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| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base G (138/129); minor base T (4/2); total (142/131) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.86e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 273 total aligned reads displayed.
CGATACCGAATGGCGTTCCGACTGGAAATGGGATCGTGTTCTGCCCCATCTTTCTGATTTAACCGGACGCACCATTCTGGATGTCGGCTGCGGCAGCGGTTATCACATGTGGCGCATGATTGGCGCAGGCGCGCACCTCGCGGTGGGGATCGACCCTACGCAACTGTTTCTGTGCCAGTTTGAAGCGGTGCGTAAACTACTGGGTAATGATCAGCGCGCGCATTTGTTACCGTTAGGTATTGAACAACTTCCGGCACTGAAAGCCTTTGATACCGTCTTTAGCATGGGCGTGCTTTACCATCGCCGTAGTCCGCTGGAGCATCTATGGCAGTTGAAAGATCAACTGGTCAATGAAGGTGAACTGGTGCTGGAAACGCTGGTTATTGATGGTGATGAGAACACGGTGCTGGTACCAGGCGATCGTTACGCGCAAATGCGTAATGTCTATTTCATCCCTTCCGCGCTGGCGCTGAAAAACTGGCTGAAGAAGTGTG‑GTTTTGTAGATATCCGCATTGCGGATGTGAGCGTTACCACCACAGAAGAGCAGCGACGCACCGAATGG > CP042583/1634492‑1635053 ||| cGATACCGAATGGCGTTCCGACTGGAAATGGGATCGTGTTCTGCCCCATCTTTCTGATTTATCCGGACGCACCATTCTGGATGTCGGCTGCGGCAGCGGTTATCACATGTGGCGCATGATTGGCGCAGGCGCGCACCTCGCGGTGGGGATCGACCCTACGCAACTGTTTCTGTGCCAGTTTGAAGCGGTGCGTAAACTACTGGGTAATGATCAGCGCGCGCATTTGTTACCGTTAGGTATTGAACAACTTCCGGCACTGAAAGCCTTTGATACCGTCTTTTCGATGGGc < 1:246320/289‑1 (MQ=255) 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tGAAAGCCTTTGATACCGTCTTTTCGATGGGCGTGCTTTACCATCGCCGTTCACCGCTGGAGCATCTATGGCAGTTGAAAGATCAACTGGTCAATGAAGGTGAACTGGTGCTGGAAACGCTGGTTATTGATGGTGATGAGAACACGGTGCTGGTACCAGGCGATCGTTACGCGCAAATGCGTAATGTCTATTTCATCCCTTCCGCGCTGGCGCTGAAAAACTGGCTGAAGAAGTGTG‑GTGTTGTAGATATCCTCATTGCGGATGTGAGCGTTACCACCACAGAAGagca > 2:756389/1‑289 (MQ=255) cTTTGATAACGTCTTTTCGATGGGCGTGCTTTACCATCGCCGTTCACCGCTGGAGCATCTATGGCAGTTGAAAGATCAACTGGTCAATGAAGGTGAACTGGTGCTGGAAACGCTGGTTATTGATGGTGATGAGAACACGGTGCTGGTACCAGGCGATCGTTACGCGCAAATGCGTAATGTCTATTTCATCCCTTCCGCGCTGGCGCTGAAAAACTGGCTGAAGAAGTGTG‑GTTTTGTAGATATCCGCATTGCGGATGTGAGCGTTACCACCACAGAAGAGCAGCGAc < 2:1898933/287‑1 (MQ=255) tGATACCGTCTTTTCGATGGGCGTGCTTTACCATCGCCGTTCACCGCTGGAGCATCTATGGCAGTTGAAAGATCAACTGGTCAATGAAGGTGAACTGGTGCTGGAAACGCTGGTTATTGATGGTGATGAGAACACGGTGCTGGTACCAGGCGATCGTTACGCGCAAATGCGTAATGTCTATTTCATCCCTTCCGCGCTGGCGCTGAAAAACTGGCTGAAGAAGTGTG‑GTTTTGTAGATATCCGCATTGCGGATGTGAGCGTTACCACCCCAGAAGAGCAGCGACGCAcc > 1:20055/1‑289 (MQ=255) ccGTCTTTTCGATGGGCGTGCTTTACCATCGCCGTTCACCGCTGGAGCATCTATGGCAGTTGAAAGATCAACTGGTCAATGAAGGTGAACTGGTGCTGGAAACGCTGGTTATTGATGGTGATGAGAACACGGTGCTGGTACCAGGCGATCGTTACGCGCAAATGCGTAATGTCTATTTCATCCCTTCCGCGCTGGCGCTGAAAAACTGGCTGAAGAAGTGTG‑GTTTTGTAGATATCCGCATTGCGGATGTGAGCGTTACCACCACAGAAGAGCAGCGACGCACCGAatg < 2:728630/289‑1 (MQ=255) cGTCTTTTCGATGGGCGTGCTTTACCATCGCCGTTCACCGCTGGAGCATCTATGGCAGTTGAAAGATCAACTGGTCAATGAAGGTGAACTGGTGCTGGAAACGCTGGTTATTGATGGTGATGAGAACACGGTGCTGGTACCAGGCGATCGTTACGCGCAAATGCGTAATGTCTATTTCATCCCTTCCGCGCTGGCGCTGAAAAACTGGCTGAAGAAGTGTG‑GTTTTGTAGATATCCGCATTGCGGATGTGAGCGTTACCACCACAGAAGAGCAGCGACGCACCGAatgg < 1:510186/289‑1 (MQ=255) cGTCTTTTCGATGGGCGTGCTTTACCATCGCCGTTCACCGCTGGAGCATCTATGGCAGTTGAAAGATCAACTGGTCAATGAAGGTGAACTGGTGCTGGAAACGCTGGTTATTGATGGTGATGAGAACACGGTGCTGGTACCAGGCGATCGTTACGCGCAAATGCGTAATGTCTATTTCATCCCTTCCGCGCTGGCGCTGAAAAACTGGCTGAAGAAGTGTG‑GTTTTGTAGATATCCGCATTGCGGATGTGAGCGTTACCACCACAGAAGAGCAGCGACGCACCGAatgg > 1:544217/1‑289 (MQ=255) ||| CGATACCGAATGGCGTTCCGACTGGAAATGGGATCGTGTTCTGCCCCATCTTTCTGATTTAACCGGACGCACCATTCTGGATGTCGGCTGCGGCAGCGGTTATCACATGTGGCGCATGATTGGCGCAGGCGCGCACCTCGCGGTGGGGATCGACCCTACGCAACTGTTTCTGTGCCAGTTTGAAGCGGTGCGTAAACTACTGGGTAATGATCAGCGCGCGCATTTGTTACCGTTAGGTATTGAACAACTTCCGGCACTGAAAGCCTTTGATACCGTCTTTAGCATGGGCGTGCTTTACCATCGCCGTAGTCCGCTGGAGCATCTATGGCAGTTGAAAGATCAACTGGTCAATGAAGGTGAACTGGTGCTGGAAACGCTGGTTATTGATGGTGATGAGAACACGGTGCTGGTACCAGGCGATCGTTACGCGCAAATGCGTAATGTCTATTTCATCCCTTCCGCGCTGGCGCTGAAAAACTGGCTGAAGAAGTGTG‑GTTTTGTAGATATCCGCATTGCGGATGTGAGCGTTACCACCACAGAAGAGCAGCGACGCACCGAATGG > CP042583/1634492‑1635053 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |