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Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,635,068 | 0 | C | G | 98.5% | 764.9 / NA | 330 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
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Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.67e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 330 total aligned reads displayed.
TACCATCGCCGTAGTCCGCTGGAGCATCTATGGCAGTTGAAAGATCAACTGGTCAATGAAGGTGAACTGGTGCTGGAAACGCTGGTTATTGATGGTGATGAGAACACGGTGCTGGTACCAGGCGATCGTTACGCGCAAATGCGTAATGTCTATTTCATCCCTTCCGCGCT‑GGCGCTGAAAAACTGGCTGAAGAAGTGTGGTTTTGTAGATATCCGCATTGCGGATGTGAGCGTTACCACCACAGAAGAGCAGCG‑ACGCACCGAATGGATGGTTACCGAAAGCCTGGCCGATTTCCTCGACCCACATGATCCGGGTAAAACGGTGGAAGGTTATCCGGCACCTAAACGCGCGGTGCTGATTGCGCGCAAGCCGTAAAGGTCTGGTATTACTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCTTGCTAATTCAATATATTGCAGGGACTATGTAGGCCTGATAAGCATAGCGCATCAGGCAGCTTTACGTTTGCATAACCTCAGCGCCCGTTTCCGGGCGCTATTCACGTCTTACGCCTGAACAGCTGGC > CP042583/1634787‑1635344 ||| aCCATCGCCGTTCACCGCTGGAGCATCTATGGCAGTTGAAAGATCAACTGGTCAATGAAGGTGAACTGGTGCTGGAAACGCTGGTTATTGATGGTGATGAGAACACGGTGCTGGTACCAGGCGATCGTTACGCGCAAATGCGTAATGTCTATTTCATCCCTTCCGCGCT‑GGCGCTGAAAAACTGGCTGAAGAAGTGTGGTTTTGTAGATATCCGCATTGCGGATGTGAGCGTTACCACCACAGAAGAGCAGCG‑ACGCACCGAATGGATGGTTACCGAATCGCTGGCCGa < 1:689156/289‑1 (MQ=255) 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TACCATCGCCGTAGTCCGCTGGAGCATCTATGGCAGTTGAAAGATCAACTGGTCAATGAAGGTGAACTGGTGCTGGAAACGCTGGTTATTGATGGTGATGAGAACACGGTGCTGGTACCAGGCGATCGTTACGCGCAAATGCGTAATGTCTATTTCATCCCTTCCGCGCT‑GGCGCTGAAAAACTGGCTGAAGAAGTGTGGTTTTGTAGATATCCGCATTGCGGATGTGAGCGTTACCACCACAGAAGAGCAGCG‑ACGCACCGAATGGATGGTTACCGAAAGCCTGGCCGATTTCCTCGACCCACATGATCCGGGTAAAACGGTGGAAGGTTATCCGGCACCTAAACGCGCGGTGCTGATTGCGCGCAAGCCGTAAAGGTCTGGTATTACTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCTTGCTAATTCAATATATTGCAGGGACTATGTAGGCCTGATAAGCATAGCGCATCAGGCAGCTTTACGTTTGCATAACCTCAGCGCCCGTTTCCGGGCGCTATTCACGTCTTACGCCTGAACAGCTGGC > CP042583/1634787‑1635344 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |