| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | CP042583 | 511,006 | 3 bp→TGA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP042583 | 511,007 | 0 | C | G | 100.0% | 400.8 / NA | 169 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (61/108); total (61/108) | |||||||||||
| * | CP042583 | 511,008 | 0 | T | A | 99.4% | 394.9 / NA | 169 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base A (61/107); minor base G (0/1); total (61/108) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 | |||||||||||
Only 100 of 169 total aligned reads displayed.
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| Alignment Legend |
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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |