Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP042583 | 1,850,219 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP042583 | 1,850,219 | 0 | A | T | 99.5% | 467.3 / NA | 199 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (122/75); minor base C (0/1); total (122/77) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.84e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,850,220 | 0 | G | C | 99.5% | 460.3 / NA | 199 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base C (122/75); total (122/77) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.84e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | CP042583 | 1,850,221 | 0 | C | G | 99.0% | 462.9 / NA | 199 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/2); new base G (122/75); total (122/77) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.49e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 |
Only 100 of 199 total aligned reads displayed.
TTCTCTGGAAACATGTGTTCCGCAACGCCATGCTGCTGGTGATTGCCGGTTTTCCGGCGACGTTTATCAGCATGTTTTTTACCGGCAGCCTGCTGATTGAGGTGATGTTTAGTCTCAATGGTCTGGGCTTACTGGGCTACGAAGCGACCGTCAGCCGCGATTATCCTGTAATGTTTGGTACCTTGTATATTTTCACCCTGATTGGCCTGCTGCTGAATATTGTCAGTGATA‑TCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGAGCCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGAGCTTATG‑GATTTTCCTCGTCTT‑G‑TTTGGTTTGAGTTTGTGTTCTGAACTTATCGCCAACGATAAACCGTTGCTGGTGCGTTATGACGGCAGTTGGTATTTCCCGTTATTGAAAAACTACAGCGAAAGCGATTTTGGCGGCCCGCTGGCAAGTCAGGCTGATTATCAGGACCCGTGGCTGAAACAACGGCTGGAAAATAACGGCTGGGTACTGTG > CP042583/1849939‑1850499 ||| tGGAAACATGTGTTCCGCAACGCCATGCTGCTGGTGATTGCCGGTTTTCCGGCGACGTTTATCAGCATGTTTTTTACCGGCTCGCTGCTGATTGAGGTGATGTTTTCACTCAATGGTCTGGGCTTACTGGGCTACGAAGCGACCGTCTCGCGCGATTATCCTGTAATGTTTGGTACCTTGTATATTTTCACCCTGATTGGCCTGCTGCTGAATATTGTCAGTGATA‑TCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGccc < 1:1830488/289‑1 (MQ=255) tGGAAACATGTGTTCCGCAACGCCATGCTGCTGGTGATTGCCGGTTTTCCGGCGACGTTTATCAGCATGTTTTTTACCGGCTCGCTGCTGATTGAGGTGATGTTTTCACTCAATGGTCTGGGCTTACTGGGCTACGAAGCGACCGTCTCGCGCGATTATCCTGTAATGTTTGGTACCTTGTATATTTTCACCCTGATTGGCCTGCTGCTGAATATTGTCAGTGATA‑TCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGcc > 1:699002/1‑288 (MQ=255) tgtTCCGCAACGCCATGCTGCTGGTGATTGCCGGTTTTCCGGCGACGTTTATCAGCATGTTTTTTACCGGCTCGCTGCTGATTGAGGTGATGTTTTCACTAAATGGTCTGGGCTTACTGGGCTACGAAGCGACCGTCTCGCGCGATTATCCTGTAATGTTTGGTACCTTGTATATTTTCACCCTGATTGGCCTGCTGCTGAATATTGTCAGTGATA‑TCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCa < 2:1373914/288‑1 (MQ=255) ttCCGCAACGCCATGCTGCTGGTGATTGCCGGTTTTCCGGCGACGTTTATCAGCATGTTTTTTACCGGCTCGCTGCTGATTGAGGTGATGTTTTCACTCAATGGTCTGGGCTTACTGGGCTACGAAGCGACCGTCTCGCGCGATTATCCTGTAATGTTTGGTACCTTGTATATTTTCACCCTGATTGGCCTGCTGCTGAATATTGTCAGTGATA‑TCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAgg > 1:1261732/1‑288 (MQ=255) tgctgcTGGTGATTGCCGGTTTTCCGGCGACGTTTATCAGCATGTTTTTTACCGGCTCGCTGCTGATTGAGGTGATGTTTTCACTCAATGGTCTGGGCTTACTGGGCTACGAAGCGACCGTCTCGCGCGATTATCCTGTAATGTTTGGTACCTTGTATATTTTCACCCTGATTGGCCTGCTGCTGAATATTGTCAGTGATA‑TCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCATCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGt > 1:1048140/1‑289 (MQ=255) tgctgcTGGTGATTGCCGGTTTTCCGGCGACGTTTATCAGCATGTTTTTTACCGGCTCGCTGCTGATTGAGGTGATGTTTTCACTCAATGGTCTGGGCTTACTGGGCTACGAAGCGACCGTCTCGCGCGATTATCCTGTAATGTTTGGTACCTTGTATATTTTCACCCTGATTGGCCTGCTGCTGAATATTGTCAGTGATA‑TCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGt > 1:920656/1‑289 (MQ=255) gctgctGGTGATTGCCGGTTTTCCGGCGACGTTTATCAGCATGTTTTTTACCGGCTCGCTGCTGATTGAGGTGATGTTTTCACTCAATGGTCTGGGCTTACTGGGCTACGAAGCGACCGTCTCGCGCGATTATCCTGTAATGTTTGGTACCTTGTATATTTTCACCCTGATTGGCCTGCTGCTGAATATTGTCAGTGATA‑TCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGtt < 1:711710/289‑1 (MQ=255) tGCCGGTTTTCCGGCGACGTTTATCAGCATGTTTTTTACCGGCTCGCTGCTGATTGAGGTGATGTTTTCACTCAATGGTCTGGGCTTACTGGGCTACGAAGCGACCGTCTCGCGCGATTATCCTGTAATGTTTGGTACCTTGTATATTTTCACCCTGATTGGCCTGCTGCTGAATATTGTCAGTGATA‑TCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAAcc > 1:1702608/1‑289 (MQ=255) cATGTTTTTTACCGGCTCGCTGCTGATTGAGGTGATGTTTTCACTCAATGGTCTGGGCTTACTGGGCTACGAAGCGACCGTCTCGCGCGATTATCCTGTAATGTTTGGTACCTTGTATATTTTCACCCTGATTGGCCTGCTGCTGAATATTGTCAGTGATA‑TCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGGTTTCGTTATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATG‑GAttt > 2:112621/1‑289 (MQ=255) gTTTTTTACCGGCTCGCTGCTGATTGAGGTGATGTTTTCACTCAATGGTCTGGGCTTACTGGGCTACGAAGCGACCGTCTCGCGCGATTATCCTGTAATGTTTGGTACCTTGTATATTTTCACCCTGATTGGCCTGCTGCTGAATATTGTCAGTGATA‑TCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCCACTGGTCGTTATG‑GATTTTc > 2:228607/1‑288 (MQ=255) cgctgctgATTGAGGTGATGTTTTCACTCAATGGTCTGGGCTTACTGGGCTACGAAGCGACCGTCTCGCGCGATTATCCTGTAATGTTTGGTACCTTGTATATTTTCACCCTGATTGGCCTGCTGCTGAATATTGTCAGTGATA‑TCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATG‑GATTTTCCTCGTCTT‑g‑tttggt < 1:122275/287‑1 (MQ=255) ttGAGGTGATGTTTTCACTCAATGGTCTGGGCTTACTGGGCTACGAAGCGACCGTCTCGCGCGATTATCCTGTAATGTTTGGTACCTTGTATATTTTCACCCTGATTGGCCTGCTGCTGAATATTGTCAGTGATA‑TCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATG‑GATTTTCCTCGTCTT‑G‑TTTGGTTTGAGttt < 1:583714/288‑1 (MQ=255) atgttttcactcAATGGTCTGGGCTTACTGGGCTACGAAGCGACCGTCTCGCGCGATTATCCTGTAATGTTTGGTACCTTGTATATTTTCACCCTGATTGGCCTGCTGCTGAATCTTGTCCGTGATA‑TCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGCCTCAGCCCCGTCAATCCGGCCTGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATG‑GATTTTCCTCTTCGT‑GTTTTGGTTTG‑GTTTGTGTTCTGa > 2:357685/10‑289 (MQ=255) atgttttcactcAATGGTCTGGGCTTACTGGGCTACGAAGCGACCGTCTCGCGCGATTATCCTGTAATGTTTGGTACCTTGTATATTTTCACCCTGATTGGCCTGCTGCTGAATATTGTCAGTGATA‑TCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATG‑GATTTTCCTCGTCTT‑G‑TTTGGTTTGAGTTTGTGTTCTGa > 1:171953/10‑289 (MQ=255) ttttttctcttAATTGTCTTGGCTTACTGGGCTACGAAGCGACCGTCTCGCGCGATGTTCCTGTAATGTTTGGTACCTTGTATATTTTCACCCTGGTTGGCCTGCTGCTGAATATTGTCAGTGATA‑TCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATG‑GATTTTCCTCGTCTT‑G‑TTTGGTTTGAGTTTGTGTTCTGaa < 2:898210/282‑1 (MQ=255) ttttcactcAATGGTCTGGGCTTACTGGGCTACGAAGCGACCGTCTCGCGCGATTATCCTGTAATGTTTGGTACCTTGTATATTTTCACCCTGATTGGCCTGCTGCTGAATATTGTCAGTGATA‑TCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTAGTTATG‑GATTTTTCTCGGCTT‑T‑TTTGGTTTGAGGTTGTGTTCTGAACt > 1:1646307/7‑289 (MQ=255) ttcactcAATGGTCTGGGCTTACTGGGCTACGAAGCGACCGTCTCGCGCGATTATCCTGTAATGTTTGGTACCTTGTATATTTTCACCCTGATTGGCCTGCTGCTGAATATTGTCAGTGATA‑TCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGGCGTTGTG‑GGTTTTCCTCGTATT‑G‑CTGGGTTTGGGTTTGTGTTCTGAACTTa > 2:258235/5‑289 (MQ=255) tcactcAATGGTCTGGGCTTACTGGGCTACGAAGCGACCGTCTCGCGCGATTATCCTGTAATGTTTGGTACCTTGTATATTTTCACCCTGATTGGCCTGCTGCTGAATATTGTCAGTGATA‑TCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATG‑GATTTTCCTCGTCTT‑G‑TTTGGTTTGAGTTTGTGTTCTGAACTTa > 1:63225/4‑288 (MQ=255) actcAATGGTCTGGGCTTACTGGGCTACGAAGCGACCGTCTCGCGCGATTATCCTGTAATGTTTGGTACCTTGTATATTTTCACCCTGATTGGCCTGCTGCTGAATATTGTCAGTGATA‑TCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGGCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTTTG‑GATTTTCCTCGTCTT‑G‑TTTGGTTTGCGTTTGGGTTCTGAACTTAtg > 2:1478253/2‑287 (MQ=255) cAATGGTCTGGGCTTACTGGGCTACGAAGCGACCGTCTCGCGCGATTATCCTGTAATGTTTGGTACCTTGTATATTTTCACCCTGATTGGCCTGCTGCTGAATATTGTCAGTGATA‑TCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATG‑GCTTTTCCTCGTCTT‑G‑TTTGGTTTGAGTTTGTGTTCTGAACTTATCGCCa > 1:964556/1‑289 (MQ=255) aTGGTCTGGGCTTACTGGGCTACGAAGCGACCGTCTCGCGCGATTATCCTGTAATGTTTGGTACCTTGTATATTTTCACCCTGATTGGCCTGCTGCTGAATATTGTCAGTGATA‑TCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATG‑GATTTTCCTCGTCTT‑G‑TTTGGTTTGAGTTTGTGTTCTGAACTTATCGCCAAc > 1:184847/1‑289 (MQ=255) tCTGGGCTTACTGGGCTACGAAGCGACCGTCTCGCGCGATTATCCTGTAATGTTTGGTACCTTGTATATTTTCACCCTGATTGGCCTGCTGCTGAATATTGTCAGTGATA‑TCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCTCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCt > 2:244741/1‑220 (MQ=255) tCTGGGCTTACGGGGCTCCGAGGCGACCGTCTCGAGCGATTATCCTGTAATGTTTGGTACCTTGTATATTTTCACCCTGATTGGCCTGCTGCTGAATATTGTCAGTGATA‑TCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATG‑GATTTTCCTCGTCTT‑G‑TTTGGTTTGAGTTTGTGTTCTGAACTTATCGCCAACGAt < 1:1510855/288‑1 (MQ=255) cTGGGCTTACTGGGCTACGAAGCGACCGTCTCGCGCGATTATCCTGTAATGTTTGGTACCTTGTATATTTTCACCCTGATTGGCCTGCTGCTGAATATTGTCAGTGATA‑TCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATG‑GATTTTCCTCGTCTT‑G‑TTTGGTTTGAGTTTGTGTTCTGAACTTATCGCCAACGATaa < 1:1390402/289‑1 (MQ=255) tgcgCTTACTGGGCTACGAAGCGACCGTCTCGCGCGATTGTCCTGTGATGGTTGGTACCTTTTATATTTTCACCCTGATTGGCCTGCTGCTGAATATATTCAGTGTTA‑TCAGCTATACGCTAGTTGATCCGCTTCTTCATTTTGAGCGTCTTTAATGTCGCGACTTGGCGCCGTCAATCAGTCCCGTTGGGCTCGTTTTCGTCATAACCGTCCCGGCTACCTGTCCTTAGG‑GTTTGTCCTCGGCTT‑G‑TTTGGTTTGCATTGGTGTTCTGAACTTGTctcttatcccct > 2:525239/4‑277 (MQ=255) gggCTTACTGGGCTACGAAGCGACCGTATCGCGCGATTATCCTGTAATGCTTGGTACCTTGTATATTTTCACCCTGATTGGCCTGCTGCTGAATATTGTCAGTGATA‑TCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGAACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGTGCCAGTGTTCGTCTTAACCGTCGCGGCTACTGG‑TCGTCTGTGATTGTCCTAGTCTTGG‑TTTGGTTT‑ATGTTGTGTTTTGAACTTATCGCCacagttaat > 2:1566609/1‑280 (MQ=255) ttACTGGGCTACGAAGCGACCGTCTCGCGCGATTATCCTGTAATGTTTGGTACCTTGTATATTTTCACCCTGATTGGCCTGCTGCTGAATATTGTCAGTGATA‑TCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATG‑GATTTTCCTCGTCTT‑G‑TTTGGTTTGAGTTTGTGTTCTGAACTTATCGCCAACGATAAACCGtt > 1:254094/1‑289 (MQ=255) aCTGGGCTACGAAGCGACCGTCTCGCGCGATTATCCTGTAATGTTTGGTACCTTGTATATTTTCACCCTGATTGGCCTGCTGCTGAATATTGTCAGTGATA‑TCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATG‑GATTTTCCTCGTCTT‑G‑TTTGGTTTGAGTTTGTGTTCTGAACTTATCGCCAACGATAAACCGtt > 2:346841/1‑287 (MQ=255) aCTGGGCTACGAAGCGACCGTCTCGCGCGATTATCCTGTAATGTTTGGTACCTTGTATATTTTCACCCTGATTGGCCTGCTGCTGAATATTGTCAGTGATA‑TCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCCCGGCTACTGGTCGTTATG‑GGTTTTCCCTGTCTT‑G‑TTTGGTTTTGGTTTGTGTTCTGAACTTATTGCCAACGATAAACCGtt > 2:1390402/1‑287 (MQ=255) cTGGGCTACGAAGCGACCGTCTCGCGCGATTATCCTGTAATGTTTGGTACCTTGTATATTTTCACCCTGATTGGCCTGCTGCTGAATATTGTCAGTGATA‑TCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCTCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCCACTGGTCGTTATG‑GGTTTTCCTCGCTTT‑T‑TTTGGTTTGAGTTTGTGTTGTGATTTTATCACCCACgtaatagccgtgtg > 2:629492/1‑276 (MQ=255) cTGGGCTACGAAGCGACCGTCTCGCGCGATTATCCTGTAATGTTTGGTACCTTGTATATTTTCACCCTGATTGGCCTGCTGCTGAATATTGTCAGTGATA‑TCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATG‑GATTTTCCTCGTCTT‑G‑TTTGGTTTGAGTTTGTGTTCTGAACTTATCGCCAACGATAAACCGtt > 1:1301468/1‑286 (MQ=255) cTGGGCTACGAAGCGACCGTCTCGCGCGATTATCCTGTAATGTTTGGTACCTTGTATATTTTCACCCTGATTGGCCTGCTGCTGAATATTGTCAGTGATA‑TCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATG‑GATTTTCCTCGTCTT‑G‑TTTGGTTTGAGTTTGTGTTCTGAACTTATCGCCAACGATAAACCGTTgtt > 1:1670811/1‑287 (MQ=255) gCTACGAAGCGACCGTCTCGCGCGATTATCCTGTAATGTTTGGTACCTTGTATATTTTCACCCTGGTTGGCCTGCTGCTGAATATTGTCAGTGATA‑TCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATG‑GATTTTCCTCGTCTT‑G‑TTTGGTTTGAGTTTGTGTTCTGAACTTATCGCCAACGATAAACCGTTGCTGGt > 1:510063/1‑288 (MQ=255) gCTACGAAGCGACCGTCTCGCGCGATTATCCTGTAATGTTTGGTACCTTGTATATTTTCACCCTGATTGGCCTGCTGCTGAATATTGTCAGTGATA‑TCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATG‑GATTTGCCTCGTCTT‑G‑TTTGGTTTGCGTTTGTGTTCTGTATTTATCGCCAACGATAAACCGTTTCTGGTg > 2:1457615/1‑289 (MQ=255) cTACGAAGCGACCGTCTCGCGCGATTATCCTGTAATGTTTGGTACCTTGTATATTTTCACCCTGATTGGCCTGCTGCTGAATATTGTCAGTGATA‑TCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATG‑GATTTTCCTCGTCTT‑G‑TTTGGTTTGAGTTTGTGTTCTGAACTTATCGCCAACGATAAACCGTTGCTGGTg < 2:1805624/288‑1 (MQ=255) cGAAGCGACCGTCTCGCGCGATTATCCTGTAATGTTTGGTACCTTGTATATTTTCACCCTGATTGGCCTGCTGCTGAATATTGTCAGTGATA‑TCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATG‑GAtt > 2:1930779/1‑219 (MQ=255) cGAAGCGACCGTCTCGCGCGATTATCCTGTAATGTTTGGTACCTTGTATATTTTCACCCTGATTGGCCTGCTGCTGAATATTGTCAGTGATA‑TCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATG‑GAtt < 1:1930779/219‑1 (MQ=255) cGACCGTCTCGCGCGATTATCCTGTACTGTTTGGTACCTTGTATATTTTCACCCTGATTGGCCTGCTGCTGAATATTGTCAGTGATA‑TCAGCTATACCCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGCCGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGCTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTCTG‑GATTTTCCTCCTCTT‑G‑TTTGGGTTGAGTTTGTGTTCTGAACTTATGTCCCACGATAAACCGTTTCGAGTGCGTTATGag > 2:425090/1‑288 (MQ=255) cGACCGTCTCGCGCGATTATCCTGTAATGTTTGGTACCTTGTATATTTTCACCCTGATTGGCCTGCTGCTGAATATTGTCAGTGATA‑TCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATG‑GATTTTCCTCGTCTT‑g‑tttggt > 2:495974/1‑232 (MQ=255) gtctcgcgcgATTATCCTGTAATGTTTGGTACCTTGTATATTTTCACCCTGATTGGCCTGCTGCTGAATATTGTCAGTGATA‑TCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATG‑GATTTTCCTCGTCTT‑G‑TTTGGTTTTAGTTTGTGTTCTGCACTTATCGCCAACGATAAACCGTTGCTGGTGCGTTATGACGGCAg > 1:1287838/7‑289 (MQ=255) gtcccgcgcgATTATCCTGTAATGTTTGGTACCTTGTATATTTTCACCCTGATTGGCCTGCTGCTGAATATTGTCAGTGATA‑TCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATG‑GATTTTCCTCGTCTT‑G‑TTTGGTTTGGGTTCGTGTTCTGAACTTATCGCCCACGATAAACCGTTGCTGGTGCGTTATGACGGCAg > 1:1020859/7‑289 (MQ=255) cgATTATCCTGTAATGTTTGGTACCTTGTATATTTTCACCCTGATTGGCCTGCTGCTGAATATTGTCAGTGATA‑TCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATG‑GATTTTCCTCGTCTT‑G‑TTTGGTTTGAGTTTGTGTTCTGAACTTATCGCCAACGATAAACCGTTGCTGGTGCGTTATGACTGCAGTTGGTAtt > 1:840370/1‑289 (MQ=255) gATTATCCTGTAATGTTTGGTACCTTGTATATTTTCACCCTGATTGGCCTGCTGCTGAATATTGTCAGTGATA‑TCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATG‑GATTTTCCTCGTCTT‑G‑TTTGGTTTGAGTTTGTGTTCTGAACTTATCGCCAACGATAAACCGTTg > 1:602366/1‑260 (MQ=255) aTGTTTGGTACCTTGTATATTTTCACCCTGATTGGCCTGCTGCTGAATATTGTCAGTGATA‑TCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATG‑GATTTTCCTCGTCTT‑G‑TTTGGTTTGAGTTTGTGTTCTGAACTTATCGCCAACGATAAACCGTTGCTGGTGCGTTATGACGGCAGTTGGTATTTCCCGTTATTGaa > 1:1907992/1‑289 (MQ=255) aTGTTTGGTACCTTGTATATTTTCACCCTGATTGGCCTGCTGCTGAATATTGTCAGTGATA‑TCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATG‑GATTTTCCTCGTCTT‑G‑TTTGGTTTGAGTTTGTGTTCTGAACTTATCGCCAACGATAAACCGTTGCTGGTGCGTTATGACGGCAGTTGGTATTTCCCGTTATTGaa < 1:1022770/289‑1 (MQ=255) tttGGTACCTTGTATATTTTCACCCTGATTGGCCTGCTGCTGAATATTGTCAGTGCTA‑TCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCAACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGGGTCTACTGGACGTTATG‑GATTTTCCTCGTCTT‑G‑TTGGGTTGGAGTCTGTGTTCTGAACTTATCGTCAACGTTAACCCGTTGCTGGTGCGTTTGGATGGCGGTTGGTCTTTCCTGTTATTTaaaaa > 2:1070117/1‑289 (MQ=255) tACCTTGTATATTTTCACCCTGATTGGCCTGCTGCTGAATATTGTCAGTGATA‑TCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATG‑GATTTTCCTCGTCTT‑G‑TTTGGTTTGAGTTTGTGTTCTGAACTTATCGCCAACGATAAACCGTTGCTGGTGCGTTATGACGGCAGTTGGTATTTCCCGTTATTGAAAAACTACa > 1:541591/1‑289 (MQ=255) tACCTTGTATATTTTCACCCTGATTGGCCTGCTGCTGAATATTGTCAGTGATA‑TCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATG‑GATTTTCCTCGTCTT‑G‑TTTGGTTTGAGTTTGTGTTCTGAACTTATCGCCAACGATAAACCGTTGCTGGTGCGTTATGACGGCAGTTGGTATTTCCCGTTATTGAAAAACTACa > 2:1823224/1‑289 (MQ=255) tACCTTGTATATTTTCACCCTGATTGGCCTGCTGCTGAATATTGTCAGTGATA‑TCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATG‑GATTTTCCTCGTCTT‑G‑TTTGGTTTGAGTTTGTGTTCTGAACTTATCGCCAACGATAAACCGTTGCTGGTGCGTTATGACGGCAGTTGGTATTTCCCGTTATTGAAAAACTACa > 2:665133/1‑289 (MQ=255) tACCTTGTATATTTTCACCCTGATTGGCCTGCTGCTGAATATTGTCAGTGATA‑TCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATG‑GATTTTCCTCGTCTT‑G‑TTTGGTTTGAGTTTGTGTTCTGAACTTATCGCCAACGATAAACCGTTGCTGGTGCGTTATGACGGCAGTTGGTATTTCCCGTTATTGAAAAACTACa > 1:87263/1‑289 (MQ=255) tGTATATTTTCACCCTGATTGGCCTGCTGCTGAATATTGTCAGTGATA‑TCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATG‑GATTTTCCTCGTTTT‑G‑TTTGGTTTGAGTTTGTGTTCTGAACTTATCGCCAACGATAAACCGTTTCTGGGTCGTTATGACGGGAGTTGGTATTTCCTGTTATTTAATAACTACAGCGaa > 2:1343461/1‑289 (MQ=255) tGTATATTTTCACCCTGATTGGCCTGCTGCTGAATATTGTCAGTGATA‑TCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATG‑GATTTTCCTCGTCTT‑T‑TTTGGTTTGAGTTTGTGGTCTGAACTTATCGCCAACGATAAACTGTTGCTGGTTCGTTATGACGTCCGTTGGTATTTCCCTTTATTGAAAAACTACatccaa > 2:929836/1‑284 (MQ=255) tGTATATTTTCACCCTGATTGGCCTGCTGCTGAATATTGTCAGTGATA‑TCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATG‑GATTTTCCTCGTCTT‑G‑TTTGGTTTGAGTTTGTGTTCTGAACTTATCGCCAACGATAAACCGTTGCTGGTGCGTTATGACGGCAGTTGGTATTTCCCGTTATTGAAAAACTACAGCGaa > 1:80574/1‑289 (MQ=255) tGTATATTTTCACCCTGATTGGCCTGCTGCTGAATATTGTCAGTGATA‑TCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATG‑GATTTTCCTCGTCTT‑G‑TTTGGTTTGAGTTTGTGTTCTGAACTTATCGCCAACGATAAACCGTTGCTGGTGCGTTATGACGGCAGTTGGTATTTCCCGTTATTGAAAAACTACAGCGaa > 1:217465/1‑289 (MQ=255) tGTATATTTTCACCCTGATTGGCCTGCTGCTGAATATTGTCAGTGATA‑TCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATG‑GATTTTCCTCGTCTT‑G‑TTTGGTTTGAGTTTGTGTTCTGAACTTATCGCCAACGATAAACCGTTGCTGGTGCGTTATGACGGCAGTTGGTATTTCCCGTTATTGAAAAACTACAGCGaa > 2:1151923/1‑289 (MQ=255) aCCCTGATTGGCCTGCTGCTGAATATTGTCAGTGATA‑TCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATG‑GATTTTCCTCGTCTT‑G‑TTTGGTTTGAGTTTGTGTTCTGAACTTATCGCCAACGATAAACCGTTGCTGGTGCGTTATGACGGCAGTTGGTATTTCCCGTTATTGAAAAACTACAGCGAAAGCGATTTTg > 1:1549592/1‑288 (MQ=255) cccTGATTGGCCTGCTGCTGAATATTGTCAGTGATA‑TCAGCTATCCGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATG‑GATTTTCCTCGTCTT‑G‑TTTGGCTTGTGTTTGTGTTCTGAACTTATCGCCAACGATAAACCGTTTCTGGTGCGTTATGACGGCCGTTGGTCTTTCCCGTTATTGAACACACATCGCCAAAGCGAtttttgg > 2:852598/1‑286 (MQ=255) cccTGATTGGCCTGCTGCTGAATATTGTCAGTGATA‑TCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTcg < 2:1707687/141‑1 (MQ=255) cccTGATTGGCCTGCTGCTGAATATTGTCAGTGATA‑TCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTcg > 1:1707687/1‑141 (MQ=255) cccTGATTGGCCTGCTGCTGAATATTGTCAGTGATA‑TCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTCCTGGTCGTTATG‑GATTTTCCTCGTCTT‑G‑TTTGGTTTGTGTTTGTGTTCTGAACTTTTCGCCAACGCTAAACCGTTGCTGGTGCGTTATGACGGCCTTTTGTTTTTCACGTTATTCAAAAACTACAGCGATAGCGATTTTggc > 2:1492975/1‑289 (MQ=255) tGATTGGCCTGCTGCTGAATATTGTCAGTGATA‑TCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATG‑GATTTTCCTCGTCTT‑G‑TTTGGTTTGAGTTTGTGTTCTGAACTTATCGCCAACGATAAACCGTTGCTGGTGCGTTATGACGGCAGTTGGTATTTCCCGTTATTGAAAAACTACAGCGAAAGCGATTTTggcggc < 2:80574/289‑1 (MQ=255) aTTGGCCTGCTGCTGAATATTGTCAGTGATA‑TCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATG‑GATTTTCCTCGTCTT‑G‑TTTGGTTTGAGTTTGTGTTCTGAACTTATCGCCAACGATAAACCGTTGCTGGTGCGTTATGACGGCAGTTGGTATTTCCCGTTATTGAAAAACTACAGCGAAAGCGATTTTGGCGGccc > 1:1413748/1‑289 (MQ=255) ccTTCTGCTTAATATTTTC‑GTTATGTTCATCTATATGTTGGTTGATCCGCGTATTGTTTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATG‑GATTTTCCTCGTCTT‑G‑TTTGGTTTGAGTTTGTGTTCTGAACTTATCGCCAACGATAAACCGTTGCTGGTGCGTTATGACGGCAGTTGGTATTTCCCGTTATTGAAAAACTACAGCGAAAGCGATTTTGGCGGCCCGCTg < 2:1646307/288‑1 (MQ=255) gAATATTGTCAGTGATA‑TCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATG‑GATTTTCCTCGTCTT‑G‑TTTGGTTTGAGTTTGTGTTCTGAACTTATCGCCAACGATAAACCGTTGCTGGTGCGTTATGACGGCAGTTGGTATTTCCCGTTATTGAAAAACTACAGCGAAAGCGATTTTGGCGGCCCGCTGGCAAGTCAgg < 1:1587957/289‑1 (MQ=255) atcttttCAGTGATA‑TCGGTGATACGCGGGTTGATCCGCGTAGTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATG‑GATTTTCCTCGTCTT‑G‑TTTGGTTTGAGTTTGTGTTCTGAACTTATCGCCAACGATAAACCGTTGCTGGTGCGTTATGACGGCAGTTGGTATTTCCCGTTATTGAAAAACTACAGCGAAAGCGATTTTGGCGGCCCGCTGGCAAGTCAGGCt < 2:1702608/283‑1 (MQ=255) tatTGTCAGTGATA‑TCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATG‑GATTTTCCTCGTCTT‑G‑TTTGGTTTGAGTTTGTGTTCTGAACTTATCGCCAACGATAAACCGTTGCTGGTGCGTTATGACGGCAGTTGGTATTTCCCGTTATTGAAAAACTACAGCGAAAGCGATTTTGGCGGCCCGCTGGCAAGTCAGGCTg < 1:1151923/289‑1 (MQ=255) tatTGTCAGTGATA‑TCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATG‑GATTTTCCTCGTCTT‑G‑TTTGGTTTGAGTTTGTGTTCTGAACTTATCGCCAACGATAAACCGTTGCTGGTGCGTCATGACGGCAGTTGGTATTTCCCGTTATTGAAAAACTACAGCGAAAGCGATTTTGGCGGCCCGCTGGCAAGTCAGGCTg < 1:344902/289‑1 (MQ=255) tGTCAGTGATA‑TCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATG‑GATTTTCCTCGTCTT‑G‑TTTGGTTTGAGTTTGTGTTCTGAACTTATCGCCAACGATAAACCGTTGCTGGTGCGTTATGACGGCAGTTGGTATTTCCCGTTATTGAAAAACTACAGCGAAAGCGATTTTGGCGGCCCGCTGGCAAGTCAGGc < 2:1111352/284‑1 (MQ=255) tGTCAGTGATA‑TCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATG‑GATTTTCCTCGTCTT‑G‑TTTGGTTTGAGTTTGTGTTCTGAACTTATCGCCAACGATAAACCGTTGCTGGTGCGTTATGACGGCAGTTGGTATTTCCCGTTATTGAAAAACTACAGCGAAAGCGATTTTGGCGGCCCGCTGGCAAGTCAGGc > 1:1111352/1‑284 (MQ=255) tCAGTGATA‑TCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATG‑GATTTTCCTCGTCTT‑G‑TTTGGTTTGAGTTTGTGTTCTGAACTTATCGCCAACGATAAACCGTTGCTGGTGCGTTATGACGGCAGTTGGTATTTCCCGTTATTGAAAAACTACAGCGAAAGCGATTTTGGCGGCCCGCTGGCAAGTCAGGCTGATTa > 1:68829/1‑288 (MQ=255) tCAGTGATA‑TCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATG‑GATTTTCCTCGTCTT‑G‑TTTGGTTTGAGTTTGTGTTCTGAACTTATCGCCAACGATAAACCGTTGCTGGTGCGTTATGACGGCAGTTGGTATTTCCCGTTATTGAAAAACTACAGCGAAAGCGATTTTGGCGGCCCGCTGGCAAGTCAGGCTGATTa > 1:554183/1‑288 (MQ=255) tCAGTGATA‑TCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATG‑GATTTTCCTCGTCTT‑G‑TTTGGTTTGAGTTTGTGTTCTGAACTTATCGCCAACGATAAACCGTTGCTGGTGCGTTATGACGGCAGTTGGTATTTCCCGTTATTGAAAAACTACAGCGAAAGCGATTTTGGCGGCCCGCTGGCAAGTCAGGCTGATTAt > 2:1610873/1‑289 (MQ=255) gTGATA‑TCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATG‑GATTTTCCTCGTCGT‑G‑TTTGGTTTGAGTTTGTGTTCTGAACTTATCGCCAACGATAAACCGTTGCTGGTGCGTTATGACGGCAGTTGGTATTTCCCGTTATTGAAAAACTACAGCGAACGCGATTTTGGCGGCCAGCTGGCAAGTCAGGCTGATTATCAg > 1:1677062/1‑289 (MQ=255) gATA‑TCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATG‑GATTTTCCTCGTCTT‑G‑TTTGGTTTGAGTTTGTGTTCTGAACTTATCGCCAACGATAAACCGTTGCTGGTGCGTTATGACGGCAGTTGGTATTTCCCGTTATTGAAAAACTACAGCGAAAGCGATTTTGGCGGCCCGCTGGCAAGTCAGGCTGATTATCa < 1:1478253/286‑1 (MQ=255) ata‑tCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATG‑GATTTTCCTCGTCTT‑G‑TTTGGTTTGAGTTTGTGTTCTGAACTTATCGCCAACGATAAACCGTTGCTGGTGCGTTATGACg < 2:585678/206‑1 (MQ=255) a‑tCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATG‑GATTTTCCTCGTCTT‑G‑TTTGGTTTGAGTTTGTGTTCTGAACTTATCGCCAACGATAAACCGTTGCTGGTGCGTTATGACGGCAGTTGGTATTTCCCGTTATTGAAAAACTACAGCGAAAGCGATTTTGGCGGCCCGCTGGCAAGTCAGGCTGATTATCAGGAccc < 1:196073/289‑1 (MQ=255) a‑tCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTGATG‑GATTTTCCTCGTCTT‑G‑TTTGGTTTGAGTTTGTGTTCTGAACTTATCGCCAACGATAAACCGTTGCTGGTGCGTTATGACGGCAGTTGGTATTTCCCGTTATTGCAAAACTACATCGAAAACGATTTTGGCGGCCCGCTGGCCAGTCAGGCTGATTagccttgct > 2:1898046/1‑280 (MQ=255) taCGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATG‑GATTTTCCTCGTCTT‑G‑TTTGGTTTGAGTTTGTGTTCTGAACTTATCGCCAACGATAAACCGTTGCTGGTGCGTTATGACGGCCGTTGGTATTTCCCGTTATTGAAAAACTACAGGTAAAGAGATTTTGGCTGCCCGCTGGCCAGGTAGGCTGAATAACACGACGCGTAGCTGa > 2:870477/1‑289 (MQ=255) aCGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATG‑GATTTTCCTCGTCTT‑G‑TTTGGTTTGAGTTTGTGTTCTGAACTTATCGCCAACGATAAACCGTTGCTGGTGCGTTATGACGGCAGTTGGTATTTCCCGTTATTGAAAAACTACAGCGAAAGCGATTTTGGCGGCCCGCTGGCAAGTCAGGCTGATTATCAGGACCCGTGGCTGaa > 1:457132/1‑289 (MQ=255) ggTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATG‑GATTTTCCTCGTCTT‑G‑TTTGGTTTGAGTTTGTGTTCTGAACTTATCGCCAACGATAAACCGTTGCTGGTGCGTTATGACGGCAGtt < 1:35382/196‑1 (MQ=255) gTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATG‑GATTTTCCTCGTCTT‑G‑TTTGGTTTGAGTTTGTGTTCTGAACTTATCGCCAACGATAAGCCGTTGCTGGTGCGTTATGACGGCAGTTGGTATTTCCCGTTATTGAAAAACTACAGCGAAAGCGATTTTGGCGGCCCGCTGGCAAGTCAGGCTGATTATCAGGACCCGTGGCTGAAACAACg > 1:1443904/1‑289 (MQ=255) gTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATG‑GATTTTCCTCGTCTT‑G‑TTTGGTTTGAGTTTGTGTTCTGAACTTATCGCCAACGATAAACCGTTGCTGGTGCGTTATGACGGCAGTTGGTATTTCCCGTTATTGAAAAACTACAGCGAAAGCGATTTTGGCGGCCCGCTGGCAAGTCAGGCTGATTATCAGGACCCGTGGCTGAAACAACg > 1:1811035/1‑289 (MQ=255) gTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATG‑GATTTTCCTCGTCTT‑G‑TTTGGTTTGAGTTTGTGTTCTGAACTTATCGCCAACGATAAACCGTTGCTGGTGCGTTATGACGGCAGTTGGTATTTCCCGTTATTGAAAAACTACAGCGAAAGCGATTTTGGCGGCCCGCTGGCAAGTCAGGCTGATTATCAGGACCCGTGGCTGAAACAACg > 1:329738/1‑289 (MQ=255) ttGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATG‑GATTTTCCTCGTCTT‑G‑TTTGGTTTGAGTTTGTGTTCTGAACTTATCGCCAACGATAAACCGTTGCTGGTGCGTTATGACGGCAGTTGGTATTTCCCGTTATTGAAAAACTACAGCGAAACCGGTTTTGGCGGCCCGCTGGCAAGTCAGGCTGATTATAGGGACCCGTGGCTGAAACAACga > 1:608693/1‑288 (MQ=255) tCCGCGTATTGATTTTGAGTGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCTCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATG‑GATTTTCCTCGTCTT‑G‑TTTGGTTTGAGTTTGTGTTCTGAACTTATCGCCAACGATAAACCGTTGCTGGTGCGTTATGACGGCAGTTGGTATTTCCCGTTATTGAAAAACTACAGCGAAAGCGATTTTGGCGGCCCGCTGGCAAGTCAGGCTGATTATCAGGACCCGTGGCTGAAACAACGGCTg < 1:1887620/288‑1 (MQ=255) tCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTgg < 2:635747/96‑1 (MQ=255) tCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATG‑GATTTTCCTCGTCTT‑G‑TTTGGTTTGAGTTTGTGTTCTGAACTTATCGCCAACGATAAACCGTTGCTGGTGCGTTATGACGGCAGTTGGTATTTCCCGTTATTGAAAAACTACAGCGAAAGCGATTTTGGCGGCCCGCTGGCCAGTCAGGCTGATTATCAGGACCCGTGGCTGAAACAACGGCTgg > 1:1098051/1‑289 (MQ=255) tCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTGTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATG‑GATTTTCCTCGTCTT‑G‑TTTGGTTTGAGTTTGTGTTCTGAACTTATCGCCAACGATAAACCGTTGCTGGTGCGTTATGACGGCAGTTGGTATTTCCCGTTATTGAAAAACTACAGCGAAAGCGATTTTGGCGGCCCGCTGGCAAGTCAGGCTGATTATCAGGACCCGTGGCTGAAACAACGGCTgg < 2:171953/289‑1 (MQ=255) gTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATG‑GATTTTCCTCGTCTT‑G‑TTTGGTTTGAGTTTGTGTTCTGAACTTATCGCCAACGATAAACCGTTGCTGGTGCGTTATGACGGCAGTTGGTATTTCCCGTTATTGAAAAACTACAGCGAAAGCGATTTTGGCGGCCCGCTGGCAAGTCAGGCTGATTATCAGGACCCGTGGCTGAAACAACGGCTGGAAAAt > 1:1458890/1‑289 (MQ=255) agtgtGATTGTGAGGGAGGTGAATGTGGCGCCGCAGCCCGGCCAATCAGGCCCGGTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTTCTTGTCGTTATG‑GATTTTCCTCGTCTT‑G‑TTTGGTTTGAGTTGGTGTTCTGAACTTGTCGCCAACGATAAACCGTTGCTGGTGCGTTATGACGGCAGTTGGTATTTCCCGTTATTGAAAAACTACAGCGAAAGCGATTTTGGCGGCCCGCTGGCAAGTCAGGCTGATTATCAGGACCCGTGGCTGAAACAACGGCTGGAAAAt < 2:1042650/285‑1 (MQ=255) aTTGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATG‑GATTTTCCTCGTCTT‑G‑TTTGGTTTGAGTTTGTGTTCTGAACTTATCGCCAACGATAAACCGTTGCTGGTGCGTTATGACGGCAGTTGGTATTTCCCGTTATTGAAAAACTACAGCGAAAGCGATTTTGGCGGCCCGCTGGCAAGTCAGGCTGATTATCAGGACCCGTGGCTGAAACAACGGCTGGAAAATaa < 2:383384/289‑1 (MQ=255) ttGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATG‑GATTTTCCTCGTCTT‑G‑TTTGGTTTGAGTTTGTGTTCTGAACTTATCGCCAACGATAAACCGTTGCTGGTGCGTTATGAC‑GCAGTTGGTATTTCCCGTTATTGAAAAACTACAGCGAAAGCGATTTTGGCGGCCCGCTGGCAAGTCAGGCTGATTATCAGGACCCGTGGCTGAAACAACGGCTGGAAAATAACg < 2:1282460/289‑1 (MQ=255) tGATTTTGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATG‑GATTTTCCTCGTCTT‑G‑TTTGGTTTGAGTTTGTGTTCTGAACTTATCGCCAACGATAAACCGTTGCTGGTGCGTTATGACGGCAGTTGGTATTTCCCGTTATTGAAAAACTACAGCGAAAGCGATTTTGGCGGCCCGCTGGCAAGTCAGGCTGATTATCAGGACCCGTGGCTGAAACAACGGCTGGAAAATAACg < 1:417018/289‑1 (MQ=255) gtaTTTTGGGGACCGTTAATGCTCCGACTCACCCCCGTCATTCGGGCCCTTTGGGCGCGTTTTCGTCCTAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATG‑GATTTTCCTCGTCTT‑G‑TTTGGTTTGAGTTTGTGTTCTGAACTTATCGCCAACGATAAACCGTTGCTGGCGCGTTATGACGGCAGTTGGTATTTCCCGTTATTGAAAAACTACAGCGAAAGCGATTTTGGCGGCCCGCTGGCAAGTCAGGCTGATTATCAGGACCCGTGGCTGAAACAACGGCTGGAAAATAACg < 2:1848516/287‑1 (MQ=255) taTTTTGTGGGCCGTTAAGTTCGCGACGCAGCTCCGTCAATCAGGCCCGTTGTGCGCGGTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATG‑GATTTTCATCGTCTT‑G‑TTGGGTTTGAGTTTGGGTTCTGAACTTATCGCCAACGATAAACCGTTGCTGGTGCGTTATGACGGCAGTTGGTATTTCCCGTTATTGAAAAACTACAGCGAAAGCGATTTTGGCGGCCCGCTGGCAAGTCAGGCTGATTATCAGGACCCGTGGCTGAAACAACGGCTGGAAAATAACgg < 2:1364702/288‑1 (MQ=255) tttttGA‑GGTCGTTAACGTCCCTACTCTGCCCCGTCAGTCACGCCCGTTGGGCGCGGTTTCGTCCTAACCGTTGCGGCTACTGTTTGTTATG‑GATGTTCTTCGTCTT‑G‑TTTGGTTTGAGTTTGTGTTCTGAATTTATCGCCAACGATAAACTGTTGCTGGTGCGTTATGTAGGCAGTTGGTATTTCCCGTTATTGAAAAACTACAGCGAAAGCGATTTTGGCGGCCCGCTGGCAAGTCAGGCTGAGTATCAGGACCCGTGGCTGAAACAACGGCTGGAAAATAACGGCt < 2:1020859/288‑1 (MQ=255) ttttGAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATG‑GATTTTCCTCGTCTT‑G‑TTTGGTTTGAGTTTGTGTTCTGAACTTATCGCCAACGATAAACCGTTGCTGGTGCGTTATGACGGCAGTTGGTATTTCCCGTTATTGAAAAACTACAGCGAAAGCGATTTTGGCGGCCCGCTGGCAAGTCAGGCTGATTATCAGGACCCGTGGCTGAAACAACGGCTGGAAAATAACGGCt < 1:659237/289‑1 (MQ=255) gAGGGACGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATG‑GATTTTCCTCGTCTT‑G‑TTTGGTTTGAGTTTGTGTTCTGAACTTATCGCCAACGATAAACCGTTGCTGGTGCGTTATGACGGCAGTTGGTATTTCCCGTTATTGAAAAACTACAGCGAAAGCGATTTTGGCGGCCCGCTGGCAAGTCAGGCTGATTATCAGGACCCGTGGCTGAAACAACGGCTGGAAAATAACGGCTGGGt < 1:1610873/289‑1 (MQ=255) aCGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATG‑GATTTTCCTCGTCTT‑G‑TTTGGTTTGAGTTTGTGTTCTGAACTTATCGCCAACGATAAACCGTTGCTGGTGCGTTATCACGGCAGTTGGTATTTCCCGTTATTGAAAAACTACAGCGAAAGCGATTTTGGCGGCCCGCTGGCAAGTCAGGCTGATTATCCGGACCCGTGGCTGAAACCACGGCCGGCAAAACACGGCTGGGtccctg > 2:888560/1‑284 (MQ=255) cGTTAATGTCGCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGTCGTTATG‑GATTTTCCTCGTCTT‑G‑TTTGGTTTGAGTTTGTGTTCTGAACTTATCGCCAACGATAAACCGTTGCTGGTGCGTTATGACGGCAGTTGGTATTTCCCGTTATTGAAAAACTACAGCGAAAGCGATTTTGGCGGCCCGCTGGCAAGTCAGGCTGATTATCAGGACCCGTGGCTGAAACAACGGCTGGAAAATAACGGCTGGGTACtgtg > 2:12428/1‑289 (MQ=255) ||| TTCTCTGGAAACATGTGTTCCGCAACGCCATGCTGCTGGTGATTGCCGGTTTTCCGGCGACGTTTATCAGCATGTTTTTTACCGGCAGCCTGCTGATTGAGGTGATGTTTAGTCTCAATGGTCTGGGCTTACTGGGCTACGAAGCGACCGTCAGCCGCGATTATCCTGTAATGTTTGGTACCTTGTATATTTTCACCCTGATTGGCCTGCTGCTGAATATTGTCAGTGATA‑TCAGCTATACGCTGGTTGATCCGCGTATTGATTTTGAGGGACGTTAATGAGCCGACTCAGCCCCGTCAATCAGGCCCGTTGGGCGCGTTTTCGTCATAACCGTCGCGGCTACTGGAGCTTATG‑GATTTTCCTCGTCTT‑G‑TTTGGTTTGAGTTTGTGTTCTGAACTTATCGCCAACGATAAACCGTTGCTGGTGCGTTATGACGGCAGTTGGTATTTCCCGTTATTGAAAAACTACAGCGAAAGCGATTTTGGCGGCCCGCTGGCAAGTCAGGCTGATTATCAGGACCCGTGGCTGAAACAACGGCTGGAAAATAACGGCTGGGTACTGTG > CP042583/1849939‑1850499 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |