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| * | CP042583 | 517,873 | 0 | C | G | 99.3% | 658.5 / NA | 281 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
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| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.00e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| * | CP042583 | 517,874 | 0 | T | A | 98.9% | 655.8 / NA | 281 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); major base A (155/121); minor base G (0/3); total (155/126) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.66e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 281 total aligned reads displayed.
CACCGTCAGGCGGCGAGGGTTTAACTCACATGATGATACTGACTGTTGCTCACTCTTTGAAGTGATTTGCGTCACATTCAGGGAATTCCTCAATGCAGCGCATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAACCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAAACTGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATGCTGATCTGAATTTCAGTCAAATACGCAGGGTTACCCTGGCACGTTAGCTTAACTGCTTTCACGTTCTCTTTTCCCCAGCTTTTGGCAAAGGCGGCGTCAAAGTCACGGCGGCTCACTGTTTTACCGTAATTATCCGCAAGGAATTTTCCGGCTTCGCTCTCTTTAATTTCTTGATTCAGGCGTACCATCGTACCGAAGTATGCGTCCGGATCAAAACCAAAGCAGGCACCGTGTTTGGCATATTCGTAGCGTTCCAGGCAGGAACGTCCGCCAGCTC > CP042583/517596‑518149 ||| aCCGTCAGGCGGCGAGGGTTTAACTCACATGATGATACTGACTGTTGCTCACTCTTTGAAGTGATTTGCGTCACATTCAGGGAATTCCTCAATGCAGCGCATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAACCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAATGAGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATCGAGATCTGAAttt < 1:1124441/289‑1 (MQ=255) 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CACCGTCAGGCGGCGAGGGTTTAACTCACATGATGATACTGACTGTTGCTCACTCTTTGAAGTGATTTGCGTCACATTCAGGGAATTCCTCAATGCAGCGCATTATGTATAAATCTTAATCGCCTTGGTTTATGGAAGACGAATTAGCGTGTTTTGTAAATCAGATGATTAATAACCCGCTTTATCAATCACAAAGGTTTTGCCACAGTTACCTGGGTGAGGTTGTGGCAAGAAACTGTTTGCAGAAAGCGGAGCGTTGATGGCGTCAGCTTTGATGCTGATCTGAATTTCAGTCAAATACGCAGGGTTACCCTGGCACGTTAGCTTAACTGCTTTCACGTTCTCTTTTCCCCAGCTTTTGGCAAAGGCGGCGTCAAAGTCACGGCGGCTCACTGTTTTACCGTAATTATCCGCAAGGAATTTTCCGGCTTCGCTCTCTTTAATTTCTTGATTCAGGCGTACCATCGTACCGAAGTATGCGTCCGGATCAAAACCAAAGCAGGCACCGTGTTTGGCATATTCGTAGCGTTCCAGGCAGGAACGTCCGCCAGCTC > CP042583/517596‑518149 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |