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| RA | CP042583 | 492,966 | 3 bp→TGA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base G (118/156); minor base T (1/0); total (119/156) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.33e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| * | CP042583 | 492,968 | 0 | T | A | 99.6% | 654.8 / NA | 275 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base A (118/156); minor base C (1/0); total (119/156) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.33e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
Only 100 of 275 total aligned reads displayed.
TGACGTTGCGGAACTGAACGGTGAATTACGTAATCGGCAGTATCTTGTCGAGCAATTAACAAAAGCACATGTCAACGATGTGAATTTTACGCCGTTTAAATATCAGTTAAGCCCGAGTTTGCCAGTGAAAAAAGACGGTCCGGGTAAGGCGATTATTGTGATCCTTTCCGCGTTGATCGGCGGGATGGTGGCTTGTGGTGGCGTGCTGTTGCGCTATGCGATGGCATCCAGAAAACAGGATGCCATGATGGCAGACCACTTAGTTTAACTATTTGCGGTACTAGGTGCCGTTCGTCCGAGCGGCACCACAAGCGGCGTTCCGGCAACTGGATCGTCAATGATCATGCAGCGCAGACCATAAATGCGCTCAATCAGTTCAGCAGTGACAATCTCCTTCGGCGCTCCCTGAGCAACAATTTTCCCTTCCCGCAATGCAATCAAATGGCTGGCGTAACGACAGGCCTGATTAAGATCGTGCAGCACCGCCGCCAGGGTATAGCCTTTTTCGCGGTTCAGTTCGCTTAACAACTCCAGCAAATCAATCTGATGACTGATATCCA > CP042583/492687‑493246 ||| tGACGTTGCGGAACTGAACGGTGAATTACGTAATCGGCAGTATCTTGTCGAGCAATTAACAAAAGCACATGTCAACGATGTGAATTTTACGCCGTTTAAATATCAGTTAAGCCCGTCATTGCCAGTGAAAAAAGACGGTCCGGGTAAGGCGATTATTGTGATCCTTTCCGCGTTGATCGGCGGGATGGTGGCTTGTGGTGGCGTGCTGTTGCGCTATGCGATGGCATCCAGAAAACAGGATGCCATGATGGCAGACCACTTAGTTTAACTATTTGCGGTTGAAGGTGcc > 1:1852013/1‑289 (MQ=255) 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TGACGTTGCGGAACTGAACGGTGAATTACGTAATCGGCAGTATCTTGTCGAGCAATTAACAAAAGCACATGTCAACGATGTGAATTTTACGCCGTTTAAATATCAGTTAAGCCCGAGTTTGCCAGTGAAAAAAGACGGTCCGGGTAAGGCGATTATTGTGATCCTTTCCGCGTTGATCGGCGGGATGGTGGCTTGTGGTGGCGTGCTGTTGCGCTATGCGATGGCATCCAGAAAACAGGATGCCATGATGGCAGACCACTTAGTTTAACTATTTGCGGTACTAGGTGCCGTTCGTCCGAGCGGCACCACAAGCGGCGTTCCGGCAACTGGATCGTCAATGATCATGCAGCGCAGACCATAAATGCGCTCAATCAGTTCAGCAGTGACAATCTCCTTCGGCGCTCCCTGAGCAACAATTTTCCCTTCCCGCAATGCAATCAAATGGCTGGCGTAACGACAGGCCTGATTAAGATCGTGCAGCACCGCCGCCAGGGTATAGCCTTTTTCGCGGTTCAGTTCGCTTAACAACTCCAGCAAATCAATCTGATGACTGATATCCA > CP042583/492687‑493246 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |