Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 1,699,929 | 3 bp→TGA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 1,699,929 | 0 | A | T | 99.4% | 746.3 / NA | 314 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (157/155); minor base G (0/2); total (157/157) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.98e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,699,930 | 0 | C | G | 99.4% | 729.3 / NA | 314 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); major base G (156/154); minor base A (0/2); total (157/157) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.98e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,699,931 | 0 | T | A | 99.7% | 745.2 / NA | 314 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base A (157/156); minor base G (0/1); total (157/157) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 314 total aligned reads displayed.
CACGATGGTTCATTACCCAATAAGATTGAAAGCTCACCACTTTGTTGAAATTGACAGCAAACAAACAAAAAAATGCATTTCACCCTTTGACATCACCATGCACTGCCATTAATATGCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGCTTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTACTACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCGCTTCGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCGATTTACATCAACTTCTTGCCCGTTGATAAACGCCCGCAAAGATGGGGTTACCGGCAATGGCACTTTTCGGTCAGACTCATATTCTGCACGATTGCGGCTCAATGGCTCATGAACTTCCAGCCAGTTGCTGCCATCTGGTTCAGTGGTGTATTTTACTGGCTGGTCGATAATTTGCACACGCGTCCCAACAGGAACATTATCAAACAGATATTTGATATCGTC > CP042583/1699650‑1700210 ||| acGATGGTTCATTACCCAATAAGATTGAAAGCTCACCACTTTGTTGAAATTGACAGCAAACAAACAAAAAAATGCATTTCACCCTTTGACATCACCATGCACTGCCATTAATATGCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGCTTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGa > 1:46869/1‑287 (MQ=255) cGATGGTTCATTACCCAATAAGATTGAAAGCTCACCACTTTGTTGAAATTGACAGCAAACAAACAAAAAAATGCATTTCACCCTTTGACATCACCATGCACTGCCATTAATATGCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGCTTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACt > 1:123943/1‑289 (MQ=255) cGATGGTTCATTACCCAATAAGATTGAAAGCTCACCACTTTGTTGAAATTGACAGCAAACAAACAAAAAAATGCATTTCACCCTTTGACATCACCATGCACTGCCATTAATATGCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGCTTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGACTTGAACCAGAACt > 2:1529043/1‑289 (MQ=255) tGGTTCATTACCCAATAAGATTGAAAGCTCACCACTTTGTTGAAATTGACAGCAAACAAACAAAAAAATGCATTTCACCCTTTGACATCACCATGCACTGCCATTAATATGCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGCTTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAAt < 1:994761/289‑1 (MQ=255) tGGTTCATTACCCAATAAGATTGAAAGCTCACCACTTTGTTGAAATTGACAGCAAACAAACAAAAAAATGCATTTCACCCTTTGACATCACCATGCACTGCCATTAATATGCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGCTTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAAt < 1:1625557/289‑1 (MQ=255) ttCATTACCCAATAAGATTGAAAGCTCACCACTTTGTTGAAATTGACAGCAAACAAACAAAAAAATGCATTTCACCCTTTGACATCACCATGCACTGCCATTAATATGCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTC‑AAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGCTTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGc > 1:641602/1‑289 (MQ=255) cATTACCCAATAAGATTGAAAGCTCACCACTTTTTTGAAATTGACAGCAAACAAACAAAAAAATGCATTTCACCCTTTGACATCACCATGCACTGCCATTAATATGCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGCTTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGca < 2:317068/289‑1 (MQ=255) cATTACCCAATAAGATTGAAAGCTCACCACTTTGTTGAAATTGACAGCAAACAAACAAAAAAATGCATTTCACCCTTTGACATCACCATGCACTGCCATTAATATGCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGCTTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGca < 2:646533/289‑1 (MQ=255) cATTACCCAATAAGATTGAAAGCTCACCACTTTGTTGAAATTGACAGCAAACAAACAAAAAAATGCATTTCACCCTTTGACATCACCATGCACTGCCATTAATATGCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGCTTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGc > 1:18520/1‑288 (MQ=255) tACCCAATAAGATTGAAAGCTCACCACTTTGTTGAAATTGACAGCAAACAAACAAAAAAATGCATTTCACCCTTTGACATCACCATGCCCTGCCATTAATATGCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCACTCGGTAGAACGGCGGATTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGCTTTTTGCTTTCTAATTACCAACACTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAg > 1:499302/1‑289 (MQ=255) cccAATAAGATTGAAAGCTCACCACTTTGTTGAAATTGACAGCAAACAAACAAAAAAATGCATTTCACCCTTTGACATCACCATGCACTGCCATTAATATGCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGCTTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGc > 2:906187/1‑289 (MQ=255) aaTAAGATTGAAAGCTCACCACTTTGTTGAAATTGACAGCAAACAAACAAAAAAATGCATTTCACCCTTTGACATCACCATGCACTGCCATTAATATGCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGCTTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCAt > 1:895433/1‑288 (MQ=255) tAAGATTGAAAGCTCACCACTTTGTTGAAATTGACAGCAAACAAACAAAAAAATGCATTTCACCCTTTGACATCACCATGCACTGCCATTAATATGCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGCTTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGAACAGGCATTc > 2:1848327/1‑288 (MQ=255) tAAGATTGAAAGCTCACCACTTTGTTGAAATTGACAGCAAACAAACAAAAAAATGCATTTCACCCTTTGACATCACCATGCACTGCCATTAATATGCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGCTTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCATAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTc > 1:770596/1‑288 (MQ=255) ttGAAAGCTCACCACTTTGTTGAAATTGACAGCAAACAAACAAAAAAATGCATTTCACCCTTTGACATCACCATGCACTGCCATTAATATGCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGCTTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTcccgatc > 1:853523/1‑284 (MQ=255) ttGAAAGCTCACCACTTTGTTGAAATTGACAGCAAACAAACAAAAAAATGCATTTCACCCTTTGACATCACCATGCACTGCCATTAATATGCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGCTTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTcccgatc < 1:1412675/289‑6 (MQ=255) ttGAAAGCTCACCACTTTGTTGAAATTGACAGCAAACAAACAAAAAAATGCATTTCACCCTTTGACATCACCATGCACTGCCATTAATATGCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGCTTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTcccgat < 2:443212/288‑5 (MQ=255) aaaGCTCACCACTTTGTTGAAATTGACAGCAAACAAACAAAAAAATGCATTTCACCCTTTGACATCACCATGCACTGCCATTAATATGCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGCTTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCATAACTAATTTGCCCAGGCATTcccgatcgac > 2:527619/1‑281 (MQ=255) caccacTTTGTTGAAATTGACAGCAAACAAACAAAAAAATGCATTTCACCCTTTGACATCACCATGCACTGCCATTAATATGCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGCTTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCa > 1:332489/1‑289 (MQ=255) cacTTTGTTGAAATTGACAGCAAACAAACCAAAAAATGCATTTCACCCTTTGACATCACCATGCACTGCCATTAATATGCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGCTTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACg < 1:986777/289‑1 (MQ=255) tgttgAAATTGACAGCAAACAAACAAAAAAATGCATTTCACCCTTTGACATCACCATGCACTGCCATTAATATGCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGCTTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACgcagca > 2:69351/1‑289 (MQ=255) aaTTGACAGCAAACAACCAAAAAAATGCGTTTCACCCTTTGACAGTGCCATGCGCTGCCATTAATAGGCGCGCCGTTCACACGATTCCTCGGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGCTTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTgcg < 2:1063831/289‑1 (MQ=37) aaTTGACAGCAAACAAACAAAAAAATGCATTTCACCCTTTGACATCACCATGCACTGCCATTAATATGCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGCTTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTgcg < 1:628628/289‑1 (MQ=255) aaTTGACAGCAAACAAACAAAAAAATGCATTTCACCCTTTGACATCACCATGCACTGCCATTAATATGCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGCTTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTgcg < 2:110130/289‑1 (MQ=255) aTTGACAGCAAACAAACAAAAAAATGCATTTCACCCTTTGACATCACCATGCACTGCCATTAATATGCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGCTTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTcccgat > 1:1008434/1‑260 (MQ=255) aacaaaccaaAAAATGCATTTCACCCTTTGCCATCACCATGCACTGCCATTAATATGCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGCTTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCGATTTACATc < 2:1778193/289‑1 (MQ=255) acaaacaaaAAAATGCATTTCACCCTTTGACATCACCATGCACTGCCATTAATATGCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGCTTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCGATTTACATCa > 1:1526284/1‑289 (MQ=255) caaacaaaAAAATGCATTTCACCCTTTGACATCACCATGCACTGCCATTAATATGCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGCTTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCGATTTACATCaa < 1:115681/289‑1 (MQ=255) cccTTTGACATCACCATGCACTGCCATTAATATGCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGCTTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCGATTTACATCAACTTCTTGCCCGTTGATAAACg < 1:1279946/289‑1 (MQ=255) ttGACATCACCATGCACTGCCATTAATATGCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGCTTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCGATTTACATCAACTTCTTGCCCGTTGATAAACGccc > 1:725278/1‑288 (MQ=255) cACCATGCACTGCCATTAATATGCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGCTTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGcac < 2:293404/207‑1 (MQ=255) cACCATGCACTGCCATTAATATGCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGCTTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCGATTTACATCAACTTCTTGCCCGTTGATAAACGCCCGCAAAGAt > 1:349785/1‑289 (MQ=255) cACCATGCACTGCCATTAATATGCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGCTTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCGATTTACATCAACTTCTTGCCCGTTGATAAACGCCCGCAAAGAt > 2:92035/1‑289 (MQ=255) cACCATGCACTGCCATTAATATGCACCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGCTTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGAGCGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCGATTTACATCAACTTCTTGCCCGTTGATAAACGCCCGCAAAGAt > 1:1152869/1‑289 (MQ=255) aCCATGTACTGCCATTAATATGCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGCTTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCGATTTACATCAACTTCTTGCCCGTTGATAAACGCCCGCAAAGATg < 2:562175/289‑1 (MQ=255) aCCATGCACTGCCATTAATATGCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGCTTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCGATTTACATCAACTTCTTGCCCGTTGATAAACGCCCGCAAAGATg < 2:623880/289‑1 (MQ=255) ccATTAATATGCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGCTTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCGATTTACATCAACTTCTTGCCCGTTGATAAACGCCCGCAAAGATGGGGTTACCGGc > 1:438794/1‑289 (MQ=255) ccATTAATATGCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGCTTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCGATTTACATCAACTTCTTGCCCGTTGATAAACGCCCGCAAAGATGGGGTTACCGGc > 2:405403/1‑289 (MQ=255) ttAATATGCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGCTTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCGATTTACATCAACTTCTTGCCCGTTGATAAACGCCCGCAAAGATGGGGTTACCGGCAAt > 1:694239/1‑289 (MQ=255) gcgcCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGCTTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCGATTTACATCAACTTCTTGCCCGTTGATAAACGCCCGCAAAGATGGGGTTACCGGCAATGGCACtt > 2:1221147/1‑289 (MQ=255) cGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGCTTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCGATTTACATCAACTTCTTGCCCGTTGATAAACGCCCGCAAAGATGGGGTTACCGGCAATGGCACTTTTCgg > 1:364548/1‑288 (MQ=255) cGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTAGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAGAGCCTGCTTTCTAGCAGGCTTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTATTATAACATCTGTCTTGAAACAGCACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCACTTGCGCGATTTACATCATCTTCTTGCCCTTTGATAAACGCCCGCAAAGCTGGGGTTACCGGCCATGGCCCGTGTCGGt > 2:772764/1‑289 (MQ=37) gTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGCTTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCGATTTACATCAACTTCTTGCCCGTTGATAAACGCCCGCAAAGATGGGGTTACCGGCAATTGCACTTTTCGGTc > 1:1049552/1‑289 (MQ=255) ttCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGCTTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAACACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGCCGTTGCAACTCAGCATTTGCGCCATTTACATCAACTTTTTGCCGGTTGATAAACCCCTGCCAAGACGGGGTTAACGGCAATGGCCCTTTTCGGCCa > 2:1496531/1‑289 (MQ=37) ttCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGCTTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCGATTTACATCAACTTCTTGCCCGTTGATAAACGCCCGCAAAGATGGGGTTACCTGCAATGGCACTTTTCGGTCa > 2:1816700/1‑289 (MQ=255) ttCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGCTTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCGATTTACATCAACTTCTTGCCCGTTGATAAACGCCCGCAAAGATGGGGTTACCGGCAATGGCACTTTTCGGTCa < 2:603319/289‑1 (MQ=255) ttCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGCTTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCGATTTACATCAACTTCTTGCCCGTTGATAAACGCCCGCAAAGATGGGGTTACCGGCAATGGCACTTTTCGGTCa < 2:1553302/289‑1 (MQ=255) ttCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGCTTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCGATTTACATCAACTTCTTGCCCGTTGATAAACGCCCGCAAAGATGGGGTTACCGGCAATGGCACTTTTCGGTCa > 1:1897465/1‑289 (MQ=255) ttCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGCTTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCGATTTACATCAACTTCTTGCCCGTTGATAAACGCCCGCAAAGATGGGGTTACCGGCAATGGCACTTTTCGGTCa > 2:741985/1‑289 (MQ=255) tCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGCTTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCGATTTACATCAACTTCTTGCCCGTTGATAAACGCCCGCAAAGATGGGGTTACCGGCAATGGCACTTTTCGGTCa < 1:1219157/288‑1 (MQ=255) acGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGCTTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCGATTTACATCAACTTCTTGCCCGTTGATAAACGCCCGCAAAGATGGGGTTACCGGCAATGGCACTTTTCGGTCAGACTc < 1:1552136/289‑1 (MQ=255) acGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGCTTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCGATTTACATCAACTTCTTGCCCGTTGATAAACGCCCGCAAAGATGGGGTTACCGGCAATGGCACTTTTCGGTCAGACTc < 2:1433968/289‑1 (MQ=255) ttCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGCTTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCGATTTACATCAACTTCTTGCCCGTTGATAAACGCCCGCAAAGATGGGGTTACCGGCAATGGCACTTTTCGGTCAGACTCata < 1:298237/288‑1 (MQ=255) tCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGCTTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTgc > 2:768247/1‑203 (MQ=255) gTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGCTTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCGATTTACATCAACTTCTTGCCCGTTGATAAACGCCCGCAAAGATGGGGTTACCGGCAATGGCACTTTTCGGTCAGACTCATATTCTGCAc < 1:1656557/289‑1 (MQ=255) gTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGCTTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCGATTTACATCAACTTCTTGCCCGTTGATAAACGCCCGCAAAGATGGGGTTACCGGCAATGGCACTTTTCGGTCAGACTCATATTCTGCACGAt > 1:244940/1‑289 (MQ=255) ttCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGCTTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCGATTTACATCAACTTCTTGCCCGTTGATAAACGCCCGCAAAGATGGGGTTACCGGCAATGGCACTTTTCGGt > 1:757880/1‑267 (MQ=255) aGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGCTTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCGATTTACATCAACTTCTTGCCCGTTGATAAACGCCCGCAAAGATGGGGTTACCGGCAATGGCACTTTTCGGTCAGACTCATATTCTGCACGATTGc > 1:79592/1‑288 (MQ=255) tCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGCTTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCGATTTACATCAACTTCTTGCCCGTTGATAAACGCCCGCAAAGATGGGGTTACCGGCAATGGCACTTTTCGGTCAGACTCATATTCTGCACGATTGCgcg > 2:1253134/1‑287 (MQ=255) ggTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGCTTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCGATTTACATCAACTTCTTGCCCGTTGATAAACGCCCGCAAAGATGGGGTTACCGGCAATGGCACTTTTCGGTCAGACTCATATTCTGCACGATTGCgcgac > 2:1859843/1‑285 (MQ=255) aGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGCTTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCGATTTACATCAACTTCTTGCCCGTTGATAAACGCCCGCAAAGATGGGGTTACCGGCAATGGCACTTTTCGGTCAGACTCATATTCTGCACGATTGCgcgacaa < 1:145273/288‑7 (MQ=255) ggACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGCTTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCGATTTACATCAACTTCTTGCCCGTTGATAAACGCCCGCAAAGATGGGGTTACCGGCAATGGCACTTTTCGGTCAGACTCATATTCTGCACGATTGCGCGACAATGGCTCATg < 1:1108192/289‑1 (MQ=255) ggACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGCTTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTT‑AAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCGATTTACATCAACTTCTTGCCCGTTGATAAACGCCCGCAAAGATGGGGTTACCGGCAATGGCACTTTTCGGTCAGACTCATATTCTGCACGATTGCGCGACAATGGCTCATg < 1:819281/288‑1 (MQ=255) gACTGTTAATCCGTATGTCTCTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGCTTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCGATTTACATCAACTTCTTGCACGTTGATAAACGCCCGCAAAGATGGGGTTACCGGCAATGGCACTTTTCGGTCAGACTCATATTCTGCACGATTGCGCGACAATGGCTCATGa > 1:402334/1‑289 (MQ=255) gACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGCTTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCGATTTACATCAACTTCTTGCCCGTTGATAAACGCCCGCAAAGATGGGGTTACCGGCAATGGCACTTTTCGGTCAGACTCATATTCTGCACGATTGCGCGACAATGGCTCATGa > 1:1706589/1‑289 (MQ=255) aTCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGC‑TTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCGATTTACATCAACTTCTTGCCCGTTGATAAACGCCCGCAAAGATGGGGTTACCGGCAATGGCACTTTTCGGTCAGACTCATATTCTGCACGATTGCGCGACAATGGCTCATGAACTTccagc < 1:609699/289‑1 (MQ=255) tCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGCTTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCGATTTACATCAACTTCTTGCCCGTTGATAAACGCCCGCAAAGATGGGGTTACCGGCAATGGCACTTTTCGGTCAGACTCATATTCTGCACGATTGCGCGACAATGGCTCATGAACTTccagc < 1:1537431/289‑1 (MQ=255) tATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGCTTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTa < 1:1633084/117‑1 (MQ=255) tGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGCTTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCGATTTACATCAACTTCTTGCCCGTTGATAAACGCCCGCAAAGATGGGGTTACCGGCAATGGCACTTTTCGGTCAGACTCATATTCTGCACGATTGCGCGACAATGGCTCATGAACTTCCAGCCAGttc > 1:136604/1‑288 (MQ=255) tGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGCTTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCGATTTACATCAACTTCTTGCACGTTGATAAACGCCCGCAAAGATGGGGTTACCGGCAATGGAACTTTTCGGTCAGACTCATATTCTGCACTATTGCTCGACAATGGCTAAGGAACCTccagccaggtc > 2:1030570/1‑286 (MQ=255) ctattattgtaGTCCAGTCAGCGGATCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGCTTTTTGCTTTCTACTTACCAACGCTCTCAAAACATCTGGCTTAAACCAGAACTAATTAGCACAGTCATTCCCGATCGACGTTGCAAAGCCGCATTTGCGCAATTTACATCAACTGCTTGCCCGTTGATAAACGCCAGCAAAGATGGGGTTACCAGCAATGGCACTTTTCGGTCAGACTCATATTCTGCACGATTGCGACACAATGGCTCATGAACTTCCAGCCAGttcgag < 2:1443283/279‑5 (MQ=255) aGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGCTTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCGATTTACATCAACTTCTTGCCCGTTGATAAACGCCCGCAAAGATGGGGTTACCGGCAATGGCACTTTTCGGTCAGACTCATATTCTGCACGATTGCGCGACAATGGCTCATg < 2:1728461/255‑1 (MQ=255) aGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGCTTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCGATTTACATCAACTTCTTGCCCGTTGATAAACGCCCGCAAAGATGGGGTTACCGGCAATGGCACTTTTCGGTCAGACGCATATTCTGCACGATTGCGCGACAATGGCTCATGAAATTCAAGCCAGTTCGAGCCAGCTGGTTCAgtg > 2:479177/1‑289 (MQ=255) cataggtaccAAAGTCACAGAGGCCTTGTTTCTAGCAGGCTTTTTGCTGTCTAATTACGCACGCTCTTAAAACATCTGTCTGGATACAGAACTGATTTGCACAGGCACTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCGTTTTACATCGACTTCTTGCCAGTTGATAAACGCCCGCAAAGATGGGGTTACCGGCAATGGCACTTTTCGGTCAGACTCATATTCTGCACGATTGCGCGACAATGGCTCATTAACTTCCAGCCAGTTCGAGCCATCTGGTTCAgtggt < 2:1591421/280‑1 (MQ=255) cAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGCTTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCGATTTACATCAACTTCTTGCCCGTTGATAAACGCCCGCAAAGATGGGGTTACCGGCAATGGCACTTTTCGGTCAGACTCATATTCTGCACGATTGCGCGACAATGGCTCATGAACTTCCAGCCAGTTCGAGCCATCTGGTTCAgtggt < 1:1083521/288‑1 (MQ=255) cAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGCTTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCGATTTACATCAACTTCTTGCCCGTTGATAAACGCCCGCAAAGATGGGGTTACCGGCAATGGCACTTTTCGGTCAGACTCATATTCTGCACGATTGCGCGACAATGGCTCATGAACTTCCAGCCAGTTCGAGCCATCTGGTTCAgtg < 2:1303041/286‑1 (MQ=255) cAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGCTTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGAACAGGCATTCCCGAACGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCGATTTACATCAACTTCTTGCCCGTTGATAAACGCCCGCAAAGATGGGGTTACCGGCAATGGCACTTTTCGGTCAGACTCATATTCTGCACGATTGCGCGACAATGGCTCATGAACTTCCAGCCAGTTCGAGCCATCTGGTTCAgtg < 2:235453/286‑1 (MQ=255) aggagCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGCTTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCGATTTACATCAACTTCTTGCCCGTTGATAAACGCCCGCAAAGATGGGGTTACCGGCAATGGCACTTTTCGGTCAGACTCATATTCTGCACGATTGCGCGACAATGGCTCATGAACTTCCAGCCAGTTCGAGCCATCTGGTTCAGTGGTGTAt > 1:936945/1‑289 (MQ=255) ccAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGCTTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCGATTTACATCAACTTCTTGCCCGTTGATAAACGCCCGCAAAGATGGGGTTACCGGCAATGGCACTTTTCGGTCAGACTCATATTCTGCACGATTGCGCGACAATGGCTCATGAACTTCCAGCCAGttcgag > 2:461581/1‑259 (MQ=255) aagcaaaaaGCCTGCTTTCTAGCAGGCTTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCGATTTACATCAACTTCTTGCCCGTTGATAAACGCCCGCAAAGATGGGGTTACCGGCAATGGCACTTTTCGGTCAGACTCATATTCTGCACGATTGCGCGACAATGGCTCATGAACTTCCAGCCAGTTCGAGCCATCTGGTTCAGTGGTGTATTTTActgg < 1:1599036/283‑1 (MQ=255) aaaaaaGCCTGCTTTCTAGCAGGTTATTTGCTTTCTAATTACAACCGCTCTTAAAACATCTTTCTTGAACCAGAACTAATTTGCAACGGCATTCCCGATCTACGTTGAAACGCAGCATTTGCGCGATTTACATCAACTTCTTGCCCGTTGATAAACGCCCACAAAGATGGGGTTACCGGCAATGGCACTTTGCGGTCAGACTAGTATTCTGCACGATTGCGCGACAATGGCTCATGAACTTCCAGCCAGTACGAGCCATCTGGTTCAGTGGTGTATTTTACTGGCTGGt < 2:1477413/289‑1 (MQ=255) tCTAGCAGGCTTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCGATTTACATCAACTTCTTGCCCGTTGATAAACGCCCGCAAAGATGGGGTTACCGGCAATGGCACTTTTCGGTCAGACTCATATTCTGCACGATTGCGCGACAATGGCTCATGAACTTCCAGCCAGTTCGAGCCATCTGGTTCAGTGGTGTATTTTACTGGCTGGTCGATAATTTGcaca < 2:1657122/289‑1 (MQ=255) tCTAGCAGGCTTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCGATTTACATCAACTTCTTGCCCGTTGATAAACGCCCGCAAAGATGGGGTTACCGGCAATGGCACTTTTCGGTCAGACTCATATTCTGCACGATTGCGCGACAATGGCTCATGAACTTCCAGCCAGTTCGAGCCATCTGGTTCAGTGGTGTATTTTACTGGCTGGTCGATAATTTGcac > 2:1934279/1‑288 (MQ=255) aGCAGTCTTTTTGCTTTCCAAGTGCCAACGCTCTTAATACATCGTTCTTGAACCAGAACTAATTTGCTCTGACATTCCCGCGCGACGTTGCAAAGCAGCATTTGCGCGAATTACATCAACTTCGGGCCCGTTGAGAAACGCCCGCAAAGATGGGGTTACCGGCAATGGCACTTTTCGGTCAGAGTCATATTCTGCACGATTGCGCGACTATGGCTCATGAACTTTCAGCCAGTTCGAGCCATCTGGTTCAGTGGTGTATTTTACTGGCTGGTCGATAATTTGCACAcgc < 2:1128255/289‑1 (MQ=255) gCTTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCGATTTACATCAACTTCTTGCCCGTTGATAAACGCCCGCAAAGATGGGGTTACCGGCAATGGCACTTTTCGGTCAGACTCATATTCTGCACGATTGCGCGACAATGGCTCATGAACTTCCAGCCAGTTCGAGCCATCTGGTTCAGTGGTGTATTTTACTGGCTGGTCGATAATTTGCACACGCGTccc > 2:978934/1‑289 (MQ=255) ttttGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCGATTTACATCAACTTCTTGCCCGTTGATAAACGCCCGCAAAGATGGGGTTACCGGCAATGGCACTTTTCGGTCAGACTCATATTCTGCACGATTGCGCGACAATGGCTCATGAACTTCCAGCCAGTTCGAGCCATCTGGTTCAGTGGTGTATTTTACTGGCTGGTCGATAATTTGCACACGCGTCCCAAc < 1:458797/289‑1 (MQ=255) ttttGCGTTCCAATTCACACCGCTCTTAAAACTTCTGTCTTGACCCAGAACTAATTTTCCCCGGCATTCCGGATCGACGTTGCACCGCAGCATTTGCGCTATTTACATCAACTTCTTGCCCGTTGATAAACGCCCGCAAAGATGGGGTTACCGGCAATGGCACTTTTCGGTCAGACTCATATTCTGCACGATTGCGCGACAATGGCTCATGAACTTCCAGCCAGTTCGAGCCATCTGGTTCAGTGGTGTATTTTACTGGCTGGTCGATAATTTGCACACGCGTCCCAAc < 2:361386/289‑1 (MQ=255) cTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCGATTTACATCAACTTCTTGCCCGTTGATAAACGCCCGCAAAGATGGGGTTACCGGCAATGGCACTTTTCGGTCAGACTCATATTCTGCACGATTGCGCGACAATGGCTCATGAACTTCCAGCCAGTTCGAGCCATCTGGTTCAGTGGTGTATTTTACTGGCTGGTCGATAATTTGCACACGCGTCCCAACAGGaa < 1:1502214/289‑1 (MQ=255) ttCTAATTACAAACGCTCTTAAAACATCGGTCGTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTGGCAACGCAGCATTTGCGCGATTTACACCAACTTCTGGCCCGTTGATAAACGCCCGCAAAGATGGGGTTACCGGCAATGGCACTTTTCGGTCAGACTCATATTCTGCACGATTGCGCGACAATGGCTCATGAACTTCCAGCCAGTTCGAGCCATCTGGTTCAGTGGTGTATTTTACTGGCTGGTCGATAATTTGCACACGCGTCCCAACAGGAACa < 2:1693544/289‑1 (MQ=255) aTTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCGATTTACATCAACTTCTTGCCCGTTGATAAACGCCCGCAAAGATGGGGTTACCGGCAATGGCACTTTTCGGTCAGACTCATATTCTGCACGATTGCGCGACAATGGCTCATGAACTTCCAGCCAGTTCGAGCCATCTGGTTCAGTGGTGTATTTTACTGGCTGGTCGATAATTTGCACACGCGTCCCAACAGGAACATTATc < 2:332489/289‑1 (MQ=255) ttACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCGATTTACATCAACTTCTTGCCCGTTGATAAACGCCCGCAAAGATGGGGTTACCGGCAATGGCACTTTTCGGTCAGACTCATATTCTGCACGATTGCGCGACAATGGCTCATGAACTTCCAGCCAGTTCGAGCCATCTGGTTCAGTGGTGTATTTTACTGGCTGGTCGATAATTTGCACACGCGTCCCAACAGGAACATTATCa < 2:1897465/289‑1 (MQ=255) aCCCACGCTCTTCAAACATCTGTCTTGGACCATAACCAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCGATTTACATCAACTTCTTGCCCGTTGATAAACGCCCGCAAAGATGGGGTTACCGGCAATGGCACTTTTCGGTCAGACTCATATTCTGCACGATTGCGCGACAATGGCTCTTGAACTTCCAGCCAGTTCGAGCCATCTGGTTCAGTGGTGTATTTTACTGGCTGGTCGATAATTTGCACACGCGTCCCAACAGGAACATTATCaaa < 2:853523/289‑1 (MQ=255) aCCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCGATTTACATCAACTTCTTGCCCGTTGATAAACGCCCGCAAAGATGGGGTTACCGGCAATGGCACTTTTCGGTCAGACTCATATTCTGCACGATTGCGCGACAATGGCTCATGAACTTCCAGCCAGTTCGAGCCATCTGGTTCAGTGGTGTATTTTACTGGCTGGTCGATAATTTGCACACGCGTCCCAACAGGAACATTATCaaa < 2:117357/289‑1 (MQ=255) ccaaggccttgaaaaCATCTGTCTTGAACAAGAACTAATTTGCACAGGCTTTCCCGTGCGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCTATTTCCATCAACTTCTTGCCCGTGGATAAACGCCCGCAAAGATGGGGTTACCGGCAATGGCACTTTTCGGTCAGACCCATATTCTGCACGATTGCGCGACAATGGCTCATGAACTTCCAGCCAGTTCGAGCCATCTGGTGCAGTGGTGTATTTTACTGGCTGGTCGGTAATTTGCACACGCGTCCCAACAGGAACATTATCAAAc < 2:431002/278‑1 (MQ=255) aaCGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCGATTTACATCAAATTCTTGCACGTTGATAAACGCCAGCAAAGATGGGGTTACCGGCAATGGCACTTTTCGGTCAGACTCATATTCTGCACGATTGCGCGACAATGGCTCATGAACTTCCAGCCAGTTCGAGCCATCTGGTTCAGTGGTGTATTTTACTGGCTGGTCGATAATTTGCACACGCGTCCCAACAGGAACATTATCAAACAg < 1:1804807/289‑1 (MQ=255) cGCTCTTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCGATTTACATCAACTTCTTGCCCGTTGATAAACGCCCGCAAAGATGGGGTTACCGGCAATGGCACTTTTCGGTCAGACTCATATTCTGCACGATTGCGCGACAATGGCTCATGAACTTCCAGCCAGTTCGAGCCATCTGGTTCAGTGGTGTATTTTACTGGCTGGTCGATAATTTGCACACGCGTc < 1:914595/264‑1 (MQ=255) ctctTAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCGATTTACATCAACTTCTTGCCCGTTGATAAACGCCCGCAAAGATGGGGTTACCGGCAATGGCACTTTTCGGTCAGACTCATATTCTGCACGATTGCGCGACAATGGCTCATGAACTTCCAGCCAGTTCGAGCCATCTGGTTCAGTGGTGTATTTTACTGGCTGGTCGATCATTTGCACACGCGTCCCAACAGGAACATTATCAAACAGatat > 1:1931086/1‑289 (MQ=255) ttAAAACATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCGATTTACATCAACTTCTTGCCCGTTGATAAACGCCCGCAAAGATGGGGTTACCGGCAATGGCACTTTTCGGTCAGACTCATATTCTGCACGATTGCGCGACAATGGCTCATGAACTTCCAGCCAGTTCGAGCCATCTGGTTCAGTGGTGTATTTTACTGGCTGGTCGATAATTTGCACACGCGTCCCAACAGGAACATTATCAAACAGATATTTg > 1:1758607/1‑289 (MQ=255) aaCATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCGATTTACATCAACTTCTTGCCCGTTGATAAACGCCCGCAAAGATGGGGTTACCGGCAATGGCACTTTTCGGTCAGACTCATATTCTGCACGATTGCGCGACAATGGCTCATGAACTTCCAGCCAGTTCGAGCCATCTGGTTCAGTGGTGTATTTTACTGGCTGGTCGATAATTTGCACACGCGTCCCAACAGGAACATTATCAAACAGATATTTGatat < 2:136604/289‑1 (MQ=255) aaCATCTGTCTTGAACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCCGATCGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCGATTTACATCAACTTCTTGCCCGTTGATAAACGCCCGCAAAGATGGGGTTACCGGCAATGGCACTTTTCGGTCAGACTCATATTCTGCACGATTGCGCGACAATGGCTCATGAACTTCCAGCCAGTTCGAGCCATCTGGTTCAGTGGTGTATTTTACTGGCTGGTCGATAATTTGCACACGCGTCCCAACAGGAACATTATCAAACAGATATTTGatat < 1:224666/289‑1 (MQ=255) ||| CACGATGGTTCATTACCCAATAAGATTGAAAGCTCACCACTTTGTTGAAATTGACAGCAAACAAACAAAAAAATGCATTTCACCCTTTGACATCACCATGCACTGCCATTAATATGCGCCCCGTTCACACGATTCCTCTGTAGTTCAGTCGGTAGAACGGCGGACTGTTAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCAAAAAAGCCTGCTTTCTAGCAGGCTTTTTGCTTTCTAATTACCAACGCTCTTAAAACATCTGTCTACTACCAGAACTAATTTGCACAGGCATTCCGCTTCGACGTTGCAACGCAGCATTTGCGCGATTTACATCAACTTCTTGCCCGTTGATAAACGCCCGCAAAGATGGGGTTACCGGCAATGGCACTTTTCGGTCAGACTCATATTCTGCACGATTGCGGCTCAATGGCTCATGAACTTCCAGCCAGTTGCTGCCATCTGGTTCAGTGGTGTATTTTACTGGCTGGTCGATAATTTGCACACGCGTCCCAACAGGAACATTATCAAACAGATATTTGATATCGTC > CP042583/1699650‑1700210 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |