| Predicted mutation | ||||||
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| RA | CP042583 | 510,511 | 3 bp→TGA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP042583 | 510,512 | 0 | C | G | 100.0% | 419.1 / NA | 177 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (115/62); total (115/62) | |||||||||||
| * | CP042583 | 510,513 | 0 | T | A | 99.4% | 419.6 / NA | 177 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base A (115/61); minor base G (0/1); total (115/62) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.50e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
Only 100 of 177 total aligned reads displayed.
GATGAAAGTTATAGTAGCTGTCTGTAGTTATATATCAAAAACTCTCATTTAGACGGTCAATAAATCGGGAGAACACCAAATTATTTAAAGAAGATTTATTATAGGAAATGTAAAGCTTTATACTAGGTAACGGATGTTCTAGTTTTATCTCTTTTAAGTTAAGAAAGTCACGGTAGGAATTATAAAGTTCATAGGGGACTATTCCCAGTAAATCTGTAACTGCAATGCTATTAATGATTGTCAGCAAAGAGGAACCACGAAAACTGATTTTGCGATTCATAAATCTCTCGTCTATTTCCATTTGAATATCATCAACCCCTGCACTTTTAGATATTAATTGGGTGAACTCTTCTGCCATAATTTGTTCATAAGTGCTATTGTCAGTAATTCGTGGATGCCTATTACTACAAATTAGAGTATTGCGAATCGTATGCAATGGCATGCAAATGACGGAACGGCTGATCACTGGCATTTGGGTGATCACCAGATCGGCTTTGCGGTGAACCAACAGTTCTTCAGCATTCTCTGCACTCATGAGGAT > CP042583/510249‑510789 ||| gATGAAAGTTATAGTAGCTGTCTGTAGTTATATATCAAAAACTCTCATTTAGACGGTCAATAAATCGGGAGAACACCAAATTATTTAAAGAAGATTTATTATAGGAAATGTAAAGCTTTATTGAAGGTAACGGATGTTCTAGTTTTATCTCTTTTAAGTTAAGAAAGTCACGGTAGGAATTATAAAGTTCATAGGGGACTATTCCCAGTAAATCTGTAACTGCAATGCTATTAATGATTGTCAGCAAAGAGGAACCACGAAATGAGATTTTGCGATTCATAAAtctctc > 1:1376153/1‑289 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |