Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 1,738,163 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 1,738,163 | 0 | A | T | 99.4% | 412.5 / NA | 174 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (121/52); minor base G (1/0); total (122/52) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,738,164 | 0 | G | C | 100.0% | 408.4 / NA | 174 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base C (122/52); total (122/52) | |||||||||||
* | CP042583 | 1,738,165 | 0 | C | G | 100.0% | 410.6 / NA | 174 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (122/52); total (122/52) |
Only 100 of 174 total aligned reads displayed.
GTTTTCATAATATTTCGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTAGCGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGAGCATTTCTGGCTTACGGATGTCACTTATTCTAACGGCATGTTTATTGGCGTAATCAGCAATGACCCTGGTATTGTTACAAACGTAGAATATGGCCAGGAGTGGAAAATCAAGAAAGAAGA > CP042583/1737893‑1738440 ||| gTTTTCATAATATTTCGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTa < 2:855159/282‑1 (MQ=255) gTTTTCATAATATTTCGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTa > 1:855159/1‑282 (MQ=255) gTTTTCATAATATTTCGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACgg > 1:224891/1‑289 (MQ=255) tatTTCGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACgg > 2:1114515/1‑279 (MQ=255) ttgTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACTATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGCTTTTGCTAACGTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCg < 2:575503/286‑1 (MQ=255) tttCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGAt > 1:1202392/1‑289 (MQ=255) aTGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAAc > 1:1935454/1‑289 (MQ=255) aCCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAAcc > 1:1106001/1‑289 (MQ=255) aCCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAAcc > 2:881594/1‑289 (MQ=255) aCCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAAcc > 1:284390/1‑289 (MQ=255) tAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAGAGATATTACATATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGAGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCCCGGATAGAATCCGATaa > 2:86130/1‑289 (MQ=255) atatGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGtt > 2:1493008/1‑289 (MQ=255) tatGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGATTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATGACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTGAGTGATGGGAGGTTATGTTAAACAAGCGAGGTCTGACGCGATTAAAATTGGAGGGAAAGAAACCGAAAAATTAATCGTgggca > 2:414247/1‑286 (MQ=255) tatGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTa > 2:965117/1‑289 (MQ=255) tatGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTa > 1:1861352/1‑289 (MQ=255) tGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATg > 1:1764073/1‑289 (MQ=255) ggAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACgg > 2:1600745/1‑209 (MQ=255) ggAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACgg < 1:1600745/209‑1 (MQ=255) aaaCCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATaaa > 1:1026642/1‑289 (MQ=255) aCTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGAt > 2:1224132/1‑289 (MQ=255) cTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGTGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGAt > 2:448543/1‑288 (MQ=255) cTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAACGAt > 2:183688/1‑288 (MQ=255) cTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGAAAAATTCATCGGGGTTATGAATAAAAAAGaag > 2:1702998/1‑287 (MQ=255) aaTAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGAt > 1:1363896/1‑288 (MQ=255) aaTAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATa > 2:475955/1‑289 (MQ=255) tAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACt > 1:1563922/1‑289 (MQ=255) aaaTGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAAAGGCCGATACtttt > 1:1235090/1‑288 (MQ=255) aTGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGc > 1:562441/1‑289 (MQ=255) aTGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGc < 2:1935454/289‑1 (MQ=255) aTAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAg > 1:1851561/1‑288 (MQ=255) tAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGt < 1:1208461/288‑1 (MQ=255) aaTTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGcc < 1:496746/289‑1 (MQ=255) tCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATaa < 2:943338/289‑1 (MQ=255) aTACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGa > 2:1385264/1‑288 (MQ=255) aTACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTACGATAAACAAGCGATGGCTGACTCGAGTAAACATGCGCGGAAATAAACCGATAAATTCATTGAGGTTATGAATAAAAAATATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGACCCGaataccag > 2:256058/1‑281 (MQ=255) taaaattccattTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTTCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGAt < 2:565852/285‑1 (MQ=255) tACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGAt < 1:1224132/288‑1 (MQ=255) attcaattTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACgg > 2:1370285/1‑289 (MQ=255) attcaattTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACgg > 1:1922331/1‑289 (MQ=255) ttcaattTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAACAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGTTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTACACATGCGCGGAAAGAAACGGATAAATTCATCGAGGTTAGGAATAAAAAAGAGGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCTATAACCGATccctga > 2:611027/1‑284 (MQ=255) aattTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGcc < 1:686202/247‑1 (MQ=255) aattTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGcc > 2:686202/1‑247 (MQ=255) aattTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGAt > 2:529194/1‑280 (MQ=255) aattTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGAAGTCAAAGCCCCGATAACCGACCAGGgaaga > 2:976918/1‑289 (MQ=255) tttCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGgaagaa > 1:132742/1‑288 (MQ=255) cGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGa > 1:385334/1‑289 (MQ=255) ggCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGAg < 2:476046/289‑1 (MQ=255) gCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGAGc > 1:142725/1‑289 (MQ=255) gCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATACATCGAGGTTAGGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCACCGATAACCGATCACGGAAGAACCAAGc > 2:365767/1‑289 (MQ=255) gATAAGGATTAACTTCCACATGTTTTTGATAACTTGGACTCCAAAGGGATTCTGGAGAAAAAGTGAAAAAGATATTACGTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTGTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGATGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATTCGCGGAAAGAAGCCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGAGCAttt < 2:1876371/289‑1 (MQ=255) aTAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGAGCAtt > 2:105561/1‑287 (MQ=255) aTTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATACATAGAGGTGATGAAT‑AAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCACGATAGCCGATCACGGAAGAAACGAGCATTTCTGTCtt > 2:1375432/1‑288 (MQ=255) aCTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGAGCATTTCTGGCTTACgg > 1:892766/1‑289 (MQ=255) aCTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGAGCATTTCTGGCTTACgg > 2:1659351/1‑289 (MQ=255) aCTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGACCATTTCCGGCCTACgg > 2:557222/1‑289 (MQ=255) cTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAAcc < 1:1810974/269‑1 (MQ=255) cTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCGTTAGTGAATTTGCGGATACGGTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTGAACATGCGCGGAAAGAAAACGATACATTCATCGAGGTTATGAATAATAAAGATGCCGATACGTTCGCAGTACAAGCCCCTATAACCGATCAGGGAAAAACGTAACAATTCTGGCtatacgt > 2:898220/1‑283 (MQ=255) acaGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGTGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGAGCATTTCTGGCTTACGGAGGTc > 2:328252/1‑288 (MQ=255) aGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGAGCATTTCTGGCTTACGGATGTCACt < 2:1563922/289‑1 (MQ=255) tttGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGAGCATTTCTGGCTTACGGATGTCACTTAt > 2:1743398/1‑287 (MQ=255) aCTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGAGCATTTCTGGCTTACGGATGTCACTTATTCTAACGGc < 1:1461412/289‑1 (MQ=255) tttGACGACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACTGGAGGTTATTATAAACAAGCGAGGTCTTACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCTATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATTACGGAAGAACCGAGCATTTCTGGCTTACGGATGTCACTTATTCTAACGGCAt < 1:86130/289‑1 (MQ=255) tGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGAGCATTTCTGGCTTACGGATGTCACTTATTCTAACGGCATGt > 1:418095/1‑289 (MQ=255) aaGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGAGCATTTCTGGCTTACGGATGTCACTTATTCTAACGGCATGTTTATTGGc < 2:1202392/289‑1 (MQ=255) aaGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGAGCATTTCTGGCTTACGGATGTCACTTATTCTAACGGCATGTTTATTGGc > 2:813784/1‑289 (MQ=255) ttCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGAGCATTTCTGGCTTACGGATGTCACTTATTCTAACGGCATGTTTATTGGCGTAATc > 1:1698523/1‑289 (MQ=255) gagaAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGAGCATTTCTGGCTTACGGATGTCACTTATTCTAACGGCATGTTTATTGGCGTAATCAGCaa > 1:1908204/1‑289 (MQ=255) gaAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGTGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGAGCATTTCTGGCTTACGGATGTCACTTATTCTAACGGCATGTTTATTGGCGTAATCAGCAAt < 1:328252/288‑1 (MQ=255) gaAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGAGCATTTCTGGCTTACGGATGTCACTTATTCTAACGGCATGTTTATTGGCGTAATCAGCAAt < 1:475955/288‑1 (MQ=255) gaAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGAGCATTTCTGGCTTACGGATGTCACTTATTCTAACGGCATGTTTATTGGCGTAATCAGCAAt < 2:1908204/288‑1 (MQ=255) gaAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGAGCATTTCTGGCTTACGGATGTCACTTATTCTAACGGCATGTTTATTGGCGTAATCAGCAAt < 2:670677/288‑1 (MQ=255) aaaaaaTGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGAGCATTTCTGGCTTACGGATGTCACTTATTCTAACGGCATGTTTATTGGCGTAATCAGCAATg > 1:1117860/1‑288 (MQ=255) aaaaaaTGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGAGCATTTCTGGCTTACGGATGTCACTTATTCTAACGGCATGTTTATTGGCGTAATCAGCAATGa < 2:384618/289‑1 (MQ=255) aaaTGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGAGCATTTCTGGCTTACGGATGTCACTTATTCTAACGGCATGTTTATTGGCGTAATCAGCAATGAccc < 2:1861352/289‑1 (MQ=255) atTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGAGCATTTCTGGCTTACGGATGTCACTTATTCTAACGGCATGTTTATTGGCGTAATCAGCAATGACCCTGGTATTGTTACa < 1:973457/289‑1 (MQ=255) tACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGAACACGGAAGAACCGAGCATTTCTTGCTTACGGATGTCACTTATTCTAACGGCATGTTTATTGGCGTAATCAGCAATGACCCCGGTATTGTTACaaa > 2:910380/1‑289 (MQ=255) aTGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCTCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGATCATTTCTGGCCTACGGCTGTCACTTATTCTAACGGCATGTTTATTGGCGTAATCCGCAATGACCCTTGTATTGTTACAAACGTAg > 2:697858/1‑289 (MQ=255) aTGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGAGCATTTCTGGCTTACGGATGTCACTTATTCTAACGGCATGTTTATTGGCGTAATCAGCAATGACCCTGGTATTGTTACAAACGTAg > 1:668968/1‑289 (MQ=255) aTGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGAGCATTTCTGGCTTACGGATGTCACTTATTCTAACGGCATGCTTATTGGCGTAATCAGCAATGACCCTGGTATTGTTAAAAACGTAg > 2:1344877/1‑289 (MQ=255) tGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTTTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGAGCATTTCTGGCTTACGGATGTCACTTATTCTAACGGCATGTTAATTGGCGTAATCAGCAATGACCCTTGAATTGTTACAAACGTaaa > 2:1700666/1‑287 (MQ=255) gTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGAGCATTTCTGGCTTACGGATGTCACTTATTCTAACGGCATGTTTATTGGCGTAATCAGCAATGACCCTGGTATTGTTACAAACGTAGaa > 1:79100/1‑289 (MQ=255) ttGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGAGCATTTCTGGCTTACGGATGTCACTTATTCTAACGGCATGTTTATTGGCGTAATCAGCAATGACCCTGGTATTGTTACAAACGTAGAat < 1:1385264/289‑1 (MQ=255) gAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGAGCATTTCTGGCTTACGGATGTCACTTATTCTAACGGCAt > 2:693292/1‑237 (MQ=255) gAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGAGCATTTCTGGCTTACGGATGTCACTTATTCTAACGGCAt < 1:693292/237‑1 (MQ=255) aGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGAGCATTTCTGGCTTACGGATGTCACTTATTCTAACGGCATGTTTATTGGCGTAATCAGCAATGAc < 1:671951/261‑1 (MQ=255) aGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGAGCATTTCTGGCTTACGGATGTCACTTATTCTAACGGCATGTTTATTGGCGTAATCAGCAATGACCCTGGTATTGTTACAAACGTAGAATATg > 1:1701289/1‑289 (MQ=255) gTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGAGCATTTCTGGCTTACGGATGTCACTTATTCTAACGGCATGTTTATTGGCGTAATCAGCAATGACCCTGGTATTGTTACAAACGTAGAATATg > 1:533982/1‑288 (MQ=255) gTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGAGCATTTCTGGCTTACGGATGTCACTTATTCTAACGGCATGTTTATTGGCGTAATCAGCAATGACCCTGGTATTGTTACAAACGTAGAATATg > 2:1214624/1‑288 (MQ=255) tCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGAGCATTTCTGGCTTACGGATGTCACTTATTCTAACGGCATGTTTATTGGCGTAATCAGCAATGACCCTGGTATTGTTACAAACGTAGAATATgg > 1:250183/1‑288 (MQ=255) tCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGAGCATTTCTGGCTTACGGATGTCACTTATTCTAACGGCATGTTTATTGGCGTAATCAGCAATGACCCTGGTATTGTTACAAACGTAGAATATgg > 1:1838520/1‑288 (MQ=255) tCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGAGCATTTCTGGCTTACGGATGTCACTTATTCTAACGGCATGTTTATTGGCGTAATCAGCAATGACCCTGGTATTGTTACAAACGTAGAATATgg > 2:1452018/1‑288 (MQ=255) cTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGAGCATTTCTGGCTTACGGATGTCACTTATTCTAACGGCATGTTTATTGGCGTAATCAGCAATGACCCTGGTATTGt > 1:1371892/1‑266 (MQ=255) tactacCGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCa > 1:363585/1‑171 (MQ=255) ccGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGAGCATTTCTGGCTTACGGATGTCACTTATTCTAACGGCATGTTTATTGGCGTAATCAGCAATGACCCTGGTATTGTTACAAACGTAGAATATGGCCAGGAGTGGAAAATCaa > 2:228836/1‑289 (MQ=255) ccGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGAGCATTTCTGGCTTACGGATGTCACTTATTCTAACGGCATGTTTATTGGCGTAATCAGCAATGACCCTGGTATTGTTACAAACGTAGAATATGGCCAGGAGTGGAAAATCaa > 1:9181/1‑289 (MQ=255) ccGCGGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGAGCATTTCTGGCTTACGGATGTCACTTATTCTAACGGCATGTTTATTGGCGTAATCAGCAATGACCCTGGTATTGTTACAAACGTAGAATATGGCCAGGAGTGGAAAATCaa > 1:909536/1‑289 (MQ=255) cgGGCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGAGCATTTCTGGCTTACGGATGTCACTTATTCTAACGGCATGTTTATTGGCGTAATCAGCaa < 1:839180/235‑1 (MQ=255) ggCTTTAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGAGCATTTCTGGCTTACGGATGTCACTTATTCTAACGGCATGTTTATTGGCGTAATCAGCAATGACCCTGGTATTGTTACAAACGTAGAATATGGCCAGGAGTGGAAAATCaagaaa < 1:881594/288‑1 (MQ=255) tttAGTGAAGTTTCGGATACGTTATGGACGGGAGGTTATGAAAAACAACCGATGTCTGACGAGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGAGCATTTCTGGCTTACGGATGTCACTTATTCTAACGGCATGTTTATTGGCGTAATCAGCAATGACCCTGGTATTGTTACAAACGTAGAATATGGCCAGGAGTGGAAAATCAAGAaagaag < 2:1425497/289‑1 (MQ=255) ttAGTGAAGTTTCGGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGAGCATTTCTGGCTTACGGATGTCACTTATTCTAACGGCATGTTTATTGGCGTAATCAGCAATGACCCTGGTATTGTTACAAACGTAGAATATGGCCAGGAGTGGAAAATCAAGAAagaaga < 2:122967/289‑1 (MQ=255) ||| GTTTTCATAATATTTCGCGGGTAGTTATATTATATTTCAATGAATAATAACAACTAACCATTAAAATTATTTCTATATGGGGAAAACCCACTCAAGAATAAAAATGATAATGCAATTTTATCAGGATACAATTCAATTTCGGCCTGATAATGATTAACTTCCACAGGTTTTTGCTAACTTTGACTACAAAGGGATTCTGGAGAAAAAATGAAAAAGATATTACTTATGTTGAGTCTGCTATTTTTTACTACCGCGGGCTTTAGTGAAGTTAGCGATACGTTAGTGACGGGAGGTTATGATAAACAAGCGATGTCTGACGCGATTAAACATGCGCGGAAAGAAACCGATAAATTCATCGAGGTTATGAATAAAAAAGATGCCGATACTTTCGCAGTCAAAGCCCCGATAACCGATCACGGAAGAACCGAGCATTTCTGGCTTACGGATGTCACTTATTCTAACGGCATGTTTATTGGCGTAATCAGCAATGACCCTGGTATTGTTACAAACGTAGAATATGGCCAGGAGTGGAAAATCAAGAAAGAAGA > CP042583/1737893‑1738440 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |