| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP042583 | 1,851,029 | 3 bp→TCG | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP042583 | 1,851,029 | 0 | A | T | 99.5% | 500.6 / ‑4.9 | 211 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (111/99); minor base . (1/0); total (112/99) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| * | CP042583 | 1,851,030 | 0 | G | C | 99.5% | 492.3 / ‑5.8 | 211 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base C (110/99); minor base T (1/0); total (112/99) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.70e-01 | |||||||||||
| * | CP042583 | 1,851,031 | 0 | C | G | 99.5% | 487.6 / NA | 211 | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base G (111/99); total (112/99) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 | |||||||||||
Only 100 of 211 total aligned reads displayed.
TTGAAGTATGGAGCGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGTACAGCCTAACTTCTGGTGGCTGCTGGCAATTACTGTCTTGTTTGGCTGGATGAGTCTGGTCGGCGTGGTGCGGGCGGAGTTTTTACGTACTCGTAATTTCGACTACATTCGTGCGGCACAGGCGCTTGGCGTCAGCGATCGCAGTATCATCCTGCGTCATATGTTGCCTAATGCCATGGTCGCGACCCTCACCTTTTTACCGTTTATTTTATGTAGTAGCATA‑ACCACCCTGA‑CCAGCCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTAGTCCGAGTCTCGG‑TGAACTGCTGTTACAAGGGAAAAATAACCTTCAGGCCCCGTGGCTTGGGATCACCGCCTTCTTGAGCGTGGCGATATTATTGTCTTTGCTGATCTTTATTGGTGAAGCCGTCCGCGACGCATTTGATCCTAATAAGGCGGTGTAACATGACGCAAACTCTGTTAGCGATTGAAAATTTGAGCGTGGGTTTTCGCCATCAGCAAACCGTACGTAC > CP042583/1850754‑1851310 ||| tatggtcggggATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGTCCAGCCTAACTTCTGGTGGCTGCTGGCACTTACTGTCTTGTTTGGCTGGATGAGTCTGGTCGGCGTGGTGCGGGCGGAGTTTTTACGTACTCGTAATTTCGACTACATTCGTGCGGCACAGGCGCTTGGCGTCAGCGATCGCAGTATCATCCTGCGTCATATGTTGCCTAATGCCATGGTCGCGTCCCTCACCTTTTTACCGTTTATTTTATGTATTTCGATA‑ACCACCCTGA‑cct > 1:1948228/9‑287 (MQ=255) tatggtcggggATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGTACAGCCTAACTTCTGGTGGCTGCTGGCAATTACTGTCTTGTTTGGCTGGATGAGTCTGGTCGGCGTGGTGCGGGCGGAGTTTTTACGTACTCGTAATTTCGACTACATTCGTGCGGCACAGGCGCTTGGCGTCAGCGATCGCAGTATCATCCTGCGTCATATGTTGCCTAATGCCATGGTCGCGACCCTCACCTTTTTACCGTTTATTTTATGTAGTTCGATA‑ACCACCCTGA‑ccc > 1:1116015/9‑287 (MQ=255) tggtcggggATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGTACAGCCTAACTTCTGGTGGCTGCTGGCAATTACTGTCTTGTTTGGCTGGATGAGTCTGGTCGGCGTGGTGCGGGCGGAGTTTTTACGTACTCGTAATTTCGACTACATTCGTGCGGCACAGGCGCTTGGCGTCAGCGATCGCAGTATCATCCTGCGTCATATGTTGCCTAATGCCATGGTCGCGACCCTCACCTTTTTACCGTTTATTTTATGTAGTTCGATA‑ACCACCCTGA‑cctcg > 1:795096/7‑285 (MQ=255) tggtcggggATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGTACAGCCTAACTTCTGGTGGCTGCTGGCAATTACTGTCTTGTTTGGCTGGATGAGTCTGGTCGGCGTGGTGCGGGCGGAGTTTTTACGTACTCGTAATTTCGACTACATTCGTGCGGCACAGGCGCTTGGCGTCAGCGATCGCAGTATCATCCTGCGTCATATGTTGCCTAATGCCATGGTCGCGACCCTCACCTTTTTACCGTTTATTTTATGTAGTTCGATA‑ACCACCCTGA‑cctcg > 2:902138/7‑285 (MQ=255) gtcggggATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGTACAGCCTAACTTCTGGTGGCTGCTGGCAATTACTGTCTTGTTTGGCTGGATGAGTCTGGTCGGCGTGGTGCGGGCGGAGTTTTTACGTACTCGTAATTTCGACTACATTCGTGCGGCACAGGCGCTTGGCGTCAGCGATCGCAGTATCATCCTGCGTCATATGTTGCCTAATGCCATGGTCGCGACCCTCACCTTTTTACCGTTTATTTTATGTAGTTCGATA‑ACCACCCTGA‑cctcgctc > 1:1417217/5‑283 (MQ=255) ggggATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGTACAGCCTAACTTCTGGTGGCTGCTGGCAATTACTGTCTTGTTTGGCTGGATGAGTCTGGTCGGCGTGGTGCGGGCGGAGTTTTTACGTACTCGTAATTTCGACTACATTCGTGCGGCACAGGCGCTTGGCGTCAGCGATCGCAGTATCATCCTGCGTCATATGTTGCCTAATGCCATGGTCGCGACCCTCACCTTTTTACCGTTTATTTTATGTAGTTCGATA‑ACCACCCTGA‑CCTCGCTCGAt > 1:1056325/2‑289 (MQ=255) gATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGTACAGCCTAACTTCTGGTGGCTGCTGGCAATTACTGTCTTGTTTGGCTGGATGAGTCTGGTCGGCGTGGTGCGGGCGGAGTTTTTACGTACTCGTAATTTCGACTACATTCGTGCGGCACAGGCGCTTGGCGTCAGCGATCGCAGTATCATCCTGCGTCATATGTTGCCTAATGCCATGGTCGCGACCCTCACCTTTTTACCGTTTATTTTATGTAGTTCGATA‑ACCACCCTGA‑CCTCGCTCGAttt > 1:470628/1‑288 (MQ=255) gATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGGCGTACAGCCTAACTTCTGGTGGCTGCTGGCAATTACTGTCTTGTTTGGCTGGATGAGTCTGGTCGGCGTGGGGCGGGCGGAGTTTTTACGTACTCGTAATTTCGACTACATTCGTGCGGCCGCGGCGCTTGGCGTCAGCGACCGCAGTATCATCTTGCGTACTCTGTTGCCTAATGCCATGGTCCAGACCCTCCCCTTTTTACCGTTTATTTTATTTAGTTCGCTA‑ACCACCCTGATCCAG‑CTCGAttt > 2:1827859/1‑288 (MQ=255) tGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGTACAGTCTAACTTCTGGTGGCTGCTGGCAATTACTGTCTTGTTTGGCTGGATGAGTCTGGTCGGCGTGGTGCGGGCGGAGTTTTTACGTACTCGTAATTTCGACTACATTCGTGCGGCACAGGCGCTTGGCGTCAGCGATCGCAGTATCATCCTGCGTCATATGTTGCCTAATGCCATGGTCGCGACCCTCACCTTTTTACCGTTTATTTTATGTAGTTCGATA‑ACCACCCTGA‑CCTCGCTCGATTTcc > 2:1361599/1‑288 (MQ=255) tacGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGTACAGCCTAACTTCTGGTGGCTGCTGGCAATTACTGTCTTGTTTGGCTGGATGAGTCTGGTCGGCGTGGTGCGGGCGGAGTTTTTACGTACTCGTAATTTCGACTACATTCGTGCGGCACAGGCGCTTGGCGTCAGCGATCGCAGTATCATCCTGCGTCATATGTTGCCTAATGCCATGGTCGCGACCCTCACCTTTTTACCGTTTATTTTATGTAGTTCGATA‑ACCACCCTGA‑CCTCGCTCGATTTCCTc > 1:283348/3‑289 (MQ=255) ccGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGTACAGCCTAACTTCTGGTGGCTGCTGGCAATTACTGTCTTGTTTGGCTGGATGAGTCTGGTCGGCGTGGTGCGGGCGGAGTTTTTACGTACTCGTAATTTCGACTACATTCGTGCGGCACAGGCGCTTGGCGTCAGCGATCGCAGTATCATCCTGCGTCATATGTTGCCTAATGCCATGGTCGCGACCCTCACCTTTTTACCGTTTATTTTATGTAGTTCGATA‑ACCACCCTGA‑CCTCGCTCGATTTCCTCg > 1:1449091/1‑289 (MQ=255) cGACTCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGTACAGCCTAACTTCTGGTGGCTGCTGGCAATTACTGTCTTGTTTGGCTGGATGAGTCTGGTCGGCGTGGTGCGGGCGGAGTTTTTACGTACTCGTAATTTCGACTACATTCGTGCGGCACAGGCGCTTGGCGTCAGCGATCGCAGTATCATCCTGCGTCCTATGTTGCCTAATGCCATGGTCGCGACCCTCACCTTTTTACCGTTTATTTTATGTAGTTCGATA‑ACCACCCTGA‑CCTCGCTCGATTTCCTCgg < 1:1587931/289‑1 (MQ=255) aCGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGTACAGCCTAACTTCTGGTGGCTGCTGGCAATTACTGTCTTGTTTGGCTGGATGAGTCTGGTCGGCGTGGTTCGGGCGGAGTTTTTACGTACTCGTAATTTCGACTACATTCGTGCGGCGCAGGCGCTTGGCGTCAGCGATCGCAGTATCATCCTTCGTCATATGTTGCCTAATGCCATGGTTGCGACCCGCACCATTTTACCGTTTATTTTATGTAGTTCGATG‑ACCAACCTGA‑CCTCGCTCGATTTCCTCGGCt > 1:833408/1‑289 (MQ=255) cGCTGTTTTTGATTATTTGACTGTCCTGCGTCTTACAGACTGACGTCTGGTGGCTGCGTGCAATTACTGTCTTGTTTGGCTGTATGAGTCTGGTCGGCGGGGTGCGGGCGGAGTTTTTACGTACTCGTAATTTCGACTACATTCGGGCGGCACAGGCGCTTGGCGTCAGCGATCGCAGTATCATCCTGCGTCATATGTTGCCTAATGCCATGGTCGCGACCCTCACCTGTTTACCGTTTATTTGATGTAGTTCGATA‑ACCACCCTGA‑CCTCGCTCGATTTCCTCGGCt < 2:1404913/288‑1 (MQ=255) tttttGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGTACAGCCTAACTTCTGGTGGCTGCTGGCAATTACTGTCTTGTTTGGCTGGATGAGTCTGGTCGGCGTGGTGCGGGCGGAGTTTTTACGTACTCGTAATTTCGCCTACATTCGTGCGGCACAGGCGCCTGGCGTCAGCGATCGCAGTATCATCCTGCGTCATCTGTTGCCTACAGCCATGGTCGCGACCCTCACCTATCTACCGTTTATTTTATGTAGT‑TCGTATACCCCCCTTA‑CCTCGCTCGCTTTCCTCGGCTTAgg > 2:1381970/1‑287 (MQ=255) tttttGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGTACAGCCTAACTTCTGGTGGCTGCTGGCAATTACTGTCTTGTTTGGCTGGATGAGTCTGGTCGGCGTGGTGCGGGCGGAGTTTTTACGTACTCGTAATTTCGACTACATTCGTGCGGCACAGGCGCTTGGCGTCAGCGATCGCAGTATCATCCTGCGTCATATGTTGCCTAATGCCATGGTCGCGACCCTCACCTTTTTACCGTTTATTTTATGTAGTTCGATA‑ACCACCCTGA‑CCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTc < 2:1449091/289‑1 (MQ=255) ttattTTACTTTGCAGAGTCGTACTGCCTAACTTCTGGTGGCGGCTGGCAATTACTGGCTTGTTTGGCTGGATGGGTCTGGTCTGCGTGGTGCGGGCGGAGTTTTTACGTACTCGTAATTTCGACTACATTCGTGCGGCACAGTCGCTTGGCGTCAGCGATCGCAGTATCATCCTGCGTCATATGTTGCCTAATGCCATGGTCGCGACCCTCACCTTTTTACCGTTTATTTTATGTAGTTCGATA‑ACCACCCTGA‑CCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCt < 2:1908722/289‑1 (MQ=255) ttttACTTTCCAGCGTCGTACAGCCTAACTTCTGGTGGCTGCTGGCAATTACTGTCTTGTTTGGCTGGATGAGTCTGGTCGGCGTGGTGCGGGCGGAGTTTTTACGTACTCGTAATTTCGACTACATTCGTGCGGCACAGGCGCTTGGCGTCAGCGATCGCAGTATCATCCTGCGTCATATGTTGCCTAATGCCATGGTCGCGACCCTCACCTTTTTACCGTTTATTTTATGTAGTTCGATA‑ACCACCCTGA‑CCTCGCTCGATTTCCt < 2:828525/268‑1 (MQ=255) ttttACTTTCCAGCGTCGTACAGCCTAACTTCTGGTGGCTGCTGGCAATTACTGTCTTGTTTGGCTGGATGAGTCTGGTCGGCGTGGTGCGGGCGGAGTTTTTACGTACTCGTAATTTCGACTACATTCGTGCGGCACAGGCGCTTGGCGTCAGCGATCGCAGTATCATCCTGCGTCATATGTTGCCTAATGCCATGGTCGCGACCCTCACCTTTTTACCGTTTATTTTATGTAGTTCGATA‑ACCACCCTGA‑CCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCgg > 2:172459/1‑289 (MQ=255) ccAGCGTCGTACAGCCTAACTTCTGGTGGCTGCTGGCAATTACTGTCTTGTTTGGCTGGATGAGTCTGGTCGGCGTGGTGCGGGCGGAGTTTTTACGTACTCGTAATTTCGACTACATTCGTGCGGCACAGGCGCTTGGCGTCAGCGATCGCAGTATCATCCTGCGTCATATGTTGCCTAATGCCATGGTCGCGACCCTCACCTTTTTACCGTTTATTTTATGTAGTTCGATA‑ACCACCCTGA‑CCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGttcaccgtc < 1:137157/289‑9 (MQ=255) cAGCGTCGTACAGCCTAACTTCTGGTGGCTGCTGGCAATTACTGTCTTGTTTGGCTGGATGAGTCTGGTCGGCGTGGTGCGGGCGGAGTTTTTACGTACTCGTAATTTCGACTACATTCGTGCGGCACAGGCGCTTGGCGTCAGCGATCGCAGTATCATCCTGCGTCATATGTTGCCTAATGCCATGGTCGCGACCCTCACCTTTTTACCGTTTATTTTATGTAGTTCGATA‑ACCACCCTGA‑CCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGttcaccgtc > 1:15408/1‑280 (MQ=255) cAGCGTCGTACAGCCTAACTTCTGGTGGCTGCTGGCAATTACTGTCTTGTTTGGCTGGATGAGTCTGGTCGGCGTGGTGCGGGCGGAGTTTTTACGTACTCGTAATTTCGACTACATTCGTGCGGCACAGGCGCTTGGCGTCAGCGATCGCAGTATCATCCTGCGTCATATGTTGCCTAATGCCATGGTCGCGACCCTCACCTTTTTACCGTTTATTTTATGTAGTTCGATA‑ACCACCCTGA‑CCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGttcaccgtc > 2:1151219/1‑280 (MQ=255) aCAGCCTAACTTCTGGTGGCTGCTGGCAATTACTGTCTTGTTTGGCTGGATGAGTCTGGTCGGCGTGGTGCGGGCGGAGTTTTTACGTACTCGTAATTTCGACTACATTCGTGCGGCACAGGCGCTTGGCGTCAGCGATCGCAGTATCATCCTGCGTCATATGTTGCCTAATGCCATGGTCGCGACCCTCACCTTTTTACCGTTTATTTTATGTAGTTCGATA‑ACCACCCTGA‑CCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGG‑TGaa < 1:342409/289‑1 (MQ=255) ccTAACTTCTGGTGGCTGCTGGCAATTACTGTCTTGTTTGGCTGGATGAGTCTGGTCGGCGTGGTGCGGGCGGAGTTTTTACGTACTCGTAATTTCGACTACATTCGTGCGGCACAGGCGCTTGGCGTCAGCGATCGCAGTATCATCCTGCGTCATATGTTGCCTAATGCCATGGTCGCGACCCTCACCTTTTTACCGTTTATTTTATGTAGTTCGATA‑ACCACCCTGA‑CCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGG‑TGAAct > 1:25112/1‑287 (MQ=255) tAACTTCTGGTGGCTGCTGGCAATTACTGTCTTGTTTGGCTGGATGAGTCTGGTCGGCGTGGTGCGGGCGGAGTTTTTACGTACTCGTAATTTCGACTACATTCGTGCGGCACAGGCGCTTGGCGTCAGCGATCGCAGTATCATCCTGCGTCATATGTTGCCTAATGCCATGGTCGCGACCCTCACCTTTTTACCGTTTATTTTATGTAGTTCGATA‑ACCACCCTGA‑CCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGG‑TGAAct > 1:566611/1‑285 (MQ=255) aaCTTCTGGTGGCTGCTGGCAATTACTGTCTTGTTTGGCTGGATGAGTCTGGTCGGCGTGGTGCGGGCGGAGTTTTTACGTACTCGTAATTTCGACTACATTCGTGCGGCACAGGCGCTTGGCGTCAGCGATCGCAGTATCATCCTGCGTCATATGTTGCCTAATGCCATGGTCGCGACCCTCACCTTTTTACCGTTTATTTTATGTAGTTCGATA‑ACCACCCTGA‑CCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGG‑TGAACTGCTGt < 1:40141/289‑1 (MQ=255) cTTCTGGTGGCTGCTGGCAATTACTGTCTTGTTTGGCTGGATGAGTCTGGTCGGCGTGGTGCGGGCGGAGTTTTTACGTACTCGTAATTTCGACTACATTCGTGCGGCACAGGCGCTTGGCGTCAGCGATCGCAGTATCATCCTGCGTCATATGTT‑CCTAATGCCATGGTCGCGACCCTCACCTTTTTACCGTTTATTTTATGTAGTTCGATA‑CCCACCCTGA‑CCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGG‑TGAACTGCTGTTAc < 2:595606/289‑1 (MQ=255) ggtggCTGCTGGCAATTACTGTCTTGTTTGGCTGGATGAGTCTGGTCGGCGTGGTGCGGGCGGAGTTTTTACGTACTCGTAATTTCGACTACATTCGTGCGGCACAGGCGCTTGGCGTCAGCGATCGCAGTATCATCCTGCGTCATATGTTGCCTAATGCCATGGTCGCGACCCTCACCTTTTTACCGTTTATTTTATGTAGTTCGATA‑ACCACCCTGA‑c > 1:991143/1‑220 (MQ=255) ggtggCTGCTGGCAATTACTGTCTTGTTTGGCTGGATGAGTCTGGTCGGCGTGGTGCGGGCGGAGTTTTTACGTACTCGTAATTTCGACTACATTCGTGCGGCACAGGCGCTTGGCGTCAGCGATCGCAGTATCATCCTGCGTCATATGTTGCCTAATGCCATGGTCGCGACCCTCACCTTTTTACCGTTTATTTTATGTAGTTCGATA‑ACCACCCTGA‑CCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGG‑TGAACTGCTGTTACAAgg < 1:1151219/289‑1 (MQ=255) ggCTGCTGGCAATTACTGTCTTGTTTGGCTGGATGAGTCTGGTCGGCGTGGTGCGGGCGGAGTTTTTACGTACTCGTAATTTCGACTACATTCGTGCGGCACAGGCGCTTGGCGTCAGCGATCGCAGTATCATCCTGCGTCATATGTTGCCTAATGCCATGGTCGCGACCCTCACCTTTTTACCGTTTATTTTATGTAGTTCGATA‑ACCACCCTGA‑CCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGG‑TGAACTGCTGTTACAAGGGaa < 2:283348/289‑1 (MQ=255) gctgctGGCAATTACTGACTTGTTTGGCTGGATGAGTCTGGTCGGCGTGGTGCGGGCGGAGTTTTTACGTACTCGTAATTTCGACTACATTCGTGCGGCACAGGCGCTTGGCGTCAGCGATCGCAGTATCATCCTGCGTCATATGTTGCCTAATGCCATGGTCGCGACCCTCACCTTTTTACCGTTTATTTTATGTAGTTCGATA‑ACCACCCTGA‑CCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGG‑TGAACTGATGTTACAAGGGaaa > 1:1253476/1‑289 (MQ=255) tCTTGTTTGGCTGGATGAGTCTGGTCGGCGTGGTGCGGGCGGAGTTTTTACGTACTCGTAATTTCGACTACATTCGTGCGGCACAGGCGCTTGGCGTCAGCGATCGCAGTATCATCCTGCGTCATATGTTGCCTAATGCCATGGTCGCGACCCTCACCTTTTTACCGTTTATTTTATGTAGTTCGATA‑ACCACCCTGA‑CCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGG‑TGACCTGCTGTTACAAGGGAAAAATAACCTTCAGGcccc > 1:218219/1‑289 (MQ=255) tCTTGTTTGGCTGGATGAGTCTGGTCGGCGTGGTGCGGGCGGAGTTTTTACGTACTCGTAATTTCGACTACATTCGTGCGGCACAGGCGCTTGGCGTCAGCGATCGCAGTATCATCCTGCGTCATATGTTGCCTAATGCCATGGTCGCGACCCTCACCTTTTTACCGTTTATTTTATGTAGTTCGATA‑ACCACCCTGA‑CCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGG‑TGAACTGCTGTTACAAGGGAAAAATAACCTTCAGGcccc > 1:1723631/1‑289 (MQ=255) tCTTGTTTGGCTGGATGAGTCTGGTCGGCGTGGTGCGGGCGGAGTTTTTACGTACTCGTAATTTCGACTACATTCGTGCGGCACAGGCGCTTGGCGTCAGCGATCGCAGTATCATCCTGCGTCATATGTTGCCTAATGCCATGGTCGCGACCCTCACCTTTTTACCGTTTATTTTATGTAGTTCGATA‑ACCACCCTGA‑CCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGG‑TGAACTGCTGTTACAAGGGAAAAATAACCTTCAGGcccc < 1:1825939/289‑1 (MQ=255) cTTGGTTGGCTGGATGAGTCTGGTCGGCGTGGTGCGGGCGGCGTTTTTACGTACTCGTAATTTCGACTACATTCGTGCGGCACAGGCGCTTGGCGTCCGCTATCGCAGTATCATCCTGCGTCATATGTTGCCTAATGCCCTGGTCGCGACCCTCACCCTTTTACCGTTTATTTTATGTAGTTCGATA‑ACCACCCTGA‑CCTCGCACGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCG‑TCATCGGTTGACCTGCTGTTCCAAGGGCAAAATAACCTTCAGCcccct > 2:431760/1‑288 (MQ=255) gTTTGGCTGGATGATGCTGGTCGGCGTGGTGCGGGCGGAGTTTTTACGTACTCGTAATTTCGACTACATTCGTGCGGCACAGGCGCTTGGCGTCAGCGATCGCAGTATCATCCTGCGTCATATGTTGCCTAATGCCATGGTCGCGACCCTCACCTTTTTACCGTTTATTTTATGTAGTTCGATA‑ACCACCCTGA‑CCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGG‑TGAACTGCTGTTACAAGGGAAAAATAACCTTCAGGCCCCGTgg < 1:580054/289‑1 (MQ=255) tttGGCTGGATGAGTCTGGTCGGCGTGGTGCGGGCGGAGTTTTTACGTACTCGTAATTTCGACTACATTCGTGCGGCACAGGCGCTTGGCGTCAGCGATCGCAGTATCATCCTGCGTCATATGTTGCCTAATGCCATGGTCGCGACCCTCACCTTTTTACCGTTTATTTTATGTAGTTCGATA‑ACCACCCTGA‑CCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGG‑TGAACTGCTGTTACAAGGGAAAAATAACCTTCAGGCCCCGTg > 1:1481853/1‑287 (MQ=255) ggAGTCTGGGTGGCGGGGTGCGGGCTGTGTTTTTACGTACTCGTAATTTCGACTACATTGGTGCGGCACAGGCGCTTTGCGTCAGGGATCGCAGTATCATCCTGAGTCATATGTTGCCTAATGCCATGGTCGCGACCCTCACCTTTTTACCGTTTATTTTATGTAGTTCGATA‑ACCACCCTGA‑CCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGG‑TGAACTGCTGTTACAAGGGAAAAATAACCTTCAGGCCCCGTGGCTTGGGATCAc < 2:1301589/288‑1 (MQ=255) tCTGGTCGGCGTGGTGCGGGCGGAGTTTTTACGTACTCGTAATTTCGACTACATTCGTGCGGCACAGGCGCTTGGCGTCAGCGATCGCAGTATCATCCTGCGTCATATGTTGCCTAATGCCATGGTCGCGACCCTCACCTTTTTACCGTTTATTTTATGTAGTTCGATA‑ACCACCCTGA‑CCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGG‑TGAACTGCTGTTACAAGGGAAAAATAACCTTCAGGCCCCGTGGCTTGGGATCACCg > 1:900260/1‑287 (MQ=255) tCTGGTCGGCGTGGTGCGGGCGGAGTTTTTACGTACTCGTAATTTCGACTACATTCGTGCGGCACAGGCGCTTGGCGTCAGCGATCGCAGTATCATCCTGCGTCATATGTTGCCTAATGCCATGGTCGCGACCCTCACCTTTTTACCGTTTATTTTATGTAGTTCGATA‑ACCACCCTGA‑CCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGG‑TGAACTGCTGTTACAAGGGAAAAATAACCTTCAGGCCCCGTGGCTTGGGATCACCGc > 2:675903/1‑288 (MQ=255) cGTGGTGCGGGCGGAGTTTTTACGTACTCGTAATTTCGACTACATTCGTGCGGCACAGGCGCTTGGCGTCAGCGATCGCAGTATCATCCTGCGTCATATGTTGCCTAATGCCATGGTCGCGACCCTCACCTTTTTACCGTTTATTTTATGTAGTTCGATA‑ACCACCCTGA‑CCTCGCTCGATTTCCTCGGCtt > 1:1726289/1‑192 (MQ=255) cGTGGTGCGGGCGGAGTTTTTACGTACTCGTAATTTCGACTACATTCGTGCGGCACAGGCGCTTGGCGTCAGCGATCGCAGTATCATCCTGCGTCATATGTTGCCTAATGCCATGGTCGCGACCCTCACCTTTTTACCGTTTATTTTATGTAGTTCGATA‑ACCACACTGA‑CCTCGCCCGATTTCCTCGGCTTCGGGCTACCGCTCGGTTCACCGTCCCTCGG‑TGAACGGCTGTTGCATGGTAAAAATAACCTTCTGGCGCTGTGGCTTGGGATCGTCGCCTCCTTgtcg > 2:1593554/1‑286 (MQ=255) cGTGGTGCGGGCGGAGTTTTTACGTACTCATAATTTCGACTACATTCGTGCGGCACAGGCGCTTGGCGTCAGCGATCGCAGTATCATCCTGCGTCATATGTTGCCTAATGCCATGGTCGCGACCCTCACCTTTTTACCGTTTATTTTATGTAGTTCGATA‑ACCACCCTGA‑CCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGG‑TGAACTGCTGTTACAAGGGAAAAATAACCTTCATGCCCCGTGGCTTGGGATCACCGCCTTCTTgtcg > 1:119887/1‑286 (MQ=255) tgCGGGCGGAGTTTTTACGTACTCGTAATTTCGACTACATTCGTGCGGCACAGGCGCTTGGCGTCAGCGATCGCAGTATCATCCTGCGTCATATGTTGCCTAATGCCATGGTCGCGACCCTCACCTTTTTACCGTTTATTTTATGTAGTTCGATA‑ACCACCCTGA‑CCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGG‑TGAACTGCTGTTACAAGGGAAAAATAACCTTCAGGCCCCGTGGCTTGGGATCACCGCCTTCTTgtcggtgg < 1:1283638/288‑8 (MQ=255) gcgggcggAGTTTTTACGTACTCGTAATTTCGACTACATTCGTGCGGCACAGGCGCTTGGCGTCAGCGATCGCAGTATCATCCTGCGTCATATGTTGCCTAATGCCATGGTCGCGACCCTCACCTTTTTACCGTTTATTTTATGTAGTTCGATA‑ACCACCCTGA‑CCCG‑CTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGG‑TGAACTGCTGTTACAAGGGAAAAATAACCTTCAGGCCCCGTGGCTTGGGATCACCGCCTTCTTGTCGGTGGCg < 2:1116015/288‑1 (MQ=255) ggTTTTTCCGTACTCGTAATTTCGACTCCATTCGGGCGGCACAGGCGCTTGGCGTCAGCGATCGCAGTATCATCCTGCGTCATATGTTGCCTAATGCCATGGTCGCGACCCTCACCTTTTTACCGTTTATTTTATGTAGTTCGATA‑ACCACCCTGA‑CCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGG‑TGAACTGCTGTTACAAGGGAAAAATAACCTTCAGGCCCCGTGGCTTGGGATCACCGCCTTCTTGTCGGTGGCGAtattat < 2:795096/287‑1 (MQ=255) gTTTTTACGTACTCGTAATTTCGACTACATTCGTGCGGCACAGGCGCTTGGCGTCAGCGATCGCAGTATCATCCTGCGTCATATGTTGCCTAATGCCATGGTCGCGACCCTCACCTTTTTACCGTTTATTTTATGTAGTTCGATA‑ACCACCCTGA‑CCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGG‑TGAACTGCTGTTACAAGGGAAAAATAACCTTCAGGCCCCGTGGCTTGGGATCACCGCCTTGTTGTCGGGGGCGATCGTATTg > 2:711162/1‑289 (MQ=255) acgtcatCGTAAGTTCGACTACATTCGTGCGGCACAGGCGCTTGGCGTCAGCGATCGCAGTATCATCCTGCGTCATATGTTGCCTAATGCCATGGTCGCGACCCTCACCTTTTTACCGTTTATTTTATGTAGTTCGATA‑ACCACCCTGA‑CCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGG‑TGAACTGCTGTTACAAGGGAAAAATAACCTTCAGGCCCCGTGGCTTGGGATCACCGCCTTCTTGTCGGTGGCGATATTATTGTCTTTg < 2:1576841/283‑1 (MQ=255) aCGTACTCGTAATTTCGACTACAGTCGGGCGGCACAGGGGATTGGCGTCAGGGATCGCAGTGTCATCCTGCGTCATATGTTGCGTAATGCCATGGTCGCGACCCTCACCTTTTTACCGTTTATTTTATGTAGTTCGATA‑ACCACCCTGA‑CCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGG‑TGAACTGCTGTTACAAGGGAAAAATAACCTTCAGGCCCCGTGGCTTGGGATCACCGCCTTCTTGTCGGTGGCGATATTATTGTCTTTg < 2:1948228/289‑1 (MQ=255) cGTACTCGTAATTTCGACTACATTCGTGCGGCACAGGCGCTTGGCGTCAGCGATCGCAGTATCATCCTGCGTCATATGTTGCCTAATGCCATGGTCGCGACCCTCACCTTTTTACCGTTTATTTTATGTAGTTCGATA‑ACCACCCTGA‑CCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGG‑TGAACTGCTGTTACAAGGGAAAAATAACCTTCAGGCCCCGTGGCTTGGGATCACCGCCTTCTTGTCGGTGGCGATATTATTGTCTTTGc < 1:1163674/289‑1 (MQ=255) aCTCGTAATTTCGACTACATTCGTGCGGCACAGGCGCTTGGCGTCAGCGATCGCAGTATCATCCTGCGTCATATGTTGCCTAATGCCATGGTCGCGACCCTCACCTTTTTACCGTTTATTTTATGTAGTTCGATA‑ACCACCCTGA‑CCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGG‑TGAACTGCTGTTACAAGGGAAAAATAACCTTCAGGCCCCGTGGCTTGGGATCACCGCCTTCTTGTCGGTGGCGATATTATTGTCTTTGCTg < 1:224406/288‑1 (MQ=255) aCTCGTAATTTCGACTACATTCGTGCGGCACAGGCGCTTGGCGTCAGCGATCGCAGTATCATCCTGCGTCATATGTTGCCTAATGCCATGGTCGCGACCCTCACCTTTTTACCGTTTATTTTATGTAGTTCGATA‑ACCACCCTGA‑CCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGG‑TGAACTGCTGTTACAAGGGAAAAATAACCTTCAGGCCCCGTGGCTTGGGATCACCGCCTTCTTGTCGGTGGCGATATTATTGTCTTTGCTg < 1:1505447/288‑1 (MQ=255) cTCGTAATTTCGACTACATTCGTGCGGCACAGGCGCTTGGCGTCAGCGATCGCAGTATCATCCTGCGTCATATGTTGCCTAATGCCATGGTCGCGACCCTCACCTTTTTACCGTTTATTTTATGTAGTTCGATA‑ACCACCCTGA‑CCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGG‑TGAACTGCTGTTACAAGGGAAAAATAACCTTCAGGCCCCGTGGCTTGGGATCACCGCCTTCTTGTCGGTGGCGATATTATTGTCTTTGCTGa > 1:1030344/1‑288 (MQ=255) cTCGTAATTTCGACTACATTCGTGCGGCACAGGCGCTTGGCGTCAGCGATCGCAGTATCATCCTGCGTCATATGTTGCCTAATGCCATGGTCGCGACCCTCACCTTTTTACCGTTTATTTTATGTAGTTCGATA‑ACCACCCTGA‑CCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGG‑TGAACTGCTGTTACAAGGGAAAAATAACCTTCAGGCCCCGTGGCTTGGGATCACCGCCTTCTTGTCGGTGGCGATATTATTGTCTTTGCTGAt < 1:1596432/289‑1 (MQ=255) cTCGTAATTTCGACGACAGTCCTTCGGCACACGCGCTTGGCGTCAGCGATCGCAGTATCATCCTGCGTCATATGTTGCCTAATGCCATGGTCGCGACCCTCACCTTTTTACCGTTTATTTTATGTAGTTCGATA‑ACCACCCTGA‑CCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGG‑TGAACTGCTGTTACAAGGGAAAAATAACCTTCAGGCCCCGTGGCTTGGGATCACCGCCTTCTTGTCGGTGGCGATATTATTGTCTTTGCTGAt < 2:1599572/289‑1 (MQ=255) gACTACATTCGTGCGGCACAGGCGCTTGGCGTCAGCGATCGCAGTATCATCCTGCGTCATATGTTGCCTAATGCCATGGTCGCGACCCTCACCTTTTTACCGTTTATTTTATGTAGTTCGATA‑ACCACCCTGA‑CCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGG‑TGAACTGCTGTTACAAGGGAAAAATAACCTTCAGGCCCCGTGGCTTGGGATCACCGCCTTCTTGTCGGTGGCGATATTATTGTCTTTGCTGATCTTTATTGGTg > 1:1225316/1‑289 (MQ=255) gACTACATTCGTGCGGCACAGGCGCTTGGCGTCAGCGATCGCAGTATCATCCTGCGTCATATGTTGCCTAATGCCATGGTCGCGACCCTCACCTTTTTACCGTTTATTTTATGTAGTTCGATA‑ACCACCCTGA‑CCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTCCACCGTCACTCGG‑TGAACTGCTGTTACAAGGGAAAAATAACCTTCAGGCCCCGTGGCTTGGGATCACCGCCTTCTTGTCGGTGGCGTTATTATTTTCTTTGCTGATTTTTATTGGTg > 2:234383/1‑289 (MQ=255) gaCATACCTGCGGCCCAGGCGCTTGCCGGCAGCGACCGCAGTATCATCCTCCGTCATATGTTGCCTATTGCCATTGTCGCCACCCTCACCTTTTTACCGTTTATTTTATGTAGTTCGATA‑ACCACCCTGA‑CCTCGCTCGATTTCCTCGTCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGG‑TGAACTGCTGTTACAAGGGAAAAATAACCTTCAGGCCCCGTGGCTTGTGATCACCGCCTTCTTGTCGGTGGCGATATTATTGTCTTTGCTGATCTTTATTGGTGAAg < 2:325254/288‑1 (MQ=255) gTGCGGCACAGGCGCTTGGCGTCAGCGATCGCAGTATCATCCTGCGTCATATGTTGCCTAATGCCATGGTCGCGACCCTCACCTTTTTACCGTTTATTTTATGTAGTTCGATA‑ACCACCCTGA‑CCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGG‑TGAACTGCTGTTACAAGGGAAAAATAACCTTCAGGCCCCGTGGCTTGGGATCACCGCCTTCTTGTCGGTGGCGATATTATTGTCTTTGCGGACCTTTATTGGTGAAGCCGTcc > 2:240494/1‑288 (MQ=255) tGCGGCACAGGCGCTTGGCGTCAGCGATCGCAGTATCATCCTGCGTCATATGTTGCCTAATGCCATGGTCGCGACCCTCACCTTTTTACCGTTTATTTTATGTAGTTCGATA‑ACCACCCTGA‑CCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGG‑TGAACTGCTGTTACAAGGGAAAAATAACCTTCAGGCCCCGTGGCTTGGGATCACCGCCTTCTTGTCGGTGGCGATATTATTGTCTTTGCTGAGCTTTATTGGTGAAGCCGTCcg > 2:970957/1‑288 (MQ=255) tgCACAGGCGCTTGGACTCGGCGATCGCAGTATCATCCGGCGTCGTCTGTTGCCTAATGACATGTTCGCGACCCTCGCCTTTTTGCCGTTTATTTGCTGTAGTTCGATA‑ACCACCCTGA‑CCGCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGG‑TGAACTGCTGTTACAAGGGAAAAATAACCTTCAGGCCCCGTGGCTTGGGATCACCGCCTTCTTGTCGGTGGCGTTATTATTGTCTTTGCTGATCTTTATTGGTGAAGCCGTCCGCGa < 2:1875586/287‑1 (MQ=255) gCACAGGCGCTTGGCGTCAGCGATCGCAGTATCATCCTTCGTCATATGTTGCCTAATGCCATGGTCGCGACCCTCACCTTTTTACCGTGTATTTTATGTAGTTCGATA‑ACCACCCTGA‑CCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGG‑TGAACTGCTGTTACAAGGGAAAAATAACCTTCAGGCCCCGTGGCTGGGGATCACCGCCTTCTTGTCGGTGGCTATATTATTGTGTTTTCGGATCTGTATTGGTGAAGCCGTCTGCGAc > 2:1128061/1‑288 (MQ=255) gCACAGGCGCTTGGCGTCAGCGATCGCAGTATCATCCTGCGTCATATGTTGCCTAATGCCATGGTCGCGACCCTCACCTTTTTACCGTTTATTTTATGTAGTTCGATA‑ACCACCCTGA‑CCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGG‑TGAACTGCTGTTACAAGGGAAAAATAACCTTCAGGCCCCGTGGCTTGGGATCACCGCCTTCTTGTCGGTGGCGATATTATTGTCTTTGCTGATCTTTATTGGTGAAGCCGTCCGCGAc > 2:276666/1‑288 (MQ=255) gcgcTTGGCGTCAGCGATCGCAGTATCATCCTGCGTCATATGTTGCCTAATGCCATGGTCGCGACCCTCACCTTTTTACCGTTTATTTTATGTAGTTCGATA‑ACCACCCTGA‑CCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGG‑TGAACTGCTGTTACAAGGGAAAAATAACCTTCAGGcccc > 1:1669155/1‑203 (MQ=255) cgcTTGGCGTCAGCGATCGCAGTATCATCCTGCGTCATATGTTGCCTAATGCCATGGTCGCGACCCTCACCTTTTTACCGTTTATTTTATGTAGTTCGATA‑ACCACCCTGA‑CCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGG‑TGAACTGCTGTTACAAGGGAAAAATAACCTTCAGGCCCCGTGGCTTGGGATCACCGCCTTCTTGTCGGTGGCGATATTATTGTCTTTGCTGATCTTTATTGGTGAAGCCGTCCGCGACGCAtt < 1:711162/286‑1 (MQ=255) gcTTGGCGTCAGCGATCGCAGTATCATCCTGCGTCATATGTTGCCTAATGCCATGGTCGCGACCCTCACCTTTTTACCGTTTATTTTATGTAGTTCGATA‑ACCACCCTGA‑CCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGG‑TGAACTGCTGTTACAAGGGAAAAATAACCTTCAGGCCCCGTGGCTTGGGATCACCGCCTTCTTGTCGGTGGCGATATTATTGTCTTTGCTGATCTTTATTGGTGAAGCCGTCCGCGACGCATTTGAt < 1:522897/289‑1 (MQ=255) cTTCGCGTAAGCGATCGCAGTATCATACTGCGTCATATGTTGCCTAATGCCATGGTCGCGACCCTCACCTTTTTACCGTTTATTTTATGTAGTTCGATA‑ACCACCCTGA‑CCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGG‑TGAACTGCTGTTACAAGGGAAAAATAACCTTCAGGCCCCGTGGCTTGGGATCACCGCCTTCTTGTCGGTGGCGATATTATTGTCTTTGCTGATCTTTATTGGTGAAGCCGTCCGCGACGCATTTGAt < 2:352842/288‑1 (MQ=255) tCAGCGATCGCAGTATCATCCTGCGTCATATGTTGCCTAATGCCATGGTCGCGACCCTCACCTTTTTACCGTTTATTTTATGTAGTTCGATA‑ACCACCCTGA‑CCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGG‑TGAACTGCTGTTACAAGGGAAAAATAACCTTCAGGCCCCGTGGCTTGGGATCAcc > 1:1591062/1‑209 (MQ=255) tCAGCGATCGCAGTATCATCCTGCGTCATATGTTGCCTAATGCCATGGTCGCGACCCTCACCTTTTTACCGTTTATTTTATGTAGTTCGATA‑ACCACCCTGA‑CCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGG‑TGAACTGCTGTTACAAGGGAAAAATAACCTTCAGGCCCCGTGGCTTGGGATCACCGCCTTCTTGTCGGTGGCGATATTATTGTCTTTGCTGATCTTTATTGGTGAAGCCGTCCGCGACGCATTTGATCCtaataa > 1:626591/1‑289 (MQ=255) tCAGCGATCGCAGTATCATCCTGCGTCATATGTTGCCTAATGCCATGGTCGCGACCCTCACCTTTTTACCGTTTATTTTATGTAGTTCGATA‑ACCACCCTGA‑CCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGG‑TGAACTGCTGTTACAAGGGAAAAATAACCTTCAGGCCCCGTGGCTTGGGATCACCGCCTTCTTGTCGGTGGCGATATTATTGTCTTTGCTGATCTTTATTGGTGAAGCCGTCCGCGACGCATTTGATCCtaataa > 1:915479/1‑289 (MQ=255) cAGCGATCGCAGTATCATCCTGCGTCATATGTTGCCTAATGCCATGGTCGCGACCCTCACCTTTTTACCGTTTATTTTATGTAGTTCGATA‑ACCACCCTGA‑CCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGG‑TGAACTGCTGTTACAAGGGAAAAATAACCTTCAGGCCCCGTGGCTTGGGATCACCGCCTTCTTGTCGGTGGCGATATTATTGTCTTTGCTGATCTTTATTGGTGAAGCCGTCCGCGACGCATTTGATCCTAATAAg < 1:675903/289‑1 (MQ=255) aGCGATCGCAGTATCATCCTGCGTCATATGTTGCCTAATGCCATGGTCGCGACCCTCACCTTTTTACCGTTTATTTTATGTAGTTCGATA‑ACCACCCTGA‑CCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGG‑TGAACTGCTGTTACAAGGGAAAAATAACCTTCAGGCCCCGTGGCTTGGGATCACCGCCTTCTTGTCGGTGGCGATATTATTGTCTTTGCTGATCTTTATTGGTGAAGCCGTCCGCGACGCATTTGATCCTAATAAgg < 2:1417217/289‑1 (MQ=255) tATCATCCTGCGTCATATGTTGCCTAATGCCATGGTCGCGACCCTCACCTTTTTACCGTTTATTTTATGTAGTTCGATA‑ACCACCCTGA‑CCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGG‑TGAACTGCTGTTACAAGGGAAAAATAACCTTCAGGCCCCGTGGCTTGGGATCACCGCCTTCTTGTCGGTGGCGATATTATTGTCTTTGCTGATCTTTATTGGTGAAGCCGTCCGCGACGCATTTGATCCTAATAAGGCGGTGTAGCAt < 1:417617/289‑1 (MQ=255) tcCTGCGTCATATGTTGCCTAATGCCATGGTCGCGACCCTCACCTTTTTACCGTTTATTTTATGTAGTTCGATA‑ACCACCCTGA‑CCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCt < 1:1849905/118‑1 (MQ=255) tcCTGCGTCATATGTTGCCTAATGCCATGGTCGCGACCCTCACCTTTTTACCGTTTATTTTATGTAGTTCGATA‑ACCACCCTGA‑CCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGG‑TGAACTGCTGTTACAAGGG‑‑AAATAACCTTCAGGCCCCGTGGCTTGGGATCACCGCCTTCTTGTCGGTGGCGATATTATTGTCTTTGCTGATCTTTATTGGTGAAGCCGTCCGCGACGCATTTGATCCTAATAAGGCGGTGTAGCATGACGCaa > 1:1935035/1‑289 (MQ=255) ccTGCGTCTTATGTTGACTAGTGCCATGGTCGCTACCCTTACCTTTTTACCGTTTATTTTATGTAGTTCGCTG‑ACCACCCTAA‑CCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTAGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGG‑TGAACTGCTGTTACAAGGGAAAAATAACCTTCAGGCCCCGTGGCTTGGGATCACCGCCTTCTTGTCGGTGGCGATATTATTGTCTTTGCTGATCTTTATTGGTGAAGCCGTCCGCGACGCATTTGATCCTAATAAGGCGGTGTAGCATGACGCa < 2:761129/289‑1 (MQ=255) ccTGCGTCATATGTTGCCTAATGCCATGGTCGCGACCCTCACCTTTTTTCCGTTTATTTTATGTAGTTCGATA‑ACCACCCTGA‑CCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGG‑TGAACTGCTGTTACAAGGGAAAAATAACCTTCAGGCCCCGTGGCTTGGGATCACCGCCTTCTTGTCGGTGGCGATATTATTGTCTTTGCTGATCTTTATTGGTGAAGCCGTCCGCGACGCATTTGATCCTAATAAGGCGGTGTAGCATGACGCa < 2:919884/289‑1 (MQ=255) tGCGTCATATGTTGCCTAATGCCATGGTCGCGACCCTCACCTTTTTACCGTTTATTTTATGTAGTTCGATA‑ACCACCCTGA‑CCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGG‑TGAACTGCTGTTACAAGGGAAAAATAACCTTCAGGCCCCGTGGCTTGGGATCACCGCCTTCTTGTCGGTGGCGATATTATTGTCTTTGCTGATCTTTATTGGTGAAGCCGTCCGCGACGCATTTGATCCTAATAAGGCGGTGTAGCATGACGCaa > 2:854925/1‑288 (MQ=255) cGTCATATGTTGCCTAATGCCATGGTCGCGACCCTCACCTTTTTACCGTTTATTTTATGTAGTTCGATA‑ACCACCCTGA‑CCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGG‑TGAACTGCTGTTACAAGGGAAAAATAACCTTCAGGCCCCGTGGCTTGGGATCACCGCCTTCTTGTCGGTGGCGATATTATTGTCTTTGCTGATCTTTATTGGTGAAGCCGTCCGCGACGCATTTGATCCTAATAAGGCGGTGTGGCATGACGCAAAc > 2:646329/1‑288 (MQ=255) tCATATGTTGCCTAATGCCATGGTCGCGACCCTCACCTTTTTACCGTTTATTTTATGTAGTTCGATA‑ACCACCCTGA‑CCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGG‑TGAACTGCTGTTACAAGGGAAAAATAACCTTCAGGCCCCGTGGCTTGGGATCACCGCCTTCTTGTCGGTGGCGATATTATTGt > 2:1035717/1‑212 (MQ=255) tGCCTAATGCCATGGTCGCGACCCTCACCTTTTTACCGTTTATTTTATGTAGTTCGATA‑ACCACCCTGA‑CCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGG‑TGAACTGCTGTTACCAGGGAAAAATAACCTTCAGGCCCCGTGGCTTGGGATCACCGCCTTCTTGTCGGTGGCGATATTATTGTCTTTGCTGACCTTTATTGGTGAAGCCGTCCGCGACGCATTTGTTCCTAATAAGGCGGTGTAGCATGACGCAAACTCGGTTAGCGa > 2:491034/1‑289 (MQ=255) ccTAATGCCATGGTCGCGACCCTCACCTTTTTACCGTTTATTTTATGTAGTTCGATA‑ACCACCCTGA‑CCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGG‑TGAACTGCTGTTACAAGGGAAAAAt > 1:740645/1‑144 (MQ=255) ccTAATGCCATGGTCGCGACCCTCACCTTTTTACCGTTTATTTTATGTAGTTCGATA‑ACCACCCTGA‑CCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGG‑TGAACTGCTGTTACAAGGGAAAAAt < 2:740645/144‑1 (MQ=255) ccTAATGCCATGGTCGCGACCCTCACCTTTTTACCGTTTATTTTATGTAGTTCGATA‑ACCACCCTGA‑CCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGG‑TGAACTGCTGTTACAAGGGAAAAATAACCTTCAGGCCCCGTGGCTTGGGATCACCGCCTTCTTGTCGGTGGCGATATTATTGTCTTTGCTGATCTTTATTGGTGAAGCCGTCCGCGACGCATTTGATCCTAATAAGGCGGTGTAGCATGACGCAAACTCTGTTAGCGAtt > 2:1772852/1‑289 (MQ=255) tGGTCGCGACCCTCACCTTTTTACCGTTTATTTTATGTAGTTCGATA‑ACCACCCTGA‑CCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGG‑TGAACTGCTGTTACATGGGAAAAATAACCTTCAGGCCCCGTGGCTTGGGATCACCGCCTTCTTGTCGGTGGCGATATTATTGTCTTTGCTGATCTTTATTGGTGAAGCCGTCCGCGACGCATTTGATCCTAATAAGGCGGTGTAGCATGACGCAAACTCTGTTAGCGATTGAAAATTTg > 2:1220968/1‑288 (MQ=255) tGGTCGCGACCCTCACCTTTTTACCGTTTATTTTATGTAGTTCGATA‑ACCACCCTGA‑CCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGG‑TGAACTGCTGTTACAAGGGAAAAATAACCTTCAGGCCCCGTGGCTTGGGATCACCGCCTTCTTGTCGGTGGCGATATTATTGTCTTTGCTGATCTTTATTGGTGAAGCCGTCCGCGACGCATTTGATCCTAATAAGGCGGTGTAGCATGACGCAAACTCTGTTAGCGATTGAAAATTTg > 1:1636674/1‑288 (MQ=255) tGGTCGCGACCCTCACCTTTTTACCGTTTATTTTATGTAGTTCGATA‑ACCACCCTGA‑CCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGG‑TGAACTGCTGTTACAAGGGAAAAATAACCTTCAGGCCCCGTGGCTTGGGATCACCGCCTTCTTGTCGGTGGCGATATTATTGTCTTTGCTGATCTTGCTTGGTGAAGCCGTCCGCGACGCATGTGATCCTAATAGGGCGGTGTATCATGCTGCAAACTCGGTTAGGGATCGAAAATTTg > 2:1097871/1‑288 (MQ=255) gcgACCCTCACCTTTTTACCGTTTATTTTATGTAGTTCGATA‑ACCACCCTGA‑CCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGG‑TGAACTGCTGTTACAAGGGAAAAATAACCTTCAGGCCCCGTGGCTTGGGATCACCGCCTTCTTGTCGGTGGCGATATTATTGTCTTTGCTGATCTTTATTGGTGAAGCCGTCCGCGACGCATTTGATCCTAATAAGGCGGTTTAGCATGACGCAAACTCTGTTAGCGAGTTCAAAtttttcggtg > 2:898848/1‑282 (MQ=255) cgACCCTCACCTTTTTACCGTTTATTTTATGTAGTTCGATA‑ACCACCCTGA‑CCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGG‑TGAACTGCTGTTACAAGGGAAAAATAACCTTCAGGCCCCGTGGCTTGGGATCACCGCCTTCTTGTCGGTGGCGATATTATTGTCTTTGCTGATCTTTATTGGTGAAGCCGTCCGCGACGCATTTGATCCTAATAAGGCGGTGTAGCATGACGCAAACTCTGTTAGCGATTGAAAATTTgtcggtgg > 1:540448/1‑282 (MQ=255) ccTCACCTTTTTACCGTTTATTTTATGTAGTTCGATA‑ACCACCCTGA‑CCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGG‑TGAACTGCTGTTACAAGGGAAAAATAACCTTCAGGCCCCGTGGCTTGGGATCACCGCCTTCTTGTCGGTGGCGATATTATTGTCTTTGCTGATCTTTATTGGTGAAGCCGTCCGCGACGCATTTGATCCTAATAAGGCGGTGTAGCATGACGCAAACTCTGTTAGCGATTGAAAATTTGTCGGTGGGttt > 1:955461/1‑289 (MQ=255) tCACCTTTTTACCGTTTATTTTATGTAGTTCGATA‑ACCACCCTGA‑CCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGG‑TGAACTGCTGTTACAAGGGAAAAATAACCTTCAGGCCCCGTGGCTTGGGATCACCGACTTCTTGTCGGTGGCGATCTTATTGTCTTTGCTGATCTTTAATGTTGAACCCGTCCGCGACGCATTTGATCTTACTAAGGGTGTGTAGCCTGACGCAAACTCCGTTCGCGATGTAAAAGTTGTCGGTGGGTTTTc > 2:1462115/1‑289 (MQ=255) tttACCGTTTATTTTATGTAGTTCGATA‑ACCACCCTGA‑CCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGG‑TGAACTGCTGTTACAAGGGAAAAATAACCTTCAGGCCCCGTGGCTTGGGATCACCGCCTTCTTGTCGGTGGCGATATTATTGTCTTTGCTGATCTTTATTGGTGAAGCCGTCCGCGACGCATTTGATCCTAATAAGGCGGTGTAGCATGACGCAAACTCTGTTAGCGATTGAAAATTTGTCGGTGGGTTGTCGCCATCa > 2:398558/1‑289 (MQ=255) tACCGTTTATTTTATGTAGTTCGATA‑ACCACCCTGA‑CCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGG‑TGAACTGCTGTTACAAGGGAAAAATAACCTTCAGGCCCCGTGGCTTGGGATCACCGCCTTCTTGTCGGTGGCGATATTATTGTCTTTGCTGATCTTTATTGGTGAAGCCGTCCGCGACGCATTTGATCCTAATAAGGCGGTGTATCATGACGCAAACTCTGTTAGCGATTGCAAATTTGTCGGTGGTTTTTCTCCATCAGc > 2:819630/1‑289 (MQ=255) cGTTTATTTTATGTAGTTCGATA‑ACCACCCTGA‑CCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGG‑TGAACTGCTGTTACAAGGGAAAAATAACCTTCAGGCCCCGTGGCTTGGGATCACCGCCTTCTTGTCGGTGGCGATATTATTGTCTTTGCTGATCTTTATTGGTGAAGCCGTCCGCGACGCATTTGATCCTAATAAgg > 1:1907053/1‑222 (MQ=255) gTTTATTTTTTGTAGTTCGATA‑ACCACCCTGA‑CCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGG‑TGAACTGCTGTTACAAGGGAAAAATAACCTTCAGGCCCCGTGGCTTGGGATCACCGCCTTCTTGTCGGTGGCGATATTATTGTCTTTGCTGATCTTTATTGGTGAAGCCGTCCGCGACGCATTTGATCCTAATAAGGCGGTGTAGCATGACGCAAACTCTGTTAGCGATTGAAAATTTGTCGGTGGGTTTTCGCCATCAGCAAAc < 1:1097871/289‑1 (MQ=255) tttattttatGTAGTTCGATA‑ACCACCCTGA‑CCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGG‑TGAACTGCTGTTACAAGGGAAAAATAACCTTCAGGCCCCGTGGCTTGGGATCACCGCCTTCTTGTCGGTGGCGATATTATTGt > 2:1632543/1‑166 (MQ=255) tttattttatGTAGTTCGATA‑ACCACCCTGA‑CCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGG‑TGAACTGCTGTTACAAGGGAAAAATAACCTTCAGGCCCCGTGGCTTGGGATCACCGCCTTCTTGTCGGTGGCGATATTATTGTCTTTGCTGATCTTTATTGGTGAAGCCGTCCGCGACGCATTTGATCCTAATAAGGCGGTGTAGCATGACGCAAACTCTGTTAGCGATTGAAAATTTGTCGGTGGGTTTTCGCCATCAGCAAAcc > 2:666574/1‑289 (MQ=255) cttattttatGTAGTTCGATA‑ACCACCCTGA‑CCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGG‑TGAACTGCTGTTACAAGGGAAAAATAACCTTCAGGCCCCGTGGCTTGGGATCACCGCCTTCTTGTCGGTGGCGATATTATTGTCTTTGCTGATCTTTATTGGTGAAGCCGTCCGCGACGCATTTGATCCTAATAAgg < 2:1515280/219‑1 (MQ=255) tattttatGTAGTTCGATA‑ACCACCCTGA‑CCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGG‑TGAACTGCTGTTACAAGGGAAAAATAACCTTCAGGCCCCGTGGCTTGGGATCACCGCCTTCTTGTCGGTGGCGATATTATTGTCTTTGCTGATCTTTATTGGTGAAGCCGTCCGCGACGCATTTGATCCTAATAAGGCGGTGTAGCATGACGCAAACTCTGTTAGCGATTGAAAATTTGTCGGTGGGTTTTCGCCATCAGCAAACcgt < 2:540448/289‑1 (MQ=255) atGTAGTTCGATA‑ACCACCCTGA‑CCTCGCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTTCACCGTCACTCGG‑TGAACTGCTGTTACAAGGGAAAAATAACCTTCAGGCCCCGTGGCTTGGGATCACCGCCTTCTTGTCGGTGGCGATATTATTGTCTTTGCTGATCTTTATTGGTGAAGCCGTCCGCGACGCATTTGATCCTAATAAGGCGGTGTAGCATGACGCAAACTCTGTTAGCGATTGAAAATTTGTCGGTGGGTTTTCGCCATCAGCAAACCgtacgtac > 2:1757615/1‑289 (MQ=255) ||| TTGAAGTATGGAGCGGGATGCCGACGCTGTTTTTGATTATTTTACTTTCCAGCGTCGTACAGCCTAACTTCTGGTGGCTGCTGGCAATTACTGTCTTGTTTGGCTGGATGAGTCTGGTCGGCGTGGTGCGGGCGGAGTTTTTACGTACTCGTAATTTCGACTACATTCGTGCGGCACAGGCGCTTGGCGTCAGCGATCGCAGTATCATCCTGCGTCATATGTTGCCTAATGCCATGGTCGCGACCCTCACCTTTTTACCGTTTATTTTATGTAGTAGCATA‑ACCACCCTGA‑CCAGCCTCGATTTCCTCGGCTTCGGTCTACCGCTCGGTAGTCCGAGTCTCGG‑TGAACTGCTGTTACAAGGGAAAAATAACCTTCAGGCCCCGTGGCTTGGGATCACCGCCTTCTTGAGCGTGGCGATATTATTGTCTTTGCTGATCTTTATTGGTGAAGCCGTCCGCGACGCATTTGATCCTAATAAGGCGGTGTAACATGACGCAAACTCTGTTAGCGATTGAAAATTTGAGCGTGGGTTTTCGCCATCAGCAAACCGTACGTAC > CP042583/1850754‑1851310 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |