| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP042583 | 1,601,014 | 3 bp→TCA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP042583 | 1,601,014 | 0 | A | T | 97.2% | 581.7 / NA | 255 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (110/136); minor base C (7/0); total (117/138) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.10e-03 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| * | CP042583 | 1,601,015 | 0 | G | C | 99.6% | 598.4 / NA | 255 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base C (116/137); total (117/138) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| * | CP042583 | 1,601,016 | 0 | T | A | 97.6% | 585.3 / NA | 255 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base A (112/136); minor base C (5/1); total (117/138) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 9.76e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 255 total aligned reads displayed.
GGCGGCATCGCCTTCGCCACGCCTCCGGGTACGCCACTGGCACCGAAAGCCCAGGAAGGCAAACACTTCCTGTTGCAGGAAAGTGAACCGAAAGAGTGGCGTGAATGGGGAACTGCGCTTCCCAAATAATGCCCACTGCTCCGGCGTGCCTGCGCCGGAGCGTTTATGCTAAACTGCGCGCCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACAC‑AAATGCGCGAAGCGATGCCTAGCACGCTCAGTTTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTG‑AAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTAGTATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACGG > CP042583/1600734‑1601285 ||| gcggcATCGCCTTCGCCACGCCTCCGGGTACGCCACTGGCACCGAAAGCCCAGGAAGGCAAACACTTCCTGTTGCAGGAAAGTGAACCGAAAGAGTGGCGTGAATGGGGAACTGCGCTTCCCAAATAATGCCCACTGCTCCGGCGTGCCTGCGCCGGAGCGTTTATGCTAAACTGCGCGCCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACCC‑AAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTtgatg > 1:383642/1‑289 (MQ=255) gcggcATCGCCTTCGCCACGCCTCCGGGTACGCCACTGGCACCGAAAGCCCAGGAAGGCAAACACTTCCTGTTGCAGGAAAGTGAACCGAAAGAGTGGCGTGAATGGGGAACTGCGCTTCCCAAATAATGCCCACTGCTCCGGCGTGCCTGCGCCGGAGCGTTTATGCTAAACTGCGCGCCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACAC‑AAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTtgatg > 1:252265/1‑289 (MQ=255) gcggcATCGCCTTCGCCACGCCTCCGGGTACGCCACTGGCACCGAAAGCCCAGGAAGGCAAACACTTCCTGTTGCAGGAAAGTGAACCGAAAGAGTGGCGTGAATGGGGAACTGCGCTTCCCAAATAATGCCCACTGCTCCGGCGTGCCTGCGCCGGAGCGTTTATGCTAAACTGCGCGCCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACAC‑AAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTtgatg > 1:319375/1‑289 (MQ=255) gcATCGCCTTCGCCACGCCTCCGGGTACGCCACTGGCACCGAAAGCCCAGGAAGGCAAACACTTCCTGTTGCAGGAAAGTGAACCGAAAGAGTGGCGTGAATGGGGAACTGCGCTTCCCAAATAATGCCCACTGCTCCGGCGTGCCTGCGCCGGAGCGTTTATGCTAAACTGCGCGCCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACAC‑AAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGAtt > 1:879948/1‑289 (MQ=255) ccTCCGGGTACGCCACTGGCACCGAAAGCCCAGGAAGGCAAACACTTCCTGTTGCAGGAAAGTGAACCGAAAGAGTGGCGTGAATGGGGAACTGCGCTTCCCAAATAATGCCCACTGCTCCGGCGTGCCTGCGCCGGAGCGTTTATGCTAAACTGCGCGCCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACCCACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACAC‑AACTGCGCGAAGCGCTGCCTTCGACGCTCCCATTTGACTCTTTTCTTTCCCCCTGtta > 2:1930970/1‑286 (MQ=255) aCTGGCACCGAAAGCCCAGGACGGCAAACACTTCCTGTTGCAGGAAAGTGAACCGAAAGAGTGGCGTGAATGGGGAACTGCGCTTCCCAAATAATGCCCACTGCTCCGGCGTGCCTGCGCCGGAGCGTTTATGCTAAACTGCGCGCCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACAC‑AAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGcgccg < 1:15020/289‑1 (MQ=255) tGGCACCGAAAGCCCAGGAAGGCAAACACTTCCTGTTGCAGGAAAGTGAACCGAAAGAGTGGCGTGAATGGGGAACTGCGCTTCCCAAATAATGCCCACTGCTCCGGCGTGCCTGCGCCGGAGCGTTTATGCTAAACTGCGCGCCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGTCCCAACCCACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTTACAC‑AACTTCCCCAATCGCTGCCTTCCTCGCCTCCATTTGATGTTTTTCTTGCCGCCGGTCCGCCCCCGGTGtgcccg > 2:80970/1‑286 (MQ=255) aCCGAAAGCCCAGGAAGGCAAACACTTCCTGTTGCAGGAAAGTGAACCGAAAGAGTGGCGTGAATGGGGAACTGCGCTTCCCAAATAATGCCCACTGCTCCGGCGTGCCTGCGCCGGAGCGTTTATGCTCAACTGCGCGCCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCGCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGCCGCCTTTCTGACCC‑AAATGCGTCAAGCCATGCCTTCGACCCCTCCCTTTGATGACTTTCTTGCCTCCTGTACGCGCCCCTTGcgcccacgcgt > 2:923165/1‑282 (MQ=255) aCCGAAAGCCCAGGAAGGCAAACACTTCCTGTTGCAGGAAAGTGAACCGAAAGAGTGGCGTGAATGGGGAACTGCGCTTCCCAAATAATGCCCACTGCTCCGGCGTGCCTGCGCCGGAGCGTTTATGCTAAACTGCGCGCCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACAC‑AAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCgcagca < 1:1546485/288‑1 (MQ=255) aCCGAAAGACCAGGAAGGCAAACAATTCCTGTTTCAGGACAGTGAACACATAGAGTGGCGAGAATGGGGAACTGCGATTCGCAAATAAGGGCAACTGCTCCTGCGTTGCTGCGCCGGAGAGGTTATGATAAACTGCGCGACTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACGCACCGTTTATTTCTCGGAAGCCTTTCTGACAC‑AAAGGCGCTAAGCGATTCCATCGAAGCTCTCATGTGATGATTTGCTTGCCTCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCAt < 2:1282989/289‑1 (MQ=255) ccGAAAGCCCAGGAAGGCAAACACTTCCTGTTGCAGGAAAGTGAACCGAAAGAGTGGCGTGAATGGGGAACTGCGCTTCCCAAATAATGCCCACTGCTCCGGCGTGCCTGCGCCGGAGCGTTTATGCTAAACTGCGCGCCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACAC‑AAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCAtt < 1:1161891/289‑1 (MQ=255) ccGAAAGCCCAGGAAGGCAAACACTTCCTGTTGCAGGAAAGTGAACCGAAAGAGTGGCGTGAATGGGGAACTGCGCTTCCCAAATAATGCCCACTGCTCCGGCGTGCCTGCGCCGGAGCGTTTATGCTAAACTGCGCGCCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACAC‑AAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCAtt < 1:926314/289‑1 (MQ=255) gAAAGCCCAGGAAGGCAAACACTTCCTGTTGCAGGAAAGTGAACCGAAAGAGTGGCGTGAATGGGGAACTGCGCTTCCCAAATAATGCCCACTGCTCCGGCGTGCCTGCGCCGGAGCGTTTATGCTAAACTGCGCGCCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACAC‑AAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTcg < 1:410786/289‑1 (MQ=255) aaaGCCCAGGAAGGCAAACACTTCCTGTTGCAGGAAAGTGAACCGAAAGAGTGGCGTGAATGGGGAACTGCGCTTCCCAAATAATGCCCACTGCTCCGGCGTGCCTGCGCCGGAGCGTTTATGCTAAACTGCGCGCCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCCACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACAC‑AAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCCCCCATTTTATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGACGCACCACTcgc > 2:669595/1‑289 (MQ=255) aaGGCAAACACTTCCTGTTGCAGGAAAGTGAACCGAAAGAGTGGCGTGAATGGGGAACTGCGCTTCCCAAATAATGCCCACTGCTCCGGCGTGCCTGCGCCGGAGCGTTTATGCTAAACTGCGCGCCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACAC‑AAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACg < 1:1320102/288‑1 (MQ=255) cAAACACTTCCTGTTGCAGGAAAGTGAACCGAAAGAGTGGCGTGAATGGGGAACTGCGCTTCCCAAATAATGCCCACTGCTCCGGCGTGCCTGCGCCGGAGCGTTTATGCTAAACTGCGCGCCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACAC‑AAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGaa > 1:1039730/1‑289 (MQ=255) tCCTGTTGAAGGAAAGTGAACCGAAAGGGTGGCGTGAATGGGGACCTGCGCTTCCCAAATAATGCCCACTGCTCCGGCGTGCCTGCGCCGGAGCGTTTATGCTAAACTGCGCGCCTGTTTTTGTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACAC‑AAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCg < 2:1141148/289‑1 (MQ=255) aaaGTGAACCGAAAGAGTGGCGTGAATGGGGAACTGCGCTTCCCAAATAATGCCCACTGCTCCGGCGTGCCTGCGCCGGAGCGTTTATGCTAAACTGCGCGCCTGTTTTTTTGCCAATGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACAC‑AAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTc < 2:206365/288‑1 (MQ=255) aaGTGAACCGAAAGGGTGGCGTGAATGGGGAACTGCGCTTCCCAAATAATGCCCACTGCTCCGGCGTGCCTGCGCCGGAGCGTTTATGCTAAACTGCGCGCCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACAC‑AAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTcc < 2:750914/288‑1 (MQ=255) aGTGAACCGAAAGAGTGGCGTGAATGGGGAACTGCGCTTCCCAAATAATGCCCACTGCTCCGGCGTGCCTGCGCCGGAGCGTTTATGCTAAACTGCGCGCCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACAC‑AAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCt > 1:528613/1‑288 (MQ=255) aaGAGTGGCGTGAATGGGGAACTGCGCTTCCCAACGAATGCCCACTGCTCCGGCGTGCCTGCGCCGGAGCGTTTATGCTAAACTGCGCGCCTGTTTTTTTGCAAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACAC‑AAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCGCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCg < 1:1375210/289‑1 (MQ=255) tGGCGTGAATGGGGAACTGCGCTTCCCAAATAATGCCCACTGCTCCGGCGTGCCTGCGCCGGAGCGTTTATGCTAAACTGCGCGCCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACAC‑CAATGCCCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTTCCGCCTGTCAGCCCCCGTTGCCCCGCAGCATTCGCGTTAATCCCCCGAAAATCTCCGTTTCTGATTTCCTGCCATTAACCcctcct > 2:1649859/1‑289 (MQ=255) tGGCGTGAATGGGGAACTGCGCTTCCCAAATAATGCCCACTGCTCCGGCGTGCCTGCGCCGGAGCGTTTATGCTAAACTGCGCGCCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACAC‑AAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCt > 1:35258/1‑289 (MQ=255) gAACTGCGCTTCCCAAATAATGCCCACTGCTCCGGCGTGCCTGCGCCGGAGCGTTTATGCTAAACTGCGCGCCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACAC‑AAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGAc > 1:482596/1‑287 (MQ=255) aCTTCGCTTCCCAAATAATGCCCACTGCTCCGGCGTGCCTGCGCCGGAGCGTTTATGCTAAACTGCGCGCCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACAC‑AAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCt < 1:57106/288‑1 (MQ=255) aaaTAATGCCCTCTGCTCCGGCGTGCCTGCGCCGAAGCGTTTATGCTAAACTGCGCGCCTGTTTTTTGGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACAC‑AAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCg < 1:424388/289‑1 (MQ=255) aaaTAATGCCCACTGCTCCGGCGTGCCTGCGCCGGAGCGTTTATGCTAAACTGCGCGCCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACAC‑AAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCg < 1:670210/289‑1 (MQ=255) aaatGGCCAGTGCTCCCGTGTGGCTGGTCGGGATGGTTTATGGTAAACTGGGCGCCGGTTTTTTGGACAGTGGTACATGCTCGGGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACAC‑AAATGCGCGAAGCGATGCCTTGGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCgtgg < 2:14329/288‑1 (MQ=255) tatGCCCCCTGCTCCGGCGGGCCTGCGCCGGAGCGTTTATGCTAAACTGCGCGCCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTATCTGACAC‑AAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCgtg < 2:252265/286‑1 (MQ=255) gCCCACTGCTCCGGCGTGCCTGCGCCGGAGCGTTTATGCTAAACTGCGCGCCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACAC‑AAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTgccg < 1:982417/172‑1 (MQ=255) aaacgCTCCGGCGTGCCTGCGCCGGAGCGTTTATGCTAAACTGCGCGCCTGTTTTTTTGCCTGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACAC‑AAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCATCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTg‑aag > 1:796491/5‑289 (MQ=255) cTGCTCCGGCGTGCCTGCGCCGGAGCGTTTATGCTAAACTGCGCGCCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACAC‑AAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTg‑aagaa < 1:1649859/289‑1 (MQ=255) cTGCCCCGGCGTGCCTGCGACGGAGCGTTTATGCTAAACTGCGCGCCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACAC‑AAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTg‑aagaa < 1:99579/289‑1 (MQ=255) tGCTCCGGCGTGCCTGCGCCGGAGCGTTTATGCTAAACTGCGCGCCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACAC‑AAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTg‑aag > 1:1858267/1‑286 (MQ=255) tGCTCCGGCGTGCCTGCGCCGGAGCGTTTATGCTAAACTGCGCGCCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACAC‑AAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTg‑aag < 2:1858267/286‑1 (MQ=255) tGCCTGCGCCGGAGCGTTTATGCTAAACTGCGCGCCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACAC‑AAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCg < 1:44565/234‑1 (MQ=255) tGCCTGCGCCGGAGCGTTTATGCTAAACTGCGCGCCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACAC‑AAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCg > 2:44565/1‑234 (MQ=255) tGCCTGCGCCGGAGCGTTTATGCTAAACTGCGCGCCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACAC‑AAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCtt > 1:297432/1‑240 (MQ=255) tGCCTGCGCCGGAGCGTTTATGCTAAACTGCGCGCCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACAC‑AAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTG‑AAGAAGGTTTCTGGAt > 1:234534/1‑289 (MQ=255) ccTGCGCCGGAGCGTTTATGCTAAACTGCGCGCCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACAC‑AAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCCTTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTTGGCTT‑AAGCAGGTTTCTGGATTg > 2:93886/1‑289 (MQ=255) ccTGCGCCGGAGCGTTTATGCTAAACTGCGCGCCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACAC‑AAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTG‑AAGAAGGTTTCTGGAtt < 2:395447/288‑1 (MQ=255) ccTGCGCCGGAGCGTTTATGCTAAACTGCGCGCCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACAC‑AAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTG‑AAGAAGGTTTCTGGATTg > 1:778587/1‑289 (MQ=255) cgcCGGAGCGTTTATGCTAAACTGCGCGCCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACAC‑CAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGACAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTTGACCCGTCCGCCCATTCGGTTGTTGG‑ATGAAGGTTTCTggtgcgaacg > 2:1444346/1‑281 (MQ=255) gccgaggtgTTTGTGCGAAACAGCGCGCGTGTTTGTGTGCCAGGGGTGAGTGCTCGTGGCCAAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTGTCTGGCAC‑AAATGCGCGAAGGGAGGCCGTGGGCGCTCTCATTTGATGATTGTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAAGTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTG‑AAGAAGGTTTCTGGATTGAAcg < 2:1577843/280‑1 (MQ=255) gcCGGAGCGTTTATGCTAAACTGCGCGCCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACAC‑AAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGG‑GTGTAAGAAGGTTTCTGGATTGAAcgc > 2:1733362/1‑289 (MQ=255) ttATGCTAAACTGCGCGCCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACAC‑AAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTG‑AAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGaa < 1:914423/288‑1 (MQ=255) tAAAGTGCTGGCCTGATTTTTTGTCAGTGGTACCTGCTCCTGCCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACAC‑AAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTG‑AAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCa < 2:1350596/288‑1 (MQ=255) tAAACTGCGCGCCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACAC‑AAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTG‑AAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCAt < 1:1733362/289‑1 (MQ=255) tAAACTGCGCGCCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACAC‑AAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTG‑AAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCAt < 1:1930970/289‑1 (MQ=255) tAAACTGCGCGCCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACAC‑AAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTG‑AAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCAt < 1:93793/289‑1 (MQ=255) tAAACTGCGCGCCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACAC‑AAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTG‑AAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCAt < 1:1351094/289‑1 (MQ=255) tAAACTGCGCGCCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACAC‑AAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCACTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTG‑AAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCa < 1:865049/288‑1 (MQ=255) tGCGCGCCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACAC‑AAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTG‑AAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCa < 1:1581267/289‑1 (MQ=255) tGCGCGCCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACAC‑AAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTG‑AAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCa < 1:952352/289‑1 (MQ=255) cgcgcCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACAC‑AAATGTGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTG‑AAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCAtt > 1:1945433/1‑289 (MQ=255) cgcgcCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACAC‑AAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCCTTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCCGGACGGTTACGCCAATTTCGGGTGGTG‑AAGAGGGTTTCTGGGTTGAACGCGACAATGAAAGTTCTTTGCCagt > 2:1340217/1‑287 (MQ=255) cgcgcCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACAC‑AAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGGCAATTCCGTGGTGTG‑AAGAAGGTTTCTGGATTGAAAGTGAACATGAAGATGCATTTCCaat > 2:789322/1‑287 (MQ=255) cgcgcCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACAC‑AAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCgtgg > 2:154280/1‑239 (MQ=255) cgcgcCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACAC‑AAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTG‑AAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCAtt > 2:373865/1‑289 (MQ=255) cgcgcCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACAC‑AAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTG‑AAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCAtt > 1:82426/1‑289 (MQ=255) cgcgcCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACAC‑AAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTG‑AAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCAtt > 1:1268731/1‑289 (MQ=255) cgcgcCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACAC‑AAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTG‑AAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCAtt > 2:190586/1‑289 (MQ=255) cgcgcCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACAC‑AAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTG‑AAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCAtt > 1:847829/1‑289 (MQ=255) cgcgcCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACAC‑AAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGGTGCTGATTGCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCCATCCCGTGGTGGG‑ATGAAGGTTTCTGGCTTGAACGCGACAATGCACGTGCATTGCCAtt > 2:1797221/1‑289 (MQ=255) cgccgttttttttGCCAGTGGTACATGCTCTAGGCCCAACCCACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACAC‑AAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTG‑AAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTg < 2:400989/282‑1 (MQ=255) cgcCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACAC‑AAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTG‑AAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTgg > 1:1177164/1‑289 (MQ=255) gcCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACAC‑AAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTG‑AAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTggg < 1:617153/289‑1 (MQ=255) tGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACAC‑AAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTG‑AAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGgtag < 1:1878480/289‑1 (MQ=255) ttGGCAGTTGTACATGCGCACGGCCCCACACACCGTTTATTTCCCCGACGCGTTTCTACCAC‑CACTGCGCCAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATTATTTTCTGGCCGCCTATCAGCGCCCGTTGCGCCGCAACATTCGCGTTAATACGCCGACAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGGCGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTG‑AAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCTTTTGGTAGTAccgac < 2:312014/289‑3 (MQ=255) tgtccAGTGGTACCTGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGAAGCCTTTCTGACAC‑AAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTG‑AAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTAccgcc < 2:325350/286‑1 (MQ=255) aGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACAC‑AAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTG‑AAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCa > 1:1209728/1‑289 (MQ=255) gCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACAC‑AAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTG‑AAGAAGGTTTCTGGATTTAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTCAGTgg > 1:1106605/1‑288 (MQ=255) tGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACAC‑AAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCt < 1:199444/190‑1 (MQ=255) tGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACAC‑AAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTG‑AAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGc > 1:1210832/1‑284 (MQ=255) tGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACAC‑AAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTG‑AAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCTTGtt > 2:1813833/1‑289 (MQ=255) ggCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACAC‑AAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTG‑AAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGtt < 1:789322/288‑1 (MQ=255) acacacCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACAC‑AAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATATGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGACAATTCCGTGGTGTG‑AAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGAAGCATTGACATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGGGGCCTGTTGtatagt > 1:1394314/1‑287 (MQ=255) acacacCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACAC‑AAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGt > 1:1480041/1‑141 (MQ=255) gTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACAC‑AAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTG‑AAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGaa > 1:1303646/1‑288 (MQ=255) gTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACAC‑AAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTG‑AAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAg < 1:1256370/289‑1 (MQ=255) tttATTTCCCGTACGCCTTTCTGAACC‑AAATGAGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTG‑AAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGc < 2:1945433/289‑1 (MQ=255) gttattcaccagcggCCTTTC‑GACACAAAATGCGCGAAGCGTCGACTTCGGCGCTCGCATTTTATTATTTTCGTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTG‑AAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTTCCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGc < 2:1870478/275‑1 (MQ=255) ttATTTCCCGGACGCCTTTCTGACAC‑AAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTG‑AAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGc < 1:452867/288‑1 (MQ=255) ttATTTCCCGGACGCCTTTCTGACAC‑AAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTG‑AAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGc < 1:1534685/288‑1 (MQ=255) aTTTCCCGGACGCCTTTCTGACAC‑AAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTG‑AAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCag > 2:959253/1‑289 (MQ=255) tCCCGGACGCCTTTCTGACAC‑AAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTG‑AAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCagttc > 2:1273601/1‑287 (MQ=255) cccGGACGCCTTTCTGACAC‑AAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTG‑AAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCagttca < 1:1906211/289‑4 (MQ=255) cccGGACGCCTTTCTGACAC‑AAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTG‑AAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCagttca < 2:62214/289‑4 (MQ=255) cTTTCTGACAC‑AAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTCCGCCAATTCCGTGGTGTG‑AAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTTTATTCACTCAGCCAGTTCTCtgttgcct > 2:570827/1‑289 (MQ=255) cTTGCTGACAC‑AAATGCGGGAAGCGCGGCCTTCGGCGCTCTCATTGAGTGATTTTCTGGCCGCCTGTCAGCGGCCGTTGCGCCGCATCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGATCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTG‑AAGAAGGTGTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAAtgttgcc < 2:1510664/288‑1 (MQ=255) ttCTGACAC‑AAATGCGCGAAGGTGTGCATTCGGCGCTCTCATTTGATGATTTTCTTTCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTG‑AAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCt < 2:1186076/253‑1 (MQ=255) c‑aAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGTGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTG‑AAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCt > 1:652493/1‑289 (MQ=255) c‑aAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTG‑AAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAAtgttgcctgttgcc < 1:1448976/285‑1 (MQ=255) c‑aAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTG‑AAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCt > 1:277179/1‑289 (MQ=255) c‑aAATGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTG‑AAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCt < 2:859559/289‑1 (MQ=255) aTGCGCGAAGCGGTGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTG‑AAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGt < 1:60900/289‑1 (MQ=255) aTGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTG‑AAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGt < 2:1209728/289‑1 (MQ=255) aTGCGCGAAGCGATGCCTTCGACGCTCTCAGTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTG‑AAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGt < 2:477366/289‑1 (MQ=255) aGCGATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTG‑AAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGGGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTTCCGCCTTGTTTGCTGAc > 1:1851352/1‑289 (MQ=255) gATGCCTTCGACGCTCTCATTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTG‑AAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTTCAATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACgg < 2:482596/288‑1 (MQ=255) ||| GGCGGCATCGCCTTCGCCACGCCTCCGGGTACGCCACTGGCACCGAAAGCCCAGGAAGGCAAACACTTCCTGTTGCAGGAAAGTGAACCGAAAGAGTGGCGTGAATGGGGAACTGCGCTTCCCAAATAATGCCCACTGCTCCGGCGTGCCTGCGCCGGAGCGTTTATGCTAAACTGCGCGCCTGTTTTTTTGCCAGTGGTACATGCTCGTGGCCCAACACACCGTTTATTTCCCGGACGCCTTTCTGACAC‑AAATGCGCGAAGCGATGCCTAGCACGCTCAGTTTTGATGATTTTCTTGCCGCCTGTCAGCGCCCGTTGCGCCGCAGCATTCGCGTTAATACGCTGAAAATCTCCGTTGCTGATTTCCTGCAATTAACCGCTCCTTATGGCTGGACGCTTACGCCAATTCCGTGGTGTG‑AAGAAGGTTTCTGGATTGAACGCGACAATGAAGATGCATTGCCATTGGGTAGTACCGCCGAGCATTTAAGTGGCCTGTTTTATATTCAGGAAGCCAGTAGTATGTTGCCTGTTGCCGCCTTGTTTGCTGACGG > CP042583/1600734‑1601285 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |