Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 1,667,069 | 3 bp→TCA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 1,667,069 | 0 | A | T | 99.6% | 644.7 / NA | 274 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); new base T (137/135); total (138/136) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,667,070 | 0 | G | C | 99.6% | 639.8 / NA | 274 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base C (137/135); minor base T (1/0); total (138/136) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.95e-01 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,667,071 | 0 | T | A | 99.3% | 642.9 / NA | 274 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base A (136/135); minor base C (2/0); total (138/136) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.98e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 274 total aligned reads displayed.
ATATCATCGAGCAACGTCAGTAAACTACTCCCGGCCAAAAGCATTCCCTCTCATTTTTATTGTTGAAGGGTGTAAGTATGAAGCAAAAACGGCAGCTCTGATACTTGCTTCACAGGTCAACATTTTTTTAACAATCAAGTGCAATTATATCTCTCGCCAGCAGAATGATTTTCACGTTTACTATGAACCACCTTTTTATTTCCACCGTGAGGGATTATGCGTTTCCGCCAGTTGTTACCGCTTTTTGGCGCGCTGTTTGCGTTGTATATCATTTGGGGCAGTACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTAGTGGTTGCAACCGTGCCCCTCTTTACCCTGTGCTTCAGCCGC > CP042583/1666790‑1667350 ||| atatCATCGAGCAACGTCAGTAAACTACTCCCGGCCAAAAGCATTCCCTCTCATTTTTATTGTTGAAGGGTGTAAGTATGAAGCAAAAACGGCAGCTCTGATACTTGCTTCACAGGTCAACATTTTTTTAACAATCAAGTGCAATTATATCTCTCGCCAGCAGAATGATTTTCACGTTTACTATGAACCACCTTTTTATTTCCACCGTGAGGGATTATGCGTTTCCGCCAGTTGTTACCGCTTTTTGGCGCGCTGTTTGCGTTGTATATCATTTGGGGCTCAACCTAtt > 1:771168/1‑289 (MQ=255) atatCATCGAGCAACGTCAGTAAACTACTCCCGGCCAAAAGCATTCCCTCTCATTTTTATTGTTGAAGGGTGTAAGTATGAAGCAAAAACGGCAGCTCTGATACTTGCTTCACAGGTCAACATTTTTTTAACAATCAAGTGCAATTATATCTCTCGCCAGCAGAATGATTTTCACGTTTACTATGAACCACCTTTTTATTTCCACCGTGAGGGATTATGCGTTTCCGCCAGTTGTTACCGCTTTTTGGCGCGCTGTTTGCGTTGTATATCATTTGGGGCTCAACCTAtt > 1:1313843/1‑289 (MQ=255) atatCATCGAGCAACGTCAGTAAACTACTCCCGGCCAAAAGCATTCCCTCTCATTTTTATTGTTGAAGGGTGTAAGTATGAAGCAAAAACGGCAGCTCTGATACTTGCTTCACAGGTCAACATTTTTTTAACAATCAAGTGCAATTATATCTCTCGCCAGCAGAATGATTTTCACGTTTACTATGAACCACCTTTTTATTTCCACCGTGAGGGATTATGCGTTTCCGCCAGTTGTTACAGCTTTTTGGCGCGCTGTTTGCGTTGTATATCATTTGGGGCTCAACCTAtt > 1:737589/1‑289 (MQ=255) cGAGCAACGTCAGTAAACTACTCCCGGCCAAAAGCATTCCCTCTCATTTTTATTGTTGAAGGGTGTAAGTATGAAGCAAAAACGGCAGCTCTGATACTTGCTTCACAGGTCAACATTTTTTTAACAATCAAGTGCAATTATATCTCTCGCCAGCAGAATGATTTTCACGTTTACTATGAACCACCTTTTTATTTCCACCGTGAGGGATTATGCGTTTCCGCCAGTTGTTACCGCTTTTTGGCGCGCTGTTTGCGTTGTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCAt > 1:85223/1‑289 (MQ=255) aGCAACGTCAGTAAACTACTCCCGGCCAAAAGCATTCCCTCTCATTTTTATTGTTGAAGGGTGTAAGTATGAAGCAAAAACGGCAGCTCTGATACTTGCTTCACAGGTCAACATTTTTTTAACAATCAAGTGCAATTATATCTCTCGCCAGCAGAATGATTTTCACGTTTACTATGAACCACCTTTTTATTTCCACCGTGAGGGATTATGCGTTTCCGCCAGTTGTTACCGCTTTTTGGCTCGCTGTTTGCGTTGTATATCATTTGGTGCTCAACCTATTTTGTCATTc > 1:798302/1‑289 (MQ=255) cAACGTCAGTAAACTACTCCCGGCCAAAAGCATTCCCTCTCATTTTTATTGTTGAAGGGTGTAAGTATGAAGCAAAAACGGCAGCTCTGATACTTGCTTCACAGGTCAACATTTTTTTAACAATCAAGTGCAATTATATCTCTCGCCAGCAGAATGATTTTCACGTTTACTATGAACCACCTTTTTATTTCCACCGTGAGGGATTATGCGTTTCCGCCAGTTGTTACCGCTTTTTGGCGCGCTGTTTGCGTTGTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCgg > 2:746262/1‑289 (MQ=255) cGTCAGTAAACTACTCCCGGCCAAAAGCATTCCCTCTCATTTTTATTGTTGAAGGGTGTAAGTATGAAGCAAAAACGGCAGCTCTGATACTTGCTTCACAGGTCAACATTTTTTTAACAATCAAGTGCAATTATATCTCTCGCCAGCAGAATGATTTTCACGTTTACTATGAACCACCTTTTTATTTCCACCGTGAGGGATTATGCGTTTCCGCCAGTTGTTACCGCTTTTTGGCGCGCTGTTTGCGTTGTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGAtt > 1:289879/1‑289 (MQ=255) aaaCTACTCCCGGCCAAAAGCATTCCCTCTCATTTTTATTGTTGAAGGGTGTAAGTATGAAGCAAAAACGGCAGCTCTGATACTTGCTTCACAGGTCAACATTTTTTTAACAATCAAGTGCAATTATATCTCTCGCCAGCAGAATGATTTTCACGTTTACTATGAACCACCTTTTTATTTCCACCGTGAGGGATTATGCGTTTCCGCCAGTTGTTACCGCTTTTTGGCGCGCTGTTTGCGTTGTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTg < 1:155944/288‑1 (MQ=255) actCCCGGCCAAAAGCATTCCCTCTCATTTTTATTGTTGAAGGGTGTAAGTATGAAGCAAAAACGGCAGCTCTGATACTTGCTTCACAGGTCAACATTTTTTTAACAATCAAGTGCAATTATATCTCTCGCCAGCAGAATGATTTTCACGTTTACTATGAACCACCTTTTTATTTCCACCGTGAGGGATTATGCGTTTCCGCCAGTTGTTACCGCTTTTTGGCGCGCTGTTTGCGTTGTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGc > 2:1724069/1‑289 (MQ=255) ctCCCGGCCAAAAGCATTCCCTCTCATTTTTATTGTTGAAGGGTGTAAGTATGAAGCAAAAACGGCAGCTCTGATACTTGCTTCACAGGTCAACATTTTTTTAACAATCAAGTGCAATTATATCTCTCGCCAGCAGAATGATTTTCACGTTTACTATGAACCACCTTTTTATTTCCACCGTGAGGGATTATGCGTTTCCGCCAGTTGTTACCGCTTTTTGGCGCGCTGTTTGCGTTGTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGaaa > 1:1515714/1‑286 (MQ=255) tCCCGGCCAAAAGCATTCCCTCTCATTTTTATTGTTGAAGGGTGTAAGTATGAAGCAAAAACGGCAGCTCTGATACTTGCTTCACAGGTCAACATTTTTTTAACAATCAAGTGCAATTATATCTCTCGCCAGCAGAATGATTTTCACGTTTACTATGAACCACCTTTTTATTTCCACCGTGAGGGATTATGCGTTTCCGCCAGTTGTTACCGCTTTTTGGCGCGCTGTTTGCGTTGTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTg > 1:1106751/1‑289 (MQ=255) ccGGGCAAAAGCATTCCCCCTCATTTTTATTGTTGAAGGGGATAGGTATGAAGCAAAATCGGCATCTCTGCTACTTGCTTCACAGGTCAACATTTTTTTACCAATCAAGTGCAATTATATCTCTCGCCAGCAGAATGATTTTCACGTTTACTATGAACCACCTTTTTATTTCCACCGTGAGGGATTATGCGTTTCCGCCAGTTGTTACCGCTTTTTGGCGCGCTGTTTGCGTTGTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGc < 2:1899281/289‑1 (MQ=255) ccGGCCAAAAGCATTCCCTCTCATTTTTATTGTTGAAGGGTGTAAGTATGAAGCAAAAACGGCAGCTCTGATACTTGCTTCACAGGTCAACATTTTTTTAACAATCAAGTGCAATTATATCTCTCGCCAGCAGAATGATTTTCACGTTTACTATGAACCACCTTTTTATTTCCACCGTGAGGGATTATGCGTTTCCGCCAGTTGTTACCGCTTTTTGGCGCGCTGTTTGCGTTGTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGc < 1:338564/289‑1 (MQ=255) ccGGCCAAAAGCATTCCCTCTCATTTTTATTGTTGAAGGGTGTAAGTATGAAGCAAAAACGGCAGCTCTGATACTTGCTTCACAGGTCAACATTTTTTTAACAATCAAGTGCAATTATATCTCTCGCCAGCAGAATGATTTTCACGTTTACTATGAACCACCTTTTTATTTCCACCGTGAGGGATTATGCGTTTCCGCCAGTTGTTACCGCTTTTTGGCGCGCTGTTTGCGTTGTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGc < 2:1301827/289‑1 (MQ=255) ccGGCCAAAAGCATTCCCTCTCATTTTTATTGTTGAAGGGTGTAAGTATGAAGCAAAAACGGCAGCTCTGATACTTGCTTCACAGGTCAACATTTTTTTAACAATCAAGTGCAATTATATCTCTCGCCAGCAGAATGATTTTCACGTTTACTATGAACCACCTTTTTATTTCCACCGTGAGGGATTATGCGTTTCCGCCAGTTGTTACCGCTTTTTGGCGCGCTGTTTGCGTTGTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGc < 2:430006/289‑1 (MQ=255) ggCCAAAAGCATTCCCTCTCATTTTTATTGTTGAAGGGTGTAAGTATGAAGCAAAAACGGCAGCTCTGATACTTGCTTCACAGGTCAACATTTTTTTAACAATCAAGTGCAATTATATCTCTCGCCAGCAGAATGATTTTCACGTTTACTATGAACCACCTTTTTATTTCCACCGTGAGGGATTATGCGTTTCCGCCAGTTGTTACCGCTTTTTGGCGCGCTGTTTGCGTTGTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCt < 1:1040027/289‑1 (MQ=255) gCCAAAAGCATTCCCTCTCATTTTTATTGTTGAAGGGTGTAAGTATGAAGCAAAAACGGCAGCTCTGATACTTGCTTCACAGGTCAACATTTTTTTAACAATCAAGTGCAATTATATCTCTCGCCAGCAGAATGATTTTCACGTTTACTATGAACCACCTTTTTATTTCCACCGTGAGGGATTATGCGTTTCCGCCAGTTGTTACCGCTTTTTGGCGCGCTGTTTGCGTTGTATATCATTTGGGGCTCAACCTCTTTTGTCATTCGGATTGCCGTGGAAAGCTGGCCt > 2:355506/1‑288 (MQ=255) gCCAAAAGCATTCCCTCTCATTTTTATTGTTGAAGGGTGTAAGTATGAAGCAAAAACGGCAGCTCTGATACTTGCTTCACAGGTCAACATTTTTTTAACAATCAAGTGCAATTATATCTCTCGCCAGCAGAATGATTTTCACGTTTACTATGAACCACCTTTTTATTTCCACCGTGAGGGATTATGCGTTTCCGCCAGTTGTTACCGCTTTTTGGCGCGCTGTTTGCGTTGTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGc < 1:1740759/286‑1 (MQ=255) aaaGCATTCCCTCTCATTTTTATTGTTGAAGGGTGTAAGTCTGAAGCAAAAACGGCAGCTCTGATACTTGCTTCACAGGTCAACATTTTTTTAACAATCAAGTGCAATTATATCTCTCGCCCGCAGAATGATTTTCACGTTTACTATGAACCACCTTCTTATTTCCACCGTGAGGGATTATGCGTTTCCGCCAGTTGTTACAGCTTTTTGCCGCGCTGTCTGCGTGTCATATAATTTGTGGCACAACCTTTTTTGTCATTCGGCTTGGCGTGGAAAGTTGGCCTCCGtt > 2:213383/1‑289 (MQ=255) tCCCTCTCATTTTTATTGTTGAAGGGTGTAAGTATGAAGCAAAAACGGCAGCTCTGATACTTGCTTCACAGGTCAACATTTTTTTAACAATCAAGTGCAATTATATCTCTCGCCAGCAGAATGATTTTCACGTTTACTATGAACCACCTTTTTATTTCCACCGTGAGGGATTATGCGTTTCCGCCAGTTGTTACCGCTTTTTTGCGCGTTGTTTGCGTTGTATTTCATTTGGGGCTCACCCTATTTTGTCATTCGGCTTGGCTTGGATAGCTGGCGTCCGTTAattatg > 2:1646481/1‑289 (MQ=255) tCCCTCTCATTTTTATTGTTGAAGGGTGTAAGTATGAAGCAAAAACGGCAGCTCTGATACTTGCTTCACAGGTCAACATTTTTTTAACAATCAAGTGCAATTATATCTCTCGCCAGCAGAATGATTTTCACGTTTACTATGAACCACCTTTTTATTTCCACCGTGAGGGATTATGCGTTTCCGCCAGTTGTTACCGCTTTTTGGCGCGCTGTTTGCGTTGTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGa > 2:593240/1‑257 (MQ=255) tCCCTCTCATTTTTATTGTTGAAGGGTGTAAGTATGAAGCAAAAACGGCAGCTCTGATACTTGCTTCACAGGTCAACATTTTTTTAACAATCAAGTGCAATTATATCTCTCGCCAGCAGAATGATTTTCACGTTTACTATGAACCACCTTTTTATTTCCACCGTGAGGGATTATGCGTTTCCGCCAGTTGTTACCGCTTTTTGGCGCGCTGTTTGCGTTGTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAatgatg > 2:162965/1‑289 (MQ=255) tttttATTGTTGAAGGGTGTAAGTATGAAGCAAAAACGGCAGCTCTGATACTTGCTTCACAGGTCAACATTTTTTTAACAATCAAGTGCAATTATATCTCTCGCCAGCAGAATGATTTTCACGTTTACTATGAACCACCTTTTTATTTCCACCGTGAGGGATTATGCGTTTCCGCCAGTTGTTACCGCTTTTTGGCGCGCTGTTTGCGTTGTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGtt < 1:25673/289‑1 (MQ=255) gAAGGGTGTAAGTATGAAGCAAAAACGGCAGCTCTGATACTTGCTTCACAGGTCAACATTTTTTTAACAATCAAGTGCAATTATATCTCTCGCCAGCAGAATGATTTTCACGTTTACTATGAACCACCTTTTTATTTCGACCGTGAGGGATTATGCGTTTCCGCCAGTTGTTACCGCTTTTTGGCGCGCTGTTTGCGTTGTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGc > 1:596077/1‑289 (MQ=255) tgtAAGTATGAAGCAAAAACGGCAGCTCTGATACTTGCTTCACAGGTCAACATTTTTTTAACAATCAAGTGCAATTATATCTCTCGCCAGCAGAATGATTTTCACGTTTACTATGAACCACCTTTTTATTTCCACCGTGAGGGATTATGCGTTTCCGCCAGTTGTTACCGCTTTTTGGCGCGCTGTTTGCGTTGTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCg < 1:1257035/288‑1 (MQ=255) gAAGCAAAAACGGCAGCTCTGATACTTGCTTCACAGGACAACATTTTTTTAACAATCAAGTGCAATTATATCTATCGCCAGCAGAATGATTTTCACGTTTACTATGAACCACCTTTTTATTTCCACCGTGAGGGATTATGCGTTTCCGCCAGTTGTTACCGCTTTTTGGCGCGCTGTTTGAGTTGTATATCATTTGGGGCTCCACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGAAGTTCGGTTCATGGCAGCCGGTATTTTAtt > 1:1788418/1‑289 (MQ=255) aaGCAAAAACGGCAGCTCTGATACTTGCTTCACAGGTCAACATTTTTTTAACAATCAAGTGCAATTATATCTCTCGCCAGCAGAATGATTTTCACGTTTACTATGAACCACCTTTTTATTTCCGCCGTGAGGGATTATGCGTTTCCGCCAGTTGTTACCGCTTTTTGGCGCGCTGTTTGCGTTGTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTAtt > 1:394594/1‑288 (MQ=255) aaGCAAAAACGGCAGCTCTGATACTTGCTTCACAGGTCAACATTTTTTTAACAATCAAGTGCAATTATATCTCTCGCCAGCAGAATGATTTTCACGTTTACTATGAACCACCTTTTTATTTCCACCGTGAGGGATTATGCGTTTCCGCCAGTTGTTACCGCTTTTTGGCGCGCTGTTTGCGTTGTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGa > 1:1300464/1‑221 (MQ=255) aaGCAAAAACGGCAGCTCTGATACTTGCTTCACAGGTCAACATTTTTTTAACAATCAAGTGCAATTATATCTCTCGCCAGCAGAATGATTTTCACGTTTACTATGAACCACCTTTTTATTTCCACCGTGAGGGATTATGCGTTTCCGCCAGTTGTTACCGCTTTTTGGCGCGCTGTTTGCGTTGTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTCATGTTGTCGGGCGTTCGGTTCCTTGCAGACGGTATTTTATTg > 2:90323/1‑289 (MQ=255) aaGCAAAAACGGCAGCTCTGATACTTGCTTCACAGGTCAACATTTTTTTAACAATCAAGTGCAATTATATCTCTCGCCAGCAGAATGATTTTCACGTTTACTATGAACCACCTTTTTATTTCCACCGTGAGGGATTATGCGTTTCCGCCAGTTGTTACCGCTTTTTGGCGCGCTGTTTGCGTTGTATATCATTTGAGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGc > 2:1145378/1‑239 (MQ=255) aaGCAAAAACGGCAGCTCTGATACTTGCTTCACAGGTCAACATTTTTTTAACAATCAAGTGCAATTATATCTCTCGCCAGCAGAATGATTTTCACGTTTACTATGAACCACCTTTTTATTTCCACCGTGAGGGATTATGCGTTTCCGCCAGTTGTTACCGCTTTTTGGCGCGCTGTTTGCGTTGTATATCATTTGAGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGc < 1:1145378/239‑1 (MQ=255) aaaaaCGGCAGTTCTGATACTTGCTTAGCAGGTCAACATTGTTTTAACAATCAAGTGCAATTATATCTCTCGCCAGCAGAATGATTTTCACGTTTACTATGCACCACCTTTTTATTTCCACCGTGAGGGATTATGCGTTTCCGCCAGTTGTTACCGCTTTTTGGCGCGCTGTTTGCGTTGTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTg < 2:1434918/288‑1 (MQ=255) aaaaCGGCAGCTCTGATACTTGCTTCACAGGTCAACATTTTTTTAACAATCAAGTGCAATTATATCTCTCGCCAGCAGAATGATTTTCACGTTTACTATGAACCACCTTTTTATTTCCACCGTGAGGGATTATGCGTTTCCGCCAGTTGTTACCGCTTTTTGGCGCGCTGTTTGCGTTGTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGc < 1:367552/289‑1 (MQ=255) tctGATACTTGCTTCACAGGTCAACATTTTTTTAACAATCAAGTGCAATTATATCTCTCGCCAGCAGAATGATTTTCACGTTTACTATGAACCACCTTTTTATTTCCACCGTGAGGGATTATGCGTTTCCGCCAGTTGTTACCGCTTTTTGGCGCGCTGTTTGCGTTGTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGc > 1:1946699/1‑260 (MQ=255) aTACTTGCTTCACAGGTCAACATTTTTTTAACAATCAAGTGCAATTATATCTCTCGCCAGCAGAATGATTTTCACGTTTACTATGAACCACCTTTTTATTTCCACCGTGAGGGATTATGCGTTTCCGCCAGTTGTTACCGCTTTTTGGCGCGCTGTTTGCGTTGTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTgc > 1:778877/1‑288 (MQ=255) tGCTTCACAGGTCAACATTTTTTTAACAATCAAGTGCAATTATATCTCTCGCCAGCAGAATGATTTTCACGTTTACTATGAACCACCTTTTTATTTCCACCGTGAGGGATTATGCGTTTCCGCCAGTTGTTACCGCTTTTTGGCGCGCTGTTTGCGTTGTATATCA‑TTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGac > 2:176343/1‑288 (MQ=255) ggTCAACATTTTTTTAACAATCAAGTGCAATTATATCTCTCGCCAGCAGAATGATTTTCACGTTTACTATGAACCACCTTTTTATTTCCACCGTGAGGGATTATGCGTTTCCGCCAGTTGTTACCGCTTTTTGGCGCGCTGTTTGCGTTGTATATCATTTGGGGCTCAACTTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGTCGGCTTTTTTGTCACTGCGCGGACATAAACTc > 2:356748/1‑288 (MQ=255) ggTCAACATTTTTTTAACAATCAAGTGCAATTATATCTCTCGCCAGCAGAATGATTTTCACGTTTACTATGAACCACCTTTTTATTTCCACCGTGAGGGATTATGCGTTTCCGCCAGTTGTTACCGCTTTTTGGCGCGCTGTTTGCGTTGTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAACGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCTGGGCCGCCGGTATGTCTTTCCTGGCATGTTTGCTCCTGCCGGGGCACACACTc > 2:1749697/1‑288 (MQ=255) ggTCAACATTTTTTTAACAATCAAGTGCAATTATATCTCTCGCCAGCAGAATGATTTTCACGTTTACTATGAACCACCTTTTTATTTCCACCGTGAGGGATTATGCGTTTCCGCCAGTTGTTACCGCTTTTTGGCGCGCTGTTTGCGTTGTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTCTTTTTTTGCTGGACTTTTTGCTAATGCCTGGacaacaacct > 2:777531/1‑281 (MQ=255) gTCAACATTTTTTTAACAATCAAGTGCAATTATATCTCTCGCCAGCAGAATGATTTTCACGTTTACTATGAACCACCTTTTTATTTCCACCGTGAGGGATTATGCGTTTCCGCCAGTTGTTACCGCTTTTTGGCGCGCTGTTTGCGTTGTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTcc > 1:1535008/1‑288 (MQ=255) gTCAACATTTTTTTAACAATCAAGTGCAATTATATCTCTCGCCAGCAGAATGATTTTCACGTTTACTATGAACCACCTTTTTATTTCCACCGTGAGGGATTATGCGTTTCCGCCAGTTGTTACCGCTTTTTGGCGCGCTGTTTGCGTTGTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTcc > 2:481761/1‑288 (MQ=255) tCAACATTTTTTTAACAATCAAGTGCAATTATATCTCTCGCCAGCAGAATGATTTTCACGTTTACTATGAACCACCTTTTTATTTCCACCGTGAGGGATTATGCGTTTCCGCCAGTTGTTACCGCTTTTTGGCGCGCTGTTTGCGTTGTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTcc < 2:1515714/287‑1 (MQ=255) aaCATTTTTTTAACAATCAAGTGCAATTATATCTCTCGCCAGCAGAATGATTTTCACGTTTACTATGAACCACCTTTTTATTTCCACCGTGAGGGATTATGCGTTTCCGCCAGTTGTTACCGCTTTTTGGCGCGCTGTTTGCGTTGTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGTGTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGGCGGTATTGTATTGCTGGCATTTTTGTTACTTCGCGGCCATAAACTccccc > 2:791094/1‑288 (MQ=255) aaCATTTTTTTAACAATCAAGTGCAATTATATCTCTCGCCAGCAGAATGATTTTCACGTTTACTATGAACCACCTTTTTATTTCCACCGTGAGGGATTATGCGTTTCCGCCAGTTGTTACCGCTTTTTGGCGCGCTGTTTGCGTTGTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGc > 1:1889800/1‑256 (MQ=255) aaCATTTTTTTAACAATCAAGTGCAATTATATCTCTCGCCAGCAGAATGATTTTCACGTTTACTATGAACCACCTTTTTATTTCCACCGTGAGGGATTATGCGTTTCCGCCAGTTGTTACCGCTTTTTGGCGCGCTGTTTGCGTTGTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTccccc > 2:1062618/1‑288 (MQ=255) ttttAACAATCAAGTGCAATTATATCTCTCGCCAGCAGAATGATTTTCACGTTTACTATGAACCACCTTTTTATTTCCACCGTGAGGGATTATGCGTTTCCGCCAGTTGTTACCGCTTTTTGGCGCGCTGTTTGCGTTGTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCCCCGCTACg > 1:1177268/1‑288 (MQ=255) ttttAACAATCAAGTGCAATTATATCTCTCGCCAGCAGAATGATTTTCACGTTTACTATGAACCACCTTTTTATTTCCACCGTGAGGGATTATGCGTTTCCGCCAGTTGTTACCGCTTTTTGGCGCGCTGTTTGCGTTGTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCAATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTccc < 2:1945484/279‑1 (MQ=255) tAACACTCAAGTGCAATTATATCTCTCGCCAGCAGAATGATTTTCACGTTTACTATGAACCACCTTTTTATTTCCACCGTGAGGGATTATGCGTTTCCGCCAGTTGTTACCGCTTTTTGGCGCGCTGTTTGCGTTGTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCCCCGCTACGTCCg < 1:523932/289‑1 (MQ=255) tAACAATCAAGTGCAATTATATCTCTCGCCAGCAGAATGATTTTCACGTTTACTATGAACCACCTTTTTATTTCCACCGTGAGGGATTATGCGTTTCCGCCAGTTGTTACCGCTTTTTGGCGCGCTGTTTGCGTTGTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCCCCGCTACGTCCg < 1:1930758/289‑1 (MQ=255) tgcAAGTGCAATTATATCTCTAGCCAGCAGAATGATTTTCACGTTTACTATGAACGTCCTTTTTCTTTCCACCGTGAGGGATTATGCGTTTCCGCCAGTTGTTACCGCTTTTTGGCGCGCTGTTTGCGTTGTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCCCCGCTACGTCCgctgct < 2:1290758/287‑1 (MQ=255) gCAATTATATCTCTCGCCAGCAGAATGATTTTCACGTTTACTATGAACCACCTTTTTATTTCCACCGTGAGGGATTATGCGTTTCCGCCAGTTGTTACCGCTTTTTGGCGCGCTGTTTGCGTTGTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATg < 1:1234575/287‑1 (MQ=255) gCAATTATATCTCTCGCCAGCAGAATGATTTTCACGTTTACTATGAACCACCTTTTTATTTCCACCGTGAGGGATTATGCGTTTCCGCCAGTTGTTACCGCTTTTTGGCGCGCTGTTTGCGTTGTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGcc < 1:1663669/289‑1 (MQ=255) aTTATATCTCTCGCCAGCAGAATGATTTTCACGTTTACTATGAACCACCTTTTTATTTCCGCCGTGAGGGATTATGCGTTTCCGCCAGTTGTTACCGCTTTTTGGCGCGCTGTTTGCGTTGTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCcgcg < 2:394594/289‑1 (MQ=255) ttATATCTCTCGCCAGCAGAATGATTTTCACGTTTACTATGAACCACCTTTTTATTTCCACCGTGAGGGATTATGCGTTTCCGCCAGTTGTTACCGCTTTTTGGCGCGCTGTTTGCGTTGTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCCCCGCTACGTCCGCTGCCCAATGccccc > 2:1413783/1‑285 (MQ=255) atCTCTCGCCAGCAGAATGATTTTCACGTTTACTATGAACCACCTTTTTATTTCCACCGTGAGGGATTATGCGTTTCCGCCAGTTGTTACCGCTTTTTGGCGCGCTGTTTGCGTTGTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGAt < 2:695407/289‑1 (MQ=255) ctcGCCAGCAGAATGATTTTCACGTTTACTATGAACCACCTTTTTATTTCCACCGTGAGGGATTATGCGTTTCCGCCAGTTGTTACCGCTTTTTGGCGCGCTGTTTGCGTTGTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTgg > 2:1880166/1‑288 (MQ=255) cGCCAGCAGAATGATTTTCACGTTTACTATGAACCACCTTTTTATTTCCACCGTGAGGGATTATGCGTTTCCGCCAGTTGTTACCGCTTTTTGGCGCGCTGTTTGCGTTGTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACaaa < 2:1793991/245‑1 (MQ=255) cGCCAGCAGAATGATTTTCACGTTTACTATGAACCACCTTTTTATTTCCACCGTGAGGGATTATGCGTTTCCGCCAGTTGTTACCGCTTTTTGGCGCGCTGTTTGCGTTGTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTgg > 1:859257/1‑286 (MQ=255) agAATGATTTTCACGTTTACTATGAACCACCTTTTTATTTCCACCGTGAGGGATTATGCGTTTCCGCCAGTTGTTACCGCTTTTTGGCGCGCTGTTTGCGTTGTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTa < 2:1264517/286‑1 (MQ=255) ttttAACGTTTACTATGAACCACCTTTTTAGTGCAGCCGGGAGGGTTTATGCGTTTCGGCCAGTTGTTACCGCTTTTTGGCGCGCTGGTTGCGTTGTATATCATTTGGGGCGCAACCTATTTTGTGATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCAGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTgctggct < 2:1829748/288‑1 (MQ=255) tttCACGTTTACTATGAACCACCTTTTTATTTCCACCGTGAGGGATTATGCGTTTCCGCCAGTTGTTACCGCTTTTTGGCGCGCTGTTTGCGTTGTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGt < 1:69314/289‑1 (MQ=255) cGTTTCCTATGAACCACCTTTTTATTTCACCCGTGAGGGATTATGCTTTTCCGCCAGTTGTTACCGCTTTTTGGCGCGCTGTTTGCGTTGTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTa < 2:643114/289‑1 (MQ=255) gTTTACTATGAACCACCTTTTTATTTCCACCGTGAGGGATTATGCGTTTCCGCCAGTTGTTACCGCTTTTTGGCGCGCTGTTTGCGTTGTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTaa < 2:1259926/289‑1 (MQ=255) ttACTATGAACCACCTTTTTATTTCCCCCGTGAGGGATTATGCGATTCCGCCAGTTGTTACCGCTTTTTGGCGCGCTGTCTGCGTTGTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGTTTGCCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATCGCGGGCGTTCGATCCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTTGCCTTTTTGCTACTCCCCGGACAACACCCCCCCCCGCTACGTCCGCTTCTCAATGCCTCACTGATTGGCCCGCTATTCCTGGCTGtgtctacgg > 2:1611367/1‑281 (MQ=255) ccTATGACCCACCTTTTTAGTTCCTCCGTGAGGGATTATGCGTTTCCGCCAGTTGTTACCGCTTTTTGGCGCGCTGTTTGCGTTGTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGc < 2:1015737/288‑1 (MQ=255) aCTATGAACCACCTTTTTATTTCCACCGTGAGGGATTATGCGTTTCCGCCAGTTGTTACCGCTTTTTGGCGCGCTGTTTGCGTTGTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGc < 1:1074587/289‑1 (MQ=255) cTATGAACCACCTTTTTATTTCCACCGTGAGGGATTATGCGTTTCCGCCAGTTGTTACCGCTTTTTGGCGCGCTGTTTGCGTTGTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCa < 2:329207/289‑1 (MQ=255) tGAACCACCTTTTTATTTCCACCGTGAGGGATTATGCGTTTCCGCCAGTTGTTACCGCTTTTTGGCGCGCTGTTTGCGTTGTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATgg > 1:1472046/1‑289 (MQ=255) ccaccTTTTTATTTCCACCGTGAGGGATTATGCGTTTCCGCCAGTTGTTACCGCTTTTTGGCGCGCTGTTTGCGTTGTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGAc < 1:584643/289‑1 (MQ=255) ccTTTTTATTTCCACCGTGAGGGATTATGCGTTTCCGCCAGTTGTTACCGCTTTTTGGCGCGCTGTTTGCGTTGTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCCGTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCTTGGTGACGGt > 2:860372/1‑289 (MQ=255) cTTTTTATTTCCACCGTGAGGGATTATGCGTTTCCGCCAGTTGTTACCGCTTTTTGGCGCGCTGTTTGCGTTGTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGtt > 1:1364726/1‑289 (MQ=255) ttttATTTCCACCGTGAGGGATTATGCGTTTCCGCCAGTTGTTACCGCTTTTTGGCGCGCTGTTTGCGTTGTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTg > 1:607366/1‑288 (MQ=255) tttATTTCCACCGTGAGGGATTATGCGTTTCCGCCAGTTGTTACCGCTTTTTGGCGCGCTGTTTGCGTTGTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGcc < 2:1570005/289‑1 (MQ=255) cGTGAGGGATTATGCGTTTCCGCCAGTTGTTACCGCTTTTTGGCGCGCTGTTTGCGTTGTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCaaaa > 2:1665794/1‑289 (MQ=255) ggtattattCGTTTCCGCCGGTTGTTACCGCTCTTTTGCGAGCTTTTTGCGTTGTATATCATTTCGGTCTCAACCTATTTGTTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGTCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACGCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGtt < 2:949479/285‑1 (MQ=255) tGCGTTTCCGCCAGTTGTTACCGCTTTTTGGCGCGCTGTTTGCGTTGTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCCCCGCTACTTCCGCTGTTCATTGCCGCCCTGATCTGCCCCTTATTGCTGGCTGTGGGTATTGGCCTGGTGACGGTGGCCGGACATCAACATGTTCCTTTCg > 2:584508/1‑288 (MQ=255) gTTTCCGCCAGTTGTTACCGCTTTTTGGCGCGCTGTTTGCGTTGTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCAt < 1:1811889/289‑1 (MQ=255) ttCCGCCAGTTGTTACCGCTTTTTGGCGCGCTGTTTGCGTTGTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTgcg > 1:1008766/1‑167 (MQ=255) ttCCGCCAGTTGTTACCGCTTTTTGGCGCGCTGTTTGCGTTGTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATcg < 1:1758833/289‑1 (MQ=255) tCCGCCAGTTGTTACCGCTTTTTGGCGCGCTGTTTGCGTTGTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATcgc < 1:1413783/289‑1 (MQ=255) tCCGCCAGTTGTTACCGCTTTTTGGCGCGCTGTTTGCGTTGTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATcgc < 1:481761/289‑1 (MQ=255) tCCACCCGTTGTTTCCGCTTGTGGGCGCGCTTTTTGGGTTGGTAATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCCGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTCCTGCGCGGACACAACCTCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATcgc < 2:1840138/289‑1 (MQ=255) tttgttACCGCTTTTTGGGGCGCTGTTTGGTTTGTTTATCATTTGGGGTTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAGGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGGAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTa < 2:264116/288‑1 (MQ=255) ttgttACCGCTTTTTGGCGCGCTGTTTGCGTTGTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTa < 2:85223/288‑1 (MQ=255) tgttTCCGCTTTTTGGCGCGCTGTTTGCGTTGTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTa < 1:310551/287‑1 (MQ=255) tgttACCGCTTTTTGGCACGCTGTTTGCGTTGTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTa < 1:982162/287‑1 (MQ=255) ttACCGCTTTTTGGCGCGCTGTTTGCGTTGTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACCGCGCGGACCCAAACTCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCCCTGACTGGCCTGTTATTTCTGGCTGGCGGTTATGGCATGGTTACGGTGTCTCATCAGCCATCTGTTCCTTCCGTCATCTCCGCTGCAGTgg > 2:1645355/1‑289 (MQ=255) tACCGCTTTTTGGCGCGCTGTTTGCGTTGTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGGGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTAGTGGt < 2:1184941/289‑1 (MQ=255) ttGGCGCGCTGTTTGCGTTGTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTa > 1:142135/1‑219 (MQ=255) tGGCGCGCTGTTTGCGTTGTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATTATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTAGTGGTTGCAACCGTg < 1:90323/289‑1 (MQ=255) tGGCGCGCTGTTTGCGTTGTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTAGTGGTTGCAACCGTg < 2:1364726/289‑1 (MQ=255) cgcgcTGTTTGCGTTGTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTAGTGGTTGCAACCGTGcc < 1:1716710/288‑1 (MQ=255) cgcgcTGTTTGCGTTGTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTAGTGGTTGCAACCGTGcc < 2:1106751/288‑1 (MQ=255) agctcTGTTTGCGGTTTATATCGTTGTGGGCTCAACCTATTTTGTGATTCGGATTGGCGTGTAAAGCTTGCATCCGTTCATGATGGCGTGCTTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTTGCATTTTTGCTACTGTGCGGACTCAAACTCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTAGTGGTTGCAACCGTGcc < 2:1051459/284‑1 (MQ=255) gTTGTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTAGTGGTTGCAACCGTGCCCCTCTTTACCCt < 1:1609611/288‑1 (MQ=255) gTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTAGTGGTTGCAACCGTGcc < 2:1084482/273‑1 (MQ=255) tataTCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTAGTGGTTGCAACCGTGcc < 1:1124194/272‑1 (MQ=255) aTTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTAGTGGTTGCAACCGTGCCCCTCTTTACCCTGTGCTTCAgcc < 1:1585513/289‑1 (MQ=255) tttGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTAGTGGTTGCAACCGTGCCCCTCTTTACCCTGTGCTTCAgcc > 2:1457244/1‑288 (MQ=255) ttGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTAGTGGTTGCAACCGTGCCCCTCTTTACCCTGTGCTTCAgccgc < 1:1349873/289‑1 (MQ=255) ||| ATATCATCGAGCAACGTCAGTAAACTACTCCCGGCCAAAAGCATTCCCTCTCATTTTTATTGTTGAAGGGTGTAAGTATGAAGCAAAAACGGCAGCTCTGATACTTGCTTCACAGGTCAACATTTTTTTAACAATCAAGTGCAATTATATCTCTCGCCAGCAGAATGATTTTCACGTTTACTATGAACCACCTTTTTATTTCCACCGTGAGGGATTATGCGTTTCCGCCAGTTGTTACCGCTTTTTGGCGCGCTGTTTGCGTTGTATATCATTTGGGGCAGTACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTAGTGGTTGCAACCGTGCCCCTCTTTACCCTGTGCTTCAGCCGC > CP042583/1666790‑1667350 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |