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| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| * | CP042583 | 1,750,060 | 0 | C | G | 100.0% | 687.8 / NA | 287 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
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Only 100 of 287 total aligned reads displayed.
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tttGTCTTTCAGATCCTGCGTTCATTTGAACACGATAATTCGGAAGATAAACCCGGCCCGGGTATGCCACCGCACGGCTGGCGTACCCAGTTCTGGGTGGTTGATCAA‑ACCAACAAAGTGCTGGTTGGTCCGCGAGCGCCGATTCCACCTGACGGTACACGGCGACCCATTCTGGTCAACGGTGCGGAAGTTGGCGCGGTGAGCGCCTCCCCCGTTGAGCGGTTAACGCGCAATACTGATATCAATTTCGATAAACAACAGCGGCAAACCAGCTGGTTGATTGTCGc > 1:302471/1‑287 (MQ=255) tttGTCTTTCAGATCCTGCGTTCATTTGAACACGATAATTCGGAAGATAAACCCGGCCCGGGTATGCCACCGCACGGCTGGCGTACCCAGTTCTGGGTGGTTGATCAA‑AACAACAAAGTGCTGGTTGGTCCGCGAGCGCCGATTCCACCTGACGGTACACGGCGACCCATTCTGGTCAACGGTGCGGAAGTTGGCGCGGTGATCGCCTCCCCCGTTGAGCGGTTAACGCGCAATACTGATATCAATTTCGATAAACAACAGCGGCAAACCAGCTGGGTGATTGTCGc > 1:1097667/1‑287 (MQ=255) tCAGATCCTGCGTTCATTTGAACACGATAATTCGGAAGATAAACCCGGCCCGGGTATGCCACCGCACGGCTGGCGTACCCAGTTCTGGGTGGTTGATCAA‑AACAACAAAGTGCTGGTTGGTCCGCGAGCGCCGATTCCACCTGACGGTACACGGCGACCCATTCTGGTCAACGGTGCGGAAGTTGGCGCGGTGATCGCCTCCCCCGTTGAGCGGTTAACGCGCAATACTGATATCAATTTCGATAAACAACAGCGGCAAACCAGCTGGTTGATTGTCGCCCTGGCAACg > 2:779094/1‑289 (MQ=255) 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GCGCGCAATGAAGTTCTGGCGACCCGGTATTACCGGCAAACTGTTTCTGGCGATTTTCGCCACCTGCATTGTCTTGCTGATCAGTATGCACTGGGCGGTGCGTATCAGTTTTGAGCGTGGCTTTATTGATTACATCAAGCATGGTAATGAACAGCGATTACAACTGTTAAGTGATGCGCTTGGCGAGCAGTATGCGCAGCATGGCAACTGGCGCTTCCTGCGCAACAATGATCGCTTTGTCTTTCAGATCCTGCGTAGTTTTGAACACGATAATAGCGAAGATAAACCCGGCCCGGGTATGCCACCGCACGGCTGGCGTACCCAGTTCTGGGTGGTTGATCAA‑AACAACAAAGTGCTGGTTGGTCCGCGAGCGCCGATTCCACCTGACGGTACACGGCGACCCATTCTGGTCAACGGTGCGGAAGTTGGCGCGGTGATCGCCTCCCCCGTTGAGCGGTTAACGCGCAATACTGATATCAATTTCGATAAACAACAGCGGCAAACCAGCTGGTTGATTGTCGCCCTGGCAACGTTACTCGCGGCACTTGCCACTT > CP042583/1749784‑1750337 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |