Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 1,459,378 | 3 bp→TCA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 1,459,378 | 0 | A | T | 100.0% | 674.1 / NA | 283 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base T (133/150); total (133/150) | |||||||||||
* | CP042583 | 1,459,379 | 0 | G | C | 99.3% | 667.2 / NA | 283 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/2); new base C (132/147); total (133/150) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.00e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,459,380 | 0 | T | A | 99.3% | 671.4 / NA | 283 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/0); major base A (130/149); minor base C (1/1); total (133/150) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 283 total aligned reads displayed.
GATGGGTTTTGTCCTGCCTGAAGCGGCTCATTAACAGGAGTATAATGATGGATTTTTCTTTAACTGAAGAACAAGAACTGCTGCTGGCCAGTATTCGCGAACTGATTACGACTAACTTTCCGGAAGAGTATTTCCGCACCTGCGATCAAAACGGGACATATCCGCGTGAGTTTATGCGGGCGCTGGCGGATAACGGTATTTCCATGCTTGGCGTGCCGGAAGAATTTGGTGGTATCCCTGCGGATTACGTCACCCAAATGCTGGCGCTGATGGAAGTGAGTAAATGCGGTGCTCCGGCATTTTTAATTACCAACGGTCAATGTATTCACAGTATGCGCCGTTTCGGTTCTGCAGAGCAGCTACGTAAAACGGCAGAGAGCACCCTGGAAACGGGTGATCCCGCCTATGCCCTGGCGTTGACGGAACCAGGTGCTGGCAGTGATAACAACAGTGCCACTACCACTTACACGCGTAAAAACGGCAAGGTCTACATCAACGGACAAAAAACCTTTATTACCGGTGCGAAAGAGTACCCGTATATGCTGGTGCTGGCGCG > CP042583/1459100‑1459655 ||| gATGGGTTTTGTCCTGCCTGAAGCGGCTCATTAACAGGAGTATAATGATGGATTTTTCTTTAACTGAAGAACAAGAACTGCTGCTGGCCAGTATTCGCGAACTGATTACGACTAACTTTCCGGAAGAGTATTTCCGCACCTGCGATCAAAACGGGACATATCCGCGTGAGTTTATGCGGGCGCTGGCGGATAACGGTATTTCCATGCTTGGCGTGCCGGAAGAATTTGGTGGTATCCCTGCGGATTACGTCACCCAAATGCTGGCGCTGATGGGAGTGTCAAAATGCg < 1:1486757/288‑1 (MQ=255) gTCCTGCCTGAAGCGGCTCATTAACAGGAGTATAATGATGGATTTTTCTTTAACTGAAGAACAAGAACTGCTGCTGGCCAGTATTCGCGAACTGATTACGACTAACTTTCCGGAAGAGTATTTCCGCACCTGCGATCAAAACGGGACATATCCGCGTGAGTTTATGCGGGCGCTGGCGGATAACGGTATTTCCATGCTTGGCGTGCCGGAAGAATTTGGTGGTATCCCTGCGGATTACGTCACCCAAATGCTGGCGCTGATGGAAGTGTCAAAATGCGGTGCTCCGGCa < 1:553328/289‑1 (MQ=255) tgcctgAAGAGGCGACTTAACAGGAGTATAATGATGGATTTTTCTTTAACTGAAGAACAAGAACTGCTGCTGGCCAGTATTCGCGAACTGATTACGACTAACTTTCCGGAAGAGTATTTCCGCACCTGCGATCAAAACGGGACATATCCGCGTGAGTTTATGCGGGCGCTGGCGGATAACGGTATTTCCATGCTTGGCGTGCCGGAAGAATTTGGTGGTATCCCTGCGGATTACGTCACCCAAATGCTGGCGCTGATGGAAGTGTCAAAATGCGGTGCTCCGGCAtttt < 2:313381/289‑1 (MQ=255) ggCTCATTAACAGGAGTATAATGATGGATTTTTCTTTAACTGAAGAACAAGAACTGCTGCTGGCCAGTATTCGCGAACTGATTACGACTAACTTTCCGGAAGAGTATTTCCGCACCTGCGATCAAAACGGGACATATCCGCGTGAGTTTATGCGGGCGCTGGCGGATAACGGTATTTCCATGCTTGGCGTGCCGGAAGAATTTGGTGGTATCCCTGCGGATTACGTCACCCAAATGCTGGCGCTGATGGAAGTGTCAAAATGCGGTGCTCCGGCATTTTTAATTAcc < 1:1678421/287‑1 (MQ=255) gCTCATTAACAGGAGTTTTATGATGGATTTTTCTTCAACTGAAGAACAAAAACTGCTGCTGGTCAGCATTCGCGCACAGATTACGACTAACTTTCTGGAAGAGTATTTCCGCAGCTGCGAGCAAAACGGGACATATCCGCGTGAGTTTATGCGGGCGCTGGCGGATAACGGTATTTCCATGCTTGGCGTGCCGGAAGAATTTGGTGGTATCCCTGCGGATTACGTCACCCAAATGCTGGCGCTGATGGAAGTGTCAAAATGCGGTGCTCCGGCATTTTTAATTGCCaa < 2:376464/288‑1 (MQ=255) cTCATTAACAGGAGTATAATGATGGATTTTTCTTTAACTGAAGAACAAGAACTGCTGCTGGCCAGTATTCGCGAACTGATTACGACTAACTTTCCGGAAGAGTATTTCCGCACCTGCGATCAAAACGGGACATATCCGCGTGAGTTTATGCGGGCGCTGGCGGATAACGGTATTTCCATGCTTGGCGTGCCGGAAGAATTTGGTGGTATCCCTGCGGATTACGTCACCCAAATGCTGGCGCTGATGGAAGTGTCAAAATGCGGTGCTCCGGCATTTTTAATTACCAACg > 1:1399890/1‑289 (MQ=255) aTTAGCAGGAGTATAATGATGGATTTTTCTTTGACTGAAGAACAAGAACTGCTGCTGGCCAGTATTCGCGAACTGATTACGACTAACTTTCCGGAAGAGTATTTCCGCACCTGCGATCAAAACGGGACATATCCGCGTGAGTTTATGCGGGCGCTGGCGGATAACGGTATTTCCATGCTTGGCGTGCCGGAAGAATTTGGTGGTATCCCTGCGGATTACGTCACCCAAATGCTGGCGCTGATGGAAGTGTCAAAATGCGGTGCTCCGGCATTTTTAATTACCAACGGTc < 2:831163/289‑1 (MQ=255) aTTAACAGGAGTATAATGATGGATTTTTCTTTAACTGAAGAACAAGAACTGCTGCTGGCCAGTATTCGCGAACTGATTACGACTAACTTTCCGGAAGAGTATTTCCGCACCTGCGATCAAAACGGGACATATCCGCGTGAGTTTATGCGGGCGCTGGTGGATAACGGTATTTCCATGCTTGGCGTGCCGGAAGAATTTGGTGGTATCCCTGCGGATTACGTCACCCAAATGCTGGCGCTGATGGAAGTGTCAAAATGCGGTGCTCCGGCATTTTTAATTACCAACGGTc < 1:1758084/289‑1 (MQ=255) aTTAACAGGAGTATAATGATGGATTTTTCTTTAACTGAAGAACAAGAACTGCTGCTGGCCAGTATTCGCGAACTGATTACGACTAACTTTCCGGAAGAGTATTTCCGCACCTGCGATCAAAACGGGACATATCCGCGTGAGTTTATGCGGGCGCTGGCGGATAACGGTATTTCCATGCTTGGCGTGCCGGAAGAATTTGGTGGTATCCCTGCGGATTACGTCACCCAAATGCTGGCGCTGATGGAAGTGTCAAAATGCGGTGCTCCGGCATTTTTAATTACCAACGGTc < 1:1300608/289‑1 (MQ=255) aTTAACAGGAGTATAATGATGGATTTTTCTTTAACTGAAGAACAAGAACTGCTGCTGGCCAGTATTCGCGAACTGATTACGACTAACTTTCCGGAAGAGTATTTCCGCACCTGCGATCAAAACGGGACATATCCGCGTGAGTTTATGCGGGCGCTGGCGGATAACGGTATTTCCATGCTTGGCGTGCCGGAAGAATTTGGTGGTATCCCTGCGGATTACGTCACCCAAATGCTGGCGCTGATGGAAGTGTCAAAATGCGGTGCTCCGGCATTTTTAATTACCAACGGTc < 1:1318445/289‑1 (MQ=255) tAACAGGGGTATAATGATGGATTTTCCTTTAACTGAAGAACAAGAACTGCTGCTGTCCAGTATTCGCGAACTGATTACGACTAACTTTCCGGAAGAGTATTTCCGCACCTGCGATCAAAACGGGACATATCCGCGTGAGTTTATGCGGGCGCTGGCGGATAACGGTATTTCCATGCTTGGCGTGCCGGAAGAAGTTGATGGGATCCCTGCGGATTACGTCACCCAAATGCTGGCGCTGATGGAAGTGTCAAAATGCGGTGTTCCGGCATTTTTAATTACCAACGGTCaa < 2:676818/289‑1 (MQ=255) aaCAGGAGTATAATGATGGATTTTTCTTTAACTGAAGAACAAGAACTGCTGCTGGCCAGTATTCGCGAACTGATTACGACTAACTTTCCGGAAGAGTATTTCCGCACCTGCGATCAAAACGGGACATATCCGCGTGAGTTTATGCGGGCGCTGGCGGATAACGGTATTTCCATGCTTGGCGTGCCGGAAGAATTTGGTGGTATCCCTGCGGATTACGTCACCCAAATGCTGGCGCTGATGGAAGTGTCAAAATGCGGTGCTCCGGCATTTTTAATTACCAACGGTCAAt < 1:90040/289‑1 (MQ=255) ggAGTATAATGATGGATTTTTCTTTAACTGAAGAACAAGAACTGCTGCTGGCCAGTATTCGCGAACTGATTACGACTAACTTTCCGGAAGAGTATTTCCGCACCTGCGATCAAAACGGGACATATCCGCGTGAGTTTATGCGGGCGCTGGCGGATAACGGTATTTCCATGCTTGGCGTGCCGGAAGAATTTGGTGGTATCCCTGCGGATTACGTCACCCAAATGCTGGCGCTGATGGAAGTGTCAAAATGCGGTGCTCCGGCATTTTTAATTACCAACGGTCAATGTAt > 2:1307418/1‑289 (MQ=255) ggAGTATAATGATGGATTTTTCTTTAACTGAAGAACAAGAACTGCTGCTGGCCAGTATTCGCGAACTGATTACGACTAACTTTCCGGAAGAGTATTTCCGCACCTGCGATCAAAACGGGACATATCCGCGTGAGTTTATGCGGGCGCTGGCGGATAACGGTATTTCCATGCTTGGCGTGCCGGAAGAATTTGGTGGTATCCCTGCGGATTACGTCACCCAAATGCTGGCGCTGATGGAAGTGTCAAAATGCGGTGCTCCGGCATTTTTAATTACCAACGGTCAATGTAt > 1:688163/1‑289 (MQ=255) gTATAATGATGGATTTTTCTTTAACTGAAGAACAAGAACTGCTGCTGGCCAGTATTCGCGAACTGATTACGACTAACTTTCCGGAAGAGTATTTCCGCACCTGCGATCAAAACGGGACATATCCGCGTGAGTTTATGCGGGCGCTGGCGGATAACGGTATTTCCATGCTTGGCGTGCCGGAAGAATTTGGTGGTATCCCTGCGGATTACGTCACCCAAATGCTGGCGCTGATGGAAGTGTCAAAATGCGGTGCTCCGGCATTTTTAATTACCAACGGTCAATGTATTc > 1:829981/1‑288 (MQ=255) gTATAATGATGGATTTTTCTTTAACTGAAGAACAAGAACTGCTGCTGGCCAGTATTCGCGAACTGATTACGACTAACTTTCCGGAAGAGTATTTCCGCACCTGCGATCAAAACGGGACATATCCGCGTGAGTTTATGCGGGCGCTGGCGGATAACGGTATTTCCATGCTTGGCGTGCCGGAAGAATTTGGTGGTATCCCTGCGGATTACGTCACCCAAATGCTGGCGCTGATGGAAGTGTCAAAATGCGGTGCTCCGGCATTTTTAATTACCAACGGTCAATGTATTc > 1:317009/1‑288 (MQ=255) attaaaagttgGAGTTTTCTTTAACTGAAGAACAAAAACTGAGGCTGGCAGGTATTCGCGAACTGATTACGACGAACTTTCCGGAAGAGTATTTCCGCACCTGCGATCAAAACGGGACATATCCGCGTGAGTTTATGCGGGCGCTGGCGGATAACGGTATTTCCATGCTTGGCGTGCCGGAAGAATTTGGTGGTATCCCTGCGGATTACGTCACCCAAATGCTGGCGCTGATGGAAGTGTCAAAATGCGGTGCTCCGGCATTTTTAATTACCAACGGTCAATGTATTc < 2:1246295/279‑1 (MQ=255) ataATGATGGATTTTTCTTTAACTGAAGAACAAGAACTGCTGCTGGCCAGTATTCGCGAACTGATTACGACTAACTTTCCGGAAGAGTATTTCCGCACCTGCGATCAAAACGGGACATATCCGCGTGAGTTTATGCGGGCGCTGGCGGATAACGGTATTTCCATGCTTGGCGTGCCGGAAGAATTTGGTGGTATCCCTGCGGATTACGTCACCCAAATGCTGGCGCTGATGGAAGTGTCAAAATGCGGTGCTCCGGCATTTTTAATTACCAACGGTCAATGTATTca < 1:958214/287‑1 (MQ=255) tgGATTTTTCTTTAACTGAAGAACAAGAACTGCTGCTGGCCAGTATTCGCGAACTGATTACGACTAACTTTCCGGAAGAGTATTTCCGCACCTGCGATCAAAACGGGACATATCCGCGTGAGTTTATGCGGGCGCTGGCGGATAACGGTATTTCCATGCTTGGCGTGCCGGAAGAATTTGGTGGTATCCCTGCGGATTACGTCACCCAAATGCTGGCGCTGATGGAAGTGTCAAAATTCGGTGCTCCGGCATTTTTAATACCCAACGGTCAAGTTATCCACAGAATgc > 2:1548878/1‑288 (MQ=255) gATTTTTCTTTAACTGAAGAACAAGAACTGCTGCTGGCCAGTATTCGCGAACTGATTACGACTAACTTTCCGGAAGAGTATTTCCGCACCTGCGATCAAAACGGGACATATCCGCGTGAGTTTATGCGGGCGCTGGCGGATAACGGTATTTCCATGCTTGGCGTGCCGGAAGAATTTGGTGGTATCCCTGCGGATTACGTCACCCAAATGCTGGCGCTGATGGAAGTGTCAAAATGCGGTGCTCCGGCATTTTTAATTACCAACGGTCAAt < 1:1551739/271‑1 (MQ=255) gATTTTTCTTTAACTGAAGAACAAGAACTGCTGCTGGCCAGTATTCGCGAACTGATTACGACTAACTTTCCGGAAGAGTATTTCCGCACCTGCGATCAAAACGGGACATATCCGCGTGAGTTTATGCGGGCGCTGGCGGATAACGGTATTTCCATGCTTGGCGTGCCGGAAGAATTTGGTGGTATCCCTGCGGATTACGTCACCCAAATGCTGGCGCTGATGGAAGTGTCAAAATGCGGTGCTCCGGCATTTTTAATTACCAACGGTCAATGTATTCACAGTATGCGcc > 1:122344/1‑289 (MQ=255) cTTTAACTGAAGAACAAGAACTGCTGCTGGCCAGTATTCGCGAACTGATTACGACTAACTTTCCGGAAGAGTATTTCCGCACCTGCGATCAAAACGGGACATATCCGCGTGAGTTTATGCGGGCGCTGGCGGATAACGGTATTTCCATGCTTGGCGTGCCGGAAGAATTTGGTGGTATCCCTGCGGATTACGTCACCCAAATGCTGGCGCTGATGGAAGTGTCAAAATGCGGTGCTCCGGCATTTTTAATTACCAACGGTCAATGTATTCACAGTATGCGCCGTTTCgg < 1:1038946/289‑1 (MQ=255) tAACTGAAGAACAAGAACTGCTGCTGGCCAGTATTCGCGAACTGATTACGACTAACTTTCCGGAAGAGTATTTCCGCACCTGCGATCAAAACGGGACATATCCGCGTGAGTTTATGCGGGCGCTGGCGGATAACGGTATTTCCATGCTTGGCGTGCCGGAAGAATTTGGTGGTATCCCTGCGGATTACGTCACCCAAATGCTGGCGCTGATGGAAGTTTCAAAATGCGGTGCTCCGGCATTTTTAATTACCAACGGTCACTGTATTCACAGTATGCCCCGTTTCgtt > 2:496404/1‑285 (MQ=255) aCTGAAGAACAAGAACTGCTTCTGGCCAGTATTCGCGAACTGATTACGACTAACTTTCCGGAAGAGTATTTCCGCACCTGCGATCAAAACGGGACATATCCGCGTGAGTTTATGCGGGCGCTGGCGGATAACGGTATTTCCATGCTTGGCGTGCCGGAAGAATTTGGTGGTATCCCTGCGGATTACGTCACCCAAATGCTGGCGCTGATGGAAGTGTCAAAATGCGGTGCTCCGGCATTTTTAATTACCAACGGTCAATGTATTCACAGTATGCGCCGTTTCGGTTCTg < 2:922772/289‑1 (MQ=255) aagaacaagaacTGCTGCTGGCCAGTATTCGCGAACTGATTACGACTAACTTTCCGGAAGAGTATTTCCGCACCTGCGATCAAAACGGGACATATCCGCGTGAGTTTATGCGGGCGCTGGCGGATAACGGTATTTCCATGCTTGGCGTGCCGGAAGAATTTGGTGGTATCCCTGCGGATTACGTCACTCAAATGCTGGCGATGATGGAAGTGTCAAAATGCGGTGCTCCGGCATTTTTAATTACCAACGGTCAATGTATTCACAGTATGCGCCGTTTCGGTTCTGCaga > 1:1200340/1‑289 (MQ=255) aagaacaagaacTGCTGCTGGCCAGTATTCGCGAACTGATTACGACTAACTTTCCGGAAGAGTATTTCCGCACCTGCGATCAAAACGGGACATATCCGCGTGAGTTTATGCGGGCGCTGGCGGATAACGGTATTTCCATGCTTGGCGTGCCGGAAGAATTTGGTGGTATCCCTGCGGATTACGTCACCCAACTGCTGGCGCTGATGGAAGTGTCAAAATGCGGTGCCCCGGCATTTTTACTTACCAACGGTCAATGTATCCACAGTATTCCCCATTTCGGTTCTTCag > 2:1836656/1‑288 (MQ=255) aagaacaagaacTGCTGCTGGCCAGTATTCGCGAACTGATTACGACTAACTTTCCGGAAGAGTATTTCCGCACCTGCGATCAAAACGGGACATATCCGCGTGAGTTTATGCGGGCGCTGGCGGATAACGGTATTTCCATGCTTGGCGTGCCGGAAGAATTTGGTGGTATCCCTGCGGATTACGTCACCCAAATGCTGGCGCTGATGGAAGTGTCAAAATGCGGTGCTCCGGCATTTTTAATTACCAACGGTCAATGTATTCACAGTATGCGCCGTTTCGGTTCTGCaga > 2:532721/1‑289 (MQ=255) agaacTGCTGCTGGCCAGTATTCGCGAACTGATTACGACTAACTTTCCGGAAGAGTATTTCCGCACCTGCGATCAAAACGGGACATATCCGCGTGAGTTTATGCGGGCGCTGGCGGATAACGGTATTTCCATGCTTGGCGTGCCGGAAGAATTTGGTGGTATCCCTGCGGATTACGTCACCCAAATGCTGGCGCTGATGGAAGTGTCAAAATGCGGTGCTCCGGCATTTTTAATTACCAACGGTCAACGTATTCACAGTATGCGCCGTTTCGGTTCCGCAGagcagcca > 2:1950932/1‑287 (MQ=255) tgctgctgGCCAGTATTCGCGAACTGATTACGACTAACTTTCCGGAAGAGTATTTCCGCACCTGCGATCAAAACGGGACATATCCGCGTGAGTTTATGCGGGAGCTGGCGGATAACGGTATTTCCATGCTTGGCGTGCCGGAAGAATTTGGTGGTATCCCTGCGGATTACGTCACCCAAATGCTGGCGCTGATGGAAGTGTCAAAATGAGGTGCTCCGGCATTTTTAATTACCAACGGTCAATGTATTCACAGTATGCGCCGTTTCGGTTCTGCAGAGCAGCTACGTaa > 1:655/1‑289 (MQ=255) ctgctgGCCAGTATTCGCGAACTGATTACGACTAACTTTCCGGAAGAGTATTTCCGCACCTGCGATCAAAACGGGACATATCCGCGTGAGTTTATGCGGGCGCTGGCGGATAACGGTATTTCCATGCTTGGCGTGCCGGAAGAATTTGGTGGTATCCCTGCGGATTACGTCACCCAAATGCTGGCGCTGATGGAAGTGTCAAAATGCGGTGCTCCGGCATTTTTAATTACCAACGGTCAATGTATTCACAGTATGCGCCGTTTCGGTTCTGCAGAGCAGCTACGTaaa < 1:756889/288‑1 (MQ=255) tgcgagCCAGGATTCGCGACATGATTACGACCAACTTTCCGGAAGAGTATTTCCGAACCTGCGATCAAAACGGGACATATCCGCGTGAGTTTATGCGGGCGCTGGCGGATAACGGTATTTCCATGCTTGGCGTGCCGGAAGAATTTGGTGGTATCCCTGCGGATTACGTCACCCAAATGCTGGCGCTGATGGAAGTGTCAAAATGCGGTGCTCCGGCATTTTTAATTACCAACGGTCAATGTATTCACAGTATGCGCCGTTTCGGTTCTGCAGAGCAGCTACGTaaaa < 2:1709261/283‑1 (MQ=255) 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tATTCGCGAACTGATTACGACTAACTTTCCGGAAGAGTATTTCCGCACCTGCGATCAAAACGGGACATATCCGCGTGAGTTTATGCGGGCGCTGGCGGATAACGGTATTTCCATGCTTGGCGTGCCGGAAGAATTTGGTGGTATCCCTGCGGATTACGTCACCCAAATGCTGGCGCTGATGGAAGTGTCAAAATGCGGTGCTCCGGCATTTTTAATTACCAACGGTCAATGTATTCACAGTATGCGCCGTTTCGGTTCTGCAGAGCAGCTACGTAAAACGGCAGAGAGc > 1:8090/1‑289 (MQ=255) aTTCGCGAACTGATTACGACTAACTTTCCGGAAGAGTATTTCCGCACCTGCGATCAAAACGGGACATATCCGCGTGAGTTTATGCGGGCGCTGGCGGATAACGGTATTTCCATGCTTGGCGTGCCGGAAGAATTTGGTGGTATCCCTGCGGATTACGTCACCCAAATGCTGGCGCTGATGGAAGTGTCAAAATGCGGTGCTCCGGCATTTTTAATTACCAACGGTCAATGTATTCACAGTATGCGCCGTTTCGGTTCTGCAGAGCAGCTACGTAAAACGGCagagag < 2:1537511/287‑1 (MQ=255) tCGCGAACTGATTACGACTAACTTTCCGGAAGAGTATTTCCGCACCTGCGATCAAAACGGGACATATCCGCGTGAGTTTATGCGGGCGCTGGCGGATAACGGTATTTCCATGCTTGGCGTGCCGGAAGAATTTGGTGGTATCCCTGCGGATTACGTCACCCAAATGCTGGCGCTGATGGAAGTGTCAAAATGCGGTGCTCCGGCATTTTTAATTACCAACGGTCAATGTATTCACAGTATGCGCCGTTTCGGTTCTGCAGAGCAGCTACGTAAAACGGCAGAGAGCAcc < 2:1821504/289‑1 (MQ=255) gcgACCCGATTCCGACTAACATTCCGGAAGAGTATTTCCCCACCTCCGATCAAAACGGGACATATCCGCGTGAGTTTATGCGGGCGCTGGCGGATAACGGTATTTCCATGCTTGGCGTGCCGGAAGAATTTGGTGGTATCCCTGCGGATTACGTCACCCAAATGCTGGCGCTGATGGAAGTGTCAAAATGCGGTGCTCCGGCATTTTTAATTACCAACGGTCAATGTATTCACAGTATGCGCCGTTTCGGTTCTGCAGAGCAGCTACGTAAAACGGCAGAGAGCACCCt < 2:69082/289‑1 (MQ=255) cTGATTACGACTAACTTTCCGGAAGAGTATTTCCGCACCTGCGATCAAAACGGGACATATCCGCGTGAGTTTATGCGGGCGCTGGCGGATAACGGTATTTCCATGCTTGGCGTGCCGGAAGAATTTGGTGGTATCCCTGCGGATTACGTCACCCAAATGCTGGCGCTGATGGAAGTGTCAAAATGCGGTTCTCCGGCATTTTTAATTACCAACGGTCAATGTATTCACAGTATGCGCCGTTTCGGTTCTTCAGACGCGTTTAGTAAAACGGCagagaagacctgcccct > 2:1645206/1‑277 (MQ=255) aTTACGACTAACTTTCCGGAAGAGTATTTCCGCACCTGCGATCAAAACGGGACATATCCGCGTGAGTTTATGCGGGCGCTGGCGGATAACGGTATTTCCATGCTTGGCGTGCCGGAAGAATTTGGTGGTATCCCTGCGGATTACGTCACCCAAATGCTGGCGCTGATGGAAGTGTCAAAATGCGGTGCTCCGGCATTTTTAATTACCAACGGTCAATGTATTCACAGTATGCGCCGTTTCGGTTCTGCAGAGCAGCTACGTAAAACGGCAGAGAGCACCCTGGAAACgg > 2:761743/1‑289 (MQ=255) 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cACCCAAATGCTGGCGCTGATGGAAGTGTCAAAATGCGGTGCTCCGGCATTTTTAATTACCAACGGTCAATGTATTCACAGTATGCGCCGTTTCGGTTCTGCAGAGCAGCTACGTAAAACGGCAGAGAGCACCCTGGAAACGGGTGATCCCGCCTATGCCCTGGCGTTGACGGAACCAGGTGCTGGCTCAGATAACAACAGTGCCACTACCACTTACACGCGTAAAAACGGCAAGGTCTACATCAACGGACAAAAAACCTTTATTACCGGTGCGAAAGAGTACCCGta < 1:1729471/288‑1 (MQ=255) gATGGAAGTGTCAAAATGCGGTGCTCCGGCATTTTTAATTACCAACGGTCAATGTATTCACAGTATGCGCCGTTTCGGTTCTGCAGAGCAGCTACGTAAAACGGCa < 2:1322167/106‑1 (MQ=255) ||| GATGGGTTTTGTCCTGCCTGAAGCGGCTCATTAACAGGAGTATAATGATGGATTTTTCTTTAACTGAAGAACAAGAACTGCTGCTGGCCAGTATTCGCGAACTGATTACGACTAACTTTCCGGAAGAGTATTTCCGCACCTGCGATCAAAACGGGACATATCCGCGTGAGTTTATGCGGGCGCTGGCGGATAACGGTATTTCCATGCTTGGCGTGCCGGAAGAATTTGGTGGTATCCCTGCGGATTACGTCACCCAAATGCTGGCGCTGATGGAAGTGAGTAAATGCGGTGCTCCGGCATTTTTAATTACCAACGGTCAATGTATTCACAGTATGCGCCGTTTCGGTTCTGCAGAGCAGCTACGTAAAACGGCAGAGAGCACCCTGGAAACGGGTGATCCCGCCTATGCCCTGGCGTTGACGGAACCAGGTGCTGGCAGTGATAACAACAGTGCCACTACCACTTACACGCGTAAAAACGGCAAGGTCTACATCAACGGACAAAAAACCTTTATTACCGGTGCGAAAGAGTACCCGTATATGCTGGTGCTGGCGCG > CP042583/1459100‑1459655 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |