| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP042583 | 489,266 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP042583 | 489,266 | 0 | A | T | 97.7% | 597.4 / NA | 265 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (2/1); major base T (113/141); minor base C (6/0); total (122/143) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.57e-03 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| * | CP042583 | 489,267 | 0 | G | C | 100.0% | 623.9 / NA | 265 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base C (122/143); total (122/143) | |||||||||||
| * | CP042583 | 489,268 | 0 | C | G | 99.6% | 623.0 / NA | 265 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base G (121/143); total (122/143) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.60e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 265 total aligned reads displayed.
CGCGGATCCGGCGCTGTTGTGCGGCGATGTCGATATTATGCTGCCAGGTGAGTATGCGCAGCTGGCGCAGCTCAACGCCACTCAGGTTGAGATTCCAGAAACCACGCTTAGCGCGCTGGTGGCAGAA‑CAAGCGGCAAAAACACCGGATGCTCCGGCGCTGGCAGATGCGCGTTACCTGTTCAGCTATCGGGAAATGCGCGAGCAGGTGGTGGCGCTGGCGAATCTGCTGCGTGAGCGCGGCGTTAAACCAGGGGACAGCGTGGCGGTGGCACTACCGCGCAGCGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGAAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGCTGGAAGATGCGCGTCCGAGCCTGTTAATTACCACCGACGATCAACTGCCGCGCTTTAGCGATGTTCCCAATTTAACAAGCCTTTGCTATAACGCCCCGCTTACACCGCAGGGCAGTGCGCCGCTGCAACTTAGTCAACCGCATCACACGGCTTATAT‑CATCTTTACCTCTGGCTCCACCGGC > CP042583/488986‑489547 ||| aTCCGGCGCTGTTGTGCGGCGATGTCGATATTATGCTGCCAGGTGAGTATGCGCAGCTGGCGCAGCTCAACGCCACTCAGGTTGAGATTCCAGAAACCACGCTTAGCGCGCTGGTGGCAGAA‑CAAGCGGCAAAAACACCGGATGCTCCGGCGCTGGCAGATGCGCGTTACCTGTTCAGCTATCGGGAAATGCGCGAGCAGGTGGTGGCGCTGGCGAATCTGCTGCGTGAGCGCGGCGTTAAACCAGGGGACAGCGTGGCGGTGGCACTACCGCGCTCGGTCTTTTTGa > 1:515965/1‑288 (MQ=255) gcgcTGTTGTGCGGCGATGTCGATATTATGCTGCCAGGTGAGTATGCGCAGCTGGCGCAGCTCAACGCCACTCAGGTTGAGATTCCAGAAACCACGCTTAGCGCGCTGGTGGCAGAA‑CAAGCGGCAAAAACACCGGATGCTCCGGCGCTGGCAGATGCGCGTTACCTGTTCAGCTATCGGGAAATGCGCGAGCAGGTGGTGGCGCTGGCGAATCTGCTGCGTGAGCGCGGCGTTAAACCAGGGGACAGCGTGGCGGTGGCACTACCGCGCTCGGTCTTTTTGACCCTg > 1:405790/1‑288 (MQ=255) cgcTGTTGTGCGGCGATGTCGATATTATGCTGCCAGGTGAGTATGCGCAGCTGGCGCAGCTCAACGCCACTCAGGTTGAGATTCCAGAAACCACGCTTAGCGCGCTGGTGGCAGAA‑CAAGCGGCAAAAACACCGGATGCTCCGGCGCTGGCAGATGCGCGTTACCTGTTCAGCTATCGGGAAATGCGCGAGCAGGTGGTGGCGCTGGCGAATCTGCTGCGTGAGCGCGGCGTTAAACCAGGGGACAGCGTGGCGGTGGCACTACCGCGCTCGGTCTTTTTGACCCTgg < 1:1181296/288‑1 (MQ=255) cTGTTGTGCGGCGATGTCGATATTATGCTGCCAGGTGAGTATGCGCAGCTGGCGCAGCTCAACGCCACTCAGGTTGAGATTCCAGAAACCACGCTTAGCGCGCTGGTGGCAGAA‑CAAGCGGCAAAAACACCGGATGCTCCGGCGCTGGCAGATGCGCGTTACCTGTTCAGCTATCGGGAAATGCGCGAGCAGGTGGTGGCGCTGGCGAATCTGCTGCGTGAGCGCGGCGTTAAACCAGGGGACAGCGTGGCGGTGGCACTACCGCGCTCGGTCTTTTTGACCCTGGCa < 2:1535519/288‑1 (MQ=255) cggcgATGTCGATATTATGCTGCCAGGTGAGTATGCGCAGCTGGCGCAGCTCAACGCCACTCAGGTTGAGATTCCAGAAACCACGCTTAGCGCGCTGGTGGCAGAA‑CAAGCGGCAAAAACACCGGATGCTCCGGCGCTGGCAGATGCGCGTTACCTGTTCAGCTATCGGGAAATGCGCGAGCAGGTGGTGGCGCTGGCGAATCTGCTGCGTGAGCGCGGCGTTAAACCAGGGGACAGCGTGGCGGTGGCACTACCGCGCTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCg > 1:1299138/1‑289 (MQ=255) gcgATGTCGATATTATGCTGCCAGGTGAGTATGCGCAGCTGGCGCAGCTCAACGCCACTCAGGTTGAGATTCCAGAAACCACGCTTAGCGCGCTGGTGGCAGAA‑CAAGCGGCAAAAACACCGGATGCTCCGGCGCTGGCAGATGCGCGTTACCTGTTCAGCTATCGGGAAATGCGCGAGCAGGTGGTGGCGCTGGCGAATCTGCTGCGTGAGCGCGGCGTTAAACCAGGGGACAGCGTGGCGGTGGCACTACCGCGCTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGa < 1:1456876/288‑1 (MQ=255) aTGTCGATATTATGCTGCCAGGTGAGTATGCGCAGCTGGCGCAGCTCAACGCCACTCAGGTTGAGATTCCAGAAAACACGCTTAGCGCGCTGGTGGCAGAA‑CAAGCGGCAAAAACACCGGATGCTCCGGCGCTGGCAGATGCGCGTTACCTGTTCAGCTATCGGGAAATGCGCGAGCAGGTGGTGGCGCTGGCGAATCTGCTGCGTGAGCGCGGCGTTAAACCAGGGGACAGCGGGGCGGTGGCACTACCGCGCTCGGCCTTTTTCACCCTGGCCCTCCATGCGATAGt > 2:1241695/1‑289 (MQ=255) tCGATATTATGCTGCCAGGTGAGTATGCGCAGCTGGCGCAGCTCAACGCCACTCAGGTTGAGATTCCAGAAACCACGCTTAGCGCGCTGGTGGCAGAA‑CAAGCGGCAACAACACCGGATGCTCCGGCGCTGGCAGATGCGCGTTACCTGTTCAGCTATCGGGAAATGCGCGAGCAGGTGGTGGCGCTGGCGAATCTGCTGCGTGAGCGCGGCGTTAAACCAGGGGACAGCGTGGCGGTGGCCCTCCCGCGCTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACCCCATGCGATCGTTg > 2:534931/1‑288 (MQ=255) tCGATATTATGCTGCCAGGTGAGTATGCGCAGCTGGCGCAGCTCAACGCCACTCAGGTTGAGATTCCAGAAACCACGCTTAGCGCGCTGGTGGCAGAA‑CAAGCGGCAAAAACACCGGATGCTCCGGCGCTGGCAGATGCGCGTTACCTGTTCAGCTATCGGGAAATGCGCGAGCAGGTGGTGGCGCTGGCGAATCTGCTGCGTGAGCGCGGCGTTAAACCAGGGGACAGCGTGGCGGTGGCACTACCGCGCTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGa > 1:1686241/1‑289 (MQ=255) atatTATGCTGCCAGGTGAGTATGCGCAGCTGGCGCAGCTCAACGCCACTCAGGTTGAGATTCCAGAAACCACGCTTAGCGCGCTGGTGGCAGAA‑CAAGCGGCAAAAACACCGGATGCTCCGGCGCTGGCAGATGCGCGTTACCTGTTCAGCTATCGGGAAATGCGCGAGCAGGTGGTGGCGCTGGCGAATCTGCTGCGTGAGCGCGGCGTTAAACCAGGGGACAGCGTGGCGGTGGCACTACCGCGCTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGAAg < 1:1600154/288‑1 (MQ=255) attatGCTGCCAGGTGAGTATGCGCAGCTGGCGCAGCTCAACGCCACTCAGGTTGAGATTCCAGAAACCACGCTTAGCGCGCTGGTGGCAGAA‑CAAGCGGCAAAAACACCGGATGCTCCGGCGCTGGCAGATGCGCGTTACCTGTTCAGCTATCGGGAAATGCGCGAGCAGGTGGCGGCGCTGGCGAATCTGCTGCGTGAGCGCGGCGTTAAACCAGGGGACAGCGTGGCGGTGGCACTACCGCGCCCGGGCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGATGCTg > 2:239924/1‑289 (MQ=255) tatGCTGCCAGGTGAGTATGCGCAGCTGGCGCAGCTCAACGCCACTCAGGTTGAGATTCCAGAAACCACGCTTAGCGCGCTGGTGGCAGAA‑CAAGCGGCAAAAACACCGGATGCTCCGGCGCTGGCAGATGCGCGTTACCTGTTCAGCTATCGGGAAATGCGCGAGCAGGTGGTGGCGCTGGCGAATCTGCTGCGTGAGCGCGGCGTTAAACCAGGGGACAGCGTGGCGGTGGCACTACCGCGCTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGAAGCTGGa < 1:1588361/289‑1 (MQ=255) tgctgcCAGGTGAGTATGCGCAGCTGGCGCAGCTCAACGCCACTCAGGTTGAGATTCCAGAAAGCACGCTTAGCGCGCTGGTGGCAGAA‑CAAGCGGCAAAAACACCGGATGCTCCGGCGCTGGCAGATGCGCGTTACCTGTTCAGCTATCGGGAAATGCGCGAGCAGGTGGTGGCGCTGGCGAATCTGCTGCGTGAGCGCGGCGTTAAACCAGGGGACAGCGTGGCGGGGGCACTACCGCGGTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGGTGAAGCTGGa < 1:1662841/287‑1 (MQ=255) gctgcCAGGTGAGTATGCGCAGCTGGCGCAGCTCAACGCCACTCAGGTTGAGATTCCAGAAACCACGCTTAGCGCGCTGGTGGCAGAA‑CAAGCGGCAAAAACACCGGATGCTCCGGCGCTGGCAGATGCGCGTTACCTGTTCAGCTATCGGGAAATGCGCGAGCAGGTGGTGGCGCTGGCGAATCTGCTGCGTGAGCGCGGCGTTAAACCAGGGGACAGCGTGGCGGTGGCACTACCGCGCTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGAAGCTGGAGCg > 2:890189/1‑289 (MQ=255) tGAGTATGCGCAGCTGGCGCAGCTCAACGCCACTCAGGTTGAGATTCCAGAAACCACGCTTAGCGCGCTGGTGGCAGAA‑CAAGCGGCAAAAACACCGGATGCTCCGGCGCTGGCAGATGCGCGTTACCTGTTCAGCTATCGGGAAATGCGCGAGCAGGTGGTGGCGCTGGCGAATCTGCTGCGTGAGCGCGGCGTTAAACCAGGGGACAGCGTGGCGGTGGCACTACCGCGCTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGAAGCTGGAGCGGCCTGGCt > 2:483543/1‑288 (MQ=255) tGAGTATGCGCAGCTGGCGCAGCTCAACGCCACCCAGGCTGAGATTCCAGAAACCACGCTTAGCGCGCTGGTGGCAGAA‑CAAGCGGCAAAAACACCGGATGCTCCGGCGCTGGCAGATGCGCGTTACCTGTTCAGCTATCGGGAAATGCGCGAGCAGGTGGTGGCGCTGGCGAATCTGCTCCGTGAGCGCGGCGTTAAGCCAGGGCACAGCGTGGAGGTGGCACTACTCCGCACGTTCTCTTTGACCCTGGCACTCGATGCGAGAGGTGAAGCGGGACCCGCCCGGcc > 2:1662841/1‑287 (MQ=255) cgcAGCTGGCGCAGCTCAACGCCACTCAGGTTGAGATTCCAGAAACCACGCTTAGCGCGCTGGTGGCAGAA‑CAAGCGGCAAAAACACCGGATGCTCCGGCGCTGGCAGATGCGCGTTACCTGTTCAGCTATCGGGAAATGCGCGAGCAGGTGGTGGCGCTGGCGAATCTGCTGCGTGAGCGCGGCGTTAAACCAGGGGACAGCGTGGCGGTGGCACTACCGCGCTCGGTCTGTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGGTCAAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCCgg > 2:1265010/1‑288 (MQ=255) gccgCTGGCGCAGCTCAACGCCACTCAGGTTGAGATTCCAGAAACCACGCTTAGCGCGCTGGTGGCAGAA‑CAAGCGGCAAAAACACCGGATGCTCCGGCGCTGGCAGATGCGCGTTACCTGTTCAGCTATCGGGAAATGCGCGAGCAGGTGGTGGCGCTGGCGAATCTGCTGCGTGAGCGCGGCGTTAAACCAGGGGACAGCGTGGCGGTGGCACTACCGCGCTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGAAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGa < 2:914050/285‑1 (MQ=255) gcAGCTGGCGCAGCTCAACGCCACTCAGGTTGAGATTCCAGAAACCACGCTTAGCGCGCTGGTGGCAGAA‑CAAGCGGCAAAAACACCGGATGCTCCGGCGCTGGCAGATGCGCGTTACCTGTTCAGCTATCGGGAAATGCGCGAGCAGGTGGTGGCGCTGGCGAATCTGCTGCGTGAGCGCGGCGTTAAACCAGGGGACAGCGTGGCGGTGGTACTACCGCGCTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGAAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGa < 1:1171539/288‑1 (MQ=255) gcAGCTGGCGCAGCTCAACGCCACTCAGGTTGAGATTCCAGAAACCACGCTTAGCGCGCTGGTGGCAGAA‑CAAGCGGCAAAAACACCGGATGCTCCGGCGCTGGCAGATGCGCGTTACCTGTCCAGCTATAGGGAAATGCGCGAGCAGGTGGTGGCGCTGGCGAATCTGCTGCGTGAGCGCGGCGTTAAACCAGGGGACAGCGTGGCGGTGGCACTACCGCGCTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGAAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCCGGAt > 2:1002365/1‑289 (MQ=255) gCTGGCGCAGCTCAACGCCACTCAGGTTGAGATTCCAGAAACCACGCTTAGCGCGCTGGTGGCAGAA‑CAAGCGGCAAAAACACCGGATGCTCCGGCGCTGGCAGATGCGCGTTACCTGTTCAGCTATCGGGAAATGCGCGAGCAGGTGGTGGCGCTGGCGAATCTGCTGCGTGAGCGCGGCGTTAAACCAGGGGACAGCGTGGCGGTGGCACTACCGCGCTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGa > 2:1371950/1‑251 (MQ=255) cTGGCGCAGCTCAACGCCACTCAGGTTGAGATTCCAGAAACCACGCTTAGCGCGCTGGTGGCAGAA‑CAAGCGGCAAAAACACCGGATGCTCCGGCGCTGGCAGATGCGCGTTACCTGTTCAGCTATCGGGAAATGCGCGAGCAGGTGGTGGCGCTGGCGAATCTGCTGCGTGAGCGCGGCGTTAAACCAGGGGACAGCGTGGCGGTGGCACTACCGCGCTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCa < 1:19310/245‑1 (MQ=255) 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tGAGATTCCAGAAACCACGCTTAGCGCGCTGGTGGCAGAA‑CAAGCGGCAAAAACACCGGATGCTCCGTCGCTGGCAGATGCGCGTTACCTGTTCAGCTATCGGGAAATGCGCGAGCAGGTGGTGGCGCTGGCGAATCTGCTGCGTGAGCGCGGCGTTAAACCAGGGGACAGCGTGGCGGTGGCACTACCGCGCTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGAAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAat < 1:890189/288‑1 (MQ=255) tGAGATTCCAGAAACCACGCTTAGCGCGCTGGTGGCAGAA‑CAAGCGGCAAAAACACCGGATGCTCCGGCGCTGGCAGATGCGCGTTACCTGTTCAGCTATCGGGAAATGCGCGAGCAGGTGGTGGCGCTGGCGAATCTGCTGCGTGAGCGCGGCGTTAAACCAGGGGACAGCGTGGCGGTGGCACTACCGCGCTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGAAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAatg < 2:1908877/289‑1 (MQ=255) ttCCAGAAACCACGCTTAGCGCGCTGGTGGCAGAA‑CAAGCGGCAAAAACACCGGATGCTCCGGCGCTGGCAGATGCGCGTTACCTGTTCAGCTATCGGGAAATGCGCGAGCAGGTGGTGGCGCTGGCGAATCTGCTGCGTGAGCGCGGCGTTAAACCAGGGGACAGCGTGGCGGTGGCACTACCGCGCTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGAAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGc < 2:1668729/288‑1 (MQ=255) 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tGGCGGTGGCACTACCGCGCTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGAAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGCTGGAAGATGCGCGTCCGTCGCTGTTAATTACCACCGACGATCAACTGCCGCGCTTTAGCGATGTTCCCAATTTAACAAGCCTTTGCTATAACGCCCCGCTTACACCGCAGGGCAGTGCGCCGCTGCAACTTTCACAACCGCATCACACGGCTTATAT‑CATCTTTAcc > 1:435346/1‑287 (MQ=255) ggCGGTGGCACTACCGCGCTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGAAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGCTGGAAGATGCGCGTCCGTCGCTGTTAATTACCACCGACGATCAACTGCCGCGCTTTAGCGATGTTCCCAATTTAACaa > 2:1073865/1‑197 (MQ=255) ggCGGTGGCACTACCGCGCTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGAAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGCTGGAAGATGCGCGTCCGTCGCTGTTAATTACCACCGACGATCAACTGCCGCGCTTTAGCGATGTTCCCAATTTAACAAGCCTTTGCTATAACGCCCCGCTTACACCGCAGGGCAGTGCGCCGCTGCAACTTTCACAACCGCATCACACGGCTTATAT‑CATCTTTAcc > 1:1492359/1‑286 (MQ=255) gCACTACCGCGCTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGAAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGCTGGAAGATGCGCGTCCGTCGCTGTTAATTACCACCGACGATCAACTGCCGCGCTTTAGCGATGTTCCCAATTTAACAAGCCTTTGCTATAACGCCCCGCTTACACCGCAGGGCAGTGCGCCGCTGCAACTTTCACAACCGCATCACACGGCTTATATCCATCTTTACCCCCGGCTc > 2:1948394/1‑288 (MQ=255) tACCGCGCTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGAAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGCTGGAAGATGCGCGTCCGTCGCTGTTAATTACCACCGACGATCAACTGCCGCGCTTTAGCGATGTTCCCAATTTAACAAGCCTTTGCTATAACGCCCCGCTTACACCGCAGGGCAGTGCGCCGCTGCAACTTTCACAACCGCATCACACGGCTTATAT‑CATCTTTACCTCTGGCTCCACCgg < 2:1710582/289‑1 (MQ=255) aCCGCGCTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGAAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGTTGGAAGATGCGCGTCCGTCGCTGTTAATTACCACCGACGATCAACTGCCGCGCTTTAGCGATGTTCCCAATTTAACAAGCCTTTGCTATAACGCCCCGCTTACACCGCAGGGCAGTGCGCCGCTGCAACTTTCACAACCGCATCACACGGCTTATAT‑CATCTTTACCTCTGGCTCCACCGGc < 1:1864940/289‑1 (MQ=255) ||| CGCGGATCCGGCGCTGTTGTGCGGCGATGTCGATATTATGCTGCCAGGTGAGTATGCGCAGCTGGCGCAGCTCAACGCCACTCAGGTTGAGATTCCAGAAACCACGCTTAGCGCGCTGGTGGCAGAA‑CAAGCGGCAAAAACACCGGATGCTCCGGCGCTGGCAGATGCGCGTTACCTGTTCAGCTATCGGGAAATGCGCGAGCAGGTGGTGGCGCTGGCGAATCTGCTGCGTGAGCGCGGCGTTAAACCAGGGGACAGCGTGGCGGTGGCACTACCGCGCAGCGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGAAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGCTGGAAGATGCGCGTCCGAGCCTGTTAATTACCACCGACGATCAACTGCCGCGCTTTAGCGATGTTCCCAATTTAACAAGCCTTTGCTATAACGCCCCGCTTACACCGCAGGGCAGTGCGCCGCTGCAACTTAGTCAACCGCATCACACGGCTTATAT‑CATCTTTACCTCTGGCTCCACCGGC > CP042583/488986‑489547 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |