| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP042583 | 1,622,424 | 3 bp→TGA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP042583 | 1,622,424 | 0 | A | T | 100.0% | 716.9 / NA | 301 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base T (150/151); total (150/151) | |||||||||||
| * | CP042583 | 1,622,425 | 0 | C | G | 99.3% | 710.5 / NA | 301 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); major base G (148/150); minor base T (1/1); total (150/151) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
| * | CP042583 | 1,622,426 | 0 | T | A | 100.0% | 719.8 / NA | 301 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base A (150/151); total (150/151) | |||||||||||
Only 100 of 301 total aligned reads displayed.
ATCGGCTCACTGGCTTCAGGTAAGAGGCTACGAATTTCGTTCTGTTCCAGCTCAATGGTTTTGACAATTGGCGTGGCATCACGGTGATAAACATAAGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGGCTCCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACGCCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCACTATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTT > CP042583/1622146‑1622702 ||| tcccTGGCTTCAGGTAAGAGCGAACGAATTTCATTCGTTTACAGGTCAATGGTTTTGACAATTGGCGTAGCATGACGGTGATAAACAGAAGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATGACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACGCCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAAGTCTGAATAGCTTGTTTTa < 2:757282/285‑1 (MQ=255) tCAGGTAAGAGCGAACGAATTTCGTTCTGTTCCAGCTCAATGGTTTTGACAATTGGCGTGGCATCACGGTGATAAACATAAGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACGCCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGa > 1:962949/1‑289 (MQ=255) tCAGGTAAGAGCGAACGAATTTCGTTCTGTTCCAGCTCAATGGTTTTGACAATTGGCGTGGCATCACGGTGATAAACATAAGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACGCCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGa < 1:253627/289‑1 (MQ=255) ggTAAGAGCGAACGAATTTCGTTCTGTTCCAGCTCAATGGTTTTGACAATTGGCGTGGCATCACGGTGATAAACATAAGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACGCCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGatat > 1:1769497/1‑289 (MQ=255) ggTAAGAGCGAACGAATTTCGTTCTGTTCCAGCTCAATGGTTTTGACAATTGGCGTGGCATCACGGTGATAAACATAAGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACGCCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGatat > 2:174977/1‑289 (MQ=255) gTAAGAGCGAACGAATTTCGTTCTGTTCCAGCTCAATGGTTTTGACAATTGGCGTGGCATCACGGTGATAAACATAAGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACGCCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCCTACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGatat > 1:1294641/1‑288 (MQ=255) agcgaaCGAATTTCGTTCTGTTCCAGCTCAATGGTTTTGACAATTGGCGTGGCATCACGGTGATAAACATAAGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACGCCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGatat > 1:879289/6‑283 (MQ=255) gaaCGAATTTCGTTCTGTTCCAGCTCAATGGTTTTGACAATTGGCGTGGCATCACGGTGATAAACATAAGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACGCCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCa < 1:1471235/287‑1 (MQ=255) aaCGAATTTCGTTCTGTTCCAGCTCAATGGTTTTGACAATTGGCGTGGCATCACGGTGATAAACATAAGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACGCCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAg > 1:267418/2‑289 (MQ=255) tttCGTTCTGTTCCAGCTCAATGGTTTTGACAATTGGCGTGGCATCACGGTGATAAACATAAGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACGCCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGAt > 1:615337/1‑288 (MQ=255) tCGTTCTGTTCCAGCTCAATGGTTTTGACAATTGGCGTGGCATCACGGTGATAAACATAAGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACGCCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCa > 2:1269847/1‑289 (MQ=255) cGTTCTGTTCCAGCTCAATGGTTTTGACAATTGGCGTGGCATCACGGTGATAAACATAAGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACGCCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCaa < 1:1316718/289‑1 (MQ=255) tGTTCCAGCTCAATGGTTTTGACAATTGGCGTGGCATCACGGTGATAAACATAAGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACGCCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGtt > 1:1624983/1‑288 (MQ=255) gCTCAATGGTTTTGACAATTGGCGTGGCATCACGGTGATAAACATAAGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACGCCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACg > 1:149098/1‑289 (MQ=255) tCAATGGTTTTGACAATTGGCGTGGCATCACGGTGATAAACATAAGGCCGCCCGACAGCGACCCCCAGAGTAAGAACCTTCAGCGACCCCAACATAACGCGGTTTATTCCCGGTAAATTATTACCCTCCAGGGCGACCAAACCTGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCTCATACTGGTTGGCTACTTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCTTCCCCCTTTTCTCCAACGTTCCCATACGaa < 1:107589/289‑1 (MQ=255) tCAATGGTTTTGACAATTGGCGTGGCATCACGGTGATAAACATAAGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACGCCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGaa < 1:10600/289‑1 (MQ=255) aTGGTTTTGACAATTGGCGTGGCATCACGGTGATAAACATAAGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTCAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGGGGTCGCGGTAAATTATTAAACGCCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATTCCCTTTCAGGCAGCTCCCCTACTGTGTTGCTAATTGACTAAGGAATTCTTAATAGCTTGCTTTACCTAGTTTGATATTTGCACCCAGGGGATCCATCTTTCCCATACGAACgt > 2:1239020/1‑288 (MQ=255) aTGGTTTTGACAATTGGCGTGGCATCACGGTGATAAACATAAGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACGCCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACgg > 2:1487692/1‑289 (MQ=255) aTGGTTTTGACAATTGGCGTGGCATCACGGTGATAAACATAAGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACGCCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACgg > 2:707614/1‑289 (MQ=255) tttGACAATTGGCGTGGCATCACGGTGATAAACATAAGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACGCCAGTGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTc < 2:917273/289‑1 (MQ=255) tttGACAATTGGCGTGGCATCACGGTGATAAACATAAGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACGCCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGt < 2:267418/288‑1 (MQ=255) tGGCGTGGCATCACGGTGATAAACATAAGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACGCCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCg < 1:1401039/289‑1 (MQ=255) tGGCGTGGCATCACGGTGATAAACATAAGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACGCCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCg > 1:332811/1‑289 (MQ=255) gTGGCATAACGGTGATAAACATAAGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACGCCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACg < 2:1709822/288‑1 (MQ=255) gATCAACATAAGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACGCCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCg < 2:1080346/288‑1 (MQ=255) gATAAACATAAGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACGCCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCg < 1:49511/288‑1 (MQ=255) gATAAACATAAGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACGCCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCg < 1:1323297/288‑1 (MQ=255) aTAAACATAAGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACGCCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCCGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTCAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGTTGTCCCTCGTTCGCCGCTCCCAAAGa > 2:1069224/1‑284 (MQ=255) aTAAACATAAGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACGCCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGct > 2:1514343/1‑276 (MQ=255) aTAAACATAAGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACGCCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGccc > 2:186846/1‑286 (MQ=255) aTAAACATAAGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACGCCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGAcc > 1:1813483/1‑286 (MQ=255) aaCATAAGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACGCCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGc < 1:1934931/289‑1 (MQ=255) aaCATAAGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACGCCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGc < 1:1001174/289‑1 (MQ=255) aCATAAGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACGCCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGcc < 1:1515216/289‑1 (MQ=255) ggCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACGCCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACg > 1:719014/1‑242 (MQ=255) ggCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACGCCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACt > 1:1852618/1‑289 (MQ=255) ccAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACGCCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTgg > 2:1607923/1‑288 (MQ=255) ggCAAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACGCCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACg < 2:307607/289‑1 (MQ=255) gCCAGAGTAAGAACGGTGAGCGACCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACGCCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGCCCGCTTGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAACCGc > 1:1118782/1‑289 (MQ=255) gtgagcgaccccAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACGCCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCg > 2:722314/9‑244 (MQ=255) gtgagcgaccccAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACGCCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGcc > 2:89482/9‑250 (MQ=255) gtgagcgaccccAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACGCCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGc > 2:254758/9‑288 (MQ=255) gtgagcgaccccAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACGCCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGc > 1:798078/9‑288 (MQ=255) gtgagcgaccccAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACGCCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGc > 1:1187914/9‑288 (MQ=255) gtgagcgaccccAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACGCCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGc > 1:1256389/9‑288 (MQ=255) gtgagcgaccccAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACGCCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGc > 1:390432/9‑288 (MQ=255) gtgagcgaccccAACATAACGCGGAGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACGCCAGGGCAACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTATTAACTTCCTGATTAATCACCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTGAGGAATTCTGAATAGCTTGGTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCACAGGGGATCCAACGTTCGCATACGAACTGATGTCCCTCGTGCGCCGCTCTCAACGACCGCGGGCCTGAACTGTGGCTCAGCATGAACGCAGGTTCCTTTTTGc > 2:648502/9‑288 (MQ=255) tgagcgaccccAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACGCCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCt < 2:328266/281‑1 (MQ=255) ccAACATACCGCGGTGTGGTAGCGGTAAATTATTAAACGCCCGGGCAGCAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTGCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCCGGTTGCTTTTTGCTcaaccaa < 2:526862/286‑1 (MQ=255) ccAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACGCCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACtg < 2:1624983/289‑1 (MQ=255) cATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACGCCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGtt < 2:1304092/289‑1 (MQ=255) caaagcgGTGTGGTGGCGGTAAATTATAAAACGCCAGGGCTACAGGGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCATCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCt < 2:1546420/285‑1 (MQ=255) aCGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACGCCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTa > 1:1546420/1‑289 (MQ=255) aCGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACGCCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTa > 1:904766/1‑289 (MQ=255) gcgGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACGCCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTAt < 2:1947005/288‑1 (MQ=255) ggTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACGCCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTAttt < 1:528221/288‑1 (MQ=255) ggTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACGCCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTc > 1:1223554/1‑289 (MQ=255) tgtgGTCGCGGTAAATTATTAAACGCCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCAt > 1:1878816/1‑289 (MQ=255) tgtgGTCGCGGTAAATTATTAAACGCCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCAt > 2:1126390/1‑289 (MQ=255) tgtgGTCGCGGTAAATTATTAAACGCCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCAt > 1:138202/1‑289 (MQ=255) tgtgGTCGCGGTAAATTATTAAACGCCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCAt > 2:1435414/1‑289 (MQ=255) gTAAATTATTAAACGCCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCt > 2:1893467/1‑288 (MQ=255) gTAAATTATTAAACGCCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCt > 2:1373157/1‑288 (MQ=255) ttattaAACGCCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTgcgcgc < 2:810475/289‑1 (MQ=255) atagtaAACGCCAGGGCGACAGGGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTGACTAATTAAGCTCCTTGCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTATTTTACCCAGTTTTATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTGCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTgcgcgc < 2:624888/285‑1 (MQ=255) aaCGCCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGGGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGtt > 1:1434259/1‑289 (MQ=255) ccAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTAt > 2:608639/1‑259 (MQ=255) cAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTc > 1:1272924/1‑213 (MQ=255) cAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTAt > 2:1834917/1‑258 (MQ=255) cAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAAtc < 1:431846/289‑1 (MQ=255) gCGACAGAGCGGTCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCGTTCCGTCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAAtct < 2:1037557/286‑1 (MQ=255) cAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTAt < 2:842324/250‑1 (MQ=255) gCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAAc < 1:707614/288‑1 (MQ=255) tATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTaaaa > 2:1795380/1‑289 (MQ=255) gCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCaa > 1:649551/1‑288 (MQ=255) gCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAg < 1:1796045/289‑1 (MQ=255) gTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGgt > 2:450625/1‑289 (MQ=255) aaTCACTTCCTCATTATTCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATATGGGTTGGCTAATTGTCTCAGTAATTCTGACTAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGCCGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGgtg < 1:477130/288‑1 (MQ=255) aaTCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGgtgt < 1:204672/289‑1 (MQ=255) tacACTTCCTCATTTATCTCCTTTCGGGCAGATCGCGTACTGGTTGGCTAATTGACTCAAGAATTCTGAATAGCGTGTTTTACCCAGTCTGATGTTCGTCCCCGTGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGTATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCTCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGGAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTc < 2:1407271/287‑1 (MQ=255) aTCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTc < 2:798078/289‑1 (MQ=255) aTCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTc < 2:557891/289‑1 (MQ=255) aCTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGt < 1:579549/289‑1 (MQ=255) ttCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTcc > 1:991424/1‑289 (MQ=255) aTCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAACATGACCAAGCGGGGTCAGGCCCAACCGtttt > 2:1587671/1‑289 (MQ=255) tctcCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGttttt < 1:756805/289‑1 (MQ=255) tcCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCg < 1:1870456/289‑1 (MQ=255) ccTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGGTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGa > 1:1105431/1‑289 (MQ=255) tttCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGaaa < 1:1367270/289‑1 (MQ=255) tttCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGaaa < 2:399738/289‑1 (MQ=255) tttCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGaaa < 1:1918450/289‑1 (MQ=255) tttCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGAACAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGaaa > 1:1143146/1‑289 (MQ=255) tCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATa < 1:1587027/289‑1 (MQ=255) ggCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGcc > 1:1716702/1‑289 (MQ=255) gCTAATTGACTCAGGAATTCTGAGTAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGa > 1:1704720/1‑289 (MQ=255) tAATTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGaaa < 1:312626/289‑1 (MQ=255) aaTTGACCCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTCCCCAGTTTGTTATTCGGCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAAt < 2:1187914/289‑1 (MQ=255) aTTGACTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATa > 1:1863732/1‑289 (MQ=255) cTCAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCtt < 1:831148/289‑1 (MQ=255) cAGGAATTCTGAATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAACCGAAATAACCttt > 2:945681/1‑288 (MQ=255) ||| ATCGGCTCACTGGCTTCAGGTAAGAGGCTACGAATTTCGTTCTGTTCCAGCTCAATGGTTTTGACAATTGGCGTGGCATCACGGTGATAAACATAAGGCCGCCAGACAGCGACGGCCAGAGTAAGAACGGTGAGGCTCCCCAACATAACGCGGTGTGGTCGCGGTAAATTATTAAACGCCAGGGCGACAGAGCGGGCTATCTGTTGCACGTAATCACTTCCTCATTAATCTCCTTTCAGGCAGCTCGCATACTGGTTGGCTAATTGACTCAGGAATTCACTATAGCTTGTTTTACCCAGTTTGATATTCGTCCCCAGGGGATCCAACGTTCCCATACGAACGGATGTCCCTCGTGCGACGCTCTCAACGACCGCTGGCCTGAACTGTGGCTCAGCAAAAACGCAGGTTGCTTTTTGCTCAACCAACTGTGTTCTTATTTCATGTAAACGCTGCGCGCCAGGTTGAATCTCAGGGTTAACGGTAAAATGACCAAGCGGTGTCAGTCCAAACTGTTTTTCGAAATAGCCGTAAGCATCGTGAAAAACGAAATAACCTTT > CP042583/1622146‑1622702 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |