Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 527,451 | 3 bp→TCA | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 527,451 | 0 | A | T | 100.0% | 574.9 / NA | 239 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base T (120/119); total (120/119) | |||||||||||
* | CP042583 | 527,452 | 0 | G | C | 100.0% | 571.6 / NA | 239 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base C (120/119); total (120/119) | |||||||||||
* | CP042583 | 527,453 | 0 | T | A | 99.6% | 575.0 / NA | 239 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base A (119/119); minor base C (1/0); total (120/119) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 239 total aligned reads displayed.
ACTTGATAACGCCTTCGAAGCCAGCCTGCGTAGCGATGAAGGAAACAAGATCGTTGAATTATTCCTCAGCGATGAAGGCGATGATGTGGTGATTGAAGTCGCCGATCAGGGCTGCGGCGTTCCAGAGTCTCTACGAGACAAAATATTTGAGCAGGGGGTCAGTACGCGTGCTGACGAGCCCGGTGAACATGGCATTGGGTTGTACTTGATTGCCAGCTACGTAACGCGCTGCGGTGGTGTTATCACTCTCGAAGATAATGATCCCTGCGGTACCTTATTTAGTATCTATATTCCGAAAGTGAAACCTAATGACAGCTCCATTAACCCTATTGATCGTTGAGGACGAAACGCCGCTGGCAGAGATGCATGCGGAATATATTCGTCACATTCCCGGATTCAGTCAGATATTACTGGCGGGAAATCTGGCGCAGGCCCGAATGATGATCGAGCGTTTTAAGCCGGGGCTAATCTTGCTCGATAACTATCTTCCTGACGGTAGAGGGATTAATTTACTGCATGAACTGGTGCAGGCGCATTATCCCGGCGACGTGGTGTTTACC > CP042583/527171‑527730 ||| aaCGCCTTCGAAGCCAGCCTGCGTAGCGATGAAGGAAACAAGATCGTTGAATTATTCCTCAGCGATGAAGGCGATGATGTGGTGATTGAAGTCGCCGATCAGGGCTGCGGCGTTCCAGAGTCTCTACGAGACAAAATATTTGAGCAGGGGGTCAGTACGCGTGCTGACGAGCCCGGTGAACATGGCATTGGGTTGTACTTGATTGCCAGCTACGTAACGCGCTGCGGTGGTGTTATCACTCTCGAAGATAATGATCCCTGCGGTACCTTATTTTCAATCTATATTCCGa > 1:1608691/1‑289 (MQ=255) ttggAAGCCAGCCTGCGTAGCGATGAAGGAAACAAGATCGTTGAATTATTCCTCAGCGATGAAGGCGATGATGTGGTGATTGGAGTCGCGGATCAGGGCTGCGGCGTTCCAGAGTCTCTACGAGACAAAATATTTGAGCAGGGGGTCAGTACGCGTGCTGACGAGCCCGGTGAACATGGCATTGGGTTGTACTTGATTGCCAGCTACGTAACGCGCTGCGGTGGTGTTATCACTCTCGAAGATAATGATCCCTGCGGTACCTTATTTTCAATCTATAGTCCGAAAGTGa < 1:685552/286‑1 (MQ=255) ttCGGAGCCAGCCTGCGTGTGGATGAAGGAAGCACGATCGTTTGAGTATTCCTCCGCGATGAAGGCGATGATGTGGGGATTGAAGTCGCCGATCAGGGCTGCGGCGTTCCAGAGTCGCTACGAGACAAAATATTTGAGCAGGGGGTCAGTACGCGTGCTGACGAGCCCGGTGAACATGGCATTGGGTTGTACTTGATTGCCAGCTACGTAACGCGCTGCGGTGGTGTTATCACTCTCGAAGATAATGATCCCTGCGGTACCTTATTTTCAATCTATATTCCGAAAGTGa < 2:124351/289‑1 (MQ=255) ttCGAAGCCAGCCTGCGTAGCGATGAAGGAAACAAGATCGTTGAATTATTCCTCAGCGATGAAGGCGATGATGTGGTGATTGAAGTCGCCGATCAGGGCTGCGGCGTTCCAGAGTCTCTACGAGACAAAATATTTGAGCAGGGGGTCAGTACGCGTGCTGACGAGCCCGGTGAACATGGCATTGGGTTGTACTTGATTGCCAGCTACGTAACGCGCTGCGGTGGTGTTATCACTCTCGAAGATAATGATCCCTGCGGTACCTTATTTTCAATCTATATTCCGAAAGTGa < 1:722503/289‑1 (MQ=255) ttCGAAGCCAGCCTGCGTAGCGATGAAGGAAACAAGATCGTTGAATTATTCCTCAGCGATGAAGGCGATGATGTGGTGATTGAAGTCGCCGATCAGGGCTGCGGCGTTCCAGAGTCTCTACGAGACAAAATATTTGAGCAGGGGGTCAGTACGCGTGCTGACGAGCCCGGTGAACATGGCATTGGGTTGTACTTGATTGCCAGCTACGTAACGCGCTGCGGTGGTGTTATCACTCTCGAAGATAATGATCCCTGCGGTACCTTATTTTCAATCTATATTCCGAAAGTGa < 1:320581/289‑1 (MQ=255) ttCGAAGCCAGCCTGCGTAGCGATGAAGGAAACAAGATCGTTGAATTATTCCTCAGCGATGAAGGCGATGATGTGGTGATTGAAGTCGCCGATCAGGGCTGCGGCGTTCCAGAGTCTCTACGAGACAAAATATTTGAGCAGGGGGTCAGTACGCGTGCTGACGAGCCCGGTGAACATGGCATTGGGTTGTACTTGATTGCCAGCTACGTAACGCGCTGCGGTGGTGTTATCACTCTCGAAGATAATGATCCCTGCGGTACCTTATTTTCAATCTATATTCCGAAAGTGa < 2:777761/289‑1 (MQ=255) tCGAAGCCAGCCTGCGTAGCGATGAAGGAAACAAGATCGTTGAATTATTCCTCAGCGATGAAGGCGATGATGTGGTGATTGAAGTCGCCGATCAGGGCTGCGGCGTTCCAGAGTCTCTACGAGACAACATATTTGAGCAGGGGGTCAGTACGCGTGCTGACGAGCCCGGTGAACCTGGCATTGGGTTGTACTTGATTGCCAGCTACGTAACGCGCTGCGGTGGTGTTATCACTCTCGAAGATAATGATCCCTGCGGTACCTTATTTTCAATCTATATTCCGAAAGTGaa > 2:1576185/1‑289 (MQ=255) cggccTGCGTAGCGATGAAGGAAAGTAGATCGTTGAATTATTCCTCAGCGATGAAGGCGATGATGTGGTGATTGAAGTCGCCGATCAGGGCTGCGGCGTTCCAGAGTCTCGACGAGACAAAATATTTGAGCAGGGGGTCAGTACGCGTGCTGACGAGCCCGGTGAACATGGCATTGGGTTGTACTTGATTGCCAGCTACGTAACGCGCTGCGGTGGTGTTATCACTCTCGAAGATAATGATCCCTGCGGTACCTTATTTTCAATCTATATTCCGAAAGTGAAACCTAAt < 2:443443/287‑1 (MQ=255) ccTGCGTAGCGATGAAGGAAACAAGATCGTTGAATTATTCCTCAGCGATGAAGGCGATGATGTGGTGATTGAAGTCGCCGATCAGGGCTGCGGCGTTCCAGAGTCTCTACGAGACAAAATATTTGAGCAGGGGGTCAGTACGCGTGCTGACGAGCCCGGTGAACATGGCATTGGGTTGTACTTGATTGCCAGCTACGTAACGCGCTGCGGTGGTGTTATCACTCTCGAAGATAATGATCCCTGCGGTACCTTATTTTCAATCTATATTCCGAAAGTGAAACCTAATGAc > 1:487128/1‑289 (MQ=255) tGCGTAGCGATGAAGGAAACAAGATCGTTGAATTATTCCTCAGCGATGAAGGCGATGATGTGGTGATTGAAGTCGCCGATCAGGGCTGCGGCGTTCCAGAGTCTCTACGAGACAAAATATTTGAGCAGGGGGTCAGTACGCGTGCTGACGAGCCCGGTGAACATGGCATTGGGTTGTACTTGATTGCCAGCTACGTAACGCGCTGCGGTGGTGTTATCACTCTCGAAGATAATGATCCCTGCGGTACCTTATTTTCAATCTATATTCCGAAAGTGAAACCTAATGACAg < 2:592364/289‑1 (MQ=255) tGCGGAGCGATGAAGGAAACAAGATCATTGAATTATTCCTCCGCGATGAAGGCGATGATGTGGTGATTGAAGTCGCCGATCAGGGCTGCGGCGTTCCAGTGTCTCTACGAGACAAAATATTTGAGCAGGGGGTCAGTACGCGTGCTGACGAGCCCGGTGAACATGTCATTGGGTTGTACTTGATTGCCAGCTACGTAACGCGCTGCGGTGGTGTTATCACTCTCGAAGATAATGATCCCTGCGGTACCTTATTTTCAATCTATATTCCGAAAGTGAAACCTAATGACAg < 2:1099406/289‑1 (MQ=255) gCGTAGCGATGAAGGAAACAAGATCGTTGAATTATTCCTCAGCGATGAAGGCGATGATGTGGTGATTGAAGTCGCCGATCAGGGCTGCGGCGTTCCAGAGTCTCTACGAGACAAAATATTTGAGCAGGGGGTCAGTACGCGTGCTGACGAGCCCGGTGAACATGGCATTGGGTTGTACTTGATTGCCAGCTACGTAACGCGCTGCGGTGGTGTTATCACTCTCGAAGATAATGATCCCTGCGGTACCTTATTTTCAATCTATATTCCGAAAGTGAAACCTAATGACAGc < 1:1572726/289‑1 (MQ=255) gCGTAGCGAGTAAGGAGACAAGATCGTTGAATTATTCCTAAGGGATGAAGGCGATGATGTGGTGATTGAAGTCGCCGATCAGGGCTGCGGCGTTCCAGAGTCTCTACGAGACAAAATATTTGAGCAGGGGGTCAGTACGCGTGCTGACGAGCCCGGTGAACATGGCATTGGGTTGTACTTGATTGCCAGCTACGTAACGCGCTGCGGTGGTGTTATCACTCTCGAAGATAATGATCCCTGCGGTACCTTATTTTCAATCTATATTCCGAAAGTGAAACCTAATGACAGc < 2:1881826/289‑1 (MQ=255) gCGTAGAGGTGAAGGAAACAAGATCGTTGAATTATTCCTCAGCGATGAAGGCGATGATGGGGTGATTGAAGTCGCCGATCAGGGCTGCGGCGTTCCAGAGTCGCTACGAGACAAAATATTTGAGGAGGGGGTCAGTACGCGTGCTGACGAGCCCGGTGAACATGGCATTGGGTTGTACTTGATTGCCAGCTACGTAACGCGCTGCGGTGGTGTTATCACTCTCGAAGATAATGATCCCTGCGGTACCTTATTTTCAATCTATATTCCGAAAGTGAAACCTAATGACAg < 2:1828719/288‑1 (MQ=255) gATGAAGGAAACAAGATCGTTGAATTATTCCTCAGCGATGAAGGCGATGATGTGGTGATTGAAGTCGCCGATCAGGGCTGCGGCGTTCCAGAGTCTCTACGAGACAAAATATTTGAGCAGGGGGTCAGTACGCGTGCTGACGAGCCCGGTGAACATGGCATTGGGTTGTACTTGATTGCCAGCTACGTAACGCGCTGCGGTGGTGTTATCACTCTCGAAGATAATGATCCCTGCGGTACCTTATTTTCAATCTATATTCCGAAAGTGAAACCTAATGACAGCTCCAtt < 1:298053/288‑1 (MQ=255) gATGAAGGAAACAAGATCGTTGAATTATTCCTCAGCGATGAAGGCGATGATGTGGTGATTGAAGTCGCCGATCAGGGCTGCGGCGTTCCAGAGTCTCTACGAGACAAAATATTTGAGCAGGGGGTCAGTACGCGTGCTGACGAGCCCGGTGAACATGGCATTGGGTTGTACTTGATTGCCAGCTACGTAACGCGCTGCGGTGGTGTTATCACTCTCGAAGATAATGATCCCTGCGGTACCTTATTTTCAATCTATATTCCGAAAGTGAAACCTAATGACAGCTCCAtt < 2:168121/288‑1 (MQ=255) gATGAAGGAAACAAGATCGTTGAATTATTCCTCAGCGATGAAGGCGATGATGTGGTGATTGAAGTCGCCGATCAGGGCTGCGGCGTTCCAGAGTCTCTACGAGACAAAATATTTGAGCAGGGGGTCAGTACGCGTGCTGACGAGCCCGGTGAACATGGCATTGGGTTGTACTTGATTGCCAGCTACGTAACGCGCTGCGGTGGTGTTATCACTCTCGAAGATAATGATCCCTGCGGTACCTTATTTTCAATCTATATTCCGAAAGTGAAACCTAATGACAGCTCCATTa > 2:281465/1‑289 (MQ=255) aaCAAGATCGTTGAATTATTCCTCAGCGATGAAGGCGATGATGTGGTGATTGAAGTCGCCGATCAGGGCTGCGGCGTTCCAGAGTCTCTACGAGACAAAATATTTGAGCAGGGGGTCAGTACGCGTGCTGACGAGCCCGGTGAACATGGCATTGGGTTGTACTTGATTGCCAGCTACGTAACGCGCTGCGGTGGTGTTATCACTCTCGAAGATAATGATCCCTGCGGTACCTTATTTTCAATCTATATTCCGAAAGTGAAACCTAATGACAGCTCCATTAACCCTAtt < 1:1196864/288‑1 (MQ=255) gATCGTTGAATTATTCCTCAGCGATGAAGGCGATGATGTGGTGATTGAAGTCGCCGATCAGGGCTGCGGCGTTCCAGAGTCTCTACGAGACAAAATATTTGAGCAGGGGGTCAGTACGCGTGCTGACGAGCCCGGTGAACATGGCATTGGGTTGTACTTGATTGCCAGCTACGTAACGCGCTGCGGTGGTGTTATCACTCTCGAAGATAATGATCCCTGCGGTACCTTATTTTCAATCTATATTCCGAAAGTGAAACCTAATGACAGCTCCATTAACCCTAt < 2:89488/282‑1 (MQ=255) gATCGTTGAATTATTCCTCAGCGATGAAGGCGATGATGTGGTGATTGAAGTCGCCGATCAGGGCTGCGGCGTTCCAGAGTCTCTACGAGACAAAATATTTGAGCAGGGGGTCAGTACGCGTGCTGACGAGCCCGGTGAACATGGCATTGGGTTGTACTTGATTGCCAGCTACGTAACGCGCTGCGGTGGTGTTATCACTCTCGAAGATAATGATCCCTGCGGTACCTTATTTTCAATCTATATTCCGAAAGTGAAACCTAATGACAGCTCCATTAACCCTAt > 1:89488/1‑282 (MQ=255) gATCGTTGAATTATTCCTCAGCGATGAAGGCGATGATGTGGTGATTGAAGTCGCCGATCAGGGCTGCGGCGTTCCAGAGTCTCTACGAGACAAAATATTTGAGCAGGGGGTCAGTACGCGTGCTGACGAGCCCGGTGAACATGGCATTGGGTTGTACTTGATTGCCAGCTACGTAACGCGCTGCGGTGGTGTTATCACTCTCGAAGATAATGATCCCTGCGGTACCTTATTTTCAATCTATATTCCGAAAGTGAAACCTAATGACAGCTCCATTAACCCTATTGATCGt > 2:186711/1‑289 (MQ=255) cGTTGAATTATTCCTCAGCGATGAAGGCGATGATGTGGTGATTGAAGTCGCCGATCAGGGCTGCGGCGTTCCAGAGTCTCTACGAGACAAAATATTTGAGCAGGGGGTCAGTACGCGTGCTGACGAGCCCGGTGAACATGGCATTGGGTTGTACTTGATTGCCAGCTACGTAACGCGCTGCGGTGGTGTTATCACTCTCGAAGATAATGATCCCTGCGGTACCTTATTTTCAATCTATATTCCGAAAGTGAAACCTAATGACAGCTCCATTAAcc > 1:631487/1‑275 (MQ=255) cGTTGAATTATTCCTCAGCGATGAAGGCGATGATGTGGTGATTGAAGTCGCCGATCAGGGCTGCGGCGTTCCAGAGTCTCTACGAGACAAAATATTTGAGCAGGGGGTCAGTACGCGTGCTGACGAGCCCGGTGAACATGGCATTGGGTTGTACTTGATTGCCAGCTACGTAACGCGCTGCGGTGGTGTTATCACTCTCGAAGATAATGATCCCTGCGGTACCTTATTTTCAATCTATATTCCGAAAGTGAAACCTAATGACAGCTCCATTAACCCTATTGATCGTTGa > 1:883583/1‑289 (MQ=255) aaTTATTCCTCAGCGATGAAGGCGATGATGTGGTGATTGAAGTCGCCGATCAGGGCTGCGGCGTTCCAGAGTCTCTACGAGACAAAATATTTGAGCAGGGGGTCAGTACGCGTGCTGACGAGCCCGGTGAACATGGCATTGGGTTGTACTTGATTGCCAGCTACGTAACGCGCTGCGGTGGTGTTATCACTCTCGATGATAATGATCCCTGCGGTACCTTATTTTCAATCTATATTCCGAAAGTGAAACCTAATGACAGCTCCATTAACCCTATTGATCGTTGAGGACg > 1:305077/1‑289 (MQ=255) tCAGCGATGAAGGCGATGATGTGGTGATTGAAGTCGCCGATCAGGGCTGCGGCGTTCCAGAGTCTCTACGAGACAAAATATTTGAGCAGGGGGTCAGTACGCGTGCTGACGAGCCCGGTGAACATGGCATTGGGTTGTACTTGATTGCCAGCTACGTAACGCGCTGCGGTGGTGTTATCACTCTCGAAGATAATGATCCCTGCGGTACCTTATTTTCAATCTATATTCCGAAAGTGAAACCTAATGACAGCTCCATTAACCCTATTGATCGTTGAGGACGAAAcgccgc < 1:424768/289‑1 (MQ=255) cAGCGATGAAGGCGATGATGTGGTGATTGAAGTCGCCGATCAGGGCTGCGGCGTTCCAGAGTCTCTACGAGACAAAATATTTGAGCAGGGGGTCAGTACGCGTGCTGACGAGCCCGGTGAACATGGCATTGGGTTGTACTTGATTGCCAGCTACGTAACGCGCTGCGGTGGTGTTATAACTCTCGAAGATAATGATCCCTGCGGTACCTTATTTTCAATCTATATTCCGAAAGTGAAACCTAATGACAGCTCCATTAACCCTATTTATCGTTGAGGTCGAAAcgcc > 2:813423/1‑286 (MQ=255) aGCGATGAAGGCGATGATGTGGTGATTGAAGTCGCCGATCAGGGCTGCGGCGTTCCAGAGTCTCTACGAGACAAAATATTTGAGCAGGGGGTCAGTACGCGTGCTGACGAGCCCGGTGAACATGGCATTGGGTTGTACTTGATTGCCAGCTACGTAACGCGCTGCGGTGGTGTTATCACTCTCGAAGATAATGATCCCTGCGGTACCTTATTTTCAATCTATATTCCGAAAGTGAAACCTAATGACAGCTCCATTAACCCTATTGATCGTTGAGGACGAAACGCCGCTg > 1:1306388/1‑289 (MQ=255) gatgatGTGGTGATTGAAGTCGCCGATCAGGGCTGCGGCGTTCCAGAGTCTCTACGAGACAAAATATTTGAGCAGGGGGTCAGTACGCGTGCTGACGAGCCCGGTGAACATGGCATTGGGTTGTACTTGATTGCCAGCTACGTAACGCGCTGCGGTGGTGTTATCACTCTCGAAGATAATGATCCCTGCGGTACCTTATTTTCAATCTATATTCCGAAAGTGAAACCTAATGACAGCTCCATTAACCCTATTGATCGTTGAGGACGAAACGCCGCTGGCAGAGatgcat > 1:1230082/1‑289 (MQ=255) atgatgTGGTGATTGAAGTCGCCGATCAGGGCTGCGGCGTTCCAGAGTCTCTACGAGACAAAATATTTGAGCAGGGGGTCAGTACGCGTGCTGACGAGCCCGGTGAACATGGCATTGGGTTGTACTTGATTGCCAGCTACGTAACGCGCTGCGGTGGTGTTATCACTCTCGAAGATAATGATCCCTGCGGTACCTTATTTTCAATCTATATTCCGAAAGTGAAACCTAATGACAGCTCCATTAACCCTATTGATCGTTGAGGACGAAACGCCGCTGGCAGAGatgcatt > 1:1342858/1‑288 (MQ=255) tggtgATTGAAGTCGCCGATCAGGGCTGCGGCGTTCCAGAGTCTCTACGAGACAAAATATTTGAGCAGGGGGTCAGTACGCGTGCTGACGAGCCCGGTGAACATGGCATTGGGTTGTACTTGATTGCCAGCTACGTAACGCGCTGCGGTGGTGTTATCACTCTCGAAGATAATGATCCCTGCGGTACCTTATTTTCAATCTATATTCCGAAAGTGAAACCTAATGACAGCTCCATTAACCCTATTGATCGTTGAGGACGAAACGCCGCTGGCAGAGATGCATGCGGAat > 1:1751934/1‑289 (MQ=255) tgATTGAAGTCGCCGATCAGGGCTGCGGCGTTCCAGAGTCTCTACGAGACAAAATATTTGAGCAGGGGGTCAGTACGCGTGCTGACGAGCCCGGTGAACATGGCATTGGGTTGTACTTGATTGCCAGCTACGTAACGCGCTGCGGTGGTGTTATCACTCTCGAAGATAATGATCCCTGCGGTACCTTATTTTCAATCTATATTCCGAAAGTGAAACCTAATGACAGCTCCATTAACCCTATTGATCGTTGAGGACGAAACGCCGCTGGCAGAGATGCATGCGGAatata > 1:1518195/1‑289 (MQ=255) tGAAGTCGCCGATCAGGGCTGCGGCGTTCCAGAGTCTCTACGAGACAAAATATTTGAGCAGGGGGTCAGTACGCGTGCTGACGAGCCCGGTGAACATGGCATTGGGTTGTACTTGATTGCCAGCTACGTAACGCGCTGCGGTGGTGTTATCACTCTCGAAGATAATGATCCCTGCGGTACCTTATTTTCAATCTATATTCCGAAAGTGAAACCTAATGACAGCTCCATTAACCCTATTGATCGTTGAGGACGAAACGCCGCTGGCAGAGATGCATGCGGAATATATTCg > 1:978277/1‑289 (MQ=255) ggCTGCGGCGTTGCCGAGTCACTACGAGACAAAATATTTGAGCAGGGGGTCAGTACGCGTGCTGACGGGCCCGGTGAACATGGCATTGGGTTGTACTGGATTGCCAGCTACGTAACGCGCTGCGGTGGTGTTATCACTCTCGAAGATAATGATCCCTGCGGTACCTTATTTTCAATCTATATTCCGAAAGTGAAACCTAATGACAGCTCCATTAACCCTATTGATCGTTGAGGACGAAACGCCGCTGGCAGAGATGCATGCGGAATATATTCGTCACATTCCCGGAtt < 2:1036126/288‑1 (MQ=255) tGCGGTGTTCCAGGGTCTCTACGAGAAAAAATATTTGGGCAGGGGGTCAGTACGCGTGCTGACGAGCCCGGTGAACATGGCATTGGGTTGTACTTGATTGCCAGCTACGTAACGCGCTGCGGTGGTGTTATCACTCTCGAAGATAATGATCCCTGCGGTACCTTATTTTCAATCTATATTCCGAAAGTGAAACCTAATGACAGCTCCATTAACCCTATTGATCGTTGAGGACGAAACGCCGCTGGCAGAGATGCATGCGGAATATATTCGTCACATTCCCGGATtcagt < 2:862257/289‑1 (MQ=255) cggcgTTCCAGAGTCTCTACGAGACAAAATATTTGAGCAGGGGGTCAGTACGCGTGCTGACGAGCCCGGTGAACATGGCATTGGGTTGTACTTGATTGCCAGCTACGTAACGCGCTGCGGTGGTGTTATCACTCTCGAAGATAATGATCCCTGCGGTACCTTATTTTCAATCTATATTCCGAAAGTGAAACCTAATGACAGCTCCAt < 1:1272193/207‑1 (MQ=255) cggcgTACCAGAGTCTCTACGAGACAAAATATTTGAGCAGGGGGTCAGTACGCGTGCTGACGAGCCCGGTGAACATGGCATTGGGTTGTACTTGATTGCCAGCTACGTAACGCGCTGCGGTGGTGTTATCACTCTCGAAGATAATGATCCCTGCGGTACCTTATTTTCAATCTATATTCCGAAAGTGAAACCTAATGACAGCTCCATTAACCCTATTGATCGTTGAGGACGAAACGCCGCTGGAAGAGATGCATGCGGAATATATTCGTCACATTCCCGGATtcagtca > 1:1096647/1‑289 (MQ=255) ttCCAGAGTCTCTACGAGACAAAATATTTGAGCAGGGGGTCAGTACGCGTGCTGACGAGCCCGGTGAACATGGCATTGGGTTGTACTTGATTGCCAGCTACGTAACGCGCTGCGGTGGTGTTATCACTCTCGAAGATAATGATCCCTGCGGTACCTTATTTTCAATCTATATTCCGAAAGTGAAACCTAATGACAGCTCCATTAACCCTATTGATCGTTGAGGACGAAACGCCGCTGGCAGAGATGCATGCGGAATATATTCGTCACATTCCCGGATTCAGTCAGatat > 2:962139/1‑289 (MQ=255) ttCCAGAGTCTCTACGAGACAAAATATTTGAGCAGGGGGTCAGTACGCGTGCTGACGAGCCCGGTGAACATGGCATTGGGTTGTACTTGATTGCCAGCTACGTAACGCGCTGCGGTGGTGTTATCACTCTCGAAGATAATGATCCCTGCGGTACCTTATTTTCAATCTATATTCCGAAAGTGAAACCTAATGACAGCTCCATTAACCCTATTGATCGTTGAGGACGAAACGCCGCTGGCAGAGATGCATGCGGAATATATTCGTCACATTCCCGGATTCAGTCAGatat > 1:1877642/1‑289 (MQ=255) ccAGAGTCTCTACGAGACAAAATATTTGAGCAGGGGGTCAGTACGCGTGCTGACGAGCCCGGTGAACATGGCATTGGGTTGTACTTGATTGCCAGCTACGTAACGCGCTGCGGTGGTGTTATCACTCTCGAAGATAATGATCCCTGCGGTACCTTATTTTCAATCTATATTCCGAAAGTGAAACCTAATGACAGCTCCATTAACCCTATTGATCGTTGAGGACGAAACGCCGCTGGCAGAGATGCATGCGGAATATATTCGTCACATTCCCGGATTCAGTCAGATAtt > 1:1826288/1‑288 (MQ=255) tctACGAGACAAAATATTTGAGCAGGGGGTCAGTACGCGTGCTGACGAGCCCGGTGAACATGGCATTGGGTTGTACTTGATTGCCAGCTACGTAACGCGCTGCGGTGGTGTTATCACTCTCGAAGATAATGATCCCTGCGGTACCTTATTTTCAATCTATATTCCGAAAGTGAAACCTAATGACAGCTCCATTAACCCTATTGATCGTTGAGGACGAAACGCCGCTGGCAGAGATGCATGCGGAATATATTCGTCACATTCCCGGATTCAGTCAGATATTACTGGCggg > 1:807545/1‑289 (MQ=255) aaaaaaTTTGTGCATGGGTTCAGTACGCTTGGTGGCGAGCCCGGTGAAACTGGCATTGGGTTGTACTTGATTGCCAGCTACGTAACGCGCTGCGGTGGTGTTATCACTCTCGAAGATAATGATCCCTGCGGTACCTTATTTTCAATCTATATTCCGAAAGTGAAACCTAATGACAGCTCCATTAACCCTATTGATCGTTGAGGACGAAACGCCGCTGGCAGAGATGCATGCGGAATATATTCGTCACATTCCCGGATTCAGTCAGATATTACTGGCGGGAAATCTGgcg < 2:1131501/289‑1 (MQ=255) aaaaTATTTGAGCAGGGGGTCAGTACGCGTGCTGACGAGCCCGGTGAACATGGCATTGGGTTGTACTTGATTGCCAGCTACGTAACGCGCTGCGGTGGTGTTATCACTCTCGAAGATAATGATCCCTGCGGTACCTTATTTTCAATCTATATTCCGAAAGTGAAACCTAATGACAGCTCCATTAACCCTATTGATCGTTGAGGACGAAACGCCGCTGGCAGAGATGCATGCGGAATATATTCGTCACATTCCCGGATTCAGTCAGATATTACTGGCGGGAAATCTGgcg < 2:883583/289‑1 (MQ=255) aaaaTATTTGAGCAGGGGGTCAGTACGCGTGCTGACGAGCCCGGTGAACATGGCATTGGGTTGTACTTGATTGCCAGCTACGTAACGCGCTGCGGTGGTGTTATCACTCTCGAAGATAATGATCCCTGCGGTACCTTATTTTCAATCTATATTCCGAAAGTGAAACCTAATGACAGCTCCATTAACCCTATTGATCGTTGAGGACGAAACGCCGCTGGCAGAGATGCATGCGGAATATATTCGTCACATTCCCGGATTCAGTCAGATATTACTGGCGGGAAATCTGgcg < 1:1073190/289‑1 (MQ=255) aaaaTATTTGAGCAGGGGGTCAGTACGCGTGCTGACGAGCCCGGTGAACATGGCATTGGGTTGTACTTGATTGCCAGCTACGTAACGCGCTGCGGTGGTGTTATCACTCTCGAAGATAATGATCCCTGCGGTACCTTATTTTCAATCTATATTCCGAAAGTGAAACCTAATGACAGCTCCATTAACCCTATTGATCGTTGAGGACGAAACGCCGCTGGCAGAGATGCATGCGGAATATATTCGTCACATTCCCGGATTCAGTCAGATATTACTGGCGGGAAATCTGgcg < 1:124905/289‑1 (MQ=255) aaaaTATTTGAGCAGGGGGTCAGTACGCGTGCTGACGAGCCCGGTGAACATGGCATTGGGTTGTACTTGATTGCCAGCTACGTAACGCGCTGCGGTGGTGTTATCACTCTCGAAGATAATGATCCCTGCGGTACCTTATTTTCAATCTATATTCCGAAAGTGAAACCTAATGACAGCTCCATTAACCCTATTGATCGTTGAGGACGAAACGCCGCTGGCAGAGATGCATGCGGAATATATTCGTCACATTCCCGGATTCAGTCAGATATTACTGGCGGGAAATCTGgc > 2:1632024/1‑288 (MQ=255) aaaTATGTGAGCAGGGGGTCATTGAGCGTGGTGACGAGCCCGGTGAACATGGCATTGGGGTGTACTTGATTGCCAGGTACGTAACGCGCTGCGGTGGTGTTATCACTCTCGAAGATAATGATCCCTGCGGTACCTTATTTTCAATCTATATTCCGGAAGTGAAACCTAATGACAGCTCCATTAACCCTATTGATCGTTGAGGACGAAACGCCGGTGGCAGAGATGCATGCGGAATATATTCGTCACATTCCCGGATTCAGTCAGATATTACTGGCGGGAAATCTGgcgc < 2:1622074/289‑1 (MQ=255) ttGAGCAGGGGGTCAGTACGCGTGCTGACGAGCCCGGTGAACATGGCATTGGGTTGTACTTGATTGCCAGCTACGTAGCGCGCTGCGGTGGTGTTATCACTCTCGAAGATAATGATCCCTGCGGTACCTTATTTTCAATCTATATTCCGAAAGTGAAACCTAATGACAGCTCCATTAACCCTATTGATCGTTGAGGACGAAACGCCGCTGGCAGAGATGCATGCGGAATATATTCGTCACATTCCCGGATTCAGTCAGATATTACTGGCGGGAAATCTGGCGCAGGcc < 1:1007559/288‑1 (MQ=255) ttGAGCAGGGGGTCAGTACGCGTGCTGACGAGCCCGGTGAACATGGCATTGGGTTGTACTTGATTGCCAGCTACGTAACGCGCTGCGGTGGTGTTATCACTCTCGAAGATAATGATCCCTGCGGTACCTTATTTTCAATCTATATTCCGAAAGTGAAACCTAATGACAGCTCCATTAACCCTATTGATCGTTGAGGACGAAACGCCGCTGGCAGAGATGCATGCGGAATATATTCGTCACATTCCCGGATTCAGTCAGATATTACTGGCGGGAAATCTGGCGCAGGccc > 1:647717/1‑289 (MQ=255) ggTCAGTACGCGTGCTGACGAGCCCGGTGAACATGGCATTGGGTTGTACTTGATTGCCAGCTACGTAACGCGCTGCGGTGGTGTTATCACTCTCGAAGATAATGATCCCTGCGGTACCTTATTTTCAATCTATATTCCGAAAGTGAAACCTAATGACAGCTCCATTAACCCTATTGATCGTTGAGGACGAAACGCCGCTGGCAGAGATGCATGCGGAATATATTCGTCACATTCCCGGATTCAGTCAGATATTACTGGCGGGAAATCTGGCGCAGGCCCGAAtgatga > 1:533566/1‑288 (MQ=255) aCGCGTGCTGACGAGCCCGGTGAACATGGCATTGGGTTGTACTTGATTGCCAGCTACGTAACGCGCTGCGGTGGTGTTATCACTCTCGAAGATAATGATCCCTGCGGTACCTTATTTTCAATCTATATTCCGAAAGTGAAACCTAATGACAGCTCCATTAACCCTATTGATCGTTGAGGACGAAACGCCGCTGGCAGAGATGCATGCGGAATATATTCGTCACATTCCCGGATTCAGTCAGATATTACTGGCGGGAAATCTGGCGCAGGCCCGAATGATGATCGAg < 1:1525177/286‑1 (MQ=255) cgcgTGCTGACGAGCCCGGTGAACATGGCATTGGGTTGTACTTGATTGACAGCTACGTAACGCGCTGCGGTGGTGTTATCACTCTCGAAGATAATGATCCCTGCGGTACCTTATTTTCAATCTATATTCCGAAAGTGAAACCTAATGACAGCTCCATTAACCCTATTGATCGTTGAGGACGAAACGCCGCTGGCAGAGATGCATGCGGAATATATTCGTCACATTCCCGGATTCAGTAAGATATTACTGGCgg < 2:1188273/253‑1 (MQ=255) gTGCTGACGGGCCCGGTGAACATGGCATTGGGTTGTACTTGATTGCCAGCTACGTAACGCGCTGCGGTGGTGTTATCACTCTCGAAGATAATGATCCCTGCGGTACCTTATTTTCAATCTATATTCCGAAAGTGAAACCTAATGACAGCTCCATTAACCCTATTGATCGTTGAGGACGAAACGCCGCTGGCAGAGATGCATGCGGAATATATTCGTCACATTCCCGGATTCAGTCAGATATTACTGGCGGGAAATCTGgcgc < 2:533824/262‑1 (MQ=255) tGCTGACGAGCCCGGTGAACATGGCATTGGGTTGTACTTGATTGCCAGCTACGTAACGCGCTGCGGTGGTGTTATCACTCTCGAAGATAATGATCCCTGCGGTACCTTATTTTCAATCTATATTCCGAAAGTGAAACCTAATGACAGCTCCATTAACCCTATTGATCGTTGAGGACGAAACGCCGCTGGCAGAGATGCATGCGGAATATATTCGTCACATTCCCGGATTCAGTCAGATATTACTGGCGGGAAATCTGGCGCAGGCCCGAATGATGATCGAGCGTTTTaa > 1:998578/1‑289 (MQ=255) gACGAGCCCGGTGAACATGGCATTGGGTTGTACTTGATTGCCAGCTACGTAACGCGCTGCGGTGGTGTTATCACTCTCGAAGATAATGATCCCTGCGGTACCTTATTTTCAATCTATATTCCGAAAGTGAAACCTAATGACAGCTCCATTAACCCTATTGAACGTTGAGGACGAAACGCCGCTGGCCGAGATGCATGCGGAATATAGTCGTCACATTCCCGGATTCACTCAGATATGACTGGCGGGAAATCTGGCGCAGGCCCGAACGATGCACTAGCGTTTAAAGCCg > 2:1652157/1‑289 (MQ=255) tGAACATGGCCTTGGGTTGTACTTGATTGCCAGCTACGTAACGCGCTGCGGTGGTGTTATCACTCTCGAAGATAATGATCCCTGCGGTACCTTATTTTCAATCTATATTCCGAAAGTGGCACCTAATGACATCTCCATTAACCCCATTGATCGTTGAGGAGGAAACGCCGCTGGCAGAGATGCATGCGGAATATGTTCGTCACATTCCCTGATTCAGTCAGATATTACTGGCGGGAAACCTGGGGCAGGCCCGAATGCTGATCGGCGGTTTTCAGGCGGGCCTAATGtt > 2:943630/1‑289 (MQ=255) tGAACATGGCATTGGGTTGTACTTGATTGCCAGCTACGTAACGCGCTGCGGTGGTGTTATCACTCTCGAAGATAATGATCCCTGCGGTACCTTATTTTCAATCTATATTCCGAAAGTGAAACCTAATGa < 2:1825896/129‑1 (MQ=255) aCATGGGATTGGGTTGTACTTGATTGCCAGCTACGTAACGCGCTGCGGGTGTGTTATCACTCTCGAAGATAATGATCCCTGCGGTACCTTATTTTCAATCTATATTCCGAAAGTGAAACCTAATGACAGCTCCATTAACCCTATTGATCGTTGAGGACGAAACGCCGCTGGCAGAGATGCATGCGGAATATATTCGTCACATTCCCGGATTCAGTCAGATATTACTGGCGGGAAATCTGGCGCAGGCCCGAATGATGATCGAGCGTTTTAAGCCGGGGCTAATCTTGCt < 2:1302392/289‑1 (MQ=255) aCATGGCATTGGGTTGTACTTAATTGCCAGCTACGTAACGCGCTGCGGTGGTGTTATCACTCTCGAAGATAATGATCCCTGCGGTACCTTATTTTCAATCTATATTCCGAAAGTGAAACCTAATGACAGCTCCATTAACCCTATTGATCGTTGAGGACGAAACGCCGCTGGCAGAGATGCATGCGGAATATATTCGTCACATTCCCGGATTCAGTCAGATATTACTGGCGGGAAATCTGGCGCAGGCCCGAATGATGATCGAGCGTTTTAAGCCGGGGCTAATCTTGCt < 1:1636022/289‑1 (MQ=255) ggCATTGGGTTGTACTTGATTGCCAGCTACGTAACGCGCTGCGGTGGTGTTATCACTCTCGAAGATAATGATCCCTGCGGTACCTTATTTTCAATCTATATTCCGAAAGTGAAACCTAATGACAGCTCCATTAACCCTATTGATCGTTGAGGACGAAACGCCGCTGGCAGAGATGCATGCGGAATATATTCGTCACATTCCCGGATTCAGTCAGATATTACTGGCGGGAAATCTGGCGCAGGCCCGAATGATGATCGAGCGTTTTAAGCCGGGGCTAATCTTGCTCGa < 2:79536/288‑1 (MQ=255) ggCATTGGGTTGTACTTGATTGCCAGCTACGTAACGCGCTGCGGTGGTGTTATCACTCTCGAAGATAATGATCCCTGCGGTACCTTATTTTCAATCTATATTCCGAAAGTGAAACCTAATGACAGCTCCATTAACCCTATTGATCGTTGAGGACGAAACGCCGCTGGCAGAGATGCATGCGGAATATATTCGTCACATTCCCGGATTCAGTCAGATACTACTGGCGGGAAATCTGGCGCAGGCCCGAATGATGATCGAGCGTTTTAAGCCGGGGCTAATCTTGCTCGAt < 2:738161/289‑1 (MQ=255) aTTGGGTTGTACTTGATTGCCAGCTACGTAACGCGCTGCGGTGGTGTTATCACTCTCGAAGATAATGATCCCTGCGGTACCTTATTTTCAATCTATATTCCGAAAGTGAAACCTAATGACAGCTCCATTAACCCTATTGATCGTTGAGGACGAAACGCCGCTGGCAGAGATGCATGCGGAATATATTCGTCACATTCCCGGATTCAGTCAGATATTACTGGCGGGAAATCTGGCGCAGGCCCGAATGCTGATCGAGCGTTTTAAGCCGGGGCTAATCTTGCCCTATaat > 2:1747026/1‑288 (MQ=255) ggTTGTACTTGATTGCCAGCTACGTAACGCGCTGCGGTGGTGTTATCACTCTCGAAGATAATGATCCCTGCGGTACCTTATTTTCAATCTATATTCCGAAAGTGAAACCTAATGACAGCTCCATTAACCCTATTGATCGTTGAGGACGAAACGCCGCTGGCAGAGATGCATGCGGAATATATTCGTCACATTCCCGGATTCAGTCAGATATTACTGGCGGGAAATCTGGCGCAGGCCCGAATGATGATCGAGCGTTTTAAGCCGGGGCTAATCTTGCTCGATAACTa > 1:117337/1‑287 (MQ=255) ggTTGTACTTGATTGCCAGCTACGTAACGCGCTGCGGTGGTGTTATCACTCTCGAAGATAATGATCCCTGCGGTACCTTATTTTCAATCTATATTCCGAAAGTGAAACCTAATGACAGCTCCATTAACCCTATTGATCGTTGAGGACGAAACGCCGCTGGCAGAGATGCATGCGGAATATATTCGTCACATTCCCGGATTCAGTCAGATATTACTGGCGGGAAATCTGGCGCAGGCCCGAATGATGATCGAGCGTTTTAAGCCGGGGCTAATCTTGCTCGATAACTa > 1:788132/1‑287 (MQ=255) tGTACTTGATTGCCAGCTACGTAACGCGCTGCGGTGGTGTTATCACTCTCGAAGATAATGATCCCTGCGGTACCTTATTTTCAATCTATATTCCGAAAGTGAAACCTAATGACAGCTCCATTAACCCTATTGATCGTTGAGGACGAAACGCCGCTGGCAGAGATGCATGCGGAATATATTCGTCACATTCCCGGATTCAGTCAGATATTACTGGCGGGAAATCTGGCGCAGGCCCGAATGATGATCGa > 2:1133178/1‑248 (MQ=255) tGTACTTGATTGCCAGCTACGTAACGCGCTGCGGTGGTGTTATCACTCTCGAAGATAATGATCCCTGCGGTACCTTATTTTCAATCTATATTCCGAAAGTGAAACCTAATGACAGCTCCATTAACCCTATTGATCGTTGAGGACGAAACGCCGCTGGCAGAGATGCATGCGGAATATATTCGTCACATTCCCGGATTCAGTCAGATATTACTGGCGGGAAATCTGGCGCAGGCCCGAATGATGATCGa < 1:1133178/248‑1 (MQ=255) ttccTTGATTGCCAGCTACGTAACGCGCTGCGGTGGTGTTATCACTCTCGAAGATAATGATCCCTGCGGTACCTTATTTTCAATCTATATTCCGAAAGTGAAACCTAATGACAGCTCCATTAACCCTATTGATCGTTGAGGACGAAACGCCGCTGGCAGAGATGCATGCGGAATATATTCGTCACATTCCCGGATTCAGTCAGATATTACTGGCGGGAAATCTGGCGCAGGCCCGAATGATGATCGAGCGTTTTAAGCCGGGGCTAATCTTGCTCGATAACTATCTTcc < 1:1906978/286‑1 (MQ=255) tACTTGATTGCCAGCTACGTAACGCGCTGCGGTGGTGTTATCACTCTCGAAGATAATGATCCCTGCGGTACCTTATTTTCAATCTATATTCCGAAAGTGAAACCTAATGACAGCTCCATTAACCCTATTGATCGTTGAGGACGAAACGCCGCTGGCAGAGATGCATGCGGAATATATTCGTCACATTCCCGGATtcagt > 1:1369809/1‑199 (MQ=255) tACTTGATTGCCAGCTACGTAACGCGCTGCGGTGGTGTTATCACTCTCGAAGATAATGATCCCTGCGGTACCTTATTTTCAATCTATATTCCGAAAGTGAAACCTAATGACAGCTCCATTAACCCTATTGATCGTTGAGGACGAAACGCCGCTGGCAGAGATGCATGCGGAATATATTCGTCACATTCCCGGATtcagt < 2:1369809/199‑1 (MQ=255) tACTTGATTGCCAGCTACGTAACGCGCTGCGGTGGTGTTATCACTCTCGAAGATAATGATCCCTGCGGTACCTTATTTTCAATCTATATTCCGAAAGTGAAACCTAATGACAGCTCCATTAACCCTATTGATCGTTGAGGACGAAACGCCGCTGGCAGAGATGCATGCGGAATATATTCGTCACATTCCCGGATTCAGTCAGATATTACTGGCGGGAAATCTGGCGCAGGCCCGAATGATGATCGAGCGTTTTAAGc < 1:834616/257‑1 (MQ=255) tACTTGATTGCCAGCTACGTAACGCGCTGCGGTGGTGTTATCACTCTCGAAGATAATGATCCCTGCGGTACCTTATTTTCAATCTATATTCCGAAAGTGAAACCTAATGACAGCTCCATTAACCCTATTGATCGTTGAGGACGAAACGCCGCTGGCAGAGATGCATGCGGAATATATTCGTCACATTCCCGGATTCAGTCAGATATTACTGGCGGGAAATCTGGCGCAGGCCCGAATGATGATCGAGCGTTTTAAGCGGGGGCTAATCTTGCCAGGTAAATATCTTCCt > 2:152227/1‑289 (MQ=255) tACTTGATTGCCAGCTACGTAACGCGCTGCGGTGGTGTTATCACTCTCGAAGATAATGATCCCTGCGGTACCTTATTTTCAATCTATATTCCGAAAGTGAAACCTAATGACAGCTCCATTAACCCTATTGATCGTTGAGGACGAAACGCCGCTGGCAGAGATGCATGCGGAATATATTCGTCACATTCCCGGATTCAGTCAGATATTACTGGCGGGAAATCTGGCGCAGGCCCGAATGATGATCGAGCGTTTTAAGCCGGGGCTAATCTTGCTCGATAACTATCtt > 1:740479/1‑286 (MQ=255) tACTTGATTGCCAGCTACGTAACGCGCTGCGGTGGTGTTATCACTCTCGAAGATAATGATCCCTGCGGTACCTTATTTTCAATCTATATTCCGAAAGTGAAACCTAATGACAGCTCCATTAACCCTATTGATCGTTGAGGACGAAACGCCGCTGGCAGAGATGAATGCGGAATATATTCGTCACATTCCCGGATTCAGTCAGATATTACTGGCGGGAAATCTGGCGCAGGCCCGAATGATGATCGAGCGTTTTAAGCCGGGGCTAATCTTGCTCGATAACTATCTTCCt > 1:1797381/1‑289 (MQ=255) gATTGCCAGCTACGTAACGCGCTGCGGTGGTGTTATCACTCTCGAAGATAATGATCCCTGCGGTACCTTATTTTCAATCTATATTCCGAAAGTGAAACCTAATGACAGCTCCATTAACCCTATTGATCGTTGAGGACGAAACGCCGCTGGCAGAGATGCATGCGGAATATATTCGTCACATTCCCGGATTCAGTCAGATATTACTGGCGGGAAATCTGGCGCAGGCCCGAATGATGATCGAGCGTTTTAAGCCGGGGCTAATCTTGCTCGATAACTATCTTCCTGACgg > 1:1412483/1‑289 (MQ=255) ttGCCAGCTACGTAACGCGCTGCGGTGGTGTTATCACTCTCGAAGATAATGATCCCTGCGGTACCTTATTTTCAATCTATATTCCGAAAGTGAAACCTAATGACAGCTCCATTAACCCTATTGATCGTTGAGGACGAAACGCCGCTGGCAGAGATGCATGCGGAATATATTCGTCACATTCCCGGATTCAGTCAGATATTACTGGCGGGAAATCTGGCGCAGGCCCGAATGATGATCGAGCGTTTTAAGCCGGGGCTAATCTTGCTCGATAACTATCTTCCTGACGGTa < 1:1576185/289‑1 (MQ=255) ttGCCAGCTACGTAACGCGCTGCGGTGGTGTTATCACTCTCGAAGATAATGATCCCTGCGGTACCTTATTTTCAATCTATATTCCGAAAGTGAAACCTAATGACAGCTCCATTAACCCTATTGATCGTTGAGGACGAAACGCCGCTGGCAGAGATGCATGCGGAATATATTCGTCACATTCCCGGATTCAGTCAGATATTACTGGCGGGAAATCTGGCGCAGGCCCGAATGATGATCGAGCGTTTTAAGCCGGGGCTAATCTTGCTCGATAACTATCTTCCTGACGGTa < 2:487128/289‑1 (MQ=255) ttGCCAGCTACGTAACGCGCTGCGGTGGTGTTATCACTCTCGAAGATAATGATCCCTGCGGTACCTTATTTTCAATCTATATTCCGAAAGTGAAACCTAATGACAGCTCCATTAACCCTATTGATCGTTGAGGACGAAACGCCGCTGGCAGAGATGCATGCGGAATATATTCGTCACATTCCAGGATTCAGTCAGATATTACTGGCGGGAAATCTGGCGCAGGCCCGAATGATGATCGAGCGTTTTAAGCCGGGGCTAATCTTGCTCGATAACTATCTTCCTGACGGTa < 1:1652157/289‑1 (MQ=255) gCCAGCTACGTAACGCTCTGAGTTGGTGTTATCACTCGCGAAGATACTGATCCCTGCGGTACCTTATTTTCAATCTATATTCCGAAAGTGAAACCTAATGACAGCTCCATTAACCCTATTGATCGTTGAGGACAAAACGCCGCTGGCAGAGATGCATGCGGAATATATTCGTCACATTCCCGGATTCAGTCAGATATTACTGGCGGGAAATCTGGCGCAGGCCCGAATGATGATCGAGCGTTTTAAGCCGGGGCTAATCTTGCTCGATAACTATCTTCCTGACGGTaga < 2:309806/289‑1 (MQ=255) gCCAGCTACGTAACGCGCTGCGGTGGTGTTATCACTCTCGAAGATAATGATCCCTGCGGTACCTTATTTTCAATCTATATTCCGAAAGTGAAACCTAATGACAGCTCCATTAACCCTATTGATCGTTGAGGACGAAACGCCGCTGGCAGAGATGCATGCGGAATATATTCGTCACATTCCCGGATTCAGTCAGATATTACTGGCGGGAAATCTGGCGCAGGCCCGAATGATGATCGAGCGTTTTAAGCCGGGGCTAATCTTGCTCGATAACTATCTTCCTGACGGTaga < 2:1608691/289‑1 (MQ=255) ccAGCTACGTAACGCGCTGCGGTGGTGTTATCACTCTCGAAGATAATGATCCCTGCGGTACCTTATTTTCAATCTATATTCCGAAAGTGAAACCTAATGACAGCTCCATTAACCCTATTGATCGTTGAGGACGAAACGCCGCTGGCAGAGATGCATGCGGAATATATTCGTCACATTCCCGGATTCAGTCAGATTTTACTGGCGGGAAATCTGGCGCAGGCACGAATGATGAACGAGCGATTTAAGCCGGGGCTAATCTGGCTCGTGAACTATCTTCATGagcgtggag > 2:525925/1‑281 (MQ=255) tGCGGTGGTGTTATCACTCTCGAAGATAATGATCCCTGCGGTACCTTATTTTCAATCTATATTCCGAAAGTGAAACCTAATGACAGCTCCATTAACCCTATTGATCGTTGAGGACGAAACGCCGCTGGCAGAGATGCATGCGGAATATATTCGTCACATTCCCGGATTCAGTCAGATATTACTGGCGGGAAATCTGGCGCa < 2:1793207/201‑1 (MQ=255) tGCGGTGGTGTTATCACTCTCGAAGATAATGATCCCTGCGGTACCTTATTTTCAATCTATATTCCGAAAGTGAAACCTAATGACAGCTCCATTAACCCTATTGATCGTTGAGGACGAAACGCCGCTGGCAGAGATGCATGCGGAATATATTCGTCACATTCCCGGATTCAGTCAGATATTACTGGCGGGAAATCTGGCGCAGGCCCGAATGATGATCGAGCGTTTTAAGCCGGGGCTAATCTTGCTCGATAACTATCTTCCTGACGGTAGAGGGATTAATTTACTGCa < 1:585533/288‑1 (MQ=255) tGCGGTGGTGTTATCACTCTCGAAGATAATGATCCCTGCGGTACCTTATTTTCAATCTATATTCCGAAAGTGAAACCTAATGACAGCTCCATTAACCCTATTGATCGTTGAGGACGAAACGCCGCTGGCAGAGATGCATGCGGAATATATTCGTCACATTCCCGGATTCAGTCAGATATTACTGGCGGGAAATCTGGCGCAGGCCCGAATGATGATCGAGCGTTTTAAGCCGGGGCTAATCTTGCTCGATAACTATCTTCCTGACGGTAGAGGGATTAATTTACTGCAt > 1:1041610/1‑289 (MQ=255) tGCGGTGGTGTTATCACTCTCGAAGATAATGATCCCTGCGGTACCTTATTTTCAATCTATATTCCGAAAGTGAAACCTAATGACAGCTCCATTAACCCTATTGATCGTTGAGGACGAAACGCCGCTGGCAGAGATGCATGCGGAATATATTCGTCACATTCCCGGATTCAGTCAGATATTACTGGCGGGAAATCTGGCGCAGGCCCGAATGATGATCGAGCGTTTTAAGCCGGGGCTAATCTTGCTCGATAACTATCTTCCTGACGGTAGAGGGATTAATTTACTGCAt > 1:516755/1‑289 (MQ=255) tggtgTTATCACTCTCGAAGATAATGATCCCTGCGGTACCTTATTTTCAATCTATATTCCGAAAGTGAAACCTAATGACAGCTCCATTAACCCTATTGATCGTTGAGGACGAAACGCCGCTGGCAGAGATGCATGCGGAATATATTCGTCACATTCCCGGATTCAGTCAGATATTACTGGCGGGAAATCTGGCGCAGGCCCGAATGATGATCGAGCGTTTTAAGCCGGGGCTAATCTTGCTCGATAACTATCTTCCTGACGGTAGAGGGATTAATTTACTGCATGAAc < 2:117337/288‑1 (MQ=255) aCTCTCGAAGATAATGATCCCTGCGGTACCTTATTTTCAATCTATATTCCGAAAGTGAAACCTAATGACAGCTCCATTAACCCTATTGATCGTTGAGGACGAAACGCCGCTGGCAGAGATGCATGCGGAATATATTCGTCACATTCCCGGATTCAGTCAGATATTACTGGCGGGAAATCTGGCGCAGGCCCGAATGATGATCGAGCGTTTTAAGCCGGGGCTAATCTTGCTCGATAACTATCTTCCTGACGGTaga < 2:666571/256‑1 (MQ=255) aCTCTCGAAGATAATGATCCCTGCGGTACCTTATTTTCAATCTATATTCCGAAAGTGAAACCTAATGACAGCTCCATTAACCCTATTGATCGTTGAGGACGAAACGCCGCTGGCAGAGATGCATGCGGAATATATTCGTCACATTCCCGGATTCAGTCAGATATTACTGGCGGGAAATCTGGCGCAGGCCCGAATGATGATCGAGCGTTTTAAGCCGGGGCTAATCTTGCTCGATAACTATCTTCCTGACGGTAGAGGGATTACTTTACTGCATGAACTGTTTCAGgc > 2:1042835/1‑288 (MQ=255) tctcGAAGATAATGATCCCTGCGGTACCTTATTTTCAATCTATATTCCGAAAGTGAAACCTAATGACAGCTCCATTAACCCTATTGATCGTTGAGGACGAAACGCCGCTGGCAGAGATGCATGCGGAATATATTCGTCACATTCCCGGATTCAGTCCGATATTACTGGCGGGAAATCTGGCGCATGCCCGCATGATGAACGACCGTTTTAAGCCTGGGCTAATCTTTCTCGGTAGACATCTTCCTGACGGTAGATGGATTAATTTACTTCTTGAACTgtgtcgagctgt > 2:1444220/1‑278 (MQ=255) tctcGAAGATAATGATCCCTGCGGTACCTTATTTTCAATCTATATTCCGAAAGTGAAACCTAATGACAGCTCCATTAACCCTATTGATCGTTGAGGACGAAACGCCGCTGGCAGAGATGCATGCGGAATATATTCGTCACATTCCCGGATTCAGTCAGATATTACTGGCGGGAAATCTGGCGCAGGCCCGAATGATGATCGAGCGTTTTAAGCCGGGGCTAATCt < 2:624571/225‑1 (MQ=255) tctcGAAGATAATGATCCCTGCGGTACCTTATTTTCAATCTATATTCCGAAAGTGAAACCTAATGACAGCTCCATTAACCCTATTGATCGTTGAGGACGAAACGCCGCTGGCAGAGATGCATGCGGAATATATTCGTCACATTCCCGGATTCAGTCAGATATTACTGGCGGGAAATCTGGCGCAGGCCCGAATGATGATCGAGCGTTTTAAGCCGGGGCTAATCTTGCTCGATAACTATCTTCCTGACGGTAGAGGGATTAATTTACTGCATGAACTGGTGCAGGCGCa > 1:356739/1‑289 (MQ=255) ctcGAAGATAATGATCCCTGCGGTACCTTATTTTCAATCTATATTCCGAAAGTGAAACCTAATGACAGCTCCATTAACCCTATTGATCGTTGAGGACGAAACGCCGCTGGCAGAGATGCATGCGGAATATATTCGTCACATTCCCGGATTCAGTCAGATATTACTGGCGGGAAATCTGGCGCAGGCCCGAATGATGATCGAGCGTTTTAAGCCGGGGCTAATCTTGCTCGATAACTATCTTCCTGACGGTAAAGGGATTAATTTACTGCATGAACTGGTGCCGGCCCAt > 2:1497635/1‑289 (MQ=255) aaTGATCCCTGCGGTACCTTATTTTCAATCTATATTCCGAAAGTGAAACCTAATGACAGCTCCATTAACCCTATTGATCGTTGAGGACGAAACGCCGCTGGCAGAGATGCATGCGGAATATATTCGTCACATTCCCGGATTCAGTCAGATATTACTGGCGGGAAATCTGGCGCAGGCCAGAATGATGATCGAGCGTGTTAAGCCGGGGCTAATCTTGCTCGATAAATATCTTCCTGACGGTAGAGGGATTAAATTACTGCATGAACTGGTGCAGGCGCATTAGCCCGGc > 1:43663/1‑289 (MQ=255) tCCCTGCGGTACCTTATTTTCAATCTATATTCCGAAAGTGAAACCTAATGACAGCTCCATTAACCCTATTGATCGTTGAGGACGAAACGCCGCTGGCAGAGATGCATGCGGAATATATTCGTCACATTCCCGGATTCAGTCAGATATTACTGGCGGGAAATCTGGCGCAGGCCCGAATGATGATCGAGCGTTTTAAGCCGGGGCTAATCTTGCTCGATAACTATCTTCCTGACGGTAGAGGGATTAATTTACTGCATGAACTGGTGCAGGCGCATTATCCCGGCGACg < 1:337658/288‑1 (MQ=255) cccTGCGGTACCTTATTTTCAATCTATATTCCGAAAGTGAAACCTAATGACAGCTCCATTAACCCTATTGATCGTTGAGGACGAAACGCCGCTGGCAGAGATGCATGCGGAATATATTCGTCACATTCCCGGATTCAGTCAGATATTACTGGCGGGAAATCTGGCGCAGGCCCGAATGATGATCGAGCGTTTTAAGCCGGGGCTAATCTTGCTCGATAACTATCTTCCTGACGGTAGAGGGATTAATTTACTGCATGAACTGGTGCAGGCGCATTATCCCGGCGACgtg < 2:356739/289‑1 (MQ=255) cTGCGGTACCTTATTTTCAATCTATATTCCGAAAGTGAAACCTAATGACAGCTCCATTAACCCTATTGATCGTTGAGGACGAAACGCCGCTGGCAGAGATGCATGCGGAATATATTCGTCACATTCCCGGATTCAGTCAGATATTACTGGCGGGAAATCTGGCGCAGGCCCGAATGATGATCGAGCGTTTTAAGCCGGGGCTAATCTTGCTCGATAACTATCTTCCTGACGGTAGAGGGATTAATTTACTGCATGAACTGGTGCAGGCGCATTATCCCgg < 2:1946273/280‑1 (MQ=255) cTGCGGTACCTTATTTTCAATCTATATTCCGAAAGTGAAACCTAATGACAGCTCCATTAACCCTATTGATCGTTGAGGACGAAACGCCGCTGGCAGAGATGCATGCGGAATATATTCGTCACATTCCCGGATTCAGTCAGATATTACTGGCGGGAAATCTGGCGCAGGCCCGAATGATGATCGAGCGTTTTAAGCCGGGGCTAATCTTGCTCGATAACTATCTTCCTGACGGTAGAGGGATTAATTTACTGCATGAAATGGTGCAGGCGCATTATCCCGGCGACgtggg > 1:1462609/1‑288 (MQ=255) cTGCGGTACCTTATTTTCAATCTATATTCCGAAAGTGAAACCTAATGACAGCTCCATTAACCCTATTGATCGTTGAGGACGAAACGCCGCTGGCAGAGATGCATGCGGAATATATTCGTCACATTCCCGGATTCAGTCAGATATTACTGGCGGGAAATCTGGCGCAGGCCCGAATGATGATCGAGCGTTTTAAGCCGGGGCTAATCTTGCTCGATAACTATCTTACTGAAGGTAGAGGGATTAATTTACTGCATGAACGTGTGCAGGCGCATTATCCCGGGGACgtggt > 2:134414/1‑289 (MQ=255) tGCGGTACCTTATTTTCAATCTATATTCCGAAAGTGAAACCTAATGACAGCTCCATTAACCCTATTGATCGTTGAGGACGAAACGCCGCTGGCAGAGATGCATGCGGAATATATTCGTCACATTCCCGGATTCAGTCAGATATTACTGGCGGGAAATGTGGCGCAGGCCCGTATGATGAACGAGCGTTTTAAGCAGGGGCTAATCTTGCTCGATAACTATCTTCCTGACGGTCGAGGGATTAATTTACTGCATTAACTGGTGCAGGGGCATAATCCCGGCTACgtggtg > 2:252920/1‑289 (MQ=255) tGCGGTACCTTATTTTCAATCTATATTCCGAAAGTGAAACCTAATGACAGCTCCATTAACCCTATTGATCGTTGAGGACGAAACGCCGCTGGCAGAGATGCATGCGGAATATATTCGTCACATTCCCGGATTCAGTCAGATATTACTGGCGGGAAATCTGGCGCAGGCCCGAATGATGATCGAGCGTTTTAAGCCGGGGCTAATCTTGCTCGATAACTATCTTCCTGACGGTAGAGGGATTAATTTACTGCATGCACTGGTGCACGCGCATTATCCCGGTGACggggtg > 2:1726018/1‑289 (MQ=255) tGCGGTACCTGAATTTCAATCTATATTCCTAAAGTTAAACCTAATGACATCTCCAATAACCCTATTGATCGTTGAGGACGAAACGCCGCTGGCAGAGATGCATACGGAATATATTCGTCACATTCCCGGATTCAGTCAGATATTACTGGCGGGAAATCTGGCGAAGGCCCGAATGATGATCGAGCGTTTTAAGCCGGGGCTAATCGTGCTCGATAACTATCTTCCTGACGGTAGAGGGATTAATTTACTGCATGAACTGGTGCAGGCGCATTATCCCGGCGACgtggtg < 1:1032808/289‑1 (MQ=255) ccTTATTTTCAATCTATATTCCGAAAGTGAAACCTAATGACAGCTCCATTAACCCTATTGATCGTTGAGGACGAAACGCCGCTGGCAGAGATGCATGCGGAATATATTCGTCACATTCCCGGATTCAGTCAGATATTACTGGCGGGAAATCTGGCGCAGGCCCGAATGATGATCGAGCGTTTTAAGCCGGGGCTAATCTTGCTCGATAACTATCTTCCTGACGGTAGAGGGATTAATTTACTGCATGAACTGGTGCAGGCGCATTATCCCGGCGACGTGGTGTTTAcc > 1:1692989/1‑288 (MQ=255) ||| ACTTGATAACGCCTTCGAAGCCAGCCTGCGTAGCGATGAAGGAAACAAGATCGTTGAATTATTCCTCAGCGATGAAGGCGATGATGTGGTGATTGAAGTCGCCGATCAGGGCTGCGGCGTTCCAGAGTCTCTACGAGACAAAATATTTGAGCAGGGGGTCAGTACGCGTGCTGACGAGCCCGGTGAACATGGCATTGGGTTGTACTTGATTGCCAGCTACGTAACGCGCTGCGGTGGTGTTATCACTCTCGAAGATAATGATCCCTGCGGTACCTTATTTAGTATCTATATTCCGAAAGTGAAACCTAATGACAGCTCCATTAACCCTATTGATCGTTGAGGACGAAACGCCGCTGGCAGAGATGCATGCGGAATATATTCGTCACATTCCCGGATTCAGTCAGATATTACTGGCGGGAAATCTGGCGCAGGCCCGAATGATGATCGAGCGTTTTAAGCCGGGGCTAATCTTGCTCGATAACTATCTTCCTGACGGTAGAGGGATTAATTTACTGCATGAACTGGTGCAGGCGCATTATCCCGGCGACGTGGTGTTTACC > CP042583/527171‑527730 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |