Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 1,715,041 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 1,715,041 | 0 | A | T | 98.4% | 562.2 / NA | 252 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/1); major base T (122/122); minor base G (2/2); total (127/125) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.97e-01 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,715,042 | 0 | G | C | 97.2% | 565.3 / NA | 252 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (3/4); new base C (124/119); total (127/125) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.19e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,715,043 | 0 | C | G | 99.2% | 574.5 / NA | 252 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/2); new base G (127/121); total (127/125) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.41e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.96e-01 |
Only 100 of 252 total aligned reads displayed.
GGCGACTCCGGCGAGTATTGCGGGCTGTAAAAAAGTGGTGCTGTGCAGTCCGCCGCCGA‑TTGCCGATGAGATCCTTTATGCGGCGCAGCTGTGCGGTGTGCAGGACGTGTTTAACGTCGGCGGCGCACAGGCCATTGCCGCACTGGCGTTTGGTACGGAATCTGTGCCAAAAGTGGACAAAATCTTCGGGCCGGGTAACGCCTTTGTCACCGAAGCGAAACGTCAGGTGAGCCAGCGTCTGGACGGTGCGGCGATCGATATGCCCGCAGGCCCGAGC‑GAAGTG‑CTGGTGATTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGCTTCTGATTTGCTCTCTCAGGCTGAACACGGCCCGGACAGTCAGGTGATTTTACTGACGCCCGCTGCTGATATGGCGCGTCGCGTTGCCGAGGCCGTCGAACGCCAACTGGCAGAACTGCCGCGTGCCGAAACCGCCCGCCAGGCACTGAACGCCAGCCGCCTGATCGTGACTAAAGATTTAGCGCAGTGCGTGGAGATCTCCAACCAGTACGGCCCGGAGCACCTGATCAT > CP042583/1714767‑1715321 ||| ggCGACTCCGGCGAGTATTGCGGGCTGTAAAAAAGTGGTGCTGTGCTCACCGCCGCCGA‑TTGCCGATGAGATCCTTTATGCGGCGCAGCTGTGCGGTGTGCAGGACGTGTTTAACGTCGGCGGCGCACAGGCCATTGCCGCACTGGCGTTTGGTACGGAATCTGTGCCAAAAGTGGACAAAATCTTCGGGCCGGGTAACGCCTTTGTCACCGAAGCGAAACGTCAGGTGAGCCAGCGTCTGGACGGTGCGGTGGTCGATATTCCCGCAGGCCCGTCG‑GAAGTG‑CCgggg > 2:648721/1‑287 (MQ=255) ggCGACTCCGGCGAGTATTGCGGGCTGTAAAAAAGTGGTGCTGTGCTCACCGCCGCCGA‑TTGCCGATGAGATCCTTTATGCGGCGCAGCTGTGCGGTGTGCAGGACGTGTTTAACGTCGGCGGCGCACAGGCCATTGCCGCACTGGCGTTTGGTACGGAATCTGTGCCAAAAGTGGACAAAATCTTCGGGCCGGGTAACGCCTTTGTCACCGAAGCGAAACGTCAGGTGAGCCAGCGTCTGGACGGTGCGGCGATCGATATGCCCGCAGGCCCGTCG‑GAAGTG‑CTGGTg > 1:1643783/1‑289 (MQ=255) cGACTCCGGCGAGTATTGCGGGCTGTAAAAAAGTGGTGCTGTGCTCACCGCCGCCGA‑TTGCCGATGAGATCCTTTATGCGGCGCAGCTGTGCGGTGTGCAGGACGTGTTTAACGTCGGCGGCGCACAGGCCATTGCCGCACTGGCGTTTGGTACGGAATCTGTGCCAAAAGTGGACAAAATCTTCGGGCCGGGTAACGCCTTTGTCACCGAAGCGAAACGTCAGGTGAGCCAGCGTCTGGCCGGTGCGGCGATCGATATGCCCGCAGGCCCGTGG‑GGAGGT‑CTGGTGag > 2:904057/1‑288 (MQ=255) gAGTATTGCGGGCTGTAAAAAAGTGGTGCTGTGCTCACCGCCGCCGA‑TTGCCGATGAGATCCTTTATGCGGCGCAGCTGTGCGGTGTGCAGGACGTGTTTAACGTCGGCGGCGCACAGGCCATTGCCGCACTGGCGTTTGGTACGGAATCTGTGCCAAAAGTGGACAAAATCTTCGGGCCGGGTAACGCCTTTGTCACCGAAGCGAAACGTCAGGTGAGCCAGCGTCTGGACGGTGCGGCGATCGATATGCCCGCAGGCCCGTCG‑GAAGTG‑CTGGTGATTGCTGACAg < 1:53767/288‑1 (MQ=255) tAAAAAAGTGGTGCTGTGCTCACCGCCGCCGA‑TTGCCGATGAGATCCTTTATGCGGCGCAGCTGTGCGGTGTGCAGGACGTGTTTAACGTCGGCGGCGCACAGGCCATTGCCGCACTGGCGTTTGGTACGGAATCTGTGCCAAAAGTGGACAAAATCTTCGGGCCGGGTAACGCCTTTGTCACCGAAGCGAAACGTCAGGTGAGCCAGCGTCTGGACGGTGCGGCGATCGATATGCCCGCAGGCCCGTCG‑GAAGTG‑CTGGTGATTGCTGGCAGCGGCGCTAAGCCGGag > 1:163515/1‑288 (MQ=255) tAAAAAAGTGGTGCTGTGCTCACCGCCGCCGA‑TTGCCGATGAGATCCTTTATGCGGCGCAGCTGTGCGGTGTGCAGGACGTGTTTAACGTCGGCGGCGCACAGGCCATTGCCGCACTGGCGTTTGGTACGGAATCTGTGCCAAAAGTGGACAAAATCTTCGGGCCGGGTAACGCCTTTGTCACCGAAGCGAAACGTCAGGTGAGCCAGCGTCTGGACGGTGCGGCGATCGATATGCCCGCAGGCCCGTCG‑GAAGTG‑CTGGTGATTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGag > 1:1493201/1‑288 (MQ=255) ggtgCTGTGCTCACCGCCGCCGA‑TTGCCGATGAGATCCTTTATGCGGCGCAGCTGTGCGGTGTGCAGGACGTGTTTAACGTCGGCGGCGCACAGGCCATTGCCGCACTGGCGTTTGGTACGGAATCTGTGCCAAAAGTGGACAAAATCTTCGGGCCGGGTAACGCCTTTGTCACCGAAGCGAAACGTCAGGTGAGCCAGCGTCTGGACGGTGCGGCGATCGATATGCCCGCAGGCCCGTCG‑GAAGTG‑CTGGTGATTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGCt < 1:1169903/289‑1 (MQ=255) gtgctgtgctCACCGCCGCCGA‑TTGCCGATGAGATCCTTTATGCGGCGCAGCTGTGCGGTGTGCAGGACGTGTTTAACGTCGGCGGCGCACAGGCCATTGCCGCACTGGCGTTTGGTACGGAATCTGTGCCAAAAGTGGACAAAATCTTCGGGCCGGGTAACGCCTTTGTCACCGAAGCGAAACGTCAGGTGAGCCAGCGTCTGGACGGTGCGGCGATCGATATGCCCGCAGGCCCGTCG‑GAAGTG‑CTGGTGATTGCTGACTGCGGCGCTACGCCGGATTTCGGGGCtt > 1:790734/1‑289 (MQ=255) gtgctgtgctCACCGCCGCCGA‑TTGCCGATGAGATCCTTTATGCGGCGCAGCTGTGCGGTGTGCAGGACGTGTTTAACGTCGGCGGCGCACAGGCCATTGCCGCACTGGCGTTTGGTACGGAATCTGTGCCAAAAGTGGACAAAATCTTCGGGCCGGGTAACGCCTTTGTCACCGAAGCGAAACGTCAGGTGAGCCAGCGTCTGGACGGTGCGGCGATCGATATGCCCGCAGGCCCGTCG‑GAAGTG‑CTGGTGATTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGCt > 2:267713/1‑288 (MQ=255) gtgctgtgctCACCGCCGCCGA‑TTGCCGATGAGATCCTTTATGCGGCGCAGCTGTGCGGTGTGCAGGACGTGTTTAACGTCGGCGGCGCACAGGCCATTGCCGCACTGGCGTTTGGTACGGAATCTGTGCCAAAAGTGGACAAAATCTTCGGGCCGGGTAACGCCTTTGTCACCGAAGCGAAACGTCAGGTGAGCCAGCGTCTGGACGGTGCGGCGATCGATATGCCCGCAGGCCCGTCG‑GAAGTG‑CTGGTGATTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGCt > 1:1353846/1‑288 (MQ=255) tgCTGTGCTCCCCGCCGCCGT‑TTGCGGTTGAGTTCCTTGATGCGGCGCGGCTGTGCGGTGTGCGGGACGTGTTTAACGTCGGAGGCGCACAGGCCATTGCCGCACGGGCGTTTGGTACGGAATCTGTGCCAAAAGTGGACAAAATCTTCGGGCCGGGTAACGCCTTTGTCACCGAAGCGAAACGTCAGGTGAGCCAGCGTCTGGACGGTGCGGCGATCGATATGCCCGCAGGCCCGTCG‑GAAGTG‑CTGGTGATTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGCtt < 2:736037/288‑1 (MQ=255) ctcacgcgcgcggA‑TTGCCGGTGAGATCCTTTGTGCGGCGCAGCTGTGCGGGGTGCAGGACGTTTTTAGCGTCGGGGGCGAGCAGGCCATTGGCGGACTGGCGTTTGGTACGGAATCTGTGCCAAAAGTGGACAAAGTCGTCGGGCCGGGTAACGCCTTTGTCACCGAAGCGAAACGTCAGGTGAGCCAGCGTCTGGACGGTGCGGCGATCGATATGCCCGCAGGCCCGTCG‑GAAGTG‑CTGGTGATTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGCTTCTGATTTg < 2:4656/281‑1 (MQ=255) ctcaccgccgccgA‑TTGCCGATGAGATCCTTTATGCGGCGCAGCTGTGCGGTGTGCAGGACGTGTTTAACGTCGGCGGCGCACAGGCCATTGCCGCACTGGCGTTTGGTACGGAATCTGTGCCAAAAGTGGACAAAATCTTCGGGCCGGGTAACGCCTTTGTCACCGAAGCGAAACGTCAGGTGAGCCAGCGTCTGGACGGTGCGGCGATCGATATGCCCGCAGGCCCGTCG‑GAAGTG‑CTGGTGATTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGCTTCTGATTTg < 2:745784/285‑1 (MQ=255) cctCCGCCGGCGGTTTGCCGAGGGGATCCTTTGTGCGGCGCAGCTGTGCGGTGGGCAGGACGTGTTTAACGTCGGCGGCGCACAGGCCATTGCCGCACTGGCGTTTGGTACGGAATCTGTGCCAAAAGTGGACAAAATCTTCGGGCCGGGTAACGCCTTTGTCACCGAAGCGAAACGTCAGGTGAGCCAGCGTCTGGACGGTGCGGCAATCGATATGCCCGCAGGCCCGTCG‑GAAGTG‑CTGGTGATTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGCTTCTGATTTg < 2:196336/287‑1 (MQ=255) accgccgccgA‑TTGCCGATGAGATCCTTTATGCGGCGCAGCTGTGCGGTGTGCAGGACGTGTTTAACGTCGGCGGCGCACAGGCCATTGCGGCACTGGCGTTTGGTACGGAATCTGTGCCAAAAGTGGACAAAATCTTCGGGCCGGGTAACGCCTTTGTCACCGAAGCGAAACGTCAGGTGCGCCAGCGTCTGGACGGTGCGGCCATCGCTATGCCCGCAGGGCCGTCG‑GGAGTG‑CTGGGGTTTGCGTACAGCGGCGCTCCGCCGGATTTTGCGGCTTCTTAGTTgtc > 2:1522980/2‑286 (MQ=255) cgccgccgA‑TTGCCGATGAGATCCTTTATGCGGCGCAGCTGTGCGGTGTGCAGGACGTGTTTAACGTCGGCGGCGCACAGGCCATTGCCGCACTGGCGTTTGGTACGGAATCTGTGCCAAAAGTGGACAAAATCTTCGGGCCGGGTAACGCCTTTGTCACCGAAGCGAAACGTCAGGTGAGCCAGCGTCTGGACGGTGCGGCGATCGATATGCCCGCAGGCCCGTCG‑GAAGTG‑CTGGTGATTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGCTTCTGATTTGctc > 1:1950173/1‑287 (MQ=255) 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a‑TTGCCGATGAGATCCTTTATGCGGCGCAGCTGTGCGGTGTGCAGGACGTGTTTAACGTCGGCGGCGCACAGGCCATTGCCGCACTGGCGTTTGGTACGGAATCTGTGCCAAAAGTGGACAAAATCTTCGGGCCGGGTAACGCCTTTGTCACCGAAGCGAAACGTCAGGTGAGCCAGCGGCTGGACGGTGCGGCGATCGATATGCCCGCAGGCCCGTCG‑GAAGTG‑CCGGGGATTGCTGACAGCCGCGCTACGCCGGCTTTCGTGCCTTCTGATTTGctctgccccgct > 2:1378921/1‑280 (MQ=255) cGATGAGATCCTTTATGCGGCGCAGCTGTGCGGTGTGCAGGACGTGTTTAACGTCGGCGGCGCACAGGCCATTGCCGCACTGGCGTTTGGTACGGAATCTGTGCCAAAAGTGGACAAAATCTTCGGGCCGGGTAACGCCTTTGTCACCGAAGCGAAACGTCAGGTGAGCCAGCGTCTGGACGGTGCGGCGATCGATATGCCCGCAGGCCCGTCG‑GAAGTG‑CTGGTGATTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGCTTCTGATTTGCTCTCTCAGGCTGAaca < 1:179477/288‑1 (MQ=255) ccTTTATGCGGCGCAGCTGTGCGGTGTGCAGGACGTGTTTAACGTCGGCGGCGCACAGGCCATTGCCGCACTGGCGTTTGGTACGGAATCTGTGCCAAAAGTGGACAAAATCTTCGGGCCGGGTAACGCCTTTGTCACCGAAGCGAAACGTCAGGTGAGCCAGCGTCTGGACGGTGCGGCGATCGATATGCCCGCAGGCCCGTCG‑GAAGTG‑CTGGTGATTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGCTTCTGATTTGCTCTCTCAGGCTGAACACGGCCCgg > 1:398333/1‑287 (MQ=255) ccTTTATGCGGCGCAGCTGTGCGGTGTGCAGGACGTGTTTAACGTCGGCGGCGCACAGGCCATTGCCGCACTGGCGTTTGGTACGGAATCTGTGCCAAAAGTGGACAAAATCTTCGGGCCGGGTAACGCCTTTGTCACCGAAGCGAAACGTCAGGTGAGCCAGCGTCTGGACGGTGCGGCGATCGATATGCCCGCAGGCCCGTCG‑GAAGTG‑CTGGTGATTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGCTTCTGATTTGCTCTCTCAGGCTGAACACGGCCCgg > 1:1385589/1‑287 (MQ=255) cTTTATGCGGCGCAGCTGTGCGGTGTGCAGGACGTGTTTAACGTCGGCGGCGCACAGGCCATTGCCGCACTGGCGTTTGGTACGGAATCTGTACCAAAAGTGGACAAAATCTTCGGGCCGGGTAACGCCTTTGTCACCGAAGCGAAACGTCAGGTGAGCCAGCGTCTGGACGGTGCGGCGATCGATATGCCCGCAGGCCCGTCG‑GAAGTG‑CTGGTGATTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGAGTTCGTGGCTTCTGATTTGCTCTCTCAGGCTTAACACGGCCCgcgc > 2:966738/1‑285 (MQ=255) tATGCGGCGCAGCTGTGCGGTGTGCAGGACGTGTTTAACGTCGGCGGCGCACAGGCCATTGCCGCACTGGCGTTTGGTACGGAATCTGTGCCAAAAGTGGACAAAATCTTCGGGCCGGGTAACGCCTTTGTCACCGAAGCGAAACGTCAGGTGAGCCAGCGTCTGGACGGTGCGGCGATCGATATGCCCGCAGGCCCTTCG‑GAAGTG‑CTGGTGCTTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGCTCATGATTTGCTGTCTCAGGCCGAACACGGCCCTGActcac > 1:174841/1‑285 (MQ=255) 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tgtgCAGGACGTGTTTAACGTCGGCGGCGCACAGGCCATTGCCGCACTGGCGTTTGGTACGGAATCTGTGCCAAAAGTGGACAAAATCTTCGGGCCGGGTAACGCCTTTGTCACCGAAGCGAAACGTCAGGTGAGCCAGCGTCTGGACGGTGCGGCGATCGATATGCCCGCAGGCCCGTCG‑GAAGTG‑CTGGTGATTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGCTTCTGATTTGCTCTCTCAGGCTGAACACGGCCCGGACTCACAGGTGATTTTACTGACGcc > 1:1568662/1‑288 (MQ=255) tgCAGGACGTGTTTAACGTCGGCGGCGCACAGGCCATTGCCGCACTGGCGTTTGGTACGGAATCTGTGCCAAAAGTGGACAAAATCTTCGGGCCGGGTAACGCCTTTGTCACCGAAGCGAAACGTCAGGTGAGCCAGCGTCTGGACGGTGCGGCGATCGATATGCCCGCAGGCCCGTCG‑GAAGTG‑CTGGTGATTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGCTTCTGATTTGCTCTCTCAGGCTGAACACGGCCCGGACTCACAGGTGATTTTACTGACGCCCg > 1:694301/1‑288 (MQ=255) gACGTGTTTAACGTCGGCGGCGCACAGGCCATTGCCGCACTGGCGTTTGGTACGGAATCTGTGCCAAAAGTGGACAAAATCTTCGGGCCGGGTAACGCCTTTGTCACCGAAGCGAAACGTCAGGTGAGCCAGCGTCTGGACGGTGCGGCGATCGATATGCCCGCAGGCCCGTCG‑GAAGTG‑CTGGTGATTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGCTTCTGATTTGCTCTCTCAGGCTGAACACGGCCCGGACTCACAGGTGATTTTACTGACGCCCGctgctg > 1:1065023/1‑289 (MQ=255) 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tatGCCCGCAGGCCCGTCG‑GAAGGG‑CTGGTGATTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGCTTCTGATTTGCTCTCTCAGGCTGAACACGGCCCGGACTCACAGGTGATTTTACTGACGCCCGCTGCTGATATGGCGCGTCGCGTTGCCGAGGCCGTCGAACGCCAACTGGCAGAACTGCCGCGTGCCGAAACCGCCCGCCAGGCACTGAACGCCAGCCGCCTGATCGTGACTAAAGATTTAGCGCAGTGCGTGGAGATCTCCAACCAGTACGGCCCGGAGCa < 2:1771539/288‑1 (MQ=255) tatGCCCGCAGG‑CCGGGC‑GGAGGGTCTGGTGATTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGCTTCTGATTTGCTCTCTCAGGCTGAACACGGCCCGGACTCACAGGTGATTTTACTGACGCCCGCTGCTGATATGGCGCGTCGCGTTGCCGAGGCCGTCGAACGCCAACTGGCAGAACTGCCGCGTGCCGAAACCGCCCGCCAGGCACTGAACGCCAGCCGCCTGATCGTGACTAAAGATTTAGCGCAGTGCGTGGAGATCTCCAACCAGTACGGCCCGGAGCa < 2:1457737/288‑1 (MQ=255) atGCCCGCAGGCCCGTCG‑GAAGTG‑CTGGTGATTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGCTTCTGATTTGCTCTCTCAGGCTGAACACGGCCCGGACTCACAGGTGATTTTACTGACGCCCGCTGCTGATATGGCGCGTCGCGTTGCCGAGGCCGTCGAACGCCAACTGGCAGAACTGCCGCGTGCCGAAACCGCCCGCCAGGCACTGAACGCCAGCCGCCTGATCGTGACTAAAGATTTAGCGCAGTGCGTGGAGATCTCCAACCAGTACGGCCCGGAGCAcc < 2:626102/289‑1 (MQ=255) cccTCAGGCCCGTCG‑GAAGTG‑CTGGTGATTGCTGACAGCTGCGCTACGCCGGATTTCGTGGCTTCTGATTTGCTCTCTCAGGCTGAACACGGCCCGGACTCACAGGTGATTTTACTGACGCCCGCTGCTGATATGGCGCGTCTCGTTGCCGAGGCCGTCGAACGCCAACTGGCAGAACTGCCGCGTGCCGAAACCGCCCGCCAGGCACTGAACGCCAGCCGCCTGATCGTGACTAAAGATTTAGCGCAGTGCGTGGAGATCTCCAACCAGTACGGCCCGGAGCACCTGa < 1:625576/289‑1 (MQ=255) cGCAGGCCCGTCG‑GAAGTG‑CTGGTGATTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGCTCCTGATTTGCTCTCTCAGGCTGAACACGGCCCGGACTCACAGGTGATTTTACTGACGCCCGCTGCTGATATGGCGCGTCGCGTTGACGAGGCCGTCGAACGCCAACTGGCAGAACTGCCTCGTGCCGAAACCGCCCGCCAGGCACTGACCGCCAGCCGGCTGATCGTGACGAAAGAGTTAGCGCAGTGCGTGGAGATCTCCAACCAGTAAGGCCCGGGGGACCTGAta > 1:628736/1‑288 (MQ=255) cAGGCCCGTCG‑GAAGTG‑CTGGTGATTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGCTTCTGATTTGCTCTCTCAGGCTGAACACGGCCCGGACTCACAGGTGATTTTACTGACGCCCGCTGCTGATATGGCGCGTCGCGTTGCCGAGGCCGTCGAACGCCAACTGGCAGAACTGCCGCGTGCCGAAACCGCCCGCCAGGCACTGAACGCCAGCCGCCTGATCGTGACTAAAGATTTAGCGCAGTGCGTGGAGATCTCCAACCAGTACGGCCCGGAGCACCTGATCAt > 1:45394/1‑289 (MQ=255) ||| GGCGACTCCGGCGAGTATTGCGGGCTGTAAAAAAGTGGTGCTGTGCAGTCCGCCGCCGA‑TTGCCGATGAGATCCTTTATGCGGCGCAGCTGTGCGGTGTGCAGGACGTGTTTAACGTCGGCGGCGCACAGGCCATTGCCGCACTGGCGTTTGGTACGGAATCTGTGCCAAAAGTGGACAAAATCTTCGGGCCGGGTAACGCCTTTGTCACCGAAGCGAAACGTCAGGTGAGCCAGCGTCTGGACGGTGCGGCGATCGATATGCCCGCAGGCCCGAGC‑GAAGTG‑CTGGTGATTGCTGACAGCGGCGCTACGCCGGATTTCGTGGCTTCTGATTTGCTCTCTCAGGCTGAACACGGCCCGGACAGTCAGGTGATTTTACTGACGCCCGCTGCTGATATGGCGCGTCGCGTTGCCGAGGCCGTCGAACGCCAACTGGCAGAACTGCCGCGTGCCGAAACCGCCCGCCAGGCACTGAACGCCAGCCGCCTGATCGTGACTAAAGATTTAGCGCAGTGCGTGGAGATCTCCAACCAGTACGGCCCGGAGCACCTGATCAT > CP042583/1714767‑1715321 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |