| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP042583 | 1,599,117 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP042583 | 1,599,117 | 0 | A | T | 100.0% | 576.0 / NA | 244 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base T (142/102); total (142/102) | |||||||||||
| * | CP042583 | 1,599,118 | 0 | G | C | 99.2% | 572.6 / NA | 244 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base C (141/101); minor base A (1/1); total (142/102) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| * | CP042583 | 1,599,119 | 0 | C | G | 99.6% | 568.5 / NA | 244 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base G (140/102); total (142/102) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.97e-01 | |||||||||||
Only 100 of 244 total aligned reads displayed.
TGATGTCCTGATCGAGCGGCGTTTTACCGATCTGGTGAAAAAAGGTAGCCGTTTCTGGAACGTTTCCGGCGTTGATGCCAACGTCAGT‑ATCAGTGGCGCGAAGGTGAAACTGGAAAGCCTGGCGGCACTGGTTAACGGTGCGATTGCCTTCGATAGTCCAGAAGAGAGCAAACCTGCCGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGTAATAATAAAACTGGAACTGCCGAGTGGGGCCGGATTAACCGCCGACAGCACGCCGTTAATGTATCAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAGGGGAAAT‑GACCGTTGATCCCAGCG‑TCGTTACCCTGCTTC‑GTGAAAATACCCGCATCGAATTACGCAACCCGAAATTATCCCTTAGCGATGCTAATCTCAGCGCCCTGCTGACCGGCAAAACCTTCGAGCTGGTGCCCGGCGATGGCGAGCCACGCAAAGAGTTCGTTGTTGTGCCAGGCGAAAAAGCACTGCTGCATGAA > CP042583/1598837‑1599395 ||| tgatGTCCTGATCGAGCGGCGTTTTACCGATCTGGTGAAAAAAGGTAGCCGTTTCTGGAACGTTTCCGGCGTTGATGCCAACGTCAGT‑ATCAGTGGCGCGAAGGTGAAACTGGAAAGCCTGGCGGCACTGGTTAACGGTGCGATTGCCTTCGATTCACCAGAAGAGTCGAAACCTGCCGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCACACAGCCAGCGTGGCGTAATAATAAAACTGGAACTGCCGAGTTGGGCCGGATTAACCGCCGACTCGACGCCg > 2:813560/1‑289 (MQ=255) aTCGAGCGGCGTTTTACCGATCTGGTGAAAAAAGGTAGCCGTTTCTGGAACGTTTCCGGCGTTGATGCCAACGTCAGT‑ATCAGTGGCGCGAAGGTGAAACTGGAAAGCCTGGCGGCACTGGTTAACGGTGCGATTGCCTTCGATTCACCAGAAGAGTCGAAACCTGCCGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGTAATAATAAAACTGGAACTGCCGAGTGGGGCCGGATTAACCGCCGACTCGACGCCGTTAATGTAt > 1:1008651/1‑288 (MQ=255) ttggttGAAAAAAGGTGGCCGTTTCTGGAACGGTTCCGGCGTTGATGCCAACGTCAGT‑ATCAGTGGAGCGAAGGTGAAACTGGAAAGCCTGGCGGCACTGGTTAACGGTGCGATTGCCTTCGATTCACCAGAAGATTCGAAACCTGCCGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGTAATAATAAAACTGGAACTGCCGAGTGGGGCCGGATTAACCGCCGACTCGACGCCGTTAATGTATCAGGTGCTGGAAGTCGGACa < 2:725090/283‑1 (MQ=255) aaaaaaGGTAGCCGTTTCTGGGACGTTTCCGGCGTTGATGCCAACGTCAGT‑ATCAGTGGCGCGAAGGTGAAACTGGAAAGCCTGGCGGCACTGGTTAACGGTGCGATTGCCTTCGATTCACCAGAAGAGTCGAAACCTGCCGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGTAATAATAAAACTGGAACTGCCGAGTGGGGCCGGATTAACCGCCGACTCGACGCCGTTAATGTATCAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACt < 2:884251/288‑1 (MQ=255) aaGGTAGCCGTTTCTGGAACGTTTCCGGCGTTGATGCCAACGTCAGT‑ATCAGTGGCGCGAAGGTGAAACTGGAAAGCCTGGCGGCACTGGTTAACGGTGCGATTGCCTTCGATTCACCAGAAGAGTCGAAACCTGCCGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGTAATAATAAAACTGGAACTGCCGAGTGGGGCCGGATTAACCGCCGACTCGACGCCGTTAATGTATCAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACt < 2:21590/289‑1 (MQ=255) tCTGGAACGTTTCCGGCGTTGATGCCAACGTCAGT‑ATCAGTGGCGCGAAGGTGAAACTGGAAAGCCTGGCGGCACTGGTTAACGGTGCGATTGCCTTCGATTCACCAGAAGAGTCGAAACCTGCCGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGTAATAATAAAACTGGAACTGCCGAGTGGGGCCGGATTAACCGCCGACTCGACGCCGTTAATGTATCAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAAt > 1:1565338/1‑287 (MQ=255) aaCGTTTCCGGCGTTGATGCCAACGTCAGT‑ATCAGTGGCGCGAAGGTGAAACTGGAAAGCCTGGCGGCACTGGTTAACGGTGCGATTGCCTTCGATTCACCAGAAGAGTCGAAACCTGCCGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGTAATAATAAAACTGGAACTGCCGAGTGGGGCCGGATTAACCGCCGACTCGACGCCGTTAATGTATCAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCtggt < 1:711810/288‑1 (MQ=255) gTTTGCGGGGGTGATGCCAACGT‑AGTGATAAGTGGGGCGAAGGTGAAACTGGAAAGCCTGGCGGCACTGGTTAACGGTGCGATTGCCTTCGATTCACCAGAAGGGTCGAAACCTGACGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGTAATAATAAAACTGGAACTGCCGAGTGGGGCCGGATTAACCGCCGACTCGACGCCGTTAATGTATCAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTggtggt < 2:1742673/288‑1 (MQ=255) tttCCGGCGTTGATGCCAACGTCAGT‑ATCAGTGGCGCGAAGGTGAAACTGGAAAGCCTGGCGGCACTGGTTAACGGTGCGATTGCCTTCGATTCACCAGAAGAGTCGAAACCTGCCGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGTAATAATAAAACTGGAACTGCCGAGTGGGGCCGGATTAACCGCCGACTCGACGCCGTTAATGTATCAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTaa > 1:1542843/1‑289 (MQ=255) tttCCGGCGTTGATGCCAACGTCAGT‑ATCAGTGGCGCGAAGGTGAAACTGGAAAGCCTGGCGGCACTGGTTAACGGTGCGATTGCCTTCGATTCACCAGAAGAGTCGAAACCTGCCGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGTAATAATAAAACTGGAACTGCCGAGTGGGGCCGGATTAACCGCCGACTCGACGCCGTTAATGTATCAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTaa > 1:936857/1‑289 (MQ=255) ccGGCGTTGATGCCAACGTCAGT‑ATCAGTGGCGCGAAGGTGAAACTGGAAAGCCTGGCGGCACTGGTTAACGGTGCGATTGCCTTCGATTCACCAGAAGAGTCGAAACCTGCCGAGGCGGAAGATACCTTTGGTATGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGTAATAATAAAACTGGAACTGCCGAGTGGGGCCGGATTAACCGCCGACTCGACGCCGTTAATGTATCAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGt < 1:1296644/289‑1 (MQ=255) ggCGTTGATGCCAACGGCAGT‑ATCAGTGGCGCGAAGGTGAAACTTGAAAGCCTGGCGGCACTGGTTAACGGTGCGATTGCCTTCGATTCACCAGAAGAGTCGAAACCTGCCGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGTAATAATAAAACTGGAACTGCCGAGTGGGGCCGGATTAACCGCCGACTCGACGCCGTTAATGTATCAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTca < 1:145437/289‑1 (MQ=255) gATGCCAACGTCAGT‑ATCAGTGGCGCGAAGGTGAAACTGGAAAGCCTGGCGGCACTGGTTAACGGTGCGATTGCCTTCGATTCACCAGAAGAGTCGAAACCTGCCGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGTAATAATAAAACTGGAACTGCCGAGTGGGGCCGGATTAACCGCCGACTCGACGCCGTTAATGTATCAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAgggg > 1:1655075/1‑289 (MQ=255) gATGCCAACGTCAGT‑ATCAGTGGCGCGAAGGTGAAACTGGAAAGCCTGGCGGCACTGGTTAACGGTGCGATTGCCTTCGATTCACCAGAAGAGTCGAAACCTGCCGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGTAATAATAAAACTGGAACTGCCGAGTGGGGCCGGATTAACCGCCGACTCGACGCCGTTAATGTATCAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAgggg > 1:1916049/1‑289 (MQ=255) cAACGTCAGT‑ATCAGTGGCGCGAAGGTGAAACTGGAAAGCCTGGCGGCACTGGTTAACGGTGCGATTGCCTTCGATTCACCAGAAGAGTCGAAACCTGCCGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGTAATAATAAAACTGGAACTGCCGAGTGGGGCCGGATTAACCGCCGACTCGACGCCGTTAATGTATCAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAGGGGAAAt < 1:637097/288‑1 (MQ=255) aaCGTCAGT‑ATCAGTGGCGCGAAGGTGAAACTGGAAAGCCTGGCGGCACTGGTTAACGGTGCGATTGCCTTCGATTCACCAGAAGAGTCGAAACCTGCCGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGTAATAATAAAACTGGAACTGCCGAGTGGGGCCGGATTAACCGCCGACTCGACGCCGTTAATGTATCAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAGGGGAAAT‑Ga < 2:1519411/289‑1 (MQ=255) cGTCAGT‑ATCAGTGGCGCGAAGGTGAAACTGGAAAGCCTGGCGGCACTGGTTAACGGTGCGATTGCCTTCGATTCACCAGAAGAGTCGAAACCTGCCGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGTAATAATAAAACTGGAACTGCCGAGTGGGGCCGGATTAACCGCCGACTCGACGCCGTTAATGTATCAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTca > 1:498080/1‑275 (MQ=255) cGTCAGT‑ATCAGTGGCGCGAAGGTGAAACTGGAAAGCCTGGCGGCACTGGTTAACGGTGCGATTGCCTTCGATTCACCAGAAGAGTCGAAACCTGCCGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGTAATAATAAAACTGGAACTGCCGAGTGGGGCCGGATTAACCGCCGACTCGACGCCGTTAATGTATCAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTca < 2:498080/275‑1 (MQ=255) cAGT‑ATCGGTGGCGGGAAGGTGAAACTGGAAAGCCTGGGGGCACTGGTTAACGGTGCGATTGCCTTCGATTCACCAGAAGAGTCGAAACCTGCCGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGTAATAATAAAACTGGAACTGCCGAGTGGGGCCGGATTAACCGCCGACTCGACGCCGTTAATGTATCAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAGGGGAAAT‑GACCGtt < 2:1372138/289‑1 (MQ=255) cAGT‑ATCAGTGGGGCGAAGGGGAAACTGGAAAGCCTGGCGGCACTGGTTAACGGAGCGATTGCCTTCGATTCACCAGAAGAGTCGAAACCTGCCGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGTAATAATAAAACTGGAACTGCCGAGTGGGGCCGGATTAACCGCCGACTCGACGCCGTTAATGTATCAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAGGGGAAAT‑GACCGt < 2:145442/288‑1 (MQ=255) aTCAGTGGCGCGAAGGTGAAACTGGAAAGCCTGGCGGCACTGGTTAACGGTGCGATTGCCTTCGATTCACCAGAAGAGTCGAAACCTGCCGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGTAATAATAAAACTGGAACTGCCGAGTGGGGCCGGATTAACCGCCGACTCGACGCCGTTAATGTATCAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAGGGGAAAT‑GACCGTTGAt < 1:40433/288‑1 (MQ=255) gaggggctaaGGTACAACTGAAAGACCGGGCGGCCATGGTTAACGGTGCGATTGCCTTCGGTGAACCAGACGAGTCGACACCTGCCGAGAGGGAAGATACCTTTGGTCTGTCTGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGTAATAATAAAACTGGAACTGCCGAGTGGGGCCGGATTAACCGCCGACTCGACGCCGTTAATGTATCAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAGGGGAAAT‑GACCGTTGATCCCAg < 2:1193838/281‑1 (MQ=255) gTGGCGCGAAGGTGAAACTGGAAAGCCTGGCGGCACTGGTTAACGGTGCGATTGCCTTCGATTCACCAGAAGAGTCGAAACCTGCCGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGTAATAATAAAACTGGAACTGCCGAGTGGGGCCGGATTAACCGCCGACTCGACGCCGTTAATGTATCAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAGGGGAAAT‑GACCGTTGATCCCa > 1:38666/1‑288 (MQ=255) gTGGCGCGAAGGTGAAACTGGAAAGCCTGGCGGCACTGGTTAACGGTGCGATTGCCTTCGATTCACCAGAAGAGTCGAAACCTGCCGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGTAATAATAAAACTCGAACTGCCGAGTGGGGCCGGATTAACCGCCGACTCGACGCCGTTAATGTATCAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAGGGGAAAT‑GACCGTTGATGCCa > 1:1900646/1‑288 (MQ=255) gggCGCGAAGGTGGAACCGGAAAGCCTGGCGGCACTGGTTAACGGTGCGATTGCCGTCGATTCACCAGAAGGGTCGAAACCTGCCGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGTAATAATAAAACTGGAACTGCCGAGTGGGGCCGGATTAACCGCCGACTCGACGCCGTTAATGTATCAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAGGGGAAAT‑GACCGTTGATCCCAg < 2:1008651/287‑1 (MQ=255) gcgcGAAGGTGAAACTGGAAAGCCTGGCGGCACTGGTTAACGGTGCGATTGCCTTCGATTCACCAGAAGAGTCGAAACCTGCCGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGTAATAATAAAACTGGAACTGCCGAGTGGGGCCGGATTAACCGCCGACTCGACGCCGTTAATGTATCAGGGGCTGGCAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGCTTCAAATCATGGAGGTAAAGTCACAGGGGAAAA‑GACCGTTTATCCCAGcc > 2:369917/1‑287 (MQ=255) gcgcGAAGGTGAAACTGGAAAGCCTGGCGGCACTGGTTAACGGTGCGATTGCCTTCGATTCACCAGAAGAGTCGAAACCTGCCGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGTAATAATAAAACTGGAACTGCCGAGTGGGGCCGGATTAACCGCCGACTCGACGCCGTTAATGTATCAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAGGGGAAAT‑GACCGTTGATCCCAGcg > 2:168179/1‑288 (MQ=255) ggcgagggtaaccgggACAGCCGTGCGGCACTGGTTAACGTGTCGATTGGCTTCGATTCACCAGAAGAGTCGAAACCTGCCGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCAAAGCCGGCGTGGCGTAATAATAAAACGGGAACTGCCGAGTGGGGCCGGATTAACCGCCGACTCGACGCCGTTAATGTATCCGGGGCTGGCAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAGGGGAAAT‑GACCGTTGATCCCAGcg‑tcg < 2:15908/275‑1 (MQ=255) cgAAGGTGAAACTGGAAAGCCTGGCGGCACTGGTTAACGGTGCGATTGCCTTCGATTCACCAGAAGAGTCGAAACCTGCCGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGTAATAATAAAACTGGAACTGCCGAGTGGGGCCGGATTAACCGCCGACTCGACGCCGTTAATGTATCAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAGGGGAAAT‑GACCGTTGATCCCAGcg‑tcg < 1:330699/288‑1 (MQ=255) gTGAAACGGGAAAGCCTGGCGGCACTGGTTAACGGTGCGATTGCCTTCGATTCACCAGAAGAGTCGAAACCTGCCGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGTAATAATAAAACTGGAACTGCCGAGTGGGGCCGGATTAACCGCCGACTCGACGCCGTTAATGTATCAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAGGGGAAAT‑GACCGTTGATCCCAGCG‑TCGTTAcc < 2:19165/288‑1 (MQ=255) ccTGGCGGCACTGGTTAACGGTGCGATTGCCTTCGATTCACCAGAAGAGTCGAAACCTGCCGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGTAATAATAAAACTGGAACTGCCGAGTGGGGCCGGATTAACCGCCGACTCGACGCCGTTAATGTATCAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAGGGGAAAT‑GACCGTTGATCCCAGCG‑TCGTTACCCTGCTTC‑GTGAAAAt > 2:181661/1‑289 (MQ=255) aaCTGGTTAACGGTGCGATTGCCTTCGATTCACCAGAAGAGTCGAAACCTGCCGAGGCGGAAGATACCTTTTGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGTAATAATAAAACTGGAACTGCCGAGTGGGGCCGGATTAACCGCCGACTCGACGCCGTTAATGTATCAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAGGGGAAAT‑GACCGTTGATCCCAGCG‑TCGTTACCCTGCTTC‑GTGAAAATACCCGCa < 2:928090/287‑1 (MQ=255) cTGGTTAACGGTGCGATTGCCTTCGATTCACCAGAAGAGTCGAAACCTGCCGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGTAATAATAAAACTGGAACTGCCGAGTGGGGCCGGATTAACCGCCGACTCGACGCCGTTAATGTATCAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAGGGGAAAT‑GACCGTTGATCCCAGCG‑TCGTTACCCTGCTTC‑CTGAAAATACCCGCCTct > 2:984109/1‑288 (MQ=255) cGATTGCCTTCGATTCACCAGAAGAGTCGAAACCTGCCGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGTAATAATAAAACTGGAACTGCCGAGTGGGGCCGGATTAACCGCCGACTCGACGCCGTTAATGTATCAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCTGGGTGG‑AAAGGTACAAGGGAAATGGACGGTTGAT‑CCAGCGTTGGTTACCC‑GCTTCGGTGAAATAACCGGCACGAAATTAGGAAAccg > 1:1195966/1‑288 (MQ=255) cGATTGCCTTCGATTCACCAGAAGAGTCGAAACCTGCCGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGTAATAATAAAACTGGAACTGCCGAGTGGGGCCGGATTAACCGCCGACTCGACGCCGTTAATGTATCAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAGGGGAAAT‑GACCGTTGATCCCAg < 1:1235802/241‑1 (MQ=255) cGATTGCCTTCGATTCACCAGAAGAGTCGAAACCTGCCGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGTAATAATAAAACTGGAACTGCCGAGTGGGGCCGGATTAACCGCCGACTCGACGCCGTTAATGTATCAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAGGGGAAAT‑GACCGTTGATCCCAGcg‑t < 1:1829207/244‑1 (MQ=255) cGATTGCCTTCGATTCACCAGAAGAGTCGAAACCTGCCGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGTAATAATAAAACTGGAACTGCCGAGTGGGGCCGGATTAACCGCCGACTCGACGCCGTTAATGTATCAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAGGGGAAAT‑GACCGTTGATCCCAGCG‑TCGTTACCCTGCTTC‑GTGAAAATACCCGCATCGAATTACGCAAccc > 1:96400/1‑289 (MQ=255) gATTGCCTTCGATTCACCAGAAGAGTCGAAACCTGCCGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGTAATAATAAAACTGGAACTGCCGAGTGGGGCCGGATTAACCGCCGACTCGACGCCGTTAATGTATCAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAGGGGAAAT‑GACCGTTGATCCCAGCG‑TCGTTACCCTGCTTC‑GTGAAAATACCCGCATCGAATTACGCAAccc < 2:1103424/288‑1 (MQ=255) cTTCGATTCACCAGAAGAGTCGAAACCTGCCGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGTAATAATAAAACTGGAACTGCCGAGTGGGGCCGGATTAACCGCCGACTCGACGCCGTTAATGTATCAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAGGGGAAAT‑GACCGTTGATCCCAGCG‑TCGTTACCCTGCTTC‑GTGAAAATACCCGCATCGAATTACGCAACCCGAAATTa < 1:168179/289‑1 (MQ=255) ttcgattcaccAGAAGAGTCGAAACCTGCCGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGTAATAATAAAACTGGAACTGCCGAGTGGGGCCGGATTAACCGCCGACTCGACGCCGTTAATGTATCAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAGGGGAAAT‑GACCGTTGATCCCAGCG‑TCGTTACCCTGCTTC‑GTGAAAATACCCGCATCGAATTACGCAACCCGaaa > 1:254015/10‑285 (MQ=255) ccccAGAAGAGGCGAACCCGGCCGAGCCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGTCCCACAGCCAGCGTGGCGTAATAATAAAACTGGAACTGCCGAGTGGGGCCGGATTAACCGCCGACTCGACGCCGTTAATGTATCAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAGGGGAAAT‑GACCGTTGATCCCAGCG‑TCGTTACCCTGCTTC‑GTGAAAATACCCGCATCGAATTACGCAACCCGAAATTATCCCTTAg < 2:1830133/287‑1 (MQ=255) caccAGAAGAGTCGAAACCTGCCGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGAGCTGGCCAACAGCCAGCGTGGCGTAATAATAAAACTGGAACTGCCGAGTGGGGCCGGATTAACCGCCGACTCGACGCCGTTAATGTATCAGGGGCTGGAAGTCGTACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAGGGGAAAT‑GACCGTTGATCCCAGCG‑TCGTTACCCTGCTTC‑GTGAAAATACCCGCATCGAATTACGCAACCCGAAATTATCCCTTAg < 1:1167747/287‑1 (MQ=255) acccggaagagtcgaaaCCGGCCGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGGTCGGGCCCACAGCCAGCGTGGCGTAATAATAAAACTGGAACTGCCGAGTGGGGCCGGATTAACCGCCGACTCGACGCCGTTAATGTATCAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAACCTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAGGGGAAAT‑GACCGTTGATCCCAGCG‑TCGTTACCCTTCTTC‑GTGAAAATACCCGCATCGAATTACGCAACCCGAAATTATCCCTTAg < 2:261752/275‑1 (MQ=255) accAGAAGAGTCGAAACCTGCCGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGTAATAATAAAACTGGAACTGCCGAGTGGGGCCGGATTAACCGCCGACTCGACGCCGTTAATGTATCAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAGGGGAAAT‑GACCGTTGATCCCAGCG‑TCGTTACCCTGCTTC‑GTGAAAATACCCGCATCGAATTACGCAACCCGACATTATCCCTTAg > 2:1914694/2‑288 (MQ=255) ccgaaagaGTGCAACCCTGCCGAGGGGGAAGATACCTTTGGTCGGTAGGAAGATCTGGCCCGCAGCCAGCGTGGCGTAATAATAAAACTGGAACTGCCGAGTGGGGCCGGATTAACCGCCGACTCGACGCCGTTAATGTATCAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAGGGGAAAT‑GACCGTTGATCCCAGCG‑TCGTTACCCTGCTTC‑GTGAAAATACCCGCATCGAATTACGCAACCCGAAATTATCCCTTAGCg < 2:516173/285‑1 (MQ=255) ccAGAAGAGTCGAAACCTGCCGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGTAATAATAAAACTGGAACTGCCGAGTGGGGCCGGATTAACCGCCGACTCGACGCCGTTAATGTATCAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAGGGGAAAT‑GACCGTTGATCCCAGCG‑TCGTTACCCTGCTTC‑GTGAAAATACCCGCATCGAATTACGCAACCCGAAATTATCCCTTAGCg < 2:485959/289‑1 (MQ=255) cAGAAGAGTCGAAACCTGCCGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGTAATAATAAAACTGGAACTGCCGAGTGGGGCCGGATTAACCGCCGACTCGACGCCGTTAATGTATCAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAGGGGAAAT‑GACCGTTGATCCCAGCG‑TCGTTACCCTGCTTC‑GTGAAAATACCCGCATCGAATTACGCAACCCGAAATTATCCCTTAGCGa > 2:567905/1‑289 (MQ=255) agagtcgaaaCCTGCCGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATATGGCCCACAGCCAGCGTAGCGTAATAATAAAACTGGAACTGCCGAGTGGGGCCGGATTAACCGCCGACTCGACGCCGTTAATGTATCAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAGGGGAAAT‑GACCGTTGATCCCAGCG‑TCGTTACCCTGCTTC‑GTGAAAATACCCGCATCGAATTACGCAACCCGAAATTATCCCTTAGCGATg < 1:1372255/280‑1 (MQ=255) tcgaaaCCTGCCGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGTAATAATAAAACTGGAACTGCCGAGTGGGGCCGGATTAACCGCCGACTCGACGCCGTTAATGTATCAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAGGGGAAAT‑GACCGTTGATCCCAGCG‑TCGTTACCCTGCTTC‑GTGAAAATACCCGCATCGAATTACGCAACCCGAAATTATCCCTTAGCGATGCTaa > 1:1637951/4‑287 (MQ=255) tcgaaaCCTGCCGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGTAATAATAAAACTGGAACTGCCGAGTGGGGCCGGATTAACCGCCGACTCGACGCCGTTAATGTATCAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAGGGGAAAT‑GACCGTTGATCCCAGCG‑TCGTTACCCTGCTTC‑GTGAAAATACCCGCATCGAATTACGCAACCCGAAATTATCCCTTAGCGATGCTAAt > 2:1263159/4‑288 (MQ=255) aaCGTGCCGGGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACGGCCAGCGTGGCGTAATAATAAAACTGGAACTGCCGAGTGGGGCCGGATTAACCGCCGACTCGACGCCGTTAATGTATCAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAGGGGAAAT‑GACCGTTGATCCCAGCG‑TCGTTACCCTGCTTC‑GTGAAAATACCCGCATCGAATTACGCAACCCGAAATTATCCCTTAGCGATGCTAATCTCa < 2:338810/288‑1 (MQ=255) ccggCCGCGGCTGGAGGTCCCTTTGGTCACTATGAAGATCGGGCCGACAGCCAGCGTGGCGTAAGAATAAAACTGGAACTGCCTGGTGGGGCCGGATTAACCGCCGACTCGACGCCGTTCATGTATACGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAGCCTGGAGTTAAGTCATGGTGGTAAAGTCACAGGGGAAAT‑GACCGTTGCTCCCAGCG‑TCGTTACCCTGCTTC‑GTGAAAATACCCGCATCGACTTACGCAACCCGAAATTATCCCTTAGCGATGCCAATCTCAgcg < 2:303376/286‑1 (MQ=255) gCCGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGTAATAATAAAACTGGAACTGCCGAGTGGGGCCGGATTAACCGCCGACTCGACGCCGTTAATGTATCAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAGGGGAAAT‑GACCGTTGATCCCAGCG‑TCGTTACCCTGCTTC‑GTGAAAATACCCGCATCGAATTACGCAACCCGAAATTATCCCTTAGCGATGCTAATCTCAGCGcc > 1:837954/1‑288 (MQ=255) gCCGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGTAATAATAAAACTGGAACTGCCGAGTGGGGCCGGATTAACCGCCGACTCGACGCCGTTAATGTATCAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAGGGGAAAT‑GACCGTTGATCACAGCG‑TCGTTACCCTGCTTC‑GTGAAAATACCCGCATCGAATTACGCAACCCGAAATTATCCCTTAGCGCTgtatattatacaca > 1:1727512/1‑274 (MQ=255) cGGAAGAGACCTTTGGTCTGTATGAAGGTCTGGCCAACAGCCAGCGTGGCGTAATAATAAAACTGGAACTGCCGAGTGGGGCCGGATTAACCGCCGACTCGACGCCGTTAATGTATCAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAGGGGAAAT‑GACCGTTGATCCCAGCG‑TCGTTACCCTGCTTC‑GTGAAAATACCCGCATCGAATTACGCAACCCGAAATTATCCCTTAGCGATGCTAATCTCAGCGCCCTGCTGa < 1:1176239/288‑1 (MQ=255) tGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGTAATAATAAAACTGGAACTGCCGAGTGGGGCCGGATTAACCGCCGACTCGACGCCGTTAATGTATCAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAGGGGAAAT‑GACCTTTGATCCCAGCG‑TCGTTACCCTGCTTC‑CGGAAAATACCCGCATCCAATTACGCAACCCGAAATTATTCCTTACCCACTCTAATCCCATGCACCTGCTGACCGGCAAAACCtt > 2:1398736/1‑288 (MQ=255) gATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGTAATAATAAAACTGGAACTGCCGAGTGGGGCCGGATTAACCGCCGACTCGACGCCGTTAATGTATCAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTaaa < 1:578355/120‑1 (MQ=255) cTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGTAATAATAAAACTGGAACTGCCGAGTGGGGCCGGATTAACCGCCGACTCGACGCCGTTAATGTATCAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAGGGGAAAT‑GACCGTTGATCCCAGCG‑TCGTTACCCTGCTTC‑GTGAAAATACCCGCATCGAATTACGCAACCCGAACTTATCCCCTAGCGATGCTAATCCCAGCGCCCTCCTGACCGGCAAAACCTTCTAGCTGGTCCCCGGCg > 2:1674382/1‑289 (MQ=255) tGGCCCACAGCCAGCGTGGCGTAATAATAAAACTGGAACTGCCGAGTGGGGCCGGATTAACCGCCGACTCGACGCCGTTAATGTATCAGGGGCTGGAAGTCGGACAg > 1:1047023/1‑107 (MQ=255) tGGCCCACAGCCAGCGTGGCGTAATAATAAAACTGGAACTGCCGAGTGGGGCCGGATTAACCGCCGACTCGACGCCGTTAATGTATCAGGGGCTGGAAGTCGGACAg < 2:1047023/107‑1 (MQ=255) tGGCCCACAGCCAGCGTGGCGTAATAATAAAACTGGAACTGCCGAGTGGGGCCGGATTAACCGCCGACTCGACGCCGTTAATGTATCAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATcc > 1:1932077/1‑130 (MQ=255) tGGCCCACAGCCAGCGTGGCGTAATAATAAAACTGGAACTGCCGAGTGGGGCCGGATTAACCGCCGACTCGACGCCGTTAATGTATCAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCCCAGGGGAAAT‑GACCGTTGATCCCAGCG‑TCGTTACCCTGCTTC‑GTGAAAATACCCGCATCGAATTACGCAACCCGAAATTATCCCTTAGCGATGCTAATCTCCGCGCCCTGCTGACCGGCAAAACCTTCGAGCCGGTGCCCGGCgc > 2:1658088/1‑288 (MQ=255) tGGCCCACAGCCAGCGTGGCGTAATAATAAAACTGGAACTGCCGAGTGGGGCCGGATTAACCGCCGACTCGACGCCGTTAATGTATCAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAGGGGAAAT‑GACCGTTGATCCCAGCG‑TCGTTACCCTGCTTC‑GTGAAAATACCCGCATCGAATTACGCAACCCGAAATTATCCCTTAGCGATGCTAATCTCATCGCCCTGCTGACCGGCAAAACCTTCGAGCTGGTGCCCGGcca > 2:1137596/1‑287 (MQ=255) tGGCCCACAGCCAGCGTGGCGTAATAATAAAACTGGAACTGCCGAGTGGGGCCGGATTAACCGCCGACTCGACGCCGTTAATGTATCAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAGGGGAAAT‑GACCGTTGATCCCAGCG‑TCGTTACCCTGCTTC‑GTGAAAATACCCGCATCGAATTACGCAACCCGAAATTATCCCTTAGCGATGCTAATCTCAGCGCCCTGCTGACCGGCAAAACCTTCGAGCTGGTGCCCGGCGa > 2:1478403/1‑289 (MQ=255) tGGCCCACAGCCAGCGTGGCGTAATAATAAAACTGGAACTGCCGAGTGGGGCCGGATTAACCGCCGACTCGACGCCGTTAATGTATCAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAGGGGAAAT‑GACCGTTGATCCCAGCG‑TCGTTACCCTGCTTC‑GTGAAAATACCCGCATCGAATTACGCAACCCGAAATTATCCCTTAGCGATGCTAATCTCAGCGCCCTGCTGACCGGCAAAACCTTCGAGCTGGTGCCCGGCGa > 2:1847536/1‑289 (MQ=255) tGGCCCACAGCCAGCGTGGCGTAATAATAAAACTGGAACTGCCGAGTGGGGCCGGATTAACCGCCGACTCGACGCCGTTAATGTATCAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAGGGGAAAT‑GACCGTTGATCCCAGCG‑TCGTTACCCTGCTTC‑GTGAAAATACCCGCATCGAATTACGCAACCCGAAATTATCCCTTAGCGATGCTAATCTCAGCGCCCTGCTGACCGGCAAAACCTTCGAGCTGGTGCCCGGCGa > 2:622389/1‑289 (MQ=255) tGGCCCACAGCCAGCGTGGCGTAATAATAAAACTGGAACTGCCGAGTGGGGCCGGATTAACCGCCGACTCGACGCCGTTAATGTATCAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAGGGGAAAT‑GACCGTTGATCCCAGCG‑TCGTTACCCTGCTTC‑GTGAAAATACCCGCATCGAATTACGCAACCCGAAATTATCCCTTAGCGATGCTAATCTCAGCGCCCTGCTGACCGGCAAAACCTTCGAGCTGGTGCCCGGCGa > 1:19738/1‑289 (MQ=255) tGGCCCACAGCCAGCGTGGCGTAATAATAAAACTGGAACTGCCGAGTGGGGCCGGATTAACCGCCGACTCGACGCCGTTAATGTATCAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAGGGGAAAT‑GACCGTTGATCCCAGCG‑TCGTTACCCTGCTTC‑GTGAAAATACCCGCATCGAATTACGCAACCCGAAATTATCCCTTAGCGATGCTAATCTCAGCGCCCTGCTGACCGGCAAAACCTTCGAGCTGGTGCCCGGCGa > 1:729822/1‑289 (MQ=255) tGGCCCACAGCCAGCGTGGCGTAATAATAAAACTGGAACTGCCGAGTGGGGCCGGATTAACCGCCGACTCGACGCCGTTAATGTATCAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAGGGGAAAT‑GACCGTTGATCCCAGCG‑TCGTTACCCTGCTTC‑GTGAAAATACCCGCATCGAATTACGCAACCCGAAATTATCCCTTAGCGATGCTAATCTCAGCGCCCTGCTGACCGGCAAAACCTTCGAGCTGGTGCCCGGCGa > 1:1678230/1‑289 (MQ=255) tGGCCCACAGCCAGCGTGGCGTAATAATAAAACTGGAACTGCCGAGTGGGGCCGGATTAACCGCCGACTCGACGCCGTTAATGTATCAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAGGGGAAAT‑GACCGTTGATCCCAGCG‑TCGTTACCCTGCTTC‑GTGAAAATACCCGCATCGAATTACGCAACCCGAAATTATCCCTTAGCGATGCTAATCTCAGCGCCCTGCTGACCGGCAAAACCTTCGAGCTGGTCCCCGGCGa > 1:1782490/1‑289 (MQ=255) tGGCCCACAGCCAGCGTGGCGTAATAATAAAACTGGAACTGCCGAGTGGGGCCGGATTAACCGCCGACTCGACGCCGTTAATGTATCAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAGGGGAAAT‑GACCGTTGATCCCAGCG‑TCGTTACCCTGCTTC‑GTGAAAATACCCGCATCGAATTACGCAACCCGAAATTATCCCTTAGCGATGCTAATCTCAGCGCCCTGCGGACCGGCAAAACCTTCGAGCCGGTGCCCGGcca > 2:1542517/1‑287 (MQ=255) tGGCCCACAGCCAGCGTGGCGTAATAATAAAACTGGAACTGCCGAGTGGGGCCGGATTAACCGCCGACTCGACGCCGTTAATGTATCAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAGGGGAAAT‑GACCGTTGATCCCAGCG‑TCGTTACCCTGCTTC‑GTGAAAATACCCGCATCGAATTACGCAACCCGAAATTATCCCTTAGCGATGCTAATCCCAGCGCCCTGCTGACCGGCAAAACCTTCCAGCTGGTTCCCGGcca > 2:784362/1‑287 (MQ=255) tGGCCCACAGCCAGCGTGGCGTAATAATAAAACTGGAACTGCCGAGTGGGGCCGGATTAACCGCCGACTCGACGCCGTTAATGTATCAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAGGGGAAAT‑GACCGTTGATCCCAGCG‑TCGTTACCCTGCTTC‑GTGAAAATACCCGCATCGAATTACGCAACCCGAAA‑TATCCCTTAGCGATGCTAATCTCAGCGCCCTGCTGACCGGCAAAACCTTCGAGCTGGTGCCCGGCGAt > 1:294990/1‑289 (MQ=255) tGGCCCACAGCCAGCGTGGCGTAATAATAAAACTGGAACTGCCGAGTGGGGCCGGATTAACCGCCGACTCGACGCCGTTAATGTATCAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAGGGGAAAT‑GACCGTTGATCCCAGCG‑TCGTTACCCTGCTTC‑GTGAAAATACACGCATCGAATTACGCAACCCGAAATTATCCCTTAGCGATGCTAATCTCAGCGCCCTGCTGACCGGCAAAACCTTCACCCTGGTGCCGCGCGa > 2:900578/1‑289 (MQ=255) tGGCCCACAGCCAGCGTGGCGTAATAATAAAACTGGAACTGCCGAGTGGGGCCGGATTAACCGCCGACTCGACGCCGTTAATGTATCAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAGGGGAAAT‑GACCGTTGATCCCAGCG‑TCGTTACCCTGCTTC‑GTG‑AAATACCCGCATCGAATTACGCAACCCGAAATTATCCCTTAGCGATGCTAATCTCAGCGCCCTGCTGACCGGCAAAACCTTCGAGCTGGTGCCCGGCGAt > 1:443012/1‑289 (MQ=255) tGGCCCACAGCCAGCGTGGCGTAATAATAAAACTGGAACTGCCGAGTGGGGCCGGATTAACCGCCGACTCGACGCCGTTAATGTATCAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAGGGGAAAT‑GACCGTTGATCCCAGCG‑TCGGTACCCTTCTTC‑GTCAAAATACCCGCATCGAATTACGCAACCCGAAATTATCCCTTAGCGATGCTAATCACAGCGCCCTGTTGACCGGCAAAACCTTCGACCTGGTGCCCGGCGa > 2:1644861/1‑289 (MQ=255) tGGCCCACAGCCAGCGTGGCGTAATAATAAAACTGGAACTGCCGAGTGGGGCCGGATTAACCGCCGACTCGACGCCGTTAATGTATCAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTCACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAGGGGAAAT‑GACCGTTGATCCCAGCG‑TCGTTACCCTGCTCC‑GTGAAAATACCCGCATCGAATTACGCAACCCGAAATTATCCCTGAGCCATGCCAATCTCAGCGCCCTGCTTACCGGCAAAACCTTCGCGCTGGTGCCCTGCGa > 2:1313540/1‑289 (MQ=255) gCCCACAGCCAGCGTGGCGTAATAATAAAACTGGAACTGCCGAGTGGGGCCGGATTAACCGCCGACTCGACGCCGTTAATGTATCAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAGGGGAAAT‑GACCGTTGATCCCAGCG‑TCGTTACCCTGCTTC‑GTGAAAATACCCGCATCGAATTACGCAACCCGAAATTATCCCTTAGCGATGCTAATCTCAGCGCCCTGCTGACCGGCCAAACCTTCGAGCTGGTGCCCGGCGATg > 1:1886755/1‑289 (MQ=255) cagccagcGTGGCGTAATAATAAAACTGGAACTGCCGAGTGGGGCCGGATTAACCGCCGACTCGACGCCGTTAATGTATCAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAGGGGAAAT‑GACCGTTGATCCCAGCG‑TCGTTACCCTGCTTC‑GTGAAAATACCCGCATCGAATTACGCAACCCGAAATTATCCCTTAGCGATGCTAATCTCAGCGCCCTGCTGACCGGCAAAACCTTCGAGCTGGTGCCCGGCGATGGCGa > 1:1111675/1‑288 (MQ=255) agccagcGTGGCGTAATAATAAAACTGGAACTGCCGAGTGGGGCCGGATTAACCGCCGACTCGACGCCGTTAATGTATCAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAGGGGAAAT‑GACCGTTGATCCCAGCG‑TCGTTACCCTGCTTC‑GTGAAAATACCCGCATCGAATTACGCAACCCGAAATTATCCCTTAGCGATGCTAATCTCAGCGCCCTGCTGACCGGCAAAACCTTCGAGCTGGTGCCCGGCGATGGCGAg > 1:1512864/1‑288 (MQ=255) gTGGCGTAATAATAAAACTGGAACTGCCGAGTGGGGCCGGATTAACCGCCGACTCGACGCCGTTAATGTATCAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAGGGGAAAT‑GACCGTTGATCCCAGCG‑TCGTTACCCTGCTTC‑GTGAAAATACCCGCATCGAATTACGCAACCCGAAATTATCCCTTAGCGATGCTAATCTCAGCGCCCTGCTGACCGGCAAAACCTTCGAGCTGGTGCCCGGCGATGGCGAGCCACGCa < 2:837954/288‑1 (MQ=255) gTGGCGTAATAATAAAACTGGAACTGCCGAGGGGGGCCGGATTAACCGCCGACTCGACGCCGTTAATGTATCAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAGGGGAAAT‑GACCGTTGATCCCAGCG‑TCGTTACCCTGCTTC‑GTGAAAATACCCGCATCGAATTACGCAACCCGAAATTATCCCTTAGCGATGCTAATCTCAGCGCCCTGCTGACCGGCAAAACCTTCGAGCTGGTGCCCGGCGATGGCGAGCCACGCa < 1:241339/288‑1 (MQ=255) ggCGTAATAATAAAACTGGAACTGCCGAGTGGGGCCGGATTAACCGCCGACTCGAGGCCGTTAATGGATCAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAACTCCTGGAGGTAACGTCACAGGGGAAAT‑GACCGTTGATCCCAGCG‑TCGTTACCCTGCTTC‑GTGAAAATACCCGCATCGAATTACGCAACCCGAAATTATCCCTTAGCGATGCTAATCTCAGCGCCCTGCTGACCGGCAAAACCTTCGAGCTGGTGCCCGGCGATGGCGAGCCACGCaaa < 2:221200/288‑1 (MQ=255) cGTAATAATAAAACGGGAACTGCCGGGTGGGGCCGGATTAACCGCCGACTCGAAGCCGTTAATGTATCAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAGGGGAAAT‑GACCGTTGATCCCAGCG‑TCGTTACCCTGCTTC‑GTGAAAATACCCGCATCGAATTACGCAACCCGAAATTATCCCTTAGCGATGCTAATCTCAGCGCCCTGCTGACCGGCAAAACCTTCGAGCTGGTGCCCGGCGATGGCGAGCCACGCAAaga < 2:1886571/288‑1 (MQ=255) gTAATAATAAAACTGGAACTGCCGAGTGGGGCCGGATTAACCGCCGACTCGACGCCGTTAATGTATCAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAGGGGAAAT‑GACCGTTGATCCCAGCG‑TCGTTACCCTGCTTC‑GTGAAAATACCCGCATCGAATTACGCAACCCGAAATTATCCCTTAGCGATGCTAATCTCAGCGCCCTGCTGACCGGCAAAACCTTCGAGCTGGTGcc < 1:884987/263‑1 (MQ=255) aataataaAACTGGAACTGCCGAGTGGGGCCGGATTAACCGCCGACTCGACGCCGTTAATGTATCAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAGGGGAAAT‑GACCGTTGATCCCAGCG‑TCGTTACCCTGCTTC‑GTGAAAATACCCGCATCGAATTACGCAACCCGAAATTATCCCTTAGCGCTGCTAATCTCAGCGCCCTGCTGACCGGCAAACCCTTCCAGCTGGTTCCCGGCGAGGGCGTGCCACCCAAAGAGATc > 2:170011/1‑289 (MQ=255) taataaAACTGGAACTGCCGAGTGGGGCCGGATTAACCGCCGACTCGACGCCGTTAATGTATCAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAGGGGAAAT‑GACCGTTGATCCCAGCG‑TCGTTACCCTGCTTC‑GTGAAAATACCCGCATCGAATTACGCAACCCGAAATTATCCCTTAGCGATGCTAATCTCAGCGCCCTGCTGACCGGCAAAACCTTCGAGCTGGTGCCCGGCGATGGCGAGCCACGCAAAGAGTTCgt > 1:126338/1‑289 (MQ=255) cgggagcggCCGGGTGGGGCCGGATTAACCGCCGACTAGAAGCCGTTAATGTATCAGGGGCGGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTGAAATCCTGGTGGTAAATTCACAGGGGAAAT‑GACCGTTGATCCCAGCG‑TCGTTACCCTGCTGC‑GTGAAAATACCCGCATCGAATTACGCAACCCGAAATTATCCCTTAGCGATGCTAATCTCAGCGCCCTGCGGACCGGCAAAACCTTCGAGCTGGTGCCCGGCGATGGCGAGCCACGCAAAGAGTTCGTTGTTGTGc < 2:1607068/281‑1 (MQ=255) gAACTGCCGAGTGGGGCCGGATTAACCGCCGACTCGACGCCGTTAATGTATCAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAGGGGAAAT‑GACCGTTGATCCCAGCG‑TCGTTACCCTGCTTC‑GTGAAAATACCCGCATCGAATTACGCAACCCGAAATTATCCCTTAGCGATGCTAATCTCAGTGCCCCGCTTACCGGCCAACCCTTCCAGCCGGTTCACGCAGAGTGTCAGCCACCCAAAGAGTACGTTGTTGTGCCAg > 2:1339087/1‑289 (MQ=255) tGCCGAGTGGGGCCGGATTAACCGCCGACTCGACGCCGTTAATGTATCAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAGGGGAAAT‑GACCGTTGATCCCAGCG‑TCGTTACCCTGCTTC‑GTGAAAATACCCGCATCGAATTACGCAACCCGAAATTATCCCTTAGCGATGCTAATCTCAGCGCCCTGCTGACCGGCAAAACCTTCGAGCTGGTGCCCGGCGATGGCGAGCCACGCAAAGAGTTCGTTGTTGTGCCAGGCGa < 1:1357184/289‑1 (MQ=255) ccGAGTGGGGCCGGATTAACCGCCGACTCGACGCCGTTAATGTATCAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAGGGGAAAT‑GACCGTTGATCCCAGCG‑TCGTTACCCTGCTTC‑GTGAAAATACCCGCATCGAATTACGCAACCCGAAATTATCCCTTAGCGATGCTAATCTCAGCGCCCTGCTGACCGGCCAAACCTTCCAGCTGGTGCCCGGCGATCGCGAGCCACCACAAGGGTTCCTTGTGGTGCCCGGCGgaa > 2:681903/1‑289 (MQ=255) aGTGGGGCCGGATTAACCGCCGACTCGACGCCGTTAATGTATCAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAGGGGAAAT‑GACCGTTGATCCCAg < 1:511797/125‑1 (MQ=255) gggCCGGATTAACCGCCGACTCGACGCCGTTAATGTATCAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAGGGGAAAT‑GACCGTTGATCCCAGCG‑TCGTTACCCTGCTTC‑GTGAAAATACCCGCATCGAATTACGCAACCCGAAATTATCCCTTAGCGATGCTAATCTCAGCGCCCTGCTGACCGGCAAAACCTTCGAGCTGGTGCCCGGCGATGGCGAGCCACGCAAAGAGTTCGTTGTTGTGCCAGGCGAAAAAGc > 1:1088933/1‑286 (MQ=255) ggCCGGATTAACCCCCAACTCGACGCCGTTAATGTATCAGGGGCTGAAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAGGGGAAAT‑GACCGTTGATCCCAGCG‑TCGTTACCCTGCTTC‑GTGAAAATACCCGCATCGAATTACGCAACCCGAAATTATCCCTTAGCGATGCTAATCTCAGCGCCCTGCTGACCGGCAAAACCTTCGAGCTGGTGCCCGGCGATGGCGAGCCACGCAAAGAGTTCGTTGTTGTGCCAGGCGAAAAAGCAct < 2:579208/288‑1 (MQ=255) gCCGGATTAACCGCCGACTCGACGCCGTTAATGTATCAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAGGGGAAAT‑GACCGTTGATCCCAGCG‑TCGTTACCCTGCTTC‑GTGAAAATACCCGCATCGAATTACGCAACCCGAAATTATCCCTTAGCGATGCTAATCTCAGCGCCCTGCTGACCGGCAAAACCTTCGAGCTGGTGCCCGGCGATGGCGAGCCACGCAAAGAGTTCGTTGTTGTGCCAGGCGAAAAAGCActg < 1:784362/288‑1 (MQ=255) ccGGATTAACCGCCGACTCGACGCCGTTAATGTATCAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAGGGGAAAT‑GACCGTTGATCCCAGCG‑TCGTTACCCTGCTTC‑GTGAAAATACCCGCATCGAATTACGCAACCCGAAATTATCCCTTAGCGATGCTAATCTCAGCGCCCTGCTGACCGGCAAAACCTTCGAGCTGGTGCCCGGCGATGGCCAGCCCCGCCAAGAGTTCGTTGTTGTGCCAGGCGAAAAAGCCctgc > 2:33142/1‑288 (MQ=255) gATTAACCGCCGACTCGACGCCGTTAATGTATCAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAGGGGAAAT‑GACCGTTGATCCCAGCG‑TCGTTACCCTGCTTC‑GTGAAAATACCCGCATCGAATTACGCAACCCGAAATTATCCCTTAGCGATGCTACTCTCAGCGCCCTGCTGACCGGCAAAACCTTCGAGCTGGTGCCCGGCGATGGCGAGCCACGc > 2:1466796/1‑248 (MQ=255) gATTAACCGCCGACTCGACGCCGTTAATGTATCAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAGGGGAAAT‑GACCGTTGATCCCAGCG‑TCGTTACCCTGCTTC‑GTGAAAATACCCGCATCGAATTACGCAACCCGAAATTATCCCTTAGCGATGCTAATCTCAGCGCCCTGCTGACCGGCAAAACCTTCGAGCTGGTGCCCGGCGATGGCGAGCCACGc < 1:1466796/248‑1 (MQ=255) aTTAACCGCCGACTCGACGCCGTTAATGTATCAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAGGGGAAAT‑GACCGTTGATCCCAGCG‑TCGTTACCCTGCTTC‑GTGAAAATACCCGCATCGAATTACGCAACCCGAAATTATCCCTTAGCGATGCTAATCTCAGCGCCCTGCTGACCGGCAAAACCTTCGAGCTGGTGCCCGGCGATGGCGAGCCACGCAAAGAGTTCGTTGTTGTGCCAGGCGAAAAAGCACTGCTGCa < 2:1131513/288‑1 (MQ=255) aCCGCCGACTCGACGCCGTTAATGTATCAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAGGGGAAAT‑GACCGTTGATCCCAGCG‑TCGTTACCCTGCTTC‑GTGAAAATACCCGCATCGAATTACGCAACCCGAAATTATCCCTTAGCGATGCTAATCTCAGCGCCCTGCTGACCGGCAAAACCTTCGAGCTGGTGCCCGGCGATGGCGAGCCACGCAAAGAGTTCGTTGTTGTGCCAGGCGAAAAAGCACTGCTGCATGaa > 1:1839908/1‑288 (MQ=255) ||| TGATGTCCTGATCGAGCGGCGTTTTACCGATCTGGTGAAAAAAGGTAGCCGTTTCTGGAACGTTTCCGGCGTTGATGCCAACGTCAGT‑ATCAGTGGCGCGAAGGTGAAACTGGAAAGCCTGGCGGCACTGGTTAACGGTGCGATTGCCTTCGATAGTCCAGAAGAGAGCAAACCTGCCGAGGCGGAAGATACCTTTGGTCTGTATGAAGATCTGGCCCACAGCCAGCGTGGCGTAATAATAAAACTGGAACTGCCGAGTGGGGCCGGATTAACCGCCGACAGCACGCCGTTAATGTATCAGGGGCTGGAAGTCGGACAGCTGACTAAACTGGATTTAAATCCTGGTGGTAAAGTCACAGGGGAAAT‑GACCGTTGATCCCAGCG‑TCGTTACCCTGCTTC‑GTGAAAATACCCGCATCGAATTACGCAACCCGAAATTATCCCTTAGCGATGCTAATCTCAGCGCCCTGCTGACCGGCAAAACCTTCGAGCTGGTGCCCGGCGATGGCGAGCCACGCAAAGAGTTCGTTGTTGTGCCAGGCGAAAAAGCACTGCTGCATGAA > CP042583/1598837‑1599395 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |