| Predicted mutation | ||||||
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| RA | CP042583 | 1,816,759 | 3 bp→TGA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (154/106); total (154/106) | |||||||||||
| * | CP042583 | 1,816,761 | 0 | T | A | 99.6% | 619.9 / NA | 260 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base A (153/106); minor base G (1/0); total (154/106) | |||||||||||
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Only 100 of 260 total aligned reads displayed.
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gATCGTTATCTTGATGTTTTAGATATTGCCGGTCCGGCAGCACGCAAAGTTAACTGACGCCAGAGCCATTCCACCGGCCCCTGGCGGAAGTAACGCAGCCAGATAACAGAGAAGAGGATATTCGCCAGCCATACCGGAATAACAAACGCCAGCAGCTCCAGGCGGTCAAAATGCATAAACAAACAGAGGTGGTAAAAAAGCGGGGTACAAATCAGCGGTTGCAATAGATAGTTGGTCAGCGCAAACAGTCCGACGCAGGCCAGCGCAAGCACCAGCTTAAAGCGGCTCa > 2:800632/1‑289 (MQ=255) aTCGTTATCTTGATGTTTTAGATATTGCCGGTCCGGCAGCACGCAAAGTTAACTGACGCCAGAGCCATTCCACCGGCCCCTGGCGGAAGTAACGCAGCCAGATAACAGAGAAGAGGATATTCGCCAGCCATACCGGAATAACAAACGCCAGCAGCTCCAGGCGGTCAAAATGCATAAACAAACCGa > 1:1679991/1‑186 (MQ=255) aTCGTTATCTTGATGTTTTAGATATTGCCGGTCCGGCAGCACGCAAAGTTAACTGACGCCAGAGCCATTCCACCGGCCCCTGGCGGAAGTAACGCAGCCAGATAACAGAGAAGAGGATATTCGCCAGCCATACCGGAATAACAAACGCCAGCAGCTCCAGGCGGTCAAAATGCATAAACAAACCGAGGTGGTAAAAAAGCGTGGTACAAATCAGCGTTTGCAATAGATAGTTGGTCAGCGCCATCCGTCCGACGCAGGCGATCGCAAGCACCAGCTTAAAGCGGCTCaa > 1:33916/1‑289 (MQ=255) ||| TCACTCACGGCTTTCATTACTGCTTCA‑CGCGTGTCGGCACTGACCAGCGTGCTGTTATTGAGCACCCGGGAAACCGTTGCCACAGAGACGCCAGCCTGACGCGCTACATCACGAATGGTGATCATATTCACTACCTGTTATGAGATTGCAGTAAATGACTGCTTGCTGGCGGCTATTTTG‑TCAGCACTGAATACAGGACTTCGTGAATCGAGTCACAGCAATGGAAACGGTTACAGCCGTTTTGTTAACGAATGTGATCCAGATCGTTATCTACTTGTTTTAGATATTGCCGGTCCGGCAGCACGCAAAGTTAACTGACGCCAGAGCCATTCCACCGGCCCCTGGCGGAAGTAACGCAGCCAGATAACAGAGAAGAGGATATTCGCCAGCCATACCGGAATAACAAACGCCAGCAGCTCCAGGCGGTCAAAATGCATAAACAAACCGAGGTGGTAAAAAAGCGTGGTACAAATCAGCGTTTGCAATAGATAGTTGGTCAGCGCCATCCGTCCGACGCAGGCGATCGCAAGCACCAGCTTAAAGCGGCTCAA > CP042583/1816487‑1817037 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |