Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 1,586,411 | 3 bp→TCA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 1,586,411 | 0 | A | T | 99.6% | 592.1 / NA | 251 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); new base T (156/94); total (157/94) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.97e-01 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,586,412 | 0 | G | C | 99.2% | 587.5 / NA | 251 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base C (155/93); minor base A (1/1); total (157/94) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,586,413 | 0 | T | A | 99.6% | 593.5 / NA | 251 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base A (155/94); minor base G (1/0); total (157/94) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 251 total aligned reads displayed.
TAGCCGATTTCCAGATTCCGGAAATGTACGTGTCAACATACTCGTTGCAAAACGTGGCACGTACGGACTGAATACTTTCAGTCAGGCGAGACCATATGCACATCAATCGCTATGCCTGCATGAACGCGAAAACCATCACGGCTTGTTGTTCATGTATGCATGTTTGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGAGCATG‑GATGCATTTGCTGCAAGTATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACCGAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTGGATTGCGTTTGTGCTGCTGATATTCCTCGGCGGGCGAATGATTATTGAGGGTTTTCGTGGCGCAGATGATGAAGATGAAGAGCCGCGCCGTCGACACGGTTTCTGGCTACTGGTAACCACCGCGATT > CP042583/1586138‑1586689 ||| tAGCCGATTTCCAGATTCCGGAAATGTACGTGTCAACATACTCGTTGCAAAACGTGGCACGTACGGACTGAATACTTTCAGTCAGGCGAGACCATATGCACATCAATCGCTATGCCTGCATGAACGCGAAAACCATCACGGCTTGTTGTTCATGTATGCATGTTTGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCTATG‑GATGCATTTGTTGCATCAATCGGTAAAGGt > 1:1902689/1‑288 (MQ=255) gCCGATTTCCAGATTCCGGAAATGTACGTGTCAACATACTCGTTGCAAAACGTGGCACGTACGGACTGAATACTTTCAGTCAGGCGAGACCATATGCACATCAATCGCTATGCCTGCATGAACGCGAAAACCATCACGGCTTGTTGTTCATGTATGCATGTTTGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATG‑GATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGcc > 1:1861977/1‑289 (MQ=255) gCCGATTTCCAGATTCCGGAAATGTACGTGTCAACATACTCGTTGCAAAACGTGGCACGTACGGACTGAATACTTTCAGTCAGGCGAGACCATATGCACATCAATCGCTATGCCTGCATGAACGCGAAAACCATCACGGCTTGTTGTTCATGTATGCATGTTTGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCCTTCGGTTGGTCGATGAGAT‑CATTTGCTGCCTCAATTGGTAAAGGTGcc > 2:1498182/1‑289 (MQ=255) ttCCAGATTCCGGAAATGTACGTGTCAACATACTCGTTGCAAAACGTGGCACGTACGGACTGAATACTTTCAGTCAGGCGAGACCATATGCACATCAATCGCTATGCCTGCATGAACGCGAAAACCATCACGGCTTGTTGTTCATGTATGCATGTTTGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATG‑GATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCt > 1:546097/1‑288 (MQ=255) gtCAACATACTCGTTGCAAAACGTGGCACGTACGGACTGAATACTTTCAGTCAGGCGAGACCATATGCACATCAATCGCTATGCCTGCATGAACGCGAAAACCATCACGGCTTGTTGTTCATGTATGCATGTTTGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATG‑GATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACCGAAATTTTCTGAAGc > 1:270312/1‑289 (MQ=255) aaCATACTCGTTGCAAAACGTGGCACGTACGGACTGAATACTTTCAGTCAGGCGAGACCATATGCACATCGATCGCTATGCCTGCATGAACGCGAAAACCATCACGGCTTGTTGTTCATGTATGCATGTTTGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATG‑GATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACCGAAATTTTCTGAAGCAtt < 1:1177673/289‑1 (MQ=255) aaCATACTCGTTGCAAAACGTGGCACGTACGGACTGAATACTTTCAGTCAGGCGAGACCATATGCACATCAATCGCTATGCCTGCATGAACGCGAAAACCATCACGGCTTGTTGTTCATGTATGCATGTTTGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATG‑GATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACCGAAATTTTCTGAAGCAtt < 2:1090575/289‑1 (MQ=255) aaCATACTCGTTGCAAAACGTGGCACGTACGGACTGAATACTTTCAGTCAGGCGAGACCATATGCACATCAATCGCTATGCCTGCATGAACGCGAAAACCATCACGGCTTGTTGTTCATGTATGCATGTTTGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATG‑GATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACCGAAATTTTCTGAAGCAtt < 1:1089755/289‑1 (MQ=255) cTCGTTGCAAAACGTGGCACGTACGGACTGAATACTTTCAGTCAGGCGAGACCATATGCACATCAATCGCTATGCCTGCATGAACGCGAAAACCATCACGGCTTGTTGTTCATGTATGCATGTTTGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATG‑GATGTATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACCGAAATTTTCTGAAGCATTGCGAAc < 2:1159706/289‑1 (MQ=255) cTCGTTGCAAAACGTGGCACGTACGGACTGAATACTTTCAGTCAGGCGAGACCATATGCACATCAATCGCTATGCCTGCATGAACGCGAAAACCATCACGGCTTGTTGTTCATGTATGCATGTTTGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATG‑GATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACCGAAATTTTCTGAAGCATTGCGAAc < 2:1936199/289‑1 (MQ=255) tCGTTGCAAAACGTGGCACGTACGGACTGAATACTTTCAGTCAGGCGAGACCATATGCACATCAATCGCTATGCCTGCATGAACGCGAAAACCATCACGGCTTGTTGTTCATGTATGCATGTTTGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATG‑GATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCAc > 2:375246/1‑252 (MQ=255) cGTTGCAAGACGTGGCACGTACGGACTGAATACTTTCAGTCAGGCGAGACCATATGCACATCAATCGCTATGCCTGCATGAACGCGAAAACCATCACGGCTTGTTGTTCATGTATGCATGTTTGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTAATGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATG‑GATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACCGAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCg > 2:875133/1‑289 (MQ=255) gCAAAACGTGGCACGTACGGACTGAATACTTTCAGTCAGGCGAGACCATATGCACATCAATCGCTATGCCTGCATGAACGCGAAAACCATCACGGCTTGTTGTTCATGTATGCATGTTTGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATG‑GATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACCGAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCt > 1:434900/1‑289 (MQ=255) ggCACGTACGGACTGAATACTTTCAGTCAGGCGAGACCATATGCACATCAATCGCTATGCCTGCATGAACGCGAAAACCATCACGGCTTGTTGTTCATGTATGCATGTTTGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTGGGTATGTCGATG‑GATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACCGAAATTTTCGTAAGCATTGCGAACTGGCCTTATTCTTgg > 2:1601868/1‑289 (MQ=255) ggCACGTACGGACTGAATACTTTCAGTCAGGCGAGACCATATGCACATCAATCGCTATGCCTGCATGAACGCGAAAACCACCACGGCTTGTTGTTCATGTATGCATGTTTGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATG‑GATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACCGAAATTGTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTgg > 2:638895/1‑289 (MQ=255) aCGGACTGAATACTTTCAGTCAGGCGCGACCATATGCACATCAATCGCTATGCCTGCATGAACGCGAAAACCATCACGGCTTGTTGTTCATGTATGCATGTTTGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATG‑GATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATCAACCGAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGTCCTTATTTTTtgtgtctcc > 1:334944/1‑284 (MQ=255) aCGGACTGAATACTTTCAGTCAGGCGAGACCATATGCACATCAATCGCTATGCCTGCATGAACGCGAAAACCATCACGGCTTGTTGTTCATGTATGCATGTTTGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATG‑GATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACCGAAATTTTCTG‑AGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCg > 2:97498/1‑289 (MQ=255) gtcagGCGAGACCATATGCACATCAATCGCTATGCCTGCATGAACGCGAAAACCATCACGGCTTGTTGTTCATGTATGCATGTTTGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATG‑GATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACCGAAATTTTCTg < 1:1320532/236‑1 (MQ=255) gtcagGCGAGACCATATGCACATCAATCGCTATGCCTGCATGAACGCGAAAACCATCACGGCTTGTTGTTCATGTATGCATGTTTGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATG‑GATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACCGAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTg > 1:960639/1‑289 (MQ=255) cagGCGAGACCATATGCACATCAATCGCTATGCCTGCATGAACGCGAAAACCATCACGGCTTGTTGTTCATGTATGCATGTTTGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATG‑GATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACCGAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGAt < 2:5396/289‑1 (MQ=255) cagGCGAGACCATATGCACATCAAGCGCTATGCCTGCATGAACGCGAAAACCATCACGGCTTGTTGTTCATGTATGCATGTTTGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAACATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATG‑GATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACCGAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGAt < 2:720559/289‑1 (MQ=255) gCGAGACCATATGCACATCAATCGCTATGCCTGCATGAACGCGAAAACCATCACGGCTTGTTGTTCATGTATGCATGTTTGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATG‑GATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACCGAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCgg > 2:1294454/1‑289 (MQ=255) gaaaCCCTATGAACATCAATCGCTATGCCTGCATGACACCGAAAACCATCACGGTTTGTTGTTCATGTATGCATGTTTGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATG‑GATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACCGAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGc < 2:1710425/285‑1 (MQ=255) ccATATGCACATCAATCGCTATGCCTGCATGAACGCGAAAACCATCACGGCTTGTTGTTCATGTATGCATGTTTGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATG‑GATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACCGAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGAt < 1:990530/280‑1 (MQ=255) atGCACATCAATCGCTATGCCTGCATGAACGCGAAAACCATCACGGCTTGTTGTTCATGTATGCATGTTTGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATG‑GATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACCGAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGAt > 1:126103/1‑276 (MQ=255) caTCAATCGCTATGCCTGCATGAACGCGAAAACCATCACGGCTTGTTGTTCATGTATGCATGTTTGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATG‑GATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACCGAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCAt > 1:1750319/1‑289 (MQ=255) aTCAATCGCTATGCCTGCATGAACGCGAAAACCATCACGGCTTGTTGTTCATGTATGCATGTTTGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATG‑GATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACCGAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATg > 2:1718003/1‑289 (MQ=255) tCAATCGCTATGCCTGCATGAACGCGAAAACCATCACGGCTTGTTGTTCATGTATGCATGTTTGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATG‑GATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACCGAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGAt > 2:1950688/1‑269 (MQ=255) aaTCGCTATGCCTGCATGAACGCGAAAACCATCACGGCTTGTTGTTCATGTATGCATGTTTGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATG‑GATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACCGAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTa > 1:1219362/1‑289 (MQ=255) aTCGCTATGCCTGCATGAACGCGAAAACCATCACGGCTTGTTGTTCATGTATGCATGTTTGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATG‑GATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACCGAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGGTa > 1:581593/1‑288 (MQ=255) tCGCTATGCCTGCATGAACGCGAAAACCATCACGGCTTGTTGTTCATGTATGCATGTTTGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATG‑GATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACCGAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTag > 1:1293612/1‑288 (MQ=255) cTATGCCTGCATGAACGCGAAAACCATCACGGCTTGTTGTTCATGTATGCATGTTTGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATG‑GATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACCGAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTagcca > 2:1667610/1‑288 (MQ=255) gCCTGCATGAACGCGAAAACCATCACGGCTTGTTGTTCATGTATGCATGTTTGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATG‑GATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACCGAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGAcgc < 2:268062/251‑1 (MQ=255) cTGCATGAACGCGAAAACCATCACGGCTTGTTGTTCATGTATGCATGTTTGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATG‑GATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACCGAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGt < 2:1123844/288‑1 (MQ=255) gCATGAACGCGAAAACCATCACGGCTTGTTGTTCATGTATGCATGTTTGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATG‑GATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACCGAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCAGGTTAGCCAGCCGGttgg > 2:66940/1‑287 (MQ=255) cATGAACGCGAAAACCATCACGGCTTGTTGTTCATGTATGCATGTTTGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATG‑GATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACCGAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCGGGGGAATGGGCATGTGAGCCAGCCGGtttt > 2:1619045/1‑287 (MQ=255) tGAACGGAAAAACCTGCGCGTCATGTTGTCTATGTATGCGTTTTTGCTGGGGGCGTTGTTGTGTTTTATCGATACTCCGGTCAGTGCACTTTCATGAATACCACTGCTACTGTTCTTCTTTCCTTTGGTATGTCGATG‑TATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACCGAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTcc < 2:1578695/289‑1 (MQ=255) cgcgAAAACCATCACGGCTTGTTGTTCATGTATGCATGTTTGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATG‑GATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACCGAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGa > 1:171462/1‑289 (MQ=255) aaaaCCATCACGGCTTGTTGTTCATGTATGCATGTTTGCTGGGGGCGCTGATGTGCTATATGGATACCCCGGTCACGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTAGCGTTTGGTATGTCGATG‑GATGCATCTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACCGAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTGGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCAGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCAAGCCGGTTTGTACTTGACTg > 2:1454248/1‑288 (MQ=255) aaaaCCATCACGGCTTGTTGTTCATGTATGCATGTTTGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATG‑GATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACCGAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATgg > 1:201092/1‑289 (MQ=255) aaaCCATCACGGCTTGTTGTTCATGTATGCATGTTTGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATG‑GATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACCGAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATgg < 1:1667610/288‑1 (MQ=255) aTCACGGCTTGTTGTTCATGTATGCATGTTTGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATG‑GATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACCGAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAAcc > 1:1630979/1‑287 (MQ=255) ggCTTGTTGTTCATGTATGCATGTTTGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATG‑GATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACCGAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTGGAt < 1:1619045/289‑1 (MQ=255) cTTGTTGTTCATGTATGCATGTTTGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGCTACCCCGGTCAGGACATTGGCATGAATCTCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATG‑GATGCATTTTCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATCAATCGAAATTGTCTGAAGCATTTCGAACCGGCATTATTTTGGGTTCCTCCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGCAACGGGCATGTTAGCCAGACGCTTTGTGCTTGATTGGAActcatggactt > 2:899107/1‑279 (MQ=255) cATGTATGCATGTTTCCGTGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGAACATGGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATG‑GATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACCGAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTGGATTGCGTTTGtgc < 2:581593/289‑1 (MQ=255) aTGCACGTTTGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATG‑GATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACCGAAATTTTCTGAAGCATGGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGCATGGGCATGTTCGCCACCCGGTTTGTCCGTGCATGCAACCCTTGGATTGCGTTCGTGatggtg > 2:1509563/1‑289 (MQ=255) tGCATGTTTGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATG‑GATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACCGAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTGGATTGCGTTTGTGCTGCTGa > 1:1448065/1‑289 (MQ=255) tttGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATG‑GATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACCGAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTGGATTGCGTTTGTGCTGCTGATAtt > 1:249038/1‑287 (MQ=255) tGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATG‑GATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACCGAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTGGATTGCGTTTGTGCTGCTGATATTCCTc > 1:1073496/1‑289 (MQ=255) cTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATG‑GATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACCGAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTGGATTGCGTTTGTGCTGCTGATATTCCTcg > 1:1820226/1‑288 (MQ=255) tGGGGGCGATGATGTGGTTTATGGATACCCAGGGCAGGACATTGTCATGAATCTCTCTGCTACTGTACTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATG‑GATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACCGAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTGGATTGCGTTTGTGCTGCTGATATTCCTcgg < 1:122522/288‑1 (MQ=255) ggCGATGATGTGTTTTCTGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATG‑GATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACCGAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTGGATTGCGTTTGTGCTGCTGATATTCCTCggcgggc > 1:669069/1‑289 (MQ=255) ggCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATG‑GATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACCGAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATgg < 1:938530/246‑1 (MQ=255) ggCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATG‑GATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACCGAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATgg > 2:938530/1‑246 (MQ=255) ggCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATAACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATG‑GATGCATTTGCTGCATCACTCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACCGAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGCTCGGCTGGGGAATGGGCACGTTGGCCAGCCGGTTTGTCCTTGGATGGTAGGACTGGATTGCGTTTGGGCTGCTGTTCATTCTCggcgggc > 2:427157/1‑289 (MQ=255) gtTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATG‑GATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACCGAAATTTTCTGACGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTGGATTGCGTTTGTGCTGCTGATATTCCTCGGCGGGCGAATGattat < 1:605236/288‑1 (MQ=255) tATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATG‑GATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAACCCGAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGTCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTGGATTGCGTTTGTGCTGCTGTTATTCCTCGGCGGGCGAATGATTCTTGCgg > 2:1214279/1‑289 (MQ=255) aTACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATG‑GATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACCGAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTGGATTGCGTTTGTGCTGCTGATATTCCTCGGCGGGCGAATGATTATTGAGGGtttt > 1:1408130/1‑289 (MQ=255) aCCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATG‑GATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACCGAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGaa > 1:399452/1‑221 (MQ=255) aCCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATG‑GATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACCGAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTGGATTGCGTTTGTGCTGCTGATATTCCTCGGCGGGCGAATGATTATTGAGGGTTTTCg < 1:419248/289‑1 (MQ=255) cccGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATG‑GATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACCGAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTGGATTGCGTTTGTGCTGCTGATATTCCTCGGCGGGCGAATGATTATTGAGGGTTTTCGTg > 1:925469/1‑289 (MQ=255) ccaggTAAGGACATTGTCATGAATATCATTGCTTCTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATG‑GATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACCGAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTGGATTGCGTTTGTGCTGCTGATATTCCTCGGCGGGCGAATGATTATTGAGGGTTTTCGTg < 2:1902689/286‑1 (MQ=255) ggTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATG‑GATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACCGAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTGGATTGCGTTTGTGCTGCTGATATTCCTCGGCGGGCGAATGATTATTGAGGGTTTTCGTGgcg < 2:953379/289‑1 (MQ=255) tCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATG‑GATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACCGAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTGGATTGCGTTTGTGCTGCTGATATTCCTCGGCGGGCGAATGATTATTGAGGGTTTTCGTGgcgc < 1:1207465/288‑1 (MQ=255) cATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATG‑GATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACCGAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTGGATTGCGTTTGTGCTGCTGATATTCCTCGGCGGGCGAATGATTATTGAGGGTTTTCGTGGCGCAgatga < 1:741528/288‑1 (MQ=255) aTTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATG‑GATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACCGAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTGGATTGCGTTTGTGCTGCTGATATTCCTCGGCGGGCGAATGATTATTGAGGGTTTTCGTGGCGCAGatgatg < 1:1718003/289‑1 (MQ=255) tGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATG‑GATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACCGAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTGGATTGCGTTTGTGCTGCTGATATTCCTCGGCGGGCGAATGATTATTGAGGGTTTTCGTGGCGCAGATgatgaa > 1:511069/1‑289 (MQ=255) tGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATG‑GATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACCGAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGGTTGTCCTTGAATGGAACCACTGGATTGCGTTTGTGCTGCGGATATTCCTCGGCGGGCGAAGGATTATTGAGGGTTTTCGTggggtcgttggtgga > 2:1262159/1‑276 (MQ=255) tGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATG‑GATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACCGAAATTTTCTGCAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGCCTTGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTGGATTGCGGTTGTGCTGCTGATAGTCCACGGCGGGCGAATGATTATTGAGGGTTTTCGTGGCCCATATgatgaaaatgg > 2:227538/1‑288 (MQ=255) tGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATG‑GATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACCGAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTGGATTGCGTTTGTGCTGCTGATATTCCTCGGCGGGCGAATGATTATTGAGGGTTTTCGTGGCGCAGATgatgaagatga > 1:824076/1‑289 (MQ=255) tcccTGTTACTGTTTTTTTGGCGTTTGGTATGTCGATG‑GATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACCGAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTGGATTGCGTTTGTGCTGCTGATATTCCTCGGCGGGCGAATGATTATTGAGGGTTTTCGTGGCGCAGATGATGAAGATGAAGAGcc < 2:1073496/286‑1 (MQ=255) tCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATG‑GATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACCGAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGTCGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTGGATTGCGTTTGTGCTGCTGATATTCCTCGGCGGGCGAATGATTATTGAGGGTTTTCGTGGCGCAGATGATGAAGATGAAGAGcc < 2:422756/289‑1 (MQ=255) cACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATG‑GATGCATTTTCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACCGAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGt < 2:1434874/182‑1 (MQ=255) cACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATG‑GATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACCGAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGt > 1:1434874/1‑182 (MQ=255) cACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATG‑GATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACCGAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTGGATTGCGTTTGTGCTGCTGATATTCCTCGGCGGGCGAATGATTATTGAGGGTTTTCGTGGCGCAGAtgatga > 1:188496/1‑276 (MQ=255) cACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATG‑GATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACCGAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTGGATTGCGTTTGTGCTGCTGATATTCCTCGGCGGGCGAATGATTATTGAGGGTTTTCGTGGCGCAGAtgatga < 2:188496/276‑1 (MQ=255) cACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATG‑GATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACCGAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTGGATTGCGTTTGTGCTGCTGATATTCCTCGGCGGGCGAATGATTATTGAGGGTTTTCGTGGCGCAGATGATGAAGATGAAGAGcc > 1:719155/1‑288 (MQ=255) cACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATG‑GATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACCGAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTGGATTGCGTTTGTGCTGCTGATATTCCTCGGCGGGCGAATGATTATTGAGGGTTTTCGTGGCGCAGATGATGAAGATGAAGAGcc > 1:1587771/1‑288 (MQ=255) tGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATG‑GATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACCGAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTGGATTGCGTTTGTGCTGCTGATATTCCTCGGCGGGCGAATGATTATTGAGGGTTTTCGTGGCGCAGATGATGAAGATGAAGAGCCgcgc < 2:12526/289‑1 (MQ=255) cTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATG‑GATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACCGAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGAt > 2:313527/1‑145 (MQ=255) cTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATG‑GATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACCGAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTGGATTGCGTTTGtgc > 1:792955/1‑213 (MQ=255) cTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATG‑GATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACCGAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTGGATTGCGTTTGTGCTGCTGATATTCCTCGGCGGGCGAATGATTATTGAGGGTTTTCGTGGCGCAg > 2:191795/1‑264 (MQ=255) aCTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATG‑GATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACCGAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTGGATTGCGTTTGTGCTGCTGATATTCCTCGGCGGGCGAATg > 1:45491/1‑237 (MQ=255) aCTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATG‑GATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACCGAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTGGATTGCGTTTGTGCTGCTGATATTCCTCGGCGGGCGAATg < 2:45491/237‑1 (MQ=255) gTTCTTCTTGCGTTTGGTATGTCGATG‑GATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACCGAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTGGATTGCGTTTGTGCTGCTGATATTCCTCGGCGGGCGAATGATTATTGAGGGTTTTCGTGGCGCAGATGATGAGGATGAAGAGCCGCGcctgcgc > 2:17589/1‑283 (MQ=255) ttcttcTTGCGTTTGGTATGTCGATG‑GATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACCGAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTGGATTGCGTTTGTGCTGCTGATATTCCTCGGCGGGCGAATGATTATTGAGGGTTTTCGTGGCGCAGATGATGAAGATGAAGAGCCGCGCCGTCGaca < 1:875133/289‑1 (MQ=255) cttcttGCGTTTGGTATGTCGATG‑GATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACCGAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTGGATTGCGTTTGCGCTGCTGCTATTCCTCGGCGGGCGAATGATTATTGAGTGTTTTCGTGGCGCCGATGATGAAGATGAAGCGCTGCGCCGACggtacg > 2:1196272/1‑284 (MQ=255) ttGCGTTTGGTATGTCGATG‑GATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACCGAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTGGATTGCGTTTGTGCTGCTGATATTCCTCGGCGGGCGAATGATTATTGAGGGTTTTCGTGGCGCAGATGATGAAGATGAAGAGCCGCGCCGTCGACACGGttt < 2:511069/289‑1 (MQ=255) tGCGTTTGGTATGTCGATG‑GATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACCGAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTGGATTGCGTTTGTGCTGCTGATATTCCTCGGCGGGCGAATGATTATTGAGGGTTTTCGTGGCGCAGATGATGAAGATGAAGAGCCGCGCCGTCGACACGGtt > 2:778717/1‑287 (MQ=255) gCGTTTGGTATGTCGATG‑GATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACCGAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTGGATTGCGTTTGTGCTGCTGATATTCCTCGGCGGGCGAATGATTATTGAGGGTTTTCGTGGCGCAgatga < 2:783573/254‑1 (MQ=255) gTTTGGTATGTCGATG‑GATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACCGAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTGGATTGCGTTTGTGCTGCTGATATTCCTCggcgggcg > 2:801157/1‑219 (MQ=255) gTTTGGTATGTCGATG‑GATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACCGAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTGGATTGCGTTTGTGCTGCTGATATTCCTCGGCGGGTGAATGATTATTGAGGGTTTTCGTGGCGCAGATGATGAAGATGAAGAGCCGCGCCGTCGACACGGTTTCTg > 1:761253/1‑288 (MQ=255) ttgggtatgtcgaTG‑GATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACCGAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTGGATTGCGTTTGTGCTGCTGATATTCCTCGGCGGGCGAATGATTATTGAGGGTTTTCGTGGCGCAGATGATGAAGATGAAGAGCCGCGCCGTCGACACGGTTTCTGGc < 1:1498182/277‑1 (MQ=255) ttGGTATGTCGATG‑GATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACCGAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTGGATTGCGTTTGTGCTGCTGATATTCCTCGGCGGGCGAATGATTATTGAGGGTTTTCGTGGCGCAGATGATGAAGATGAAGAGCCGCGCCGTCGACACGGTTTCTGGc < 1:1383483/288‑1 (MQ=255) ttGGTATGTCGATG‑GATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACCGAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTGGATTGCGTTTGTGCTGCTGATATTCCTCGGCGGGCGAATGATTATTGAGGGTTTTCGTGGCGCAGATGATGAAGATGAAGAGCCGCGCCGTCGACACGGTTTCTGGc < 1:1912968/288‑1 (MQ=255) cgaTG‑GATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACCGAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTGGATTGCGTTTGTGCTGCTGATATTCCTCGGCGGGCGAATGATTATTGAGGGTTTTCGTGGCGCAGATGATGAAGATGAAGAGCCGCGCCGTCGACACGGTTTCTGGCTACTGGTaa > 2:1357480/3‑288 (MQ=255) tG‑GATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACCGAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTGGATTGCGTTTGTGCTGCTGATATTCCTCGGCGGGCGAATGATTATTGAGGGTTTTCGTGGCGCAGATGATGAAGATGAAGAGCCGCGCCGTCGACACGGTTTCTGGCTACTGGTAacca < 1:954484/288‑1 (MQ=255) gATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACCGAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTGGATTGCGTTTGTGCTGCTGATATTCCTCGGCGGGCGAATGATTATTGAGGGTTTTCGTGGCGCAGATGATGAAGATGAAGAGCCGCGCCGTCGacac < 2:1820592/264‑1 (MQ=255) gATGCATTTGCTGCATCAATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACCGAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTGGATTGCGTTTGTGCTGCTGATATTCCTCGGCGGGCGAATGATTATTGAGGGTTTTCGTGGCGCAGATGATGAAGATGAAGAGCCGCGCCGTCGACACGGTTTCTGGCTACTGGTAaccacc > 1:858366/1‑288 (MQ=255) aTGCATTTGCTGCATCAATCAGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACCGAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCATTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGACGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTGGATTGCGTTTGTGCTGCTGATATTCCTCGGCGGGCGAATGATTATTGAGGGTTTTCGTGGCGCAGATGATGAAGATGAAGAGCCGCGCCGTCGACACGGTTTCTGGCTACTGGTAACCACcg < 2:1413356/288‑1 (MQ=255) ||| TAGCCGATTTCCAGATTCCGGAAATGTACGTGTCAACATACTCGTTGCAAAACGTGGCACGTACGGACTGAATACTTTCAGTCAGGCGAGACCATATGCACATCAATCGCTATGCCTGCATGAACGCGAAAACCATCACGGCTTGTTGTTCATGTATGCATGTTTGCTGGGGGCGATGATGTGTTTTATGGATACCCCGGTCAGGACATTGTCATGAATATCACTGCTACTGTTCTTCTTGCGTTTGGTATGAGCATG‑GATGCATTTGCTGCAAGTATCGGTAAAGGTGCCACCCTCCATAAACCGAAATTTTCTGAAGCATTGCGAACCGGCCTTATTTTTGGTGCCGTCGAAACCCTGACGCCGCTGATCGGCTGGGGAATGGGCATGTTAGCCAGCCGGTTTGTCCTTGAATGGAACCACTGGATTGCGTTTGTGCTGCTGATATTCCTCGGCGGGCGAATGATTATTGAGGGTTTTCGTGGCGCAGATGATGAAGATGAAGAGCCGCGCCGTCGACACGGTTTCTGGCTACTGGTAACCACCGCGATT > CP042583/1586138‑1586689 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |