Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
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RA | CP042583 | 1,585,812 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP042583 | 1,585,812 | 0 | A | T | 100.0% | 479.7 / NA | 202 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
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* | CP042583 | 1,585,813 | 0 | G | C | 99.0% | 467.4 / ‑7.1 | 202 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base C (70/130); minor base T (2/0); total (72/130) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.26e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,585,814 | 0 | C | G | 100.0% | 474.6 / NA | 202 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (72/130); total (72/130) |
Only 100 of 202 total aligned reads displayed.
GTTCATCATGCCCCGCCGTAACGGCCCCACCCTGCTGGCAATTCCTTTGCTCCGGCGTGGTCGCATCGATAGCGTTATCTTCGTCGGATTGATTGTCATTCTTATCTATAACAACGTCACGAATCATGGTGCGTTAATAACGACATGGTTATTAAGCGCACTGGCTCTGATGGGTTTTTATATATTCTGGATCCGCGTTCCGAAGATCATCTTTAAACAAAAAGGTTTTTTCTTCGCCAATGTCTGGATTGAATATAGCCGAATCAAAGCGATGAACTTGAGCGAAGATGGCGTGTTGGTGATGCAATTAGAACAGCGTCGGCTGTTAATCCGCGTTCGAAATATCGACGATCTGGAAAAAATTTATAAGCTTCTCGTTAGTACTCAATAAGTTATGAATTTAGCCAAAGCTATGTTTAGTGTATTTTTAATAATCAGACATAGCTTAGGCTATATTACCTCTTCCCTTATTTGTTATTTATTTTAACGTTTCATTGATATATAAATCCAAATGAAAATCGTTATCAATAAAGCAATGAAATAATATATTCCAAC > CP042583/1585532‑1586086 ||| gTTCATCATGCCCCGCCGTAACGGCCCCACCCTGCTGGCAATTCCTTTGCTCCGGCGTGGTCGCATCGATAGCGTTATCTTCGTCGGATTGATTGTCATTCTTATCTATAACAACGTCACGAATCATGGTGCGTTAATAACGACATGGTTATTAAGCGCACTGGCTCTGATGGGTTTTTATATATTCTGGATCCGCGTTCCGAAGATCATCTTTAAACAAAAAGGTTTTTTCTTCGCCAATGTCTGGATTGAATATAGCCGAATCAAAGCGATGAACTTGTCGGAAGAt > 1:102896/1‑289 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |