| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP042583 | 1,494,181 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP042583 | 1,494,181 | 0 | A | T | 99.2% | 615.8 / NA | 265 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/1); major base T (125/137); minor base C (1/1); total (126/139) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| * | CP042583 | 1,494,182 | 0 | G | C | 98.9% | 609.2 / NA | 265 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/3); new base C (126/134); total (126/139) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.48e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.97e-01 | |||||||||||
| * | CP042583 | 1,494,183 | 0 | C | G | 99.6% | 620.7 / NA | 265 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); new base G (125/138); total (126/139) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
Only 100 of 265 total aligned reads displayed.
ACCATTGGTCAGAACGGCTGCGCCGGTTTGTATCCGGCAATGCTGGCGGTGATGGTTGCGCCTACGGTTGGCATTAACCCGCTGGACCCGATGTGGATTGCGACGCTGGTCGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTGATTGTACT‑GCCTGCGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGGCAGCATGACAGC‑TGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCTGGATAGCGAAGACGACGCCGAACTGGCAC‑ACCATTAATTCTTATGCTGGCAACGGTCCGTTTTGT‑ATAGGGGCCGTTGCCTTACTTTTTAAATGTTCCATCGCGGCGATGCATACACTCTCATATTTAAACAGATCGTCAGCGAAAAAAATGTCCAACTTATCAATACATTCCTGGCTCAAACTATGTGCCTGTAGGCTGAAGCTTAAAACCTCATACCCGAG > CP042583/1493902‑1494462 ||| cTGCGCCGGTTTGTATCCGGCAATGCTGGCGGTGATGGTTGCGCCTACGGTTGGCGTTAACCCGCTGGACCCGATGTGGATTGCGACGCTGGTCGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTGATTGTACT‑GCCTGCGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGGCTCGATGACAGC‑TGGCCCGCTGAccag > 1:548363/1‑288 (MQ=255) cTGCGCCGGTTTGTATCCGGCAATGCTGGCGGTGATGGTTGCGCCTACGGTTGGCATTAACCCGCTGGACCCGATGTGGATTGCGACGCTGGTCGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTGATTGTACT‑GCCTGCGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGGCTCGATGACAGC‑TGGCACGCTGAccag > 1:665626/1‑288 (MQ=255) ggCAATGCTGGCGGTGATGGTTGCGCCTACGGTTGGCATTAACCCGCTGGACCCGATGTGGATTGCGACGCTGGTCGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTGATTGTACT‑GCCTGCGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGGCTCGATGACAGC‑TGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCACAcc > 1:166312/1‑289 (MQ=255) gCAATGCTGGCGGTGATGGTTGCGCCTACGGTTGGCATTAACCCGCTGGACCCGATGTGGATTGCGACGCTGGTCGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTGATTGTACT‑GCCTGCGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGGCTCGATGACAGC‑TGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCg > 1:1629794/1‑289 (MQ=255) aaTGCTGGCGGTGTTGGTTCCGCCTCGGGTTGGCATTACCCCGCTGGACCCGATGTGGATTGCGCGGCTGGTCGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTGATTGTACT‑GCCTGCGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGGCTCGATGACAGC‑TGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGa < 2:665626/288‑1 (MQ=255) tGCTGGCGGTGATGGTTGCGCCTACGGTTGGCATTAACCCGCTGGACCCGATGTGGATTGCGACGCTGGTCGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTGATTGTACT‑GCCTGCGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGGTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGGCTCGATGACAGC‑TGGCACGCTTACCAGCCAGGGGCTGAATCAAACCGaaaa > 2:943159/1‑289 (MQ=255) cTGGCGGTGATGGTTGCGCCTACGGTTGGCATTAACCCGCTGGACCCGATGTGGATTGCGACGCTGGTCGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTGATTGTACT‑GCCTGCGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGGCTCGATGACAGC‑TGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAg > 1:1495296/1‑289 (MQ=255) tGGCGGTGATGGTTGCGCCTACGGTTGGCATTAACCCGCTGGACCCGATGTGGATTGCGACGCTGGTCGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTGATTGTACT‑GCCTGCGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGGCTCGATGACAGC‑TGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAg < 2:198010/288‑1 (MQ=255) tGGCGGTGATGGTTGCGCCTACGGTTGGCATTAACCCGCTGGACCCGATGTGGATTGCGACGCTGGTCGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTGATTGTACT‑GCCTGCGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGGCTCGATGACAGC‑TGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAg < 1:633643/288‑1 (MQ=255) ggTGATGGTTGCGCCTACGGTTGGCATTAACCCGCTGGACCCGATGTGGATTGCGACGCTGGTCGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTGATTGTACT‑GCCTGCGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTGGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGGCCCGAAGACAGCACGGCCCG‑TGCCCAACCAGTGGCGGAAGCAAACCGATAAAGACag > 2:864363/1‑287 (MQ=255) gATGGTTGCGCCTACGGTTGGCATTAACCCGCTGGACCCGATGTGGATTGCGACGCTGGTCGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTGATTGTACT‑GCCTGCGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGGCTCGATGACAGC‑TGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCt < 2:1327862/288‑1 (MQ=255) aTGGTTGCGCCTACGGTTGGCATTAACCCGCTGGACCCGATGTGGATTGCGACGCTGGTCGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTGATTGTACT‑GCCTGCGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGGCTCGATGACAGC‑TGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCCgg > 1:839560/1‑289 (MQ=255) tGGTTGGGCCTGCGGTTTGCCATACCCCGCTGGGCCCGATGTGTGTTGCGACGATGGTCGGTATTGTTACCGGTAGGCCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTGATTGTACT‑GCCTGCGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGGCTCGATGACAGC‑TGGCACGCTGCCCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCAGTCTgg < 2:435126/288‑1 (MQ=255) tGGTTGCGCCTTCGGTTGGCATTAACCCGCTGGACCCGATGTGGATTGCGACGCTGGTCGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTGATTGTACT‑GCCTGCGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGGCTCGATGACAGC‑TGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCTgg < 1:1896182/288‑1 (MQ=255) gcgcCTACGGTTGGCATTAACCCGCTGGACCCGATGTGGATTGCGACGCTGGTCGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTGATTGTACT‑GCCTGCGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTGATCGACATGGTCCGTACGGCGTTCAACGTTATCGGCTCGATGACAGC‑TGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGACTCCACCCGATAAAGCACTTCAGGATAGCg > 2:1259423/1‑289 (MQ=255) gtACTGTTGGCATTACCCCGCTGGACGCGATGTGGTTTGCGACGCTGGTCGGGATTGTTACCGTTAGTTCCGAGGGCGTGGCCGGTGTCGTTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTGCTTGTACT‑GCCTGCGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGGCTCGATGACAGC‑TGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCTGGATAGCGAAga < 2:788774/288‑1 (MQ=255) cGGTTGGCATTAACCCGCTGGACCCGATGTGGATTGCGACGCTGGTCGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTGATTGTACT‑GCCTGCGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGGCTCGATGACAGC‑TGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCTGGATAGCGAAgacga < 1:1344444/289‑1 (MQ=255) gTTGGCATTAACCCGCTGGACCCGATGTGGATTGCGACGCTGGTCGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTGATTGTACT‑GCCTGCGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGGCTCGATGACAGC‑TGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCTGGATAGCGAAgacgac < 2:1373650/288‑1 (MQ=255) cTGGACCCGATGTGGATTGCGACGCTGGTCGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTGATTGTACT‑GCCTGCGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGGCTCGATGACAGC‑TGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCTGGATAGCGAAGACGACGCCGAACTGGCAC‑Acc > 1:570117/1‑289 (MQ=255) ggACCCGATGTGGATTGCGACGCTGGTCGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTGATTGTACT‑GCCTGCGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGGCTCGATGACAGC‑TGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCTGGATAGCGAAGACGACGCCGAACTGGCAC‑ACCAt < 1:810599/289‑1 (MQ=255) accggttgtgGTTTGCGACGCTGGTGGGTGTTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGGGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTGATTGTACT‑GCCTGCGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGGCTCGATGACAGC‑TGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCTGGATAGCGAAGACGACGCCGAACTGGCAC‑ACCAtt < 2:1945901/282‑1 (MQ=255) acccgtgttgGATTGCGGGGGTGGTCGGTTTTGTGACCGTTGGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTGATTGTACT‑GCCTGCGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGGCTCGATGACAGC‑TGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCTGGATAGCGAAGACGACGCCGAACTGGCAC‑ACCAtt < 2:1707146/280‑1 (MQ=255) aCCCGGTGTGGATTGCGACGCTGGTCGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTGATTGTACT‑GCCTGCGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGTGTTAAACGTTAGTGGCTCGATGACAGC‑TGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCTGGATAGCGAAGACGACGGCGAACTGGCAC‑ACCAtt < 1:1162968/288‑1 (MQ=255) cGACGCTGGTCGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTGATTGTACT‑GCCTGCGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGGCTCGATGACAGC‑TGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCTGGATAGCGAAGACGACGCCGAACTGGCAC‑CACATTAATTCTTATGCTTGCa > 2:1399958/1‑289 (MQ=255) tGGTCGGTATTGTTACCGTTGGTTCCGCGGCCGTTGCCGTTGTGGGTGGTGGTGAAACTTTCGCCGCACTGATTGTACT‑GCCTGGGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGGCTCGATGACAGC‑TGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCTGGATAGCGAAGACGACGCCGAACTGGCAC‑ACCATTAATTCTTATGCTGGCAACGGt < 2:487491/288‑1 (MQ=255) 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cGTTAAACGTTAGTGGCTCGATGACAGC‑TGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCTGGATAGCGAAGACGACGCCGAACTGGCAC‑ACCATTAATTCTTATGCTGGCAACGGTCCGTTTTGT‑ATAGGGGCCGTTGCCTTACTTTTTAAATGTTCCATCGCGGCGATGCATACTGACTCATATTTAAACAGATCGTCAGCGAAAAAAATGTCCAACTTATCAATACATTCCTGGCTCAATGAATGTGCCTGTAGCGAGAAGCTTAAAAcc > 2:1551429/1‑288 (MQ=255) gTTAAACGTTAGTGGCTCGATGACAGC‑TGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCTGGATAGCGAAGACGACGCCGAACTGGCAC‑ACCATTAATTCTTATGCTGGCAACGGTCCGTTTTGT‑ATAGGGGCCGTTGCCTTACTTTTTAAATGTTCCATCGCGGCGATGCATACTGACTCATATTTAAACAGATCGTCAGCGAAAAAAATGTCCAACTTATCAATACATTCCTGGCTCAATGAATGTGCCTGTAGCGAGAAGCTTAAAACCTc > 2:84273/1‑289 (MQ=255) aaCGTTAGTGGCTCGATGACAGC‑TGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCTGGATAGCGAAGACGACGCCGAACTGGCAC‑ACCATTAATTCTTATGCTGGCAACGGTCCGTTTTGT‑ATAGGGGCCGTTGCCTTACTTTTTAAATGTTCCATCGCGGCGATGCATACTGACTCATATTTAAACAGATCGTCAGCGAAAAAAATGTCCAACTTATCAATATATTCCTGGCTCAATGAATGTGCCTGTAGCGAGAAGCTTAAAACCTCATa > 1:1097348/1‑288 (MQ=255) aaCGTTAGTGGCTCGATGACAGC‑TGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCTGGATAGCGAAGACGACGCCGAACTGGCAC‑ACCATTAATTCTTATGCTGGCAACGGTCCGTTTTGT‑ATAGGGGCCGTTGCCTTACTTTTTAAATGTTCCATCGCGGCGATGCATACTGACTCATATTTAAACAGATCGTCAGCGAAAAAAATGTCCAACTTATCAATACATTCCTGGCTCAATGAATGTGCCTGTAGCGAGAAGCTTAAAACCTCATa > 2:516223/1‑288 (MQ=255) tAGTGGCTCGATGACAGC‑TGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCTGGATAGCGAAGACGACGCCGAACTGGCAC‑ACCATTAATTCTTATGCTGGCAACGGTCCGTTTTGT‑ATAGGGGCCGTTGCCTTACTTTTTAAATGTTCCATCGCGGCGATGCATACTGACTCATATTTAAACAGATCGTCAGCGAAAAAAATGTCCaa > 1:380667/1‑223 (MQ=255) tAGTGGCTCGATGACAGC‑TGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCTGGATAGCGAAGACGACGCCGAACTGGCAC‑ACCATTAATTCTTATGCTGGCAACGGTCCGTTTTGT‑ATAGGGGCCGTTGCCTTACTTTTTAAATGTTCCATCGCGGCGATGCATACTGACTCATATTTAAACAGATCGTCAGCGAAAAAAATGTCCAACTTATCAATACATTCCTGGCTCaatgaa < 1:297625/251‑5 (MQ=255) ||| ACCATTGGTCAGAACGGCTGCGCCGGTTTGTATCCGGCAATGCTGGCGGTGATGGTTGCGCCTACGGTTGGCATTAACCCGCTGGACCCGATGTGGATTGCGACGCTGGTCGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTGATTGTACT‑GCCTGCGATGGGCCTGCCAGTAACCCTGGTGGCGCTGTTAATCTCCGTTGAACCGCTTATCGACATGGGCCGTACGGCGTTAAACGTTAGTGGCAGCATGACAGC‑TGGCACGCTGACCAGCCAGTGGCTGAAGCAAACCGATAAAGCCATTCTGGATAGCGAAGACGACGCCGAACTGGCAC‑ACCATTAATTCTTATGCTGGCAACGGTCCGTTTTGT‑ATAGGGGCCGTTGCCTTACTTTTTAAATGTTCCATCGCGGCGATGCATACACTCTCATATTTAAACAGATCGTCAGCGAAAAAAATGTCCAACTTATCAATACATTCCTGGCTCAAACTATGTGCCTGTAGGCTGAAGCTTAAAACCTCATACCCGAG > CP042583/1493902‑1494462 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |