCCATACGCGCACCTCATTGTTGTCGGCGCTCTCTGTGTGGAGCACCTCATTTCAAGCATAGAACACCTGTTAAAAACCGCGTCGCCGGAGAATTTTTTTCTTTGCGATTTCTTATTATCa < 2:383850/289‑1 (MQ=255) ccatcATCTGTTCTGAGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATCCAGCAGGTCGAACGTCCAGTCGGGTCCATCGCTCAAACGTGTGGTGTCCTTATTCATAGAATCGATCGTCGCCATACGCGCACCTCATTGTTGTCGGCGCTCTCTGTGTGGAGCACCTCATTTCAAGCATAGCACACCTGTTAAAAACCTCGGCGCCGGAGAATTTTTTTCTTTGCGATTTCTTATTATCag > 1:1044581/1‑289 (MQ=255) gtcatcTGTTCTGAGATTATCACTTCAATCTCGTGCGGGTAGCTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCAGTCTATCTCTGCCAGATAAGCATCCGGCAGGTCGAACGTCCAGTCGGGTCCATCGCTCAAACGTGTGGTGTCCTTATTCATAGAATCGATCGTCGCCATACGCGCACCTCATTGTTGTCGGCGCTCTCTGTGTGGAGCACCTCATTTCAAGCATAGAACACCTGTTAAAAACCGCGTCGCCGGAGAATTTTTTTCTTTGCGATTTCTTATTATCagag < 2:1302918/288‑1 (MQ=255) ||| CAATGCTACTGGCGTCGGTCCAGCTACGGAATAAGTAATTGTTTTTGAAGAAAGAGTTATGCCCATAGCAGGCATGAGCCATCACCAGCGCTTGCATGGTAATGGTGTTCTCTTCCATCAGGTAAGCGATACACGGGTTAGAGTTAATGACGATTTCATAGGCCAGTCCTTGCTGACCGTGCTTATACAGCCGTTCAGTCTCGATAAACTTTTTACCGAAACTCCAGTGCGGATAGTTAATTGGCATGCCGACGCTGGAGTAGGCATCCATCATCTGTTCACTGGTTATCACTTCAATCTGGTGCGGGTAGGTATCCAGCCGGTAGAGTTTCGCCACCCGGTCTATCTCTGCCAGATAAACATCCAGCAGGTCGAACGTCCAGTCGGGTCCATCGCTCAAACGTGTGGTGTCCTTATTCATAGAATCGATCGTCGCCATACGCGCACCTCATTGTTGTCGGCGCTCTCTGTGTGGAGCACCTCATTTCAAGCATAGAACACCTGTTAAAAACCGCGTCGCCGGAGAATTTTTTTCTTTGCGATTTCTTATTATCAGAGTGC > CP042583/1042598‑1043158 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |