Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 1,700,736 | 3 bp→CGA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 1,700,736 | 0 | G | C | 99.3% | 626.1 / NA | 270 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/0); major base C (144/123); minor base A (2/0); total (147/123) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.02e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,700,737 | 0 | C | G | 99.2% | 623.1 / NA | 270 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); major base G (146/120); minor base T (1/1); total (147/123) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,700,738 | 0 | T | A | 99.6% | 638.4 / NA | 270 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base A (147/122); minor base C (0/1); total (147/123) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.56e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 270 total aligned reads displayed.
TTTCTCGCCCAGCCTGGCCGATACCAATAGGAAAGACTTCCACAGTATTACTGTCTGGTGGGTAGTAATAAAGACGCATCTCAGCGACGTTAACAACAATCCCTTTACGAACAGTGTCGGGCAAAATCAGTTGCTGCGGAATGGTGAGTTG‑GCTGCCAGACTTCGGCAAAAAAACATCAGCGCCCGGGTTCGCTTCCAGCATGTTACTTAACCCTTGCCCGTATTGTGCGGCAAAAGTCTCCAGCGGCTGGGTATTGTGATCAGGAACAGTTACAGTAAAGCTCTGCCCCACTAAACGGCTACCCTCTGGAGGTAATGGATAAGTTACCGCCAGGCTAGTATGGCTGGCAAAAAGCAGAGCAAAACTGCAAAGAATATTTACACGACGCATCATGTCCCTTTCCTATGTCGCGAAAGCTATCCGTTAAGTATAGCTTTTATCAGACTTTTCGTTTTTAACTGTTCAAATCAGAAGTCGTATTCCCCGGTAGAACAATATTACTGGCAGCAAGTTCGCCCATGTTGTTGTATATCGCACAGGCAGCTTCGATGATGGGCA > CP042583/1700456‑1701014 ||| cGCCCAGCCTGGCCGATACCAATAGGAAAGACTTCCACAGTATTACTGTCTGGTGGGTAGTAATAAAGACGCATCTCAGCGACGTTAACAACAATCCCTTTACGAACAGTGTCGGGCAAAATCAGTTGCTGCGGAATGGTGAGTTG‑CGAGCCAGACTTCGGCAAAAAAACATCAGCGCCCGGGTTCGCTTCCAGCATGTTACTTAACCCTTGCCCGTATTGTGCGGCAAAAGTCTCCAGCGGCTGGGTATTGTGATCAGGAACAGTTACAGTAAACGACTGCCCCACTa < 1:504408/289‑1 (MQ=255) ccTGGCCGATACCAATAGGAAAGACTTCCACAGTATTACTGTCTGGTGGGTAGTAATAAAGACGCATCTCAGCGACGTTAACAACAATCCCTTTACGAACAGTGTCGGGCAAAATCAGTTGCTGCGGAATGGTGAGTTG‑CGAGCCAGACTTCGGCAAAAAAACATCAGCGCCCGGGTTCGCTTCCAGCATGTTACTTAACCCTTGCCCGTATTGTGCGGCAAAAGTCTCCAGCGGCTGGGTATTGTGATCAGGCACAGTTACAGTAAACGACTGCCCAACTAAActggt > 2:1096351/1‑285 (MQ=255) cTGGCCGATACCAATAGGAAAGACTTCCACAGTATTACTGTCTGGTGGGTAGTAATAAAGACGCATCTCAGCGACGTTAACAACAATCCCTTTACGAACAGTGTCGGGCAAAATCAGTTGCTGCGGAATGGTGAGTTG‑CGAGCCAGACTTCGGCAAAAAAACATCAGCGCCCGGGTTCGCTTCCAGCATGTTACTTAACCCTTGCCCGTATTGTGCGGCAAAAGTCTCCAGCGGCTGGGTATTGTGATCAGGAACAGTTACAGTAAACGACTGCCCCACTAAACgg < 2:1075047/286‑1 (MQ=255) cTGGCCGATACCAATAGGAAAGACTTCCACAGTATTACTGTCTGGTGGGTAGTAATAAAGACGCATCTCAGCGACGTTAACAACAATCCCTTTACGAACAGTGTCGGGCAAAATCAGTTGCTGCGGAATGGTGAGTTG‑CGAGCCAGACTTCGGCAAAAAAACATCAGCGCCCGGGTTCGCTTCCAGCATGTTACTTAACCCTTGCCCGTATTGTGCGGCAAAAGTCTCCAGCGGCTGGGTATTGTGATCAGGAACAGTTACAGTAAACGACTGCCCCACTAAACGGCTa < 1:1123695/289‑1 (MQ=255) cTGGCCGATACAAATAGGAAAGACTTCCACAGTATTACTGTCTGGTGGGTAGTAATAAAGACGCATCTCAGCGACGTTAACAACAATCCCTTTACGAACAGTGTCGGGCAAAATCAGTTGCTGCGGAATGGTGAGTTG‑CGAGCCAGACTTCGGCAAAAAAACATCAGCGCCCGGGTTCGCTTCCAGCATGTTACTTAACCCTTGCCCGTATTGTGCGGCAAAAGTCTCCAGCGGCTGGGTATTGTGATCAGGAACAGTTACAGTAAACGACTGCCCCACTAAACGGc < 1:77363/287‑1 (MQ=255) ccGATACCAATAGGAAAGACTTCCACAGTATTACTGTCTGGTGGGTAGTAATAAAGACGCATCTCAGCGACGTTAACAACAATCCCTTTACGAACAGTGTCGGGCAAAATCAGTTGCTGCGGAATGGTGAGTTG‑CGAGCCAGACTTCGGCAAAAAAACATCAGCGCCCGGGTTCGCTTCCAGCATGTTACTTAACCCTTGCCCGTATTGTGCGGCAAAAGTCTCCAGCGGCTGGGTATTGTGATCAGGAACAGTTACAGTAAACGACTGCCCCACTAAACGGCTACCct < 1:786154/289‑1 (MQ=255) gACTTCCACAGTATTACTGTCTGGTGGGTAGTAATAAAGACGCATCTCAGCGACGTTAACAACAATCCCTTTACGAACAGTGTCGGGCAAAATCAGTTGCTGCGGAATGGTGAGTTG‑CGAGCCAGACTTCGGCAAAAAAACATCAGCGCCCGGGTTCGCTTCCAGCATGTTACTTAACCCTTGCCCGTATTGTGCGGCAAAAGTCTCCAGCGGCTGGGTATTGTGATCAGGAACAGTTACAGTAAACGACTGCCCCACTAAACGGCTACCCTCTGGAGGTAATGGATaa > 2:1745436/1‑289 (MQ=255) cctccaacatATTACTGTCGGGTGGGTGGTAATAAAGACGCATCTCAGCGACGTTAACAACAATCCCTTTACGAACCGTGTCGGGCAAAATCAGTTGCTGCGGAATGGTGAGTTGCGATG‑CAGACTTCGGCAAAAAAACATCAGCGCCCGGGTTCGCTTCCAGCATGTTACTTAACCCTTGCCCGTATTGTGCGGCAAAAGTCTCCAGCGGCTGGGTATTGTGATCAGGAACAGTTACAGTAAACGACTGCCCCACTAAACGGCTACCCTCTGGAGGTAATGGATAAGt < 2:1811944/280‑1 (MQ=255) ttCCACAGTATTACTGTCTGGTGGGTAGTAATAAAGACGCATCTCAGCGACGTTAACAACAATCCCTTTACGAACAGTGTCGGGCAAAATCAGTTGCTGCGGAATGGTGAGTTG‑CGAGCCAGACTTCGGCAAAAAAACATCAGCGCCCGGGTTCGCTTCCAGCATGTTACTTAACCCTTGCCCGTATTGTGCGGCAAAAGTCTCCAGCGGCTGGGTATTGTGATCAGGAACAGTTACAGTAAACGACTGCCCCACTAAACGGCTACCCTCTGGAGGTAATGGATAAGtt < 1:271198/289‑1 (MQ=255) caGTATTACTGACTCGTGGGTAATAATAAGGAGGCATTGCAGCGACGTTAACAACAATCCCTTTACGAACAGTGTCGGGCAAAATCAGTTGCTGCGGAATGGTGAGGTG‑CGAGCCAGACTTCGGCAAAAAAACATCAGCGCCCGGGTTCGCTTCCAGCATGTTACTTAACCCTTGCCCGTATTGTGCGGCAAAAGTCTCCAGCGGCTGGGTATTGTGATCAGGAACAGTTACAGTAAACGACTGCCCCACTAAACGGCTACCCTCTGGAGGTAATGGATAAGTTACCGc < 2:740436/289‑1 (MQ=255) aTTACTGTCTGGTGGGTAGTAATAAAGACGCATCTCAGCGACGTTAACAACAATCCCTTTACGAACAGTGTCGGGCAAAATCAGTTGCTGCGGAATGGTGAGTTG‑CGAGCCAGACTTCGGCAAAAAAACATCAGCGCCCGGGTTCGCTTCCAGCATGTTACTTAACCCTTGCCCGTATTGTGCGGCAAAAGTCTCCAGCGGCTGGGTATTGTGATCAGGAACAGTTACAGTAAACGACTGCCCCACTAAACGGCTACCCTCTGGAGGTAATGGATAAGTTACCGCCAg < 1:177682/288‑1 (MQ=255) tCTGGTGGGTAGTAATAAAGACGCATCTCAGCGACGTTAACAACAATCCCTTTACGAACAGTGTCGGGCAAAATCAGTTGCTGCGGAATGGTGAGTTG‑CGAGCCAGACTTCGGCAAAAAAACATCAGCGCCCGGGTTCGCTTCCAGCATGTTACTTAACCCTTGCCCGTATTGTGCGGCAAAAGTCTCCAGCGGCTGGGTATTGTGATCAGGAACAGTTACAGTAAACGACTGCCCCACTAAACGGCTATCCTCTGGAGGTAATGGATAAGTTACAGCCAGGCTAGTAt > 1:573718/1‑289 (MQ=255) tCTGGTGGGTAGTAATAAAGACGCATCTCAGCGACGTTAACAACAATCCCTTTACGAACAGTGTCGGGCAAAATCAGTTGCTGCGGAATGGTGAGTTA‑CGAGCCAGACTTCGGCAAAAAAACATCAGCGCCCGGGTTCGCTTCCAGCATGTTACTTAACCCTTGCCCGTATTGTGCGGCAAAAGTCTCCAGCGGCTGGGTATTGTGATCAGGAACAGTTACAGTAAACGACTGCCCCACTAAACGGCTACCCTCTGGAGGTAATGGATAAGTTACCGCCAGGCTAGTAt > 2:1250999/1‑289 (MQ=255) tCTGGTGGGTAGTAATAAAGACGCATCTCAGCGACGTTAACAACAATCCCTTTACGAACAGTGTCCGGCAAAATCAGTTGCTGCGGAATGGTGAGTTG‑CGAGCCAGACTTCGGCAAAAAAACATCAGCGCCCGGGTTCGCTTCCAGCATGTTACTTAACCCTTGCCCGTATTGTGCGGCAAAAGTCTCCAGCGGCTGGGTATTGTGATCAGGAACAGTTACAGTAAACGACTGCCCCACTAAACGGCTACCCTCTGGAGGTAATGGATAAGTTACCGCCAGGCTAGTAt > 1:1471736/1‑289 (MQ=255) tggtggGTAGTAATAAAGACGCATCTCAGCGACGTTAACAACAATCCCTTTACGAACAGTGTCGGGCAAAATCAGTTGCTGCGGAATGGTGAGTTG‑CGAGCCAGACTTCGGCAAAAAAACATCAGCGCCCGGGTTCGCTTCCAGCATGTTACTTAACCCTTGCCCGTATTGTGCGGCAAAAGTCTCCAGCGGCTGGGTATTGTGATCAGGAACAGTTACAGTAAACGACTGCCCCACTAAACGGCTACCctct < 2:866116/253‑1 (MQ=255) tggtggGTAGTAATAAAGACGCATCTCAGCGACGTTAACAACAATCCCTTTACGAACAGTGTCGGGCAAAATCAGTTGCTGCGGAATGGTGAGTTG‑CGAGCCAGACTTCGGCAAAAAAACATCAGCGCCCGGGTTCGCTTCCAGCATGTTACTTAACCCTTGCCCGTATTGTGCGGCAAAAGTCTCCAGCGGCTGGGTATTGTGATCAGGAACAGTTACAGTAAACGACTGCCCCACTAAACGGCTACCctct > 1:866116/1‑253 (MQ=255) tggtggGTAGTAATAAAGACGCATCTCAGCGACGTTAACAACAATCCCTTTACGAACAGTGTCGGGCAAAATCAGTTGCTGCGGAATGGTGAGTTG‑CGAGCCAGACTTCGGCAAAAAAACATCAGCGCCCGGGTTCGCTTCCAGCATGTTACTTAACCCTTGCCCGTATTGTGCGGCAAAAGTCTCCAGCGGCTGGGTATTGTGATCAGGAACAGTTACAGTAAACGACTGCCCCACTAAACGGCTACCCTCTgg > 1:1652732/1‑255 (MQ=255) tggtggGTAGTAATAAAGACGCATCTCAGCGACGTTAACAACAATCCCTTTACGAACAGTGTCGGGCAAAATCAGTTGCTGCGGAATGGTGAGTTG‑CGAGCCAGACTTCGGCAAAAAAACATCAGCGCCCGGGTTCGCTTCCAGCATGTTACTTAACCCTTGCCCGTATTGTGCGGCAAAAGTCTCCAGCGGCTGGGTATTGTGATCAGGAACAGTTACAGTAAACGACTGCCCCACTAAACGGCTACCCTCTgg < 2:1652732/255‑1 (MQ=255) tggGTAGTAATAAAGACGCATCTCAGCGACGTTAACAACAATCCCTTTACGAACAGTGTCGGGCAAAATCAGTTGCTGCGGAATGGTGAGTTG‑CGAGCCAGACTTCGGCAAAAAAACATCAGCGCCCGGGTTCGCTTCCAGCATGTTACTTAACCCTTGCCCGTATTGTGCGGCAAAAGTCTCCAGCGGCTGGGTATTGTGATCAGGAACAGTTACAGTAAACGACTGCCCCACTAAACGGCTACCCTCTGGAGGTAATGGATAAGTTACCGCCAGGCTAGTAtggctg > 2:356326/1‑289 (MQ=255) agtaATAAAGACGCATCTCAGCGACGTTAACAACAATCCCTTTACGAACAGTGTCGGGCAAAATCAGTTGCTGCGGAATGGTGAGTTG‑CGAGCCAGACTTCGGCAAAAAAACATCAGCGCCCGGGTTCGCTTCCAGCATGTTACTTAACCCTTGCCCGTATTGTGCGGCAAAAGTCTCCAGCGGCTGGGTATTGTGATCAGGAACAGTTACAGTAAACGACTGCCCCACTAAACGGCTCCCACCTGGAGGTAATGGATAAGTCACCGCCCGGCGAGAAgggcggtggaa > 2:48350/1‑282 (MQ=255) agtaATAAAGACGCATCTCAGCGACGTTAACAACAATCCCTTTACGAACAGTGTCGGGCAAAATCAGTTGCTGCGGAATGGTGAGTTG‑CGAGCCAGACTTCGGCAAAAAAACATCAGCGCCCGGGTTCGCTTCCAGCATGTTACTTAACCCTTGCCCGTATTGTGCGGCAAAAGTCTCCAGCGGCTGGGTATTGTGATCAGGAACAGTTACAGTAAACGACTGCCCCACTAAACGGCTACCCTCTGGAGGTAATGGAt > 1:1511973/1‑258 (MQ=255) agtaATAAAGACGCATCTCAGCGACGTTAACAACAATCCCTTTACGAACAGTGTCGGGCAAAATCAGTTGCTGCGGAATGGTGAGTTG‑CGAGCCAGACTTCGGCAAAAAAACATCAGCGCCCGGGTTCGCTTCCAGCATGTTACTTAACCCTTGCCCGTATTGTGCGGCAAAAGTCTCCAGCGGCTGGGTATTGTGATCAGGAACAGTTACAGTAAACGACTGCCCCACTAAACGGCTACCCTCTGGAGGTAATGGAt < 2:1511973/258‑1 (MQ=255) taataaAGACGCATCTCAGCGACGTTAACAACAATCCCTTTACGAACAGTGTCGGGCAAAATCAGTTGCTGCGGAATGGTGAGTTG‑CGAGCCAGACTTCGGCAAAAAAACATCAGCGCCCGGGTTCGCTTCCAGCATGTTACTTAACCCTTGCCCGTATTGTGCGGCAAAAGTCTCCAGCGGCTGGGTATTGTGATCAGGAACAGTTACAGTAAACGACTGCCCCACTAAACGGCTACCCTCTGGAGGTAATGGATAAGTTACCGCCAGGCTAGTATGGCTGGCaaaaa > 1:936968/1‑289 (MQ=255) gACGCATCTCAGCGACGTTAACAACAATCCCTTTACGAACAGTGTCGGGCAAAATCAGTTGCTGCGGAATGGTGAGTTG‑CGAGCCAGACTTCGGCAAAAAAACATCAGCGCCCGGGTTCGCTTCCAGCATGTTACTTAACCCTTGCCCGTATTGTGCGGCAAAAGTCTCCAGCGGCTGGGTATTGTGATCAGGAACAGTTACAGTAAACGACTGCCCCACTAAACGGCTACCCTCTGGAGGTAATGGATAAGTTACCGCCAGGCTAGTATGGCTGGCAAAAAGCAGAGc > 1:832413/1‑289 (MQ=255) aCGCATCTCAGCGACGTTAACAACAATCCCTTTACGAACAGTGTCGGGCAAAATCAGTTGCTGCGGAATGGTGAGTTG‑CGAGCCAGACTTCGGCAAAAAAACATCAGCGCCCGGGTTCGCTTCCAGCATGTTACTTAACCCTTGCCCGTATTGTGCGGCAAAAGTCTCCAGCGGCTGGGTATTGTGATCAGGAACAGTTACAGTAAACGACTGCCCCACTAAACGGCTACCCTCTGGAGGTAATGGATAAGTTACCGCCAGGCTAGTATGGCTGGCAAAAAGCAGAGCa > 1:792555/1‑289 (MQ=255) gCATCTCAGCGACGTTAACAACAATCCCTTTACGAACAGTGTCGGGCAAAATCAGTTGCTGCGGAATGGTGAGTTG‑CGAGCCAGACTTCGGCAAAAAAACATCAGCGCCCGGGTTCGCTTCCAGCATGTTACTTAACCCTTGCCCGTATTGTGCGGCAAAAGTCTCCAGCGGCTGGGTATTGTGATCAGGAACAGTTACAGTAAACGACTGCCCCACTAAACGGCTACCCTCTGGAGGTAATGGATAAGTTACCGCCAGGCTAGTATGGCTGGCAAAAAGCAGAGCaaa > 2:202132/1‑289 (MQ=255) aTCTCAGCGACGTTAACAACAATCCCTTTACGAACAGTGTCGGGCAAAATCAGTTGCTGCGGAATGGTGAGTTG‑CGAGCCAGACTTCGGCAAAAAAACATCAGCGCCCGGGTTCGCTTCCAGCATGTTACTTAACCCTTGCCCGTATTGTGCGGCAAAAGTCTCCAGCGGCTGGGTATTGTGATCAGGAACAGTTACAGTAAACGACTGCCCCACTAAACGGCTACCCTCTGGAGGTAATGGATAAGTTACCGCCAGGCTAGTATGGCTGGCAAAAAGCAGAGCaaatg < 1:1886142/289‑3 (MQ=255) ctcAGCGACGTTAACAACAATCCCTTTACGAACAGTGTCGGGCAAAATCAGTTGCTGCGGAATGGTGAGTTG‑CGAGCCAGACTTCGGCAAAAAAACATCAGCGCCCGGGTTCGCTTCCAGCATGTTACTTAACCCTTGCCCGTATTGTGCGGCAAAAGTCTCCAGCGGCTGGGTATTGTGATCAGGAACAGTTACAGTAAACGACTGCCCCACTAAACGGCTACCCTCTGGAGGTAATGGATAAGTTACCGCCAGGCTAGTATGGCTGGCAAAAAGCAGAGCaaatgag < 1:1063319/289‑5 (MQ=255) aGCGACGTTAACAACAATCCCTTTACGAACAGTGTCGGGCAAAATCAGTTGCTGCGGAATGGTGAGTTG‑CGAGCCAGACTTCGGCAAAAAAACATCAGCGCCCGGGTTCGCTTCCAGCATGTTACTTAACCCTTGCCCGTATTGTGCGGCAAAAGTCTCCAGCGGCTGGGTATTGTGATCAGGAACAGTTACAGTAAACGACTGCCCCACTAAACGGCTACCCTCTGGAGGTAATGGATAAGTTACCGCCAGGCTAGTATGGCTGGCAAAAAGCAGAGCaaatgagcaa > 2:1334311/1‑282 (MQ=255) gaagTTAACAACAATCCCTTTACGAACAGTGTCGGGAAAAATCAGTTGCTGCGGAATGGGGAGGTG‑CGAGCCAGACTTCGGCAAAAAAACATCAGCGCCCGGGTTCGCTTCCAGCATGTTACTTAACCCTTGCCCGTATTGTGCGGCAAAAGTCTCCAGCGGCTGGGTATTGTGATCAGGAACAGTTACAGTAAACGACTGCCCCACTAAACGGCTACCCTCTGGAGGTAATGGATAAGTTACCGCCAGGCTAGTATGGCTGGCAAAAAGCAGAGCaaatgagcaa < 2:1793535/283‑8 (MQ=255) gACGTTAACAACAATCCCTTTACGAACAGTGTCGGGCAAAATCAGTTGCTGCGGCATGGTGAGTTG‑CGAGCCAGACTTCGGCAAAAAAACATCAGCGCCCGGGTTCGCTTCCAGCATGTTACTTAACCCTTGCCCGTATTGTGCGGCAAAAGTCTCCAGCGGCTGGGTATTGTGATCAGGAACAGTTACAGTAAACGACTGCCCCACTAAACGGCTACCCTCTGGAGGTAATGGATAAGTTACCGCCAGGCTAGTATGGCTGGCAAAAAGCAGAGCAAATGAGCAAAg < 1:737265/288‑1 (MQ=255) gACGTTAACAACAATCCCTTTACGAACAGTGTCGGGCAAAATCAGTTGCTGCGGAATGGTGAGTTG‑CGAGCCAGACTTCGGCAAAAAAACCTCAGCGCCCGGGTTCGCTTCCAGCATGTTACTTAACCCTTGCCCGTATTGTGCGGCAAAAGTCTCCAGCGGCTGGGTATTGTGATCAGGAACAGTTACAGTAAACGACTGCCCCACTAAACGGCTACCCTCTGGAGGTAATGGATAAGTTACCGCCAGGCTAGTATGGCTGGCAAAAAGCAGAGCaaatgagcaa < 2:1124157/286‑8 (MQ=255) gACGTTAACAACAATCCCTTTACGAACAGTGTCGGGCAAAATCAGTTGCTGCGGAATGGTGAGTTG‑CGAGCCAGACTTCGGCAAAAAAACATCAGCGCCCGGGTTCGCTTCCAGCATGTTACTTAACCCTTGCCCGTATTGTGCGGCAAAAGTCTCCAGCGGCTGGGTATTGTGATCAGGAACAGTTACAGTAAACGACTGCCCCACTAAACGGCTACCCTCTGGAGGTAATGGATAAGTTACCGCCAGGCTAGTATGGCTGGCAAAAAGCAGAGCaaatgagcaa < 1:1745436/286‑8 (MQ=255) gACGTTAACAACAATCCCTTTACGAACAGTGTCGGGCAAAATCAGTTGCTGCGGAATGGTGAGTTG‑CGAGCCAGACTTCGGCAAAAAAACATCAGCGCCCGGGTTCGCTTCCAGCATGTTACTTAACCCTTGCCCGTATTGTGCGGCAAAAGTCTCCAGCGGCTGGGTATTGTGATCAGGAACAGTTACAGTAAACGACTGCCCCACTAAACGGCTACCCTCTGGAGGTAATGGATAAGTTACCGCCAGGCTAGTATGGCTGGCAAAAAGCAGAGCAAATGAGCAAAg < 1:310012/288‑1 (MQ=255) gACGTGAACAACAATCCCTTTACGACCAGGGTCGGGCAAAATCAGTGGCTGCGGAATGGTGAGTTG‑CGAGCCAGACTTCGGCAAAAAAACATCAGCGCCCGGGTTCGCTTCCAGCATGTTACTTAACCCTTGCCCGTATTGTGCGGCAAAAGTCTCCAGCGGCTGGGTATTGTGATCAGGAACAGTTACAGTAAACGACTGCCCCACTAAACGGCTACCCTCTGGAGGTAATGGATAAGTTACCGCCAGGCTAGTATGGCTGGCAAAAAGCAGAGCAAATGAGCAAAg < 2:1532915/288‑1 (MQ=255) aTCCCTTTACGAACAGTGTCGGGCAAAATCAGTTGCTGCGGAATGGTGAGTTG‑CGAGCCAGACTTCGGCAAAAAAACATCAGCGCCCGGGTTCGCTTCCAGCATGTTACTTAACCCTTGCCCGTATTGTGCGGCAAAAGTCTCCAGCGGCTGGGTATTGTGATCAGGAACAGTTACAGTAAACGACTGCCCCACTAAACGGCTACCCTCTGGAGGTAATGGATAAGTTACCGCCAGGCTAGTATGGCTGGCAAAAAGCAGAGCAAATGAGCAAAGAATATTTACacgac > 1:613678/1‑289 (MQ=255) tCCCTTTACGAACAGTGTCGGGCAAAATCAGTTGCTGCGGAATGGTGAGTTG‑CGAGCCAGACTTCGGCAAAAAAACATCAGCGCCCGGGTTCGCTTCCAGCATGTTACTTAACCCTTGCCCGTATTGTGCGGCAAAAGTCTCCAGCGGCTGGGTATTGTGATCAGGAACAGTTACAGTAAACGACTGCCCCACTAAACGGCTACCCTCTGGAGGTAATGGATAAGTTACCGCCAGGCTAGTATGGCTGGCAAAAAGCAGAGCAAATGAGCAAAGAATATTTACacgac > 1:1494888/1‑288 (MQ=255) tCCCTTTACGAACAGTGTCGGGCAAAATCAGTTGCTGCGGAATGGTGAGTTG‑CGAGCCAGACTTCGGCAAAAAAACATCAGCGCCCGGGTTCGCTTCCAGCATGTTACTTAACCCTTGCCCGTATTGTGCGGCAAAAGTCTCCAGCGGCTGGGTATTGTGATCAGGAACAGTTACAGTAAACGACTGCCCCACTAAACGGCTACCCTCTGGAGGTAATGGATAAGTTACCGCCAGGCTAGTATGGCTGGCAAAAAGCAGAGCAAATGAGCAAAGAATATTTACacgac > 2:323290/1‑288 (MQ=255) tCCCTTTACGAACAGTGTCGGGCAAAATCAGTTGCTGCGGAATGGTGAGTTG‑CGAGCCAGACTTCGGCAAAAAAACATCAGCGCCCGGGTTCGCTTCCAGCATGTTACTTAACCCTTGCCCGTATTGTGCGGCAAAAGTCTCCAGCGGCTGGGTATTGTGATCAGGAACAGTTACAGTAAACGACTGCCCCACTAAACGGCTACCCTCTGGAGGTAATGGATAAGTTACCGCCAGGCTAGTATGGCTGGCAAAAAGCAGAGCAAATGAGCAAAGAATATTTACacgac > 2:598883/1‑288 (MQ=255) tCCCTTTACGAACAGTGTCGGGCAAAATCAGTTGCTGCGGAATGGTGAGTTG‑CGAGCCAGACTTCGGCAAAAAAACATCAGCGCCCGGGTTCGCTTCCAGCATGTTACTTAACCCTTGCCCGTATTGTGCGGCAAAAGTCTCCAGCGGCTGGGTATTGTGATCAGGAACAGTTACAGTAAACGACTGCCCCACTAAACGGCTACCCTCTGGAGGTAATGGATAAGTTACCGCCAGGCTAGTATGGCTGGCAAAAAGCACAGCAAATGAGCAAAGAATATTTACactac > 1:897200/1‑288 (MQ=255) aCAGTGTCGGGCAAAATCAGTTGCTGCGGAATGTTGAGTTG‑CGAGCCAGACTTCGGCAAAAAAACCTCAGCGCCCGGGTTCGCTTCCAGCATGTTACTTAACCCTTGCCCGTATTGTGCGGCAAAAGTCTCCAGCGGCTGGGTATTGTGATCAGGAACAGTTACAGTAAACGACTGCCCCACTAAACGGCTACCCTCTGGAGGTAATGGATAAGTTACCGCCAGGCTAGTATGGCTGGCAAAAAGCAGAGCAAATGAGCAAAGAATATTTACACGACGCATCATGTcc < 1:871625/288‑1 (MQ=255) aCAGTGTCGGGCAAAATCAGTTGCTGCGGAATGGTGAGTTG‑CGAGCCAGACTTCGGCAAAAAAACATCAGCGCCCGGGTTCGCTTCCAGCATGTTACTTAACCCTTGCCCGTATTGTGCGGCAAAAGTCTCCAGCGGCTGGGTATTGTGATCAGGAACAGTTACAGTAAACGACTGCCCCACTAAACGGCTACCCTCTGGAGGTAATGGATAAGTTACCGCCAGGCTAGTATGGCTGGCAAAAAGCAGAGCAAATGAGCAAAGAATATTTACACGACGCATCATGTcc < 1:623528/288‑1 (MQ=255) aCAGTGTCGGGCAAAATCAGTTGCTGCGGAATGGTGAGTTG‑CGAGCCAGACTTCGGCAAAAAAACATCAGCGCCCGGGTTCGCTTCCAGCATGTTACTTAACCCTTGCCCGTATTGTGCGGCAAAAGTCTCCAGCGGCTGGGTATTGTGATCAGGAACAGTTACAGTAAACGACTGCCCCACTAAACGGCTACCCTCTGGAGGTAATGGATAAGTTACCGCCAGGCTAGTATGGCTGGCAAAAAGCAGAGCAAATGAGCAAAGAATATTTACACGACGCATCATGTcc < 1:985483/288‑1 (MQ=255) aCAGTGTCGGGCAAAATCAGTTGCTCCGGAATGGTGAGTTG‑CGAGCCAGACTTCGGCAAAAAAACATCAGCGCCCGGGTTCGCTTCCAGCATGTTACTTAACCCTTGCCCGTATTGTGCGGCAAAAGTCTCCAGCGGCTGGGTATTGTGATCAGGAACAGTTACAGTAAACGACTGCCCCACTAAACGGCTACCCTCTGGAGGTAATGGATAAGTTACCGCCAGGCTAGTATGGCTGGCAAAAAGCAGAGCAAATGAGCAAAGAATATTTACACGACGCATCATGTcc < 1:1412673/288‑1 (MQ=255) cAGTGTCGGGCAAAATCAGTTGCTGCGGAATGGTGAGTTG‑CGAGCCAGACTTCGGCAAAAAAACATCAGCGCCCGGGTTCGCTTCCAGCATGTTACTTAACCCTTGCCCGTATTGTGCGGCAAAAGTCTCCAGCGGCTGGGTATTGTGATCAGGAACAGTTACAGTAAACGACTGCCCCACTAAACGGCTACCCTCTGGAGGTAATGGATAAGTTACCGCCAGGCTAGTATGGCTGGCAAAAAGCAGAGCAAATGAGCAAAGAATATTTACACGACGCATCATGTCCCt > 2:56898/1‑289 (MQ=255) gtCGGGCAAAATCAGTTGCTGCGGAATGGTGAGTTG‑CGAGCCAGACTTCGGCAAAAAAACATCAGCGCCCGGGTTCGCTTCCAGCATGTTACTTAACCCTTGCCCGTATTGTGCGGCAAAAGTCTCCAGCGGCTGGGTATTGTGATCAGGAACAGTTACAGTAAACGACTGCCCCACTAAACGGCTACCCTCTGGAGGTAATGGATAAGTTACCGCCAGGCTAGTATGGCTGGCAAAAAGCAGAGCAAATGAGCAAAGAATATTTACACGACGCATCATGTCCCttt > 1:337749/1‑287 (MQ=255) gggCAAAATCAGTTGCTGCGGAATGGTGAGTTG‑CGAGCCAGACTTCGGCAAAAAAACATCAGCGCCCGGGTTCGCTTCCAGCATGTTACTTAACCCTTGACCGTATTGTGCGGCAAAAGTCTCCAGCGGCTGGGTATTGTGATCAGGAACAGTTACAGTAAACGACTGCCCCACTAAACGGCTACCCTCTGGAGGTAATGGATAAGTTACCGCCAGGCTAGTATGGCTGGCAAAAAGCAGAGCAAATGAGCAAAGAATATTTACACGACGCATCATGTCCCTTTCCTAt < 2:936968/289‑1 (MQ=255) ggCAAAATCAGTTGCTGCGGAATGGTGAGTTG‑CGAGCCAGACTTCGGCAAAAAAACATCAGCGCCCGGGTTCGCTTCCAGCATGTTACTTAACCCTTGCCCGTATTGTGCGGCAAAAGTCTCCAGCGGCTGGGTATTGTGATCAGGAACAGTTACAGTAAACGACTGCCCCACTAAACGGCTACCCTCTGGAGGTAATGGATAAGTTACCGCCAGGCTAGTATGGCTGGCAAAAAGCAGAGCAAATGAGCAAAGAATATTTACACGACGCATCATGTcc > 2:222823/1‑279 (MQ=255) aaTCAGTTGCTGCGGAATGGTGAGTTG‑CGAGCCAGACTTCGGCAAAAAAACATCAGCGCCCGGGTTCGCTTCCAGCATGTTACTTAACCCTTGCCCGTATTGTGCGGCAAAAGTCTCCAGCGGCTGGGTATTGTGATCAGGAACAGTTACAGTAAACGACTGCCCCACTAAACGGCTACCCTCTGGAGGTAATGGATAAGTTACCGCCAGGCTAGTATGGCTGGCAAAAAGCAGAGCa < 1:1294969/238‑1 (MQ=255) aaTCAGTTGCTGCGGAATGGTGAGTTG‑CGAGCCAGACTTCGGCAAAAAAACATCAGCGCCCGGGTTCGCTTCCAGCATGTTACTTAACCCTTGCCCGTATTGTGCGGCAAAAGTCTCCAGCGGCTGGGTATTGTGATCAGGAACAGTTACAGTAAACGACTGCCCCACTAAACGGCTACCCTCTGGAGGTAATGGATAAGTTACCGCCAGGCTAGTATGGCTGGCAAAAAGCAGAGCAAATGAGCAAAGAATATTTACACGACGcatca < 2:239690/269‑1 (MQ=255) aaTCAGTTGCTGCGGAATGGTGAGTTG‑CGAGCCAGACTTCGGCAAAAAAACATCAGCGCCCGGGTTCGCTTCCAGCATGTTACTTAACCCTTGCCCGTATTGTGCGGCAAAAGTCTCCAGCGGCTGGGTATTGTGATCAGGAACAGTTACAGTAAACGACTGCCCCACTAAACGGCTACCCTCTGGAGGTAATGGATAAGTTACCGCCAGGCTAGTATGGCTGGCAAAAAGCAGAGCAAATGAGCAAAGAATATTTACACGACGCATCATGTCCCTTTCCTATGTcgcg > 1:235484/1‑289 (MQ=255) aaTCAGTTGCTGCGGAATGGTGAGTTG‑CGAGCCAGACTTCGGCAAAAAAACATCAGCGCCCGGGTTCGCTTCCAGCATGTTACTTAACCCTTGCCCGTATTGTGCGGCAAAAGTCTCCAGCGGCTGGGTATTGTGATCAGGAACAGTTACAGTAAACGACTGCCCCACTAAACGGCTACCCTCTGGAGGTAATGGATAAGTTACCGCCAGGCTAGTATGGCTGGCAAAAAGCAGAGCAAATGAGCAAAGAATATTTACACGACGCATCATGTCCCTTTCCTATGTcgcg > 1:217136/1‑289 (MQ=255) ttGCTGCGGAATGGTGAGTTG‑CGAGCCAGACTTCGGCAAAAAAACATCAGCGCCCGGGTTCGCTTCCAGCATGTTACTTAACCCTTGCCCGTATTGTGCGGCAAAAGTCTCCAGCGGCTGGGTATTGTGATCAGGAACAGTTACAGTAAACGACTGCCCCACTAAACGGCTACCCTCTGGAGGTAATGGATAAGTTACCGCCAGGCTAGTATGGCTGGCAAAAAGCAGAGCAAATGAGCAAAGAATATTTACACGACGCATCATGTCCCTTTCCTATGTCGCGAAAGc < 1:1281912/288‑1 (MQ=255) gctgcGGAATGGTGAGTTG‑CGAGCCAGACTTCGGCAAAAAAACATCAGCGCCCGGGTTCGCTTCCAGCATGTTACTTAACCCTTGCCCGTATTGTGCGGCAAAAGTCTCCAGCGGCTGGGTATTGTGATCAGGAACAGTTACAGTAAACGACTGCCCCACTAAACGGCTACCCTCTGGAGGTAATGGATAAGTTACCGCCAGGCTAGTATGGCTGGCAAAAAGCAGAGCAAATGAGCAAAGAATATTTACACGACGCATCATGTCCCTTTCCTATGTCGCGAAAGCTAt < 1:1393642/289‑1 (MQ=255) ggTGAGTTG‑CGGGCCAGAATTCGGAAACAAAACATCAGCGCCCGGGTTCGCTTCCAGCAGGTTACTTAACCCTTGCCCGTATTGTGCGGCAAAAGTCTCCAGCGGCTGGGTATTGTGATCAGGAACAGTTACAGTAAACGACTGCCCCACTAAACGGCTACCCTCTGGAGGTAATGGATAAGTTACCGCCAGGCTAGTATGGCTGGCAAAAAGCAGAGCAAATGAGCAAAGAATATTTACACGACGCATCATGTCCCTTTCCTATGTCGCGAAAGCTATCCGTTAAGta < 2:1704462/289‑1 (MQ=255) tgcgagCCAGACTTCGGCAAAAAAACATCAGCGCCCGGGTTCGCTTCCAGCATGTTACTTAACCCTTGCCCGTATTGTGCGGCAAAAGTCTCCAGCGGCTGGGTATTGTGATCAGGAACAGTTACAGTAAACGACTGCCCCACTAAACGGCTACCCTCTGGAGGTAATGGATAAGTTACCGCCAGGCTAGTATGGCTGGCAAAAAGCAGAGCAAATGAGCAAAGAATATTTACACGACGCATCATGTCCCTTTCCTATGTCGCGAAAGCTATCCGCTAAGTATAGCtct > 1:689245/6‑287 (MQ=255) cgagCCAGACTTCGGCAAAAAAACATCAGCGCCCGGGTTCGCTTCCAGCATGTTACTTAACCCTTGCCCGTATTGTGCGGCAAAAGTCTCCAGCGGCTGGGTATTGTGATCAGGAACAGTTACAGTAAACGACTGCCCCACTAAACGGCTACCCTCTGGAGGTa < 2:75770/161‑1 (MQ=255) agCCAGACTTCGGCAAAAAAACATCAGCGCCCGGGTTCGCTTCCAGCATGTTACTTAACCCTTGCCCGTATTGTGCGGCAAAAGTCTCCAGCGGCTGGGTATTGTGATCAGGAACAGTTACAGTAAACGACTGCCCCACTAAACGGCTACCCTCTGGAGGTAATGGATAAGTTACCGCCAGGCTAGTATGGCTGGCAAAAAGCAGAGCAAATGAGCAAAGAATATTTACACGACGCATCATGTCCCTTTCCTATGTCGCGAAAGCTATCCGTTAAGTATAGCTTTTATc > 2:985414/2‑289 (MQ=255) cTTCGGCAAAAAAACATCCGCGCCCGGGTTCGCTTCCAGCATGTTACTTAACCCTTGCCCGTATTGTGCGGCAAAAGTCTCCAGCGGCTGGGTATTGTGATCAGGAACAGTTACAGTAAACGACTGCCCCACTAAACGGCTACCCTCTGGAGGTAATGGATAAGTTACCGCCAGGCTAGTATGGCTGGCAAAAAGCAGAGCAAATGAGCAAAGAATATTTACACGACGCATCATGTCCCTTTCCTATGTCGCGAAAGCTATCCGTTAAGTATAGCTTTTATCAGACttt < 1:24673/289‑1 (MQ=255) cGGCAAAAAAACATCAGCGCCCGGGTTCGCTTCCAGCATGTTACTTAACCCTTGCCCGTATTGTGCGGCAAAAGTCTCCAGCGGCTGGGTATTGTGATCAGGAACAGTTACAGTAAACGACTGCCCCACTAAACGGCTACCCTCTGGAGGTAATGGATAAGTTACCGCCAGGCTAGTATGGCTGGCAAAAAGCAGAGCAAATGAGCAAAGAATATTTACACGACGCATCATGTCCCTTTCCTATGTCGCGAAAGCt < 2:854392/256‑1 (MQ=255) gcCCGGGTTCGCTTCCAGCATGTTACTTAACCCTTGCCCGTATTGTGCGGCAAAAGTCTCCAGCGGCTGGGTATTGTGATCAGGAACAGTTACAGTAAACGACTGCCCCACTAAACGGCTACCCTCTGGAGGTAATGGATAAGTTACCGCCAGGCTAGTATGGCTGGCAAAAAGCAGAGCAAATGAGCAAAGAATATTTACACGACGCATCATGTCCCTTTCCTATGTCGCGAAAGCTATCCGTTAAGTATAGCTTTTATCAGACTTTTCGttttt > 1:707070/1‑276 (MQ=255) ccGGGTTCGCTTCCAGCATGTTACTTAACCCTTGCCCGTATTGTGCGGCAAAAGTCTCCAGCGGCTGGGTATTGTGATCAGGAACAGTTACAGTAAACGACTGCCCCACTAAACGGCTACCCTCTGGAGGTAATGGATAAGTTACCGCCAGGCTAGTATGGCTGGCAAAAAGCAGAGCAAATGAGCAAAGAATATTTACACGACGCATCATGTCCCTTTCCTATGTCGCGAAAGCTATCCGTTAAGTATAGCTTTTATCAGACTTTTCGTTTTTAACTGTTCAAATCAg < 2:779832/289‑1 (MQ=255) ccGGGTTCGCTTCCAGCATGTTACTTAACCCTTGCCCGTATTGTGCGGCAAAAGTCTCCAGCGGCTGGGTATTGTGATCAGGAACAGTTACAGTAAACGACTGCCCCACTAAACGGCTACCCTCTGGAGGTAATGGATAAGTTACCGCCAGGCTAGTATGGCTGGCAAAAAGCAGAGCAAATGAGCAAAGAATATTTACACGACGCATCATGTCCCTTTCCTATGTCGCGAAAGCTATCCGTTAAGTATAGCTTTTATCAGACTTTTCGTTTTTAACTGTTCAAATCAg < 1:1673110/289‑1 (MQ=255) gCTTCCAGCATGTTACTTAACCCTTGCCCGTATTGTGCGGCAAAAGTCTCCAGCGGCTGGGTATTGTGATCAGGAACAGTTACAGTAAACGACTGCCCCACTAAACGGCTACCCTCTGGAGGTAATGGATAAGTTACCGCCAGGCTAGTATGGCTGGCAAAAAGCAGAGCAAATGAGCAAAGAATATTTACACGACGCATCATGTCCCTTTCCTATGTCGCGAAAGCTATCCGTTAAGTATAGCTTTTATCAGACTTTTCGTTTTTAACTGTTCAAATCAGAAGTCGTa < 1:48350/289‑1 (MQ=255) cAGCATGTTACTTCACCCTTGCCCGTATTGTGCGGCAAAAGTCTCCAGCGGCTGGGTATTGTGATCAGGAACAGTTACAGTAAACGACTGCCCCACTAAACGGCTACCCTCTGGAGGTAATGGATAAGTTACCGCCAGGCTAGTATGGCTGGCAAAAAGCAGAGCAAATGAGCAAAGAATATTTACACGACGCATCATGTCCCTTTCCTATGTCGCGAAAGCTATCCGTTAAGTATAGCTTTTATCAGACTTTTCGTTTTTAACTGTTCAAATCAGAAGTCGTATTccc < 1:1167054/289‑1 (MQ=255) cAGCATGTTACTTAACCCTTGCCCGTAGTTTGCGGCAAAAGTCTCCAGCGGCTGGGTATTGTGATCAGGAACAGTTACAGTAAACGACTGCCCCACTAAACGGCTACCCTCTGGAGGTAATGGATAAGTTACCGCCAGGCTAGTATGGCTGGCAAAAAGCAGAGCAAATGAGCAAAGAATATTTACACGACGCATCATGTCCCTTTCCTATGTCGCGAAAGCTATCCGTTAAGTATAGCTTTTATCAGACTTTTCGTTTTTAACTGTTCAAATCAGAAGTCGTATTccc < 1:175450/289‑1 (MQ=255) aTGTTACTTAACCCTTGCCCGTATTGTGCGGCAAAAGTCTCCAGCGGCTGGGTATTGTGATCAGGAACAGTTACAGTAAACGACTGCCCCACTAAACGGCTACCCTCTGGAGGTAATGGATAAGTTACCGCCAGGCTAGTATGGCTGGCAAAAAGCAGAGCAAATGAGCAAAGAATATTTACACGACGCATCATGTCCCTTTCCTATGTCGCGAAAGCTATCCGTTAAGTATAGCTTTTATCAGACTTTTCGTTTTTAACTGTTCAAATCAGAAGTCGTATTCCCCgg < 1:1645025/288‑1 (MQ=255) gTTACTTAACCCTGGCCCGTATTGTGCGGCAAAAGTCTCCAGCGGCTGGGTATTGTGATCAGGAACAGTTACAGTAAACGACTGCCCCACTAAACGGCTACCCTCTGGAGGTAATGGATAAGTTACCGCCAGGCTAGTATGGCTGGCAAAAAGCAGAGCAAATGAGCAAAGAATATTTACACGACGCATCATGTCCCTTTCCTATGTCGCGAAAGCTATCCGTTAAGTATAGCTTTTATCAGACTTTTCGTTTTTAACTGTTCAAATCAGAAGTCGTATTCCCCGGTAg < 1:1939141/289‑1 (MQ=255) ttACTTAACCCTTGCCCGTATTGTGCGGCAAAAGTCTCCAGCGGCTGGGTATTGTGATCAGGAACAGTTACAGTAAACGACTGCCCCACTAAACGGCTACCCTCTGGAGGTAATGGATAAGTTACCGCCAGGCTAGTATGGCTGGCAAAAAGCAGAGCAAATGAGCAAAGAATATTTACACGACGCATCATGTCCCTTTCCTATGTCGCGAAAGCTATCCGTTAAGTATAGCTTTTATCAGACTTTTCGTTTTTAACTGTTCAAATCAGAAGTCGTATTCCCCGGTAg > 1:920372/1‑288 (MQ=255) ttACTTAACCCTTGCCCGTATTGTGCGGCAAAAGTCTCCAGCGGCTGGGTATTGTGATCAGGAACAGTTACAGTAAACGACTGCCCCACTAAACGGCTACCCTCTGGAGGTAATGGATAAGTTACCGCCAGGCTAGTATGGCTGGCAAAAAGCAGAGCAAATGAGCAAAGAATATTTACACGACGCATCATGTCCCTTTCCTATGTCGCGAAAGCTATCCGTTAAGTATAGCTTTTATCAGACTTTTCGTTTTTAACTGTTCAAATCAGAAGTCGTATTCCCCGGTAGa > 1:644830/1‑289 (MQ=255) aaCCCTTGCCCGTATTGTGCGGCAAAAGTCTCCAGCGGCTGGGTATTGTGATCAGGAACAGTTACAGTAAACGACTGCCCCACTAAACGGCTACCCTCTGGAGGTAATGGATAAGTTACCGCCAGGCTAGTATGGCTGGCAAAAAGCAGAGCAAATGAGCAAAGAATATTTACACGACGCATCATGTCCCTTTCCTATGTCGCGAAAGCTATCCGTTAAGTATAGCTTTTATCAGACTTTTCGTTTTTAACTGTTCAAATCAGAAGTCGTATTCCCCGGTAGAACAata > 2:909559/1‑289 (MQ=255) ttGCCCGTATTGTGCGGCAAAAGTCTCCAGCGGCTGGGTATTGTGATCAGGAACAGTTACAGTAAACGACTGCCCCACTAAACGGCTACCCTCTGGAGGTAATGGATAAGTTACCGCCAGGCTAGTATGGCTGGCAAAAAGCAGAGCAAATGAGCAAAGAATATTTACACGACGCATCATGTCCCTTTCCTATGTCGCGAAAGCTATCCGTTAAGTATAGCTTTTATCAGACTTTTCGTTTTTAACTGTTCAAATCAGAAGTCGTATTCCCCGGTAGCACAATATTACt > 1:958464/1‑289 (MQ=255) tGCCCGTATTGTGCGGCAAAAGTCTCCAGCGGCTGGGTATTGTGATCAGGAACAGTTACAGTAAACGACTGCCCCACTAAACGGCTACCCTCTGGAGGTAATGGATAAGTTACCGCCAgg > 2:292051/1‑120 (MQ=255) tGCCCGTATTGTGCGGCAAAAGTCTCCAGCGGCTGGGTATTGTGATCAGGAACAGTTACAGTAAACGACTGCCCCACTAAACGGCTACCCTCTGGAGGTAATGGATAAGTTACCGCCAGGCTAGTATGGCTGGCAAAAAGCAGAGCAAATGAGCAAAGAATATTTACACGACGCATCATGTCCCTTTCCTATGTCGCGAAAGCTATCCGTTAAGTATAGCTTTTATCAGACGTTTCGTTTTTAACTGTTCAACTCAGAAGTCGTATTCCCCGGTAGCACCATATTACtt > 2:1312937/1‑288 (MQ=255) gCCCGTATTGTGCGGCAAAAGTCTCCAGCGGCTGGGTATTGTGATCAGGAACAGTTACAGTAAACGACTGCCCCACTAAACGGCTACCCTCTGGAGGTAATGGATAAGTTACCGCCAGGCTAGTATGGCTGGCAAAAAGCAGAGCAAATGAGCAAAGAATATTTACACGACGCATCATGTCCCTTTCCTATGTCGCGAAAGCTa > 2:1437715/1‑204 (MQ=255) gCCCGTATTGTGCGGCAAAAGTCTCCAGCGGCTGGGTATTGTGATCAGGAACAGTTACAGTAAACGACTGCCCCACTAAACGGCTACCCTCTGGAGGTAATGGATAAGTTACCGCCAGGCTAGTATGGCTGGCAAAAAGCAGAGCAAATGAGCAAAGAATATTTACACGACGCATCATGTCCCTTTCCTATGTCGCGAAAGCTATCCGTTAAGTATAGCTTTTATCAGACTCTTCGTTTTTAACTGTTCAAATCAGAAGACGTATTCCACGGTAGAACAATCTTAATg > 2:1453207/1‑288 (MQ=255) gCCCGTATTGTGCGGCAAAAGTCTCCAGCGGCTGGGTATTGTGATCAGGAACAGTTACAGTAAACGACTGCCCCACTAAACGGCTACCCTCTGGAGGTAATGGATAAGTTACCGCCAGGCTAGTATGGCTGGCAAAAAGCAGAGCAAATGAGCAAAGAATATTTACACGACGCATCATGTCCCTTTCCTATGTAGCGAAAGCTATCCGTTAAGTATAGCTTTTTTCAGACTTTTCGTTTTTAACTGTTCAAACCAGAATTCGTATTCCCCGGTATAACTATATTACtt > 2:1588799/1‑287 (MQ=255) tgCGGCAAAAGTCTCCAGCGGCTGGGTATTGTGATCAGGAACAGTTACAGTAAACGACTGCCCCACTAAACGGCTACCCTCTGGAGGTAATGGATAAGTTACCGCCAGGCTAGTATGGCTGGCAAAAAGCAGAGCAAATGAGCAAAGAATATTTACACGACGCATCATGTCCCTTTCCTATGTCGCGAAAGCTATCCGTTAAGTATAGCTTTTATCAGACTTTTCGTTTTTAACTGTTCAAATCAGAAGTCGTATTCCCCGGTAg < 1:1238597/265‑1 (MQ=255) tgCGGCAAAAGTCTCCAGCGGCTGGGTATTGTGATCAGGAACAGTTACAGTAAACGACTGCCCCACTAAACGGCTACCCTCTGGAGGTAATGGATAAGTTACCGCCAGGCTAGTATGGCTGGCAAAAAGCAGAGCAAATGAGCAAAGAATATTTACACGACGCATCATGTCCCTTTCCTATGTCGCGAAAGCTATCCGTTAAGTATAGCTTTTATCAGACTTTTCGTTTTTAACTGTTCAAATCAGAAGTCGTATTCCCCGGTAGAACAATATTACTGGCAGCAAGTTc > 1:1542704/1‑289 (MQ=255) tgCGGCAAAAGTCTCCAGCGGCTGGGTATTGTGATCAGGAACAGTTACAGTAAACGACTGCCCCACTAAACGGCTACCCTCTGGAGGTAATGGATAAGTTACCGCCAGGCTAGTATGGCTGGCAAAAAGCAGAGCAAATGAGCAAAGAATATTTACACGACGCATCATGTCCCTTTCCTATGTCGCGAAAGCTATCCGTTAAGTATAGCTTTTATCAGACTTTTCGTTTTTAACTGTTCAAATCAGAAGTCGTATTCCCCGGTAGAACAATATTACTGGCAGCAAGTTc > 1:1172016/1‑289 (MQ=255) tgCGGCAAAAGTCTCCAGCGGCTGGGTATTGTGATCAGGAACAGTTACAGTAAACGACTGCACCACTAAACGGCTACCCTCTGGAGGTAATGGATAAGTTACCGCCAGGCTAGAATGGCTGGCAAAAAGCAGAGCAAATGAGCAAAGAATATTTACACGACGCATCATGTCCCTTTCCTATGTCGCGAAAGCTATCCGTTAAGTATAGCTTTTATCAGACTTTTCGTTTTTAACTGTTCAAATCAGAAGTCGTATTCCCCGGTAGAACAATATTACTGGCAGCAAGTTc > 2:969717/1‑289 (MQ=255) cAAAAGTCTCCAGCGGCTGGGTATTGTGATCAGGAACAGTTACAGTAAACGACTGCCCCACTAAACGGCTACCCTCTGGAGGTAATGGATAAGTTACCGCCAGGCTAGTATGGCTGGCAAAAAGCAGAGCAAATGAGCAAAGAATATTTACACGACGCATCATGTCCCTTTCCTATGTCGCGAAAGCTATCCGTTAAGTATAGCTTTTATCAGACTTTTCGTTTTTAACTGTTCAAATCAGAAGTCGTATTCCCCGGTAGAACAATATTACTGGCAGCAAGTTCGCCCa > 2:957855/1‑289 (MQ=255) aaaaGTCTCCAGCGGCTGGGTATTGTGATCAGGAACAGTTACAGTAAACGACTGCCCCACTAAACGGCTACCCTCTGGAGGTAATGGATAAGTTACCGCCAGGCTAGTATGGCTGGCAAAAAGCAGAGCAAATGAGCAAAGAATATTTACACGACGCATCATGTCCCTTTCCTATGTCGCGAAAGCTATCCGTTAAGTATAGCTTTTATCAGACTTTTCGTTTTTAACTGTTCAAATCAGAAGTCGTATTCCCCGGTAGAACAATATTACTGGCAGCAAGTTCGCCCa < 1:1004778/288‑1 (MQ=255) aaaaGTCTCCAGCGGCTGGGTATTGTGATCAGGAACAGTTACAGTAAACGACTGCCCCACTAAACGGCTACCCTCTGGAGGTAATGGATAAGTTA‑CGCCAGGCTAGTATGGCTGGCAAAAAGCAGAGCAAATGAGCAAAGAATATTTACACGACGCATCATGTCCCTTTCCTATGTCGCGAAAGCTATCCGTTAAGTATAGCTTTTATCAGACTTTTCGTTTTTAACTGTTCAAATCAGAAGTCGTATTCCCCGGTAGAACAATATTACTGGCAGCAAGTTCGCCCAtg < 1:1927582/289‑1 (MQ=255) aaaGTCTCCAGCGGCTGGGTATCGTGAGCAGTAACAGTTACAGTAAACGACTGCCCCACTAAACGGCTACCCTCGGGAGGTAATGGATAAGTTACCGCCAGGCTAGTATGGCTAGCAAAAAGCAGAGCAAATGAGCAAAGAATATTTACACGACGCATCATGTCCCTTTCCTATGTCGCGAAAGCTATCCGTTAAGTATAGCTTTTATCAGACTTTTCGTTTTTAACTGTTCAAATCAGAAGTCGTATTCCCCGGTAGAACAATATTACTGGCAGCAAGTTCGCCCAtg < 2:1281993/289‑1 (MQ=255) aGTCACCGGCAGCTGGGTATTGTGATCAAGATCCGTTACAGTAAACGACTGCCCAACTAAACGGCTACCCTCTGGAGGTAATGGATAAGTTACCGCCAGGCTAGTATGGCTGGCAAAAACCAGAGCAAATGAGCAAAGAATATTTACACGACGCATCATGTCCCTTTCCTATGTCGCGAAAGCTATCCGTTAAGTATAGCTTTTATCAGACTTTTCGTTTTTAACTGTTCAAATCAGAAGTCGTATTCCCCGGTAGAACAATATTACTGGCAGCAAGTTCGCCCAtg < 2:792555/287‑1 (MQ=255) ctcCAGCGGCTGGGTATTGTGATCAGGAACAGTTACAGTAAACGACTGCCCCACTAAACGGCTACCCTCTGGAGGTAATGGATAAGTTACCGCCAGGCTAGTATGGCTGGCAAAAAGCAGAGCAAATGAGCAAAGAATATTTACACGACGCATCATGTCCCTTTCCTATGTCGCGAAAGCTATCCGTTAAGTATAGCTTTTATCAGACTTTTCGTTTTTAACTGTTCAAATCAGAAGTCGTATTCCCCGGTAGAACAATATTACTGGCAGCAAGTTCGCCCAtgttgtt < 2:613678/289‑1 (MQ=255) cAGCGGCTGGGTATTGTGATCAGGAACAGTTACAGTAAACGACTGCCCCACTAAACGGCTACCCTCTGGAGGTAATGGATAAGTTACCGCCAGGCTAGTATGGCTGGCAAAAAGCAGAGCAAATGAGCACAGACTATTTACACGACGCATCATGTCCCTTTCCTATGTCGCGAAAGCTATCCGTTAAGTATAGCTTTTTTCAGCCTTTTCGTTTTTAACTGTTCACATCAGAAGTCGTATTCCCCGGTAGAACAATATTACTGGCAGCACGTTAGCCCATGTTGTTGta > 2:1796424/1‑289 (MQ=255) gggtGGGTAGTGTGATCAGGAGCAGTTACAGTGAACGACTGCCCCGCTAAACGGCTACACTCTGGAGGTAAAGGATAAGTTACCGCCAAGCTAGTATGGCTGGCAAAAAGCAGAGCAAATGAGCAAAGAATATTTACACGACGCATCATGTCCCTTTCCTATGTCGCGAAAGCTATCCGTTAAGTATAGCTTTTATCAGACTTTTCGTTTTTAACTGTTCAAATCAGAAGTCGTATTCCCCGGTAGAACAATATTACTGGCAGCAAGTTCGCCCATGTTGTTGtat < 2:1904021/283‑1 (MQ=255) cTGGGTATTGTGATCAGGAACAGTTACAGTAAACGACTGCCCCACTAAACGGCTACCCTCTGGAGGTAATGGATAAGTTACCGCCAGGCTAGTATGGCTGGCAAAAAGCAGAGCAAATGAGCAAAGAATATTTACACGACGCATCATGTCCCTTTCCTATGTCGCGAAAGCTATCCGTTAAGTATAGCTTTTATCAGACTTTTCGTTTTTAACTGTTCAAATCAGAAGTCGTATTCCCCGGTAGAACAATATTACTGGCAGCAAGTTCGCCCATGTTGTTGTATATCGc > 2:1216384/1‑289 (MQ=255) tgtgATCAGGAACAGTTACAGTAAACGACTGCCCCACTAAACGGCTACCCTCTGGAGGTAATGGATAAGTTACCGCCAGGCTAGTATGGCTGGCAAAAAGCAGAGCAAATGAGCAAAGAATATTTACACGACGCATCATGTCCCTTTCCTATGTCGCGAAAGCTATCCGTTAAGTATAGCTTTTATCAGACttt < 2:412886/194‑1 (MQ=255) tgATCAGGAACAGTTACAGTAAACGACTGCCCCACTAAACGGCTACCCTCTGGAGGTAATGGATAAGTTACCGCCAGGCTAGTATGGCTGGCAAAAAGCAGAGCAAATGAGCAAAGAATATTTACACGACGCATCATGTCCCTTTCCTATGTCGCGAAAGCTATCCGTTAAGTATAGCTTTTATCAGACTTTTCGTTTTTAACTGTTCAAATCAGAAGTCGTATTCCCCGGTAGAACAATATTACTGGCAGCAAGTTCGCCCATGTTGTTGTATATCGCACAGGCAGCt > 1:1109748/1‑289 (MQ=255) gATCAGGAACAGTTACAGTAAACGACTGCCCCACTAAACGGCTACCCTCTGGAGGTAATGGATAAGTTACCGCCAGGCTAGTATGGCTGGCAAAAAGCAGAGCAAATGAGCAAAGAATATTTACACGACGCATCATGTCCCTTTCCTATGTCGCGAAAGCTATCCGTTAAGTATAGCTTTTATCAGACTTTTCGTTTTTAACTGTTCAAATCAGAAGTCGTATTCCCCGGTAGAACAATATTACTGGCAGCAAGTTCGCCCATGTTGTTGTATATCGCACAGGCAGCtt < 2:691146/289‑1 (MQ=255) gATCAGGAACAGTTACAGTAAACGACTGCCCCACTAAACGGCTACCCTCTGGAGGTAATGGATAAGTTACCGCCAGGCTAGTATGGCTGGCAAAAAGCAGAGCAAATGAGCAAAGAATATTTACACGACGCATCATGTCCCTTTCCTATGTCGCGAAAGCTATCCGTTAAGTATAGCTTTTATCAGACTTTTCGTTTTTAACTGTTCAAATCAGAAGTCGTATTCCCCGGTAGAACAATATTACTGGCAGCAAGTTCGCCCATGTTGTTGTATATCGCACAGGCAGCtt < 1:356326/289‑1 (MQ=255) tCAGGAACAGTTACAGTAAACGACTGCCCCACTAAACGGCTACCCTCTGGAGGTAATGGATAAGTTACCGCCAGGCTAGTATGGCTGGCAAAAAGCAGAGCAAATGAGCAAAGAATATTTACACGACGCATCATGTCCCTTTCCTATGTCGCGAAAGCTATCCGTTAAGTATAGCTTTTATCAGACTTTTCGTTTTTAACTGTTCAAATCAGAAGTCGTATTCCCCGGTAGAACAATATTACTGGCAGCAAGTTCGCCCAtg > 2:1209157/1‑262 (MQ=255) tCAGGAACAGTTACAGTAAACGACTGCCCCACTAAACGGCTACCCTCTGGAGGTAATGGATAAGTTACCGCCAGGCTAGTATGGCTGGCAAAAAGCAGAGCAAATGAGCAAAGAATATTTACACGACGCATCATGTCCCTTTCCTATGTCGCGAAAGCTATCCGTTAAGTATAGCTTTTATCAGACTTTTCGTTTTTAACTGTTCAAATCAGAAGTCGTATTCCCCGGTAGAACAATATTACTGGCAGCAAGTTCGCCCAtg < 1:1209157/262‑1 (MQ=255) tCAGGAACAGTTACAGTAAACGACTGCCCCACTAAACGGCTACCCTCTGGAGGTAATGGATAAGTTACCGCCAGGCTAGTATGGCTGGCAAAAAGCAGAGCAAATGAGCAAAGAATATTTACACGACGCATCATGTCCCTTTCCTATGTCGCGAAAGCTATCCGTTAAGTATAGCTTTTATCAGACTTTTCGTTTTTAACTGTTCAAATCAGAAGTCGTATTCCCCGGTAGAACAATATTACTGGCAGCAAGTTCGCCCATGTTGTTGTATATCGCACAGGCAGCTTCg > 1:425949/1‑289 (MQ=255) cAGGAACAGTTACAGTAAACGACTGCCCCACTAAACGGCTACCCTCTGGAGGTAATGGATAAGTTACCGCCAGGCTAGTATGGCTGGCAAAAAGCAGAGCAAATGAGCAAAGAATATTTACACGACGCATCATGTCCCTTTCCTATGTCGCGAAAGCTATCCGTTAAGTATAGCTTTTATCAGACTTTTCGTTTTTAACTGTTCAAATCAGAAGTCGTATTCCCCGGTAGAACAATATTACTGGCAGCAAGTTCGCCCATGTTGTTGTATATCGCACAGGCAGCTTCga > 2:514943/1‑289 (MQ=255) cAGTTACAGTACACGACTGCCCCACTAAACGGCTACCCTCTGGAGGTAATGGATAAGTTACCGCCAGGCTAGTATGGCTGGCAAAAAGCAGAGCAAATGAGCAAAGAATATTTACACGACGCATCATGTCCCTTTCCTATGTCGCGAAAGCTAACCATTAAGTACAGTTTTTATCAGACTTTTCGTTTTTAACTGTTCAAATCAGAAGTCGTATTCCCCGGTAGAACAATATTACTGGCAGCAAGTTCGCACATGTTGTTGTATATCCCACACGCAGCTCAGATGCTgg > 2:65586/1‑289 (MQ=255) ttACAGTAAACGACTGCCCCACTAAACGGCTACCCTCTGGAGGTAATGGATAAGTTACCGCCAGGCTAGTATGGCTGGCAAAAAGCAGAGCAAATGAGCAAAGAATATTTACACGACGCATCATGTCCCTTTCCTATGTCGCGAAAGCTATCCGTTAAGTATAGCTTTTATCAGACTTTTCGTTTTTAACTGTTCAAATCAGAAGTCGTATTCCCCGGTAGAACAATATTACTGGCAGCAAGTTCGCCCATGTTGTTGTATATCGca < 2:1934209/267‑1 (MQ=255) ||| TTTCTCGCCCAGCCTGGCCGATACCAATAGGAAAGACTTCCACAGTATTACTGTCTGGTGGGTAGTAATAAAGACGCATCTCAGCGACGTTAACAACAATCCCTTTACGAACAGTGTCGGGCAAAATCAGTTGCTGCGGAATGGTGAGTTG‑GCTGCCAGACTTCGGCAAAAAAACATCAGCGCCCGGGTTCGCTTCCAGCATGTTACTTAACCCTTGCCCGTATTGTGCGGCAAAAGTCTCCAGCGGCTGGGTATTGTGATCAGGAACAGTTACAGTAAAGCTCTGCCCCACTAAACGGCTACCCTCTGGAGGTAATGGATAAGTTACCGCCAGGCTAGTATGGCTGGCAAAAAGCAGAGCAAAACTGCAAAGAATATTTACACGACGCATCATGTCCCTTTCCTATGTCGCGAAAGCTATCCGTTAAGTATAGCTTTTATCAGACTTTTCGTTTTTAACTGTTCAAATCAGAAGTCGTATTCCCCGGTAGAACAATATTACTGGCAGCAAGTTCGCCCATGTTGTTGTATATCGCACAGGCAGCTTCGATGATGGGCA > CP042583/1700456‑1701014 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |