| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP042583 | 1,597,536 | 3 bp→TCA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP042583 | 1,597,536 | 0 | A | T | 99.6% | 517.8 / NA | 223 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/1); new base T (128/93); total (129/94) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.23e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
| * | CP042583 | 1,597,537 | 0 | G | C | 99.6% | 507.5 / NA | 223 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base C (128/92); total (129/94) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.21e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.92e-01 | |||||||||||
| * | CP042583 | 1,597,538 | 0 | T | A | 100.0% | 527.1 / NA | 223 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base A (129/94); total (129/94) | |||||||||||
Only 100 of 223 total aligned reads displayed.
GGCGATGCGATAACGGGGAGCATGGTCTTTTTCTGCGTTATTGGTGCCCCGCTCATTCTGGTGACCTCCATAGCTTATTTATGGTTTGGTAACCGACTGGGAATGAATTTACGTCCGGTACTGCTGATGCTTGAGCGACTTAAAGAGTGGGTAATGCTCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGAGTCATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCCCGCTACGCCTGCGTCGCCGTCATAGTCTGCAAAAATGCTGGGCGGCGCTGTTAGCGAGTATCGTTTTATTGTTACCTGCCAACCTGTTGCCTATTTCTATCATTTATCTGAACGGAGGACGGCAGGAAGATACAAT > CP042583/1597257‑1597816 ||| ggCGATGCGATAACGGGGTCGATGGTCTTTTTCTGCGTTATTGGTGCCCCGCTCATTCTGGTGACCTCCATAGCTTATTTATGGTTTGGTAACCGACTGGGAATGAATTTACGTCCGGTACTGCTGATGCTTGAGCGACTTAAAGAGTGGGTAATGCTCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTa > 1:1085513/1‑289 (MQ=255) cgatgggatAACGGGCTCGATGGTCTTTTTCGGCGTTATTGGTGCCCCGCTCATTCTGGTGACCTCCATAGCTTATGTATGGTTTTGTAACCGACTGGGAATGAATTTACGTCCGGTACTGCTGATGCTTGAGCGACTTAAAGAGTGGGTAATGCTCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTaa < 2:1439379/288‑1 (MQ=255) cgatgcgatAACGGGGTCGATGGTCTTTTTCTGCGTTATTGGTGCCCCGCTCATTCTGGTGACCTCCATAGCTTATTTATGGTTTGGTAACCGACTGGGAATGAATTTACGTCCGGTACTGCTGATGCTTGAGCGACTTAAAGAGTGGGTAATGCTCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTaa < 1:749290/288‑1 (MQ=255) cgatgcgatAACGGGGTCGATGGTCTTTTTCTGCGTTATTGGTGCCCCGCTCATTCTGGTGACCTCCATAGCTTATTTATGGTTTGGTAACCGACTGGGAATGAATTTACGTCCGGTACTGCTGATGCTTGAGCGACTTAAAGAGTGGGTAATGCTCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAAt > 2:1752777/1‑289 (MQ=255) gatgcgatAACGGGGTCGATGGTCTTTTTCTGCGTTATTGGTGCCCCGCTCATTCTGGTGACCTCCATAGCTTATTTATGGTTTGGTAACCGACTGGGAATGAATTTACGTCCGGTACTGCTGATGCTTGAGCGACTTAAAGAGTGGGTAATGCTCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTTTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATg > 2:1371261/1‑289 (MQ=255) tgcgatAACGGGGTCGATGGTCTTTTTCTGCGTTATTGGTGCCCCGCTCATTCTGGTGACCTCCATAGCTTATTTATGGTTTGGTAACCGACTGGGAATGAATTTACGTCCGGTACTGCTGATGCTTGAGCGACTTAAAGAGTGGGTAATGCTCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTaa > 2:349321/1‑285 (MQ=255) tgcgatAACGGGGTCGATGGTCTTTTTCTGCGTTATTGGTGCCCCGCTCATTCTGGTGACCTCCATAGCTTATTTATGGTTTGGTAACCGACTGGGAATGAATTTACGTCCGGTACTGCTGATGCTTGAGCGACTTAAAGAGTGGGTAATGCTCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTc > 1:1132508/1‑289 (MQ=255) taacggagtcgaTGGTCTTTTTCTGCGTTATTGGTGCCCCGCTCATTCTGGTGACCTCCATAGCTTATTTATGGTTTGGTAACCGACTGGGAATGAATTTACGTCCGGTACTGCTGATGCTTGAGCGACTTAAAGAGTGGGTAATGCTCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCgaag < 1:1539687/277‑1 (MQ=255) tcgaTGGTCTTTTTCTGCGTTATTGGTGCCCCGCTCATTCTGGTGACCTCCATAGCTTATTTATGGTTTGGTAACCGACTGGGAATGAATTTACGTCCGGTACTGCTGATGCTTGAGCGACTTAAAGAGTGGGTAATGCTCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTggg > 2:181552/4‑289 (MQ=255) gaTGGTCTTTTTCTGCGTTATTGGTGCCCCGCTCATTCTGGTGACCTCCATAGCTTATTTATGGTTTGGTAACCGACTGGGAATGAATTTACGTCCGGTACTGCTGATGCTTGAGCGACTTAAAGAGTGGGTAATGCTCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAg < 1:1407224/288‑1 (MQ=255) cttttCTGCGTTATTGGTGCCCCGCTCATTCTGCTGACTTCCATAGCTTATTTATGGTTTGGTAACCGACTGGGAATGAAGTTACGTCCGGTACTGCTGATGCTTGTGCGTCGTAAAGAGTGGGTAATGCTCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGGTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGGGTCGGCTGGTTCTCTGTTGTGGCGTTGGTGAGTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGAtttt < 2:422551/288‑1 (MQ=255) gCGTTATTGGTGCCCCGCTCATTCTGGTGACCTCCATAGCTTATTTATGGTTTGGTAACCGACTGGGAATGAATTTACGTCCGGTACTGCTGATGCTTGAGCGACTTAAAGAGTGGGTAATGCTCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCa < 1:1212261/289‑1 (MQ=255) aTTGGTGCCCCGCTCATTCTGGTGACCTCCATAGCTTATTTATGGTTTGGTAACCGACTGGGAATGAATTTACGTCCGGTACTGCTGATGCTTGAGCGACTTAAAGAGTGGGTAATGCTCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGcc < 1:15703/289‑1 (MQ=255) ttGGTGCCCCGCTCATTCTGGTGACCTCCATAGCTTATTTATGGTTTGGTAACCGACTGGGAATGAATTTACGTCCGGTACTGCTGATGCTTGAGCGACTTAAAGAGTGGGTAATGCTCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGcc > 1:1057895/1‑288 (MQ=255) ttGGTGCCCCGCTCATTCTGGTGACCTCCATAGCTTATTTATGGTTTGGTAACCGACTGGGAATGAATTTACGTCCGGTACTGCTGATGCTTGAGCGACTTAAAGAGTGGGTAATGCTCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGcc > 1:61311/1‑288 (MQ=255) gCCCCGCTCATTCTGGTGACCTCCATAGCTTATTTATGGTTTGGTAACCGACTGGGAATGAATTTACGTCCGGTACTGCTGATGCTTGAGCGACTTAAAGAGTGGGTAATGCTCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCt < 2:603471/288‑1 (MQ=255) tCATTCTGGTGACCTCCATAGCTTATTTATGGTTTGGTAACCGACTGGGAATGAATTTACGTCCGGTACTGCTGATGCTTGAGCGACTTAAAGAGTGGGTAATGCTCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAg < 2:1590995/289‑1 (MQ=255) gTGACCTCCATAGCTTATTTATGGTTTGGTAACCGACTGGGAATGAATTTACGTCCGGTACTGCTGATGCTTGAGCGACTTAAAGAGTGGGTAATGCTCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAg < 1:621744/281‑1 (MQ=255) tGACCTCCATAGCTTATTTATGGTTTGGTAACCGACTGGGAATGAATTTACGTCCGGTACTGCTGATGCTTGAGCGACTTAAAGAGTGGGTAATGCTCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGaa > 2:836219/1‑289 (MQ=255) cATAGCTTATTTATGGTTTGGTAACCGACTGGGAATGAATTTACGTCCGGTACTGCTGATGCTTGAGCGACTTAAAGAGTGGGTAATGCTCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGt > 1:1124105/1‑271 (MQ=255) cATAGCTTATTTATGGTTTGGTAACCGACTGGGAATGAATTTACGTCCGGTACTGCTGATGCTTGAGCGACTTAAAGAGTGGGTAATGCTCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGt < 2:1124105/271‑1 (MQ=255) ataacatatttatGGTTTGGTAACCGACTGGGAATAAATTTACGTCCGATACAGCTGATGCTTGCGCAACTTAAAGCGTGGGTAATGCTCGATATCTTACTGGTCGACATTGGCATTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTTGTGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGCTGTGACATCTTAATGTCGAAGGACTGGGGGATCGTTGTTATCCGCAGCGACCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCttg < 2:330073/283‑1 (MQ=255) aTAGCTTATTTATGGTTTGGTAACCGACTGGGAATGAATTTACGTCCGGTACTGCTGATGCTTGAGCGACTTAAAGAGTGGGTAATGCTCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCgtg < 1:802803/289‑1 (MQ=255) ttatGGTTTGGTAACCGACTGGGAATGAATTTACGTCCGGTACTGCTGATGCTTGAGCGACTTAAAGAGTGGGTAATGCTCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCt < 2:1495645/255‑1 (MQ=255) ttatGGTTTGGTAACCGACTGGGAATGAATTTACGTCCGGTACTGCTGATGCTTGAGCGACTTAAAGAGTGGGTAATGCTCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTg > 1:1642914/1‑289 (MQ=255) gTTTGGTAACCGACTGGGAATGAATTTACGTCCGGTACTGCTGATGCTTGAGCGACTTAAAGAGTGGGTAATGCTCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTg > 1:1733361/1‑288 (MQ=255) tGGTAACCGACTGGGAATGAATTTACGTCCGGTACTGCTGATGCTTGAGCGACTTAAAGAGTGGGTAATGCTCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGGTGGTGATTTTAACGACAGTGACGTTGTTACATCTTAATGTCGACGCACTGTTGGAGAGATTGTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGAGCCAt > 1:1203806/1‑289 (MQ=255) ggTAACCGACTGGGAATGAATTTACGTCCGGTACTGCTGATGCTTGAGCGACTTAAAGAGTGGGTAATGCTCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCAtt > 1:1798709/1‑289 (MQ=255) gTAACCGACTGGGAATGAATTTACGTCCGGTACTGCTGATGCTTGAGCGACTTAAAGAGTGGGTAATGCTCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTggg < 1:552738/281‑1 (MQ=255) taCTGGGAATGAATTTACATCCGGTAATGCTGATGCTTGAGCGAATTAAAGAGTGGTTACTGCTCGATATCGACATGGTCTGAATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCATGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGACCTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCgg < 2:1270524/288‑1 (MQ=255) gtcTGGGAATGAATTTACGTCCGGTACTGCTGATGCTTGAGCGACTTAAAGAGTGGGTAATGCTCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCgg < 1:547472/287‑1 (MQ=255) gACTGGGAATGAATTTACGTCCGGTACTGCTGATGCTTGAGCGACTTAAAGAGTGGGTAATGCTCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCgg < 1:1696543/289‑1 (MQ=255) gACTGGGAATGAATTTACGTCCGGTACTGCTGATGCTTGAGCGACTTAAAGAGTGGGTAATGCTCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCgg < 1:871738/289‑1 (MQ=255) cTGGGAATGAATTTACGTCCGGTACTGCTGATGCTTGAGCGACTTAAAGAGTGGGTAATGCTCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCt < 2:1036556/289‑1 (MQ=255) gggAATGAATTTACGTCCGGTACTGCTGATGCTTGAGCGACTTAAAGAGTGGGTAATGCTCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGGCGAGGAACTTCGTGTCTTGCTTGGGTGCCATTTTa > 2:552738/1‑281 (MQ=255) ggatTTACGGCCGGTACTGCTGGTGCTTGAGCGACTTAAAGGGTGGGTAATGGTGGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATTCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGAt < 2:385182/287‑1 (MQ=255) cGGTACTGCTGATGCTTGAGCGACTTAAAGAGTGGGTAATGCTCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCCCTTTTGTGGCGTCGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACCGTGCGAGCGATCTTCTCCGCAGCGCCCCGCTACCCGTACGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTCTCCAGCTCAGCCTGGTc > 1:278173/1‑288 (MQ=255) aCTGCTGATGCTTGAGCGACTTAAAGGGTGGGTAATGCTCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGc < 1:495774/289‑1 (MQ=255) ctgATGCTTGAGCGACTTAAAGAGTGGGTAATGCTCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCcgc > 1:78404/1‑289 (MQ=255) ctgATGCTTGAGCGACTTAAAGAGTGGGTAATGCTCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCcgc > 1:921494/1‑289 (MQ=255) aTGCTTGAGCGACTTAAAGAGTGGGTAATGCTCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGtt > 1:641520/1‑289 (MQ=255) gCTTGAGCGACTTAAAGAGTGGGTAATGCTCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGAACAGCGTGGTGGCTTCCGGCGTTg > 2:1058941/1‑288 (MQ=255) gCTTGAGCGACTTAAAGAGTGGGTAATGCTCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGGCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTg > 1:204131/1‑288 (MQ=255) aCTTAAAGAGTGGGTAATGCTCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACCTCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGCTTTTACCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCCGGCTGGGGGGCCATTTTACCGTCTATCCAGATCGGCGGTGTCGCCGCCCGCGGTTCCTTATccc > 2:505137/1‑288 (MQ=255) gggTAATGCTCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCCCGCTACGCCTGCg > 1:698831/1‑289 (MQ=255) gggTAATGCTCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCCCGCTACGCCTGCg > 1:257466/1‑289 (MQ=255) gggTAATGCTCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGGGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCCCGCTACCCCtcc > 2:1021197/1‑286 (MQ=255) gggTAATGCTCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGGTTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTAGCCCGACCAGCGTGGTAGCTGCCCGGGTTTCCCTATCCCGCTACGCCTGc > 2:1254847/1‑288 (MQ=255) ggTAATGCTCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTACTGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGGGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTTGTCGCTGCCCGCGTTTCCATCTCCGGCTACGCCTGCg > 2:902531/1‑288 (MQ=255) ggTAATGCTCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCCCGCTACGCCTGCg > 1:348358/1‑288 (MQ=255) ggTAATGCTCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCCCGCTACGCCTGCg > 1:1906835/1‑288 (MQ=255) gTAATGCTCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCCCGCTACGCCTGCGt < 1:1288512/288‑1 (MQ=255) gTAATGCTCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCCCGCTACGCCTGCGt < 1:1371261/288‑1 (MQ=255) gTAATGCGTGATATCTACCTGGTCGGCATTGTCGTTGCTTCTATAAAGGGACAGGATTATTCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACAACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCCCGCTACGCCTGCGt < 2:214879/288‑1 (MQ=255) aaTGCTCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCCCGCTACGCCTGCGTCg < 2:641520/288‑1 (MQ=255) tGCTCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCCCGCTACGCCTGCGTCGCCg > 1:396157/1‑289 (MQ=255) gATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGCAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATACCCCGCTACGCCTGGCTCGCCGTcgtt > 2:846670/1‑286 (MQ=255) cTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCCCGCTACGCCTGCGTCGCCGGCATAGTCt > 1:1750889/1‑288 (MQ=255) gTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCCCGCTACGCCTGCGTCGCGGGCATAGTCTGCAAAAAt > 1:846212/1‑289 (MQ=255) gTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATAAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATTTCCCGCTACGCCTGCGTCCCCGTCGTAGTCTTCAAAAAt > 2:964383/1‑289 (MQ=255) ggCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCCCGCTACGCCTGCGTCGCCGTCATAGTCTGCAAAAATGCTGggcgg < 2:698831/289‑1 (MQ=255) gCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCCCGCTACGCCTGCGTCCCCGTCTTAGTCTGTAAAAATGCTGGGCGGCGCTGt > 2:121699/1‑289 (MQ=255) tataAAGGTACAGGTTTATGCACATATCCAGGCCGGTGTCGGTTTGTTCTCTTTCGTGGCGTAGGTGATTTTAACGCCGGTGACGTTGTCACCTCTTAATGTTGCAGAACTGTGGGCGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGACACTTCGTGTACGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGTTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGACTGCGTTACCATATCTCGCTACGCCTGCGTCGTTGTCCTCGTCTGCCATAATGATGGTCGGCTTTGTTcgcg > 2:1304355/1‑289 (MQ=255) tataAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTTGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGCTGCCATATCCCCCTACGCCTGCGTCGCCGTCCTAGTCTGCAAAAATGCCGCGCGGCGCTTGTAGc > 2:1029875/1‑288 (MQ=255) ataAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCCCGCTACGCCTGCGTCGCCGTCATAGTCTGCAAAAATGCTGGGCGGCGCTGTTAGCg > 1:1765954/1‑288 (MQ=255) aaGGTATAAGGTTATGCCCAGATCCAGGCTGGGGTCGGTTTGTGCTCTTTTGTGGCGGTGGTGATTTTAACGACGGTGCCGTTGTCACATCGTAATGTCGAAGAGCTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCCCGCTACGCCTGCGTCGCCGTCATAGTCTGCAAAAATGCTGGGCGGCGCTGTTAGCgtcaa < 2:1524561/289‑5 (MQ=255) cAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCgaag < 1:1612591/97‑1 (MQ=255) cAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCCCGCTACGCCTGCGTCGCCGTCATAGTCTGCAAAAATGCTGGGCGGCGCTGTTAGCGTCAATCGttt > 1:1422409/1‑289 (MQ=255) aTGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCCCGCTACGCCTGCGTCGCCGTCATAGTCTGCAAAAATGCTGGGCGGCGCTGTTAGCGTCAATCGTTTTATTGtt > 1:1822189/1‑289 (MQ=255) tGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGCAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCCTATCCCGCTACGCCTGCGTCGCCGTCATAGTCTGCAAAAATGCGTGCCGGCGCTGTTGGCGGCCATCGTTTTATTGCTa > 2:1511405/1‑289 (MQ=255) tGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGGACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCCCGCTACGCCTGCGTCGCCGTCATAGTCTGCAAAAATGCTGGGCGGCGCTGTTAGCGTCAATCGTTTTATTGtt > 2:610584/1‑288 (MQ=255) tGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTggg < 2:1710640/160‑1 (MQ=255) tGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGc < 2:1631930/199‑1 (MQ=255) tGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGc > 1:1631930/1‑199 (MQ=255) tGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCTGCGTTGCCATATCCCGCTACGCCTGCGTCGCCGTCATAGTCTGCAAAAATGCTGGGCGGCGCTGTGAGCGTCAATCGTTTTAtcttt > 1:1515517/1‑284 (MQ=255) tGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCCCGCTACGCCTGCGTCGCCGTCATAGTCTGCAAAAATGCTGGGCGGCGCTGTTAGCGTCAATCGTTTTATTGtt > 1:324779/1‑288 (MQ=255) tGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCCCGCTACGCCTGCGTCGCCGTCATAGTCTGCAAAAATGCCGGGCGGCGCGGTTAGCGCCAATCGTTTTTTTgct > 2:1863623/1‑286 (MQ=255) atatCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCCCGCTACGCCTGCGTCGCCGTCCTAGTCTGCCAAAATGCTTGGCGGCGCTTGTAGCGTCAATCGTTTTTTTGTTActgt > 2:1945894/1‑285 (MQ=255) atatCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCCCGCTACGCCTGCGTCGCCGTCATAGTCTGCAAAAATGCTGGGCGGCGCTGTTAGCGTCAATCGTTTTATTGTTACCTg > 1:824811/1‑288 (MQ=255) tatCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCCCGCTACGCCTGCGTCGCCGTCATAGTCTGCAAAAATGCTGGGCGGCGCTGTTAGCGTCAATCGTTTTATTGTTACCTGcc < 1:999032/289‑1 (MQ=255) atCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGCCGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCCCGCTACGCCTGCGTCGCCGTCATAGTCTGCAAAAATGCTGTGCGGCGCTGTTAGCGTCAATCGTTTTATTGTTACCTGCCa < 1:1586554/289‑1 (MQ=255) atCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCCCGCTACGCCTGCGTCGCCGTCATAGTCTGCAAAAATGCTGGGCGGCGCTGTTAGCGTCAATCGTTTTATTGTTACCTGCCa > 2:402301/1‑289 (MQ=255) gCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCCCGCTACGCCTGCGTCGCCGTCATAGTCTGCAAAAATGCTGGGCGGCGCTGTTAGCGTCAATCGTTTTATTGTTACCTGCCAACCTGt > 1:1236587/1‑289 (MQ=255) gCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCCCGCTACGCCTGCGTCGCCGTCATAGTCTGCAAAAATGCTGGGCGGCGCTGTTAGCGTCAATCGTTTTATTGTTACCTGCCAACCTGt > 1:10030/1‑289 (MQ=255) cTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCCCGCTACGCCTGCGTCGCCGTCATAGTCTGCAAAAATGCTGGGCGGCGCTGTTAGCGTCAATCGTTTTATTGTTACCTGCCAACCTg < 1:1394731/287‑1 (MQ=255) tgtCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCTCGCGTTGCCATATCCCGCTACGCCTGCGTCGCCGTCATAGTCTGCAAAAATGCTGGGCGGCGCTGTTAGCGTCAATCGTTTTATTGTTACCTGCCAACCTGTTGcc > 2:471337/1‑288 (MQ=255) tgtCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCCCGCTACGCCTGCGTCGCCGTCATAGTCTGCAAAAATGCTGGGCGGCGCTGTTAGCGTCAATCGTTTTATTGTTACCTGCCAACCTGTTGCCt > 1:1495496/1‑289 (MQ=255) gTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCCCGCTACGCCTGCGTCGCCGTCATAGTCTGCAAAAATGCTGGGCGGCGCTGTTAGCGTCAATCGTTTTATTGTTACCTGCCAACCTGTTGCCTATTTCTATc > 2:618390/1‑289 (MQ=255) ttCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCCCGCTACGCCTGCGTCGCCGTCATAGTCTGCAAAAATGCTGGGCGGCGCTGTTAGCgtcaa > 2:707907/1‑243 (MQ=255) tgGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCCCGCTACGCCTGCGTCGCCGTCATa > 1:458117/1‑201 (MQ=255) tgGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCCCGCTACGCCTGCGTCGCCGTCATAGTCTGCAAAAATGCTGggcgg > 2:1473219/1‑222 (MQ=255) ggCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCCCGCTACGCCTGCGTCGCCGTCATAGTCTGCAAAAATGCTGGGCGGCGCTGTTAGCGTCAATCGTTTTATTGTTACCTGCCAACCTGTTGCCTATTTCTATCATTTATCTGaa < 2:1236587/288‑1 (MQ=255) ggCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCCCGCTACGCCTGCGTCGCCGTCATAGTCTGCAAAAATGCTGGGCGGCGCTGTTAGCGTCAATCGTTTTATTGTTACCTGCCAACCTGTTGCCTATTTCTATCATTTATCTGaa < 2:771266/288‑1 (MQ=255) ttGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCCCGCTACGCCTGCGTCGCCGTCATAGTCTGCAAAAATGCTGGGCGGCGCTGTTAGCGTCAATCGTTTTATTGTTACCTGCCAACCTGTTGCCTATTTCTATCATTTATCTGAACggag > 1:367261/1‑289 (MQ=255) tGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCCCGCTACGCCTGCGTCGCCGTCATAGTCTGCAAAAATGCTGGGCGGCGCTGTTAGCGTCAATCGTTTTATTGTTACCTGCCAACCTGTTGCCTATTTCTATCATTTATCTGAACggag < 1:618390/288‑1 (MQ=255) gATTTTAACGACGGTGACGGTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCCCGCTACGCCTGCGTCGCCGTCATAGTCTGCAAAAATGCTGGGCGGCGCTGTTAGCGTCAATCGTTTTATTGTTACCTGCCAACCTGTTGCCTATTTCTATCATTTATCTGAACGGAGGACgg < 2:283681/289‑1 (MQ=255) ttAGCGACGTTTACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGAGGCGATTTTATCCGCACGGCCCGGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCGTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTGGCCATATCCCGCTACGCCTGCGTCGCCGTCATAGTCTGCAAAAATGCTGGGCGGCGCTGTTAGCGTCAATCGTTTTATTGTTACCTGCCAACCTGTTGCCTATTTCTATCATTTATCTGAACGGAGGACGGCAgg < 2:1651210/289‑1 (MQ=255) tAACGACGGTGACGTGTTCACATCTTAATGTCGAAGACCTGTGGGGGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCCCGCTACGCCTGCGTCGCCGTCATAGTCTGCAAAAATGCTGGGCGGCGCTGTTAGCGTCAATCGTTTTATTGTTACCTGCCAACCTGTTGCCTATTTCTATCATTTATCTGAACGGAGGACGGCAGGa < 2:1919391/289‑1 (MQ=255) cgacgGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCCCGCTACGCCTGCGTCGCCGTCATAGTCTGCACAAATGCTGGGCGGCGCTGTTAGCGTCAATCGTTTTATTGTTACCTGCCAACCTGTTGCCTATTTCTATCATTTATCTGAACCGAGGACGGCAggtc > 2:1384696/1‑285 (MQ=255) cgacgGTGACGTTGTCACATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCCCGCTACGCCTGCGTCGCCGTCATAGTCTGCAAAAATGCTGGGCGGCGCTGTTAGCGTCAATCGTTTTATTGTTACCTGCCAACCTGTTGCCTATTTCTATCATTTATCTGAACGGAGGACGGCAGGAAGa > 2:458082/1‑289 (MQ=255) ||| GGCGATGCGATAACGGGGAGCATGGTCTTTTTCTGCGTTATTGGTGCCCCGCTCATTCTGGTGACCTCCATAGCTTATTTATGGTTTGGTAACCGACTGGGAATGAATTTACGTCCGGTACTGCTGATGCTTGAGCGACTTAAAGAGTGGGTAATGCTCGATATCTACCTGGTCGGCATTGGCGTTGCTTCTATAAAGGTACAGGATTATGCCCATATCCAGGCTGGTGTCGGCTTGTTCTCTTTTGTGGCGTTGGTGATTTTAACGACGGTGACGTTGAGTCATCTTAATGTCGAAGAACTGTGGGAGCGATTTTATCCGCAGCGCCCCGCTACGCGTAGGGACGAGAAACTTCGTGTCTGTCTTGGGTGCCATTTTACCGGCTATCCAGATCAGCGTGGTCGCTGCCCGCGTTGCCATATCCCGCTACGCCTGCGTCGCCGTCATAGTCTGCAAAAATGCTGGGCGGCGCTGTTAGCGAGTATCGTTTTATTGTTACCTGCCAACCTGTTGCCTATTTCTATCATTTATCTGAACGGAGGACGGCAGGAAGATACAAT > CP042583/1597257‑1597816 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |